4OWGA

Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-pep complex
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
SRKFFVGGNWKMNGRKKNLGELITTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIAVAAQNCYKVTNGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALSEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-PEP complex
rcsb
total genus 90
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 2014-02-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4owgA00
1VHCA 1ZHAA 1EWEA 1F2JA 4GUHA 1ICPA 1DL3A 3EWWA 2VENA 5D05A 2WNQA 3B05A 1W31A 3HO8A 1MXSA 3NQDA 4EOUA 4UNLA 1VJIA 2EAWA 3RU6A 1YADA 1OYCA 4U4MA 2DZUA 1W0MA 2VEMA 4GE8A 2OZ0A 5AFDA 3MBFA 3TKFA 3KAOA 3C0JA 1KM6A 1S5VA 5F2MA 4O1AA 5D2TA 1D9EA 2A7PA 3PB0A 2VELA 2CLIA 3PS7A 1VLIA 3NYZA 1R2TA 1H7XA 4CNOA 2QCEA 3C3NA 3D0CA 3PSWA 1FCBA 5HQEA 5KZMA 4NUWA 1G67A 3LHVA 2XN2A 1A53A 5CSRA 5H2ZA 1PL9A 2YXGA 1JCNA 1A5AA 3E9AA 4DELA 2FQIA 5G5IA 1KFKA 1LTDA 2R91A 5LGXA 1TPVA 2BWGA 1L2UA 5AHMA 2ZA2A 3BK0A 4GC4A 2C3ZA 1SSDA 3NM3A 2ZZ7A 5G4WA 5HJLA 1X7FA 2H3BA 4EIVA 3DFNA 1HG3A 3LCLA 5DBTA 3W74A 1LYXA 1QAPA 4R34A 4NJIA 3KVLA 3ZWSA 5DCDA 1YLVA 2C13A 2G95A 3BW3A 5BOOA 1B9BA 1G6CA 4FNQA 3FA5A 3LM7A 2YW4A 2ZTKA 4QITA 3USBA 2ZFAA 2DZWA 2YZRA 3ELFA 3MUXA 1GEQA 4BF9A 3B06A 3CTLA 4RXGA 5FF3A 3TE9A 1VS1A 3MYOA 1LBFA 2AGKA 4FB7A 1RZMA 1R47A 1BWKA 3BLIA 2VFHA 3FLUA 3NXFA 4DBDA 4DQWA 3S5YA 5F4WA 3PM6A 2PCQA 3GDLA 3FKKA 2XN0A 3CU2A 4OWGA 3PG9A 2DU2A 3HGJA 2I14A 2G5WA 5F2LA 4JYFA 1L9WA 3WK0A 4LVFA 5IBXC 3U6WA 3VFLA 4IQLA 5C6MA 1JQXA 4I7VA 5FEXA 4PL1A 5LSMA 4JEQA 4DF0A 3HMJG 1W54A 1RQBA 1FWSA 5DN1A 4LVBA 3BGGA 1ICQA 4JGDA 1GTEA 4PH6A 2X30A 1FWNA 4MFDA 2OT0A 2QAPA 1IIGA 2ZZ6A 3QMRA 1ZAIA 1JVNA 3C4UA 3M5YA 2EHHA 2J9XA 5AHFA 1W5MA 3BLEA 1IXPA 3C61A 2CLEA 4GUIA 4JDBA 1JCMP 1VH7A 5D04C 2Y85A 1TV5A 3TIMA 1K8XA 1YYAA 3IGSA 3K30A 1JUBA 2JK2A 3B4UA 3LTPA 3S5ZA 4UR7A 1I2QA 5DELA 1KFLA 3DI0A 3ZR4A 1IXOA 4AHQA 1QNVA 1OFDA 2OT1A 5G2IA 4AB4A 5G2WA 5CZTA 2J6XA 4YL2A 2R14A 1AL7A 4HIBA 3B0VC 4OV4A 4UMAA 5I3GA 4PTNA 5A5WA 4CCDA 3CM4A 2A21A 1F76A 3M1ZA 3N73A 1GPWA 3Q58A 4M6VA 1TTJA 4MVAA 1DV7A 4O14A 4YCPA 3SSJA 1KTCA 4BI7A 1GYLA 3WK3A 3NQ2A 3E49A 1EWDA 4XUGA 3S1VA 1CW2A 5LNWA 5KZEA 5SWUA 1TPC1 4LS1A 3W1RA 1WOAA 4H4IA 3DU0A 1EP1A 1KLZA 1XFBA 1YTEA 1FCVA 3T7VA 2QCGA 4E0CA 3UPBA 3L21A 3G0UA 3FJ6A 4AWTA 4JX4A 4O1DA 1W3IA 3W86A 2B4GA 1FCUA 3GX9A 3TQKA 3GB6A 3MHUA 3EX2A 3O6DA 3UWWA 4ZQMA 3F1QA 1ZNNA 4O57A 3GDTA 2J27A 4ZQCA 3TJXA 3IIOA 3A5FA 1F5ZA 3M9YA 3TMLA 2FJKA 2QF7A 1GG0A 1H50A 2E6DA 4MOZA 3IIXA 1H7PA 2ZZ1A 3W2MA 1NF7A 1SW7A 1VYPX 3DH7A 4JTFA 1X6UA 4NQ1A 1T0OA 4EVZA 1UUMA 3G1FA 4UTIA 1KA9F 1W5NA 4KFOA 4UTMA 1KM5A 4XZ9A 4OQVA 5DY2A 4JTIA 1TTPA 1Q6RA 1F6KA 4UCGA 3TX9A 2P10A 2E77A 3C8FA 2CLKA 5DY3A 2C15A 3TMQA 4NNBA 1KM0A 3QM3A 5AYYA 1H1YA 3GKFA 4ORMA 2NXHA 5C2XA 3T78A 5AYZA 2W0UA 5F1VA 4NJKA 3BG3A 3W7EA 3PAJA 2V0TA 3NQ6A 2RKXA 3DXIA 2A6NA 1P1XA 3LRLA 1H61A 2AAMA 2QUVA 4UTLA 1ME8A 3O63A 4TIMA 3LERA 1LRNA 2A5HA 1IXQA 4NZJA 3S1UA 3SI9A 4OU1A 2NX1A 2QAFA 1PV8A 4CQ9A 3KRSA 4GUGA 2A0NA 1NF0A 4UTWA 1LOQA 1BKSA 3KHJA 1W8SA 4TO8A 2QJGA 3OA3A 4Q4KA 4GWEA 3MI2A 4FIRA 3L68A 3NZ1A 4EF8A 2RHGA 2VEKA 3HBLA 3R13A 3HPZA 3RFAA 5CSSA 3EX3A 2Z6IA 3HG5A 1G7VA 2QCNA 1PCWA 4LC6A 3EWBX 3GKAA 3CEUA 3RNDA 2CFFA 2ZYFA 5AC6A 1TTQA 1BEUA 2JGQA 3SZ8A 3O06A 1SU5A 5LNSA 4QISA 5AHLA 1YDVA 3EWXA 4N9BA 3RF9A 3THQA 4FNPA 3W1NA 3EKZA 1XBZA 4FEZA 3DHDA 4K8HA 3H55A 5KZDA 1DJQA 2O7SA 1K7EA 2ZRXA 1YXCA 4GBUA 1ADOA 3LHZA 3V1PA 3FYOA 4JR5A 1J5TA 1OYAA 2CWNA 4MKNA 3DAQA 2NZLA 2DORA 3NQGA 4ICNA 1GWJA 1VLWA 3EWZA 3P8IA 4NJGA 4WY0A 3INPA 2PC4A 4WY0F 3F4NA 1IGSA 3KX6A 3M0ZA 3SJ3A 4Y9AA 1H63A 3EX6A 3NQFA 3W76A 1O60A 1ALDA 3DFTA 5AN7A 3EWYA 5CZ0A 1TPUA 1VYSX 3BW2A 3G1DA 1FCQA 4WY0B 3LB0A 3NQ8A 3G3DA 3M5VA 1LLWA 1EIXA 2CZFA 1TV8A 4TU1A 4WJEA 4NNAA 1FWTA 4JD4A 4POCA 4UXDA 3TSBA 1SR9A 3HG3A 1GOXA 1B4EA 2A4AA 3UWQA 4XBSA 2C1HA 5AHIA 3SGUA 4O53A 1MEWA 1TPFA 3W88A 4BI5A 2QKFA 1WDWA 3MP4A 5LKYA 3P62A 3C56A 1SZGA 4FXSA 3UXDA 1QO5A 2WKJA 1JULA 3EEGA 4MUZA 1FY6A 4WXZA 4K7VA 4UMCA 1EA0A 1THFD 3B0UX 4LVAA 4XKYB 5E0KA 4YLWA 3FJLA 1B57A 3OVPA 1X1ZA 2ZRYA 2GUUA 2VFIA 1FXQA 1FXPA 3F03K 2TYSA 1Z48A 2HSAA 5G1TA 2OX1A 4H3DA 4JICA 4HNTA 1JQVA 5D37A 2Z2UA 1FUYA 1TMHA 1PHQA 4QSHA 3LLFA 2TSYA 3UD6A 1A5BA 4IMGA 7TIMA 4JTTA 4LUIA 1LM1A 1HTIA 2EGZA 4NNCA 5HUPA 2CLOA 4AEOA 1FDJA 2NV2A 5KITA 4OV9A 4O16A 3W1LA 1TJRA 3GDMA 3W1TA 4O28A 5AOUA 1C8VA 3UNDA 4AF0B 2ALDA 1MO0A 4S2BA 3VNDA 1RR2A 4IXXA 3ATYA 3LGEA 4JYEA 3IEBA 1VQTA 1FWRA 3CLMA 5K2ZA 1NSJA 5HINA 4IX2A 3PY2A 4WXYA 5LNRA 1OF8A 4NU7A 3G0SA 5TBOA 1A5SA 4P2VA 3CWNA 1ME7A 3P7YA 3WJZA 1WAUA 3OVQA 3JS3A 3MO7A 4N4PA 3YPIA 4ONVA 4LTSA 1PIIA 3PR2A 2P0OA 2C19A 2GJLA 1EP3A 4CLMA 4AXKA 3E12A 1MZHA 3M44A 3W2LA 2B7PA 3C2VA 4A2SA 3NGJA 2FLIA 3EKLA 3G3MA 5CPOA 3EB2A 1O94A 4EF9A 4PC8A 3G8EA 1O5XA 5FEWA 4JN6A 1B3OA 1YTDA 4Q32A 4DEFA 1FBAA 4MYAA 3ZFHA 1SO4A 4FIQA 5L6UA 4O12A 3LDVA 3C52A 4RJEA 1LLZA 4O50A 3OHIA 3UZJA 4AHPA 3GXTA 5EPDA 3GVGA 4NXSA 3MMTA 3LRMA 2UV8G 2B7QA 3PBWA 1TO3A 4AWSA 1H60A 3A5VA 1AG1O 4A29A 3N9SA 2E5DA 1O5KA 1K3UA 2DP3A 2YGYA 4UTUA 2F84A 2V81A 3G1HA 2E5BA 3BPWA 1SZNA 3PWAA 1OFPA 2WSYA 3FYPA 5U7SA 4UUIA 3GYEA 3NEVA 1D3GA 1KM1A 4PODA 3DBPA 3NL3A 3W84A 2E6YA 3O05A 1GG1A 4HT3A 1L6WA 1F73A 4Y96A 1FQ0A 1YXDA 1XUZA 3G18A 4HSOA 2QDHA 3OIXA 1A50A 3QH2A 1Q6LA 5D2YA 3CPRA 2EKCA 3LXAA 2H8XA 4JYDA 3QJAA 2Y7EA 3LV5A 1Y0EA 5HULA 4UFHA 3STEA 3SIZA 2VFGA 1TV7A 5FF4A 4GUJA 2X1UA 1XDMA 5D32A 1OFQA 2ZCGA 4JX5A 2ZZ3A 2J9ZA 1H5YA 1W37A 1TREA 1XL9A 3Q2DA 1K7FA 3DFPA 1TPEA 5G1YA 2DJLA 5I3HA 2C0AA 2PRLA 3W7JA 3NOEA 5EL1A 1QPRA 3IRDA 2YCEA 3LHYA 4Y8FA 1CI1A 4C1KA 4RX0A 1KFBA 4BK9A 1NFBA 4RV8A 4YCOA 4MJZA 4N9CA 1K8YA 5F1UA 1LOLA 1W1ZA 1XBYA 3W2KA 4M5PA 3VI2A 3QEZA 2JKAA 3CIWA 3N2MA 4MPQA 4U28A 3W7NA 2Q8LA 3TFCA 2AQWA 1GVFA 1HO1A 4O1BA 3NAVA 2X1RA 4DXVA 5FEPA 5HWMA 4RK8A 5KTLA 1ONRA 4CQAA 3MP3A 2GQ8A 2X2GA 4LVGA 3W7DA 3O07A 4X2RA 3TC7A 5AHEA 3ABOA 1KFEA 3UY7A 3W1PA 1KBIA 3CHVA 4JTSA 1RD5A 2WSQA 4O1CA 4MIMA 1YPIA 5CG7A 3ABQA 4RLIA 4IMCA 4RCXA 1EB3A 3LHUA 2FB3A 2C6QA 2WNNA 4DF2A 2ZRZA 1LZOA 2QUUA 5HR6A 3VKJA 3HG2A 5HUOA 4IMEA 3N14A 5AYXA 3PC0A 1Z41A 4I7WA 4N6FA 1ZY9A 3L66A 5J5DA 4UTKA 1QPOA 3QYQA 2FB2A 2Y7GA 1YXYA 3BG9A 4AVFA 2GJNA 3NPXA 4LS0A 3LHTA 1WBJA 1LBMA 3SR7A 5CPNA 1T99A 4NJHA 4C1LA 1S3HA 3I6RA 2H6RA 4ADSA 3MW7A 4DPQA 4ADTA 1GVQA 3TQ0A 2FFCA 1M7PA 4N4QA 3U8GA 2C14A 4O10A 3P61A 4RKAA 2E1DA 1ZCOA 3N3MA 2A1YA 1RVGA 2H3DA 1KM3A 1HL2A 4IMDA 3OEXA 4UTWC 4MFEA 3W7IA 4UC5A 4UIOA 2C16A 2RH9A 4X22A 1QCWA 3OG3A 3WJYA 4IPJA 3MI3A 3TK7A 1QR7A 2V8ZA 4GFSA 5F4XA 2G96A 1TRDA 4WUIA 3W7GA 3PULA 2A7RA 4Y90A 1MEIA 2VC6A 4QQ3A 4YMZA 1VCFA 3CC1A 3RLUA 3W70A 2ATMA 1KV5A 1QDSA 1H7NA 3LX9A 1OYBA 4KKXA 1YPFA 4YXGA 2BLEA 3P5ZA 3W3OA 4Z1DA 3CQ0A 3W2NA 2QJIA 4AWUA 3W6YA 1EX5A 1WX0A 2FDSA 4KWWA 3ZWTA 3DFSA 4TMBA 3TNOA 1QPNA 5MHBA 2IQTA 5K9XA 2J88A 5FESA 3NM1A 3PF3A 1EUNA 2YPIA 3P82A 2NUYA 3GDRA 5D2VA 1Q3NA 3BLFA 3Q94A 3W1XA 4N9EA 5DLCA 1YDNA 1ME9A 3GDKA 3HOJA 4O13A 4MY1A 3G22A 2CZDA 2JKPA 2GVGA 4AMAA 4FX8A 1E51A 1LRQA 4JNMA 1SW3A 2DZVA 1G69A 3IIZA 1P5BA 4N9DA 3W1MA 3N19B 4H6KA 4O54A 4LWWA 4ZL1A 4KWVA 3SY5A 1H7WA 3ANYA 2YW3A 1ZENA 4NX5A 3DZ1A 2E68A 3R2GA 5BNKA 4LRTA 2HMCA 4E38A 4CNNA 5TQLA 3KVKA 2E6AA 1P0NA 1F05A 3LRKA 3LOTA 5D03A 3JRKA 4HPJA 3I68A 3Q37A 5TIMA 3WK2A 4XTIA 4DBEA 2CLHA 4JY8A 2Z0IA 1KLYA 3OBKA 1EP2A 2Z6JA 3E0IA 3W22A 3FOKA 5GVJA 1AW5A 5DCEA 1SZFA 2WO5A 4D2JA 3DFQA 4O11A 4KFNA 3E02A 4RZ5A 4OHQA 1AK5A 1OJXA 2QCMA 4EWND 1EEPA 3BV4A 2CW6A 4HPXA 3KRUA 1DKWA 4JTGA 4ADUA 2V5LA 3LCWA 2FPYA 1KM2A 4TR9A 4PCFA 3MYPA 2A7NA 2YYTA 3M6YA 3G1YA 4LVDA 2CZEA 4RR4A 3A24A 3THAA 4QNEA 5DCBA 2Y62A 1H62A 1PS9A 4GRSA 4P61A 2ISVA 3GNDA 1U83A 3HPXA 5U4NA 3BG5A 2NX9A 1JRBA 4I7UA 2RDTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JXJ A;  1VHC A;  1ZHA A;  1EWE A;  4IM4 A;  1JPK A;  4CD7 A;  2VEN A;  3RJY A;  1MMF A;  2WM0 A;  1W31 A;  1V3K A;  1AUS L;  1YAD A;  3EBV A;  1BVN P;  3W82 A;  1JAE A;  5DRI A;  4U4M A;  2DZU A;  1W0M A;  1SMA A;  5AFD A;  1NU5 A;  3TKF A;  4AY7 A;  3KAO A;  2J7B A;  1UA3 A;  4L61 A;  1M1B A;  1KM6 A;  2TOD A;  4W5U A;  5F2M A;  2ZVI A;  1D9E A;  3RU8 X;  3NYZ A;  4CNO A;  3D0C A;  5HJX A;  3LEP A;  3T8L A;  1E0U A;  5HQE A;  1EIB A;  2BS9 A;  3IAC A;  3PWI A;  3BCJ A;  2XN2 A;  4AEF A;  1BRL A;  4AIS A;  4DEL A;  1A5A A;  2VGI A;  1KFK A;  2C8N A;  1EF3 A;  1LTD A;  2WBG A;  2BY0 A;  2VWT A;  2PDG A;  5FA5 A;  5I5R A;  4S38 A;  4D9P A;  2ZA2 A;  4GC4 A;  3O9N A;  2WLY A;  2ZZ7 A;  4NF7 A;  5HJL A;  1OB0 A;  1VFU A;  8A3H A;  1BRL B;  3LCL A;  5DBT A;  2QUN A;  2VZU A;  1QAP A;  3ZWS A;  1K9E A;  3MSY A;  3UJS A;  3CXO A;  3IJD A;  3REQ A;  2DVX A;  4L1G A;  1EDG A;  1YLV A;  5EFD A;  2C13 A;  2G95 A;  3BW3 A;  4J7R A;  4QIT A;  1M7X A;  2ZFA A;  3VGB A;  2YZR A;  3B9E A;  3ELF A;  3FEQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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