4GUH | Genus

Total Genus 90

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	90
sequence length	259
structure length	259
Chain Sequence	NLYFQSNAMKTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKAGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVKKASAPGQISVADLRTVLTILHQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	3-dehydroquinate dehydratase
publication title	Reassessing the type I dehydroquinate dehydratase catalytic triad: Kinetic and structural studies of Glu86 mutants. pubmed doi rcsb
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus	90
structure length	259
sequence length	259
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date	2012-08-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01487	DHquinase_I	Type I 3-dehydroquinase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4guhA00

1VH7A 1LORA 3GDKA 3SW6A 2EAWA 1W5MA 1AK5A 3QSTA 1X7FA 3ABQA 1TIMA 5EKYA 3IVSA 3LXAA 3EWZA 3LX9A 3G1XA 4IXXA 4UNKA 5F2LA 5LZLA 2ZZ5A 5F1VA 4TMCA 4WOZA 1SPQA 1LBFA 2EF9A 3THAA 3TXVA 3SI9A 1AW1A 5D02A 2C18A 2ZZ7A 4Y90A 4UTIA 3EKZA 1Q6LA 4PCFA 1YDNA 1FDYA 2Y6ZA 3GYEA 2BLEA 4NNAA 1VR6A 1D9EA 5H2ZA 3SFKA 4LUIA 5BMWA 3O63A 1AW5A 1OHLA 1SO6A 5FESA 1ZALA 5AC8A 1J4EA 3QSRA 5DXXA 3LTSA 1WX0A 1O94A 3HF3A 4IX0A 2NLIA 3SR7A 1K7EA 4LS0A 3O6DA 1LLZA 2Z1BA 5K9CA 1SQ7A 4RX0A 3LBCA 3WK0A 1K03A 1K3UA 3MWAA 3W2NA 1KFCA 1O5KA 3TFCA 2ATSA 1DV7A 3W6YA 4K37A 3NQ2A 2XFWA 1FXPA 2NUXA 2X16A 2ZRUA 3KRZA 4JIQA 1HG3A 4KWWA 3B03A 5D2YA 2H6RA 4Z1CA 1TPFA 3FYPA 2Q3OA 2FB2A 4ZQMA 1JR1A 3LRLA 3NDOA 3W1AA 1WOAA 3QMSA 3FOKA 4GWEA 1EWDA 4BFAA 3SGZA 3CLMA 2FJKA 3A9IA 2J9ZA 4E2DA 1A5CA 4K36A 1TREA 4FNUA 3QRHA 2WV8A 3G1VA 3S1VA 2J9YA 2V2CA 2E5BA 1WOBA 4I7WA 3GDTA 4JX4A 1R2SA 2H3BA 4CLMA 1KM2A 1DQWA 4UTKA 1FWSA 1N7KA 2GPTA 5DCBA 5IM51 2EGZA 1Q45A 4NX5A 1DVJA 2QF7A 1FXQA 2FDSA 3TDFA 4IOTA 1VGAA 4UFIA 5H91A 2ZA2A 3S8HA 5F4WA 4BK9A 2WKJA 1RZMA 5D2WA 4BI5A 1I2QA 3QC3A 4JTFA 4UR8A 4C1LA 4FEZA 2VOMA 4KWVA 3MYPA 2A0NA 2A6LA 2VFGA 1ZHAA 2Y63A 1DKWA 4JD4A 4N4QA 4ZL1A 4QISA 1X6UA 1OX4B 3W7OA 3TK7A 1FDJA 3M5XA 2V9DA 1PL9A 3HG3A 3JS3A 5D30A 2NX3A 1E51A 2A7NA 3A24A 3TUUA 2QCHA 3P7YA 4O10A 4NNCA 4AWSA 5FEXA 2R8WA 4HHPA 3LCWA 1S5WA 1PE1A 4YWIA 1QO2A 1KBJA 5U4NA 1ADOA 3GR8A 3NPVA 3W7NA 1FDZA 4HNUA 5J5DA 1W3NA 3PR2A 2F7FA 2DU2A 3NPUA 4AH7A 4UTWC 2E6AA 3IIZA 2ZCGA 3TA6A 2Y61A 3PC0A 1AMKA 4IUOA 1Y0EA 4X22A 1NF0A 1TRIA 4HKPA 3HOJA 4W9TA 5F2IA 3EWWA 4MY8A 4EF9A 1W37A 3EX3A 2XN0A 3R2GA 4JTSA 3DKLA 4O16A 4JTTA 3M9YA 1SW0A 3ZWSA 1TQJA 4FIRA 4EVZA 2DP3A 3ABRA 1TYGA 4XBSA 4NNBA 5CG7A 4JTHA 1B9BA 3OEXA 3L0KA 4MVAA 1SO5A 2HTMA 1GVFA 4TR9A 3W3OA 3M5VA 1FWWA 3LCFA 5KTLA 4MJMA 1GG1A 1T96A 4N02A 4JYEA 1FX6A 3WJZA 1JCLA 5HINA 2V0TA 5HNRA 4MFDA 4N4PA 2BX7A 4GBUA 3GLCA 4XWUA 3S5ZA 2ZRXA 2I1OA 1EPXA 2X30A 5LKYA 4Z1BA 1LM1A 2PC4A 3DHDA 3NPXA 4JYDA 4DF2A 1UUOA 1JCMP 1TB3A 3B4UA 1KLZA 1SW7A 1GTEA 3RK8A 3M16A 4FXSA 1P0KA 1TPWA 1OYAA 1TPDA 3W7IA 3S0CA 4GXMA 3KX6A 4WD0A 3C2OA 4K7VA 2Y7GA 4K38A 3HBLA 3LXBA 1KFJA 1C9DA 2WNNA 2Q8LA 5LNRA 3UPWA 3G1FA 4ADSA 4A21A 1BEUA 3DFOA 4MIMA 3T44A 4DO6A 3WJXA 1GVSA 3DBPA 3F03K 3PBYA 3F4NA 3BW4A 4NQ1A 5G4EA 4MY9A 4YLWA 3MI3A 3RLUA 1LZOA 3NQEA 5U7SA 1UBSA 3TC6A 1I2RA 1LYXA 1VRDA 2WPBA 3B0UX 3QMTA 2GUUA 3FKKA 2A5HA 3SSJA 3W1XA 5KITA 1J2WA 1R2TA 3IEBA 5AFDA 4OV4A 5FI8A 4NJHA 3S5OA 1ICPA 3IVTA 1B4KA 1LDCA 4WY0A 3L66A 1GZGA 2NX1A 2VEMA 1OF6A 3UYCA 2CZEA 4XBKA 1Q6QA 4DF0A 2E6DA 1H51A 3NL3A 3NQVA 1YTKA 3TW6A 4NUWA 1JCYA 1VPXA 1XI3A 3GX9A 3C2RA 2WNZA 4GFSA 3VKJA 4HNVA 1H61A 3C6CA 3O05A 2G95A 4HPJA 4PL1A 3VE9A 4FB7A 5LNUA 3O06A 5HUOA 3BG5A 2ZA3A 4M6PA 1IF2A 4WUIA 4FIQA 1WBJA 5E1QA 2P0OA 1H7PA 4D2JA 1EUAA 4OT7A 4RLIA 3IIOA 1X1ZA 4I7UA 2GQ9A 4KKXA 1B3OA 3ZS4A 3W7JA 1UASA 1R30A 1T0OA 4LTSA 3LHYA 4MKNA 3W7CA 2QCLA 3AO0A 1MSSA 3VI2A 4GUJA 4X2RA 3E02A 4O8RA 2HS6A 2V2DA 1IXPA 3PUEA 4O0ZA 3G0XA 3C56A 1VJIA 1S5TA 3U6WA 3H55A 8TIMA 2P1FA 4FNPA 3SECA 3TNOA 5HWJA 3BVJA 1I2NA 3W7DA 4JY9A 1J5TA 3H54A 2WQPA 1FBAA 5AYZA 3UWZA 1P4CA 5HWNA 1RVGA 2VFHA 3MP3A 4LC6A 1F7BA 4IMFA 1JQVA 1MEWA 3G1SA 4AWUA 3B06A 1NEYA 4S2CA 3FIGA 3T4CA 4ZMGA 4K39A 1KFKA 3S42A 3CHVA 2CZDA 5L6UA 2ZRWA 3KFTA 1XM3A 2TYSA 1OJXA 2AAMA 1G69A 3BARA 4O50A 3W84A 3IIXA 3MUXA 4NJKA 5EBUA 5I3IA 1OFRA 1KM6A 2AGKA 3E12A 4LNYA 1C8VA 1WYIA 3NEVA 4UTUA 3S1WA 1DBTA 4JDBA 2X1SA 4NVTA 4L4MA 2BSLA 3QPYA 1GVOA 1VYRA 4HNNA 1OABA 1EP2A 1JVNA 3TSBA 3IIVA 3P5YA 5K3VA 4O15A 3E49A 2FFCA 1GYNA 4DPPA 5DLCA 2ZRZA 1ZAHA 2UV8G 1NVMA 3GZ3A 3P62A 5C54A 3QM3A 3W7GA 4KFPA 2PCQA 1JUKA 1XUZA 2FIQA 3TQVA 4OGZA 3PULA 1KBIA 5I3KA 4POCA 5CKSA 2DZWA 3W7PA 4AF0A 4LU0A 3E0IA 3KVMA 3HG2A 3LERA 5KZDA 3ELFA 1IGSA 3BK0A 1VCVA 1IIGA 3RU6A 4I7VA 2OT1A 4LVFA 2A1YA 3GVGA 3HIJA 5EA9A 3C52A 3U2OA 2TRSA 4DO5A 4TIMA 5LNWA 1TTQA 4UTHA 4YXGA 3TW7A 2TPSA 4AMAA 4Q32A 2BWGA 2FTPA 2A21A 5HJLA 1TSIA 4TO8A 3PB2A 5FF4A 4DXVA 5KMYA 4A22A 5CZSA 5TQLA 1OX4A 1ME7A 4OQVA 2A7RA 2G96A 3C8FA 2JKAA 3W7HA 3HQ1A 1XKYA 4CNOA 3CWNA 2Z6IA 4PODA 4PTNA 1O4UA 5D03A 4PEKA 5GVJA 4Z0SA 2J27A 1KM1A 3E96A 4CCDA 4P61A 1ML1A 4IMCA 2NZLA 4UTMA 3F1QA 2V5LA 1LOQA 4Z1AA 3SY5A 5KZEA 2GQ8A 3G0UA 3OA3A 1LRQA 3TKFA 2W79A 2VFDA 3W7KA 1R46A 3JRKA 1RQHA 3TC7A 5TIMA 1DL3A 5AYXA 4AVFA 4JY8A 1W5NA 3IVUA 5FF2A 1U5JA 2DJXA 3DXIA 3MHUA 4ML9A 5DELA 3CU2A 3HO8A 3MMTA 3WK3A 2J24A 5K7JA 2PURA 2CLOA 2Z0IA 3W87A 3PUDA 5BNKA 1G4TA 3QPZA 2OZ0A 1TRDA 3N9SA 1GJPA 5DY3A 1WBHA 2E68A 2ZTJA 1TV8A 5D09A 2OCZA 4O52A 2CU0A 4AHOA 3FLUA 5KSWA 2E5DA 3A5FA 1JJKA 1YYAA 3LB0A 2ISWA 2WSYA 1SO4A 4O12A 3UZ5A 2A85A 1FCBA 1TQXA 2QKFA 5FEWA 4DQWA 4XKYB 4GE8A 3G1DA 3O6YX 4KFOA 1RV8A 3HGSA 1QO5A 1WV2A 2C3ZA 4AHQA 4YCOA 1OX6A 2ZZ4A 4N9DA 3BV4A 3G1AA 2R91A 1HUVA 3I65A 1QNVA 2GJNA 2VEKA 3K30A 2R14A 3FYOA 3QQ1A 3Q37A 3MW7A 5LNVA 2C13A 5CPMA 1H7RA 4OU1A 5ABTA 1OFEA 1KM4A 2VENA 3N14A 4QSHA 3G1HA 1KFBA 4MLJA 1VS1A 4TU1A 1DORA 1PVNA 5FF7A 4PC8A 2PRLA 5AHEA 1A5SA 1VHNA 1H7OA 1PV8A 2V30A 1W0MA 3PBUA 2VEIA 3NL2A 1K7XA 2ISVA 1M6JA 2OMAA 3PY2A 3NQAA 4BWLA 1GWJA 1ZNNA 3TH6A 1OFAA 3P82A 1MEHA 1ZY9A 1SSDA 4RJEA 3WK2A 4AF0B 4LW7A 1G4PA 2Y88A 3NGJA 4UFHA 2CLMA 4IQLA 2QDGA 3UD6A 3N2MA 2OJPA 1CX9A 4ZZ9A 1NF7A 1JQXA 4LVAA 5BMXA 3GB6A 3VE7A 5KZMA 1SZGA 4HNTA 3QW3A 3SGUA 2HSAA 4N9CA 4YMZA 2JBMA 5HMSA 3G3MA 2CW6A 2CZ5A 4LVGA 2B7PA 1IXQA 4BR1A 5A5WA 1OVDA 3G22A 3UPBA 4UFMA 1O5XA 4O18A 4QIUA 3LCIA 4GUIA 3P81A 2QUTA 3TAKA 1TPEA 3W1LA 5J5RA 5K9DA 1JRBA 4PA8A 3YPIA 3PG9A 2WO5A 1S5VA 5C2XA 2Y7FA 3LM7A 2OT0A 3C4UA 1MEIA 1OFBA 3NZ1A 4UCGA 3N34A 1DJQA 2ABBA 2BXVA 3CPRA 3TJXA 4Y96A 1ZFJA 1JCXA 1F6KA 3DFPA 3LHVA 4PL2A 4UMBA 4EF8A 1H62A 1U83A 4WX2A 5SWUA 2QCFA 3MJYA 3W2JA 3QFEA 3FA5A 3W22A 3DAQA 2RH9A 2VXNA 4C1KA 1RQEA 1UB3A 1UUMA 1FCVA 3BGGA 5D04C 1QPOA 2DZUA 4I9AA 1OYBA 2CLLA 4N6FA 3R13A 1LROA 1F05A 4HSNA 4P2VA 5BRBA 1JULA 1W8SA 4O0KA 4FX6M 4ALDA 1OFOA 1VCFA 2A7PA 4JR5A 2ZYFA 1OFDA 3W83A 1T99A 3VCRA 3FEMA 1YDVA 3GNDA 4BI6A 3BLFA 2QEZA 4HT3A 3W1MA 4Y8FA 5KINA 1P0NA 5DXYA 2H8ZA 3I6RA 3GDLA 1Q6OA 3BG9A 2FPVA 3EX2A 5C55A 3QMRA 3NQ7A 2WJZA 1WXJA 3W07A 4QQ3A 1AL8A 3BLIA 1VYPX 4RR4A 3O1NA 2H90A 3RF9A 3HG4A 3D0CA 3LOTA 3UWWA 3W7RA 3KXQA 3PF3A 3VFLA 3TFXA 1F76A 1VCGA 1DQXA 4H4IA 5K9XA 1TPH1 3O6CA 1LOSA 3ZWTA 2NV1A 4YL2A 5BW6A 4NT0A 3CIWA 3LLDA 2YFOA 3TXZA 4UMAA 3UWYA 1SZFA 5G1TA 2B7QA 1AW2A 5CPLA 4LS2A 1H7NA 3BW3A 4LC8A 5LGZA 4UTTA 2ZZ3A 3B0PA 3MHFA 4EWND 2RDWA 1G7UA 3MYOA 5HR6A 4O4VA 2C0AA 3N2XA 3B04A 2WSQA 2Z6JA 1B57A 2LLEA 5DCEA 4PH6A 3DFNA 2ABAA 2PE4A 1MXSA 1OK4A 4O1BA 1M5WA 1JUBA 1FWTA 2E1DA 2GVGA 3FS2A 3E9AA 2EKCA 1KM5A 1FQ0A 3STGA 1H50A 4E2BA 2JGQA 3C2EA 2ALDA 1UCWA 2E77A 3EWBX 3H53A 2ZTKA 3G8EA 4ORMA 4HN4A 1SFLA 5CZJA 3HMJG 1W31A 4JYFA 4S1FA 2CWNA 3IGUA 2B7OA 1AL7A 2CLKA 1YDOA 3P84A 2Y85A 3G24A 2A2IA 1W5QA 4K8EA 3PSWA 5EMUA 4IPIA 5AHMA 2YW3A 1I4NA 1A50A 4N9EA 1ZJIA 4ZQRA 4UTTC 2TMDA 3NZRA 3OIXA 4GUHA 4AAJA 3WK1A 3NNTA 4MZYA 3W1TA 1RQBA 5I3JA 4OE7A 3EWYA 1K02A 3HPXA 4WZHA 5HR7A 3LRKA 4NJIA 1C29A 3FKRA 1QMLA 4O13A 2JKEA 1I45A 3V75A 2OX1A 4CQ9A 1IIHA 3DHFA 4MLRA 3CIXA 4LUJA 1KV8A 2P10A 1G6CA 1GTHA 2CFFA 1XDLA 3L5MA 3P8JA 3LHUA 3MI2A 1GPWA 3TQ0A 3P67A 3UXAA 1H1YA 1G4EA 4AEOA 4GJ1A 5EPDA 4QITA 1SU5A 3HGRA 1W3TA 2JGYA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4GUHA

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