4WKFA

Crystal structure of human chitotriosidase-1 catalytic domain in complex with chitobiose (2.5mm) at 1.10 a resolution
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitotriosidase-1
publication title New insights into the enzymatic mechanism of human chitotriosidase (CHIT1) catalytic domain by atomic resolution X-ray diffraction and hybrid QM/MM.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 128
structure length 368
sequence length 368
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2014-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4wkfA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4wkfA01
2JEQA 4CN1A 3CUJA 2E9BA 4BQ5A 1J0ZA 1KR1A 1VENA 3A3HA 4J7RA 1NWTA 5D8ZA 4UR9A 1KWGA 2PWFA 3N18A 3MKKA 1PX3A 2JE8A 1MXDA 2JIEA 1VJSA 1KXHA 1NOFA 5LA1A 1TE1A 1CXEA 3QHMA 2NT0A 1E40A 1OT2A 1V3KA 1JD7A 2PF0A 2VR4A 4PMDA 5GNXA 3VMOA 3W4RA 1EH9A 1LWHA 1MQPA 4OBRA 3QOKA 5IHRA 1RH9A 1GVIA 1U30A 2YOCA 3CHDA 4QLLA 1GQKA 4AIOA 2CKSA 1X1NA 2BVYA 3RJXA 3DYOA 2Y4SA 5FIPA 4R5EA 5E6YA 3WNKA 1QW9A 2FH6A 1HJVA 1I75A 4YHEA 2VQTA 2ZE0A 1GHRA 4P7QA 4X0VA 4AD2A 4EANA 4LXFA 2WMKA 3IJ7A 1E6ZA 3ARZA 8CGTA 1LG2A 4IPLA 5CPSA 5BRPA 3MUZ1 3CHFA 5CLWA 3KWXA 2ZUWA 1UR4A 1J01A 2Z1KA 1CXFA 5HNNA 3SIMA 1G01A 4HOXA 2WVVB 1JXKA 2WCSA 4ACZB 1CGYA 2V3DA 3SCSA 3DHUA 4MB4A 1UZ1A 2V38A 3IAPA 3CGTA 1HF6A 2CERA 3W82A 4UOQA 1XV8A 4U5KA 2XGBA 1C7SA 3NIYA 4W88A 3RO8A 2WWCA 4FLSA 3O6AA 3E1F1 4HMDA 2EPOA 3A47A 1OD0A 3DC0A 4CD6A 3LPGA 2BS9A 3WH9A 3ARQA 1FFRA 5D9OA 1BG4A 2AAAA 1DTUA 3D3AA 2VQUA 1BAGA 2DDXA 3BXWA 4HZ8A 1NP2A 2F8QA 1B3YA 1QW8A 3OB8A 3CO4A 2YL5A 1US3A 1OIMA 2DGAA 1E3ZA 3WQ8A 1V6XA 1JDAA 2PWDA 1BHGA 4M82A 3AI0A 4UFJA 2XTKA 4XUYA 1B30A 3WNPA 1DP0A 4AMCA 3SCUA 1K6AA 3PN8A 3PTQA 1I1XA 3AISA 1AVAA 2PWGA 1LL4A 3OLIA 4PRWA 3WMCA 1UR2A 5BXRA 4E4PA 2BFGA 3AIBA 2WSPA 1JL8A 2OYMA 2VCBA 1O6IA 1V0MA 3VIMA 4P8XA 3OLEA 2CYGA 3SCPA 4HP5A 3UR8A 3UERA 4UOJA 1E56A 4CVWA 4U33A 2FHCA 3WDIA 1E4IA 3BAWA 4H8VA 1VIWA 3WD0A 2AOSA 3N13A 4J3XA 3GBEA 7TAAA 1DWAM 3N1AA 5D9NA 5M5DA 1E15A 1RP8A 2YJQA 2JF7A 1JGIA 4LYQA 4AD3A 1L0PA 3VGFA 4F79A 4ZE4A 3BAKA 1E5NA 2CCRA 4W89A 4D6IA 4MAZA 1GPFA 2OSXA 1XH2A 2GJRA 3CPUA 1H0IA 4C7DA 3WQ5A 2PBGA 5FOOA 1MW2A 5CSYA 1JI2A 3QOMA 4UQ9A 1FA2A 1M7XA 3VX0A 1A47A 2BV9A 2NW0A 1Q6FA 1NWRA 2VZTA 4MPKA 2W61A 1C8QA 3AICA 1EOKA 5JBEA 5CQ1A 2A3BA 1W9XA 4DM1A 1QOXA 1FH8A 3VU2A 4IPNB 4CCEA 3CZKA 4RE3A 2BY1A 3SUUA 4PSPA 2JFEX 3OBAA 2BVTA 3WH8A 1KGXA 1ISZA 3GM8A 2WC3A 4J27A 3WEMA 2A3HA 4AZCA 2WWDA 3WQ6A 5BXTA 1B3ZA 4WK9A 1PIGA 5HPCA 3RCNA 3AMDA 1QBBA 4GINA 2J7CA 2UWFA 2PWHA 4M29A 1BF2A 3FY1A 4OJYA 1V3JA 3GH4A 4ZE5A 4JKLA 3KZSA 2ZX8A 3K8MA 1EA9C 1AQHA 1W91A 3K8LA 4W8LA 2OSWA 5DMYA 3TTOA 2VI0A 1HJSA 2IXUA 1J18A 4P8UA 3CTTA 4HOZA 2WANA 2YDSA 1UD3A 5CGMA 2XFRA 1CGUA 2WVSA 5IXEA 4JFVA 1PPIA 1F4HA 1UD5A 5ECUA 2VMFA 2ESCA 1QNRA 3BCFA 3KE0A 3WENA 4D71A 5AY7A 4DUWA 4NI3A 2J7FA 4TVCA 1Q6DA 2EPNA 2YBTA 2XWEA 1NQ6A 1ISYA 4Z2HA 2VL4A 4ML4A 5FKYA 3VIIA 3DECA 1DEDA 2G3MA 3EDFA 4CD5A 4FLQA 3SCVA 4HPHA 3N9KA 1QNSA 5ABEA 1BYAA 1NH6A 1XD1A 3WF1A 1N82A 5A6AA 3N11A 4J3TA 4PYSA 1UR1A 3L4UA 1UR0A 3EMCA 4L4PA 2C7FA 3RJYA 1FP8A 3W24A 4AISA 5EFDA 1D2KA 1ISWA 1WZKA 3WQVA 1XGZA 2XVNA 1YQ2A 2G8ZA 4URIA 1HKJA 1V6YA 1WDSA 5A2CA 3VINA 1E6PA 1BLIA 5FD0A 3PZOA 4B9ZA 1GHSA 2WMIB 3AS2A 4AC1X 5E9AA 1KB3A 1FHDA 1VRXA 5I6SA 2DQXA 1M04A 3VIGA 1EQCA 2JEPA 1GJUA 3B8SA 3AXXA 1HN1A 1QNOA 4KH2A 1VFOA 1PJ9A 4CN6A 3WSUA 1W1YA 4Z2KA 4OOZA 4PMUA 3ZT5A 1FH7A 3VDAA 4HA3A 3ZO9A 3EDDA 4KMQA 4JL1A 4FF5A 4JL2A 4W7VA 2PB1A 2GSJA 2D1ZA 5HPOA 4AWEA 2ZUSA 3SURA 2ZUNA 2O9OA 2BXZA 3PZGA 1MVYA 3J7HA 5M3WA 3D5HA 4ATWA 1HJWA 1CGVA 3PZMA 3DYMA 1UKOA 2CETA 2VT0A 3BSHA 4AZ6A 1JZ4A 1CPUA 1BGGA 4U5IA 1K9FA 4Y7EA 2OWCA 1GW1A 1J0HA 2VZSA 1H11A 5A69A 3WH5A 4J3VA 5D9PA 4BCEA 1E72M 4KRTA 1ITCA 4MNKA 2YL6A 2C8NA 1E43A 1ZB5A 4DWSA 1BYDA 4PMYA 1H2JA 2UY2A 3POCA 2Y24A 3CIVA 5EBAA 1CDGA 4NRSA 3WUGA 1H1NA 4HPGA 3VNYA 1C91A 3ZQ9A 3WIJA 1CGTA 4PCTA 2WCAA 5CLTA 1XSIA 1E55A 5AYIA 3DYPA 4M8UA 1UKTA 4Z2LA 3FHQA 4EE9A 2DT3A 5E0FA 4NF7A 2YDRA 4CD8A 2D24A 1E1FA 2J7DA 3N15A 1VBRA 3VKKA 1EO5A 3VTRA 3OGSA 3U7VA 1OIFA 1IZKA 1VB9A 1UH3A 3II1A 2VC9A 1FOBA 1BVZA 3BH4A 3HU7A 3CZ8A 5BXSA 3K8KA 3GZAA 3VPLA 1V3IA 5I23A 4GI9A 4ACYA 4Z2JA 5A6BA 3ZJKA 5CSUA 1UR8A 1B3XA 2WCGA 2WB5A 1R86A 2VUYA 4A3HA 1JG9A 4QCFA 3MMWA 2FGZA 3KL0A 4CCDA 3EYPA 3S2CA 1OCQA 1WZAA 2J75A 3NSXA 1JNDA 1TA3A 2VO5A 4ATLA 1R87A 2VX7A 2WM0A 2CBIA 3WNNA 4AEFA 4B3LA 3G6LA 1XSKA 2NT1A 3W27A 5AC4A 8A3HA 1E0WA 2YA0A 3VIOA 2VCCA 1KCLA 2GDVA 1SR0A 1BQCA 2GK1A 1EDGA 5C8BB 4MJ4A 2QPSA 1E3XA 1OD8A 2CNCA 4LYPA 4QP0A 3APGA 3CZLA 1V6WA 1F4AA 3VGGA 2DPEA 3F5LA 4TOQA 1S46A 4PTVA 1ITXA 2DT0A 4M56A 3U5UA 3GNOA 4HMCA 5CGTA 4CCCA 5A8MA 3WFZA 2BVDA 1LL7A 4F9DA 3WELA 3QR3A 4D1JA 3AMKA 1ODZA 3ALFA 2J74A 1NOUA 3ARUA 1PBGA 3ECQA 1PX8A 1WNOA 3B9AA 4BQ3A 5IHSA 3UCQA 3VIJA 1QI4A 2VR5A 2D0FA 3OZOA 1UA3A 3EDKA 3UESA 2EBNA 3CHCA 3WNOA 3A4AA 3SUTA 3AS0A 4V2XA 4X9YA 3VO0A 1W9VA 5JIPA 1KXTA 3QHNA 3FW6A 2J7EA 3WD3A 5D8WA 2X05A 3ARRA 2EPKX 4FMVA 1MWOA 1JYXA 1G9HA 4F8XA 7CGTA 1UWRA 3ZJ7A 1DHKA 4EKJA 2VCAA 1JFHA 4OZOA 4HOWA 4CU6A 2FHFA 2GFTA 2JF6A 3AMCA 4UFMA 2A3CA 3WD4A 1W3LA 3QGVA 4GZIA 4ZFMA 5LA2A 1CYGA 1VBUA 1G94A 1H3GA 1B1YA 1SMAA 1JZ3A 1JYWA 5DO8A 2WMGA 4UFKA 5A94A 1B90A 1X6NA 2XVKA 2WBGA 2DSUA 2OWXA 1KCKA 2W5FA 4AD5A 3VD9A 4C7GA 2X09A 2DH2A 3BMWA 3AZTA 2YBUA 2GJXA 1C92A 5EB8A 3RILA 3WF4A 1ZU8A 4W87A 1V0NA 1G5AA 4D6CA 2VX5A 1OT1A 5A6KA 1E4LA 1GJWA 5DT5A 5JBDA 4CKQA 1HJXA 2J62A 4H2CA 3WMSA 2J77A 3W0KA 3K1DA 1AMYA 2ZXQA 2ZX6A 1R7OA 5HOSA 4CD4A 4V27A 1YHTA 1O7AA 4LYRA 1OGSA 3VD7A 2D3NA 2HVMA 1EDTA 3ZR6A 2E9MA 1B3WA 1QBAA 1PX4A 1W2PA 3AIQA 4GXPA 4JFTA 6CGTA 1Z32X 3VNZA 4ATDA 1GQJA 4H04A 2WNWA 4UFIA 5A8QA 3PBGA 2CXGA 4A4AA 2XVLA 5HXMA 1C7TA 3WUBA 5FL0A 1LWJA 3O9NA 3AROA 3N12A 1GZJA 1BYCA 1WCGA 2W91A 1DWFM 1LF1A 1K9DA 3TTQA 3CZJA 4JCLA 3L4WA 3NJ3A 4Z2GA 3GH5A 4AZCB 4UCFA 5E09A 2E3ZA 4W93A 1J0JA 3EDJA 1GVYA 1JZ8A 1WP6A 2Y8KA 3OA5A 3UG3A 3NSMA 2GUYA 3VUPA 9CGTA 5HDRA 2ZX5A 2ZICA 2VURA 4KWUA 2ZX9A 1ISVA 1ECEA 1UH4A 3MV11 3BAIA 3RIKA 2WVUA 4ACZA 4AZBA 1JZ7A 1CGWA 1NWUA 4HA4A 3AHYA 2W63A 3GBDA 5I2UA 1E73M 3CUGA 4TUFA 3PZTA 3O2LA 2G41A 2VX6A 3T2OA 5DFAA 3T2QA 1XCWA 1V0KA 1AQ0A 1GOQA 1QNPA 1MFVA 4PEEA 1UD2A 2VZUA 2JIWA 1UWQA 1FHLA 2X0YA 2WZIA 4MNMA 1W9BM 3FXYA 1UG6A 2OYKA 3RM8A 2ZXBA 4HZ6A 1CLVA 4U3CA 2UY5A 1BSIA 4Q7NA 2CBVA 4OIFA 3VDHA 3W28A 1XYFA 3BLPX 3A4XA 3KEHA 4V28A 3AMLA 2YDQA 4P7LA 2PBOA 2Y2WA 2JALA 5CZKA 3VGEA 4B15A 1UWTA 2WZEA 2D23A 3PTMA 3BCDA 5C71A 5E6ZA 1TZ7A 2BHUA 4AD1A 3ARXA 1U2YA 1JZ5A 4IUGA 4P7NA 4AIEA 3IAQA 1IV8A 3MSGA 4YN5A 3RPMA 3WN6A 3CUHA 1VEPA 1WKYA 1W1PA 2WC7A 2DSVA 4P8WA 1GQIA 1EGZA 4ZXOA 3S6TA 1V08A 3VMPA 5F7UA 4WLCA 1OWQA 3AFBA 1GOMA 4FK9A 4BF7A 1PIFA 3ZIZA 1HKMA 1LJYA 4RL3A 1KBKA 1JIBA 2J8FA 2E9LA 3VDCA 5GQBA 1CXIA 3CBWA 1JDDA 1B31A 1JFXA 4UZUA 2XVPA 4GO9A 2W4XA 4GI8A 2WSKA 3EDEA 3ARWA 1ZBKA 1VAHA 2Y5EA 1KR0A 2PWEA 2IUZA 2BY0A 4JHOA 5HBFA 4J3WA 4U31A 4CGTA 3OGVA 1W9DM 3AS1A 4U3AA 4ZXLA 4D72A 2RGLA 1GONA 4GKLA 1UZ4A 2E40A 1CXKA 5AC5A 1ZBVA 1JD9A 1J12A 4XZBA 1J10A 4W5UA 2J8GA 3DHPA 3UG4A 2BHZA 2X8RA 1EHAA 4DWSD 1W32A 1DWHM 3MUIA 2XSBA 2W92A 5KZ6A 2O92A 3K46A 1E70M 1NP0A 1JYVA 5A2AA 2V5DA 2EQDA 1BGAA 4PMVA 4PUEA 2DIJA 4WSKA 1IT0A 1SFSA 4WJXA 2WHJA 3AIVA 3GTNA 4DWSB 3ZT7A 5JIWA 2FH8A 2CBJA 2XUCA 3WNMA 3M7SA 1JYNA 4HU8A 4QFUA 3L4YA 2Q8XA 3AYRA 3EMZA 2J7GA 4HMEA 2GJPA 4MTVA 3MUAA 5A6JA 1GORA 3VIHA 1M53A 3WQWA 5ABFB 3SCTA 3L4VA 5A6BD 2J4GA 4JHZA 3FHAA 1WDQA 2RGMA 5I78A 3HJEA 2E0PA 2E8YA 2ZXDA 4X0NA 4AXNA 2J78A 2WBKA 2DSWA 4FLRA 2YA1A 4UNIA 1PAMA 2C0HA 2FHBA 3RM4A 2ZIDA 2WK2A 3MUY1 2G4FA 3THCA 4ZENA 3W37A 1UH2A 4PTWA 1ZJAA 2VOTA 3CUFA 3U7BA 3AQUA 4ZEPA 2WAGA 1V0LA 5FL1A 4DUXA 4WIWA 1HL9A 1A3HA 1XD0A 1OGGA 2B31A 3CUIA 4MDOA 5CPQA 4W86A 1TA3B 4IISA 1VEOA 2W62A 4PMXA 1MQQA 1RPKA 1QI3A 2OWWA 3WUFA 3WD2A 5I5RA 4PMOA 4UQCA 2VZOA 4AW7A 4AZ7A 1E0XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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