4D2J | Genus

Total Genus 130

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	130
sequence length	338
structure length	338
Chain Sequence	SQEVAKELAENARKIAAPGKGILAADESTGTIKKRFDSIGVENTEANRAFYRDLLFSTKGLGQYISGAILFEETLYQKSPSGVPMVDLLKAEGIIPGIKVDKGLETLPLTDDEKATMGLDGLSERCKKYYEAGARFAKWRAVLSIDPAKGKPTNLSITEVAHGLARYAAICQANRLVPIVEPEILTDGSHDITVCAEVTERVLAAVFKALNDHHVLLEGALLKPNMVTHGSDCPKPASHEEIAFYTVRSLKRTVPPALPGVMFLSGGQSEEDASLNLNEMNKMGPHPFQLSFSYGRALQASCLKAWKGVPENKAKAQQVLMERARANGEAQLGKYGGG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE
publication title	Structural and Functional Divergence of the Aldolase Fold in Toxoplasma Gondii. pubmed doi rcsb
source organism	Toxoplasma gondii
total genus	130
structure length	338
sequence length	338
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2014-05-09

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4d2jA00

1NFBA 4JX4A 2VOMA 1NF7A 4FHAA 1GEQA 3P8IA 3L0GA 4O54A 2A7NA 4EIVA 4IGHA 1W3NA 3GYEA 2ZYFA 4HNUA 5D2YA 2JKPA 4Q32A 4UFIA 4IJBA 4UFKA 3LCWA 3ZFHA 2VEPA 1TJPA 3SZ8A 5CG7A 2CZ5A 5AYXA 2Y85A 2NUWA 1TRIA 2PURA 1G4TA 3NPUA 3C0JA 4UNKA 3T78A 2E6YA 3IGUA 1EX5A 2WNZA 3I7QA 1W3IA 3NQAA 2PC4A 3DFSA 1A5BA 3W2NA 5LZLA 4UR7A 1W5MA 2AAMA 4BWLC 3C6CA 2WKJA 1VQTA 3B0UX 4N9DA 1ME7A 2R8WA 3PSWA 3W88A 2WSRA 4E2DA 4WX2A 4X2RA 5DLCA 3DENA 4CNNA 4UTHA 3HO8A 5FF7A 1F73A 1B4EA 1XFBA 5BRBA 2BXVA 4K8EA 1I45A 3M41A 4BWLA 4KWVA 4RZ4A 1LP6A 3KFTA 1I2RA 1EUNA 4M7TA 5BOOA 2FQIA 5K4ZA 2E5CA 2RHGA 4I7WA 2FJKA 3EWZA 1H63A 3TAKA 3VKJA 3N2XA 3SI9A 1RZMA 4MZYA 5KZEA 4LVGA 1S5TA 1IGSA 1G6CA 4YXGA 1VPXA 1TIMA 2J9YA 2RH9A 2E5BA 4UMAA 4JY9A 4HIBA 1D9EA 3KVKA 1R2TA 1TCDA 2QCFA 2P0OA 1KM4A 4UTWA 3S5OA 3W70A 3FYOA 5L9FA 3VI2A 1EIXA 3DFPA 2V0TA 3PAJA 2ZFAA 2DORA 3C8FA 1H62A 5HR7A 1GG1A 1WX0A 2F7FA 5D2VA 1SW0A 4JTEA 3N19B 5F2LA 1P5BA 4EOUA 4R7JA 1G7UA 2R94A 4CCCA 4U4MA 3LCFA 3TV8A 1PVNA 4RZ6A 5I3HA 3WK1A 1VCVA 2C0AA 3JS3A 5ABTA 3AJXA 4HPJA 2QCDA 4UNLA 2RDUA 3UY7A 2XFWA 2NWSA 5I3IA 1F76A 5FEZA 2X1TA 3PBUA 3MP5A 1UBSA 2J88A 2C15A 3JRKA 4O0ZA 2QJGA 4L4MA 2RFGA 1G4EA 4O17A 3TC7A 5CZ0A 5CPMA 4YL2A 2V30A 4K7VA 2Z2UA 4JTLA 2J6XA 4LC6A 2G95A 4E0CA 1FDYA 2PRLA 1Z42A 4MYXA 4HNNA 5LNWA 1QPNA 1ZCOA 4PL2A 5DY2A 3EXSA 4JTTA 4NXSA 1E51A 4PCFA 2QUUA 1D3HA 1PCKA 1T99A 4FXSA 3W9ZA 4LS1A 5D2XA 1ADOA 3I68A 1GPWA 2DZWA 1OYBA 4FXRA 3LXCA 2ZRUA 1P1XA 1VHCA 3U6WA 4BR1A 3LGEA 5AB3A 3LM7A 1H7NA 1ZFJA 4O0KA 3W7NA 2Z0IA 4AWTA 2JK2A 4HSOA 4QISA 3CWOX 1CW2A 2ABAA 1B3OA 2RDTA 2ZBTA 3THQA 5F4SA 3W2LA 4IOTA 1GVFA 4BF9A 5D33A 3N9SA 5G1YA 3W83A 2A6NA 1WV2A 3BG3A 1KTNA 3NQ2A 2Z6JA 1AMKA 1RD5A 2BTMA 1D3GA 3P80A 5EYWA 1VHNA 1LM1A 1VCGA 3C2VA 4GUHA 1MEIA 3NDOA 4CNOA 3G1YA 3M5YA 1RR2A 3QPZA 3HJZA 2E77A 2V5BA 1GTHA 2OJPA 2QUTA 5FEXA 2AQWA 1OK4A 2WSQA 2OMAA 2ZZ2A 1EA0A 1LOSA 2C13A 2DP3A 3DAQA 1QNVA 1VGAA 3BVJA 3MHFA 2DZPA 4QM1A 2BX7A 2Z6IA 5C54A 4AH7A 2VFHA 4CLMA 1YYAA 3QSRA 1JUBA 3G1AA 3W73A 4LUJA 3BGGA 2X30A 2QAFA 4Q4KA 4NZJA 1QOPA 3TUUA 4UTTC 2X16A 3GXTA 1EP2A 1FXPA 3C2RA 3UNDA 4FO4A 4WY0A 4HSNA 2C16A 2EKCA 3BG9A 3FKKA 3WJSA 3LERA 4ZL1A 5HINA 3FJLA 3ELFA 4UTTA 4ADSA 1WAUA 3W7QA 1KLZA 2H6RA 1GVRA 2ATSA 3GR7A 6ALDA 4XTDA 2QCDB 5EBUA 1M7OA 1YXDA 4S2CA 2ISWA 4P61A 3PWAA 3H54A 2ZZ1A 3GDTA 4JTKA 1H60A 3PF3A 3INPA 1JCXA 1AL7A 4N2YA 5D2WA 3MHGA 1M5WA 5BNKA 1X6UA 2QEZA 1G69A 4Z0SA 3CU2A 2DU2A 5LNVA 3KHJA 1TTPA 5F2IA 3S1UA 2W0UA 1BWLA 4Z08A 4K8HA 5A5WA 4JYEA 4JN6A 1SU5A 3BW4A 3E9AA 3LV6A 3TW6A 3WJWA 1K7XA 4HT3A 3NZRA 1X1ZA 1SQ7A 3W7CA 3BLEA 4AEOA 1YDOA 2HS6A 4QJ1A 1TTJA 1BTMA 2C1HA 5LHEA 1AK5A 5CPOA 1FBAA 5AHMA 1ME8A 1OFBA 1I2QA 3W1RA 3LCLA 4O11A 1VZWA 3UWWA 1AL8A 3W7HA 1W0MA 4XKYA 1QPQA 3NEVA 4DPQA 1WDWA 4JS3A 3GZ3A 4KFPA 2CFFA 4RV8A 3M1ZA 4IX2A 3W7PA 2CLMA 3N3MA 2W79A 4K7YA 3S1XA 5HWNA 1DJNA 2VFEA 2Q8ZA 1A5AA 4O1DA 3QMRA 3WK2A 1KLYA 4XBKA 2DZUA 1I2NA 3MYOA 5D30A 3VE7A 1YXYA 1H1ZA 3N34A 3HG2A 4XUGA 4H6KA 1IIGA 3RLUA 4J9JA 2ZA2A 4BI5A 1FY6A 3O6DA 4MLJA 5AHEA 3KRUA 3TJXA 5DELA 3G1SA 3KX6A 3O05A 3Q94A 3S6DA 5AYYA 3B05A 4IMEA 2ABBA 3PM6A 3W6YA 1FCBA 1XM3A 3P67A 3LBCA 5CPLA 1OF8A 2A5HA 1W8SA 4R34A 2BLEA 4FX8A 4IX0A 5CZSA 1VYSX 1GOXA 3A5FA 3T55A 3IVUA 3PULA 3BARA 5G4EA 4YWIA 3LV5A 4BK9A 1TV7A 3Q2DA 2QDHA 1ZAJA 4O15A 5LNSA 3I6RA 4ZQRA 1IF2A 1SW7A 1KM6A 3EWYA 1K7EA 2QDGA 3NZ1A 3UD6A 3GXNA 3UWQA 2VFFA 4JTUA 3NQDA 1H7OA 4LWWA 3F1QA 3QFEA 1FWWA 5CZTA 1YPFA 8TIMA 4I7UA 1OFPA 5AFDA 4ML9A 2XN2A 5HJLA 3W85A 3QQ0A 3MBDA 3MP3A 3NVTA 2C3ZA 2TSYA 3E12A 4GUFA 1VYRA 2NLIA 3IIVA 2C19A 5G2IA 3TMLA 3HB9A 1OABA 4FNUA 2CLLA 3LCGA 4FB7A 4OT7A 1VLIA 3U8GA 2YW4A 1TYGA 3UY8A 1JR1A 1XCFA 2H3DA 3UPWA 3UPBA 2YPIA 2PCQA 4M6QA 4UC5A 4OHQA 1SSGA 3PS7A 1KM2A 1JCYA 4UTUA 4AB4A 5E0KA 1GVQA 1Q45A 4O16A 2J27A 1SO6A 4JX5A 2A4AA 5G4WA 5LGXA 3HGJA 3KRZA 2YZRA 3OIXA 2YFOA 3E02A 1W5PA 1HO1A 1A5SA 4ZVJA 3CPRA 5HWMA 2NUXA 1LRNA 3BK0A 3G18A 3L21A 4AF0B 1GJPA 4XKYB 4MZ1A 1IXNA 2YSWA 4XBSA 4EF8A 2DJLA 3IIZA 4NT0A 3DZ1A 5DCBA 3M0ZA 1GYLA 4UTKA 3LHWA 1ZY9A 3G3MA 4JGDA 2VEIA 3MUXA 3QQ1A 3IIXA 3MMTA 5E1QA 1LBLA 3E0IA 4ADTA 3NR0A 1MEHA 2QCNA 3TJLA 1AG1O 3T44A 3NM3A 5G2WA 5K9DA 3EB2A 1V5XA 3S5ZA 3WFAA 1W3TA 3QEZA 2I1OA 3W1XA 1PHWA 4AHQA 4Y8FA 1XBYA 5DBUA 2B7QA 4UTJA 1F7BA 1XDLA 4NJJA 2A0NA 3SGUA 5BMWA 4DO6A 1LYXA 3QPYA 3LI0A 2WNQA 4IMFA 3TU9A 3H55A 3W1TA 4ZQMA 5D38A 2F84A 3V1PA 3D0CA 3W7EA 1R47A 4UFMA 1AW1A 3EX6A 4OQVA 4M6VA 4EVZA 4K6AA 1G4PA 4HNVA 3RK8A 2EF9A 5D03A 1XKYA 4P2VA 3QC3A 3C2FA 3TQKA 1LRTA 4O1BA 3R89A 5MHBA 2H8ZA 3W7KA 3LHZA 3WK3A 1K8YA 4NVTA 4NZFA 4AHPA 5KMYA 4FNQA 3CHVA 3L0KA 1T8XA 3LBMA 3MP4A 3W7OA 4C1LA 3QH2A 4A3UA 3ABSA 3LLDA 2P10A 3L5AA 4OE7A 3L66A 1JQVA 1YLVA 1VRDA 1TQXA 2E6DA 1FDJA 3NQ7A 3NPXA 2YDAA 1O4UA 4O1CA 4QQ3A 3NNTA 1AW5A 3R12A 5DCEA 1MZHA 4E2BA 3P8JA 3NL6A 5CPNA 3L65A 3O1NA 5LNUA 4H3DA 2B4GA 4JX6A 4RZ5A 1EUAA 3W1LA 3WJYA 3F4NA 5LSMA 2O7SA 3HGRA 4Y90A 4TIMA 1WOBA 2YFNA 4RX0A 4DF0A 1G7VA 4N02A 1MXSA 4HKPA 4NU7A 3LTPA 5KINA 5FEPA 4MY9A 1X1OA 4ORIA 5K9CA 1H7PA 1SPQA 4JR5A 2Y7GA 3MI2A 1ME9A 3GDMA 3LHTA 4QNEA 3DFNA 3HG4A 2YX0A 4LY8A 5F4XA 3CIWA 1TPVA 3TCEA 4H4IA 4ALDA 1O94A 1FUYA 1RPXA 3QM3A 5F1VA 2X1RA 4GJ1A 2X1UA 3NOEA 3G24A 3B0VC 1ICQA 3LOTA 2ATMA 1LROA 1FXQA 3TQ0A 3T40A 3W1AA 1SZGA 3WK0A 2RDWA 2YW3A 1BWKA 1C29A 3TROA 4RJEA 2PRHA 2HSAA 1O95A 3PR2A 3TE9A 1ALDA 3PBWA 3NAVA 3T4CA 4PC8A 4LS2A 4MFEA 4GRSA 3ZS4A 1SZNA 3GDRA 4A21A 4O57A 1TPUA 1WYIA 1KM3A 1SW3A 4S2BA 2VELA 4N6FA 4UMCA 1C8VA 1GTEA 2QR6A 2Y70A 1OHLA 4MVAA 3FLUA 1QR7A 3NGJA 3HGSA 4LNYA 3RF9A 3NQGA 3L68A 3O06A 2CWNA 5F4WA 4JDBA 3W7JA 4IPIA 2Q8LA 1S5VA 2R91A 4N9EA 1OYCA 1K3UA 2V82A 2TRSA 4RR4A 1NSJA 3O63A 4LVDA 1PE1A 2NWRA 1DQXA 1KM5A 5I3KA 5G5IA 3UXAA 1YTDA 4AHOA 2A85A 5FF0A 1SUXA 3EX3A 2ZZ7A 3G3DA 3FA5A 3SW6A 1GG0A 1KFKA 5D02A 2GQ9A 2JBMA 3GDLA 4WJEA 1XBXA 3I65A 3C61A 4DPPA 1QFEA 4FNRA 1FWNA 2VXNA 4IXHA 4ONVA 2NXIA 1W56A 3OHIA 3WJXA 5K9XA 4O28A 1OF6A 2HMCA 3UWVA 2ZRXA 3R8RA 3R13A 5IM51 3TH6A 5F1UA 3NQFA 3ZWSA 3DGRA 3OA3A 1KM1A 1KFBA 1UJPA 1K02A 4PFMA 5KSWA 3G1DA 1ICPA 3ANYA 1GVSA 3LTYA 4GUGA 3MW7A 3O8AA 1PCWA 5DXYA 2QJHA 3W74A 1H51A 2E1DA 3BPWA 1KFEA 3QYQA 4W9TA 5D37A 4PODA 4NJGA 4O10A 4BFAA 4NQ1A 1RQBA 4ZZ9A 1N7KA 3GIYA 3QZEA 3M7WA 4E38A 1M6JA 1UB3A 1O5XA 5I3FA 3W76A 3DI1A 3IGSA 1FDZA 4BI6A 3NPWA 4O4VA 4UXDA 5HUPA 4JTIA 3HPSA 5D09A 1W54A 1S5WA 1SZEA 1OFOA 3W1QA 2QAPA 4LVFA 3E96A 2Y62A 2ZQ0A 2JGYA 3EX1A 3M5VA 2QKFA 2RKXA 1FX6A 5FEWA 1SO5A 3SFKA 2JKEA 1F5ZA 1WQ5A 1L6WA 1H61A 1TPB1 4UUIA 3HG5A 3W1UA 3C2OA 4BI7A 2VFDA 2J24A 3B04A 3CB8A 3GVGA 4FNSA 1KW1A 4LT9A 1K03A 1UUOA 3C2EA 3S5YA 4XQ6A 3LCXA 4CQAA 1OG0A 3IVSA 2J9ZA 4KFNA 4OV4A 5IBXC 1EB3A 3B8DA 5AHNA 3FYPA 3G1XA 1CX9A 1XUUA 3P60A 3OVQA 2GVGA 3SGZA 1V7YA 4NX5A 1NAL1 2WPBA 3S42A 2Y61A 3C56A 5IBXA 1TTQA 3E49A 3W7LA 4HN4A 1Q6LA 1SFJA 1ZAHA 1PIIA 3P5ZA 5BW6A 2FPTA 1YADA 5CKSA 1EEPA 2HTMA 3IGXA 4MYAA 3W7RA 1KV8A 1NVMA 3LHUA 3DFOA 3W87A 3HOJA 4GNJA 2GQ8A 3EKZA 3L67A 1Z44A 4MFDA 2ZDRA 3NXFA 3PC0A 2DZXA 2ZRVA 4DO4A 5AHFA 1KFJA 2VFIA 5J5RA 4IXXA 3M43A 3KAOA 3UWUA 1SO3A 2ALDA 3W1NA 4AF0A 3EWBX 3AO0A 4QAIA 4UCGA 3C4UA 2A7RA 2WOQA 3PB0A 4K36A 2FFCA 3NM1A 1G67A 3ATYA 3A24A 1MEWA 1Z41A 2CLOA 3M9YA 3CT7A 4O19A 3G0UA 3S1VA 3S1WA 4IPJA 4POCA 5EKYA 1H1YA 4X9SA 2C14A 3LI1A 3NQVA 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3GLCA 1XXXA 1LLWA 3NA8A 3B03A 4TR9A 1EP1A 2QCHA 3FJ6A 1ONRA 1HUVA 4FIRA 1JVNA 1WA3A 5KITA 1LZOA 3MI6A 3M5XA 4C1KA 2QCEA 1KFCA 1TJRA 1ZAIA 2YYTA 3TQVA 4A22A 1IXOA 3STFA 5EL1A 3GNDA 4UFJA 3STEA 1HL2A 4IQLA 2Z1BA 2CLIA 2ISVA 1KM0A 3FEMA 4MY1A 3W86A 4Z1CA 4WUIA 3GKFA 1JJKA 1M7PA 3A23A 5EPDA 1P0KA 1ZNNA 2VKZG 1C9DA 1FCQA 4L4LA 5KTLA 4K38A 1Q6RA 4Z1DA 1SR9A 2P1FA 3FS2A 4AWSA 3PB2A 3ABRA 1VC4A 1L6SA 2TMDA 1SFLA 1TPEA 2E6FA 2DZTA 2H8XA 5HNRA 3BV4A 3FKRA 3RMJA 3P84A 3W2JA 1TQJA 1Y0EA 1DBTA 3T7VA 1VCFA 4I7VA 3P7YA 5K4XA 1TTIA 1I2PA 3NL5A 3TSDA 4GXMA 1OFQA 1TPWA 3OVPA 1L2UA 1OFRA 3THAA 4AXKA 2GVJA 1XL9A 3QW3A 1OJXA 2BSLA 3G8RA 4LU0A 4LV4A 2GPTA 5C55A 4O14A 3O16A 3NL2A 3G0SA 1W37A 3GXPA 4GUJA 1QCWA 4QSHA 1FCVA 2H90A 4PTNA 5AOUA 2V9DA 3SY5A 1U83A 3LX9A 3STCA 3P5YA 4X22A 4FNPA 5I3GA 3BO9A 1QOQA 5K3VA 1W5QA 3IIOA 3HPZA 4WZHA 5CSSA 3WJZA 1S3HA 4JD4A 1A53A 2V8ZA 1HO4A 1HTIA 1OYAA 2DZSA 1OFEA 3O07A 3VCRA 2CLHA 5DBTA 2ZRZA 4FX7A 5AHLA 2DJXA 2YXGA 2C6QA 3LRKA 2QUVA 1JUEA 5FF2A 1SSDA 2WV8A 4FIQA 3GAKA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4D2JA

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