4A21 | Genus

Total Genus 115

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	115
sequence length	342
structure length	314
Chain Sequence	PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNLRPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLT

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE
publication title	Glycolytic and Non-Glycolytic Functions of the Fructose-1,6-Bisphosphate Aldolase of Mycobacterium Tuberculosis, an Essential Enzyme Produced by Replicating and Non-Replicating Bacilli pubmed doi rcsb
source organism	Mycobacterium tuberculosis
total genus	115
structure length	314
sequence length	342
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2011-09-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4a21A00

5AYYA 1LORA 1NEYA 1XDLA 4AHQA 2B0MA 1B3OA 1DOSA 5BNKA 3PUEA 2FTPA 1VQTA 2QUTA 1YDVA 4MZ1A 2QDGA 3VE7A 4QQ3A 1EIXA 4N2YA 1FWSA 1I4NA 4RZ4A 3V75A 3AJXA 4JTTA 5D32A 4EWND 1JCXA 4Z08A 5T26A 3ANYA 4BI7A 3W75A 3IGSA 1JUBA 3OG3A 2JGYA 1MXSA 3KVKA 3CWNA 2QUVA 3G1DA 2VOMA 3E12A 1GG0A 1EPXA 4N9DA 4N02A 1EWEA 1QFEA 3NGJA 3T40A 4YXGA 3CEPA 2J27A 5FF3A 2Y7GA 3G0UA 3QZEA 4MKNA 4K37A 4OGZA 2X1SA 5E93A 2NWSA 3BW3A 3TV8A 2NUYA 3N2MA 4XWUA 1JCJA 2GVGA 3PR2A 3S1VA 3PUDA 3NL3A 5IBXA 2E6YA 4JD4A 3FOKA 1LRQA 3UZ5A 3LV5A 1K7EA 4XBKA 3G8RA 4BWLC 2EHHA 4IMGA 4LOCA 3W7RA 6TIMA 5HJLA 5HQEA 3W7NA 1SW7A 2WOQA 4Z1AA 2C1HA 1RR2A 4UTTC 3EX2A 2GQAA 1G4TA 5DCEA 4BFAA 4Q32A 2FQIA 5LNSA 3UNDA 4MYXA 1WQ5A 5HINA 1M6JA 4RXFA 4O4WA 1KM3A 3D0CA 2HSAA 3NA8A 3CQ0A 5E1QA 2DU2A 4PODA 2Y7EA 4O17A 4YMZA 3GZ3A 3BG9A 2VFFA 3TQVA 3NQVA 3NPVA 2TPSA 5AHIA 1JQXA 2ZDRA 1G6CA 2Z6IA 4ADUA 2WKJA 5DY2A 3T55A 3MP3A 1VHNA 4JNMA 1WBHA 1SFJA 1C9DA 3A24A 1YXCA 3O63A 2Z2UA 5BMXA 4GRSA 3F4WA 2E6AA 5D30A 2YFOA 4NVTA 1NVMA 3P5ZA 1JUKA 1LOLA 4LVAA 3TXVA 3C2FA 3C2OA 2ISWA 2X1UA 2VFEA 3RLVA 1P1XA 1GVRA 3DFPA 4A2RA 2NX1A 2G96A 4NNCA 1H61A 5KMYA 4HPXA 4N4PA 3W1TA 3DZ1A 4LVGA 3W3OA 1EA0A 3GNDA 1SSDA 1JUEA 4JX4A 1XCFA 2JBMA 2FB3A 2F7FA 3FS2A 2AGKA 1VPXA 1TPH1 1ICQA 2OMAA 3ATYA 1D3GA 4WD0A 3W7HA 2A7RA 4AHPA 4ORIA 1OX4A 5IBXC 3C2RA 3B06A 3IRDA 4KKXA 4JTFA 1RQEA 4GFSA 1OX6A 1HUVA 3RNDA 3C56A 3PG8A 2WSYA 1TV7A 1WDWA 1V5XA 5K2ZA 2YFNA 3KFTA 2V81A 5E0KA 4MZ8A 4QISA 1TREA 2FPVA 3BG5A 3E49A 1H7WA 3W71A 4FXSA 4JDYA 3C3NA 4XTIA 3L0GA 2BLEA 3MYOA 3LRMA 3NO5A 1S5WA 1U5JA 4O15A 5HWMA 3FKKA 1F2JA 3LX9A 3GAKA 4JTKA 3W7DA 3G8EA 2OZ0A 1AL8A 2JGQA 5F1VA 1DL3A 5U7SA 1K8YA 4RK8A 4UTHA 1WOBA 4WY0F 2J9XA 3EWXA 3N9SA 3TSDA 1JULA 1VH7A 1ME9A 1DKWA 1KM5A 3FA5A 2FIQA 1KLYA 1GVQA 1UB3A 3BGJA 2ZRZA 3RK8A 4UTKA 1XM3A 3E02A 5KSWA 3TUUA 3KX6A 5HUPA 3M5VA 1W3NA 3DFNA 4GUIA 1VYRA 3DENA 5D2XA 3NPWA 3W87A 3W74A 3BW2A 1FDZA 4X22A 1LLWA 5KITA 2V0TA 1L6SA 1OF6A 1W3IA 4JTLA 5C54A 3MBDA 4M5PA 3WK1A 3UWWA 3MMTA 2E1DA 2NXIA 4GNJA 4JICA 4FX6M 3M6YA 2KZHA 3NQMA 1MSSA 2WSRA 3QJAA 4IPIA 3GKFA 3W86A 1FX6A 5IM51 1CI1A 5D2TA 2DZTA 1F05A 2JKEA 2VEKA 3S42A 1LOSA 1D3HA 4K6AA 3NQGA 2FFCA 4DO6A 2X1RA 1FCVA 5LNRA 2OX1A 4O52A 1KTCA 5D09A 2QJGA 2V5LA 1TB3A 5G2HA 1N7KA 2GJLA 2NUWA 4NXKA 3TFCA 1GOXA 4DEFA 3CIWA 5AHFA 3TXZA 3CM4A 4MFEA 2C14A 3L5LA 3FEMA 2H90A 5BOOA 4UTWC 1GZGA 2ZA3A 3PAJA 3S0CA 1A53A 5F2GA 3DHDA 1K7FA 1Q6LA 1R2SA 1VS1A 5C6MA 5F4XA 4PH6A 3WJYA 1QCWA 1I2PA 1X8FA 2A4AA 3LHVA 4OE7A 4LY8A 2B7NA 4E2DA 1SFLA 3HPXA 1P4CA 1BTMA 4UTLA 3W1PA 1TRDA 1TJRA 1TV5A 5I3KA 1G7UA 4I7VA 1KM1A 3QM3A 3WJXA 2A7NA 1QO5A 1TPVA 1WAUA 2G5WA 5G1TA 4PEKA 4PTNA 1OG0A 1L9WA 4XQ6A 4WQ6A 2WNQA 4XUGA 1M5WA 3KRZA 3L67A 3W1XA 2HMCA 4GJ1A 1AW1A 4L4LA 4TU1A 2YYTA 2RDWA 1FBAA 2Z6JA 3GAYA 3HGOA 2ZRWA 5K7JA 3UWUA 2V30A 2DZPA 2XN2A 4O57A 1TQJA 4MY9A 3EWUA 5HUOA 1RZMA 3OIXA 1KV8A 4M6QA 4OHQA 1GJPA 2ZRUA 2ZFAA 1K7XA 4A3UA 3QH2A 4R53A 3O15A 3WFAA 1JJKA 4UCGA 1FUYA 5GVJA 4AXKA 4N9CA 3I7RA 1LBMA 2BTMA 3HPZA 4GE8A 5CPOA 1G4PA 5LHFA 4JGDA 5KINA 4O0KA 4LS0A 3S8HA 2YX0A 3P8IA 1N55A 1W56A 3O8AA 2QUUA 3UXDA 2W79A 5K9CA 1D9EA 4NX5A 4QAIA 3NR0A 4JYEA 1W5QA 3LCGA 3LHZA 1PIIA 3T78A 4PA8A 2PCQA 3SW6A 2YSWA 1LLZA 5CSSA 2CLFA 2E09A 3QC3A 3VE9A 3W1LA 4FNQA 2J6XA 4O12A 3S1UA 3BW4A 3UZJA 2W6RA 4O11A 3THQA 2QJHA 4LS1A 5LSMA 1OFRA 3P8JA 4NNBA 4N9BA 3G3MA 1FY6A 1OFOA 3MJYA 1OABA 5AHLA 4K7VA 3L9CA 3M9YA 4CNOA 1KW1A 5EPDA 5I3GA 4M19A 4ZZ9A 4K7YA 3GX9A 4IPJA 2I14A 5HR7A 3Q58A 2VC6A 2CZFA 2WO5A 3NOEA 3UWQA 2QF7A 3SY5A 3QYQA 5A5WA 1PHWA 3C52A 2VFGA 2NV2A 5EL1A 3BO9A 1ICSA 2G95A 1JCMP 4FO4A 5CSRA 3RLUA 3DXIA 3PULA 4O0ZA 1DV7A 4IXXA 2QAPA 3QW3A 3W7GA 3MO7A 1XDMA 5LGZA 3W72A 4HNNA 2CU0A 1KM0A 2GVJA 3O6CA 1SW0A 3LI1A 3PY2A 2QDHA 1G69A 3SGZA 4MJZA 4NJGA 2C16A 4NNAA 3HO8A 1UUMA 2E5BA 2A7PA 3GNNA 4BWLA 1GTHA 2DZUA 3TFXA 1OJXA 4AF0B 3P67A 5G5IA 2J9ZA 4MY8A 4UR8A 2ZTKA 4DPQA 3PC0A 1HG3A 3QMSA 2ZZ5A 3MP5A 4Y90A 1SPQA 5HWNA 4YCOA 3R2GA 4Y9AA 4RXGA 4IOTA 1FCBA 2A21A 4H3DA 2Y62A 4QITA 1YADA 4X2RA 1LROA 1YDNA 3KHJA 1P0NA 2ZA1A 3UD6A 3W07A 1Q6OA 1LM1A 2R91A 4POCA 2YXGA 4O50A 1WA3A 4XZ9A 3UWZA 1TPUA 4AF0A 1YTEA 3I65A 1NFBA 3PS7A 3PBVA 5CZTA 5KZDA 3DBPA 1F6PA 1VLIA 4IMCA 4O4VA 4CQ8A 4D2JA 5F2LA 4CNPA 4GUHA 2QCHA 2CFFA 2Y70A 3GXPA 2DZWA 3GXNA 1KBJA 3M5XA 3ZR4A 2WV8A 3EWWA 4O54A 5L9FA 4FNUA 5D03A 4O53A 1XFBA 4JDBA 3F4NA 2QAFA 4GXMA 4EVZA 5BW6A 1BWKA 2Y88A 3QRHA 3C2VA 1IIGA 4I7UA 3DKLA 4HN4A 3NQ6A 4ZL1A 3RMJA 4JTSA 5FI8A 4R34A 1FXPA 4EF9A 3LCXA 2QKFA 3UY8A 1AW2A 3I7QA 3NQ7A 3UPWA 1THFD 2QCCA 2P1FA 4O1AA 1KM6A 4IUOA 2B7QA 1YLVA 3M5YA 3I7SA 3HGRA 4OV4A 5AYZA 2R8WA 1IF2A 2FLIA 1W31A 4JN6A 3EXRA 3L66A 4IMFA 4JIQA 1S3HA 2Q3OA 3TH6A 3CC1A 2WNZA 1R47A 3G1SA 4NX0A 2A5HA 1H63A 4CQ9A 2B7PA 1ZY9A 4JX5A 5EKYA 1KA9F 2PRLA 5FF7A 4IX0A 1OFDA 4U28A 5AHEA 4KFPA 1Z41A 1LDCA 1R46A 4FF7A 3B4UA 1FWNA 1IGSA 1T8XA 1TSIA 3LXAA 3HQ1A 2P10A 3TW7A 3WJSA 3G1XA 4DQWA 1RVGA 3NAVA 3UY7A 4MOZA 1RQHA 3NQFA 4NZJA 3ZFHA 1XBXA 4JYDA 5C2XA 1KBIA 3MI6A 4UNLA 4UMAA 4O1DA 5G2WA 3O06A 3ZWTA 3PSWA 4DO5A 3M47A 3E9AA 5AN7A 4NZFA 4MLRA 4ZQNA 5HMSA 2YCEA 2DP3A 1TTQA 4IMEA 3A9IA 1P0KA 3C2EA 2I9EA 2QCEA 3LCFA 1Q3NA 3NL6A 1O5KA 1QWGA 4I9AA 1EP2A 4HNVA 4TMCA 2RFGA 4MY1A 4JTGA 3BG3A 5TQLA 1FWRA 1H51A 3HG5A 2ZTJA 2YW3A 3TNOA 1FXQA 4OT7A 2X16A 1LYXA 2NLIA 4HKPA 1OFBA 3IIVA 4A2SA 4MVAA 4UTMA 3QSTA 3O07A 1FQ0A 4TO8A 2HS6A 1TTJA 3L2IA 3CWOX 3DGRA 1GG1A 3NQ2A 2BXVA 5CGQA 3TROA 3QMTA 3MI3A 2WSQA 4HT3A 3CTLA 3W2NA 1JRCA 4DF0A 3TU9A 2Q8LA 2RH9A 2DZXA 2YZRA 3OVPA 4FNPA 1YXDA 3U8GA 3G1YA 4PCFA 3I6RA 1NAL1 3HG4A 4TR9A 3W7EA 2CLKA 1WYIA 1TPC1 3A21A 3KVJA 1VLWA 5K4ZA 2Y85A 1MEHA 4FX7A 2TMDA 1LP6A 3PF3A 5D05A 3G22A 5D2VA 3W76A 4TMBA 2J9YA 5EBUA 1DHPA 2XFWA 2RDTA 1LBLA 1CX9A 1OYAA 3MWAA 2QCNA 3FJ6A 1E51A 3LRKA 4IJBA 2GPTA 3LBCA 2NWRA 4DBDA 1LBFA 3SIZA 3RF9A 2R94A 3ABSA 3BPWA 4Z0JA 4UTWA 4HSNA 5I3JA 5LNUA 2BSLA 3EXSA 3M1ZA 4Z1DA 2R14A 1PHQA 3B04A 3JRKA 1VYPX 1BEUA 3HGSA 3CEUA 2QCMA 2Y89A 4OWGA 3SJ3A 4MYAA 1XI3A 2VXNA 2H3BA 1BKSA 1ONRA 1ZCOA 1PE1A 1XBZA 4DELA 4UFMA 3FIGA 3LCHA 5FF0A 1NSJA 3QPZA 4O10A 1VYSX 4LS2A 1Y0EA 4H6KA 2CZEA 2ZRXA 4FIQA 4NJJA 3P84A 4PL1A 3EWBX 2VFIA 5H2ZA 1UASA 1SZGA 2E68A 3LGEA 1W8SA 5FEWA 1FDYA 2DORA 3UXAA 3TC6A 3NQEA 1T99A 1VCVA 2V5BA 3O6YX 3W7LA 4AAJA 4NU7A 4WX2A 1J4EA 3W1UA 3AO0A 3TCEA 2GUUA 4O14A 5D37A 4C1KA 2ZQ0A 4CCCA 3TE9A 4IQLA 3PBWA 4IXHA 2PURA 4JTEA 1ZFJA 4KFOA 4O18A 2E5CA 1ADOA 1MO0A 1H50A 1OF8A 1QPNA 2ZZ3A 3W7CA 3W7PA 3O6DA 3Q37A 2DJXA 3MI2A 1DVJA 1KFEA 4NJKA 4JIPA 5AHNA 3W7KA 2H6RA 3NM3A 4K8EA 1VC4A 2YR1A 2GJNA 5FF4A 3EX3A 2CZ5A 1GVOA 3HGJA 3IV3A 1YTDA 2QJIA 3G3DA 3UWVA 4X3ZA 1JCNA 1TCDA 3W23A 3W1MA 5EYWA 4P2VA 4B5NA 5AHMA 5EA9A 3L21A 2ZZ2A 4NJIA 4UTUA 3KOFA 3L5MA 4OU1A 1HFBA 2Y61A 2C13A 3P81A 2EGZA 3DHFA 2J88A 3USBA 1DJNA 3CU2A 3K30A 1OFEA 4KWVA 1ZNNA 1AMKA 3N19B 3LCIA 2ZZ6A 1R2TA 2C3ZA 1B4EA 4GBUA 1XXXA 4YWIA 5J5RA 1KLZA 3C61A 1TO3A 2D73A 1W54A 1UCWA 1XBYA 3TR2A 2RHGA 1OFPA 5HNRA 5LNWA 3W70A 8TIMA 3C8FA 3STFA 1CW2A 3WK0A 1MEIA 4BF9A 4DF1A 1YDOA 4MUZA 2ISSA 4AH7A 1K8ZA 3DKJA 3S5YA 1PCKA 2OJPA 1EP1A 3W1QA 1WOAA 3HMJG 1P5BA 2VEIA 5HWJA 1I45A 4ML9A 1SZNA 3P5YA 1B4KA 4UUIA 3LB0A 1W5PA 2QCDB 2NX9A 3OHIA 2H3DA 2EKCA 3PB2A 3LM7A 3W2MA 1VJIA 4YLWA 1ZAHA 4CQAA 1PV8A 4UNKA 4MFDA 5DLCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4A21A

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