4CNPA

Structure of the salmonella typhi type i dehydroquinase inhibited by a 3-epiquinic acid derivative
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
252
structure length
252
Chain Sequence
MKTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVDHFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTLNRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPSAEEMVLRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPVITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVKQASAPGQIAVNDLRSVLMILHNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE
publication title Mechanistic Insight Into the Reaction Catalyzed by Type I Dehydroquinase
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhi
total genus 97
structure length 252
sequence length 252
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2014-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4cnpA00
4M6QA 2QUUA 4Z08A 3F1QA 2W79A 3IIXA 3O06A 3LDVA 3GIYA 1MEHA 1C9DA 1FCBA 2YGYA 3M44A 3LXBA 2JGQA 1TPVA 1EWDA 1OK6A 4O14A 3USBA 3BGGA 3GX9A 4O1DA 4ONVA 2YDAA 4O18A 5C5YA 3TK7A 1R46A 4M7SA 3L5LA 1O4UA 4O0KA 2F84A 4M6PA 2NUYA 1X7FA 1LRQA 5C54A 4M6VA 5MHBA 4JTHA 2V81A 1OABA 2NXHA 3L65A 1WV2A 3TW6A 3W88A 3G8RA 2C3ZA 3A22A 2CZFA 5HNRA 5LHFA 4HHPA 3GDMA 3PB0A 3I7QA 3U2OA 1LRNA 3FJ6A 2XN1A 1W3TA 1JCLA 1W3NA 2WPBA 3TE9A 2QCLA 3P62A 4NNBA 4IOTA 1Q3NA 4L4LA 2Z0IA 5D04C 3IIVA 3SW6A 3FJLA 5D02A 2VFDA 3DKLA 3ZR4A 5BMXA 1QOQA 3A5VA 2V8ZA 2E6FA 1ALDA 4JTJA 5FEPA 2C13A 3NOEA 5LNUA 2X1SA 3N2XA 4MJMA 1GVFA 1PL9A 5K7JA 2EHHA 3B4UA 4GUHA 3W1PA 3MHGA 4UR7A 5GVJA 2QUTA 5KZEA 5G4EA 2H3DA 1NAL1 2ZZ6A 1HTIA 1G4PA 1PCKA 5FEXA 1PS9A 3TQKA 1A5CA 3IGXA 3MWAA 1ONRA 4EIVA 1IXQA 1QWGA 3EXRA 5A8GA 4JYFA 1SZFA 1K8XA 3TAKA 3STEA 1ZY9A 1S5TA 1F74A 3A21A 1JUKA 1LBFA 2PRHA 3HPXA 5G4WA 1VLIA 3W7DA 2PRLA 3B04A 4WJEA 3CWNA 1LBMA 5EMUA 1TPB1 3UWQA 3NQ7A 3W75A 3MYOA 1FCQA 3STGA 1FDYA 3NM1A 4ICNA 2GQAA 1KFJA 2CLOA 3QPZA 5AHIA 2R14A 3L5MA 6TIMA 3L67A 2FJKA 3LI1A 4NX0A 3LCLA 1P1XA 3EX2A 1MSSA 2Y7FA 4NNCA 1UUMA 4NJGA 1F5ZA 3G24A 4MUZA 3KOFA 5FI8A 2BZNA 1RV8A 1VZWA 4MLJA 4XUGA 3IVTA 4O4VA 5BMWA 4RKAA 1LOSA 2E1DA 1F6PA 2ZZ3A 4FX6M 4M7TA 2BLEA 1Z48A 3GDLA 3QJAA 4DXVA 1B4EA 4UNLA 4JS3A 2I1OA 2HSAA 3BLEA 1FWTA 1THFD 5T26A 3LRLA 2VFFA 4I7VA 5DBTA 2BXVA 1W1ZA 3M1ZA 1QPRA 1K7XA 2CLIA 3VFLA 1XXXA 1KTCA 3W73A 1AL8A 2ZRYA 3LI0A 3EWBX 1KW1A 3MP5A 1SPQA 1TPFA 3UNDA 3WJZA 4I7WA 3KRZA 3VE9A 4AHOA 4QM1A 3CPRA 3MMTA 3L21A 1OF6A 1WQ5A 3KVMA 2NV1A 2V5LA 1KTBA 1OFRA 5TQLA 1OF8A 4NU7A 3WJSA 3HG5A 3BW4A 1KM6A 2C16A 2I14A 3HF3A 3PB2A 3AO0A 1XCFA 1QCWA 5HR6A 1N8FA 2DZWA 4MFDA 4XTDA 2AAMA 2ZRZA 3NQ6A 1FBAA 1NVMA 1H7RA 3LHUA 4PODA 1I2QA 3G3DA 3W1MA 3DFNA 3B0UX 1JUBA 1JR1A 3EWXA 3WJYA 1LLWA 5K4ZA 3O63A 2QJHA 3INPA 1XUUA 2P0OA 2DZSA 1WBHA 2C6QA 2WQPA 4UTWA 1M6JA 1T96A 1OYCA 2YFOA 3EX6A 3M5VA 1ICPA 1AL7A 1VGAA 5AHEA 4HIBA 4DPPA 1HL2A 1K3UA 5DN1A 1QO2A 4O1AA 3OVRA 4JY8A 5IBXC 1NEYA 2WV8A 1LROA 4P61A 2OZ0A 1EB3A 3CHVA 1M7PA 3NQMA 3EKLA 1GYNA 1ME9A 1QO5A 2QDGA 4HPXA 1W5PA 3PC0A 3TDFA 3ZFHA 4FF7A 1UASA 1W5QA 2PURA 3UPWA 4MJZA 1SUXA 4WXYA 5AHFA 1T8XA 1TB3A 1OFQA 5D33A 1K03A 1SW7A 1ZAHA 1VYRA 2A4AA 4K36A 2CLKA 3LHZA 4JTFA 3C6CA 3PSWA 2JKAA 3W1QA 1KLZA 2Q3RA 2GVJA 3S1XA 1YXCA 1VLWA 5BRBA 1J5TA 2Q3OA 3R2GA 1WAUA 2YCEA 2Y7EA 1RR2A 3GDRA 4K6AA 2Y88A 1YDVA 2E5CA 1OFBA 4BI5A 2ISSA 2EAWA 3LHVA 4RK8A 1H7NA 1GG0A 2JKPA 1FDZA 4R53A 1I2OA 3P80A 3M16A 3N3MA 4YMZA 1IIHA 1JJKA 3STCA 5E1QA 1OFDA 3CIXA 1FWSA 4LVAA 1XFBA 4A2RA 1KM1A 3CEPA 5AN7A 4K7YA 2Y7DA 1I2PA 2YW3A 5J5DA 2FQIA 1H5YA 4UTTA 3MI3A 1L2UA 5KZMA 2QCEA 3E0IA 3CLMA 1T0OA 2ATSA 1GVRA 5K3VA 4QIUA 3CTLA 2Q8ZA 5BW6A 4FX7A 2J88A 1H61A 1MXSA 4K7VA 3KFTA 3SFKA 3BLFA 4S1FA 2YPIA 1VPXA 2Z2UA 5DY3A 3W7LA 1OX5A 2RDWA 3IEBA 3PG9A 4MZYA 2FB2A 1Q45A 4FO4A 4EWND 4QQ3A 1TPH1 3S1UA 3GZ3A 3LLDA 5CZSA 3TNOA 3RFAA 2B7NA 2J6XA 4BFAA 3HMJG 4MLRA 4IMEA 1VHCA 5BNKA 3C52A 4O53A 1G7UA 4RLIA 4O1BA 1N55A 4RZ5A 4BR1A 1XBZA 5KMYA 3TX9A 1W54A 2E6AA 2A6NA 3SECA 1Q6LA 3IIZA 4DO5A 3PY2A 1W5MA 1UB3A 1TRDA 2A7NA 4DPQA 3TSBA 3DI1A 2C18A 4O8RA 1EA0A 3W84A 2YYUA 2CLHA 3CB8A 1TV7A 4NJJA 1OG0A 4JTIA 3W1UA 3K30A 1QPNA 4NZFA 5EY5A 4Y6GA 1Q6OA 3SZ8A 3NGJA 1J2WA 3UPBA 3W9ZA 1J4EA 2OT0A 5FF0A 2VFHA 3S9YA 3IIPA 1VCVA 1TTQA 4LVBA 3CU2A 3NYZA 3FFSA 4O16A 3P74A 1IXPA 2CZEA 5ABTA 4UTJA 5LKYA 4S2CA 4CQAA 3S8HA 2BTMA 1KV5A 3LBCA 3IGSA 1OX4A 3N34A 3W2JA 4UTHA 5I3JA 3I7SA 4JX5A 3LTSA 1K7EA 1Z44A 4JN6A 1SW3A 4O50A 4ZVJA 5LNSA 2QAPA 4O11A 5EYWA 3W7JA 4KKXA 1TTPA 2X2GA 1OYAA 5HULA 4WUIA 1FCUA 4U28A 1KLYA 4CNPA 2H6RA 1F76A 2IQTA 4ZQPA 1H50A 2WSQA 1OX4B 1KFKA 2ZCGA 1VCGA 1YTKA 1WOBA 5HWMA 3U8GA 1QAPA 4O4WA 1ADOA 4IMDA 5HR7A 1TPC1 1EP2A 2ZTJA 3QH2A 4LW7A 1RQHA 1XBVA 1D3GA 4DF1A 5LGXA 1YDOA 4N4PA 1HUVA 3PBWA 3GR7A 3G18A 2HTMA 1W56A 2E68A 3G3MA 3JR2A 3BG5A 5C2XA 5CPLA 3NQEA 5E0KA 2ZFAA 1KFCA 1A5AA 3R89A 3W23A 4XKYA 8TIMA 2QKFA 3PVFA 5SWUA 1KFLA 3O15A 3MO7A 3IRDA 4O0ZA 2ZZ1A 3FYPA 4K37A 1P0NA 2GPTA 3EXTA 4PTNA 5DXYA 4ZQOA 1K7FA 3O07A 5HMSA 3DHDA 1TV5A 3W7OA 2ZZ5A 4FNUA 3MHFA 5EL1A 3OIXA 1EUAA 4JDYA 4JTGA 3QQ1A 1KV8A 1ZJIA 2Y62A 1K8YA 4JY9A 4XKYB 5HUOA 2Y89A 4ZL1A 2Y63A 1SO5A 1PHQA 2Z1BA 1G69A 4XZ9A 3G1YA 3LXCA 4DELA 1OX6A 2NLIA 3FLUA 3R12A 3CWOX 3LGEA 3UWWA 4BK9A 5F1UA 3HPZA 5LSMA 1GZGA 4E2DA 1YTEA 4NVTA 1B57A 4Y9AA 5H2ZA 3O16A 2NWSA 5D2YA 3DFQA 4AWTA 4RXFA 3NQGA 2J24A 2YYTA 3MP4A 2OT1A 5AHMA 1D9EA 5AHNA 3DFSA 1UJPA 4OWGA 2ZA2A 4IWWA 3C2OA 2WNNA 4N9EA 3LCWA 1LM1A 4MOZA 2NXIA 2C0AA 1Y0EA 2BWGA 3GXPA 1QMLA 2E77A 3P81A 3HG2A 3W71A 3OBKA 2G95A 3SGZA 4BF9A 3UWZA 1G4SA 1VS1A 1KTNA 4O13A 1GJPA 4HSNA 3B0VC 1AW2A 3S1VA 3GR8A 3FIGA 1Z41A 2YFNA 3T55A 1DKWA 2DU2A 3TC6A 1AW5A 2O7QA 4YWIA 3PUOA 1Q6RA 4IUOA 3PSVA 1DORA 4TMCA 3QW3A 2F7FA 3ABSA 1KBIA 2CFFA 4UFKA 1UCWA 1AK5A 1KFEA 3GXTA 4OU1A 3PAJA 4UNKA 3EB2A 3E12A 4HPJA 1XDMA 3NEVA 3P7YA 3SSJA 1IIGA 3W87A 3NA8A 5D2WA 2VELA 2QJGA 4ML9A 3UY8A 3QW4B 1JUEA 4ZQRA 3DFPA 5CPOA 1KM3A 1RD5A 3UQNA 1XC4A 4ZQCA 4QNWA 4YL2A 3LRKA 2VFIA 3QZEA 4E2BA 3NPXA 1DQWA 5LGZA 1EIXA 1WDWA 2NUWA 1TPDA 4NJIA 1TJRA 1UUOA 4RXGA 1TYGA 3A5FA 4FNTA 4JYDA 3B0PA 3BK0A 2ABBA 5F4XA 1LBLA 2I9EA 2EGZA 3NQFA 1FXQA 3W2KA 2JGYA 4NNAA 5HWJA 3NQ2A 1LCOA 4AWSA 4K38A 4AXKA 3LX9A 1VRDA 1I8JA 3M9YA 4FXRA 1XUZA 3GVGA 2H90A 4B5NA 4O10A 3QMTA 5DCBA 1IXOA 1BKSA 4QNEA 1ZENA 3G1VA 3M5ZA 3ABQA 3BW2A 4KWWA 1TTJA 1HO1A 4MFEA 4BI6A 2D73A 5D2TA 5DBUA 2NZLA 4NT0A 5F4WA 2B0MA 4FB7A 3AJXA 5AC8A 3W2LA 4AVFA 4JTLA 2E5DA 1P4CA 5HQEA 2WNZA 5FEWA 1GEQA 3Q2DA 4OV9A 3HOJA 3QPYA 3MHUA 1P0KA 3G1DA 4TO8A 1SR9A 3G1FA 1RQBA 1CW2A 2QJIA 2NX9A 1RVGA 4PCFA 4X9SA 3H53A 3C2VA 3O05A 4GUIA 1IGSA 2VFEA 2DZPA 3KVKA 1FQ0A 1OFOA 3NQVA 5D09A 5F2IA 1DL3A 3P82A 2QDHA 1G6CA 2DZXA 4OGZA 3W1RA 1PE1A 4ALDA 2Y7GA 1VQTA 2QCGA 4UIOA 2V30A 3P5ZA 3ELFA 4C1KA 1WXJA 1SZEA 3UY7A 1GYLA 3TH6A 3G0SA 3LV6A 4E38A 3PBYA 5D37A 1QPOA 3TQVA 3BGJA 4LOCA 4I9AA 5LHEA 4GUGA 4IJBA 3OG3A 4PFMA 3P61A 5AOUA 3U6WA 1X1ZA 2RDTA 3BPWA 3WK3A 4LVFA 5K9XA 3F4NA 2X30A 1ZAJA 1KM0A 2CZDA 4FNQA 2E5BA 3KRSA 4IMCA 4MYXA 1L6WA 3VCRA 2B4GA 2R94A 3W2MA 2CLFA 3FS2A 4GBUA 4GRSA 4RCXA 4Q4KA 4UUIA 1QR7A 2C14A 4M19A 2BSLA 1W31A 2X16A 4CLMA 1P5BA 2C1HA 4IXXA 3NQCA 1TCDA 2YX0A 3G0UA 1GPWA 3QFEA 1ME7A 4LWWA 3DFOA 3NVTA 1C8VA 1TPEA 3L0KA 1JCJA 1TMHA 5DCDA 2NXGA 2WKJA 5F4SA 4AHQA 3BG3A 4LS2A 3HGJA 4HSOA 3PBVA 2B7PA 3I68A 2VENA 3NNTA 5AYZA 3W7RA 4Z1BA 3N2MA 2HS6A 1R2RA 1XM3A 3PS7A 1PV8A 2BX7A 1LOLA 4JGDA 3UYCA 3VKJA 4HKPA 3P67A 3P84A 3BARA 5K4XA 3L66A 2ZRXA 4RJEA 1A50A 1Z42A 3DKJA 1F7BA 3TU9A 2J27A 4DBDA 1O95A 3EWZA 3MP3A 2Y6ZA 3RK8A 2A6LA 3LV5A 3C4UA 5CG7A 4P2VA 3UXDA 3TJXA 3M5YA 2UV8G 3TMLA 4CQ8A 3W7MA 5G2HA 1YADA 5U7SA 3EWWA 1V7YA 2W0UA 1S5VA 2ZZ7A 4YCPA 1QOPA 4UFLA 2V2CA 4DEFA 2DZVA 4ZZ9A 2PC4A 2X1TA 1G7VA 5FEZA 4X3ZA 3FOKA 1DVJA 1GTEA 2X1RA 1GT8A 3OHIA 2QAFA 1JULA 3BO9A 3W83A 3HIJA 4LY8A 3R8RA 3F03K 4MKNA 1EP1A 1VCFA 3SI9A 4JEQA 2CWNA 3TW7A 3W2UA 3TMQA 3W7PA 1SW0A 1VYPX 3STFA 3THAA 2YZRA 3GDKA 3LBMA 3TROA 3E49A 3LHWA 2DZUA 3ATZA 4FEZA 3UWVA 5D38A 1AW1A 1JQXA 1B9BA 4CNNA 3W07A 3PULA 2G97A 2QCCA 3OEXA 3P60A 4UFHA 3BLIA 3HGSA 3HGRA 4ADUA 4A21A 2ZDRA 3ABRA 3E9AA 2V82A 3IVSA 1I4NA 5CPMA 1PVNA 4EVZA 1OVDA 3W76A 4IX0A 1SO3A 1OK4A 2ZQ0A 3TA6A 3W72A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3I6E A;  1BYD A;  1EX1 A;  3BLK A;  3IIX A;  4H6E A;  3ITY A;  4OIF A;  1FCB A;  2BAS A;  3LXB A;  1OB0 A;  3CYV A;  3UG8 A;  1E5N A;  1UWQ A;  4O14 A;  3NJ3 A;  4ZR8 A;  3ZM8 A;  5DMN A;  4F79 A;  5GJN A;  3GX9 A;  4O1D A;  4QR6 A;  8RUC A;  2XZ7 A;  2YDA A;  2ZUV A;  3RIL A;  3L5L A;  4V1Y A;  3OQE A;  4XZL X;  1F6Y A;  2DUZ A;  1DJG A;  1X7F A;  4XD5 A;  1NWT A;  2HJP A;  4A35 A;  5C54 A;  4M6V A;  3SRK A;  2V81 A;  1OAB A;  2NXH A;  3L65 A;  4KS0 A;  1CTN A;  2CZF A;  4DWD A;  1HKK A;  2BG5 A;  4HHP A;  3GDM A;  4LQ1 A;  5EML A;  2CBI A;  3I7Q A;  3U2O A;  1LRN A;  2XN1 A;  3TE9 A;  1HKI A;  4NNB A;  2REQ B;  1TR9 A;  2Z0I A;  2ASH A;  5D02 A;  2AMX A;  3A5V A;  1WKD A;  1PKM A;  3FSU A;  4JTJ A;  3EDK A;  4YU1 A;  4HBK A;  1ECE A;  1ZBK A;  3KDN A;  3NOE A;  4GH1 A;  3TWB A;  2YLL A;  4MJM A;  3UCQ A;  1PL9 A;  1HJW A;  1Z6K A;  3MHG A;  1BHG A;  1XLJ A;  5KZE A;  3NTY A;  3FAX A;  2H3D A;  1NAL 1;  4Q8T A;  4S3K A;  5FEX A;  1KD0 A;  2PDI A;  3EXR A;  5A8G A;  4L65 A;  1ZY9 A;  3C0S A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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