4O4WA

Crystal structure of trichomonas vaginalis triosephosphate isomerase ile45-gly mutant (tvag_497370)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
RTFFVGGNWKANPKTVEEAEKLIEMLNGAKVEGNVEVVVAAPFGFLPTLQQKLRKDWKVSAENVFTKPNGAFTGEVTVPMIKSFGIEWTILGHSERRDILKEDDEFLAAKAKFALENGMKIIYCCGEHLSEREAGKASEFVSAQIEKMIPAIPAGKWDDVVIAYEPIWAIGTGKVASTQDAQEMCKVIRDILAAKVGADIANKVRILYGGSVKPNNCNELAACPDVDGFLVGGASLEPGFINIVNSNVHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Engineering mutants with altered dimer-monomer equilibrium reveal the existence of stable monomeric Triosephosphate isomerases
rcsb
source organism Trichomonas vaginalis
total genus 88
structure length 250
sequence length 250
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2013-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4o4wA00
1W1ZA 1H63A 1DOSA 3G1HA 4LRSA 1H61A 1O5KA 1TCDA 1XUZA 3QPZA 1T96A 1ZCOA 2O7QA 1KM5A 3PVFA 1GEQA 2DU2A 1SSGA 3IGXA 1O4UA 2HS6A 4LY8A 1H7RA 4LUIA 4RV8A 2DJLA 3DH7A 2Y7FA 4WUIA 3E9AA 3KOFA 2NXGA 3TU9A 5AHFA 1YTKA 2NXIA 3WJZA 4X2RA 1I2PA 5CZSA 4E38A 1FQ0A 2A5HA 2A7NA 2V5BA 5LKYA 1PV8A 1VZWA 3THQA 4DPQA 4AHPA 3C2EA 2CWNA 4GJ1A 1IIHA 2ZZ2A 4UFMA 5GVJA 4EIVA 4IMGA 4RZ5A 1W8SA 4RR4A 1W0MA 3GDKA 2GPTA 3C52A 3M5ZA 2O7SA 3DI1A 5U7SA 2OCZA 1JCXA 3S6DA 4QNWA 3T40A 5D33A 3EX4A 5BNKA 3LRMA 2JKPA 2VFIA 2QDHA 3BVJA 3BGJA 2J9ZA 2GOUA 4OT7A 1K8XA 3O16A 3HIJA 1YPIA 5HWNA 3C3NA 2PRMA 3BO9A 1DL3A 3IIVA 4JYDA 3KFTA 1M5WA 2NX9A 2WNNA 4MJZA 4P2VA 3G1DA 3UD6A 1QO2A 1QOPA 5FF4A 1WBHA 1OFRA 4W9TA 3DFQA 4JYEA 3DI0A 3D0CA 2CZFA 2WPBA 2RDTA 3S1XA 2Q8LA 1GTEA 1F6KA 4JNMA 3UQNA 3L0GA 1B57A 2FDSA 2E6YA 3L2IA 1W5OA 3O6CA 2J24A 1W3NA 1BTMA 1G6CA 1RZMA 5FF0A 1S5VA 1EPXA 2RDUA 5AHIA 1SZEA 3W2NA 1TQJA 5AYZA 1KFCA 4HNTA 4QISA 1ICPA 4Q32A 4U28A 2TMDA 4UTWC 1JCLA 1WAUA 3HBLA 2QCCA 2ZRVA 4MLRA 5HINA 3LXAA 4WY0F 5J5DA 3NPWA 1A5CA 2GVGA 4MVAA 4LOCA 1LP6A 3MUXA 4R53A 5FEWA 3PSWA 5A5WA 1WQ5A 2J88A 3GKFA 1DJQA 2QCEA 5DCEA 3E0IA 2DZXA 1KBJA 1LCOA 4ML9A 3GX9A 3WJYA 3LTSA 1FCVA 5F4WA 4O13A 1JUEA 2EHHA 4JTTA 5CKSA 5F2MA 4NT0A 3TMQA 2YYUA 3G1AA 1QPOA 2ISSA 4LS1A 1R47A 3ZR4A 1A5BA 1MXSA 4YCPA 3TQ0A 4OBTA 2DORA 4LVGA 4MJMA 3NL3A 2P1FA 2UV8G 3EWZA 4FO4A 2QF7A 2OZ0A 1K3UA 3QH2A 4E0CA 3CM4A 3QZEA 3W1LA 1VCGA 4N9DA 3GXNA 3PBVA 4O4VA 1O5XA 3G24A 2HTMA 5AC6A 1F6PA 1ICSA 3L5MA 3W1XA 3QYQA 3W1MA 3SGZA 3MWAA 2GQ9A 3VNDA 5U4NA 2X1RA 3W1UA 3LX9A 3TH6A 3W2UA 3W23A 1GYNA 3QW4B 1UUOA 4O11A 4WXYA 1C8VA 1AK5A 2E09A 3P80A 3GDMA 3L0NA 2Y88A 2YYTA 2NUYA 1IXQA 5HWMA 4JIQA 3SGUA 4ADSA 1FWRA 3C0JA 4HIBA 4N4QA 4R7JA 4UTKA 3FS2A 3OEXA 3CT7A 3TSBA 1L9WA 4ZQRA 3H55A 1RD5A 3HGSA 2ZZ3A 3W7KA 4A2SA 3INPA 1TSIA 2JBMA 3STFA 1SZGA 3U8GA 4MKNA 3NQGA 1VLIA 3TUUA 4AHQA 1ME7A 3BPWA 1ME9A 2V81A 4AVFA 5G2IA 4UR7A 4FX6M 3TCEA 4ZQPA 3GAKA 3IIPA 3QC3A 5F2IA 4FNQA 4AAJA 4BFAA 3P5YA 3G1SA 1ZFJA 1KW1A 1P5BA 5HQEA 1MEWA 4UTTA 1D3GA 1KM0A 4OE7A 4O50A 2ZTJA 1ZALA 4HT3A 5AN7A 4CCDA 3FLUA 3G22A 3DHDA 4M6PA 4UFIA 1VRDA 5D04C 4TMCA 1GG1A 1NEYA 1F7BA 4IMCA 3C61A 2NX1A 4LVAA 4Y9AA 3CQ0A 4O8RA 4C1LA 5DXXA 1G69A 5G1TA 3FFSA 3EB2A 3MBFA 4XTDA 3G0SA 3VE9A 3LI1A 4YWIA 3Q2DA 1FBAA 1GVSA 1LOLA 5G5IA 4YLWA 3GR7A 4PL1A 3W7HA 4UTUA 1G7UA 2WKJA 3WK0A 4NUWA 4ORMA 2OX1A 1YLVA 4KWVA 2QCNA 4RXFA 2Y63A 2G97A 3PBWA 2W0UA 5TQLA 4K36A 3TNOA 4WOZA 1GZGA 5KZMA 3W7QA 4GC4A 3KVMA 3KVLA 1HO1A 4O18A 4O12A 3W7IA 3U2OA 1NF0A 4JTSA 1YADA 1XM3A 2J6XA 2J9XA 3PBYA 3MYOA 2HMCA 4MZ1A 3W7RA 1G4TA 4HPXA 1EUNA 1XBYA 3MP5A 3VCRA 1L6WA 1TTQA 5E1QA 5K3VA 1YYAA 4S2CA 1LOQA 3CU2A 3C2VA 4JTFA 4M7SA 1BEUA 3PWAA 2FJKA 4Z1BA 1WA3A 2J27A 4KFNA 1FXPA 4MOZA 2QCMA 1OFEA 4X22A 1EUAA 2AQWA 4HPJA 2VFEA 2H6RA 3UY8A 1L6SA 2IQTA 1XXXA 1ALDA 4IXXA 1P0NA 3TQVA 1NVMA 1W5QA 4MYXA 2QCDA 3DZ1A 1SO6A 4Q33A 5CG7A 2ZRWA 2YZRA 5HULA 1EP2A 2BX7A 3TFCA 2A85A 1UASA 2C14A 2YGYA 4NJIA 2CLIA 4A21A 3ZWSA 3CIXA 3NNTA 2P10A 3TW6A 3W2JA 3TMLA 2NV2A 4J9JA 1ICQA 1OYCA 4RKAA 5D2VA 2CZ5A 2I14A 4IOTA 5LNWA 2BXVA 3PG9A 3EXSA 4DQWA 2V9DA 2NXHA 5AB3A 1OVDA 3FA5A 3HPZA 3LLFA 2C15A 3KRUA 2DZVA 3C6CA 2ALDA 1LRNA 4CNPA 3DFTA 2FPTA 4GBUA 3UPBA 1Z44A 1FDJA 3HQ1A 2V8ZA 3LOTA 1AW5A 3NM1A 3EWYA 4AXKA 1I2QA 3LV5A 2BZNA 2EF9A 5D05A 2E5CA 1W54A 4I9AA 4IMFA 3LCWA 3RU6A 4UFKA 4Y8FA 1AW2A 1X1ZA 3O6DA 5LHEA 1PCWA 3DFPA 4GXMA 3TJLA 1OF8A 1KBIA 1VPXA 2Y6ZA 3MW7A 4R34A 3BGGA 1T99A 3EKLA 1FXQA 1SPQA 2NWRA 4ZQOA 2Q3RA 4GUJA 3EX6A 4UTLA 3LTYA 4RJEA 4JDBA 1JRCA 4N6EA 3G1VA 2Z1BA 4ALDA 4JYFA 4B5NA 4NJKA 5HWJA 1XFBA 1PIIA 3SIZA 1K03A 3QFEA 1LRQA 3RK8A 3NQ8A 1FDZA 1QAPA 1X1OA 3QW3A 2FB2A 2A0NA 3W7DA 4POCA 3LHVA 3P67A 5I3HA 3EWXA 2AGKA 3N2XA 1X6UA 3DXIA 4O28A 3RNDA 3S1UA 3Q94A 3CC1A 3N3MA 3WJXA 3CWNA 3LBMA 3TXVA 4O4WA 4XUGA 5FEZA 4NJHA 2ZZ4A 2CLKA 3LHYA 3G0XA 1HUVA 2DZPA 3L0KA 1G4SA 4NXSA 3ABSA 3NQ6A 4UTJA 4LTSA 3G18A 2NZLA 1A50A 2DP3A 4M19A 3M44A 1RVGA 4AMAA 4E2BA 3JS3A 3BG3A 3M1ZA 1H60A 4O1CA 1DHPA 3P7YA 2QDGA 3UWWA 3BW4A 1TPH1 1HO4A 4JTIA 4NVTA 1ZY9A 3HB9A 1ZENA 3THAA 3A21A 4YMZA 1DQWA 3TSDA 4FB7A 3VFLA 5CZJA 3S5ZA 3E49A 1FX6A 4NU7A 3IVTA 5I3KA 3W7JA 1YXYA 4O15A 4Q4KA 5KINA 4A3UA 3DKLA 3A9IA 3CLMA 1PCKA 3HG2A 2FTPA 4MLJA 3NXFA 1MZHA 3KVJA 4KKXA 3LI0A 4PFMA 4O1AA 5KSWA 4CQAA 3KHJA 3M9YA 3CWOX 5D37A 3UWYA 1F73A 1H62A 3DKJA 1GOXA 4I7WA 3T78A 4FXSA 4UCGA 2PRLA 4OU1A 3A5VA 2BLEA 1OFOA 2VXNA 2WOQA 5DCDA 4MY8A 2ATSA 1ONRA 2ISVA 4QAIA 1C9DA 3BK0A 3E02A 3EX1A 1W37A 2G96A 4ZQNA 3W1PA 3QRHA 3C56A 5DBUA 1XL9A 3NL6A 3UXDA 5C55A 3W73A 2DZSA 4M6VA 2GVJA 5LGZA 2QAPA 3RMJA 4RZ6A 4IGHA 3W86A 4JY8A 1Z41A 4IWWA 1OF6A 1FWWA 1R46A 3IIOA 3ABQA 1AMKA 2Y7DA 5G2WA 1JUBA 5DY3A 2WO5A 2QCLA 2VEPA 3NAVA 1TQXA 2X1UA 4UFHA 4JX5A 1TO3A 5T26A 2TSYA 1WX0A 3QJAA 1MO0A 3NPVA 1EA0A 1ZAJA 1SW3A 1OG0A 3CIWA 1Q6LA 2YCEA 2FFCA 1P1XA 2C1HA 5K9XA 5FF3A 3W6YA 1IIGA 4JTKA 1QPRA 1WDWA 4UR8A 3WK2A 5FEXA 5I3GA 3T44A 4ZQMA 3LERA 4QM1A 1X8FA 4L4MA 4NX5A 1VQTA 5D2XA 4CQ9A 3SZ8A 4IPJA 1FCUA 3TC7A 4CNOA 4MUZA 4WXZA 1TTIA 5FI8A 2VEIA 3RLUA 3ZS4A 4ZVJA 1TTJA 1Z42A 3VKJA 2ZA1A 2CLOA 4UXDA 3KAOA 3GB6A 4WX2A 2Z2UA 3P81A 1YDOA 4WJEA 1H7PA 3NQFA 3NPUA 3WJSA 7TIMA 3KXQA 1P0KA 3L68A 5F2GA 1SFLA 4FX7A 3E96A 1S3HA 3WFAA 1EP1A 5BRBA 4Z0JA 2P0OA 2ZZ6A 4FNTA 4FNSA 4FEZA 1YXCA 3N19B 4LT9A 2JK2A 3QQ0A 1T8XA 1SO5A 3TQKA 3USBA 5C6MA 3O15A 2YSWA 1KTBA 1OK4A 1X7FA 1QPNA 4EWND 3NO5A 8TIMA 3ABOA 5DLCA 5DELA 1H5YA 2R14A 4XBKA 1RQEA 2E6AA 3EXRA 2B7PA 1NAL1 1J5TA 3G1XA 1SZNA 1LORA 4EF9A 4DO6A 3N73A 2VFDA 1W3IA 1TV8A 1D9EA 1BWKA 1OFAA 3BW3A 3P8JA 3TW7A 4UFLA 2PC4A 3OBKA 4QITA 1Q45A 3I7QA 1JJKA 4NJJA 1VHCA 1VYSX 4O10A 5LNSA 4M5PA 3DFOA 2NWSA 1O95A 4FHAA 4LC8A 2QCDB 3NM3A 4JX4A 1JCMP 4O17A 4DEFA 1VH7A 3I7SA 4AEOA 4CNNA 2C19A 2ZTKA 2XN0A 5TBOA 2RKXA 4XZ9A 4GFSA 3RFAA 2GUUA 1O94A 5DXYA 1SQ7A 3UXAA 1DV7A 1KM3A 3NPXA 2QEZA 1QOQA 1IGSA 3T55A 3UWUA 2F84A 3TKFA 3DHFA 4DO5A 1XC4A 3B0PA 1G4EA 3R2GA 5D2WA 3OA3A 1GVFA 4O19A 1M6JA 2RHGA 3I7RA 2H8ZA 3S8HA 3W22A 3OHIA 1YPFA 2YW4A 4U4MA 4WOQA 3P5ZA 1FY6A 1JR1A 1SFJA 5AYYA 5H2ZA 3W70A 3GK0A 4UTTC 3ATZA 4NNAA 3W2LA 5DY2A 1H1YA 1TYGA 2A1YA 2ZRXA 4G1KA 2BTMA 3GIYA 2JGYA 5EMUA 4PA8A 4ZZ9A 4DBDA 2X2GA 1R2SA 1XCFA 1HTIA 2VOMA 2CLFA 1UBSA 1FWSA 2YX0A 3MHFA 1KFLA 2QAFA 3CB8A 3Q37A 1OFQA 1KFJA 3W7EA 3HF3A 4HKPA 1DORA 3P62A 3W7LA 2E6FA 4MFDA 4JTUA 3C4UA 4N9CA 1JCNA 4O0ZA 3MBDA 3AO0A 4LVFA 5AHMA 5HR6A 5EA9A 1ZAIA 3W84A 5BMWA 1JULA 1FWTA 3LCIA 4FNPA 4K39A 2Y70A 3TIMA 1SSDA 2VEKA 4BI7A 4JIPA 2ZA2A 3IVUA 3P74A 3O06A 3GYEA 4Z1AA 4HSOA 2C16A 3PS7A 3L67A 1DBTA 4PC8A 3QSRA 1BWLA 3RLVA 4OV9A 2WNZA 1KM6A 3H53A 3N14A 5EYWA 4LNYA 3NG3A 5DBTA 4ORIA 5D09A 4KFPA 2X1SA 1QNVA 3R89A 3UWVA 2X16A 5C2XA 4JICA 1LRTA 3TK7A 5AYXA 1DJNA 3FJLA 1RPXA 4JR5A 3NDOA 3P82A 3GVGA 3ZWTA 2CLHA 2I9EA 2VEMA 3O63A 4M6QA 3GKAA 1ZJIA 2NV1A 3T4CA 2FB3A 3NZRA 5F1UA 1WYIA 4RX0A 3LBCA 3EKZA 3S5OA 1L2UA 3HO8A 2X30A 3VI2A 4TO8A 4LWWA 3UZJA 5IBXA 1PVNA 3LDVA 3TA6A 4NJGA 4K37A 1JCJA 5K4ZA 2B7QA 3NQEA 4A29A 1YDNA 3A5FA 2EAWA 4A22A 4IQLA 1WOBA 1T0OA 1YTEA 3H54A 2GQ8A 3M5VA 1L6YA 5AC8A 4XBSA 2YFNA 3HPXA 1KFEA 3ELFA 3K30A 3HGJA 4GUFA 4BI6A 5LZLA 4CQ8A 5C54A 1FCQA 6ALDA 4JX6A 2PURA 3W74A 1ZNNA 4H3DA 3RF9A 3W85A 1YTDA 3KVKA 1S5WA 3EWUA 2VC6A 3OIXA 4XTIA 1EB3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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