3WK3A

Orotidine 5'-monophosphate decarboxylase k72a mutant from m. thermoautotrophicus complexed with orotidine 5'-monophosphate ethyl ester
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFAVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Substrate distortion contributes to the catalysis of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 83
structure length 215
sequence length 215
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3wk3A00
3QMRA 3G8RA 3E49A 1B57A 3GX9A 2ZRWA 1LOLA 1EB3A 1O60A 3FJ6A 3ABRA 3GR7A 1W54A 3NQ2A 3C52A 3TNOA 4O1DA 4DO6A 3GDLA 1IXOA 2ZZ7A 3DFOA 3EXSA 5DN1A 1LP6A 2FJKA 3W7CA 2QCCA 3GXNA 4FNTA 3ABSA 3CQ0A 1OYCA 5DXYA 4A2RA 1YLVA 3W7JA 2Z0IA 1JR1A 2FQIA 3GKFA 3W88A 1KFBA 3KRUA 5G1YA 3FOKA 3P62A 5KZMA 4RZ5A 4LU0A 4IGHA 3A9IA 1G4PA 3M41A 2P1FA 1ZJIA 4QISA 1TPUA 1RR2A 1H61A 1GWJA 1ZENA 4Z1DA 2WSRA 1UB3A 3EX1A 5KZEA 3L68A 4ZQNA 1KFJA 4LUIA 3RNDA 1G7VA 1D9EA 3DFTA 3MHFA 4UTHA 4LTSA 5CPOA 5BOOA 4UFMA 2F84A 4K37A 3B0PA 4RV8A 5F2MA 3NNTA 2QUUA 4JY9A 4NNAA 3VNDA 4PODA 3R89A 3OBKA 3W70A 4NXSA 2PRHA 2Y88A 1E51A 3A5VA 4FNRA 4D2JA 2H8XA 1P1XA 3HG4A 3BW2A 2EGZA 2V2CA 4AF0B 2DZUA 3NQ6A 5G2HA 1R46A 2WV8A 2J27A 4HT3A 4O54A 3UY7A 4HN4A 3TW7A 1W5OA 3LTSA 3PY2A 4LV9A 2E1DA 1FWNA 1JQXA 3HPXA 2H90A 2V2DA 1FQ0A 3W72A 1B3OA 4DPPA 3I7SA 5I3GA 4MLJA 3DKJA 5D2XA 4OT7A 1L6SA 4Z1BA 3U8GA 3IIVA 1H51A 4ZQMA 1G6CA 1LLWA 1FWWA 1TCDA 3O1NA 3N19B 3I6RA 5SWUA 1BKSA 1QOPA 1FUYA 2NX3A 3ZWSA 3U2OA 5F4WA 3GIYA 2DZPA 1TPDA 1ZAJA 2ALDA 4QIUA 2VFIA 2I1OA 3HG2A 1W1ZA 3EXRA 2RDWA 3T40A 2YCEA 3BW3A 3HG5A 1KFKA 3IVTA 3HB9A 3W7NA 4AMAA 3M1ZA 3S1WA 2R94A 4ICNA 4XTDA 3FIGA 3W22A 3NQMA 1OK4A 5AYYA 4M7TA 3MI2A 4JR5A 4K39A 2QKFA 4TIMA 1P4CA 4UR8A 3BW4A 2H6RA 3M5YA 1Z42A 3P80A 4QJ1A 1WQ5A 2QJGA 3G1XA 1GG0A 1B4KA 1FCBA 4WOQA 3BVJA 3VKJA 3IV3A 4K8EA 3W86A 2OT1A 3NM3A 3TC7A 3EWXA 1VH7A 1S5WA 3G1FA 1K03A 4HPXA 1IXNA 3TQ0A 1KA9F 1TPFA 4MOZA 3T78A 1A5BA 3P60A 3PUOA 4XQ6A 3CC1A 1KBIA 2YXGA 1GVQA 1NF0A 5CGQA 5LSMA 3W1TA 3G24A 4LVAA 1QFEA 3UXAA 4Y6GA 1O5KA 3IIOA 3PB2A 1X8FA 5I3FA 3L2IA 4S1FA 4HKPA 1TTQA 2YDAA 1N55A 4TMCA 1DKWA 1MO0A 2G5WA 2VEPA 1K3UA 1SW3A 1EP2A 1F6PA 1KFEA 4O16A 3SIZA 1QDSA 4FXRA 2DZVA 2OX1A 2XN2A 3LLDA 5FF3A 2ZBTA 1V5XA 3NO5A 2ZZ1A 4M6QA 3ABOA 3L65A 3KX6A 4JICA 1L6YA 4JYFA 2B7OA 1AG1O 2A85A 4UNLA 2ZTJA 1VC4A 4UUIA 1RVGA 2R8WA 1X6UA 1UUOA 3EKZA 2RHGA 3KAOA 1ZAIA 2OMAA 4N9EA 1JCJA 3W9ZA 4BI7A 1HUVA 2ZZ5A 2E6AA 3NL2A 1KLZA 4ZMGA 2VKZG 2AQWA 4CQAA 3CM4A 1KM0A 4A2SA 2QCLA 4JD4A 3GXPA 2NWRA 1SW0A 3TH6A 2RKXA 5FF7A 3EWUA 3F4WA 3L5MA 1MEWA 3SW6A 2XN0A 4LS2A 1GZGA 3L21A 4UTWA 1LRTA 3W7IA 4AWTA 3UZ5A 4E2DA 1DL3A 4UTTC 1I2QA 5CPMA 3HQ1A 3PVFA 4OU1A 5FF4A 4X2RA 5AHMA 3GAKA 3NQ7A 3BARA 2A2IA 4O13A 1YPIA 2ZZ3A 1ALDA 4A3UA 1JCYA 3KRSA 4M6VA 4ZVJA 4GUHA 3W7QA 2RDTA 1K8ZA 3NAVA 3W7KA 3W2NA 2EKCA 5LNVA 4JX6A 3LHVA 1YDNA 1KTNA 1KM1A 1C29A 1M5WA 1Z41A 1Q6OA 3E12A 4TU1A 1B4EA 5G1TA 4MZ8A 1QMLA 5I3JA 4DBEA 2EAWA 1FXPA 2GQ8A 4NJGA 1NAL1 5F2IA 3LCGA 3TW6A 2OZ0A 2GQ9A 3W74A 1OK6A 1SO4A 3UPBA 3QM3A 4Q32A 3QFEA 3B8DA 4OQVA 1D3HA 3ZWTA 4IPJA 4IQLA 4CLMA 2V8ZA 2P10A 4FEZA 3TU9A 1TPH1 4O0KA 3STCA 1UCWA 2V82A 1SO3A 3TKFA 1OG0A 3GZ3A 3N3MA 1AL7A 2FPVA 4E38A 2EPHA 2X16A 1SR9A 2ZCGA 3P5ZA 3TE9A 1HG3A 1L9WA 2RH9A 2VFEA 1H50A 3GKAA 4YXGA 4GUGA 1VZWA 3W7DA 4FNQA 1A5SA 2CLIA 2TYSA 3WK0A 1LYXA 3G8EA 3UWQA 3WJZA 1EUNA 4Q33A 5AYXA 4LRTA 3C6CA 4S2CA 1H1YA 3QEZA 2PC4A 1SPQA 3NPXA 3P8IA 3C8FA 1TMHA 3W7MA 1KM6A 1I2RA 3V1PA 3UWWA 3PG8A 4MY8A 2HSAA 3FFSA 4FIRA 3STEA 1WXJA 4UTTA 4XBKA 2ZTKA 1T99A 4JTHA 3QPYA 3T7VA 4UMAA 3NDOA 2GJLA 2ZRZA 2BZNA 5EY5A 3CWOX 3W83A 3CLMA 2Y6ZA 3LB0A 5HNRA 2CU0A 3DZ1A 3EXTA 1TJRA 2XFWA 4Z1AA 3NEVA 1XBVA 2Y7EA 1WBJA 5E93A 2Y89A 3BK0A 4XTIA 5DCDA 4AHOA 2ISWA 3O8AA 2ISVA 1WDWA 5DBUA 4WUIA 2ZZ2A 3SSJA 5LHEA 3MI3A 1TYGA 4RXGA 4ADSA 3BGGA 6TIMA 4K8HA 4QQ3A 1JJKA 3UWUA 3FA5A 3GDRA 2QCFA 3T4CA 1VCGA 1XFBA 3W71A 2RDUA 3QF0A 4M7SA 3MBFA 4UFIA 1RZMA 2QCGA 5FESA 4KFNA 5C55A 4O18A 2QCMA 2F7FA 3FKRA 4DPQA 4ZL1A 3KVKA 3Q2DA 1H62A 3NG3A 3W84A 4UTJA 1PHQA 1QPQA 1GTEA 3S5OA 1RD5A 3T44A 4NU7A 1RPXA 1TO3A 4NJHA 4MUZA 1GPWA 2C13A 3PBWA 3I65A 1IIHA 4N9CA 2Y7FA 5LNWA 2X1SA 4GC4A 1TPVA 3BLFA 5KSWA 3NQVA 2ISSA 2R14A 1SZEA 4K36A 4S2BA 2FB3A 4PTNA 5TBOA 5AHFA 1XUUA 3N9RA 2IQTA 1IGSA 1R2RA 1LBMA 4IX2A 2PE4A 3PS7A 2PRMA 3NQCA 5ABTA 3NL6A 4FX6M 3S0CA 3KVMA 4HHPA 2D73A 1PHWA 2G97A 2J9XA 4N2YA 4WOZA 3L0GA 1W5PA 4WQ6A 4ZZ9A 4PH6A 3LCHA 4NZJA 3KOFA 5C2XA 1VYSX 2WNZA 2ZA1A 1QO2A 4QNWA 4XBSA 3NZRA 1QO5A 1OF8A 1OFAA 1TV8A 4H3DA 1F05A 4O4VA 3SFKA 3JS3A 2FPTA 3HMJG 1LTDA 3N9SA 3RFAA 3S9YA 3C0JA 4I7VA 1YADA 4JS3A 1KM5A 5HUPA 3VI2A 2E6FA 1PVNA 1AW5A 4NZFA 5CPNA 2B4GA 3ZS4A 2FTPA 1WOBA 5G5IA 1DQXA 3W7RA 1H63A 3M7WA 2CZ5A 3LTYA 5FEWA 3EWBX 1WOAA 3FLUA 1JUBA 3H53A 3NQDA 3GDKA 4WX2A 5KMYA 1GOXA 3C2RA 3M0ZA 5BRBA 4JTUA 5L9FA 1NSJA 1VQTA 1TREA 4GBUA 3HGSA 1DBTA 5TIMA 3BG9A 4K6AA 4GNJA 3P7YA 4IMCA 3FKKA 3W85A 1U5JA 4NNBA 3E9AA 3WJSA 1P0KA 1W37A 3MHUA 3G1DA 1ADOA 3O6CA 4PFMA 1YDOA 2R91A 2C18A 3B0UX 2NX1A 4W9TA 2A7PA 1UJPA 1W3NA 5FI8A 1FCUA 1YTKA 3S1XA 5LHFA 3IGSA 3TMLA 3MP4A 3L0NA 4LRSA 1Q6LA 3GNDA 3TROA 3IIZA 3W07A 3CT7A 4HNTA 1FCVA 4X3ZA 4MLRA 2ZRVA 4JXCA 4TO8A 5L6UA 4CQ8A 1VLIA 4LVFA 1JUEA 2HS8A 4YCPA 3NL5A 4DO5A 4GFSA 4DELA 1YTEA 3W3OA 3W1NA 3G0SA 2JKEA 2QDGA 4UTMA 2HMCA 1ZY9A 2ZFAA 2A6LA 4DEFA 1TV5A 1L2UA 3TMQA 5D02A 5FF0A 1CI1A 3NQGA 4ZQRA 4FNPA 4JN6A 2CLOA 1YDVA 4GUIA 3Q94A 5I3KA 5H91A 2Q3RA 3G18A 2JKAA 1GTHA 1AL8A 2ZDRA 3RF9A 4MYAA 1H7NA 3TR2A 5AB3A 3DFQA 1U83A 1QAPA 2FPYA 3W7EA 1K8YA 1TPC1 3GR8A 1T0OA 3R12A 3TIMA 2WO5A 3MP5A 3G1YA 5AFDA 5DLCA 2WOQA 1SFJA 2C14A 1FWSA 5EPDA 5K9XA 1FCQA 3LCLA 3A22A 3UXDA 1SSDA 1BTMA 1FX6A 1LRNA 3ATZA 4GRSA 1QPRA 5CSRA 3LHTA 2XN1A 3EWZA 3UWYA 2A7NA 1YXCA 4HNVA 4GXMA 2BXVA 3DBPA 1ME7A 3SI9A 2YYTA 1LDCA 1R2TA 4JGDA 3SR7A 2TPSA 3O63A 5AC7A 4JTIA 1KV8A 3R8RA 2C0AA 3MP3A 3LHWA 2B7QA 1J4EA 3M5ZA 3F4NA 4IWWA 2E09A 2FFCA 3UNDA 4GUJA 5D04C 3L5AA 3TXVA 1THFD 3G0XA 1MEHA 4LVGA 3C56A 1MSSA 4UTWC 1WX0A 3BG3A 4TMBA 5I3HA 2CFFA 2CLKA 4Q4KA 3MWAA 5KITA 1GJPA 3S8HA 3IGXA 3S1UA 1XC4A 1IIGA 1EEPA 3EWYA 3WK3A 2NX9A 3DFSA 1XUZA 2DJXA 2Y63A 3B0VC 3DAQA 4UC5A 2E6DA 4NXKA 1EWDA 4EVZA 1AK5A 2P0OA 5EL1A 2QR6A 1M7OA 4BFAA 1TTPA 1AW2A 1TJPA 2DJLA 5A5WA 3MUXA 1NEYA 1GVRA 2JBMA 3CEUA 1CX9A 4IMDA 2O7SA 1G69A 4HSNA 4Y90A 4LOCA 3NQAA 3M44A 3RMJA 2GVLA 3H55A 2Y7GA 4RJEA 2QCHA 5G4EA 3NGJA 3EKLA 5DY2A 3SECA 4B5NA 1W5NA 1SZFA 4TR9A 4JX4A 3WJYA 2VXNA 4HIBA 4MY1A 4OV9A 3KFTA 4ORMA 1KM2A 4EIVA 1ZNNA 5AHLA 3S42A 2NUXA 2JKPA 4MKNA 3R5EA 1W5MA 1Q45A 2FDSA 3E0IA 1W31A 3VFLA 3ATYA 4BI5A 1QWGA 1KV5A 3PC0A 4LUJA 4DF0A 1FDYA 5F2LA 3B06A 4HNUA 1X1ZA 2GUUA 5D09A 4NQ1A 2TMDA 4LC6A 4FF7A 4FHAA 2PRLA 2G95A 3LCIA 3GVGA 1T96A 3QJAA 4GUFA 4HPJA 5K4XA 2W6RA 3LHZA 4BWLC 2CLEA 3AJXA 5EKYA 4RXFA 1KTCA 2C15A 2V5LA 5G2WA 1K7FA 4CNOA 1KBJA 2RFGA 2VFGA 4I7WA 5FEXA 2A5HA 3OHIA 3A23A 4JTFA 1MEIA 4EWND 1DQWA 1T8XA 2NUWA 3LX9A 3DI1A 4K7YA 1W3IA 2YPIA 1DJQA 3S5NA 3IVSA 4R7JA 4WZHA 2VEMA 3Q58A 5D33A 4O53A 1H1ZA 5F4XA 3QSTA 3BLIA 3GYEA 4HNNA 5H2ZA 1HTIA 3LERA 4LW7A 1ME8A 4RKAA 1I2PA 4AHQA 3QQ0A 4JDYA 3I68A 1KW1A 4PL2A 3M5XA 1NFBA 5AHIA 3FJLA 4RZ6A 5HR6A 4EF9A 2E5CA 3NQEA 4Z0JA 3P82A 1K7EA 1ZHAA 1HO1A 4JTGA 3TAOA 3DENA 1EPXA 3M9YA 3O07A 2V2HA 3QMTA 4Y9AA 3TSMA 3BG5A 5E1QA 3GNNA 3HG3A 3UPWA 1I8JA 1OJXA 2Q3OA 3UD6A 4AXKA 4BR1A 5IBXC 3C4UA 4FX8A 1WAUA 4WY0F 3W7HA 5A8GA 4QNEA 5EYWA 3P5YA 1RQHA 3DGRA 3N2MA 1OFBA 1YXYA 2C1HA 4R53A 3MJYA 4KWWA 4MZ1A 4XWUA 2C3ZA 2ZRUA 5D05A 2YW3A 4KFPA 2V30A 5D38A 4O8RA 5AN7A 3HJZA 3P84A 4LNYA 2W0UA 4MJMA 1F2JA 4RLIA 3RLVA 5BMWA 5FEPA 2CZDA 5DCEA 2X1TA 1ONRA 3QW4B 1YTDA 2BSLA 4UTLA 3UQNA 4IX0A 3TSDA 3UZJA 1I2NA 3INPA 5EMUA 5D32A 4BWLA 5CG7A 2QCDA 3BV4A 1VYRA 3B04A 4CCEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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