4LV4A

A noncompetitive inhibitor for m. tuberculosis's class iia fructose 1,6-bisphosphate aldolase
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
345
structure length
320
Chain Sequence
PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGVVGEKLYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLTHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title A Noncompetitive Inhibitor for Mycobacterium tuberculosis's Class IIa Fructose 1,6-Bisphosphate Aldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 133
structure length 320
sequence length 345
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2013-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lv4A00
2J88A 4RK8A 2QCDB 2ZTKA 3W70A 1VHCA 4IXXA 3RNDA 3IIVA 1SW7A 4ADTA 3F1QA 3ZWSA 1WX0A 3TCEA 1RZMA 3CM4A 2DZSA 3G1XA 4DPQA 1ZNNA 4JR5A 3CU2A 1TPWA 3HPZA 2QAPA 3EXSA 3BK0A 4PEKA 3MYPA 4Y96A 5GVJA 3BPWA 2P0OA 1B4EA 3V75A 3QH2A 1TQJA 1B3OA 3GKFA 3UWYA 4O50A 1KV8A 1TV5A 2QF7A 3CPRA 5G5IA 1VGAA 1RV8A 1TSIA 4ICNA 4ZQRA 1HTIA 1I45A 4WQ6A 4NJHA 2YFOA 1TTPA 4FNRA 4IMGA 3L2IA 3VNDA 1VCVA 3KRUA 3PG8A 1ZAHA 3KX6A 1DBTA 3R2GA 3NQ2A 2CLOA 1PL9A 3W86A 3U2OA 5AYXA 4ADUA 1AL7A 1GG1A 4RCXA 5C2XA 1LDCA 1FQ0A 2E5DA 3NL3A 4LVBA 1M5WA 1FX6A 3TJLA 3DZ1A 3EKZA 1O5XA 2ZRUA 2W6RA 3HF3A 4C1LA 2FLIA 2E5CA 4NJGA 2PCQA 2ZZ2A 2ISVA 2HSAA 3M9YA 2CZEA 2Y63A 1GVQA 1SU5A 3P5YA 5U4NA 3TDFA 2VFHA 3O6YX 3P60A 4FNPA 4WD0A 1MEIA 2E09A 2QKFA 4O0ZA 5CZTA 3TKFA 1W0MA 4QISA 1TCDA 4QM1A 4W9TA 3SI9A 4ORMA 4JTGA 4KFPA 4EF8A 2KZHA 2G95A 5I3KA 2BWGA 2WO5A 1GVOA 3NPWA 5HQEA 1H50A 1KTNA 1SZGA 1A5SA 1DVJA 3PAJA 2B7OA 1TIMA 4FB7A 1Q3NA 1S5WA 5LKYA 3I65A 1HL2A 2VXNA 3KFTA 3W7EA 2NUXA 1K7FA 5L6UA 3HGJA 4Q33A 1NAL1 2NUYA 4YCOA 4UTKA 3TUUA 1XXXA 4O1DA 1T99A 2GOUA 5E0KA 5EA9A 3QPYA 4NNCA 1RQHA 2DZVA 2Y7FA 3GDTA 3H54A 1SFLA 1VC4A 4JTHA 5TIMA 2CLIA 2V81A 4QQ3A 4ML9A 3LM7A 3SJ3A 4YCPA 2QCCA 5CSRA 4JTTA 3WFAA 2VFFA 3LI1A 4XUGA 1YADA 4N9EA 1OFAA 4IMFA 5F2MA 4OQVA 5G1YA 1K7EA 3L5MA 3PF3A 3L65A 4E38A 1AG1O 3P84A 2ALDA 2DZXA 3W1PA 3PG9A 3NXFA 4H4IA 1I8JA 1JCMP 1PHQA 2PC4A 3DH7A 1W3NA 3LB0A 3QW3A 1S5VA 3HGRA 1WAUA 3G0SA 5AYZA 3GB6A 4JX5A 1K7XA 3LHUA 2E77A 4RKAA 5LSMA 1Z41A 5CKSA 3LXAA 5DLCA 5HNRA 1IIGA 2ATMA 3HGSA 3S42A 3LTPA 3DAQA 4OWGA 4IMDA 1YTDA 5CZ0A 3WJXA 4O12A 1GVSA 2WKJA 1A5CA 3CWNA 3UYCA 1F7BA 3FA5A 4Z1DA 5LNVA 1OG0A 1YDNA 3EWWA 3D0CA 4EVZA 3M43A 4O13A 2DU2A 3IGUA 1HFBA 5D2TA 3THAA 5IBXA 4UTHA 2XN2A 3LXCA 1P0KA 3C52A 3S0CA 3JRKA 3QF0A 1KA9F 4MFEA 2XFWA 1Z48A 3UWUA 1E51A 1GJPA 2G5WA 4FIQA 1H61A 3DFPA 1SZNA 1TRDA 3GXPA 4MJMA 4UIOA 3MP3A 3QRHA 4UTWA 1JUKA 4BR1A 4O15A 3LRMA 1THFD 4UFKA 7TIMA 2CLMA 2ZDRA 2YGYA 1XDMA 4E2DA 1S5TA 3SIZA 2VOMA 3TK7A 2CLLA 3STEA 3UY7A 1W5OA 4X9SA 2DJXA 3RLUA 2Y70A 5BNKA 4WOZA 2OT1A 4FNQA 1G69A 4UMBA 1LLZA 2C1HA 3PS7A 2J27A 1L9WA 1FDYA 5DCEA 3W7NA 1PCWA 3W6YA 5LNRA 2ISWA 3QJAA 4O57A 3M5YA 1FY6A 2YPIA 1WOBA 3B05A 3MBFA 5F4WA 2QCEA 4HPXA 4DO5A 3HPXA 1WBHA 3GLCA 3OVRA 4UMAA 4AMAA 1LRQA 2YXGA 3AJXA 3TMLA 4AHPA 5F1UA 3W7OA 4LW7A 2NV1A 2I14A 2NLIA 5FF4A 2I9EA 3IVUA 4LTSA 4NNAA 6ALDA 1TTJA 1SSDA 2ZA2A 3RLVA 3VE9A 3TROA 4ADSA 4Y9AA 1F05A 4GUFA 5DXYA 2Y6ZA 3LDVA 5A8GA 2X2GA 1D3HA 1K8YA 3BLFA 2BX7A 1ZAJA 4KKXA 1UUMA 1TJPA 1TPUA 3KRSA 3ZS4A 3MW7A 5TQLA 3M47A 4RZ5A 5K4XA 3EKLA 5AFDA 1QFEA 1NEYA 4I7VA 3NEVA 3NQCA 1W31A 3K30A 2R8WA 2OX1A 3DU0A 2Y85A 3PBWA 2ZCGA 4HNTA 3LERA 3HJZA 5C55A 1W5MA 3M0ZA 4RXFA 4BWLA 3U6WA 4S2CA 5G2IA 2E68A 1H51A 5AOUA 3W2JA 4GRSA 3LBCA 1VLWA 2HTMA 3IRDA 3MMTA 3HOJA 3G1SA 2C6QA 4WXZA 1QWGA 2RDWA 2FQIA 1TREA 5AHEA 4Q32A 3S1VA 1YPFA 4XQ6A 2GQ8A 2E1DA 2VEPA 3IIOA 3N73A 1EX5A 3HMJG 2PRMA 4DF2A 4LWWA 1R46A 3TV8A 4K6AA 2YFNA 4LV4A 1GQNA 2VKZG 5HUPA 2NXGA 2C19A 3EXRA 2YDAA 5EMUA 1H1ZA 4NQ1A 1U83A 3IEBA 5FEPA 2FPTA 3DXIA 4QITA 1J2WA 3EEGA 5AYYA 1VJIA 1IIHA 4MZYA 3KVLA 3WK1A 4N4PA 2Q3RA 3S6DA 1XC4A 3W1MA 5H2ZA 1XBVA 4D2JA 1C9DA 3NM3A 2WPBA 2A21A 2EKCA 4ZQPA 2GVGA 1SZFA 1TPC1 4LS0A 1EB3A 1TTQA 1VHNA 4WOQA 1OK4A 4UTUA 3R5EA 1CW2A 2CLHA 2GQAA 4FX6M 3LCWA 3BW4A 1W8SA 4U28A 1O5KA 3SGZA 4MY8A 3G1DA 4RZ4A 4E2BA 2Y7GA 2X1TA 1BWKA 3L9CA 4GE8A 4LU0A 4MYXA 6TIMA 3BVJA 3SECA 1I2PA 1ZHAA 3SGUA 3HBLA 2WQPA 3SZ8A 4JNMA 4HSOA 3LCLA 4K7VA 1LZOA 3PUEA 1C8VA 4M6PA 3N3MA 1ZAIA 4XWUA 4O53A 4O10A 3E9AA 2F84A 3MWAA 1JQVA 4DPPA 3UPWA 4HSNA 3QYQA 5BMWA 1SW0A 3GNNA 2C16A 4EWND 1W5PA 2FPVA 2Q8ZA 4UTTC 5AC8A 3PR2A 3W71A 4I7UA 1OX5A 3OA3A 1H1YA 5CZJA 5I3GA 2ZYFA 1GYLA 1F6KA 4AHOA 4Z0JA 4FO4A 4LS2A 3WK2A 3FKKA 2YYTA 1KFBA 4IXHA 4MPQA 2VEIA 3C2EA 1EP2A 3WJWA 1JCLA 4Z1AA 4JDBA 1GZGA 1LM1A 3VFLA 2IQTA 3M41A 4JY8A 1W1ZA 2J9ZA 1O60A 4NXKA 1X6UA 3PBVA 3E0IA 4MOZA 3W1NA 3C56A 1OFBA 3PWAA 3TW6A 2NWSA 3B8DA 3O05A 1H60A 4IPJA 2A7NA 3GDMA 2Y62A 3PUOA 5AC7A 3IIXA 3C61A 3SY5A 1JCYA 4A29A 2VELA 3T4CA 1UCWA 3TR2A 1GYNA 4IMCA 2QAFA 3G3MA 1JCNA 1LOLA 1OJXA 3QM3A 2DORA 2Q3OA 5HMSA 4KWVA 1FBAA 3BARA 3EWUA 1OYAA 4IWWA 3IIZA 3G1FA 4KFNA 2V2DA 3W7DA 5HULA 3W84A 3F03K 4M7SA 2NWRA 4JXCA 1FDZA 4FXRA 1YLVA 3G8EA 1KM0A 3M6YA 1AW5A 1XM3A 2HS6A 1M7OA 4NZJA 3H53A 3B06A 2QUVA 3IVSA 4GUHA 2C14A 2NXIA 3TH6A 2ZZ5A 1OFQA 4FNSA 5D33A 3JS3A 5F4XA 3O15A 4RV8A 3S1WA 4MJZA 5K7JA 3C0JA 3LHYA 3M44A 4HNNA 3EB2A 5FEWA 3UWWA 4AAJA 4AF0B 3T40A 4NX5A 5EBUA 3P67A 3LBMA 3U8GA 1N55A 3CT7A 1H7WA 4TO8A 2X1SA 4FEZA 2J6XA 3SFKA 2HMCA 3A22A 1H7RA 2BXVA 5D38A 2DZPA 3USBA 1GOXA 3BO9A 3W1AA 2FDSA 3NZ1A 2V2HA 1XDLA 3FYPA 1G4PA 3LGEA 3HG2A 1LBFA 4IMEA 5DY3A 2WSRA 3W7LA 3EWBX 3MHGA 4DBEA 1PV8A 3LCGA 2QCNA 2NZLA 2Y89A 4IOTA 1UB3A 3UNDA 1NF7A 1GG0A 5LNUA 4HPJA 3W7HA 1RR2A 1DV7A 1U5JA 1UASA 2OCZA 5FI8A 4KWWA 4UMCA 4FNUA 5F2GA 1G7VA 1RVGA 1LCOA 4LVAA 1F5ZA 5DCDA 3TFXA 3O63A 4JX6A 3Q2DA 4B5NA 4XTDA 1FCVA 3O6CA 2FTPA 4LC6A 1G67A 1SFJA 3W9ZA 3OEXA 1HG3A 1IXNA 1VQTA 1GWJA 2HS8A 4AWUA 3W72A 1LRNA 2OT0A 4O1BA 2RDUA 1XBZA 4ZZ9A 4CLMA 1VYSX 2H3BA 3L5LA 3W1LA 1X8FA 3L0KA 3LV6A 1W54A 5EPDA 5FESA 3L66A 3HG3A 3MI3A 1AMKA 1KTCA 2B7NA 3W7CA 2YYUA 1T96A 3G18A 1FXPA 2DZUA 3VI2A 4LRTA 2JGQA 1EUAA 1TPB1 1X7FA 3P61A 2E6DA 3HG5A 1I2QA 2OZ0A 3O1NA 2WNNA 1FWSA 1JVNA 3QW4B 5HWNA 4LRSA 5SWUA 3W83A 3RU6A 1VS1A 1AW2A 2B4GA 4NNBA 1DKWA 1TPEA 3L68A 4MLRA 3RFAA 2QJIA 4X22A 3G22A 2JK2A 4ORIA 4BI7A 4ZMGA 3CTLA 2Z0IA 3UWZA 1P5BA 4Y90A 4N2YA 5AN7A 3L21A 3O6DA 2X30A 1OHLA 3LHWA 4LUJA 4ZL1A 3HO8A 4UTLA 3EX4A 3STCA 4EOUA 4CCCA 4IJBA 4HNVA 4JTJA 1W5QA 3TA6A 3LLDA 4JDYA 1VRDA 3QQ0A 1D3GA 1GEQA 2ISSA 1TV7A 4JN6A 3TC6A 3TAOA 2QCGA 1G4EA 2R94A 2OJPA 3G0XA 4Y8FA 4WXYA 1TPVA 4RR4A 3QC3A 1LP6A 4JX4A 3NR0A 2ABAA 1L6YA 3S5ZA 5FF2A 4RX0A 1LRTA 4DF1A 1O4UA 5KITA 3DKLA 3DKJA 3INPA 1BWLA 1D9EA 3LRKA 1EP3A 2ZRZA 3UPBA 3GDLA 3NL2A 2GJNA 3FIGA 1YXCA 1TO3A 4QJ1A 4TU1A 5CPNA 3VCRA 4NXSA 1R30A 3DFSA 1KTBA 2QR6A 1FWNA 4NVTA 2C3ZA 1ML1A 4N4QA 1BEUA 3G1HA 3QQ1A 1KLYA 4OBTA 2B7PA 1XI3A 4AEOA 3MI6A 1GVRA 3NDOA 5AHFA 3TIMA 3TSDA 1JRCA 4ALDA 2G96A 2CWNA 4CCDA 4O28A 4PA8A 4MUZA 2VC6A 3HQ1A 3TSMA 2V0TA 4LVDA 2CU0A 1KFJA 2J9YA 3CC1A 2GVJA 4UFHA 2TMDA 4OE7A 3R12A 3W87A 3E49A 3W88A 3B4UA 3PSWA 2QCLA 1ZJIA 2A7PA 1R2TA 3NZRA 3DFQA 1WV2A 4M5PA 2V8ZA 2EHHA 3PBYA 3PUDA 1LYXA 3W1RA 2F7FA 1V5XA 1OABA 3RF9A 5I3JA 3NQMA 1J4EA 2RFGA 3KRZA 1RPXA 3NM1A 4E0CA 5AB3A 3KVJA 2JKPA 2ZTJA 5K9DA 1YDOA 1TTIA 5K2ZA 4I7WA 1KFEA 5F4SA 5H91A 3RMJA 1JCJA 2C0AA 2TRSA 1QMLA 3LTYA 5C54A 1N7KA 4O19A 1DQWA 3QMSA 4GFSA 1XKYA 3IGSA 4LVGA 3TAKA 4A22A 4UTIA 3ZWTA 3N2XA 2CZ5A 1JULA 3NO5A 3A9IA 4JTFA 5LGXA 5FEZA 1ICSA 3ANYA 3BGJA 3C3NA 4MY1A 3AO0A 1HO1A 1SQ7A 3GYEA 3TMQA 3EWZA 1FXQA 1OX4B 3W3OA 5DN1A 2B7QA 4UUIA 4MFDA 2Z1BA 3BG5A 1Y0EA 4AF0A 1I2RA 4CNOA 4CQ9A 4NX0A 2PE4A 3MHUA 3LI0A 4P2VA 1AK5A 1PCKA 1H62A 1QOQA 4TIMA 4LOCA 3CEPA 4O11A 3SR7A 1Q6RA 2A7RA 2E6FA 3LHZA 5DY2A 3UZJA 1DL3A 1TPH1 4DXVA 3NA8A 1GT8A 1KW1A 4UTJA 1YYAA 3C4UA 2A4AA 3SW6A 4LVFA 2Y7EA 3FYOA 3W75A 1QR7A 3L0NA 3OBKA 2EGZA 4JYFA 2RH9A 2A0NA 3LHTA 4O17A 3R8RA 3TFCA 1TJRA 2BZNA 3A5FA 4XKYB 4JD4A 1NSJA 5CPLA 3W7GA 1WA3A 4JS3A 1FWTA 2A2IA 1VH7A 4ZQOA 2FIQA 1QPNA 4Z0SA 5HUOA 5BOOA 1G4SA 1VCFA 2QUUA 5LHEA 1EP1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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