4B3LA

Family 1 6-phospho-beta-d glycosidase from streptococcus pyogenes
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
461
structure length
461
Chain Sequence
LAFPKEFWWGGATSGPQSEGRFAKQHRNLFDYWYEEEPDLFYDYVGPDTASDAYHQIESDLTLLASLGHNSYRTSIQWTRLIDDFEQATINPDGLAYYNRVIDACLANGIRPVINLHHFDLPIALYQAYGGWESKHVVDLFVAFSKVCFEQFGDRVKDWFVHNEPMVVVEGSYLMQFHYPAIVDGKKAVQVAYNLALATAKVIQAYRRGPAELSDGRIGTILNLTPAYPASQSEADMAAAHFAELWNNDLFMEAAVHGKFPEELVAVLKKDGVLWQSTPEELALIAENRVDYLGLNFYHPKRVKAPDAIPVISPSWSPEWYYDPYLMPGRRMNVDKGWEIYPEAVYDIAIKMRDHYDNIPWFLSENGVGISGEDRYRDETGQIQDDYRIQFLKEHLTYLHKGIEAGSNCFGYHVWTPIDGWSWLNAYKNRYGLVENNIHTQVRRPKASAYWFKKVATHNRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE
publication title Structure and Activity of the Streptococcus Pyogenes Family Gh1 6-Phospho Beta-Glycosidase Spy1599
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pyogenes
total genus 184
structure length 461
sequence length 461
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2012-07-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4b3lA00
3T08A 1GOMA 2X2YA 2X8RA 1B0IA 4YHGA 1J01A 2VQTA 4W88A 2MANA 4EANA 2FH6A 1V6VA 4N0RA 1GONA 1WDQA 1NWRA 3LPOA 5GPRA 1UWUA 2IXVA 3GH5A 4WJXA 4Z2LA 2BHUA 4WKFA 2G3NA 4AY1A 1VFFA 1MFUA 5I2UA 3GH4A 1W2VA 1XH1A 4UQCA 2D2OA 3BAYA 4D6JA 1AVAA 4WK9A 3AROA 4AZIA 4F9DA 3W81A 3BH4A 2ZX9A 1O7AA 3MSDA 4HZ7A 3DYPA 1R7AA 2XTKA 1L8NA 2NSXA 3ZO9A 2X1IA 2PWFA 2CHOA 1KXQA 5FKYA 1UWQA 1BVZA 4P7RA 4UQBA 5JIPA 5A6BD 5KEZA 3WSUA 1ZS2A 4HOXA 4JCLA 1E3ZA 1P6WA 5FOOA 3KL3A 1YQ2A 3EDDA 1JIBA 3MANA 1WZKA 2YA2A 1QI3A 4WSJA 3OZPA 1WDSA 1UR4A 5D9NA 3VIKA 3AHZA 1LQ0A 2C0HA 2CYGA 3UERA 4DUXA 1J12A 1EOKA 3M07A 3AOFA 3MMDA 4KWUA 3AQUA 2ZWZA 2VCBA 4DUVA 2XG9A 4CN4A 5D8ZA 2NW0A 1CXLA 1GVYA 5A2CA 1UUQA 1E6XM 2VI0A 2XVGA 3UESA 3M46A 5JBDA 2GJXA 1L0PA 5HPCA 3VVGA 2GDUA 3POHA 3UG3A 2WK2A 3K1DA 3PZMA 4ACYA 2OWWA 1TR1A 2WYSA 5A8OA 3NDZA 3MUZ1 4ATWA 4AEFA 4RE3A 4JFSA 3IAQA 2OWXA 3UETA 4EE9A 5IFPA 1EGZA 2BY0A 1OWQA 5FD0A 2A3AA 1NM9A 1YHTA 1JZ5A 3AFBA 5KZ6A 1CYGA 3VDHA 4PCTA 2PWGA 3ALGA 2CEQA 1NH6A 3THCA 3KEHA 1E0XA 1E6RA 2PWEA 1XYFA 1UKTA 2JIEA 3WD1A 3VX0A 1HT6A 1FP9A 2E8ZA 5EFDA 3MSGA 2D22A 4BCEA 4TX8A 2YL5A 1NOWA 4J28A 4W8BA 3PBGA 2YIHA 2EXOA 1XSIA 3N18A 3TTOA 1GZJA 2J78A 1CLXA 1OIFA 3II1A 4GO8A 2DSVA 2XVLA 3AHVA 4HMDA 5I79A 1HXJA 1W91A 4W87A 1MW1A 3VO0A 5I78A 3AYRA 3U5YA 2EEXA 1QHOA 3WN6A 3GXFA 4AEEA 4PEEA 3LMYA 3A4AA 4E8CA 2XWDA 2A3BA 1NWUA 3WUGA 1WDRA 1MQPA 2J75A 3N13A 4P7LA 3THDA 3AXHA 5D4YA 1QI2A 1KGUA 2VZSA 2AAAA 4FK9A 4CU6A 1K6AA 3U57A 4PCSA 3VGGA 1E4LA 3K4DA 2VUYA 2A3HA 4D6DA 1PZ2A 5AC4A 4ZXOA 1JZ4A 1UWTA 1E6NA 1ISXA 3DHUA 1G9HA 4K68A 1JL8A 1I1WA 3AHTA 2RGMA 3EDJA 3ZJ8A 2E9MA 2ESCA 4LGXA 1UOKA 4OJYA 1JG9A 4FLQA 1EDTA 3N11A 1SR0A 5AY7A 1CXHA 2O9RA 1JDAA 4E4PA 3TOPA 2FHCA 2DSKA 1RD6A 3GBEA 1UH4A 2J62A 4X9YA 3ZOAA 1G1YA 4J3TA 3AICA 3CIVA 5A8MA 5BXTA 2G3JA 1ESWA 1OM0A 1JYVA 4M24A 3AS1A 1ZBKA 4HA4A 3ZT6A 6CGTA 3ZT5A 2W67A 1VEOA 3RM9A 4AC1X 1HP5A 3MS8A 1UKQA 1JDDA 1WE5A 1AQ0A 2UY2A 4UFJA 3PZVA 1HX0A 3BLKA 3A4WA 4FLSA 3T0DA 2DT2A 3CH9A 1HJVA 3AS2A 2VNCA 2XWEA 1HN1A 2BS9A 3LPPA 3OBAA 4P7QA 1OIMA 2OLHA 3M7SA 2J8FA 3AZRA 2IXUA 3SUUA 1JFHA 2DSUA 1TG7A 3W0KA 4MDPA 4E8DA 3MO4A 5LA2A 1JFXA 1XV8A 1E1FA 1V6UA 3WY1A 3KZSA 3SCPA 2C8NA 8A3HA 2WMHA 4C7GA 1BYCA 4U2YA 2W62A 3M6DA 1I1XA 1DTUA 2CBVA 3PZQA 5BRPA 2ZX5A 4EK7A 1TE1A 2BXYA 1U2YA 3PZIA 1B31A 3BAWA 2ZUNA 3MUY1 3DYMA 2JF6A 4FLOA 2GDVA 3GNRA 3SCSA 2BFGA 3WDPP 3WF4A 1PIFA 3ZMRA 2XFRA 1H41A 5DFAA 2CNCA 1TA3A 1F4HA 4MNKA 2WLYA 4JHZA 2X0YA 1US3A 1E6QM 2Y5EA 4ZE5A 2E0PA 1XCWA 4D6IA 2J7BA 2DT1A 3F5KA 1J0ZA 2G3IA 1PAMA 4CN6A 1GPFA 3GDBA 4E2OA 2WVTA 3RJXA 2YA0A 2J7EA 4P7OA 1JZ7A 1US2A 1BGGA 4B3KA 4JAWA 5A6KA 1QBAA 1GVIA 3SUWA 3MKKA 1W9VA 1W1VA 1JI1A 2WC3A 5A2AA 1VF8A 2ZXBA 1M7XA 4ATLA 1Q6FA 1ZB5A 5I0DA 4JFTA 1ZBVA 4CU7A 3VM7A 4M56A 4EAMA 1K9DA 3SIMA 1OT1A 4CD7A 1GW1A 2QPUA 1JD9A 4P8UA 2XIIA 1XSJA 4XZWA 3N1AA 1CEOA 3AMCA 3BMWA 3B8SA 1W32A 5F7UA 1W9BM 2VR4A 3VDBA 1DP0A 1AMYA 4HP5A 3DC0A 4X0NA 1J0KA 4ZE4A 1PJ9A 4HU0A 3MUAA 1ISZA 2XVNA 4UFHA 3WBAA 1GJWA 3IK2A 5JBEA 1CIUA 3PZOA 5HBFA 3AIVA 1Q6CA 4W85A 3ZJ7A 2WKLA 5E6ZA 4V2XA 3EYPA 4PMZA 2EPOA 4XUYA 1FHDA 3E1F1 3WFZA 3WNLA 2ZUVA 2J7CA 3BC9A 3ZIZA 1MFVA 1QBBA 1RPKA 2GSJA 3TA9A 1CGUA 1PEZA 1GOOA 1DWJM 7A3HA 1UA7A 4JL2A 1ECEA 1HKMA 3APGA 1NWSA 4KH2A 4NSBA 1V0LA 3CHFA 1R8LA 1BFNA 3I3BA 4J3VA 4D72A 3BLPX 1QHZA 4LYQA 3GNOA 1UR0A 1PPIA 1C3FA 1KGWA 3GH7A 3VIPA 4PMRA 4MDOA 2J25A 5IFTA 1J0HA 2FGZA 3NIYA 4EKJA 1XH0A 2J7HA 2W4XA 1ISWA 4J3WA 1MXDA 1CGVA 4S3JA 2CIPA 4GPNA 4TTGA 1B9ZA 1CXKA 3UG4A 5FIPA 3WUFA 4F66A 4AIEA 4PMVA 1UG6A 3L4UA 1K9EA 1GHRA 1V0MA 1IV8A 3VIFA 2QHAA 2WCGA 1QNRA 3W24A 3MUIA 4FLRA 3VMPA 3OLIA 3WEMA 5BROA 1K9TA 3OG2A 2EQDA 5LYRA 2GK1A 4W7WA 1E70M 1OBAA 3W29A 2F2HA 1XD1A 3BSHA 1CXIA 2DDXA 2YDQA 2ZXQA 1CGXA 3VIIA 4WF7A 3GM8A 4WIWA 3A6OA 2W92A 4NF7A 3N17A 3AMKA 1MQRA 3U5UA 4Z2IA 5E09A 2EO7A 3AS3A 2OSYA 3SUSA 1TVPA 4HMEA 1IZKA 3PZNA 4U31A 5A8PA 2VRQA 3GXDA 4YPJA 2WMIB 1FFQA 1C90A 1MVYA 3RM4A 3OZOA 3T0AA 3FAXA 5GNYA 2Y24A 1MW3A 1SYTA 5CXPA 4A3HA 4IISA 1HJXA 3MMWA 3VDCA 1W3HA 2W5FA 1XSKA 5M03A 2PC8A 4CD8A 5M17A 3WNMA 4DM1A 2WHMA 3RM8A 3UCQA 3W38A 3N04A 4R5EA 2ZX8A 1QW9A 1E4MM 2WWCA 4U33A 5EFFA 1CENA 3EMQA 1JYXA 1JDCA 1KXHA 1V3HA 2DT3A 4PN2A 2XPKA 4J27A 3BAIA 4PMXA 2XVPA 1GQIA 3VPLA 2O9OA 2WAGA 1J0IA 1VJSA 4N42A 4HZ8A 4OBRA 5ABFA 3CO4A 1UD8A 3D3AA 2D0GA 4QCFA 3SCRA 1CWYA 4CD4A 2WBKA 4H8UA 1UWIA 2QF8A 3UR7A 1LL4A 1I75A 1QVBA 4Z2KA 2CBIA 1JAKA 1KXVA 1DWGM 4HPHA 3L4WA 2NT1A 2XIBA 2VJXA 3IJ9A 3RMEA 4JKKA 4ATDA 1UR1A 1H2JA 3AIBA 3L4XA 1CGWA 2XUCA 4PYSA 2WM0A 2PI6A 1JXJA 1BLIA 1B2YA 4LX4A 3CPUA 3WNOA 4HTYA 2WBGA 5AYBA 2WVSA 3IJ8A 3TTSA 1PX3A 3WQWA 4CVWA 2VX4A 1BQCA 1X6LA 2YDSA 1GCYA 3I3EA 3AISA 4GI6A 1JZ3A 1HIZA 4GZJA 3VM5A 3PN8A 3ECQA 3WMBA 4CD5A 1VJZA 3DYOA 4JKMA 3CMGA 1C7TA 2WMFA 4D6CA 4PSPA 1C8YA 4TVDA 1M01A 1H11A 3AIUA 3VU2A 5I23A 1GUVA 3CHCA 2J7DA 1AQMA 3BXWA 2DIJA 1ISVA 1BAGA 2CKSA 3WDRA 1W1TA 4D6EA 3RIKA 2XM1A 4JKLA 3RCNA 3ZM8A 1XH2A 1E5NA 3ARZA 2J8GA 1J9YA 2C7FA 2XJ7A 2E40A 5IHSA 1D7FA 2WLZA 4PUDA 3WUBA 5E70A 4JCMA 1GQLA 3RILA 4TTUA 5IHRA 4JZ5A 1BPLB 3AS0A 4JIEA 1EO5A 2ZUUA 4GINA 3GXMA 4W8AA 3FAWA 1V6YA 4MAVA 4J3UA 3AHYA 4JFVA 1UD5A 1QPKA 4J3SA 2G8ZA 3QR3A 3HN3A 4W86A 1QW8A 1WZMA 3VUPA 4CCEA 3EMCA 3O9NA 2D3LA 1Y7VA 4ACZA 3NUKA 1DWHM 1B90A 2FDMA 5CG0A 3ARYA 1BTCA 1OGSA 4DWSC 1VB9A 2ZXDA 1CXEA 3VGDA 3W4RA 1CXFA 4P8VA 1E72M 5A2BA 5ABEA 5BCAA 3EDKA 1WKYA 1W3JA 1NWTA 4GKLA 2E9LA 1UZ4A 2PF0A 3ARSA 4GO9A 1HJWA 1B3YA 1B3VA 1Q6GA 3S2CA 3RO8A 1E6ZA 2VZVA 1H09A 2CITA 2E3ZA 2G41A 5E0FA 2GJRA 4OOZA 5ECUA 4IM4A 4FF5A 4H04A 4W93A 2VZUA 5A69A 3VMOA 1W3KA 2V3FA 4V27A 3WD3A 2WW5A 1EQPA 4DWSD 4J3XA 2V5CA 3WD4A 1UA3A 4V28A 1XCXA 2CKRA 1OD0A 1C7SA 2VMFA 4B9YA 4JFUA 5D9MA 2VZOA 3W6MA 2PBOA 2VL4A 5I77A 3SCWA 3PZTA 1LG2A 5ABHA 2J79A 4AD5A 3OGSA 2XSBA 3NYDA 2BHZA 3TTYA 1CDGA 2WMJA 3N12A 2DH2A 2BY1A 2PWHA 2VRJA 3WD0A 4U3AA 1FP8A 2ZXAA 1HL9A 4H8HA 1NOUA 2QLYA 3OLEA 3CHDA 5C8BB 1CNVA 1UHVA 2WVVB 1DWIM 4AW7A 5GQBA 3AMLA 1H49A 2BVYA 5EB8A 1QI5A 3WKZA 1KBBA 2OYLA 3ARQA 2EBNA 5BXPA 1V3MA 4JL1A 2PWDA 1KFWA 5C70A 1V0KA 1XHGA 3FHQA 1E6PA 1HKKA 1VFUA 3K4AA 3WL1A 2QMJA 4AMCA 1JNEA 3GBDA 2ZWYA 4UR9A 3AJ7A 2XSAA 1BG9A 3W53A 4MB3A 3ZR5A 1TA3B 3BAKA 1W1YA 3VGEA 2CBUA 1WPCA 2Q8XA 1LWJA 5LA0A 2JALA 5CPQA 1E0WA 5I6SA 3W26A 4PTWA 3PTKA 1PBGA 3WQVA 4GZEA 1IZJA 1ODZA 4UOJA 1GOKA 1UWRA 1AQHA 3EDEA 4W5ZA 5A6BA 1J0YA 5GNZA 4P8WA 3WELA 4H41A 4GQQA 4IPNB 3K8LA 1B30A 1JNDA 2X0HA 3KL5A 1VEPA 3L2LA 5CGTA 1EHNA 1M04A 5DT5A 1LG1A 2CESA 3KL0A 1KR0A 2FH8A 2WCAA 1LLOA 4QLKA 2OSWA 4WLCA 1C93A 3SCNA 3TONA 3PZ9A 1HJQA 4Z2JA 4MNMA 5I3DA 1TFVA 1EHAA 1VFMA 4PMYA 2YBTA 4PMUA 2AOSA 4PTXA 1JAEA 5D9OA 2X05A 2G4FA 3CUFA 1R85A 2O92A 4GQRA 5DEZA 2EPLX 1CTNA 2ZIDA 3OA5A 3FY1A 1H0GA 4CCDA 4GI9A 4OBSA 3OLDA 1VBUA 5HPOA 1E43A 1QNPA 3WH7A 1G01A 2VR5A 4XX6A 1KR1A 3OGVA 2WXDM 1ZJBA 2QV4A 3AI0A 1WNOA 4QLLA 4AD2A 4PMDA 3RPMA 1R7OA 4CGTA 1FH7A 5A1AA 4F9JA 5JIWA 3VOCA 4F79A 4W89A 2J77A 3WF0A 1OGBA 2D0HA 4GIAA 3B9EA 3WH5A 1R86A 1B3WA 1OSEA 2D0FA 4OKDA 5AC5A 3AXXA 4MNJA 1JZ6A 3ARUA 4S3KA 3PTQA 4DUWA 3AZSA 1KB3A 4U5KA 4TX6A 4QAWA 5M5DA 4QFUA 3POCA 1U33A 2CPUA 3WQ5A 4DWSB 1UH2A 1HJUA 1UYQA 2DIEA 3WEZA 3W25A 3PZGA 4Q22A 3AMGA 2A3EA 3VIJA 4UQDA 3WD2A 3QHMA 1J10A 2ZUMA 2YL6A 4PTMA 1FH9A 1K9FA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3T08 A;  1GOM A;  2X2Y A;  2X8R A;  1B0I A;  4YHG A;  1J01 A;  2VQT A;  4W88 A;  2MAN A;  4EAN A;  2FH6 A;  1V6V A;  4N0R A;  1GON A;  1WDQ A;  1NWR A;  3LPO A;  5GPR A;  1UWU A;  2IXV A;  3GH5 A;  4WJX A;  4Z2L A;  2BHU A;  4WKF A;  2G3N A;  4AY1 A;  1VFF A;  1MFU A;  5I2U A;  3GH4 A;  1W2V A;  1XH1 A;  4UQC A;  2D2O A;  3BAY A;  4D6J A;  1AVA A;  4WK9 A;  3ARO A;  4AZI A;  4F9D A;  3W81 A;  3BH4 A;  2ZX9 A;  1O7A A;  3MSD A;  4HZ7 A;  3DYP A;  1R7A A;  2XTK A;  1L8N A;  2NSX A;  3ZO9 A;  2X1I A;  2PWF A;  2CHO A;  1KXQ A;  5FKY A;  1UWQ A;  1BVZ A;  4P7R A;  4UQB A;  5JIP A;  5A6B D;  5KEZ A;  3WSU A;  1ZS2 A;  4HOX A;  4JCL A;  1E3Z A;  1P6W A;  5FOO A;  3KL3 A;  1YQ2 A;  3EDD A;  1JIB A;  3MAN A;  1WZK A;  2YA2 A;  1QI3 A;  4WSJ A;  3OZP A;  1WDS A;  1UR4 A;  5D9N A;  3VIK A;  3AHZ A;  1LQ0 A;  2C0H A;  2CYG A;  3UER A;  4DUX A;  1J12 A;  1EOK A;  3M07 A;  3AOF A;  3MMD A;  4KWU A;  3AQU A;  2ZWZ A;  2VCB A;  4DUV A;  2XG9 A;  4CN4 A;  5D8Z A;  2NW0 A;  1CXL A;  1GVY A;  5A2C A;  1UUQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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