4ALD | Genus

Total Genus 138

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	138
sequence length	363
structure length	363
Chain Sequence	PYQYPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKFSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFVSNHAY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE
publication title	Crystal structure of human muscle aldolase complexed with fructose 1,6-bisphosphate: mechanistic implications. pubmed rcsb
total genus	138
structure length	363
sequence length	363
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	1998-07-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4aldA00

3L0NA 1VH7A 2W79A 4HT3A 1SFLA 2NX9A 1XXXA 2R14A 4MFDA 3DXIA 1OJXA 4JD4A 3NPUA 2VKZG 4ZZ9A 3LM7A 1OFQA 3W71A 3ZWSA 2RDTA 3O15A 3R12A 5HINA 1OX6A 2WNQA 4RR4A 4YXGA 4LVAA 3DAQA 2ZZ1A 2VFGA 1SO4A 1IGSA 1TPUA 3WK0A 4NNBA 2J9XA 1TPB1 3EX1A 2Y88A 3R13A 5CPOA 1W5QA 4ML9A 2FPTA 3GDMA 3W7GA 4NXSA 3G1XA 3OIXA 3SR7A 3NZ1A 2Y63A 3EWXA 1NVMA 3NL2A 3GXNA 3MHGA 4RKAA 1XM3A 4UXDA 1ADOA 1QNVA 1KM6A 1B4KA 3S5OA 2DJXA 4R33A 2YFOA 3C2OA 4Y8FA 4WX2A 5H2ZA 4UTJA 6ALDA 4NJIA 3LHTA 3UYCA 1N55A 4PFMA 1EPXA 3TJXA 3ATYA 3DH7A 3UQNA 1J4EA 1OABA 1T8XA 3GXTA 2CLKA 2ZYFA 1OYBA 4Y6GA 3C3NA 2YSWA 3LTSA 4HSNA 3N9SA 5IBXC 1TRIA 2V5BA 1MXSA 3F4WA 2YYTA 3UY8A 2ISVA 3IVSA 4K6AA 4M19A 1YDNA 2C19A 4WY0B 3FIGA 2A7PA 2E6DA 3UWVA 5AHLA 3W7HA 4JTEA 1EP2A 2A1YA 1P1XA 1TRDA 3B0UX 4DO6A 3W85A 4GUFA 3MHUA 3W1UA 4QM1A 1MZHA 3CIWA 2P1FA 1TSIA 4HKPA 2ABBA 3FS2A 3SSJA 4JR5A 2XN2A 3N73A 1IIGA 5D38A 3G1FA 4W9TA 3TKFA 3B0VC 2A85A 2TMDA 3KRUA 1IXOA 3TQ0A 4HHPA 5EBUA 1TV7A 1OK6A 5G2HA 4QJ1A 2E5DA 1LRQA 1ZENA 1ZAIA 4AH7A 3G1AA 3TW7A 1TJPA 4I7UA 1Q6RA 3STGA 2CZDA 1ZCOA 3L0KA 5LHFA 4PODA 3LCXA 2A7NA 1H61A 3RF9A 5F4XA 4DELA 3PBUA 3FKKA 4IQLA 2ZRYA 3RK8A 3S5ZA 5CPNA 1AMKA 1KTBA 3M43A 4MJMA 2ISWA 4DO5A 4DPQA 1AW2A 4UNLA 4J9JA 3M0ZA 4K38A 4JTGA 3BPWA 3VE7A 4JTJA 3Q58A 2ZBTA 3GXPA 4UTLA 2NUYA 4FHAA 5D33A 2YW4A 1C8VA 4QIUA 2J6XA 2ZZ4A 3TCEA 2HMCA 3W7CA 2OMAA 3P5ZA 3PC0A 3W22A 3W7IA 5BMWA 3UWUA 2X1TA 1Y0EA 3B06A 1DOSA 5LNSA 2FPYA 3S9YA 3MP5A 3E02A 3STFA 3LRKA 4LC8A 1L6WA 3UZ5A 3LCHA 1S3HA 1DHPA 2FDSA 1GVOA 2V2CA 4Z1AA 2G95A 2WNZA 1QR7A 2DZSA 2JKEA 3G8RA 3WK2A 2VOMA 1GVRA 1SU5A 1HG3A 2R91A 2CZFA 1W56A 1FY6A 2QR6A 3VFLA 1ICSA 2Z0IA 3E9AA 3C61A 1E51A 3DKJA 1IXPA 4ZQPA 2QJIA 4WZHA 1A5AA 2Z6JA 3W2UA 3KOFA 2XN1A 1W5MA 4PL1A 5I3KA 1QWGA 2NZLA 4MVAA 3W2KA 3Q37A 5D02A 3QMTA 2F7FA 5J5DA 1TPDA 3NQEA 3MI6A 1JJKA 3LXBA 1GVQA 4FIRA 3ABOA 3O6CA 3EWBX 2YYUA 2ZRXA 1QPNA 1IF2A 1VS1A 1W0MA 3DFTA 4K39A 1TQXA 1S5VA 4UCGA 4UTWA 1R2TA 3INPA 2E09A 4ONVA 3GX9A 3H54A 5I3IA 1SQ7A 2E5BA 3QMRA 1QFEA 3FOKA 1KTCA 3NNTA 4PEKA 4YL2A 2XFWA 3KVJA 1F5ZA 3YPIA 4RJEA 3W1PA 1UB3A 3MMTA 1G7VA 4UTHA 2A4AA 1ZALA 5FESA 1JCLA 2WQPA 3OHIA 1B57A 4O53A 3L65A 3OVPA 1XBYA 3NYZA 1K8YA 3NQ8A 4HNNA 3CC1A 3O07A 1SW0A 4JDBA 1A5SA 4WY0A 3EB2A 3NXFA 1YXYA 1GJPA 1ZAHA 3TW6A 2J9ZA 3GDKA 3QW4B 3NG3A 1RR2A 5C6MA 2E1DA 3HPZA 3QC3A 4WUIA 1JCJA 1EWDA 2W6RA 3PM6A 3QM3A 4CCEA 2CLOA 4JN6A 4LUJA 4XTDA 2C15A 2CLHA 2YDAA 4FNSA 4IWWA 1O5KA 2NLIA 3O6DA 5KZMA 1EEPA 3NM1A 5F1VA 1QPOA 3PF3A 3ABQA 1VQTA 3DKLA 3UPBA 2E6FA 5K3VA 3B8DA 3ZFHA 1LOSA 5CG7A 4GNJA 4AMAA 5EPDA 5F2IA 2DZVA 2RFGA 1WOBA 3L68A 3S6DA 4AF0B 4ADUA 3P61A 1VZWA 1EUNA 1KA9F 3IV3A 4JY8A 1SZEA 1RVGA 2CW6A 1I2NA 1M7PA 1JCXA 4PA8A 1FBAA 1OFRA 3EX6A 4MLRA 3G0UA 2FFCA 5G4EA 1CX9A 2HSAA 5L9FA 3EEGA 1GPWA 5CGQA 3HGSA 1DQWA 3MI2A 3OG3A 2FB3A 1PS9A 1DJNA 2LLEA 5EMUA 4P2VA 2Q3OA 3KVMA 3UXAA 1KM3A 5F2LA 1F73A 3TFXA 4AWTA 3HG4A 1N8FA 1F6KA 3THAA 1FUYA 4IMCA 1NF0A 4DEFA 2H3BA 4KFPA 4N9EA 3NPXA 3P62A 1GVSA 3P81A 3N2MA 1PL9A 1HFBA 3S0CA 3FA5A 4O10A 1SW3A 2QCFA 5H91A 3W73A 2YFNA 4EWND 4AWUA 3M5ZA 4HPXA 3M9YA 3W7DA 3D0CA 3DFSA 3L5MA 3PBYA 4MFEA 5TQLA 3V1PA 3LCIA 2XN0A 2A5HA 1HL2A 1GYLA 4O57A 3WJYA 3M47A 4E38A 3W86A 3VKJA 3TE9A 3PB0A 4GE8A 2NXGA 3W2JA 3GNNA 1LOQA 1L6SA 4JTIA 4UIOA 3HF3A 3LCGA 1K7XA 4S1FA 1BEUA 1LORA 3MP4A 1OYAA 2GJLA 4L4MA 3BO9A 4N02A 5DCDA 3S1XA 4ICNA 4LVFA 1ICPA 1LDCA 5AFDA 3NA8A 2OT1A 3NQDA 4QISA 5HUOA 2DU2A 4NXKA 1YXDA 2ZTKA 4R53A 1D9EA 1XI3A 3M5YA 4UFHA 4FX7A 3U2OA 3T78A 2H90A 2V5LA 3PR2A 1M5WA 1FWTA 3QRHA 3PG9A 5G1TA 5LKYA 1RZMA 2C1HA 5AHIA 1F76A 5C55A 2RHGA 3UPWA 2E77A 1XBXA 4N9BA 1IXQA 3S1WA 1QO5A 1DVJA 3HMJG 2BXVA 4JS3A 1ZNNA 3C2FA 1UCWA 3W75A 1KBIA 5HWJA 3L5AA 2OJPA 5HJLA 1B3OA 1O4UA 2C16A 1HTIA 5J5RA 4JTFA 2ZCGA 1XKYA 4UFMA 5LZLA 3NDOA 2J9YA 3S42A 1JRCA 3WK3A 2BSLA 4WXZA 4C1KA 4ZMGA 3JR2A 3RNDA 3BV4A 5G1YA 1F05A 4UR8A 2CZ5A 4NUWA 2QCGA 4ZVJA 1J5TA 1LYXA 2RDUA 5D09A 4X2RA 1KW1A 3H53A 3IIZA 4O1AA 3W7KA 4O14A 3QFEA 4IMEA 3W87A 1Q3NA 3M7WA 1PCWA 4FIQA 4UTWC 1C9DA 1FCUA 3RLUA 1FDJA 2Y89A 3CWNA 4OU1A 2ZZ7A 3W1QA 1ZFJA 1OK4A 1G7UA 4O15A 1PV8A 3HGRA 3IVTA 3G1VA 3BG9A 4K36A 3GKAA 4N4PA 2E6YA 3DENA 3NM3A 3G0XA 1H7XA 2ISSA 4AF0A 3L21A 4QNEA 4FX8A 3IIXA 2NV1A 2Z1BA 1TYGA 4Z1CA 1W8SA 2GVJA 2Y61A 4LU0A 1K03A 3LBCA 1OHLA 4CQ9A 3DFOA 4MY1A 3DHFA 1P4CA 1QAPA 2EPHA 4UFLA 3GKFA 1LBMA 1JUEA 1KM0A 1X1OA 5DY3A 4WOQA 5F2GA 4LS0A 1GTEA 4O1DA 4HNUA 1AL8A 3MBFA 3QPZA 4CQ8A 2PRLA 1HO4A 3KVKA 3LB0A 3HO8A 3SGUA 3W72A 1FWWA 2ZFAA 1F2JA 5FF4A 5MHBA 3GAKA 1KBJA 3P5YA 5EL1A 4DBEA 3GDTA 3W76A 3M44A 1VLIA 5I3JA 1G4EA 4RZ5A 3USBA 1FDYA 4NJGA 4QNWA 1ME9A 2GUUA 4BWLC 3UWWA 5L6UA 3NGJA 2ABAA 1FWNA 4ALDA 3UWYA 2VFIA 3PBVA 3GDRA 4H3DA 1LRTA 1OF6A 3EKZA 5IM51 1L2UA 4RV8A 4E0CA 4FX6M 4EF9A 4AEOA 3E49A 3W23A 3NQ2A 3TA6A 3KX6A 5KINA 2B7OA 1OFPA 5K9DA 3EXRA 4PTNA 2QCMA 3FYPA 1YDVA 4M7SA 1Q6QA 2WNNA 3LLFA 3P8IA 4MJZA 4RX0A 4LV9A 4MZYA 1TPVA 4UUIA 4ORIA 2A0NA 3TSDA 1WOAA 4NX0A 2PE4A 4CNPA 4K8EA 3TROA 5D05A 3LDVA 3N19B 4HSOA 3RMJA 1F6PA 3QF0A 3EWZA 4FB7A 1OG0A 5LGZA 4IUOA 3SFKA 4JYDA 2QAPA 3W7LA 1NF7A 2Y6ZA 4GUGA 2QJHA 2ALDA 1Q6OA 3MP3A 1TQJA 2B7QA 5D2VA 1AW1A 1KM4A 3E96A 2FLIA 5D2YA 1JR1A 3KAOA 4FXRA 4M6VA 7TIMA 4AHOA 4RLIA 4TO8A 3UZJA 3GYEA 3A5FA 3HOJA 3NQGA 5E0KA 1G6CA 1TCDA 2GQAA 1KFJA 3KHJA 3CHVA 4MLJA 3IGXA 1W5PA 4MKNA 4N2YA 1C29A 1JCYA 3JS3A 1G4TA 1N7KA 1KFCA 3NPVA 4LS2A 3P80A 4LW7A 4MUZA 3HGJA 4XWUA 3W1MA 3NEVA 1XFBA 2FPVA 3BARA 3MO7A 1X7FA 3MJYA 1B9BA 1TIMA 1LBFA 4AWSA 1ME8A 3U6WA 1MEIA 3DI0A 2V30A 3TUUA 1FCVA 4JNMA 4BR1A 1TV5A 2VFHA 4MZ8A 1P5BA 5HQEA 1XL9A 3C0JA 4ADSA 4UMCA 4JXCA 4O1CA 4LT9A 4O12A 4JTTA 5K4XA 3C2EA 4FNQA 2WPBA 3A24A 1SSGA 2VFDA 2Y7EA 1TTJA 1HO1A 2FJKA 5TIMA 2OCZA 2PCQA 3BK0A 3NQFA 3O8AA 1OFEA 1EX5A 4NNCA 4DBDA 1LP6A 3TH6A 3NVTA 4EIVA 1L6YA 4NQ1A 1FWSA 4Y96A 5HUPA 2OT0A 1KM5A 1VR6A 2YXGA 3DHDA 2Z2UA 1OFDA 3NZRA 1KM2A 3HG3A 3TQVA 1Z48A 1VHCA 5AC6A 3SGZA 3HGOA 1I45A 1CW2A 1LZOA 4JDYA 5DCEA 4K37A 5U4NA 2E68A 5LNVA 2CWNA 2X1SA 4OHQA 1KLYA 3B4UA 4POCA 3P7YA 5HNRA 4BI7A 3B05A 3TV8A 2WKJA 1QPQA 3NQVA 1A53A 5HULA 1P0NA 3KRZA 4MZ1A 1ZHAA 2P10A 2Q3RA 4DF0A 1K7FA 1EUAA 3UWQA 1WDWA 3LHUA 2QJGA 4OV9A 4IX2A 1GWJA 2ATMA 4TX9A 3GK0A 2WSQA 5FEWA 4JY9A 2IQTA 1U5JA 1VJIA 5SWUA 3DI1A 4JYFA 4YLWA 1K8XA 4TMCA 3QPYA 4WJEA 1DQXA 4CCCA 2ZRWA 3HBLA 2CLFA 3OA3A 3QYQA 1GOXA 2QCLA 2YX0A 3TC6A 1AW5A 2DZUA 2H8XA 4NNAA 3N3MA 4HN4A 1MSSA 2JGYA 4IMGA 1H7PA 3W83A 3C4UA 4WXYA 4YMZA 2BTMA 1W5NA 5K9CA 3GZ3A 5BRBA 3EX4A 2VELA 2Y7FA 1TV8A 2VC6A 2JKAA 5FF7A 5AYZA 3NPWA 4O52A 2JGQA 4Y90A 3VE9A 3E12A 2DJLA 3E0IA 4GWEA 4UMBA 3ZWTA 2QAFA 2GOUA 3I6RA 1XC4A 2WJZA 1I2OA 1T96A 2HS8A 1FXPA 5KTLA 4UTMA 3LXAA 2RH9A 1YXCA 1JQVA 4LS1A 2A7RA 5BMXA 1R2SA 2GVGA 1ONRA 1LLZA 3BGJA 2W0UA 2E5CA 4UTTA 3AJXA 4AB4A 3PY2A 1FWRA 1SO5A 1GG0A 4O28A 5C2XA 1GVFA 1M6JA 3S8HA 3W3OA 3LCLA 1H5YA 1J2WA 4JX5A 2YZRA 1MO0A 1YDOA 3NQAA 1XDLA 1YPFA 3STEA 5D04C 5LGXA 4XQ6A 1SW7A 1BWKA 3LI1A 4JTHA 5BNKA 3W7MA 3TX9A 1WQ5A 4BWLA 3A9IA 4RCXA 4TIMA 3QZEA 1G69A 2VEKA 5U7SA 2ZZ5A 3GAYA 2YCEA 3EX3A 1I2RA 1VCFA 1QOPA 1Z44A 4O13A 3T44A 2ZDRA 4C1LA 3PUEA 4R34A 2E6AA 2KZHA 3A22A 1QCWA 4FNTA 4Q33A 5FEPA 1TPC1 4CQAA 1R30A 2QKFA 5EA9A 1A5BA 5K2ZA 1VRDA 3P74A 3VCRA 3S1VA 2EKCA 2YR1A 3CB8A 4JX6A 2RDWA 3T40A 1LTDA 2X1UA 2VEPA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4ALDA

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