4W5UA

Crystal structure of chitinase 40 from thermophilic bacteria streptomyces thermoviolaceus.
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
GTVKLGYFTEWGTYDRNFNVKNLDTSGTAAKITHINYAFGNVTGGKCAIGDSYADYDKAFTADQSVSGQADTWDQPLRGNFNQLRQLKAKYPHIKVLWSFGGWTWSGGFADAAKDPQGFAQSCYNLVHDPRWDGVFDGIDIDWEYPNACGLTCDSSGPDAFRNLMAALRSTFGDELVTAAVTADGTPGGKIEATDYAGAAQYVDWYNVMTYDFFGAWDAQGPTAPHSPLTSYDGIPKQGFTSADAIAAFKAQGVPADKLLLGIGFYGRGWTGVTQDAPGGTATGPAAGTWEQGIEDYKVLKNTCPVTGTVAGTAYAHCGSNLWSYDTPDTIASKMAWANDQGLRGAFAWDFSGDTADGELIAALSNGLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase
publication title Crystal structure of chitinase 40 from thermothermophilic bacteria Streptomyces violaceus.
rcsb
source organism Streptomyces thermoviolaceus
total genus 130
structure length 369
sequence length 369
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4w5uA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w5uA01
1SMAA 1QNOA 5DF0A 1KBKA 1AQ0A 4UR9A 1US3A 4JFWA 1B2YA 3N13A 2WZHA 5LA2A 2V5DA 2A3CA 4PMOA 2JF6A 2Y4SA 1D3CA 1E0XA 5DMYA 1VJSA 2WB5A 2VURA 4M82A 3WD2A 5ABEA 3HMCA 4P8VA 4CN6A 4D6HA 3W6LA 2D20A 4NZCA 3LPOA 1UOKA 1CGUA 2D0HA 3ARYA 2YL6A 4H41A 4WSJA 2J7BA 3VGEA 6A3HA 3LMYA 2E40A 4TVUA 3S2CA 3ZJKA 4DUVA 3ARTA 3EMQA 4LPCA 5AC4A 3WMBA 5ABFA 2J77A 3T0AA 3BAIA 1E6SM 4PMZA 3AMDA 3WH8A 1JZ2A 3WDPP 2J7HA 1EDTA 2BHZA 2PBOA 3LPPA 4B9YA 2EPOA 3W25A 1UWTA 3WDIA 1PZ3A 1AVAA 1R7OA 3DHUA 2ZWYA 3N18A 2GJXA 9CGTA 2J8FA 2AAAA 2PBGA 2ZX6A 3FW6A 3ARXA 1UWIA 4AISA 2J7GA 3CGTA 1ESWA 1UWSA 4S3JA 2YL5A 2YLAA 1XH1A 2D3LA 1VJZA 4M80A 3MUIA 1OIFA 1QHZA 4EANA 3NDYA 2VRQA 3RIKA 1GNXA 3JUGA 2D2OA 2WLZA 1L8NA 3CMJA 1W2VA 1V6UA 1DEDA 1UH3A 3T2PA 3POCA 5M5DA 1CNVA 1OB0A 3VGDA 5JBFA 2HVMA 2JALA 3DHPA 3FN9A 3CHCA 2YL9A 4RE2A 3CUHA 3SCOA 1JYNA 2BV9A 1B3YA 4IPLA 3A4AA 2FHCA 1M03A 5CGMA 2ZUWA 1HJWA 3AMLA 3WUGA 3MUZ1 1EHAA 1V02A 1SR0A 2DSWA 1V3HA 1O6IA 1BLIA 2VX5A 1Q6FA 3ARSA 4CCCA 1ZJBA 1HL9A 1W3LA 3AS0A 1EA9C 2WMFA 3CUJA 4JIEA 4TTUA 1GOWA 1OT1A 1UZ1A 4MPKA 1UR8A 1BG9A 3AZTA 1UYQA 3VIFA 3CIVA 5A8QA 1TE1A 1QOXA 4UQDA 5CQ1A 2E8ZA 3RM8A 2XIIA 2O9PA 2ZOXA 5LA1A 1V3JA 2WC3A 4FK9A 3VDBA 2JIEA 2NSXA 1XH2A 4DM2A 1JZ3A 4LQ1A 1CBGA 1UD6A 4V27A 1PBGA 1MW3A 4MJ2A 4CU8A 4AW7A 1OWQA 5CSUA 2GDVA 1V6XA 4XV0A 1H1NA 3QR3A 4E2OA 4HMDA 5IHRA 1CGVA 1W3JA 3L4YA 3CZLA 2FH6A 4Z2JA 4IPNB 1B3WA 2YA0A 4P7LA 2OYKA 2Y5EA 1QVBA 4Q22A 3VVGA 4URIA 4J3WA 1E72M 1B0IA 3PHAA 1NWUA 3F5LA 2WKLA 1S46A 1XV8A 3BC9A 1J0HA 1KCLA 2XVPA 4CVWA 1XD1A 1W1TA 1NWTA 1C91A 3SCVA 4D6EA 1CWYA 1VFFA 3BXWA 5A2AA 3RM4A 1Q4NX 2D23A 3AHXA 3QHNA 4GI6A 2VNCA 1MFUA 5HXMA 4XUYA 3WIJA 1HJSA 1JYXA 3ARWA 2G8ZA 4CD5A 3WQ8A 2DH2A 3NYDA 3GXFA 1HKMA 2CNCA 5A8PA 4H8VA 1BFNA 4AY1A 1K9EA 2QPUA 4EK7A 5FOOA 4Z2HA 1VENA 4BQ5A 2CKSA 3AIRA 3PN8A 5CPTA 2DPEA 2YBTA 1B90A 4U2YA 5C70A 2QMJA 3ZMRA 3BLPX 4H8UA 1E5NA 2WVUA 3U7VA 4D6DA 4JKLA 2DH3A 5I24A 1MYRA 4KH2A 2VJXA 2W67A 4OBRA 1UR4A 3AIVA 5IDIA 1TR1A 2NT1A 2DDXA 5A6JA 2WHJA 2D0FA 1JI2A 5CSYA 2FGLA 4H2CA 2JEPA 4DUXA 4J3VA 4RE4A 2ZXAA 1IZJA 2CETA 3AIUA 4AZ5A 1E4IA 1VAHA 5I0DA 1WZMA 3AS1A 2VVNA 1R8LA 4GQRA 1W9DM 4UZUA 3K4AA 1EDGA 1VRXA 4CCEA 1HN1A 3RJXA 1EXPA 4PEEA 1FA2A 1N82A 3BLKA 4A4AA 1QNRA 1PX3A 2JFEX 5A69A 1DWIM 5I2UA 1GQKA 2XIBA 3WF2A 3ZJ6A 3AIBA 3DC0A 1WDRA 3VGBA 5LYRA 3ZT7A 1J0IA 4AZGA 2IXVA 4Z2LA 5A8NA 1XYFA 3KWXA 4B9ZA 5ABGA 4U31A 1JDDA 1HIZA 3CH9A 5JH8A 4UFIA 2WM0A 4QLJA 4AIOA 1TA3B 3ZSSA 5KEZA 2ZX9A 3AYSA 4PMNA 3MMUA 1V3MA 3O6AA 2XHYA 1KXHA 4UFLA 3VMNA 4HU0A 4BQ3A 1QI4A 1JL8A 1GOQA 2VMFA 3CUGA 2WVTA 2OSYA 5A6BA 2J62A 3IANA 3WEZA 4C7DA 4HU8A 3ARZA 2FHBA 1V0MA 3M6DA 5CGTA 4YPJA 1PEZA 2YJQA 3ALGA 3B8SA 2NT0A 3EMZA 3TTSA 1US2A 5A2BA 2GK1B 1R7AA 4TX8A 5D8WA 1HKJA 3ZR5A 5BRQA 1QHPA 3A47A 2J8GA 1OSEA 1JYWA 2VVSA 1LL6A 1PIGA 2ZUVA 1OM0A 1PX8A 2VTFA 1ITXA 2YL8A 1BVZA 3OBAA 4UQ9A 4AZ6A 5HDRA 5A6AA 2V5CA 3WF1A 1F4HA 3WFZA 1H0GA 3TTOA 4GINA 2J7CA 1H49A 4CN4A 4P8XA 2WAGA 2XVGA 4D6CA 1JZ4A 2CBIA 3WDJA 1LWJA 3CO4A 1X1NA 2WNWA 4UQEA 2CESA 3SCQA 4BQ4A 3T2QA 1CGXA 1FH9A 3BAYA 3VD9A 5CPSA 3ZM8A 3VDCA 4QFUA 1P6WA 3O2LA 2O92A 4MB1A 5HPOA 3L4WA 2G3NA 4U3CA 2ZUUA 1QI2A 2BNJA 3RM9A 4UTFA 4CUCA 1PZ2A 1CXHA 4V2XA 3L4ZA 1RPKA 2J4GA 4TXEA 1AQMA 4MJ4A 3F5JA 3K1DA 1V0KA 2BY3A 3GM8A 1G9HA 2D1ZA 1V3IA 2WC4A 2WMGA 2VCCA 3D5HA 5E09A 3RPMA 3EDDA 4X9YA 1H5VA 1WP6A 1ZBKA 2BVTA 4ZEPA 4PTXA 4D6IA 1EGZA 1EOKA 4M56A 1PAMA 4UOQA 3WEMA 1WDPA 1WCGA 4GZEA 2CERA 2CXGA 1E6ZA 1GONA 4WKFA 1AQHA 3TTYA 5M03A 1U33A 1KQYA 3WELA 1BAGA 2JE8A 5JBDA 2CBJA 4HOWA 4D71A 2RGLA 3AIWA 5FL0A 1E56A 3MV01 1E9LA 4DUWA 1E6PA 1W1PA 3GXDA 3AXHA 1DWHM 1GVYA 5E6ZA 2ZXQA 3N17A 2XG9A 2WHLA 1TG7A 1RP8A 1UD3A 4HPGA 4JHZA 1H4PA 2CKRA 2WZIA 1XRVA 3WENA 5BRPA 3FXYA 4YHGA 3WNOA 4DWSA 4D6FA 1W3HA 3UCQA 1WNOA 3UEQA 2V3EA 4ZXOA 3OG2A 3W81A 4PBGA 4TTGA 2DT0A 5GNZA 1EH9A 2OWXA 2V3FA 2CIPA 2ZE0A 4UFHA 4PRWA 2YOCA 4UFMA 3M46A 4UOJA 1LL7A 3RJYA 4AD2A 3RO8A 4E8CA 1UKQA 1ECEA 1GQLA 1HF6A 4OKDA 4M24A 2QMKA 1XC6A 3VX1A 3VIMA 1LG2A 1TFVA 1SYTA 4JKKA 4TVCA 4J3XA 1B3VA 1DTUA 3EDJA 2WMKA 1A3HA 4MDOA 1KGWA 5CJ5A 4PSPA 1HP5A 2WVSA 2WKGA 3VILA 1IT0A 3TP4A 2C7FA 2ZX5A 3DYPA 4HOXA 1FOBA 3VD3A 1OGBA 2WHKA 1R87A 4V28A 4ZE4A 1LQ0A 4Z2KA 1UR2A 3GNOA 1JXKA 2WCGA 3WQVA 1BYAA 2VZVA 3MV11 4NRSA 2VCAA 3IAPA 3NSMA 4YN5A 1OBAA 2VI0A 4C7FA 4J27A 3WUFA 5M3WA 3AI0A 3VMPA 1XHGA 2EBNA 1CXFA 3GXMA 1BYDA 3OGVA 4P7OA 2WZEA 1UUQA 1XCXA 1FH7A 1MVYA 3WBEA 1E43A 4LYRA 3CTTA 3L2LA 5I6SA 1E1FA 1EQPA 2HISA 2GUYA 2WPGA 4WLCA 4QCEA 3WD3A 2X09A 2W91A 1VFMA 1E5JA 2Y2WA 2QF8A 1XH0A 2FDMA 1XSKA 3W37A 4LYPA 2O9RA 4RE3A 4KWUA 1DWAM 4E4PA 4GZIA 2XFFA 3D3AA 3W38A 4IUGA 4UNIA 3VKKA 4F8XA 3AIQA 5CPQA 2JEQA 1GHRA 1R85A 2Y8KA 5A6KA 4AZCB 4QLLA 4P7QA 5A3HA 4HZ7A 2BY0A 4U33A 2VC9A 2XM1A 2ZICA 2CHOA 4PTWA 3GBEA 1UR0A 2DSUA 3U7BA 1W9VA 4QP0A 4WKHA 1MW1A 3WH9A 3AHTA 1JF6A 3F4VA 2WC7A 3EMCA 3I3DA 2PC8A 1CECA 2VT0A 5BXPA 3VGGA 2YIHA 1MQQA 4W84A 3QHOA 2X0HA 1HX0A 1NQ6A 3VTRA 3LPGA 1GQJA 3M7SA 2WMJA 3I3EA 1WDQA 4F9JA 7CGTA 4KGLA 2A3BA 5BXRA 4TUFA 3A4XA 5CXPA 3W6MA 1H3GA 1XSJA 1KB3A 1H2JA 1CYGA 1ISYA 1E15A 2EPMX 1QBBA 5A1AA 2W61A 1H0IA 3MSDA 2D24A 1FP9A 2FHFA 3QOMA 4D72A 4AD0A 1FH8A 4PMVA 2VOTA 1VEMA 5A6SA 3CHDA 3NCOA 4TOQA 4AZIA 1LG1A 4D1JA 3NSXA 4L4OA 2VRKA 1JXJA 1OGGA 3ZT6A 5DEZA 3WNMA 2VO5A 2Q8XA 4CKQA 1WAWA 2ZUMA 3DYOA 3W29A 5BROA 2GJXB 4AMCA 1J18A 1CXEA 1GOOA 2WBGA 2BS9A 2WCAA 3VIJA 3SCPA 1QPKA 4MB4A 3BAKA 5GNYA 2VZOA 3G6MA 1NOWA 5AC5A 1HKKA 2XWDA 3VIIA 4HA4A 1ISVA 1GUVA 4MNMA 1UWQA 3TONA 2WK2A 4CU6A 3KE0A 4U2ZA 5BWFA 3WH7A 4CD8A 3ZJ8A 4CGTA 4OIFA 1HVXA 3MSGA 4UQCA 1WPCA 1NP2A 2CYGA 4OOUA 1EIBA 3BAJA 5JBEA 1VFOA 2J47A 3K4DA 2PWEA 2XGIA 4AD4A 4DM1A 1BGAA 1JZ5A 1F4AA 4MB5A 3PZMA 3SURA 3E1F1 1B1YA 2EO7A 3AZSA 5BXSA 1K9DA 3S6TA 3ZSTA 4GQQA 4XB3A 3ZT5A 4W88A 1J10A 1G0CA 4W7VA 1W9XA 1PIFA 2TAAA 3PTMA 3RMEA 1H11A 3THDA 4PCSA 3U5YA 1GPFA 4B3LA 1O7AA 1EDQA 2J7EA 4QCFA 2WANA 3EYPA 3KZSA 3W0KA 3HN3A 1WE5A 2EPKX 1KCKA 2W5FA 1CGTA 2UY5A 3OB8A 2EPLX 3ZQ9A 2J75A 2UWFA 1NH6A 3CZ8A 1FHLA 2W4XA 3B9AA 2PB1A 3SUSA 4UZSA 1J01A 5FL1A 3ZJ7A 5D8ZA 1XGZA 1EO5A 5IHSA 3FY1A 2NW0A 3VINA 4AZHA 4FLSA 2G3IA 4OBSA 2GJPA 3UG4A 1G5AA 1E70M 3MUY1 3UR7A 3VD7A 1KR1A 4HMEA 1NARA 3WNPA 2XVKA 2UY2A 3VDHA 3WFLA 1V6YA 2O9TA 3L4TA 2FH8A 3GTNA 3CZEA 1LWHA 1ISXA 5I3DA 3I3BA 1CGWA 2J74A 1GQIA 3AHVA 4W85A 1OGSA 1W9PA 2O9OA 4OUEA 3ARUA 1FP8A 4OJYA 4JL1A 1J0YA 3WNKA 4PMRA 2X2YA 3WY1A 1CGYA 1OINA 4CVUA 2GDUA 3AYRA 1E6QM 1H41A 4WJXA 3NJ3A 3ECQA 4QAWA 2BVDA 2AMGA 5F7UA 2DEPA 1W1VA 4PTMA 3APGA 4LXFA 4UFJA 1TVPA 1BQCA 1QNQA 2DSKA 1PJ9A 4B3KA 1E1EA 1W9UA 1LL4A 1VEOA 3VO0A 2GVYA 4GXPA 5ABHA 1JZ7A 2ZXBA 1B31A 4B15A 1A47A 1C7TA 3HU7A 3WDRA 4ATDA 2XUCA 1UZ4A 2WSKA 4XX6A 2YDSA 4P7NA 2JIWA 3WQWA 3M07A 5I79A 2E3ZA 4N0RA 2Y8VA 2XM2A 5I5RA 1QNSA 4F66A 4W7UA 3B9DA 1V0NA 1WKYA 1JFHA 1J0KA 1UD4A 1X6NA 1ZBCA 4MAVA 1V6VA 2BY1A 2PF0A 4FLOA 4PCTA 1WZLA 3T0DA 2W62A 3CZGA 2WXDM 3AXXA 3VDAA 1KBBA 1KWGA 4XZWA 1E3XA 4M1RA 1BYBA 3AICA 4WF7A 4ACZB 2BFGA 2DIJA 4HMCA 3AMGA 3IJ9A 5IFPA 2WVVB 1NP0A 2J7DA 4YHEA 1ZU8A 2AOSA 1GOKA 5A6LA 3A3HA 4AIEA 3VM7A 3WQ6A 2WSPA 1U30A 3ALFA 1BG4A 2WMIB 4AEFA 4Z2IA 1C93A 1Y7VA 2OYMA 1HP4A 3BAWA 3BGAA 1GVIA 4HZ8A 3MMDA 1TUXA 3K8MA 3BH4A 2CPUA 1NWRA 4R27A 4F79A 5E0FA 4GO8A 1Q6CA 2CHNA 2ZX8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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