4A22 | Genus

Total Genus 117

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	117
sequence length	342
structure length	329
Chain Sequence	PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGVVGGYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNVHGVYKPGNVKLRPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLT

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE
publication title	Glycolytic and non-glycolytic functions of Mycobacterium tuberculosis fructose-1,6-bisphosphate aldolase, an essential enzyme produced by replicating and non-replicating bacilli. pubmed doi rcsb
source organism	Mycobacterium tuberculosis
total genus	117
structure length	329
sequence length	342
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2011-09-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4a22A00

1ZHAA 3M6YA 3P81A 4ZQCA 5J5DA 4K8EA 4JGDA 3UZ5A 3M5ZA 3SGZA 3PB0A 4ORMA 4S2BA 3TDFA 3G1FA 5FESA 4DBDA 1Q6OA 1G4EA 1TO3A 2WOQA 3CEUA 3FKKA 3W7KA 2C1HA 2Z0IA 3I6RA 2J27A 2NX3A 3MBDA 3NL2A 3EWYA 3W72A 3HIJA 2I14A 2ZTKA 1RD5A 4LS1A 1PHQA 5F1VA 2YFNA 2X1UA 2GQ8A 1PCWA 2QJHA 5FEZA 1YXDA 4X9SA 3THQA 2Y6ZA 4OQVA 4OV4A 2PURA 3W1QA 2HS8A 4MJZA 4PH6A 4QAIA 3CWOX 2QCNA 1YTKA 3GK0A 4I7VA 3S9YA 3GKAA 3N3MA 4AAJA 2FTPA 4CCCA 1OF8A 3RK8A 3W7QA 3BGJA 4Y8FA 2ZCGA 4M6QA 1XXXA 1EP2A 2EF9A 3R89A 5C55A 2E6FA 5EA9A 1R2SA 1LORA 1FCBA 3QQ0A 2OT0A 4NJKA 4RKAA 3BO9A 4C1KA 2V8ZA 4AWTA 2B0MA 3IIZA 3N9RA 3USBA 5I3JA 2NXIA 4JY8A 1TPDA 4DO5A 4Q32A 4NT0A 1GVRA 2VENA 1OJXA 3DU0A 1KTNA 3DGRA 3ABRA 3TJLA 2ZZ2A 4O18A 5DBTA 1SSGA 5L6UA 4JDBA 1Q3NA 2ISWA 2P1FA 3S6DA 4CCDA 4UXDA 4LS2A 3AJXA 5CPMA 1HG3A 3Q2DA 4AHOA 2LLEA 3M16A 1YDOA 1D9EA 5AC7A 4HHPA 3GLCA 7TIMA 5D37A 1WYIA 2E1DA 4N9DA 4UTMA 1AL8A 1SFLA 2ZDRA 3I68A 1G4SA 1H7NA 3PBWA 2QDGA 3I65A 2V0TA 1EP1A 3BW4A 4UC5A 1VH7A 1ZFJA 4UMBA 4I7UA 3T4CA 3BGGA 2Y70A 2VFEA 4YMZA 5D02A 1NFBA 4PCFA 4NQ1A 4CQ9A 5H2ZA 1ICPA 1OFEA 5TIMA 3P82A 3TR2A 4TU1A 1K7EA 3DFOA 2RFGA 3LCFA 3P62A 3QW4B 5CZJA 1KLYA 3OBKA 4JTEA 3NA8A 1XL9A 1I4NA 3L0KA 1I45A 1WQ5A 3MI6A 1HTIA 1IXNA 2VFGA 3NQDA 1VHNA 1ICSA 3DENA 3FYPA 5FF7A 1EB3A 3C2FA 1OF6A 5CZTA 1LRTA 2Q3OA 2Y7GA 3R5EA 3LLFA 3LGEA 3B04A 4UMAA 1JRCA 4PC8A 3FJ6A 3V1PA 3W9ZA 5A5WA 1NVMA 4DF2A 4LVBA 4NJJA 1GYNA 1XI3A 3KVMA 3OHIA 2ABBA 1KM3A 4UTJA 3G24A 3TFCA 1GG1A 3TQKA 5E93A 3TXVA 3KVJA 2V30A 3LDVA 1UJPA 2J88A 3W1UA 3OVRA 4Y96A 1ONRA 1BTMA 3QJAA 1D3HA 5AHIA 5CPLA 4EWND 4O1DA 3IGUA 1SZFA 2C14A 2Z2UA 4BWLA 3P5YA 2F7FA 1SO6A 4JTLA 1T0OA 3G1YA 3ABSA 5KITA 5CKSA 3PR2A 5DELA 1H7XA 2DU2A 3W85A 1SO3A 3S1WA 1TV5A 4AWSA 2QKFA 3G0SA 5D03A 3S1VA 5CZSA 1C9DA 1HUVA 3TKFA 2YX0A 4BF9A 3EB2A 1KV8A 1T96A 1KFJA 4L4LA 2QJIA 2Y85A 1QDSA 1I2NA 3ZWSA 2A85A 3DAQA 5HINA 4FNPA 1D3GA 2VEMA 2ZA2A 4MVAA 1I2OA 2A7PA 5CG7A 3C6CA 1KFKA 2BX7A 1IIGA 1JVNA 3NNTA 2DZWA 3CHVA 2E77A 4UFIA 1A5BA 3W84A 1OHLA 2R94A 1OX5A 2JKAA 4RJEA 3G1DA 4ZL1A 1LRQA 1SW3A 4EF8A 4CNNA 4KFNA 3W7GA 3I7SA 3BG5A 1K7XA 3TSMA 3L5MA 4QSHA 5U4NA 1O5KA 1EX5A 3JR2A 3GNNA 4PEKA 2QCHA 1PVNA 4WUIA 3MYPA 2P10A 2V82A 3BV4A 1TTJA 4UTWC 3UD6A 3L66A 1KFEA 5DXXA 3B05A 4HNVA 1JCJA 3HG4A 1FWRA 2CW6A 1WDWA 4O15A 3GYEA 5HUPA 3LERA 3PB2A 1KFBA 4FO4A 1SR9A 1EEPA 3S42A 3W7PA 1PE1A 3EWUA 3YPIA 3W2MA 3NDOA 4KKXA 1FUYA 1LZOA 5IM51 4Q4KA 3G8RA 3L5LA 3GAYA 1MEIA 2NUYA 3LCXA 2GJLA 4N9CA 3LI1A 3KVLA 3H53A 1F74A 1LP6A 2JKEA 2R14A 3L0GA 4P2VA 4RXFA 5AHEA 4GUIA 5BNKA 2A6NA 3C2OA 1YXCA 3C61A 1XUUA 4MOZA 1ZAHA 1TYGA 3PUDA 1VPXA 1Q6RA 4LY8A 4JR5A 4MUZA 4P61A 2JGQA 3NOEA 3QH2A 4MKNA 2QCLA 1DBTA 3UWVA 3WFAA 1RQHA 1Z44A 1VCVA 3W1MA 3HGSA 4N4QA 1RVGA 1OFDA 1F6PA 1XC4A 1WBJA 4JTJA 2H90A 4IUOA 5BMXA 3KVKA 1KTBA 3SI9A 2V2CA 1OYCA 3W7HA 3LXCA 4YXGA 2TSYA 2CZ5A 2PRLA 4RCXA 5HR6A 1S5TA 1WOBA 4XWUA 3UPBA 5LKYA 3GVGA 3NL5A 3CEPA 1BWKA 4FB7A 1IF2A 2BTMA 2JGYA 1KV5A 2CZEA 4DO4A 1Q45A 3CU2A 3RNDA 3DI1A 3W7DA 4R33A 4IJBA 4ZQPA 1QCWA 3KRZA 1GJPA 3STEA 2C13A 3LHZA 2H3DA 2RDUA 3GZ3A 3UZJA 4M19A 3W1AA 1W31A 5AYXA 3OEXA 3MW7A 3HMJG 3INPA 3G1SA 4LRTA 3TQVA 1SO5A 1SUXA 3MJYA 4ORIA 2ZA1A 1LOLA 1TPUA 4RK8A 4ADUA 3B06A 4LTSA 1ADOA 3S5NA 3C52A 5F4XA 6TIMA 3E02A 1EA0A 2GOUA 3T7VA 4YLWA 2WV8A 1TIMA 3PSWA 4K39A 6ALDA 3GNDA 3C0JA 3NL3A 2FJKA 3NM3A 2FIQA 1LBLA 1M6JA 2A7RA 3BG3A 4N2YA 4LC6A 1JCNA 2CLFA 3M44A 4JYEA 3SW6A 1M5WA 1MSSA 2E5CA 4Y6GA 3B0VC 5DCBA 3STCA 3WK3A 1R46A 4O52A 3LTYA 4R53A 3NPXA 4LOCA 2VEIA 4MLRA 4DXVA 4LC8A 5KZEA 3LRKA 4ADTA 5DN1A 4DQWA 1JCMP 2GPTA 4UTLA 3LCWA 2E6YA 1GOXA 1I8JA 2B7PA 2TPSA 2Y7FA 2ZZ5A 4WOQA 3LLDA 4WOZA 2NZLA 1FWWA 3DBPA 1X7FA 1K3UA 2H8XA 5MHBA 2Z6IA 3GAKA 4O8RA 4I7WA 3IRDA 4QNEA 2YFOA 1TJPA 2JKPA 4Z1BA 1KLZA 3MWAA 2CLEA 1SFJA 1L2UA 3NQCA 1TQXA 1S5VA 4YL2A 1P0NA 1K7FA 2CWNA 2QEZA 1YXYA 4O50A 1W56A 3O63A 1FQ0A 2FPTA 3NXFA 3TAKA 3LTPA 4JD4A 4JTTA 5G4EA 3TUUA 2P0OA 2X1SA 3PG9A 4GBUA 3U6WA 3TSBA 3O8AA 1A50A 4FXSA 4JX6A 4HKPA 4M7TA 4UUIA 4GUGA 1FXQA 2TYSA 2WPBA 1F2JA 3TW7A 1W0MA 4K6AA 3QSTA 3DFNA 5HULA 1OYBA 4O16A 4OHQA 3PF3A 1H7RA 4HNNA 3E9AA 1W3NA 3I7RA 1EWDA 2Y7DA 4K8HA 1NEYA 5AN7A 4XQ6A 2ZFAA 4Z08A 3KRUA 4E2DA 3HG5A 3UPWA 3MP4A 1LLWA 4IOTA 1GTEA 4XUGA 4JNMA 1ZJIA 4RXGA 4MFEA 2PRHA 3W73A 3LX9A 2PE4A 2ZRUA 1TV8A 5F4SA 3DFPA 1WBHA 1K03A 1IXQA 2NWRA 1C29A 1JJKA 4O11A 2YXGA 1G7VA 1EUAA 3M47A 1QNVA 2DP3A 3G1VA 3DH7A 1KM2A 5KSWA 3QPZA 1LCOA 1KBJA 4FX6M 1OK4A 5FF3A 3S8HA 3TXZA 1SQ7A 5CSRA 4FNUA 1GT8A 4ZMGA 3EX4A 2BWGA 2ZRYA 1QPOA 1ZENA 1T99A 1GG0A 1DOSA 1R2RA 3BK0A 3LCLA 1WOAA 5C5YA 3G0XA 1LYXA 1YDVA 4M6VA 1MEHA 5K9DA 2O7QA 4IXXA 1FDJA 4PA8A 2G97A 2YCEA 5HR7A 4IWWA 3MMTA 1W3TA 1U5JA 3FYOA 3QYQA 1TRDA 1TV7A 2OX1A 3W7OA 1DJNA 4IMDA 1O5XA 3O05A 4MJMA 4PTNA 4PFMA 4TR9A 3DFTA 1QO5A 1LBMA 3L5AA 1JQXA 3LV5A 4JTUA 2A1YA 4O53A 2PC4A 1CI1A 1OFOA 1ZCOA 3W7MA 1ML1A 1A5SA 3OVPA 4UNKA 1TPFA 4GE8A 1RQBA 1W5QA 1VYSX 1PL9A 4PL1A 2VC6A 4GUHA 5EY5A 3UWQA 3W1RA 1UUMA 5C6MA 2Y88A 4RZ6A 3LRLA 5KINA 4ICNA 4ML9A 3E96A 3MP3A 2A6LA 5LZLA 1KTCA 1UASA 3S1UA 3W74A 3M0ZA 1AMKA 2NWSA 1IIHA 1R30A 3R8RA 1SPQA 5CPNA 2ISVA 3BLFA 3SSJA 2C6QA 1KM6A 5T26A 4MYAA 2YGYA 1SW0A 5K7JA 4H4IA 2VFFA 3SIZA 1I2RA 4WY0F 1W5PA 3FLUA 4JN6A 4O4VA 3NZ1A 1R47A 4CCEA 4UFKA 4UTUA 5LNWA 4QIUA 3T40A 1HO1A 3GDRA 3R2GA 2I1OA 2CZFA 1FWTA 1YTEA 3KRSA 1W3IA 3PWAA 4NNCA 3HBLA 3RLVA 5AOUA 3NQMA 3W23A 4GUJA 2FPVA 1KM5A 3LXBA 3PBYA 1FBAA 4A21A 1YYAA 1PHWA 5CZ0A 3TW6A 1W1ZA 4EOUA 3A23A 3EXSA 1IGSA 3HJZA 5D2XA 1WX0A 3CTLA 4R7JA 3CWNA 4O0KA 4Y90A 5AFDA 2Y7EA 3B8DA 2NUXA 4IMEA 4AWUA 2FPYA 2NLIA 1PCKA 4BWLC 3L68A 5CSSA 1P4CA 3OVQA 3CIXA 1CX9A 5TQLA 1EPXA 1LLZA 4O12A 1FWNA 5G1YA 1EWEA 2C19A 3EX1A 5AC6A 5G4WA 3WK2A 1H7OA 1L6WA 3UY7A 3VE9A 5GVJA 4BR1A 3W2JA 5HWJA 4BI6A 2R91A 5AHFA 2CLHA 3GR7A 1HO4A 4LT9A 3W1NA 1KBIA 3P67A 1YDNA 5IBXC 3EX2A 3WJWA 3H54A 3U8GA 2TRSA 3S1XA 3GX9A 4RV8A 3UWUA 3VNDA 3M1ZA 3TNOA 4UCGA 3SR7A 1QO2A 3O06A 3GR8A 3P61A 2TMDA 1TPEA 3DI0A 4FX8A 3IVUA 3DKJA 5KTLA 5F2IA 1AW1A 3W7LA 3MBFA 4MPQA 3NQ8A 4ADSA 1DL3A 4ALDA 1J4EA 2DZVA 4GJ1A 4Z1AA 2Z6JA 3S5YA 3M41A 2X1TA 2ZRWA 1EUNA 5K4XA 1WV2A 3TE9A 1QR7A 2EKCA 3PVFA 3WK0A 3EWWA 4ZQMA 2CLIA 2GVGA 2QF7A 3F4WA 3IGSA 4K7YA 1XBVA 2ZQ0A 4QNWA 3D0CA 4BI7A 1W5MA 3TSDA 5C54A 4QJ1A 5BRBA 3O07A 3HF3A 1FWSA 5EPDA 1DQWA 1JUKA 3VKJA 4HPJA 3NQ6A 2J9XA 4BK9A 3RFAA 5LNUA 4HIBA 1H5YA 3O6CA 1VS1A 2XFWA 1SZGA 3DFQA 2E6AA 5EKYA 4IMFA 1DORA 1LBFA 5EBUA 1XCFA 4JTGA 3P5ZA 4Z0SA 5F4WA 3ANYA 2ZBTA 3NO5A 2DJXA 1VRDA 3IIVA 2FDSA 1OFPA 4Q33A 3RF9A 4UR7A 2RHGA 2ZZ1A 1GWJA 1TPVA 3BVJA 2UV8G 2ZRZA 1FXPA 5LGZA 1KA9F 3M5XA 4NJIA 3GXTA 3OA3A 1H60A 5BOOA 2OCZA 2DZTA 5HNRA 3IIOA 2V2DA 2YW4A 3TC6A 3LBMA 2H6RA 2WKJA 3F03K 2F84A 1MO0A 3NL6A 2QCEA 4LUIA 2OJPA 2ISSA 2ALDA 1TQJA 4ZVJA 3RLUA 5I3IA 1JCYA 1L9WA 1GVSA 2H8ZA 1TSIA 2VFDA 3PM6A 4OT7A 4O13A 1Q6QA 3W6YA 2KZHA 4RX0A 1FCQA 1TCDA 1YTDA 1VYRA 2YPIA 3PUOA 2Q3RA 3SZ8A 3VE7A 3PSVA 2QCGA 2EPHA 1VLWA 1QPNA 1B57A 3W87A 5K4ZA 3PY2A 5D2VA 1O95A 2RKXA 3GIYA 1CW2A 5G2WA 3W1TA 2BSLA 3QF0A 3QFEA 2CLLA 3FOKA 3G1XA 1AG1O 2QAPA 1VQTA 4EIVA 3PUEA 5HUOA 1VHCA 5AC8A 1ZAIA 2ATMA 1KFLA 3EXTA 2W0UA 1GVOA 1I2PA 3N34A 1OYAA 3UWZA 1PS9A 1DVJA 3DFSA 4IPJA 3PS7A 3W1PA 1TB3A 2ABAA 4NZJA 5TBOA 3N2XA 4RZ4A 1TTPA 1TPC1 4MLJA 1SO4A 4MZYA 1XKYA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4A22A

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