4DWSD

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
539
structure length
532
Chain Sequence
PTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTKPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDKDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSNQETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Chi2
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia entomophaga
total genus 191
structure length 532
sequence length 539
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsD01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsD02
1J12A 1HJVA 5LA0A 1Q4NX 1QVBA 4CGTA 2CEQA 4H2CA 2J62A 4CKQA 1XRVA 1E72M 4QLJA 3AROA 1B30A 4TTGA 1EO7A 3AZRA 3SCOA 2WMHA 4X0VA 1EGZA 4AYSA 4HOZA 5DT7A 2ZUVA 4D6GA 3D3AA 4CCDA 1G1YA 1HJXA 2PC8A 3U57A 1M04A 3IANA 3WUEA 1NQ6A 3KEHA 3WQ6A 5A94A 4CU8A 2Z1KA 4LPCA 3MV01 1GJUA 2XVKA 1V3KA 3N11A 4MB5A 4TOQA 2J47A 4ATLA 4TVCA 4UFJA 1JL8A 2ZX8A 4A4AA 1PPIA 4DWSD 4Q22A 1U33A 4PMUA 4MTVA 1E3XA 5A6AA 5CPSA 2JF6A 3S6TA 2WM0A 1EH9A 4ZENA 3VM7A 4DWSC 3UR8A 3ZMRA 1L8NA 2CERA 5CGTA 1V0MA 3VIPA 2WC3A 5ABFA 4OUEA 4W93A 4J3XA 3GBEA 1W3HA 2IXVA 1NOUA 1V3MA 2FGZA 4JIEA 2EPMX 5D9MA 3PTMA 1Q6CA 3VTRA 4Y7EA 5A1AA 1V3IA 3WD1A 4U31A 2MANA 1BG9A 1FH9A 1HIZA 1LG2A 3CPUA 4KGJA 5IHRA 1V02E 1HKIA 2YBUA 1LJYA 1UD6A 1LL6A 2VCCA 1E6PA 1E1FA 2G4FA 4AXNA 4PTWA 3CZGA 1IZKA 2CITA 2VI0A 6TAAA 3WD0A 2QLYA 3I3BA 2VZSA 2WANA 1V0LA 1C8YA 3PZIA 2ZXBA 5JIPA 4WSJA 3DHUA 1QW9A 4ACZA 3WSUA 1GOKA 5GNXA 1CYGA 5IFTA 6CGTA 2JF7A 1HJUA 5E9AA 1UD4A 4UFLA 1HKJA 1UH4A 3TP4A 3CMJA 3JUGA 2VVSA 4PTMA 4AMCA 5AC4A 1DHKA 2YL5A 3BLPX 2WMFA 4D71A 1GOMA 1RP8A 4WSKA 2WXDM 3SUTA 1JYXA 1GVIA 3OLDA 1UA3A 1B90A 3PBGA 3SCTA 1OD8A 3AQUA 3IJ7A 4W7WA 3GM8A 1UD2A 2PI6A 4FLRA 1UKOA 1V02A 2UY2A 3CIVA 1E4NA 1WCGA 4GQRA 5FIPA 1WPCA 1WB0A 2XGIA 2Z1SA 1UWUA 1Y7VA 3OA5A 4CD4A 1JFHA 4D6IA 1E56A 5BXTA 1MW1A 4CD8A 2X09A 2CESA 1JDAA 1VAHA 2WLZA 1AVAA 3WL1A 1OGBA 3THDA 4WJXA 1HJSA 1H3GA 1UKTA 1D7FA 1HVXA 1UWQA 1HF6A 3MV11 4ZE4A 2WC4A 3K4DA 3CHFA 5DT5A 4JKMA 1GQJA 2BFGA 3AIUA 4FK9A 1UKPA 4E8DA 1F4AA 3VILA 3WDQA 1V6UA 1V03A 2AMGA 5BXSA 4W87A 1M53A 5D9OA 1FHLA 1JI1A 4YHGA 2XPKA 2J8FA 3WMBA 1NARA 1X6NA 4UNIA 5IHSA 3TTYA 4F9DA 2J7EA 5I24A 3BLKA 5LYRA 3BMVA 4EKJA 2ZUSA 3T0BA 1QHPA 3BSGA 3PTKA 3VGEA 1IV8A 2CKSA 4HPHA 2HVMA 3A4XA 4WIWA 1D3CA 1XYZA 3BAKA 3AXHA 5CLWA 3ECQA 2E9BA 2IXUA 3WEOA 5BROA 1DWGM 3GNPA 4GO9A 3SCRA 3G6LA 1JGIA 2DPEA 3QHNA 3VVGA 1C92A 5E0FA 3AHZA 1W1VA 8CGTA 4RE3A 1A3HA 2E8ZA 3VIIA 1DWJM 4H7VA 3MO4A 3BXWA 1K9DA 2GJXB 3NCOA 1CGXA 2WPGA 3GH7A 3SCNA 4CVWA 3L4XA 1OGGA 1JF6A 4L4PA 3AYSA 3W4RA 4W7UA 3MMDA 2XVNA 1JZ7A 4D72A 4R27A 5F7UA 3WUGA 3GBDA 4GZEA 1E5JA 1GOIA 3ALGA 8A3HA 3AHVA 2J79A 4LYPA 2BVDA 2XFRA 1MFVA 3CGTA 3VD3A 1QOXA 3IJ9A 4MNJA 4PCSA 1B3WA 5ECUA 3VDAA 3MSDA 1ISWA 1E0XA 2DSKA 3M46A 1VEPA 5DO8A 1VJSA 3K8KA 1GCYA 4H8HA 3LPFA 3AIBA 4AD2A 1E40A 1KQYA 4HMEA 4U3AA 1OCQA 3VIMA 2J78A 4W85A 2CBVA 1FH8A 4JL2A 3ARWA 3F5JA 1QI3A 1J0HA 2WHMA 3F5KA 3ZT7A 4MB4A 2YIHA 1C8XA 4JFUA 3WD3A 2QPUA 3RJXA 4R5EA 3OG2A 1ISZA 3L4TA 2OYKA 3T2PA 2WB5A 1XH2A 1ITXA 1HX0A 2D22A 4TX8A 2J7FA 1B3ZA 3VIKA 1C93A 3AIEA 1CIUA 3CHDA 3MMWA 4TTUA 2VZOA 1BF2A 3WUFA 2V3EA 1GVYA 4W86A 3AIRA 2VURA 1E9LA 5CQ1A 4S3JA 1K6AA 1H09A 3GDBA 4N42A 3AIVA 3WH7A 2V3GA 5A6MA 2JIWA 2FH8A 3BH4A 1VFFA 2XG9A 4U3CA 1BYDA 1JDCA 2D23A 2X05A 1OSEA 4TXEA 5D8ZA 2BVTA 3QOKA 3U5UA 4GPNA 4B16A 1VENA 1C3FA 5FKYA 1G01A 3PHAA 1QNQA 2VVNA 4M82A 4D6DA 3M6DA 4V28A 3SIMA 2WMJA 2WSKA 2AOSA 4W89A 4Z2GA 3AHYA 3WFLA 4GI8A 3RDKA 3II1A 4HA3A 1GW1A 3EDKA 2YDRA 3CTTA 3RO8A 2WCGA 3N15A 4ZXLA 2WK2A 2CXGA 1WP6A 1GOQA 3O9NA 3ARVA 2WVVA 1ISVA 4HZ8A 1JZ6A 2G3IA 4EE9A 2EPOA 2ESCA 2VRJA 3DC0A 5HOSA 1BGGA 2DSZA 1KCKA 2YOCA 1B31A 2Y24A 3PZVA 2D3NA 4B9YA 2J7HA 1UR4A 1VF8A 3N18A 1TCMA 4MDOA 3QOMA 2A3EA 1WNOA 1B9ZA 3AMCA 4MNMA 1HP5A 3WQ5A 3AXIA 4J28A 1BPLB 2XJ7A 4OKDA 4UR9A 3L4WA 2NSXA 3WDPP 4D6JA 1LF1A 2YDQA 1OD0A 1UR9A 3N1AA 5I79A 5CXPA 3ZJKA 1SMAA 2V3FA 1JG9A 1EXPA 5C8BB 2WWDA 1Q6EA 3W82A 3KL0A 2G8ZA 1ISYA 4W7VA 1ZB5A 1J18A 2O9TA 1J9YA 1LL4A 1IT0A 4QFUA 1ZL1A 3KZSA 3W26A 4MB3A 1Q6DA 4HMCA 1BYBA 4ZEPA 3G6MA 1CXEA 2XVLA 4X0NA 4MNKA 5I2UA 1EHAA 3GH4A 1FH7A 1QI5A 2J7DA 2WHLA 4NRRA 2HISA 1SYTA 3W24A 1WZLA 3WY1A 4UQBA 2XM1A 4PMNA 4S3KA 4WKHA 3KL3A 3LPGA 1KBBA 1W91A 4U5IA 2G3JA 3WDHA 2V5DA 5EB8A 1GQLA 1CGUA 4MB1A 1EHNA 3K8LA 1OWQA 3MUAA 4LGXA 4XZBA 1UZ4A 2B31A 1LG1A 3NSNA 2WLYA 1WDSA 3E1F1 3VGHA 1E71M 3WD4A 2J7GA 3BAWA 3T2QA 1B1YA 3CZKA 2E9LA 3VMNA 4M56A 5IDIA 2BY2A 1UWSA 2ZICA 1HL8A 4AW7A 3AIWA 4AD5A 1E3ZA 2F2HA 3W0KA 3RM9A 4IUGA 2QPSA 4AZBA 1NP2A 1EQPA 4XZWA 3UESA 4CUCA 2ZIDA 3EMQA 3ZR5A 3VIJA 1UQYA 1UKSA 4OBRA 1CXFA 4PEEA 2OLHA 2XGBA 4UQEA 1U2YA 3PZMA 4JL1A 1QI4A 1H0IA 4JCMA 3SUVA 4UQAA 3W37A 2WZEA 2XSBA 1TE1A 2J75A 1UOKA 4D6CA 5A8OA 2D1ZA 3OZPA 1EA9C 4H04A 2YKKA 3VKKA 4DWSB 1RD6A 3CUHA 3GH5A 4W8AA 1YQ2A 1B0IA 3W28A 5I0DA 3FY1A 1BYCA 1OIMA 1JDDA 4PUDA 1CLVA 3VIHA 1E70M 4HU0A 4UFKA 2PWGA 1KGXA 1WE5A 2XFFA 2YL8A 3PZQA 4J3UA 2VMFA 1CEOA 3MUY1 2XVGA 1W9VA 3AFBA 1FFQA 3IAPA 4W88A 2WMIB 4H41A 1GQIA 1JXJA 1E1EA 3N9KA 1UWTA 1E43A 5FL0A 3AIQA 1PIFA 4J3TA 4D6EA 2VR4A 3VDHA 2ZXAA 3SEPA 1H4PA 2AAAA 2YLLA 3ARSA 3WDJA 4AWEA 3CUGA 1O6IA 4RE4A 4XX6A 3WF4A 5FL1A 1U30A 5CJ5A 1VEOA 7CGTA 2J8GA 1V3LA 3WQ4A 2ZWZA 1OGSA 1HJWA 1S46A 1SFSA 4LX4A 2VX7A 4M24A 5ABEA 1GONA 2BY1A 5CGMA 2W62A 1OT1A 3BAYA 3WDIA 1J0JA 3OLGA 2WZHA 2BY3A 2X1IA 1W32A 2BHZA 1CNVA 1CGWA 1VFOA 2GDUA 4P7QA 3ZT5A 5AC5A 4V2XA 1W1TA 4E2OA 2J7CA 2VC9A 3HN3A 3W53A 4UTFA 2WVVB 1JZ2A 2VTFA 4JCLA 2YA0A 2D24A 1E5NA 3EYPA 3POHA 2DIEA 2WAGA 1BHGA 7A3HA 2XWDA 4GINA 4XUYA 3SCPA 2CKRA 3UR7A 2RGLA 3WF2A 3NJ3A 4ZXOA 4AD0A 1H49A 3BGAA 2VNCA 4AEFA 3GXFA 3B9EA 3OIHA 2VR5A 4B9ZA 4MPKA 4K68A 3AJ7A 3AISA 4J3SA 3PTQA 1BTCA 1GHRA 4MDPA 3OLEA 4NI3A 1UWRA 2WVSA 1EOKA 4EANA 3WNOA 3OLIA 4RL3A 1E55A 1DWIM 3ZM8A 1XH0A 2YA1A 2GK1A 5EFDA 3VO0A 3RMEA 4CN6A 1QW8A 3QR3A 1QHOA 1O7AA 2CBUA 1UKQA 4AZ6A 1K9EA 1DEDA 1HKMA 1V3JA 1PJ9A 1MFUA 1AMYA 2ZXQA 1NWTA 5EMYA 3M7SA 1HT6A 5A2AA 3NSMA 1UG6A 2XHYA 4W5UA 5E6ZA 3UG5A 4AC1X 5D9PA 1B3XA 1WDPA 2DEPA 5M5DA 2F8QA 1HN1A 2VRKA 1DWFM 4D1JA 3ZOAA 2VUYA 4C7FA 1NWSA 2YA2A 3A6OA 1KXVA 1ZU8A 5JUVA 3I3DA 3IK2A 4JFVA 1UR8A 3WKZA 1FFRA 4KWUA 1YHTA 4HMDA 1OINA 1EDQA 2BXYA 4DUVA 5M3WA 4KRUA 5M17A 3VM5A 1ZJBA 1WO2A 2OYLA 1D2KA 4M81A 4BQ2A 1R7AA 1C90A 3A4WA 1W2VA 1GHSA 2EPNA 2J74A 4M80A 4TX6A 3THCA 1JNDA 4JFSA 3CUJA 3TOPA 3CUIA 4P7NA 1ZBVA 3PN8A 2DSVA 1FP9A 1PEZA 2D2OA 1CXLA 1XD1A 1W1YA 1OBAA 2D0GA 2Y8VA 3IAQA 4W8BA 4M8UA 3CUFA 2VZUA 1MWOA 2VX6A 1JD7A 5D4YA 2PBGA 3CBWA 2GFTA 1C7TA 1W3KA 3NUKA 3WNKA 3FAXA 3N17A 3ARRA 3VD4A 4ATWA 4HA1A 3HU7A 3EDFA 1XC6A 2XTKA 2JEPA 1NOWA 2WVUA 4KH2A 3VIGA 4WF7A 3ZSSA 2J25A 1E15A 2DGAA 2VO5A 4B15A 2VQTA 3UG3A 1KGWA 4E8CA 1TR1A 3T0DA 1J0IA 2CBIA 1UR1A 3ZJ8A 1IZJA 5KZ6A 2O9PA 4CCEA 1LL7A 1PZ2A 2WKLA 1KB3A 2GSJA 3DECA 4F66A 3BSHA 3APGA 5JBEA 4CU6A 1CWYA 4JFWA 2EXOA 3VD9A 4UOZA 3EDJA 3NIYA 4FLQA 3SCQA 2W4XA 1UA7A 4W5ZA 2W61A 1BAGA 5ABFB 1PZ3A 4UQDA 4UQCA 2DDXA 1MW2A 2J7BA 3EMZA 4TVUA 1A47A 4FMVA 5A69A 1OT2A 4FLSA 3VGDA 4KGLA 1V0NA 1QPKA 4KRTA 3CHCA 1GZJA 4XB3A 5CLTA 3WDRA 1VFUA 3UERA 4PRWA 1JZ8A 2J77A 1SR0A 1KBKA 1RH9A 3MS8A 1VRXA 3S2CA 2NW0A 3WH9A 5I6SA 2WHJA 4PMXA 1HJQA 1HXJA 1W3JA 1P6WA 3LPPA 3MANA 5A95A 3AHXA 4BZYA 2ZXDA 3FW6A 4J3VA 1KCLA 4AZGA 2WHKA 3B9DA 3DYPA 4HA4A 2WKGA 4WLCA 3VMPA 4HP5A 4ACZB 1UYQA 4GKLA 5I5RA 5E70A 1BGAA 2Q8XA 3OZOA 3L4VA 1W2PA 1BVNP 4NSBA 5DEZA 1MQPA 5FCZA 3VX1A 2OWCA 1HKKA 1X6LA 3VNZA 2CIPA 1CXKA 1GORA 4M29A 3WF1A 5ABGA 1QI2A 4C7DA 3WEZA 1JZ3A 2J4GA 3WMSA 2VRQA 3FNDA 4PN2A 2FHBA 4KMQA 1VB9A 3AXXA 5IFPA 1ZBCA 3ARTA 3AMGA 1DWHM 1XSJA 1XYFA 4UZUA 1TZ7A 5BXRA 2JALA 2GUYA 5EBAA 4CVUA 1L0PA 1EO5A 1EOMA 5TD4A 1MYRA 4AIUA 3AMDA 5A2BA 4M1RA 1QBAA 2XM2A 3RM8A 3AMLA 4J7RA 1XHGA 4JKKA 4B3LA 3TTSA 5AYBA 1W9UA 2DT2A 1QHZA 2YLAA 1AQ0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4GI6 A;  2DSU A;  3CH9 A;  1X1N A;  2GK1 B;  3HMC A;  3ARQ A;  1Q6G A;  3AOF A;  1VFM A;  5FOO A;  5E09 A;  3L4U A;  4GI9 A;  4OIF A;  3DYO A;  1HL9 A;  3BAJ A;  4ZFM A;  2A3H A;  4D6F A;  4Z2L A;  1SMD A;  2WZI A;  1EDT A;  1LWH A;  4FLO A;  5HNN A;  5A6J A;  2X0Y A;  1KXT A;  2D3L A;  2FHF A;  1KWG A;  2WC7 A;  3WEL A;  3GXD A;  3W6M A;  6A3H A;  4OOZ A;  3W38 A;  3NYD A;  2A3A A;  2OWW A;  3T0A A;  5CSY A;  1FP8 A;  2GJP A;  1DTU A;  1XSI A;  2FH6 A;  4MAD A;  1UQZ A;  1XCX A;  1E4I A;  2Y5E A;  2RGM A;  5CPQ A;  5I23 A;  5I78 A;  4EAM A;  1QNS A;  2CPU A;  3DYM A;  4PMY A;  1PX8 A;  5BWF A;  2O92 A;  2WVT A;  1E6Q M;  1ZBK A;  3K1D A;  5BRP A;  2QMK A;  1R85 A;  3ARY A;  4GZI A;  1V6V A;  2E4T A;  3W27 A;  3A4A A;  3A3H A;  1H2J A;  4MAZ A;  3WNM A;  1UD3 A;  4F8X A;  2DH3 A;  4B3K A;  3VIF A;  2E40 A;  4HU8 A;  2FHC A;  3FHA A;  2OYM A;  1CXH A;  9CGT A;  3AMK A;  4EK7 A;  1F4H A;  2BV9 A;  1I1X A;  5BYW A;  1UD8 A;  1XD0 A;  4MAV A;  3GNR A;  1GOW A;  3WBE A;  2YDS A;  1KXH A;  3MUZ 1;  1VBR A;  3A47 A;  5JH8 A;  4Q7N A;  1UWI A;  2XYL A;  3K46 A;  4NRS A;  1B3Y A;  3KE0 A;  2YBT A;  4DUW A;  5A2C A;  4AY1 A;  3L2M A;  1GPF A;  2ZX7 A;  3CMG A;  2PWF A;  2VCA A;  1V6Y A;  3T09 A;  2D0F A;  1ZJA A;  1JYN A;  3AIC A;  3AZT A;  1H5V A;  4BQ5 A;  2EPK X;  1GNX A;  2EBN A;  3NDZ A;  3CZE A;  1QNO A;  4DM1 A;  2W5F A;  4BS0 A;  1KGU A;  2DH2 A;  4FF5 A;  2UY5 A;  4H8V A;  3VGG A;  4P7O A;  3WFZ A;  3AHT A;  4AD4 A;  3B8S A;  1MW0 A;  1TA3 B;  2VZT A;  3VD7 A;  4HPG A;  3ZST A;  4QLL A;  3FXY A;  3RJY A;  3FHQ A;  4LYR A;  1PBG A;  2DSW A;  1V6W A;  5DFA A;  1RPK A;  2QF8 A;  1E0W A;  1VJZ A;  5I77 A;  4J27 A;  5HDR A;  3WH6 A;  4GQQ A;  4YPJ A;  2CYG A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1H5V A;  5K2Z A;  5FJI A;  3V5F A;  4R3U A;  5LNU A;  3MT1 A;  2X2G A;  4DM1 A;  1L6S A;  3UZJ A;  3TN4 A;  1TPW A;  2DH2 A;  4JTT A;  3VGG A;  3QY7 A;  4AD4 A;  3UY7 A;  4A29 A;  5H1W A;  2IQT A;  3U3H A;  1WDD A;  2AQO A;  3RJY A;  4HIB A;  1PBG A;  2DSW A;  1P5B A;  1D7K A;  1TJR A;  1A4L A;  2YCI X;  3VND A;  5E5C A;  2GJN A;  4YWS A;  3UZZ A;  3L7R A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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