4TO8 | Genus

Total Genus 109

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	109
sequence length	286
structure length	279
Chain Sequence	PLVSMKEMLIDAKENGYAVGQYNINNLEFTQAILEASQEENAPVILGVSEGAARYMSGFYTIVKMVEGLMHDLNITIPVAIHLDHGSSFEKCKEAIDAGFTSVMIDASHSPFEENVATTKKVVEYAHEKGVSVEAELGTVGGDDVVADGIIYADPKECQELVEKTGIDALAPALGSVHGPKLGFKEMEEIGLSTGLPLVLHGGTGIPTKDIQKAIPFGTAKINVNTENQIASAKAVRDVLNNDKEVYDPRKYLGPAREAIKETVKGKIKEFGTSNRAKH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II
publication title	Structural and Functional Characterization of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus's Class IIb Fructose 1,6-Bisphosphate Aldolase. pubmed doi rcsb
source organism	Staphylococcus aureus
total genus	109
structure length	279
sequence length	286
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2014-06-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4to8A00

1OFAA 3W7PA 1LBFA 1QDSA 1FWTA 4CQ8A 3T40A 2PURA 2V81A 3NL6A 4QIUA 2VFEA 4NUWA 2A7RA 5C2XA 4RLIA 3WJYA 1WOBA 1JCNA 4LVDA 3I7SA 3G0XA 2E5DA 3OVPA 4AAJA 1W3IA 2A7NA 3WK2A 1I2NA 2A85A 4POCA 4AVFA 3W2LA 5E93A 1M7OA 1B4KA 1EPXA 1T96A 3DKLA 3N73A 5A8GA 1OYCA 5D37A 5CG7A 1X6UA 3QSRA 5K2ZA 3MBDA 2C14A 4FHAA 3LTPA 4M19A 1PHQA 3P60A 1YYAA 3C6CA 4HHPA 1LCOA 4AB4A 5HULA 1IXOA 1VH7A 1LOLA 3N3MA 4GXMA 3N34A 3R13A 1GYLA 4UTKA 3A22A 3V1PA 3M44A 3TFCA 3LHTA 3LRLA 1X1ZA 3BW4A 3TXZA 1H63A 3MHFA 1NAL1 1XBXA 1VYSX 4JTFA 3RF9A 5CZTA 5SWUA 4RXGA 1BKSA 4S1FA 3G8EA 4H4IA 4U4MA 4C1LA 1NF0A 4DQWA 4NNAA 5A5WA 2V8ZA 1GZGA 1OFEA 3W7GA 5F1UA 4I9AA 3C2EA 2GQ8A 4DO6A 1XUZA 4LS2A 2E68A 2JBMA 3QRHA 4XTIA 2GJLA 3OG3A 1PL9A 1TRIA 2H3DA 1OFBA 1QMLA 3DHFA 4KWVA 2CLMA 2HTMA 2H3BA 1F2JA 1PCKA 3CQ0A 3F4NA 5HWMA 2XN2A 4WY0F 1WDWA 4L4MA 2C19A 5AN7A 1G4SA 1OX4B 4UCGA 1LTDA 1QPRA 3KFTA 4ZMGA 4MY8A 3CM4A 2YCEA 2QUUA 1JUBA 5L9FA 1EWDA 3C52A 5FESA 2H6RA 3GR8A 3A5FA 4Y96A 4MLJA 3DHDA 4K6AA 3DZ1A 6TIMA 1EP3A 3DENA 4XQ6A 3RU6A 1OFOA 3EX6A 2ZA2A 2BLEA 3KRZA 4GUGA 4IX0A 2PC4A 4R34A 5AC7A 3ABSA 2RHGA 3KVJA 3BPWA 4LU0A 1FY6A 1O4UA 4W9TA 3C56A 3NQ8A 4FNRA 4RZ6A 1HUVA 2ATSA 3C0JA 4YMZA 4HNVA 2HMCA 1SZFA 1SW7A 3UWUA 2J9YA 3CPRA 4UTWC 1ZCOA 2DZXA 3E49A 1SW0A 4M6QA 1K7FA 3IIXA 2AGKA 1Z41A 1KFCA 4O1BA 4JTKA 4Y6GA 4IQLA 2CLHA 3P5YA 3UWWA 3SECA 4K7YA 3DU0A 4Q33A 4Z1DA 3UPBA 5G1TA 8TIMA 3ZFHA 4JY8A 3G1FA 1Q3NA 1EX5A 1G4TA 4MYAA 3VCRA 1KW1A 2DP3A 4LV9A 1BWLA 1TSIA 2ISVA 4IXHA 5FEZA 4Z1BA 3C4UA 4H6KA 1YPIA 3FYOA 1FWWA 4Z1CA 3KHJA 2YFNA 4CLMA 3EWUA 4UFLA 3QC3A 4GUFA 1TPDA 3L9CA 1GVSA 2YX0A 4IXXA 3TE9A 3UXDA 4O0KA 4EIVA 1MZHA 4MOZA 5J5DA 3GNDA 1FWNA 5F4SA 3EEGA 4B5NA 2ZRXA 1WBJA 1F6PA 1P0NA 4ADSA 1PIIA 2WSRA 2YPIA 5AHMA 3B06A 1SQ7A 5DY2A 2PRMA 2LLEA 3L5LA 3O6CA 1KV5A 3DFNA 4IGHA 1HTIA 3GXPA 4K37A 4UMBA 3DFQA 4DO4A 5AYZA 4CQAA 3MO7A 3SW6A 1OABA 2TPSA 2ZZ6A 3NOEA 1SSDA 2J24A 4MIMA 4ADTA 4I7UA 1KM2A 2CFFA 5TIMA 2PRLA 2OJPA 1LORA 1QWGA 1N8FA 3A9IA 4IOTA 3GDTA 5CSSA 4MY9A 2EF9A 1VHCA 1YTDA 2GVGA 1O5KA 1B4EA 4BF9A 3BG3A 3LCXA 3IVSA 3NPVA 2QCNA 1B9BA 2ZRWA 6ALDA 1W5QA 3LBCA 1VJIA 4IMFA 1KFKA 2OT0A 3L21A 5EYWA 1VYPX 1EB3A 4A2RA 1R47A 3T7VA 4PL1A 5BNKA 2GJNA 1Z42A 1YTKA 3JS3A 1KM3A 4N9DA 1W5OA 3GAKA 5HQEA 3FS2A 4NJGA 4EF8A 4K36A 3O07A 3U6WA 2ATMA 4K7VA 5D2YA 4IWWA 4WX2A 5DY3A 3EWWA 3W1QA 2CLEA 2VELA 4UUIA 3W7RA 3PSVA 2FB3A 3PUOA 3HPXA 3HIJA 4JTSA 5T26A 1O95A 3TUUA 4JTGA 5K9XA 5FF3A 3W2MA 1OYAA 2G97A 5F2IA 1GYNA 1H7XA 1VQTA 3DAQA 3LHWA 4JXCA 3TDFA 2V2DA 4L4LA 4CQ9A 1TPVA 3KVKA 1O60A 1W3NA 3LV6A 3CC1A 1LP6A 1WA3A 3E0IA 3S42A 4EOUA 4UTUA 3W83A 1OFRA 4BWLC 1DJNA 3LHVA 3SZ8A 4PTNA 1SFLA 3TMLA 1B57A 1MXSA 2WPBA 1WQ5A 3PBWA 4YL2A 5IBXC 2R14A 1ZAHA 3PC0A 4XBKA 3CB8A 4GUIA 4RKAA 3PWAA 4Y90A 2VEKA 3QZEA 4JDBA 1XKYA 3Q94A 2JKAA 2P0OA 4QITA 4XWUA 1QOQA 2E6AA 4O17A 3EWYA 4UFJA 1R2RA 4UTTC 2ZRZA 4JIQA 1A53A 3NL3A 3USBA 4IUOA 4NXKA 2ALDA 3T78A 4M6PA 2DZVA 1FXQA 3ABOA 4N02A 1VZWA 4UXDA 3NZRA 4DF0A 4RZ4A 4IMDA 1IXNA 1ONRA 3UD6A 3W76A 3LM7A 4N9CA 4MLRA 2Z0IA 5HWNA 1EP1A 2QEZA 3W7KA 2J9ZA 5AYYA 4HSNA 3C2RA 3T55A 4CCEA 4K38A 2YR1A 2E6YA 1Q45A 5G4WA 1KM4A 2CZFA 3W2NA 5CPNA 1OF8A 1I2RA 3GKAA 1SSGA 1YDOA 2RH9A 3LGEA 3TV8A 3CTLA 4QNWA 4GFSA 3G22A 1FQ0A 5E1QA 4PFMA 3DFTA 3SSJA 3TH6A 3CEUA 2C16A 3GK0A 1K8XA 3HG3A 3LXCA 4M6VA 3W7LA 4ALDA 4MZ1A 2B4GA 3PS7A 4OBTA 4S2BA 5HNRA 4NQ1A 4QSHA 3VI2A 1TPUA 1RVGA 2QDHA 3L67A 1M7PA 3IIVA 2VEIA 3G0SA 2E09A 4M7SA 3HMJG 1OFQA 3EKZA 4OQVA 3NYZA 5F4XA 3QF0A 5HUOA 4NNCA 1QPNA 3EXSA 4O15A 3QSTA 3G0UA 1D9EA 3N2MA 5FF7A 4E2BA 4PL2A 1OG0A 3G1DA 4LVAA 2TMDA 4WXYA 4MPQA 3NEVA 1GVOA 1OX5A 4KFPA 5D09A 5LGZA 5I3IA 4GJ1A 4JX5A 1GTEA 1IIHA 2ZZ1A 3W9ZA 2YYTA 4X2RA 3EXTA 3LCLA 2IQTA 2NV1A 4X3ZA 2RDWA 1RQHA 1RV8A 4TMBA 3MMTA 3W1XA 4BI7A 4RV8A 1DORA 3W7EA 1I2PA 3RLUA 3S6DA 1F6KA 2VOMA 3M16A 5EKYA 1KTNA 4TMCA 5D2XA 4R7JA 3UWZA 3NQVA 2YW4A 3W7MA 1DQXA 2VFFA 3INPA 3O15A 4IMEA 2ZRVA 1F74A 3NZ1A 1XCFA 2FJKA 1XFBA 4N9BA 4PH6A 1SPQA 4UTIA 3P67A 2QKFA 5K4ZA 4NVTA 3P81A 3W7QA 1PE1A 2EAWA 3QPYA 3TSBA 4XZ9A 1FDZA 4O57A 3UPWA 2WNQA 5G5IA 2ZCGA 3QH2A 3FJLA 4QJ1A 5BMXA 2PRHA 3QMSA 1ZHAA 2NUXA 5BMWA 2OX1A 3L0NA 3R12A 2JGQA 3P5ZA 1TPFA 1TTJA 1LBLA 1W0MA 2P1FA 3NO5A 4AWSA 1ZJIA 4JTIA 1TMHA 1RR2A 2ZRYA 2Y63A 5TBOA 1GG0A 4BFAA 2WV8A 2VC6A 4UMAA 3W23A 3EX1A 2FPVA 2Y7EA 1I2QA 2TSYA 5AYXA 1TREA 3PF3A 2X2GA 1LLZA 3OEXA 3GIYA 4OV9A 3IGXA 5AB3A 3S9YA 3BG5A 3LXAA 1FDJA 1MEWA 4HNTA 3OVQA 4WY0A 1JULA 1RQBA 3W84A 3GDMA 3UQNA 3EB2A 4JGDA 3L0GA 3B0VC 1JQXA 4CCDA 3WJWA 4O13A 2J88A 3MYPA 1TTPA 2VFGA 4HT3A 1A5AA 3DGRA 2A1YA 1XXXA 5DBUA 3L2IA 2OZ0A 4DELA 3C3NA 1WOAA 3L5AA 5DELA 2QJGA 3KAOA 3ABQA 3O6DA 1WBHA 5I3JA 1IF2A 2JKEA 3E02A 3LI0A 5I3FA 5CZSA 1EUNA 5HR7A 2ZZ5A 3TK7A 2TRSA 5F2GA 3W1NA 3TX9A 2RKXA 1L2UA 1OJXA 4AXKA 2NX9A 4N4QA 1I2OA 1XM3A 2R91A 3P80A 3KOFA 4X22A 3E9AA 1UASA 5BOOA 2NXGA 2VEPA 5FEWA 2C15A 3LHZA 1I8JA 3FIGA 3MI2A 1KV8A 1F73A 4M5PA 3S0CA 4UTWA 1KM1A 2WO5A 2Z1BA 3DFSA 3RFAA 2EGZA 3SGUA 1K8ZA 3H53A 4UC5A 4FX8A 4Q4KA 1H1ZA 5LNUA 5F2MA 2CZ5A 1XBYA 4JYDA 4MZYA 4X9SA 5HJLA 3MYOA 1Q6LA 1EA0A 4R53A 3P84A 3HGSA 3IV3A 1N55A 3C2OA 2CLKA 2FQIA 1GTHA 4NZFA 4XKYA 1YXYA 1DBTA 4K39A 1W5NA 4LRSA 1VR6A 3DBPA 3W1AA 4K8EA 3JRKA 4PA8A 2GVJA 3M9YA 5AHNA 1P1XA 1RZMA 4MY1A 2A6LA 2AAMA 2Q3RA 2QCGA 2F84A 4Y9AA 2ZZ2A 4ZVJA 3W3OA 3WJXA 3FOKA 2B0MA 2E5BA 4O4WA 3HGRA 4PEKA 4HPXA 1WV2A 1TV7A 4WOQA 3G1XA 4JY9A 4FNSA 2NX3A 2NV2A 3UZJA 5EA9A 2Y70A 3QEZA 4AHOA 4JYFA 1KLYA 1NVMA 1O94A 1SO6A 5L6UA 3W1RA 1LBMA 4O12A 2GUUA 5D33A 3F4WA 3T44A 1ICPA 3C61A 3GLCA 3GX9A 1M5WA 1DOSA 4NX5A 3W07A 4JTTA 1DQWA 1KTBA 3UWVA 2ISSA 3STCA 3LLFA 3VFLA 4MZ8A 5DCDA 3UY7A 1XDLA 2BXVA 3SI9A 3QQ1A 5K7JA 1AK5A 3NL2A 1TV5A 2A5HA 1K3UA 2V9DA 3GR7A 3LI1A 2QUVA 3W1LA 2Y61A 4OGZA 2WKJA 3O06A 5C6MA 4JR5A 1MSSA 2DZWA 3VE7A 1VCGA 4TX9A 3TAKA 2E6FA 4MJMA 4NU7A 1IXPA 3WK1A 3G3MA 5K9CA 3SJ3A 3W72A 3HJZA 4UR7A 1SZEA 4XTDA 2I1OA 2DZSA 3VKJA 1IGSA 3IIPA 2ZA3A 3A23A 4DXVA 1DV7A 1HL2A 1ZENA 2QAPA 3Q37A 3G24A 1F5ZA 4Y8FA 2Q8ZA 3FKRA 5GVJA 3STGA 3TCEA 3LXBA 1LZOA 1TJRA 3M7WA 5U7SA 1PHWA 4GNJA 3IVUA 4WUIA 2I14A 2BTMA 3VE9A 2HSAA 3W1PA 2C0AA 3GB6A 1M6JA 1ADOA 2C6QA 1G6CA 1VLWA 1W3TA 3TMQA 5AHLA 1S5TA 2WOQA 4N9EA 1HO4A 3O05A 4O11A 3VNDA 1JRCA 1X7FA 3B8DA 3S5NA 1OK4A 3LHYA 3HF3A 4FF7A 1XI3A 5CSRA 4BWLA 4DPPA 3KRUA 3R2GA 5LGXA 1FCVA 5CPOA 3PG8A 3STEA 2FIQA 3HG5A 2Y6ZA 5EL1A 2CZEA 1H7OA 4LT9A 5IBXA 2CW6A 4S2CA 1ME7A 4FIRA 3M0ZA 2BWGA 4O4VA 1TPWA 3NG3A 3Q2DA 1KA9F 3G1YA 4UTHA 3UNDA 4JNMA 3CU2A 2DU2A 4FEZA 5LKYA 2DJLA 4HNUA 3MP4A 3PAJA 3NPUA 3TNOA 4LS1A 3NQEA 4LC6A 5KTLA 4UTTA 1ZAJA 3LRKA 4IJBA 4DBEA 3IGSA 3HQ1A 3CIWA 1FCUA 3OIXA 2B7QA 2DJXA 3LB0A 3LV5A 4O19A 4UFIA 4FXRA 4K8HA 1MO0A 3U2OA 4LWWA 2BX7A 3B4UA 3W2JA 3NQDA 3ZWSA 2FLIA 5AHFA 2ABAA 4O18A 4KFNA 3NDOA 1J4EA 3IIZA 2V5BA 2W79A 4AF0A 1G7VA 4JX4A 5CPLA 4PC8A 3EWBX 3LTYA 1JCJA 2FTPA 1UCWA 3QMTA 1J2WA 1L9WA 3AO0A 2NZLA 4Z1AA 3G18A 1AW1A 3IEBA 2Q3OA 1PVNA 3OVRA 4HKPA 4PCFA 2H8ZA 2E1DA 3TC6A 3GZ3A 1YPFA 1LRNA 1RQEA 1UJPA 3Q58A 3L66A 4QISA 1LM1A 3I68A 2PE4A 4DEFA 4O10A 1P5BA 1XUUA 4UTLA 2J27A 3NQAA 3NM1A 4IPJA 1TPC1 4O0ZA 3GAYA 4FNPA 3F03K 4N6EA 3G1VA 1D3GA 3WK0A 3OBKA 2QCEA 3UY8A 4YXGA 5G4EA 3HO8A 4GRSA 5K4XA 4D2JA 5D2WA 2X1UA 4J9JA 4LRTA 5KINA 1W31A 2HS8A 4JEQA 1OFDA 4KKXA 1KM6A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4TO8A

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