4YXGA

F96y mutant of plasmodium falciparum triosephosphate isomerase
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
246
structure length
238
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYTGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHYERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWTPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Connecting Active-Site Loop Conformations and Catalysis in Triosephosphate Isomerase: Insights from a Rare Variation at Residue 96 in the Plasmodial Enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 94
structure length 238
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4yxgA00
1AK5A 5BOOA 3LCHA 4LV4A 1T0OA 4WOZA 2YXGA 2W79A 4I7UA 4NU7A 1RD5A 2YR1A 4KFNA 4NNCA 1QPOA 2X16A 3QSRA 3IGXA 4P2VA 3NQGA 4E38A 4QAIA 1JULA 2QCFA 3O6CA 2A5HA 4FB7A 4UMBA 4LTSA 4FNTA 4MLJA 4JEQA 1QOPA 2Q8ZA 4NJJA 2F7FA 1VC4A 7TIMA 1QMLA 2OCZA 4ZMGA 4OHQA 2GVGA 4O10A 3U6WA 1GTEA 3W1TA 1OF8A 5FEXA 4EWND 1GVRA 3HPZA 1AW2A 5F4WA 5C5YA 3LERA 3IIOA 2DU2A 3W83A 5TBOA 3WK3A 5CPMA 4O1BA 4C1KA 2BX7A 1H7PA 1O4UA 1WOAA 3NR0A 1KFCA 3NYZA 3TMLA 3PR2A 3C0JA 3W7CA 2I1OA 2FDSA 1NSJA 1XCFA 2PRMA 4LT9A 3GAYA 3SGUA 1QPNA 4EF9A 3CIXA 4A2RA 1XUUA 2E5BA 1P1XA 2B4GA 1XM3A 4RLIA 5AOUA 2VOMA 2TPSA 4LY8A 4ORIA 2QCLA 4PH6A 1F6KA 3QQ0A 4UFHA 3LRMA 4K39A 5FF3A 4JXCA 4GXMA 2DP3A 5EY5A 4CQ9A 2NUWA 1T8XA 3N14A 2G96A 2ZZ5A 1SSDA 3MBFA 1SO5A 3W7HA 3N73A 5CPOA 1JRCA 1LRNA 1FY6A 1W5PA 3QC3A 4DBEA 3PBUA 3P8IA 1EIXA 3HIJA 3ZS4A 1DJNA 3PBVA 3NGJA 3O63A 5C55A 3HG2A 1ZFJA 4X3ZA 3VNDA 2W6RA 3U8GA 3DFSA 1QO5A 2I14A 1FWSA 1Q45A 4O18A 4IWWA 2QJIA 4IPJA 1ME8A 4Q33A 5CSSA 3SW6A 1EP1A 1P0NA 2YFNA 2OX1A 1H7OA 1QNVA 3FKRA 1PE1A 2NV1A 3CPRA 2OT1A 5K4XA 3E02A 4TR9A 1FDZA 3HGOA 3O16A 2QCEA 3UNDA 2ISVA 3STEA 3G1DA 5AYYA 2GJLA 3B4UA 3M1ZA 4MFDA 3DI0A 5G2IA 1OK4A 2DZUA 2QUVA 1SFLA 2WKJA 4DO6A 4R34A 4UTTC 4A3UA 3NQ6A 3KRUA 3IVUA 4O8RA 3TW6A 2EPHA 3BG5A 2BTMA 1BWLA 3FJ6A 5F4XA 1VZWA 4ONVA 5FI8A 3GYEA 1JQVA 1KBJA 4O50A 4AMAA 4MZ1A 1AW1A 3DGRA 3TU9A 4ZQCA 3O15A 4IX2A 1I2OA 2VFEA 1A5SA 4MJZA 4DO4A 4N6EA 4AHOA 1XDMA 2FB2A 3HG5A 4N6FA 1EA0A 3I7SA 1QO2A 4NQ1A 4Q4KA 1HTIA 1FDJA 4QJ1A 4H6KA 1YXDA 4FHAA 4JY8A 3HGRA 1IIHA 2EKCA 4JY9A 5K9DA 3RLUA 3G3DA 1DKWA 5FF2A 5E0KA 2FPYA 3G8RA 4RJEA 4AHQA 3MO7A 1QR7A 3M5XA 3W3OA 1NAL1 1X1OA 3QQ1A 3T44A 3SJ3A 2Y70A 3NO5A 3LCXA 1W56A 3U2OA 3R5EA 1TB3A 1RQHA 4UNKA 1S5WA 5IM51 2HS8A 4IOTA 1W5NA 3KFTA 3M5ZA 1OFPA 4FNPA 5D30A 4QNWA 4R33A 4UFJA 1OABA 5KSWA 4JYEA 2Q8LA 6ALDA 3T7VA 1SSGA 3CU2A 3W7DA 3EWXA 1I2RA 1UCWA 3LDVA 5BMWA 5KITA 1ZALA 4ADUA 3MJYA 1FWNA 2Y85A 5K3VA 1WYIA 4OBTA 3CLMA 1QDSA 5K9XA 3V1PA 2FB3A 1JQXA 2Z1BA 5HULA 4J9JA 4N9DA 5EKYA 3GNNA 3W71A 2H3BA 2QEZA 4AEOA 2ALDA 3BV4A 2E09A 3GAKA 4O53A 1UB3A 1MXSA 5HNRA 4MPQA 3OG3A 5LNWA 5HWNA 2CZFA 1P0KA 4NX5A 3T40A 1KA9F 3EWZA 2XFWA 1IGSA 4DF2A 3W1UA 2OMAA 3L0GA 2NLIA 5DXYA 1Q6OA 3M44A 2E68A 4A29A 2A2IA 1ML1A 2JBMA 4DPQA 4O1AA 2ZTKA 1TSIA 2C13A 2AGKA 3LTYA 4O15A 3GDLA 3L5LA 1DQXA 3DFOA 4I7VA 2V2HA 3CHVA 3P67A 1KFBA 4JTEA 4FIQA 2NXGA 3TJXA 5H91A 1G7UA 4X2RA 3C8FA 2Q3RA 5HMSA 3TDFA 2WNQA 3V75A 1EEPA 3NM3A 1PHWA 4HIBA 5HWJA 1K7EA 4HNUA 1TREA 4HPJA 4FX8A 1MO0A 1I2NA 3YPIA 3NOEA 3KX6A 3KXQA 1XKYA 1RR2A 4AB4A 2C3ZA 2GJNA 1LROA 1IXPA 3UQNA 1M6JA 2DZSA 3CT7A 2X30A 2C15A 2E6FA 3BGJA 1H51A 3B8DA 4ZVJA 5LNSA 3CWNA 3IIPA 1ZENA 3BO9A 3QF0A 3OHIA 1SR9A 1GTHA 1FXPA 5K4ZA 4MOZA 4FF7A 2QKFA 2GQ9A 2QJHA 3BLFA 4PEKA 4KFOA 3WJWA 3PF3A 2Z2UA 4ALDA 1L2UA 1TJPA 4WX2A 4MYXA 1GVQA 1PIIA 2BZNA 4UC5A 4JN6A 5AYXA 2HMCA 1UASA 3SECA 2J6XA 4A21A 2X1TA 1WX0A 2DZPA 1DORA 2G5WA 2V30A 1TRDA 4E0CA 1ZAHA 2ZA3A 4MFEA 3M43A 3NL6A 2V8ZA 1ZNNA 4BI5A 3IV3A 1TO3A 1O95A 1J4EA 4NJHA 5HUOA 4U4MA 3UWYA 5KZEA 3FEMA 4AHPA 3M16A 1F6PA 5FF4A 4QITA 3A5VA 3NPWA 3B06A 3P80A 1I4NA 1L6SA 3JR2A 4B5NA 3TIMA 4RV8A 2CZDA 4LS2A 5TQLA 1XBXA 3BARA 3NM1A 4N9CA 1XBVA 2YGYA 3LHYA 5DBUA 4JTKA 2CZEA 2AAMA 4NXSA 1DL3A 1SO6A 1LYXA 1PL9A 1SW0A 1ZJIA 1W5OA 4GUIA 3L5AA 5CGQA 4Z08A 2HTMA 5LNVA 3W7IA 3BPWA 3UD6A 3G1HA 3ZR4A 1OYAA 5D03A 4JTTA 1LP6A 2WNZA 1H7WA 3RFAA 4CQAA 2YYUA 4O12A 4M7SA 3LHTA 3R13A 4TIMA 5EYWA 3P5YA 1KV5A 2ZQ0A 1Z42A 1GEQA 1Q3NA 2ZRZA 4LS1A 1V7YA 2QCNA 3NZRA 4JTJA 3TX9A 4JTSA 1Y0EA 3P8JA 4UTTA 4ZZ9A 2A85A 1LBMA 1VCVA 1W3TA 1EWEA 5DN1A 1QPQA 2CLIA 3R8RA 1OX6A 5D2VA 4CCEA 3EX6A 4IXHA 1OX4B 5K7JA 3AO0A 2FIQA 3I7QA 1U5JA 3L65A 4XWUA 2WJZA 3H55A 3P60A 1TV8A 4OQVA 3PWAA 3W1XA 3QZEA 5KZMA 4MVAA 3STGA 1DJQA 1LLZA 1XI3A 1KM2A 2A7NA 3NQ2A 1TPC1 2NWRA 4S2CA 2A6NA 3M41A 3QMSA 3H53A 4QIUA 1M7OA 4LC8A 2A4AA 4MY8A 1TTJA 3QPYA 1E51A 3M5YA 4YL2A 3C61A 4ICNA 3A5FA 2GOUA 2Y88A 2C19A 1TPEA 1VQTA 1VYPX 1LORA 4EVZA 4Y9AA 4JDBA 5AHEA 5BNKA 4JYFA 5LKYA 3G0XA 3KVLA 3ATYA 3PB2A 4N02A 4MY9A 1K8YA 3HPSA 4EF8A 1TPFA 5E1QA 1NF0A 3L21A 2CZ5A 3LLDA 1S5TA 5EL1A 2GQ8A 4UTLA 4ZL1A 4RZ4A 3EWBX 3PUOA 1EB3A 1X8FA 4ZQRA 3G1AA 3TV8A 4HHPA 4N4PA 1VYSX 3VCRA 2WSYA 4TU1A 4JD4A 1FQ0A 3NQ7A 4HSOA 3G3MA 1ADOA 1ZHAA 2J24A 1GT8A 3CEUA 2QF7A 1YLVA 1CI1A 3F1QA 5F2GA 5DCBA 1PS9A 4GJ1A 2Z6JA 1VLIA 2ZRUA 1KFEA 3STCA 1H7RA 3NQVA 4NJGA 3ANYA 3A21A 4DELA 2RDUA 5F1VA 3WJYA 3RNDA 1FDYA 3W1LA 2E77A 3LRLA 5H2ZA 4Z1DA 1X7FA 3W7EA 3BW4A 3FLUA 2JGYA 4K7YA 1SFJA 3W76A 4MUZA 3NA8A 2A7RA 3LHWA 2E1DA 3W7QA 1H63A 3W2UA 2P0OA 2ZA2A 3O06A 3H54A 5K9CA 3WFAA 1TPDA 3W1QA 2GVLA 4RCXA 5D04C 1YTKA 3QSTA 4GUFA 5AFDA 5D2YA 1OFOA 1TTQA 1C8VA 5CZJA 5D05A 1TV5A 1AL8A 3W87A 1OK6A 2ZZ7A 1KW1A 5U7SA 1H1ZA 3UWUA 3TXZA 2QCCA 5SWUA 1JCLA 1W8SA 4DBDA 1WV2A 3EEGA 4P61A 2YW4A 4K7VA 1XBZA 3C2VA 1JJKA 3EB2A 4BK9A 1K03A 4H4IA 1GYNA 2H6RA 3LBMA 2B7PA 1XL9A 2ZBTA 3L5MA 3T4CA 3LHVA 4JIQA 3CB8A 1WA3A 1MSSA 1W3NA 3BW3A 4UFMA 5CKSA 1FBAA 3HF3A 1WBHA 1TTIA 4LWWA 1KM3A 3RMJA 1GPWA 3FKKA 1WXJA 4JTHA 2Y89A 3F4NA 1VJIA 3NQ8A 1A5CA 3S6DA 3S5YA 3W7LA 3QFEA 1T99A 4OU1A 3A24A 3SY5A 3UXDA 3G1VA 3TH6A 3S1WA 3ZWSA 4LW7A 3PBYA 3BK0A 1ICPA 4RK8A 1R30A 4LVFA 3RU6A 3NEVA 1YTEA 2A0NA 3TAOA 2C14A 3QEZA 4H3DA 5KMYA 1A5AA 1FCVA 1H7NA 3C56A 3M6YA 3Q2DA 2VFHA 3GXTA 1D9EA 2QJGA 4DO5A 4UTKA 3O6DA 1L9WA 1KFKA 3P84A 4UR8A 5CSRA 3L2IA 1G7VA 4WY0B 4R53A 4M6QA 4MZ8A 3BG3A 2VEKA 1H61A 3W7MA 3EX3A 3PSWA 3TQKA 3ZFHA 2RHGA 4Q32A 2FQIA 5DCEA 3SI9A 1KFLA 3LCLA 2QCMA 3CC1A 3QRHA 3MHUA 3W7RA 5AHMA 3L68A 4O1CA 4AF0A 3P5ZA 3W7JA 4TMCA 2Y7EA 4HNVA 1W0MA 1GVSA 4G1KA 1G4PA 3LI0A 3LHUA 2ISSA 4UFKA 5C54A 4GBUA 1FX6A 2GVJA 4AAJA 3MBDA 1LBLA 2FTPA 1QWGA 1SQ7A 4CNPA 1W37A 2QCHA 5D02A 3W1NA 1OF6A 3FS2A 2PC4A 4GFSA 2OZ0A 1JUBA 1VH7A 3NQEA 4WY0F 3SZ8A 5BRBA 1W1ZA 1VCGA 1TIMA 3THQA 1HUVA 4OV4A 3W75A 4JR5A 2E6YA 3C52A 5LSMA 2Z6IA 1UBSA 3IVTA 1R2TA 1K7XA 2IQTA 2VXNA 4DQWA 3I6RA 2PCQA 5CPNA 2TSYA 4O52A 3N2XA 1BKSA 3DBPA 4ML9A 3T55A 3ABQA 3TSDA 1PVNA 5D37A 4DEFA 1LCOA 3N9SA 3P81A 4UCGA 5L6UA 4AXKA 1EPXA 4XTDA 4O28A 4Z1CA 5IBXC 3W85A 4JTFA 5HQEA 2X1SA 1FUYA 3K30A 3IIVA 3N2MA 2R94A 3PG9A 2Q3OA 5HR7A 2V9DA 4OGZA 1G4TA 1KV8A 3RF9A 1HL2A 1L6YA 1K7FA 4NJIA 4QISA 4LU0A 4UUIA 3PUDA 3TC7A 4JS3A 3PSVA 5E93A 3W1PA 4JNMA 2F84A 2FJKA 1G4SA 3WJXA 5LGXA 1GJPA 2X1RA 1OVDA 3HB9A 1GOXA 2BWGA 1DBTA 5ABTA 1B4EA 3EXRA 4K6AA 2C1HA 2NUXA 1XFBA 3KRZA 3NQAA 4XKYB 3W7PA 5FEPA 3DXIA 4QQ3A 2CFFA 1R47A 3EWUA 4D2JA 3VFLA 3MW7A 3GK0A 2EAWA 1W5MA 2JKPA 1VHNA 3TXVA 3PY2A 4TO8A 3GR8A 2V82A 5DLCA 1RV8A 3PC0A 3LCIA 4XBSA 1B9BA 5KTLA 2E5CA 4NNAA 2J88A 2WOQA 1TPUA 1W31A 3S1UA 3G22A 4Y6GA 4FXSA 2ABAA 4Y96A 5C6MA 1LBFA 2PE4A 1WBJA 2JKEA 5J5DA 5EPDA 2Z0IA 3CWOX 3W9ZA 3HO8A 4XTIA 4K37A 2ZZ4A 3HG4A 3DI1A 4QNEA 3GB6A 3GVGA 2A1YA 3WJZA 4DF1A 4PTNA 1A5BA 5I3FA 2G95A 2J27A 3NQDA 1HG3A 2DORA 4UTMA 3GDRA 2ZYFA 1SU5A 4JICA 5I3GA 3GZ3A 4O17A 2WSRA 2HS6A 3KHJA 4BWLC 1R46A 5LGZA 2YFOA 2BSLA 2VFDA 3A9IA 4N4QA 3GKFA 4O54A 1SW3A 5G2WA 1IXQA 3M0ZA 2DZWA 4LRSA 3UWVA 5LHFA 3PULA 2V0TA 5DY3A 3O1NA 4PCFA 5MHBA 3UZJA 3DFPA 3PAJA 5T26A 1M7PA 3W23A 5HJLA 1QFEA 2B7QA 4QM1A 4MLRA 4POCA 1N55A 4JTUA 3MYPA 1F7BA 5DCDA 3HGJA 5AHNA 4GUGA 4FO4A 5G4WA 1IF2A 1BEUA 5C2XA 2CLEA 4XUGA 5AC7A 3W1AA 1F5ZA 1NFBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4CNN A;  3TAK A;  5KIN A;  2QDG A;  3QM3 A;  2ATS A;  1LOS A;  1OFR A;  1VS1 A;  2RDT A;  5G5I A;  3PG8 A;  4EIV A;  2ZCG A;  5IBX A;  5U4N A;  1YAD A;  3NG3 A;  4A2S A;  1MZH A;  5A8G A;  1UUO A;  1VYR A;  4TX9 A;  5F1U A;  3UWZ A;  1Q6Q A;  4N2Y A;  4IMF A;  3OA3 A;  2P10 A;  4UFI A;  3LRK A;  5LHE A;  3N19 B;  2QCD A;  3OVR A;  4GWE A;  4UTH A;  1LM1 A;  2PRH A;  1GWJ A;  4FX7 A;  2R14 A;  2BLE A;  3FJL A;  1T96 A;  3TE9 A;  1XC4 A;  3LLF A;  2H3D A;  3W7N A;  3HJZ A;  3P61 A;  4WZH A;  4CLM A;  4X22 A;  3C2E A;  3W86 A;  4KKX A;  3JRK A;  1K8Z A;  3E9A A;  1TTP A;  3PUE A;  2VC6 A;  4ADS A;  4PC8 A;  3W7O A;  3QW4 B;  4AF0 B;  3HQ1 A;  2QAP A;  3P74 A;  2H90 A;  3OVQ A;  4IMD A;  1RVG A;  4UTW A;  2YZR A;  3BVJ A;  3GDM A;  3LXB A;  1F74 A;  3IGS A;  3LB0 A;  5BW6 A;  2QCG A;  1PCW A;  3LBC A;  4XBK A;  3P7Y A;  4PA8 A;  3GXP A;  4I7W A;  2Y61 A;  1ZY9 A;  3UYC A;  2DZX A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VOH A;  4LEQ A;  4YYC A;  4E2O A;  3ZLF A;  3MB9 A;  2YXG A;  3DG7 A;  5CBI A;  2XZ9 A;  1K9F A;  4NNC A;  3FXY A;  4IPP A;  1G0C A;  2PDW A;  3NQG A;  4QAI A;  2Z1V A;  2H9A A;  3OHM B;  5DT7 A;  1P7T A;  4HK6 A;  2VL4 A;  3WQC A;  1M1B A;  1E70 M;  1A47 A;  3ZLG A;  3ZVH A;  3UG8 A;  3BXW A;  1CB7 B;  1ITX A;  2F7F A;  1JCT A;  2PA6 A;  1QML A;  4ZMG A;  4DYJ A;  1HJU A;  3S9I A;  4OHQ A;  5FAC A;  1FH7 A;  4O10 A;  2Y2W A;  4GKL A;  1XCX A;  3UU0 A;  2DUZ A;  1OF8 A;  4CNT A;  3HPZ A;  1UKS A;  3ITO A;  3IIO A;  3W83 A;  3GHS A;  1GON A;  3TN3 A;  5TBO A;  3P0X A;  1A80 A;  3KS6 A;  3WK3 A;  4RNI A;  4QDW A;  3LZ3 A;  4O1B A;  1H7P A;  1WPC A;  3NR0 A;  4G1N A;  1KFC A;  1HW6 A;  1V8E A;  1WB0 A;  3PR2 A;  1NSJ A;  1FWA C;  3SGU A;  5CAH A;  3OLE A;  1J79 A;  1XUU A;  1XM3 A;  3C3U A;  5AOU A;  1KR1 A;  1P6C A;  4LY8 A;  4U31 A;  3CLW A;  2QCL A;  2POD A;  4E4U A;  2WB5 A;  3AYS A;  2GQ3 A;  4ZOE A;  4MAZ A;  2NUW A;  4PTD A;  1T8X A;  3VIM A;  3QY6 A;  3W7H A;  1W5P A;  1GHS A;  2NSX A; 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