3WK1A

Wild-type orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from m. thermoautotrophicus complexed with orotidine 5'-monophosphate ethyl ester
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Substrate distortion contributes to the catalysis of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 88
structure length 215
sequence length 215
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3wk1A00
2GVJA 4O19A 1N8FA 1FDYA 3IVTA 1F2JA 2X1RA 4LV4A 2ZZ2A 2NV2A 1XCFA 5FF3A 3BARA 3I65A 4RR4A 2P0OA 4AVFA 2ZBTA 3GX9A 2NX9A 4LRTA 3HF3A 1SZNA 4K39A 3TX9A 2QUUA 3W71A 1B9BA 3F4WA 3OVQA 4PC8A 1JQVA 4WUIA 4JX4A 3CWOX 4JX6A 5DCDA 3TW7A 2FB3A 1W3IA 1RQHA 1OX6A 4XKYB 5D37A 1G67A 3UZJA 2WNQA 4LS2A 3BK0A 4RV8A 2W79A 4O14A 3W07A 4DO4A 1LRQA 1S5WA 3QQ0A 2A7PA 3NQ7A 2ZRVA 4GUJA 4BF9A 1XXXA 3A23A 4XUGA 3QFEA 3NQEA 3TMQA 2RH9A 3N2MA 3WJXA 5AHIA 2JK2A 4WD0A 2JKPA 3M7WA 4R53A 3KOFA 1KM6A 2Q8LA 2NXHA 5MHBA 4IMDA 3C61A 4DF0A 4JTGA 3QZEA 5SWUA 3LLDA 3R89A 3HGOA 3W1PA 4QSHA 3ZR4A 2GJNA 1LROA 3C4UA 3LTYA 5HNRA 4N4QA 3L0KA 3W7IA 1AL7A 1HL2A 2H90A 1JUKA 1K8YA 2BLEA 4NJJA 4YWIA 5I3GA 2VKZG 1UUOA 1H62A 1KA9F 1ALDA 3TQKA 1J5TA 2CFFA 4N9EA 1RPXA 1UBSA 1AW1A 4MLRA 1SZGA 1SO3A 1Q45A 1SUXA 3LHYA 4NJKA 3TNOA 5CSRA 3PULA 4LUIA 4QISA 4MFDA 2ABBA 4O1AA 4MOZA 1T96A 1ME8A 1SZFA 5A5WA 4DQWA 1OX5A 1TPDA 1OYBA 1LBFA 1T0OA 1A5BA 5FF0A 3W1UA 3HMJG 2ZFAA 3SW6A 1VZWA 2Y88A 1TQXA 3HPZA 4BFAA 1FWRA 1XBYA 3W2LA 2CLOA 1VHNA 1ZHAA 4YXGA 3W88A 4L4LA 5KZDA 3RNDA 1RQEA 4LU0A 2E68A 3G24A 4O16A 4A3UA 3USBA 4YMZA 1OVDA 4X9SA 3S1VA 1QPQA 1W5MA 4O50A 1MZHA 3B06A 2V8ZA 3DFNA 4R34A 1BKSA 2QCMA 2P10A 5D2VA 3MHGA 4WY0F 1MSSA 1LM1A 2J27A 3TXVA 4JICA 3TQ0A 2PRHA 3L9CA 4GE8A 2ZZ5A 4JTKA 5C54A 2A1YA 2C3ZA 1B57A 2YW4A 3IGSA 3IVSA 4BI7A 4N02A 4JGDA 3A5VA 4PL2A 2JKAA 2A6NA 3OHIA 3LX9A 2DZVA 4TIMA 4XKYA 5BNKA 4LVDA 3GK0A 4ADTA 2YGYA 5LNVA 3HG4A 4ZQRA 5KSWA 3UY7A 1LRTA 3NZRA 4JTHA 1EP3A 4WY0A 1OG0A 2C18A 4JIPA 1WX0A 1RQBA 1FDZA 1XBVA 1QAPA 3ZS4A 2ZQ0A 2Y89A 3P8IA 3MMTA 5K4XA 1U5JA 2E6AA 2V5BA 3NPWA 1G4SA 4CCDA 2GVGA 3L67A 1GVQA 1TIMA 3W86A 4KFNA 4UUIA 1LOLA 3Q94A 3ABSA 3D0CA 3G1AA 1L9WA 3FJLA 3N19B 4UTTA 3FLUA 3QC3A 5C55A 3HJZA 1DQXA 3NNTA 3OVPA 1GVOA 4GNJA 1EUAA 5FESA 1XFBA 2YFOA 2A5HA 3FFSA 3NYZA 4ZQPA 3W73A 1K7XA 2OT1A 4RKAA 4FNSA 5CKSA 1Q6QA 2X30A 4FNPA 4GFSA 1PE1A 3VCRA 2OJPA 5G1TA 3BG9A 2YZRA 3HGSA 2BWGA 1QPNA 4E0CA 3PY2A 3BVJA 1KW1A 2E6DA 1OFPA 3U8GA 1DL3A 2EAWA 1BTMA 1CX9A 3FA5A 1GVRA 1KM1A 4Z1DA 4LV9A 1PVNA 2DP3A 3HPXA 5LKYA 1M7OA 5U4NA 4CQ9A 4DF2A 3TSBA 4O0KA 4JIQA 4IMCA 4CQ8A 3ELFA 3HG2A 4OV9A 3RLVA 1TTQA 2QJGA 1JCXA 2C0AA 2RHGA 3DI1A 3T4CA 2NZLA 3GDKA 4HT3A 5DCBA 3GXTA 5DXYA 3W2KA 3IGXA 1G6CA 3A24A 4UXDA 2YX0A 4ZVJA 4N6FA 1VCFA 3CEPA 4LS0A 3STEA 5BMXA 4O12A 3I7SA 3W7CA 2FJKA 4UTMA 3QW3A 3O6YX 4EOUA 4MY8A 1TB3A 4GUGA 1LYXA 3M43A 3O06A 1JJKA 3IIXA 3L5MA 1DOSA 5TBOA 1AL8A 1AK5A 2JGYA 1NVMA 4K7VA 2RDTA 2XN1A 5GVJA 1O60A 1GVSA 1W5NA 3FYPA 3TSMA 3VE9A 4DEFA 1IXPA 3UWUA 3WK3A 1OYCA 3OVRA 3GLCA 2QAPA 4FXRA 1KBJA 2BSLA 4K36A 1G7VA 3CIXA 2CZEA 4CNNA 3QMTA 1GTEA 2QJHA 2Y7GA 2QR6A 4MKNA 3G3MA 1BEUA 1QDSA 1OFDA 1IF2A 3FEMA 3S9YA 3WK1A 1O95A 3M5ZA 4NX5A 3QSRA 2FPVA 3NQFA 3KAOA 3MP5A 3P80A 1TRIA 4QIUA 4N2YA 5G4EA 3SECA 1W5QA 2GOUA 4OGZA 1FXQA 4AF0B 1C9DA 1VPXA 5F1VA 1J4EA 3P60A 4MY9A 3RLUA 3G0UA 1FWNA 1L2UA 5F2MA 4LW7A 2V0TA 1RVGA 4MY1A 4JYDA 1GJPA 1GQNA 3LCFA 2EHHA 3LI1A 3NA8A 5F2IA 3TDFA 5D02A 1SSDA 1X1OA 5C2XA 1WYIA 3M1ZA 2VXNA 4TMCA 3W23A 4QAIA 3M16A 4HN4A 4H6KA 4EVZA 3W7EA 2Z6JA 3UPWA 3W83A 4PFMA 3JRKA 4K38A 5FEWA 3R13A 2VFHA 2I14A 3BLEA 3DKJA 2RKXA 3EKLA 2C1HA 1WAUA 5CPLA 4DELA 5AHFA 1BWKA 3T44A 2EGZA 3DI0A 1DHPA 4Z0JA 4ZL1A 4IPIA 4XTDA 2XN0A 3WJZA 5FEXA 1F6PA 5K9CA 2J88A 3C56A 1M5WA 1YXCA 2AQWA 1H60A 3TR2A 3R2GA 1LBLA 1VGAA 4MIMA 1OFBA 3H55A 3GB6A 4Y90A 3W70A 1MEWA 3G1VA 5IBXC 3LRLA 1SO4A 4RZ5A 4XBKA 5HWMA 1Z48A 4Q4KA 4JR5A 3E12A 4K37A 3S1XA 3PSWA 3I68A 4NXKA 1OK4A 3GYEA 3NQ2A 3NQDA 4FNUA 1A5SA 2B0MA 1GZGA 1H1YA 3G1YA 3NM1A 3MBDA 3E02A 3NL2A 3NQMA 5FF4A 2R14A 1H63A 4FO4A 4UTWA 3LM7A 3MW7A 3LV6A 4QNWA 1VYPX 4QNEA 3C8FA 1PV8A 2ZRUA 5J5RA 1H61A 3W84A 3UY8A 2PE4A 1CW2A 1KBIA 3IGUA 5KINA 1QOPA 1W37A 1Q6LA 3LHVA 1R2TA 4MYAA 3G18A 1I4NA 5LSMA 3EWWA 4P61A 3O63A 4BWLC 1JRCA 3THQA 5G2IA 3W1MA 3C2RA 2I1OA 4UFIA 1JCLA 1AW5A 1KFBA 1SFLA 3G1XA 3B03A 5D2YA 2Y63A 4HPXA 5AHEA 1F73A 2F7FA 1R46A 3NL6A 1ZJIA 3DHFA 3C0JA 4N9BA 3UWZA 3N73A 4MZYA 3F1QA 5CZ0A 3S5NA 3GAKA 2F84A 3B04A 4LUJA 4MJMA 1JCJA 3LCWA 1FBAA 5AYZA 3EWXA 3N34A 2CLLA 4OT7A 4AF0A 3KHJA 4NVTA 2GQAA 4UFLA 3P5ZA 1VC4A 3PS7A 3WFAA 1B3OA 2FB2A 3IV3A 4ML9A 5G5IA 3G0XA 3TC6A 4LVFA 3DFPA 5D09A 2A7NA 1JUBA 1ADOA 4NZJA 4UMBA 3IEBA 1MEIA 4O11A 1I45A 5DELA 2WV8A 3QRHA 3TIMA 1GWJA 1IXOA 1M7PA 1NSJA 2JBMA 4HHPA 5EL1A 2O7SA 2J9YA 1JCNA 2Y6ZA 3B8DA 1ZALA 1XM3A 2NV1A 5F4SA 2WPBA 1GTHA 3W1LA 2VFGA 3W2JA 4O4VA 3DHDA 1JQXA 5KZMA 4FX8A 1S5VA 4U4MA 2DZXA 2E6YA 5AHLA 2Y7EA 3BGGA 1W3TA 4LC6A 2G95A 5F4WA 3QMSA 4JX5A 2NX3A 3QQ1A 2HTMA 5EBUA 2ZZ3A 3L65A 4MFEA 3WK0A 2FDSA 1SO6A 2ZZ4A 3PBYA 5KZEA 1VS1A 4WY0B 4K8EA 3QF0A 3QPZA 4O8RA 3SI9A 2ZTJA 3BW3A 5D2TA 4WJEA 3L68A 1Y0EA 4MVAA 2YPIA 1FUYA 3QSTA 2OZ0A 4DPQA 4X22A 3OIXA 3ATZA 2FFCA 3NQ6A 3L0GA 3M5XA 1PHQA 3W6YA 5DBUA 5E1QA 3RF9A 3PG9A 4UTHA 1O4UA 3EWBX 4N9DA 3MP3A 1OFRA 1YPFA 3G1DA 1JCYA 3NQGA 3HBLA 4JYEA 4O1CA 3LXBA 1ICQA 5CPOA 3O07A 4Y9AA 5AHNA 3LERA 3OBKA 3BGJA 1QR7A 3SIZA 5LGXA 3PF3A 3ZWSA 1K03A 3NZ1A 4IX0A 4IUOA 1KM0A 2QF7A 4GC4A 3E9AA 4LT9A 1ZNNA 2QCNA 1FCQA 1IXQA 2VELA 1PIIA 4CNOA 2QUTA 1YDNA 2X1UA 1TPH1 1QCWA 4MJZA 5T26A 3CT7A 2R94A 3CPRA 4NNCA 7TIMA 3W1NA 4OQVA 5U7SA 1H7PA 3P7YA 1QWGA 1T99A 3C2EA 3W7OA 4HSOA 2TRSA 3BO9A 2Z6IA 4YCOA 3CWNA 3CQ0A 1O5XA 5HMSA 1TQJA 1VJIA 1IXNA 2CZDA 3NQCA 3T7VA 1PS9A 4YLWA 4A22A 1TV8A 2P1FA 2CLMA 3O6DA 3TCEA 1HFBA 1F74A 3E0IA 5I3FA 5LNUA 4DO5A 2CLIA 3HPSA 3CM4A 1IGSA 1EWEA 4UMAA 2ZA2A 5J5DA 3GIYA 3DFQA 4XQ6A 3NO5A 3N9SA 4O57A 4FIRA 8TIMA 4PA8A 3FOKA 5HWNA 1WDWA 1TSIA 2QJIA 4NZFA 1YDVA 1VLWA 4LTSA 1TPB1 2VEMA 3GDMA 3DGRA 3AJXA 5DBTA 1UCWA 4KWVA 3GR8A 1SSGA 4K7YA 1XL9A 1I2OA 3RU6A 3STFA 1LDCA 4FIQA 3G8RA 1KM5A 3GKFA 1ZY9A 1KLZA 3P62A 1UB3A 3EWYA 4J9JA 2PRMA 3GDTA 1IIGA 4GUIA 3SGUA 2ZRXA 4NNBA 1KFJA 3W85A 3B0VC 4NJIA 3SFKA 1WOBA 4FNRA 2H8XA 4OBTA 3EX6A 3GDLA 5AYYA 4H3DA 2YR1A 3M41A 3NL3A 1YXYA 4ZQCA 3QEZA 1BWLA 2QDHA 1OX4B 4IMFA 1TREA 4AMAA 3TK7A 3B0UX 1FWTA 3S42A 3A21A 2YW3A 2YFNA 2GPTA 2NUWA 5C6MA 1G4TA 4H4IA 1XDLA 1YTDA 3INPA 3W7LA 5LZLA 3JR2A 3NGJA 1JVNA 1OF8A 3W1RA 2H6RA 3O8AA 3TW6A 1GEQA 2R8WA 1XBXA 1VR6A 3DU0A 3NEVA 1TPC1 2O7QA 1OK6A 2H3BA 4DBDA 3LCIA 1G4EA 1KV5A 2CU0A 1A5AA 2Z2UA 2YYUA 3MP4A 4AHQA 3LXAA 1LZOA 1P4CA 2A2IA 4RCXA 4I9AA 1VQTA 3CC1A 3I6RA 4KWWA 4DO6A 3PB0A 4UTTC 3PWAA 2Y7FA 5CSSA 4PEKA 4JS3A 1UJPA 1H51A 2FQIA 1MEHA 4JEQA 4WZHA 3HB9A 1ZFJA 5D2WA 2A6LA 2V30A 4AEOA 4S1FA 4TX9A 2WNZA 1VYRA 2Q8ZA 3R5EA 3NM3A 5AHMA 3S1WA 2I9EA 1QPRA 3LRKA 1A50A 1FCVA 5F4XA 3UWVA 3TC7A 2WSRA 3TROA 1P5BA 5FI8A 1TPWA 1Q3NA 5I3IA 5IM51 1GG0A 1HO1A 2X2GA 1T8XA 4UTUA 5BW6A 1ZAJA 1WV2A 4MZ8A 1TTPA 3DFSA 4UIOA 3W7NA 4E2BA 1JRBA 3LBCA 4K8HA 2TYSA 3KVKA 1OFQA 5G1YA 1XUZA 1TMHA 1IIHA 4AXKA 2J9ZA 3PG8A 3R12A 3BG3A 2QCGA 1NEYA 2VFDA 1NFBA 1X8FA 1QMLA 5DY2A 1XUUA 3G1SA 2ATMA 2GUUA 1KFLA 3C3NA 2B7NA 1YLVA 5HUPA 2CZFA 4GUFA 3W1XA 1F7BA 5AFDA 4AHOA 5K9XA 2G5WA 2BZNA 1W3NA 4GJ1A 3G3DA 3IIZA 2X1SA 4M6PA 5K7JA 4MPQA 4FX6M 4TU1A 4HKPA 3B0PA 5A8GA 2DZSA 5HJLA 5CG7A 4EIVA 1HG3A 4XZ9A 2BX7A 2WSQA 1W31A 1SU5A 4JY9A 4NT0A 5HWJA 3G0SA 4JY8A 4FF7A 3W1TA 4ZQOA 3BG5A 4IGHA 3LHTA 5L6UA 3W7DA 1Q6OA 3DZ1A 5DCEA 4UTKA 2V2CA 1TPUA 1OX4A 3E49A 3S5YA 1QPOA 5AC6A 4GWEA 4WQ6A 1GVFA 4C1LA 1C8VA 5FF7A 3EXRA 3W9ZA 5EA9A 1K3UA 5AB3A 2VENA 4CCEA 5D38A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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