4Z2HA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 29
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 163
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2hA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2hA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2hA01
2VC9A 1TE1A 2O92A 3BH4A 4IPNB 4MB1A 4RL3A 4A4AA 1KR0A 2JALA 2VT0A 1NP0A 5IHSA 1E4LA 3NSNA 1WDRA 5HNNA 2ZUWA 3L4TA 2PC8A 1FOBA 5A3HA 3VOCA 2X09A 3VX0A 3CZGA 3VD9A 5GPRA 1GVYA 1HVXA 1DEDA 2J74A 1RD6A 5JIPA 3WY1A 3DYMA 4OZOA 1MXDA 4OBSA 2VTFA 2D3LA 1B90A 2DDXA 1JNEA 3W37A 4Z2JA 1FHLA 2IXUA 4J3VA 1EHAA 2Y4SA 3KZSA 2BHUA 3VIFA 4CKQA 3LPPA 2YL8A 4F8XA 3OA5A 3PZVA 4F79A 2YKKA 2J7DA 4MNKA 1MFUA 1DWHM 5BYWA 3RM4A 1U2YA 4FF5A 4UCFA 1H11A 1MW1A 7TAAA 4U3CA 3VD7A 3O6AA 1S46A 4H8HA 2V38A 2CCRA 4RE4A 1B1YA 5EFDA 1DHKA 3WF3A 3TONA 1BGAA 1E4MM 4AZCA 3AXIA 4FMVA 3SEPA 3VNZA 4U2YA 1WZAA 3WEMA 1NOFA 4WSKA 3LMYA 1GOIA 1ZBKA 3WBEA 1B3VA 2EO7A 3VO0A 4CD8A 3G6LA 1WAWA 4UFIA 5M03A 2VO5A 1BQCA 1HJXA 1M04A 2OWXA 3AXHA 3WUGA 1HL9A 3RILA 1GORA 3ARZA 4AD2A 1UKSA 4AD5A 3PBGA 3I3BA 3FY1A 4W8LA 5A6SA 1V0NA 5CSYA 3MS8A 4D6FA 1RPKA 1CXIA 4YPJA 4ZFMA 1GPFA 3AOFA 3EDFA 5CSUA 1XSIA 4E8DA 1E4NA 4AIUA 1DTUA 5DT7A 1ZBVA 2RGMA 4HA4A 1ECEA 3FN9A 2BY0A 1B2YA 2C8NA 4JIEA 1HVQA 4AC1X 1DWFM 4YHGA 1E0WA 1MXGA 4DUWA 4HP5A 1EHNA 3PZGA 2DQXA 3QR3A 4PMQA 3OGSA 4DM1A 5DT5A 5A8QA 4OOUA 2OYLA 1GOOA 2E4TA 3IJ8A 3MUZ1 3SIMA 3U7VA 1BSIA 1UYQA 4J3XA 4LQ1A 3GXMA 2D0FA 4B9YA 2J79A 2HISA 3ZM8A 4GQQA 3RO8A 4QAWA 4OBRA 4PMRA 1GJUA 3IAPA 2XM1A 4QLJA 4C7FA 4UZSA 4JFVA 4J27A 3N9KA 1FFQA 6TAAA 4JCMA 4XB3A 1E6PA 4P8WA 1A47A 2WCGA 4EK7A 2YBUA 5CPTA 1H49A 1UZ4A 1QI3A 4CVUA 1Q6CA 2DT2A 3VD4A 4PSPA 2PWEA 4TUFA 2EQDA 1OGSA 1UR4A 5ECUA 3IANA 4M82A 3NCOA 3ZJ7A 1L0PA 4RE2A 3N04A 1VJSA 1JFHA 1NQ6A 2CEQA 1UWQA 1ZS2A 2ZUNA 1JD9A 3OB8A 3WNLA 1Y7VA 1US3A 1DWGM 4PTXA 5E0CA 5GNYA 4CD6A 3CH9A 3MUAA 2PBGA 1QVBA 5LA1A 4MB5A 2VX5A 5JBFA 2J7CA 1JI2A 2XTKA 3VILA 1LG2A 5GNXA 3SCTA 2JE8A 3WUFA 1KGXA 1X6LA 1JZ7A 4WKAA 4HMDA 1LLOA 3W29A 2G41A 2ZICA 3EDDA 3S6TA 3AMKA 3VGFA 3KL0A 3RM9A 3UG4A 2X2YA 2VX7A 1B3XA 3FHQA 5I5RA 1JZ2A 3G6MA 1Z32X 5FD0A 3N11A 1HIZA 1KR1A 3BAXA 1F4AA 4CCDA 3TP4A 2VZTA 3SURA 2BY2A 1VRXA 3OGVA 2CERA 1R86A 5JBDA 3QGVA 4ZXLA 4IPLA 2O9PA 4JKMA 2D0HA 2XGBA 2ZWYA 3VIGA 1OBAA 1JYXA 3ZMRA 4J3TA 1BAGA 1WDQA 1W32A 3VGEA 3B9EA 2HVMA 4HOWA 5E70A 4JL1A 3ZR5A 5I24A 5AC5A 3OG2A 1QOXA 2QPSA 4W93A 1J0YA 2WYSA 3VINA 2GK1A 1MWOA 1V6XA 1XYZA 1QBBA 3VVGA 5A8MA 5A6JA 2ZUSA 2WW5A 4M29A 2J75A 1QNPA 1V6YA 3TTYA 5F7UA 4BQ2A 4FLQA 4AD1A 3ZJ8A 4Q7NA 5FCZA 1C8QA 1XYFA 3SCQA 4Z2LA 1PX3A 2FGZA 2WSKA 1ISYA 2E8YA 3AHTA 3L4YA 2JIEA 4DM2A 5EFFA 1G01A 2XVPA 2E0PA 3AS2A 1UQYA 4HMCA 2G3IA 2WVSA 4M24A 5ABGA 3MSDA 2D0GA 3NJ3A 4V2XA 2ZXDA 2VX6A 2ZWZA 4D72A 1SMDA 2EEXA 1UWRA 1H0GA 4KWUA 1JD7A 3BGAA 5A6MA 1QW9A 1QHPA 2Y8VA 2VL4A 4KH2A 3M7SA 1V3MA 1QI2A 1TVNA 2XYLA 3ARWA 3JUGA 4TVDA 4PMDA 2E9BA 4W7WA 2CKRA 3SUSA 3VU2A 2VVSA 1SR0A 2QMKA 1VEPA 3TA9A 1EQPA 1MW2A 2VZVA 4X0NA 5A8NA 2D2OA 4UQAA 5CLTA 5HPCA 1E6SM 5KZ6A 2WLYA 3MO4A 2WMFA 1GQKA 1KXVA 1UKTA 1NH6A 3ZO9A 1L8NA 1PZ3A 2PF0A 4H8UA 3F4VA 1Q6DA 2Z1SA 4PCSA 3EMZA 2VRKA 1LF1A 4UQEA 3BAYA 1IV8A 1R7OA 5EMYA 2JF7A 2Z1KA 1O7AA 2PWDA 1JZ5A 3VNYA 1UR1A 3ZSSA 1WNOA 2PWFA 1UKOA 2J8FA 1Q6EA 1GOMA 1CLXA 1UR0A 3B9AA 4AD4A 3A6OA 3VDBA 2MANA 4MADA 7CGTA 2YBTA 1UD3A 2EPLX 1TR1A 2ZX6A 4D1IA 3K8MA 1BLIA 2ZUMA 2C0HA 2CBUA 2YOCA 3AFBA 3L2LA 4UZUA 3FHAA 1LJYA 1BHGA 4PMVA 2XUCA 1JZ6A 4NRSA 3ZJKA 4HA3A 3IK2A 2FHBA 1MVYA 3IJ7A 5A2CA 1KBBA 3ZIZA 3WQ4A 4AZCB 3QHNA 2CYGA 1UD6A 2W67A 1JXKA 3CHFA 1XSJA 2WB5A 4W8AA 5EB8A 4UFMA 5I0DA 3ARQA 4S3JA 5BWFA 1GNXA 3AIUA 3GXIA 3BXWA 4D6DA 1PIGA 3BCFA 1HF6A 4JL2A 2CKSA 4BCEA 2JEPA 4HU0A 1PBGA 5I23A 2EJ1A 3VIMA 3K4DA 1SMAA 2ZUVA 3AS3A 3CUIA 1CIUA 1EDQA 4JZ5A 4MDOA 1G9HA 4W88A 2AOSA 2WSPA 3PZUA 3AXXA 2QLYA 4P8VA 3PTKA 3BLPX 4HU8A 3VKKA 4E4PA 5DO8A 1FA2A 4EANA 1VF8A 3BC9A 2CESA 3KEHA 4A3YA 4QFUA 4QCEA 5A6KA 2VZOA 3T0AA 4W87A 1QBAA 2WPGA 2XSBA 3VD5A 1PJ9A 2XJ7A 4CN4A 3W26A 1TMQA 1J01A 1UG6A 1ESWA 2WC4A 4M81A 3CHEA 1CXHA 3WMCA 1HP4A 3AHVA 4JFTA 1GQJA 2F8QA 2BVTA 3WEOA 1RP9A 3MUY1 2XWEA 3EMCA 1R85A 1ISXA 3U7BA 1QNOA 5E09A 1FP8A 1NWRA 1QHOA 1J0HA 1UKPA 3BAWA 3CUHA 3E1F1 1V6VA 2G8ZA 2CHOA 4OIFA 3CO4A 2J7FA 3SCOA 1GHRA 1F4HA 4H7VA 1CNVA 2WM0A 2PWGA 3OLIA 2WNWA 3F5KA 1CGTA 3WQ6A 1GW1A 3O9NA 2YLLA 3D3AA 1CPUA 1FP9A 3VX1A 2JEQA 4J28A 3OZOA 4WLCA 1GQIA 3A4AA 4Y7EA 4UFJA 1EA9C 3MSGA 1CDGA 2YDQA 2VI0A 3OLDA 1B3WA 1EOKA 1GJWA 4GO8A 3WFLA 3CMJA 3SUWA 3WH6A 1HJQA 4AD0A 2YA0A 2E8ZA 1W1VA 4MNMA 2DSKA 3ZOAA 5DMYA 1W9XA 3VMPA 3WIJA 1B3ZA 2ZIDA 3MANA 1QPKA 4D1JA 2YA1A 1OT2A 3WELA 3APGA 1BVNP 2W61A 4XZBA 1SFSA 3BAKA 1E4IA 5I78A 3CZ8A 3BMVA 1MQRA 2GDVA 1VEMA 2PBOA 4JHZA 1LWJA 2VNCA 3KWXA 1EO5A 4Z2KA 1ISZA 1TVPA 2J7HA 3B9DA 1IZJA 1J18A 4GINA 3NDZA 2WC7A 3AYSA 1ZBWA 3PZIA 1WPCA 3AS0A 5ABFA 1JZ3A 3AZRA 3AIBA 1UD4A 1CXLA 3VIIA 2WZHA 5A6AA 4AZIA 3VIKA 1GOWA 2VQUA 1OM0A 1WP6A 1XV8A 3CMGA 4BZYA 2Y2WA 4W7VA 1NWSA 1XC6A 1V0KA 3PTQA 1A3HA 2BFGA 2W92A 2EBNA 1V03A 3VIOA 2CITA 4AZBA 2GK1B 1JFXA 1HJSA 3ZJ6A 4HMEA 1ISWA 1W1TA 1H1NA 2WHMA 2AAAA 4U3AA 3QHOA 2WCAA 1V0LA 4GZEA 1HJVA 5CG0A 1OCQA 3ZSTA 4CVWA 2BY3A 4H04A 2WBGA 2G3NA 2VMFA 4UQ9A 1UZ1A 2ZXQA 4CD4A 2UY5A 4XZWA 1E72M 4U5IA 4CU6A 1JZ4A 3ZT6A 3WQ5A 1U30A 1CGYA 2WAGA 3RJYA 3ALGA 4NSBA 4JKKA 4X0VA 2WHJA 4A3HA 3CIVA 4B3LA 2BY1A 1OINA 4WJXA 5D8ZA 4JFWA 1KGWA 3PZQA 2UY4A 4ZENA 2NSXA 1VENA 1W1YA 2WKLA 3M6DA 2YL5A 2GJPA 3WF0A 2GSJA 2QPUA 1BYAA 4HTYA 3CUGA 1ED7A 1B30A 3FAXA 4TXEA 2WWDA 2D1ZA 4Q22A 1UWIA 2V3GA 1XCWA 3GH5A 1QNQA 1VFOA 3AQUA 2XG9A 4WIWA 3AHZA 3AMDA 3CGTA 1X1NA 1FHDA 2PB1A 1WZMA 4OKDA 5I79A 4PN2A 4UQDA 1W9DM 5A6LA 4C7DA 9CGTA 1UWSA 4W5ZA 3WN6A 2B31A 5E9AA 1J0ZA 2XPKA 4U2ZA 4BA0A 2W66A 3LPGA 1WE5A 3CZEA 3AYRA 4LYRA 1ZL1A 1CYGA 2ESCA 1OIFA 1NARA 1CZ1A 3DYOA 3WH5A 3MUIA 1VIWA 3CZJA 2V5DA 2IXVA 1EGZA 2G3MA 3WH8A 4ZXOA 3WNNA 2XIBA 1XD0A 4H2CA 1K9DA 4LYPA 1UD8A 4U33A 1W2VA 3ARTA 2QMJA 2G3JA 4D6IA 4M8UA 1AQHA 3VMNA 1XSKA 4ATDA 3PZMA 4XX6A 4L4PA 1AIWA 4IM4A 2JF6A 1OGGA 4CU8A 3PZ9A 1UH4A 5HBFA 3N15A 1VFMA 1CWYA 4LGXA 5BRPA 5FL1A 1GHSA 4P7QA 2WVVA 2VR5A 3GZAA 1JZ8A 4GO9A 4C7GA 3POHA 3W6LA 4S3KA 3MMDA 4FLSA 1XH1A 1OIMA 5GNZA 1W9VA 2W62A 4ZEPA 3EDEA 1E71M 4UFHA 1GCYA 1NOWA 1TA3A 1B31A 3WUBA 4N42A 2DIEA 3KL5A 3T09A 1HKKA 1KXHA 2F61A 1I1WA 5EBAA 3MMWA 2J7EA 3GH4A 3UESA 3WD1A 1ZU8A 1K9FA 4R5EA 4HOXA 3HU7A 1UH3A 2VX4A 3I3EA 2WMIA 1PZ2A 4JHOA 1WZLA 1H0IA 3GM8A 3AIRA 2YL6A 1H41A 1OD0A 2FGLA 4PEEA 4HPGA 2EPMX 1E5JA 3AIEA 3AZSA 1R8LA 5A6BD 2Y8KA 3ZQ9A 3N12A 2ZX7A 1E6RA 1VEOA 1J12A 1XD1A 3HMCA 2PWHA 1NOUA 4J3UA 2W91A 1UA3A 1V02E 5IFPA 1E43A 3F5JA 5DFAA 1UR2A 4NI3A 5I77A 1CBGA 3CLWA 1NWTA 2J78A 7A3HA 5LA0A 1V6UA 3CUFA 4PCTA 3WDQA 4D6CA 3WQVA 1M7XA 1MW3A 2WWCA 4U5KA 3VUPA 1PPIA 4UOQA 3UR8A 3II1A 3ARUA 4AEEA 2VRJA 1KGUA 3CHCA 1C90A 3WNMA 1FH7A 4W86A 1CXFA 2O9OA 2EPKX 5M3WA 1JAEA 4KRTA 2YA2A 1Q6FA 2ZXBA 2X05A 3CHDA 2VUYA 3EBVA 3A4XA 3DC0A 2D24A 2VURA 2WHLA 4CN1A 3SCWA 4GKLA 5E6YA 1LL6A 1X6NA 4IISA 3WDRA 3OLGA 3WDIA 1KQZA 4PTVA 1UD5A 3ARPA 1E6XM 3NYDA 2D3NA 2DH2A 3CUJA 4YN5A 3VM7A 4DWSA 2C7FA 2YDSA 1HT6A 4HZ7A 2J7GA 4MAZA 1K9EA 3AIWA 3SCUA 1QNRA 4MNJA 4GI6A 1C92A 1TG7A 2BXZA 3FW6A 4DWSC 3U5UA 1JIBA 1W9UA 3WQWA 3UEQA 3VM5A 4PTMA 3AISA 1I1XA 1V3IA 2BNJA 3MV11 5KEZA 3BAIA 4CUCA 1D3CA 3UETA 1G1YA 3O2LA 3VDHA 1M01A 3W4RA 2NT0A 1UR9A 2W5FA 2TAAA 6A3HA 1V6WA 3K1DA 1OB0A 4AWEA 3N1AA 1WKYA 5DF0A 3A3HA 3EDJA 2W63A 5AYBA 2WC3A 2GJXA 1DP0A 2VCAA 4DUVA 3VIHA 3VIPA 3BCDA 4Z2HA 4W5UA 1UOKA 5A94A 4KMQA 3AMLA 4DUXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4XVE A;  8CGT A;  2E5C A;  1FWD C;  5E0F A;  1HL8 A;  1R7A A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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