4DWSB

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
540
structure length
527
Chain Sequence
KPTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDDGENYVLLIELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Chi2
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia entomophaga
total genus 190
structure length 527
sequence length 540
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsB01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsB02
1ODUA 4TOQA 2WKGA 1B3ZA 3CUJA 1XV8A 1FFRA 1EDGA 4EKJA 4ML4A 1HN1A 4P8UA 3CZLA 5C8BB 4JFSA 4HPGA 3W4RA 2VZUA 3WUEA 1M03A 2UY4A 3APGA 2NT1A 2WMJA 1JAEA 1KXVA 2XFYA 2E0PA 2WMGA 5A2CA 4V27A 3POCA 4MNJA 1B3VA 4PUEA 4PMNA 3VTRA 3WMBA 1KWGA 3BAYA 2D20A 1JI2A 2CKRA 1QPKA 4PMDA 1QNPA 4XZBA 1ISZA 3SCWA 1E72M 5C70A 1UR4A 3AMGA 1HF6A 4MNLA 4GZEA 4AEEA 4WK9A 1I1XA 4KH2A 1E71M 4HPHA 1XD0A 1J10A 1UD3A 4J3UA 3NCOA 1DWFM 4QFUA 4QAWA 3UETA 1US3A 1OT1A 3VO0A 4QLJA 3OLIA 5D4YA 2J7CA 4MAZA 3S2CA 1HJXA 4TX8A 1OIMA 1W32A 4JIEA 4YHGA 2PWEA 1HVQA 1YQ2A 3GZAA 1KXHA 1UKSA 1V3IA 3SCRA 3KE0A 2ZE0A 1MFUA 2JF6A 2OWWA 1M04A 3ARYA 2ZUSA 3N11A 4UNIA 3KL5A 5BXRA 4Z2LA 1V02A 1TA3A 4AD3A 4MPKA 2QMJA 2GJXB 5GPRA 3AIEA 3II1A 3NIYA 4CN4A 3CTTA 5A8MA 1E55A 1WP6A 1YHTA 3W82A 2D2OA 2J77A 5I0DA 1CGVA 2IXVA 5BRPA 4PBGA 1LLOA 4LX4A 5I2UA 3WL1A 3MV01 1CGTA 3FXYA 2ZUNA 1GOMA 5JIWA 2WLZA 5A6MA 3W37A 2VX5A 2W66A 7A3HA 2VQUA 4PEEA 2QF8A 5FD0A 1MQRA 2WMFA 1C92A 2D24A 2WZEA 2OSYA 5EMYA 2F8QA 1CLVA 1CXHA 1V0NA 2JE8A 2X1IA 1OB0A 1UH3A 2VCCA 4CD7A 1A3HA 1RPKA 1E4NA 1UH2A 3W28A 1NWSA 1W9DM 2G3IA 3ALFA 3AHYA 4U31A 3GTNA 3WBEA 1GOQA 3WH8A 1NOFA 3ZT7A 1V3LA 3ARXA 1CGWA 5IXEA 1EHNA 3E1F1 4FK9A 2VX7A 3EDDA 5HDRA 5BXPA 3W25A 1XC6A 1E6NA 2ZOXA 4LQ1A 2CBJA 3FAXA 4X0NA 2E3ZA 4D6GA 4UCFA 1J0ZA 3EDJA 3VNYA 1QBAA 2FHFA 5CPTA 4FLOA 5CSUA 1HJSA 5AYBA 5EBAA 1WZLA 1PIGA 4MJ2A 3GYCA 3DC0A 2FGZA 1EO7A 1BVNP 1UR9A 1CGYA 1OM0A 3ARZA 1G9HA 4BQ5A 4UTFA 1NQ6A 2WMIB 1W1VA 5FCZA 1CZ1A 4IUGA 2C7FA 2D22A 1J9YA 4B9YA 4GO9A 3AHXA 3AHVA 4V28A 2E9BA 2C0HA 1XHGA 3AISA 4ZEPA 4L4PA 1V02E 5I77A 2GSJA 2JF7A 2XTKA 1E56A 4P7QA 3TTOA 3O2LA 1TZ7A 1WB0A 2FDMA 1WPCA 1VFMA 2YA0A 3PZOA 3AZSA 3OLGA 2J7DA 2YDRA 8A3HA 2J62A 4JHZA 1FHLA 1LG1A 1NWUA 2X8RA 1KFWA 2CBIA 5CQ1A 4K68A 3K1DA 5CGTA 5HOSA 1UUQA 5JUVA 3CLWA 1K9EA 1B90A 3UG5A 5CLTA 3WELA 2VZSA 4Z2IA 3TP4A 5A3HA 1KGUA 1MWOA 1GOOA 1H5VA 2XPKA 3AHZA 1ZBVA 1C8QA 1XH0A 1TG7A 2UY2A 1FOBA 1WAWA 1MVYA 2WVUA 1J0IA 3PTMA 3SUSA 3ZR5A 4PMOA 3GNOA 2GVYA 1UD2A 1V0MA 1SMDA 1KCKA 2EEXA 1E5JA 2XVKA 1UWIA 2BVDA 3RMEA 1CWYA 2X05A 1CXEA 3CUHA 1RP9A 1CGXA 1H41A 3ZT5A 3B9EA 1XYZA 4N0RA 2YIHA 1PX4A 5GNXA 4QCFA 3RJYA 1FP9A 1JF6A 1OIFA 1V6UA 3OGRA 2CPUA 1DWIM 5IFPA 2VL4A 1UD4A 3MO4A 3RO8A 3UR7A 2ZX6A 2A3BA 4M80A 5FL1A 4XX6A 3SIMA 1GHRA 2FHBA 3T0DA 2G4FA 3W29A 3M7SA 3ZSTA 1W2VA 1UQYA 3EDEA 3MV11 4PSRA 1UWTA 2OSWA 2CCRA 3B9DA 3BMWA 2WVSA 1G0CA 4P7RA 5D9MA 1I75A 2YKKA 4AIEA 1DWHM 3FN9A 1Z32X 1V6YA 1ZS2A 1LQ0A 3ZT6A 2TAAA 4GZJA 2V3DA 3PZ9A 1HP4A 4M56A 2CIPA 4AZGA 3VD3A 5DF0A 4CUCA 1BG4A 2V5CA 3NUKA 1BPLB 1XSKA 4PYSA 4P8XA 2YL8A 1JDCA 2XUCA 3RM9A 4UR9A 2WBKA 3L4ZA 4ZENA 3WD2A 3PZVA 1BGAA 3O9NA 2YLAA 1GHSA 4W8AA 4CD4A 4ATLA 1ZB5A 2BS9A 1W9UA 1BYCA 2CNCA 3BSGA 4UFKA 3WF1A 5I79A 2VQTA 1W9BM 1HL9A 2VC9A 3AS2A 2NSXA 4URIA 1SYTA 3ZJ8A 1HIZA 1DTUA 3W0KA 4N42A 2E9LA 3ZO9A 2EPKX 4BZYA 4RE3A 1RD6A 4PRWA 1X6NA 3KZSA 2WANA 4WKHA 6TAAA 5HBFA 3GXIA 1K9TA 3WIJA 4KRUA 4OKDA 1JYNA 3LMYA 1VENA 1W2PA 3ZJ6A 1NH6A 1RH9A 4JHOA 1E40A 4AD2A 2BY0A 3WNNA 4D71A 2VT0A 4W86A 3LPGA 4LPCA 2NT0A 1QNQA 2Y4SA 3IJ9A 3NDZA 3AHTA 1E0XA 1EOMA 4J28A 1JAKA 4D1JA 1ZBWA 4GPNA 4AXNA 1CENA 1W3HA 3CZGA 4F9JA 2W92A 3ALGA 4PMQA 5I23A 1C93A 3FNDA 4GI8A 3LPFA 5M5DA 2OSXA 3T0BA 4EK7A 3RCNA 1MXDA 3T09A 1WCGA 3NSMA 1JZ8A 1HJUA 3WMCA 3VIFA 4NI3A 1GUVA 1ZBCA 3RJXA 4MADA 5D9NA 4E8DA 1UYQA 2YA2A 2GJRA 1E43A 3KL0A 1G1YA 2BY3A 2D0HA 5A6SA 4HMEA 2XVGA 1WO2A 1MXGA 1E0VA 5A8QA 2WC3A 3WNMA 4IM4A 2WK2A 2J75A 1B3YA 4ATDA 4CD5A 1P6WA 3OZPA 1OGSA 2YDSA 4FLSA 2VZTA 3NSNA 5EB8A 1AQHA 2BY1A 5E09A 3ZQ9A 1E5NA 1NWTA 3VGDA 3MMUA 4PN2A 5A95A 1J01A 2JEPA 3AROA 3OIHA 3I3DA 4AD4A 2GJPA 3S6TA 1WNOA 4UZUA 1H3GA 4GIAA 5E6YA 2O9PA 4HZ6A 1A47A 2VRQA 4BA0A 1VIWA 3PZMA 4PTXA 5E9AA 5LYRA 1R7AA 2PBGA 2W91A 3KEHA 2WCGA 5ECUA 2GDUA 3AMDA 3BSHA 2XYLA 3WF3A 2QMKA 4ATWA 2CESA 3SEPA 1QI0A 3SUVA 3RIKA 1HJWA 2F2HA 3CHCA 2EQDA 3L4XA 5DEZA 2D3LA 4R5EA 5ABFB 4X0VA 2CERA 2GFTA 4AD5A 2VO5A 2WZHA 4P7NA 5D9PA 2DSVA 1QW8A 4BCEA 3SCPA 3D5HA 1VEOA 4OOZA 1HVXA 4JCMA 3WDHA 2D0FA 4B16A 1V6VA 5M03A 2X0YA 3AICA 4BQ2A 4UQDA 1ISXA 3N13A 4OZOA 2DDXA 1KBKA 1WE5A 8CGTA 3PZUA 1OBAA 1UD6A 1TCMA 5CPSA 2WWDA 4GINA 1GVIA 1KR0A 3W81A 3WQ8A 1JI1A 4D6DA 5GQBA 4BS0A 3CZJA 1B31A 3VDAA 1ISWA 1WDRA 3IJ7A 1CEOA 2J7FA 1HKKA 1UR8A 4YPJA 3WDJA 4CU7A 3SUTA 3FW6A 4JL2A 2AOSA 1HP5A 1UH4A 2WPGA 4V2XA 1F4HA 5E0CA 4EE9A 1EDTA 1UWRA 1J11A 4D6IA 2BHYA 3PBGA 3K8LA 2YL9A 4UQBA 3WL0A 1JDDA 2WYSA 2PF0A 3UCQA 1QVBA 2CKSA 2D1ZA 3WEOA 2CBUA 1KR1A 4UFJA 4TTUA 3VKKA 2WAGA 2PB1A 3EYPA 2O9TA 4C7FA 5BYWA 4XV0A 2XWDA 3WH5A 5ABEA 3WDIA 1QHZA 4AIUA 1JFXA 4W7WA 6A3HA 4HU0A 1E4LA 5A6BD 3M6DA 3OLEA 2FH6A 1B9ZA 2CITA 4P7LA 1E6SM 1PBGA 4KWUA 2WHKA 3PTKA 2XGBA 3IAPA 2J8FA 4AD0A 5I5RA 2O9OA 1UOKA 3NYDA 4A3YA 2DSZA 4J3SA 4AZIA 3GNPA 3VU2A 1J0YA 2DT3A 1KQYA 4EAMA 5CZKA 3M07A 5HPOA 4J3TA 3ZMRA 5BWFA 1FP8A 5CLWA 4QP0A 4ZXLA 3WQ6A 1DHKA 3AS1A 1WDPA 3HN3A 4JFTA 2XFRA 4F8XA 3TONA 3PZNA 3ZOAA 2QPSA 3CO4A 1JZ2A 3AYSA 1VB9A 4NSBA 1ECEA 2QLYA 3KWXA 5D8ZA 2J74A 1UR0A 4WKAA 3UR8A 2ZX7A 1XSIA 4NZCA 1TE1A 2CEQA 2GDVA 4WIWA 3THCA 1V0LA 3G6LA 5CG0A 4QCEA 2YA1A 2WHMA 1J18A 1BVZA 2HVMA 1U2YA 1KWKA 1V3KA 3AIRA 4GKLA 4B9ZA 3UEQA 5E70A 1Q6GA 3N1AA 2FHCA 2Z1KA 1TMQA 3AIWA 1PZ2A 4U3AA 5CXPA 2Q8XA 4GI6A 1US2A 2J4GA 1GJWA 4MB1A 1AQMA 3AIQA 1ZBKA 2D0GA 3K4DA 4PCTA 2ZIDA 4UQCA 1PJ9A 2YL6A 4AZCB 4DUWA 3WN6A 3AS3A 1VRXA 2Y8KA 1PX8A 1AVAA 2X09A 1MQPA 3F5LA 1UA7A 3SCQA 1JD9A 1E1EA 1R86A 2XSBA 4H2CA 4QLLA 1D3CA 3CH9A 4FLQA 1JGIA 1UZ1A 1TA3B 4EANA 3CMJA 1O6IA 1LJYA 3AZTA 2UY3A 5BXSA 4TVDA 2VCBA 1ITXA 3VX1A 2VX4A 1EIBA 2DT2A 2Y2WA 5IHSA 2WHLA 3VM5A 3L4WA 4PCSA 2EBNA 3L4YA 3PZGA 1W3KA 2WCSA 3SUUA 4OIFA 1TUXA 2QHAA 4CU8A 3CMGA 3WBAA 3PZQA 4MDOA 2XM1A 1DWAM 2XFFA 4FMVA 3WH7A 2X0HA 4JCLA 4D72A 2CHNA 1S46A 4A4AA 1WZMA 2WKLA 3IANA 1BLIA 1BAGA 1QW9A 4E4PA 3NDYA 2WZIA 4PMZA 3CUFA 2G3JA 2WWCA 2VJXA 1F4AA 4U5IA 3W38A 2ZX8A 3WMSA 3WF4A 5FOOA 4L4OA 1B1YA 4W84A 3SCTA 4DM1A 2BVTA 4CKQA 2XSAA 4JFUA 1XRVA 2VZVA 5A2AA 3CUGA 1W9VA 2VURA 1GOIA 1J0KA 3MU7A 2WBGA 1TVNA 4TVCA 4HA4A 3UG4A 4TX6A 1VJSA 2VRJA 2BXYA 2VZOA 1JZ4A 1AMYA 4MNMA 4M29A 1K6AA 1BFNA 5DO8A 1VAHA 4BQ3A 5CGMA 1LL4A 2VR4A 1SFSA 2XIBA 3VILA 4TTGA 2PWDA 1BHGA 2DGAA 3BAKA 4LYRA 4GZIA 1TFVA 3ARTA 1NOUA 5AC4A 3MUAA 1JZ6A 1MQQA 3AIVA 3TTYA 1EDQA 3MUY1 3VIIA 3VGFA 2GUYA 3BAWA 3WQVA 2E40A 1JF5A 1GCYA 1UD5A 1G5AA 2WHJA 3W6LA 1WKYA 3EBVA 2EPMX 3L2MA 2YDQA 1HL8A 4GQRA 4CVUA 4PTMA 3W53A 1B0IA 3N18A 4B3LA 3GXDA 3U57A 3IJ8A 4W5ZA 2PI6A 3MSGA 3ECQA 1W91A 3UG3A 3EMQA 2WC4A 4W85A 3PTQA 4CN6A 1JXKA 2XGIA 1UWUA 3ARSA 2PWHA 5JBEA 5JBFA 2WMHA 4AMCA 1DWGM 5EFDA 2V38A 1OGGA 5ABHA 2ZX9A 2BFGA 2Y5EA 4AZ6A 3W27A 2DIEA 2EO7A 3N12A 2O92A 3AIBA 5TD4A 1LG2A 4HOZA 3QOMA 4A3HA 1LL7A 4BQ4A 1JYVA 3K8KA 3WSUA 2YLLA 2J7BA 2WVVB 4PMYA 1JIBA 1UR1A 1E6QM 1V6WA 5BRQA 4PUDA 4E2OA 2OWCA 2YOCA 3CPUA 3CBWA 4IPLA 1JYXA 4U3CA 1NM9A 3I3BA 1GZJA 3WH6A 3QHMA 1B3WA 3AMLA 1J0HA 1JD7A 4DWSA 2J25A 3WFLA 5A6JA 4AD1A 4ACZB 1EXPA 1J12A 3TOPA 1Q6EA 4CCEA 3AMCA 3AZRA 3W26A 1OD0A 3TA9A 3JUGA 1BGGA 1M01A 3SCNA 3IAQA 4H7VA 4W8BA 6CGTA 1HJQA 2PC8A 3MANA 3A6OA 3T2OA 5ABFA 3CHFA 1U33A 3VGHA 3VX0A 5CSYA 2VI0A 2V5DA 1HX0A 1EQPA 4D6HA 2ZWZA 3W24A 1BYAA 4RE2A 1UD8A 1Q6DA 1E9LA 2WCAA 1QNOA 4W5UA 3WH9A 4CD6A 2G3MA 1JXJA 2VCAA 2VNCA 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 1FA2 A;  3MS8 A;  1KB3 A;  4D6J A;  1W3J A;  3BGA A;  2F61 A;  4U2Y A;  1C90 A;  3OGV A;  1E6Z A;  3VIG A;  2E8Z A;  4MTV A;  4TXE A;  3BCF A;  2E4T A;  1UKO A;  1H09 A;  1IZJ A;  3K8M A;  1G01 A;  1PAM A;  4W89 A;  4HP5 A;  5JIP A;  3ZSS A;  1C7T A;  2J47 A;  2ZWY A;  1E1F A;  1H11 A;  1CLX A;  5A6K A;  1UG6 A;  3DYM A;  3ZJ7 A;  5I24 A;  3AMK A;  2UY5 A;  5A69 A;  2BY2 A;  3QGV A;  4DWS B;  2WM0 A;  3EDK A;  5A8P A;  5EFF A;  3SCV A;  4B3K A;  4S3J A;  4AZ7 A;  1R7O A;  1V03 A;  4KGJ A;  2XVP A;  1MYR A;  3VMO A;  3VVG A;  3F4V A;  4WSJ A;  2A3H A;  3WQW A;  3HU7 A;  5DT5 A;  3ZIZ A;  2XVL A;  4J27 A;  3DEC A;  4D1I A;  2VVN A;  4JFW A;  5M3W A;  1UHV A;  4LYQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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