4CNNA

High resolution structure of salmonella typhi type i dehydroquinase
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
251
structure length
245
Chain Sequence
KTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVDHFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTLNRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPSAEEMVLRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPVITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVGQIAVNDLRSVLMILHNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE
publication title Mechanistic Insight Into the Reaction Catalyzed by Type I Dehydroquinase
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhi
total genus 97
structure length 245
sequence length 251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2014-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4cnnA00
2QAFA 4Z1DA 4AWUA 1IIHA 1KM2A 1Z42A 1VHNA 5J5DA 4UTTC 5G1YA 2G5WA 1HUVA 3W7OA 5HMSA 1O4UA 1CI1A 3QMSA 4PC8A 3YPIA 1H5YA 4EOUA 3W1AA 2VENA 3E49A 3DGRA 4UFHA 4TR9A 4JGDA 1W3TA 4O50A 4CLMA 2TPSA 4FF7A 3DKJA 3MHUA 4RZ6A 2Y61A 1AG1O 4HT3A 5KITA 1PVNA 2DJXA 4NXSA 3LLFA 2GPTA 3BLFA 4GFSA 3B03A 4A2RA 2G97A 4UFIA 1L9WA 4AB4A 2P10A 3VFLA 1Q6RA 1BEUA 1WBJA 3D0CA 4O18A 4R33A 1GVQA 2ISWA 5IBXC 4JTIA 1JRCA 3NQGA 4XZ9A 3UZJA 2VC6A 5D2XA 1K02A 3EXTA 3LCFA 5HUOA 1B9BA 1Q45A 4LC6A 1A50A 1XL9A 1LCOA 3IVSA 1I2QA 1YPFA 3P61A 3TSDA 3DFQA 2I9EA 3DFTA 4O0KA 2V5BA 4FNUA 2YZRA 2QDHA 4NT0A 1O60A 1V7YA 2E5BA 5BMXA 1B57A 3NA8A 3G3DA 1OYCA 3TJLA 5ABTA 1EB3A 1GJPA 3PSWA 3DU0A 2FPVA 3DFSA 1QPRA 2CZEA 1KW1A 1JRBA 1KFCA 4EWND 2G96A 2WJZA 4K37A 2V2CA 3T44A 3TW6A 3BG3A 5K9XA 4E38A 3BVJA 3EWBX 3TC7A 3M1ZA 5LNWA 7TIMA 4N02A 3O15A 3DI1A 5FEWA 2BZNA 2C19A 3W1NA 1TPEA 4AEOA 4NQ1A 1XKYA 3VE9A 1FXPA 4PEKA 3SIZA 1P0KA 2X30A 1WA3A 3O06A 2HTMA 1SZFA 4N2YA 4PL2A 4JTHA 5DCDA 3P81A 2E77A 3NAVA 1P1XA 4CCDA 4HSNA 2QJHA 5CPOA 3RNDA 3TU9A 3KRSA 2CLLA 3B0PA 2FPTA 4O28A 1OK4A 3HF3A 2GVGA 3GXTA 1SW0A 2Q3RA 1VS1A 3LHVA 1ZHAA 3A5FA 1MO0A 5HQEA 3L66A 3M6YA 2E6DA 4FO4A 4TU1A 5AHIA 3W1UA 1OK6A 4N9BA 2FFCA 4FEZA 4NU7A 4C1KA 2NX3A 3BV4A 3CB8A 3LHWA 1MEWA 3E0IA 5K9CA 2YSWA 5I3IA 2ATSA 3DAQA 1YDVA 1GVSA 2FJKA 2ZA3A 1W56A 4JX4A 1VQTA 1F7BA 2ZRVA 3G1VA 2ABAA 5G4EA 5DELA 4WX2A 1OFPA 1TSIA 2CFFA 1TPC1 1WX0A 3UYCA 3LERA 2QCNA 3Q2DA 3W7IA 4Y96A 5CPMA 1Q6LA 3QC3A 4IQLA 2PRHA 1KLYA 2BSLA 4K7YA 1OX4A 5F1VA 2ZFAA 3NDOA 2QEZA 1TPH1 3HGOA 3L5AA 1H51A 3LOTA 4ORMA 2NV2A 4FX7A 3LI0A 5K2ZA 1NF7A 5K4XA 4JN6A 3LCIA 4FNRA 3HB9A 4IGHA 1YDNA 3WK3A 5SWUA 1G4TA 4RR4A 3L65A 2BWGA 3DKLA 2P1FA 1FUYA 3LCLA 4JX6A 3CEPA 2WNQA 2FB2A 3TAOA 3RK8A 1OG0A 1T8XA 3OA3A 3N9RA 3UXAA 3C52A 3BG5A 3B04A 2QCMA 5G2WA 3FYOA 2Z1BA 1KM6A 3MI6A 3QRHA 4GNJA 1WAUA 1ZAIA 4CQ9A 4O57A 3LXBA 2TRSA 3LHZA 1JQVA 3EX2A 3GLCA 1TPB1 4PL1A 1GQNA 2A7RA 5DXYA 3MHGA 3HG4A 4UXDA 4K39A 3LDVA 3IVTA 4CQ8A 2P0OA 4H6KA 4KFOA 2VEKA 1SZNA 1D9EA 1TMHA 3C2RA 3LV5A 1TTJA 4IWWA 3UZ5A 2NV1A 3AO0A 2JKPA 3LCWA 1VYPX 2CLFA 3ZWTA 2PCQA 5AHFA 2Z0IA 3C3NA 1YTEA 4O14A 1HO4A 1ZY9A 4O52A 5CGQA 3W72A 3LRKA 2NXHA 1BWKA 1PHWA 1WDWA 4M6PA 3W86A 3TK7A 3P8IA 2NUWA 2KZHA 1ZAHA 4E2BA 1I2NA 2C3ZA 2AAMA 3FYPA 4IX0A 1HO1A 2WSYA 3GKFA 4QQ3A 4JR5A 2E1DA 6ALDA 1EUAA 1JCMP 5C54A 3WJSA 3B8DA 4Z1AA 3HJZA 1U5JA 3NL2A 4GUHA 4N6FA 3VNDA 4O11A 4ADSA 4FX6M 3V1PA 4OHQA 4X9SA 5EYWA 3S1VA 1LRNA 1S5TA 2ZA1A 2A7NA 3TSBA 3RMJA 2X1SA 3LHUA 1X1OA 4RZ4A 2XN0A 3TUUA 4YMZA 1TQXA 3TQKA 1QNVA 2OCZA 1YTKA 5AHEA 5AB3A 1KFEA 5G1TA 3HPZA 3C61A 1FBAA 2A7PA 4PH6A 5J5RA 4FNTA 1ZENA 2J9ZA 1SW3A 4GWEA 3S8HA 1SO4A 2Y6ZA 1RR2A 4LVGA 4JXCA 4UR8A 1R2RA 3ABSA 3OBKA 1G7UA 5LHFA 3FFSA 1I2OA 4JIQA 2YPIA 4OWGA 5A8GA 3MYPA 4UTTA 4TX9A 3S5YA 1WYIA 5F4XA 1LP6A 5CKSA 3G3MA 4RZ5A 5EY5A 4TMCA 4A3UA 1I2PA 3U6WA 5K9DA 1PCWA 1VYRA 2CLIA 3MJYA 5AHMA 2E09A 1QO5A 2DZSA 3BW4A 2EHHA 5KZMA 3MMTA 4JTEA 5F2LA 3TH6A 1J2WA 4PODA 1GWJA 2QKFA 4O4VA 4U4MA 4WD0A 3W7JA 4FIQA 5CZSA 3NQVA 5C6MA 3HPSA 1L6WA 4WZHA 3MWAA 4ZL1A 3QQ1A 1KM3A 1PV8A 4ZMGA 3ATZA 1ZNNA 2Y85A 2X2GA 3G1YA 3W1PA 3W7GA 3G1XA 3FLUA 3NGJA 1E51A 3UWWA 5F2GA 3LTSA 3S6DA 1ZCOA 1KTNA 4DQWA 1DQXA 1TPUA 1IGSA 3W7HA 4S2CA 4O13A 2QDGA 5AFDA 3OHIA 1DKWA 1QPNA 1O95A 3C0JA 3M47A 3R2GA 4FNQA 4FHAA 5E1QA 1WOBA 3O6DA 2ZRXA 2C18A 1RQEA 2TYSA 2JKAA 4NNAA 1XUZA 2B7QA 3R89A 3CTLA 3PWAA 3NQFA 3I7SA 1W0MA 4CNOA 5HJLA 1TTIA 2EPHA 2B7OA 4LUIA 4UCGA 4EF9A 1I8JA 5DLCA 1SZGA 4LOCA 1PL9A 3G1AA 3LB0A 4JS3A 4DF0A 4QM1A 4Z08A 2JKEA 3PAJA 5CZJA 4LU0A 1QR7A 4NJHA 2H3DA 1LOSA 1C9DA 3HPXA 3LV6A 1O5XA 3PC0A 3UQNA 3BLEA 2C6QA 3N14A 4AF0B 2NZLA 3LCXA 2NXGA 2VFIA 4N9EA 1EWEA 3O05A 3TQVA 5KSWA 2A21A 3IVUA 5HWMA 3FEMA 4O17A 3HMJG 2GQ9A 2FQIA 2OJPA 3IRDA 3CPRA 3TQ0A 3EWZA 1ZJIA 1XCFA 2CU0A 1W5OA 3QJAA 4XWUA 1D3HA 3IIXA 4IMCA 4K36A 4IXHA 1KM4A 2Y7GA 5F4SA 1XUUA 4LRSA 4LNYA 4NJGA 3TFXA 3L9CA 3H55A 3DFOA 3KOFA 2ZRWA 1L2UA 3A23A 1XC4A 3E02A 3JRKA 1Z48A 2HS8A 4WY0B 1SZEA 3KXQA 1JUEA 3MP5A 3M44A 4LY8A 4Q4KA 4DPPA 1TCDA 1ICQA 2OMAA 3GYEA 3ZR4A 4ADTA 1GT8A 3MI2A 3QSRA 2JK2A 2VFFA 2WPBA 3N2XA 2B7NA 4S2BA 5A5WA 5HR7A 3C8FA 1T99A 5G2HA 3UWYA 4JTUA 3R13A 3BPWA 2CZ5A 4XTDA 3NYZA 4LV4A 5BRBA 2LLEA 4KWWA 1U83A 3S1UA 2X16A 3GR8A 3TXVA 2NLIA 1VJIA 5D37A 2QCDA 5E0KA 2RDUA 5KZEA 5HWNA 4MZ8A 2J9YA 1RZMA 4LVBA 1AL7A 4RXGA 1TIMA 1LDCA 1K8XA 3NQ2A 3TAKA 3WJWA 3LXAA 4J9JA 5CSRA 3LX9A 1NFBA 1O94A 2FDSA 4MVAA 3L2IA 3AJXA 4WOZA 1OFRA 1XFBA 3SW6A 2VFGA 2ISSA 1JJKA 4JTTA 1M6JA 1JCXA 3G8RA 4TIMA 3PUOA 3KFTA 3UNDA 5C2XA 1H7NA 2GJLA 3IIVA 3NPWA 4QAIA 1GPWA 3QPZA 4K8EA 3NO5A 4E0CA 1XI3A 5AC7A 1VRDA 1H50A 3OVPA 4O1BA 5I3FA 5FF7A 4UTWC 3T78A 3GAKA 1LROA 2J88A 3G0SA 4Q32A 1ZALA 3UY8A 3IV3A 1H7RA 4DBEA 2B4GA 2VXNA 3S5ZA 1DJNA 1VLWA 2QUUA 3GR7A 4DF1A 5KINA 2WNZA 5LZLA 3M43A 2Y70A 4JDBA 5K7JA 1IXOA 3N2MA 2CW6A 1BKSA 1GTHA 3O6CA 5EPDA 3IGSA 2AQWA 2R94A 3INPA 4N9DA 4UMCA 5DCBA 4HHPA 1QMLA 3W1RA 1W31A 5D38A 4Z1BA 4WJEA 4PFMA 2YYUA 4O1DA 1EA0A 3SI9A 1GZGA 3QW3A 2EKCA 2YDAA 4MUZA 3A22A 1PS9A 5HNRA 4MIMA 2C14A 4NUWA 1G7VA 5C5YA 3TMQA 1TPFA 3QEZA 3A5VA 3WJXA 2QCFA 2DZXA 1W37A 2ZQ0A 1ME9A 3OIXA 4AHQA 2WOQA 4DF2A 5AYYA 4JY9A 1B3OA 2CZFA 3IGXA 3PVFA 4CCCA 2DZPA 1FDYA 5LSMA 3PG9A 5CPNA 5CZTA 4JICA 4Z0JA 3PSVA 2ISVA 3CC1A 1JCLA 5EKYA 4RXFA 3TFCA 3NVTA 3L0GA 1L6YA 1DVJA 3Q37A 1FDJA 4CCEA 2FTPA 3MO7A 1GTEA 1PIIA 2WSRA 3IEBA 3NZRA 3CWNA 1IXPA 3PG8A 4NVTA 2C16A 3C56A 3HOJA 3RU6A 1AW5A 2ZZ3A 4O12A 1UUMA 1W5PA 2H90A 4RKAA 4I7VA 5I3HA 5D2TA 1W3IA 3H54A 3W23A 1ME8A 1F74A 3IIPA 1PE1A 3G18A 1M5WA 5DN1A 5CZ0A 4JDYA 1P0NA 3A9IA 4ZZ9A 2TSYA 4YLWA 4UIOA 3TA6A 2BLEA 2H3BA 3CQ0A 2XFWA 3NL5A 1J4EA 2ZZ5A 4UNLA 4FNSA 1KBIA 1XM3A 3NZ1A 3ABQA 3A24A 3I65A 4KFPA 2J6XA 4ZQNA 1AK5A 1ICPA 3G1SA 1FY6A 1DHPA 1WXJA 4HNVA 2PE4A 3FOKA 4UC5A 1K7XA 3L0NA 2ZZ7A 4AWTA 1OFQA 3NL3A 5D05A 3HO8A 3S1XA 2FLIA 3EWWA 3LRMA 3L21A 1VCFA 3BW2A 3PUEA 2PRLA 2E6FA 3SJ3A 3KHJA 4M19A 2EGZA 4HNUA 3VKJA 5I3GA 1KM1A 2QJGA 4HPJA 2XN1A 3EWYA 1F05A 5CG7A 3S1WA 1D3GA 2X1RA 3IIZA 1CX9A 2CLMA 2YW3A 3GDTA 3RLUA 1B4EA 3W9ZA 4AMAA 3TXZA 5H91A 3Q58A 1W8SA 2Y62A 3NPVA 3VCRA 1KA9F 2ABBA 3L67A 4O1AA 4MZ1A 1QFEA 1DBTA 1W5NA 4GRSA 3B05A 1NF0A 2RHGA 3UPBA 3PUDA 1XDLA 3EX1A 1RD5A 1RV8A 1N55A 1GG1A 1T96A 3C2EA 1KFJA 2E68A 3NXFA 2WV8A 1OJXA 1LBMA 4Z1CA 4LUJA 1ME7A 1EIXA 1HG3A 1R2TA 1JUBA 1KM5A 1YLVA 1MEIA 1OFBA 1JVNA 1SO5A 1UUOA 4GUJA 2JGYA 1YYAA 4M7SA 4DXVA 2DJLA 3DBPA 4KWVA 3CHVA 5D2VA 3W07A 3EX3A 1YTDA 3LLDA 3KAOA 4GC4A 4LV9A 3L0KA 2RFGA 1MSSA 1IXNA 4GE8A 2V81A 4UUIA 4YL2A 4LVDA 2NXIA 3PBYA 4GUFA 4MY9A 5G4WA 3ATYA 1FQ0A 4JY8A 3UY7A 4MFDA 1JUKA 5LHEA 1Q3NA 3WFAA 2A0NA 3STGA 4U28A 2QAPA 3E12A 2YCEA 3M0ZA 4AF0A 1FX6A 2V2DA 2I14A 4Y8FA 4LVFA 4R7JA 4KFNA 3TJXA 4DEFA 4I7UA 4WQ6A 4MY8A 1H7OA 3NPXA 3MYOA 2E6YA 3KRZA 2HMCA 4IMEA 3CEUA 1G67A 2V2HA 4QJ1A 3R12A 4JYFA 3LTYA 5LNUA 3O6YX 2ZZ4A 3DFNA 1KFLA 3PBUA 1I4NA 4N9CA 3LGEA 2OT0A 5DY3A 5BW6A 3W7EA 1A5BA 4Z0SA 1JR1A 3PM6A 3P5ZA 1LORA 1VPXA 3PBVA 2ZZ6A 3O63A 4PTNA 4ADUA 5LGZA 3WJZA 4K8HA 1CW2A 5LNSA 2ZTKA 4HKPA 1KV5A 5G5IA 4UTUA 4IUOA 3BGJA 2A4AA 3EXRA 1K7EA 1J5TA 2W0UA 4QISA 2YX0A 1ML1A 2BX7A 4UTMA 4LWWA 4O53A 1FWTA 1OX4B 1VR6A 2QCEA 3LBMA 3GB6A 1WBHA 3UWZA 1QOQA 1VHCA 1A5SA 1QAPA 3BW3A 4UFLA 3P80A 3P82A 3WK1A 3W84A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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