3WK2A

Orotidine 5'-monophosphate decarboxylase k72a mutant from m. thermoautotrophicus complexed with orotidine 5'-monophosphate methyl ester
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFAVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Substrate distortion contributes to the catalysis of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 85
structure length 215
sequence length 215
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3wk2A00
3CTLA 5AN7A 4ALDA 4GUJA 4POCA 4WQ6A 1XBXA 4N9EA 4JYFA 1H1YA 5I3HA 3TU9A 4O0KA 3M1ZA 3OBKA 1PVNA 1H7PA 2GUUA 3LCHA 2XFWA 4LWWA 1LOLA 4LC8A 4NQ1A 1LBLA 1OYAA 3USBA 2R14A 4I7VA 7TIMA 1QMLA 3OVQA 3GZ3A 5F4WA 2CZEA 2X2GA 5HWNA 1RPXA 2A21A 2C15A 3HGSA 4IXXA 3PUOA 3HIJA 4TMCA 2VC6A 4FNRA 3B8DA 2BXVA 1I8JA 3PWAA 1SZFA 2GVLA 4O13A 3W7IA 4JDBA 2TPSA 5D30A 3HG3A 1FUYA 1I2QA 3TQKA 3TSBA 5K9DA 1JRBA 2QR6A 4CNPA 3VCRA 1XUUA 4KFPA 5DCBA 3L67A 1SUXA 1JUEA 5I3GA 2OMAA 3WK0A 1FDYA 3NQ6A 1DOSA 3CEUA 3S9YA 4QNEA 1EWDA 3WJYA 2B4GA 3DFTA 3TA6A 3I7RA 5DBUA 3MWAA 3L2IA 1F2JA 3P82A 3NL3A 1OG0A 5D37A 1OJXA 1QO2A 5BMXA 3CIXA 3MO7A 2FJKA 1LZOA 2J9YA 1I4NA 3VE9A 1BWLA 4IMFA 1OVDA 1EP1A 1L9WA 4CCCA 4L4LA 2A4AA 4WD0A 2CZDA 4HNNA 4LUIA 4EF9A 4HIBA 2A2IA 3W1RA 3G0XA 2I14A 3GDTA 2FPVA 4O1CA 3OA3A 2ISSA 2V9DA 4EVZA 4AHPA 3NOEA 4O28A 1WAUA 4UNLA 4UTWA 1C9DA 4BI6A 3C2VA 3W74A 1OABA 4MLJA 3W1TA 2YCEA 3U6WA 2E6FA 3G8EA 3CU2A 1QPOA 4DO4A 3ATZA 3OIXA 1R2RA 3OHIA 4NT0A 4R34A 4Z0JA 3NQVA 3QPZA 3UXAA 4NZJA 4UTLA 4PFMA 1JCJA 1H50A 4O50A 2NV1A 1GG1A 3GLCA 1VC4A 3W2JA 3ZWSA 3P67A 1YTDA 2CW6A 4DO6A 3RLUA 3W73A 3F4WA 3IRDA 4ML9A 4OWGA 4JTLA 2P0OA 1UUOA 3QSRA 2Y70A 4ONVA 4ZQRA 1EA0A 2J9XA 2Y85A 4MVAA 3L68A 4O4VA 4YCOA 3EXRA 3BLFA 2Y88A 1KFJA 5F2LA 1YDOA 2J88A 4MJMA 4RX0A 4XQ6A 3WJXA 2P10A 1XBVA 2YXGA 1OFOA 1S5VA 4DXVA 1GPWA 1C29A 1R46A 3PY2A 1L2UA 2ZRUA 5AHFA 4K8HA 3L21A 2OT0A 4LS1A 2QDGA 2ZRYA 3DHDA 3L5LA 1F74A 1O95A 1H7OA 3CEPA 4LY8A 1Q6OA 4LRTA 4XTIA 1EUAA 4RXGA 2A6LA 4MIMA 5AOUA 1FDZA 3LRLA 5LHEA 2A1YA 1WBHA 1JCMP 1H7XA 1ICSA 4EWND 5CPOA 4JICA 3TH6A 1QOQA 4LVAA 3B0VC 5BNKA 4N9BA 5G2WA 3C2RA 4MUZA 4LVDA 1JRCA 1EP3A 3O05A 4GUHA 1XUZA 2Y7DA 3C4UA 3BK0A 3H53A 4BK9A 1SZNA 4JN6A 1O5XA 3NR0A 1XC4A 3TROA 1K8ZA 3UY7A 4FIQA 3TIMA 1KV5A 5C6MA 2Z6IA 1TJRA 4TX9A 1DQWA 4DPQA 3T78A 3TFXA 3O6YX 3LERA 3CWNA 3LOTA 3W23A 3GYEA 1G4TA 2PRLA 1AW5A 2FB3A 1JVNA 4AH7A 3WJZA 4NX5A 3I6RA 1HO4A 4ADTA 1SW7A 5D02A 1MSSA 1XL9A 4YMZA 4LOCA 2G97A 5K4ZA 4JY8A 3G0UA 4BI5A 4JGDA 5K9CA 1ZHAA 1FY6A 1W31A 2ALDA 4GC4A 5EMUA 5CZJA 4Z1AA 3LHTA 3LCGA 3BG9A 4IMCA 3NPUA 4O11A 2WQPA 4PL2A 5IM51 3W7QA 3TXVA 3EWZA 4ORMA 5U7SA 2WKJA 3B06A 5L6UA 1FBAA 3TJXA 3QH2A 4RK8A 1HUVA 3TSDA 3LCLA 1GYLA 4M6VA 4WY0F 1QPRA 4LS0A 3FKKA 1LROA 3GVGA 3PM6A 1H5YA 5FF7A 1FWTA 5HULA 3W76A 1JCXA 3NL5A 1CX9A 1LM1A 3E0IA 4X2RA 4E38A 1XBZA 4JIPA 3IIXA 1OK4A 3E12A 3R13A 1KFCA 3TDFA 3LHZA 3KAOA 2V30A 1VYSX 1Q3NA 3W2KA 4KFNA 2YZRA 3SGZA 1DV7A 5FI8A 5I3IA 4K36A 2JKPA 1ZJIA 1GWJA 1B3OA 4O4WA 3M6YA 1VCGA 3W72A 2C1HA 2C3ZA 5F4XA 3DFNA 3ABSA 5KZEA 5LNVA 3PUDA 2EPHA 1S5WA 3A23A 2QUVA 3HPZA 3QM3A 4UMCA 3HF3A 2OT1A 1ZCOA 3IVUA 3E49A 3T7VA 4HSOA 2QCHA 1KLYA 4XBSA 1DBTA 1M7OA 4JTJA 1TV7A 5CZTA 2XN1A 3TJLA 3GAYA 3EXSA 3QQ0A 5KMYA 5D04C 5LNWA 4N6EA 1VYPX 3P81A 1FDJA 2NWRA 3LXCA 2E77A 1TTIA 2EF9A 5EA9A 1XXXA 3GDMA 1Z41A 3LHVA 5HMSA 3NQMA 1YYAA 4N9CA 3LM7A 1EP2A 3G1VA 1PL9A 2HTMA 3UWQA 1O4UA 1WOAA 4XUGA 3W2MA 1XDMA 4K7YA 1GOXA 5LNSA 3UNDA 4WY0A 3SJ3A 3DENA 3NVTA 3W1MA 3B0PA 4Y8FA 1WYIA 2DZVA 1W3NA 4TIMA 4BI7A 3IIPA 6TIMA 2A5HA 2W79A 3W1XA 4LW7A 4TU1A 1H51A 1YADA 3TE9A 3PBWA 3RK8A 1BEUA 1PE1A 3SW6A 4UMBA 2WO5A 4NJGA 1VCFA 2E5DA 2RDUA 3EWXA 4KWVA 1IIHA 2X1TA 4X22A 4A21A 3W1NA 4JYEA 3STGA 3PBYA 1KM1A 1W1ZA 4M19A 4HNUA 3KRUA 1K7EA 2DJLA 2RDTA 2WNNA 1G69A 5F2GA 1GJPA 1SFLA 5DN1A 1ZFJA 4NNCA 3LCIA 3S42A 3K30A 4QNWA 3FYPA 2ZZ6A 3BVJA 3I65A 3RLVA 2RKXA 1VR6A 2H8ZA 5CGQA 2YSWA 2DJXA 1SW0A 3W7NA 4LV4A 4UXDA 4AWTA 1VQTA 5HR6A 5D2XA 4LT9A 4PEKA 4FX7A 1IIGA 3W6YA 1HTIA 1ZAHA 3VI2A 1KFBA 3KX6A 5HQEA 3L0KA 3UPWA 2QJGA 4JS3A 1B57A 1UCWA 3SZ8A 4WXYA 4RZ4A 4YXGA 3L66A 1EB3A 4TO8A 2A7RA 1QOPA 3LXBA 1LLWA 4OE7A 5U4NA 3V75A 1GVRA 3M0ZA 3CWOX 5C2XA 3LLFA 4UTMA 5DXXA 4DELA 3NQCA 3CC1A 2EHHA 2YX0A 3W7LA 3NO5A 1M6JA 4QITA 1A5SA 1AW1A 4JDYA 2JGQA 3B04A 2CLFA 5DLCA 4AF0A 2QF7A 1GVSA 3Q94A 4NUWA 3C52A 3NGJA 3T4CA 3QFEA 1A5CA 3SR7A 4ADUA 4E0CA 1YXCA 3G1FA 1NSJA 2G96A 3PG9A 5I3JA 2DZXA 2WPBA 4FNUA 2HS8A 3KHJA 1FXQA 4LVBA 5AHNA 4RXFA 4TR9A 3EX3A 3TX9A 3W22A 2YR1A 2VENA 3MHGA 5DY2A 4UFKA 3LX9A 3MI2A 3EKZA 1Q45A 3QF0A 4W9TA 2H90A 1WV2A 3G1XA 1KTCA 4UUIA 4K6AA 3W83A 3IVSA 3SFKA 4RR4A 1B4KA 4IMDA 1A50A 1FX6A 2YPIA 1W5QA 2JGYA 1W56A 1KFLA 4N4QA 1F5ZA 2A85A 4MZ8A 2ZZ7A 4NNAA 1H61A 2G5WA 1MEHA 3QMTA 5LNRA 5HUOA 2X1UA 4XKYB 3W1UA 1SZGA 4S1FA 3S6DA 1K3UA 3TUUA 3GXPA 3KVJA 2WSRA 3I68A 3PSWA 1GQNA 1HG3A 5H2ZA 3NM3A 2QAFA 1SZEA 2OX1A 3SY5A 4M6PA 4BR1A 2PRMA 1YPIA 5AC8A 3FOKA 5T26A 4Q32A 1P5BA 3ZR4A 3LCWA 3QC3A 3C2FA 4CCEA 2HMCA 2V2CA 4UMAA 1KM5A 1A53A 2TMDA 4UR7A 2GQAA 3BG3A 3LCFA 2WJZA 3W7MA 1TCDA 2CZFA 1TRIA 4IPJA 3L9CA 1HFBA 1Q6RA 2C19A 2J27A 1ME7A 2AAMA 4BWLC 1TB3A 3EWYA 3G1SA 4JTTA 2V81A 4NJHA 3WFAA 1RQBA 1VGAA 3DFSA 4N6FA 3FLUA 2RDWA 5FF0A 1CI1A 1OFDA 1SO3A 4MZ1A 1D3HA 3H54A 3P5ZA 4PODA 4FHAA 4ZQCA 1K03A 5L9FA 4NXKA 3MBDA 4O17A 4OT7A 3Q37A 3WK1A 2VFEA 1NF0A 3SI9A 2X1RA 3TMQA 3M5ZA 3DI0A 3TNOA 1P0NA 3A21A 1TPB1 3EX4A 4MFEA 5FF4A 3G1DA 1VS1A 2QUUA 2JKEA 3W7HA 1GVQA 4G1KA 3ABRA 1N8FA 3DXIA 1WQ5A 5TBOA 1RZMA 3RF9A 1U83A 4ADSA 3GK0A 4E2DA 4OV9A 5I3FA 3LV6A 1X6UA 1D3GA 5EYWA 3BGGA 4IMEA 4M7SA 2ZRVA 3GB6A 1FCVA 1FCUA 1H63A 2Y7FA 5CKSA 4JTIA 2ZZ3A 3C8FA 2H3BA 3HB9A 5GVJA 3CIWA 1IXNA 1F6KA 4DF0A 2R8WA 1KV8A 3DKLA 1G7UA 5FEZA 1H1ZA 1SO6A 4BF9A 2E6DA 3G24A 4N2YA 1FCQA 3EXTA 5DELA 2FQIA 3NPVA 1BTMA 4N9DA 5C55A 5FEWA 5AHMA 5A5WA 5IBXC 4QSHA 2B7PA 5DBTA 1F76A 3UYCA 3PBVA 2FB2A 4AXKA 4JIQA 2ZTKA 2ZRXA 4WX2A 2ZA3A 2J24A 3NPWA 3ABQA 2ZZ2A 1Q6QA 2V8ZA 1RQHA 1YXDA 2WSQA 1Q6LA 2QCEA 3YPIA 3ANYA 5K3VA 1X1ZA 3FKRA 5AHEA 3TFCA 4K38A 1JCYA 3B03A 1SO4A 5SWUA 3QSTA 1SW3A 2X16A 3MHUA 1XKYA 3LHYA 2HS6A 1SQ7A 3FEMA 4XWUA 3IEBA 1VLWA 1TV5A 1J5TA 5CSSA 3FJLA 1MEWA 3SIZA 8TIMA 1PCKA 1WA3A 1QDSA 4Y6GA 3M47A 1G6CA 3DFOA 1SSGA 1KM6A 1TPWA 3F1QA 5C54A 2PE4A 5AHLA 4CNOA 5HJLA 3LDVA 1ZENA 1W0MA 1QR7A 3UWYA 2VFHA 4ZQNA 5CPLA 3WK3A 3STCA 4XBKA 4FIRA 1G4PA 1YTEA 1ML1A 3NNTA 2YGYA 4UFJA 6ALDA 3UY8A 2C6QA 2Y6ZA 4I7UA 4A3UA 4IXHA 2DU2A 1UASA 1X7FA 3BG5A 1OX6A 1P0KA 3W07A 3IIOA 1SU5A 1HO1A 1KTNA 5CZSA 3LBMA 4M5PA 1I2PA 3EWWA 1MO0A 3O06A 2PURA 5KZMA 4QJ1A 4UIOA 3W87A 1W5PA 5IBXA 5AC6A 3PVFA 1JUKA 2CLMA 4A22A 3M43A 4CQAA 3O1NA 2ZRWA 1FWWA 2XN2A 4CLMA 1DL3A 1GEQA 5KTLA 4EOUA 1MZHA 2ZYFA 2QCMA 4K8EA 3M5YA 3S5NA 3VNDA 3TQ0A 4HSNA 2NV2A 4R33A 3MP3A 3KRSA 4ICNA 4BFAA 3N2XA 1F05A 4ZQOA 1UUMA 3INPA 1QAPA 2KZHA 1JUBA 2CLLA 3HBLA 3LB0A 5J5DA 3DAQA 3NXFA 3QYQA 4AWSA 4HHPA 5AC7A 5CSRA 1JCLA 3M5XA 4UR8A 3A5FA 3CPRA 5F1VA 3AO0A 3KFTA 1VCVA 2CFFA 4IUOA 1Z48A 3O07A 1QFEA 4IX0A 1OYCA 3OVRA 4HPJA 2E6AA 1GT8A 4Z1DA 2F84A 2NX1A 2WSYA 3S0CA 3EEGA 2V5BA 3SSJA 3IV3A 4LVFA 2BWGA 3O6CA 3C3NA 4R53A 3BW2A 2VXNA 3KVLA 3W7DA 3LTYA 1THFD 3P74A 1X8FA 1W54A 4X3ZA 2FPTA 3EX1A 1G7VA 1H7WA 4IPIA 4RZ5A 2JKAA 2O7SA 1WX0A 2BLEA 3BW4A 2VOMA 3TMLA 1ADOA 5BOOA 3W7PA 1O94A 4JXCA 5D2YA 2CZ5A 3THQA 3M16A 3GIYA 3E02A 1TTQA 2TSYA 4Y9AA 1YXYA 2B7QA 4R7JA 2IQTA 1ME8A 1TPH1 4ORIA 1WDWA 2A7NA 2RH9A 3M7WA 4O1BA 2F7FA 4NU7A 3P84A 4P61A 4WUIA 4MPQA 1F6PA 3CQ0A 3HGRA 3KRZA 4FNPA 3BO9A 3W9ZA 3NM1A 3LXAA 4MZYA 4IWWA 4OHQA 4P2VA 3W7JA 4ZQMA 3S1VA 1G4EA 4NXSA 3NG3A 3R5EA 4LV9A 5D2TA 5LHFA 4DQWA 3FYOA 5HUPA 1QNVA 3DBPA 3F03K 3LRKA 4RLIA 2ZZ5A 1ZAIA 2E5CA 3LBCA 3UD6A 1MEIA 4UTIA 3O8AA 1I2OA 5EBUA 1KBIA 2OJPA 3MMTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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