4Z2IA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 30
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 162
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2iA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2iA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2iA01
4DWSD 2W92A 4L4PA 1MW3A 1XSKA 1JF5A 3TP4A 2VX4A 5HOSA 3CHDA 1W3KA 1FFQA 2ZUSA 5BXPA 4AMCA 3PZQA 4JHZA 4M82A 2PWGA 1CXEA 2CHNA 3GH4A 1V6XA 1UD4A 2X1IA 3AFBA 3POCA 5CSUA 1TZ7A 3SCSA 7TAAA 4HU8A 1CLXA 1M03A 3AIWA 2D49A 3WD3A 1W2PA 1ECEA 2WPGA 3EDEA 4E2OA 5C70A 3ZIZA 1GJUA 3VNZA 1CLVA 2ZUVA 4M1RA 1J0ZA 3K4DA 1C3FA 2E0PA 1PZ2A 1HKKA 1BF2A 2ZX9A 3O6AA 5IFTA 1CBGA 1Z32X 5CLTA 2WCAA 2BY3A 3VOCA 1KCLA 2HVMA 1YHTA 5ABGA 5A2BA 2JF7A 3J7HA 1UR0A 2J7GA 4GQRA 1HT6A 2FHBA 3UEQA 1X6NA 4PCSA 4GIAA 3CBWA 4PSPA 1EIBA 3W6MA 3ARUA 3W29A 2MANA 2VNCA 3WNMA 1H4PA 4CCDA 5A2CA 4WKFA 2WAGA 1HXJA 2D22A 4TVDA 4XB3A 1L0PA 3CIVA 2ZWZA 3MSDA 4AZGA 2G3NA 5A69A 4PRWA 2GJPA 3DYPA 3L4YA 1HIZA 4P7LA 3ALGA 4HA4A 3MV01 5I23A 3RM8A 2CBUA 2ZUUA 3LPFA 4AD5A 5KZ6A 3APGA 3BCFA 4AEEA 2YA1A 4HZ7A 4LGXA 1GJWA 4HZ8A 2UWFA 5A6LA 1E0VA 2XSBA 1OWQA 3T2QA 3UR8A 1PIFA 5A3HA 4UFJA 2VZSA 2YDSA 3BAWA 4GXPA 2OYMA 2Z1SA 1H09A 3CMGA 1D7FA 5A6MA 4XUYA 4W87A 1HJUA 1EQCA 2QF8A 1E6SM 4JFVA 1MFVA 2CCRA 1Q6EA 1KGWA 5AYBA 1JF6A 3RJXA 4CVWA 4ATWA 3BGAA 1DHKA 1J9YA 2DIEA 3ZJ8A 3CO4A 4JCMA 4TXEA 4GZIA 3K8MA 1E6XM 1V6WA 3OLGA 5BRQA 4P7QA 1WZLA 4UNIA 2AOSA 2WSKA 1MW0A 4UOJA 5DT5A 3VUPA 1CNVA 2YBUA 2EBNA 3DC0A 2WLZA 1QBAA 2PC8A 1V6UA 4TX6A 1QNSA 4D6DA 3VILA 4V2XA 1ODUA 1O6IA 1CWYA 2IXVA 2VCAA 5BWFA 5DFAA 1M7XA 4PMUA 3WY1A 3NIYA 2WMIA 1B9ZA 4CU6A 2ESCA 1B31A 1GOKA 5E0FA 4NSBA 2XSAA 4CD4A 2VJXA 2V3DA 5M03A 2UY4A 1IT0A 4A3YA 3WELA 3B9EA 2WLYA 1W1YA 1C7TA 1QNPA 4J3VA 2J7DA 2FGLA 3MU7A 2WXDM 3GH7A 4OBSA 4Z2LA 2D23A 4Z2HA 4AISA 4R27A 1W9PA 4WF7A 1HP5A 2NSXA 2E8YA 1E4LA 1LQ0A 3PBGA 4WK9A 5I5RA 3W6LA 1V03A 1BYCA 1CPUA 1UUQA 3L4TA 3VD9A 1I1WA 4HPGA 1ZBVA 1QOXA 4RE2A 3VGDA 5A6KA 4NRRA 1E0XA 3OG2A 3ARWA 5A1AA 1DP0A 1H3GA 1M04A 2DSWA 3IJ9A 2O9PA 3W26A 5KEZA 4BQ3A 1JDCA 1GOQA 1LJYA 2XYLA 1UKQA 3F5JA 5AYIA 5HBFA 1WDQA 3OZPA 3FN9A 4OBRA 4L4OA 1EHNA 1QHZA 1ISZA 1FH9A 3CMJA 7A3HA 3VTRA 1H0GA 1B3XA 3LPOA 4TTGA 1V6YA 4FMVA 4JCLA 4PEEA 1BG9A 1KBKA 3ARZA 2J8GA 4PN2A 3RM4A 3M46A 3WQ6A 3AS2A 3CZ8A 1KQYA 1UR1A 2WMGA 4HOWA 4UFIA 1NM9A 1DWFM 4P8VA 9CGTA 4YHEA 2XG9A 4CU8A 3F5LA 1UYQA 2BHYA 3CUIA 4LX4A 1Q6CA 2D3LA 4ZE5A 2ZUTA 3UETA 5HNNA 4S3JA 2WWDA 3TOPA 4ACZB 1JZ7A 1VFMA 1VEMA 2WNWA 3N9KA 1E3ZA 5EB8A 4U5KA 3T0BA 1OGGA 3TTOA 1US3A 3A4AA 3WQWA 3WQ4A 4PMVA 4D71A 5CGMA 2Y8KA 1V3KA 1JGIA 3VMOA 4U33A 5D9MA 2VR4A 1X6LA 1ITCA 3OLEA 2CNCA 4CU7A 5IDIA 1XGZA 1QI0A 4P7NA 3NCOA 4GI6A 2BXZA 3WMCA 3WH8A 2BFGA 3CH9A 3GXIA 1A47A 1C90A 1BGAA 5BRPA 1R85A 3DYOA 1M01A 4UZSA 1E71M 2J62A 2OSXA 4GZJA 1E70M 5FOOA 1QW9A 1GONA 3L2MA 3GXDA 2AMGA 3EBVA 2E40A 5CGTA 2PWEA 1DWAM 3PZVA 1GVYA 3AIUA 4NZCA 1V3JA 3MANA 5A6SA 2VCBA 4UQCA 1EGZA 2NW0A 3AHTA 3A47A 2CIPA 4V27A 4JL1A 5EFDA 1UWIA 1JIBA 3VIPA 1JXKA 3WH6A 2VT0A 2ZICA 3ZSTA 1BTCA 3IK2A 3AIBA 3WDRA 4PTWA 1PIGA 2D1ZA 3GXMA 3WNLA 1NP0A 4JFSA 3K8KA 1UZ4A 1CGUA 3GNRA 1ZBCA 1BAGA 3VKKA 3WUBA 1QI5A 7CGTA 1JL8A 2YDRA 4CD5A 3MUIA 1IV8A 4B9YA 4F66A 3BSGA 4CGTA 3BC9A 5CG0A 1KXQA 2WCSA 4AZCA 4U5IA 2PBGA 4UOQA 8A3HA 5IXEA 3D3AA 1UQYA 3SUTA 1JYNA 1GNXA 4PCTA 1UH3A 2X09A 1XD0A 2WM0A 1CXIA 1QVBA 3AMDA 5I77A 3KL5A 1UR9A 1W9DM 4IUGA 2E4TA 3IJ8A 5EBAA 2ZIDA 4UR9A 3EMCA 5GNYA 4PMOA 2RGLA 5AC5A 2V5CA 1UA7A 1KR1A 3OGRA 1K9EA 1ZS2A 3AICA 5IHRA 1E4IA 3VPLA 1VF8A 1A3HA 1UD5A 1TA3A 2HISA 4Z2KA 1GCYA 3SEPA 2DSKA 3GNOA 3AHZA 1B1YA 3SCUA 2VZUA 3ARXA 4F9JA 1QNQA 2GK1A 2X05A 2YL8A 1UH4A 5E70A 3N18A 3QHNA 4ML4A 3CHCA 1UKTA 4E8CA 1DEDA 4Q22A 4D72A 3WF2A 3POHA 1PEZA 3VIOA 4AZ6A 1OT1A 2XVPA 1MXDA 3VGHA 4AZ5A 1EXPA 1WP6A 3OGVA 3GXFA 5A94A 2DQXA 3OLDA 2ZXAA 3W37A 2J7FA 1CXHA 3WUEA 2OWWA 1EDGA 2WMJA 6CGTA 3WNNA 1LF1A 4LPCA 3B9DA 3VMNA 1EO7A 5CPQA 3AI0A 3ZM8A 4IISA 1W3LA 1QI3A 1BLIA 3DYMA 1EHAA 4DWSC 2XUCA 4UFMA 3SCQA 4C7FA 3NSMA 4ATDA 1XH1A 1VB9A 2VX6A 5LA0A 3TTQA 3ARSA 2WMKA 1CTNA 4JKKA 2GSJA 4XZBA 5E9AA 3AS3A 1HVXA 5A8MA 1EDTA 2OYKA 5FIPA 1B3YA 3W38A 4CD8A 1KWGA 3FY1A 1Y7VA 2B31A 3EMZA 3L4ZA 4U3AA 2D0HA 3WMBA 2DT3A 2TAAA 3CZGA 1VEOA 2CXGA 1V3IA 4JFTA 3G6MA 5CLWA 1B3ZA 3VIIA 2G3MA 2D2OA 1OIFA 4J3SA 2V3EA 1B3WA 2CBJA 3N13A 2WC7A 1WAWA 3UG5A 2A3EA 3PZGA 2EPLX 1F4AA 1JAKA 3VDAA 2CBIA 2XVGA 2WKGA 5JH8A 3M6DA 4CKQA 4MDOA 3RM9A 4WSJA 3L2LA 3QHMA 2DIJA 1AIWA 4AWEA 2WVVB 3UR7A 4W5UA 2GJXA 4U2YA 4H7VA 1E73M 1HKMA 4EANA 2BXYA 4M24A 1V0KA 4P8UA 1WDSA 3VDCA 4QCFA 1H1NA 1K6AA 4RL3A 1ESWA 2F2HA 1HL8A 2WHKA 4BA0A 2OWCA 1XCXA 3WEMA 2G41A 3N11A 2YJQA 1WNOA 3AS1A 3UG4A 1J0KA 3WF3A 1AVAA 1E4MM 3WF0A 3GDBA 3RILA 2VQTA 3RIKA 2J7EA 2QPSA 4TVUA 5FL1A 3EDKA 3AHVA 2JALA 4YPJA 2DSZA 1GOOA 3MMDA 1TUXA 2VX7A 2PBOA 3M07A 1GW1A 1KGXA 3PHAA 1VJSA 1B2YA 1HF6A 4CUCA 2OSWA 1OGSA 2WBKA 3IJ7A 1OINA 2DT2A 1TVPA 1WE5A 4IM4A 3N1AA 1BFNA 3SUWA 3VGFA 1W3HA 3TTYA 1JNDA 2XWEA 1UD3A 1GHSA 3I3DA 1BYBA 3PZIA 5I0DA 5BXTA 1HP4A 4AD1A 5LA1A 1XC6A 1UWQA 3ARTA 3CZLA 4Q7NA 4HA1A 1PPIA 2YA2A 4ZEPA 3THDA 1J0YA 3WUFA 3W25A 4C7GA 2ZWYA 4TOQA 2E9LA 3GTNA 3F5KA 3MO4A 5I78A 1GZJA 1B3VA 2JIWA 3IAQA 4UQDA 1FA2A 1S46A 2C0HA 2O9RA 4QFUA 6A3HA 4PMRA 2VRKA 1UOKA 5HXMA 1W1VA 1C8XA 5ABEA 1Q6GA 2CKRA 2YL9A 3BMWA 3OA5A 5GNXA 3O2LA 5M5DA 1J0JA 4NI3A 2ZOXA 5BXRA 3ARYA 2JEPA 1ZBWA 2VUYA 1VEPA 3WBEA 1LG1A 3WDJA 2Y8VA 2BY0A 4J3XA 3W0KA 1W91A 3EDJA 3U5UA 1UHVA 2ZE0A 3PZTA 4GKLA 4BZYA 1HJXA 1H49A 2ZUMA 1DTUA 4MDPA 1DWGM 1VAHA 2G4FA 1TR1A 2G3IA 4GO8A 1H41A 3PZOA 5BYWA 1BSIA 2VR5A 4AIUA 4EE9A 2WWCA 4HMEA 5ABFB 1D2KA 3AMCA 3L4WA 3SUSA 3KWXA 3VIFA 4PMZA 3RPMA 2EXOA 1U33A 1UWSA 1XH0A 1R86A 3VD5A 1CXLA 5CPTA 1GHRA 2UY2A 1K9FA 3LPGA 2W61A 4PBGA 4KRUA 4W8BA 1C91A 5CJ5A 1ZL1A 1NWSA 2CHOA 3ARRA 5F7UA 2D24A 1JI1A 1OSEA 4QAWA 3T2PA 4CD7A 4TX8A 4R5EA 2J25A 4FLQA 4HP5A 1WZKA 1JG9A 1AQ0A 8CGTA 4F79A 2YLAA 1ZJAA 3K4AA 4UQEA 1J12A 3IANA 1MXGA 3BH4A 4N0RA 3TA9A 3WENA 1UD2A 2PWDA 5A6JA 3BSHA 1UG6A 2ZX7A 2GJRA 3AZRA 5CQ1A 2YDQA 3CPUA 4W5ZA 4OJYA 2PB1A 4M56A 2VVSA 4RE4A 1J0HA 1JYVA 3WEZA 2OLHA 4AZ7A 3M7SA 1PX8A 3TONA 1TVNA 1KXTA 3WDIA 1SFSA 2WANA 1JAEA 4JAWA 1CYGA 1JD7A 4WLCA 2BS9A 3VMPA 5D9PA 3SCVA 3WQVA 4ZE4A 1V0LA 4H8HA 3LMYA 3NUKA 2W63A 2QHAA 3MS8A 2YOCA 2J74A 2ZXQA 3AIRA 1SMAA 4OOZA 2QV4A 1HKJA 2W4XA 2WSPA 1ZU8A 3OLIA 2EPKX 3B9AA 3QOKA 1AQMA 3N04A 3ZMRA 2JEQA 1LWJA 4UQBA 4MNLA 3EDFA 2XPKA 1WDRA 3N15A 1XYFA 5FCZA 1AQHA 4MAVA 1BVNP 1JZ8A 5M17A 4ATLA 1EA9C 5C8BB 1UR8A 2AAAA 1LL7A 3W24A 1ZJBA 4B16A 3S6TA 1B0IA 4MB3A 2PWFA 1UH2A 2DSUA 1OIMA 3CZKA 1KFWA 4UQ9A 1HJSA 1GOWA 1JDDA 1R7OA 3WFZA 3WUGA 4CCEA 2F61A 4D1JA 3AMKA 1HJWA 2DH2A 1CZ1A 2XGBA 3RMEA 4W85A 2VMFA 3VX0A 3ZJ7A 4CD6A 2A3CA 1K9TA 4LXFA 3WN6A 4E4PA 1RP8A 1FHDA 1W1TA 4D6FA 4W7VA 1CENA 4W84A 1PJ9A 2WVTA 2VI0A 2Q8XA 5ECUA 4NF7A 2ZXDA 4BCEA 3UCQA 2WHMA 4W7WA 3WD0A 1EOKA 2WBGA 1WO2A 1MQPA 5ABHA 2XTKA 3LPPA 2CPUA 1MYRA 3S2CA 4OUEA 4GI8A 2CETA 5D8ZA 1O7AA 4U3CA 5FKYA 3ZR6A 4TUFA 2VZOA 3WF1A 4MJ4A 1JZ5A 5HPCA 4PSRA 3WDQA 1E43A 1WKYA 5JBDA 4FLOA 1I75A 4AYSA 3DECA 2WB5A 2FHCA 1HJVA 1UR4A 4B3KA 2RTSA 4FF5A 3GBEA 2XWDA 4W86A 5ABFA 3L4XA 2OSYA 4EK7A 2V5DA 4J27A 3BCDA 1W9UA 1JZ3A 3A3HA 3W82A 3HJEA 4P7RA 5CZKA 3PTKA 1QHOA 1DWHM 3AMLA 1UR2A 5A6AA 4H2CA 4JFWA 1J11A 2XGIA 4D6CA 3WD2A 1V02E 4H41A 3VIHA 2XIBA 3ARPA 1XCWA 1BQCA 3A6OA 4E8DA 3NSNA 2JF6A 3N12A 1Q6DA 3WNOA 4D6EA 3BLKA 4QCEA 2CYGA 5A2AA 1H2JA 1BHGA 1HVQA 4MAZA 2G8ZA 3AMGA 2XFFA 3VGGA 2DT1A 3GZAA 5I24A 3OZOA 4Z2GA 2QPUA 4PMNA 5TD4A 3U7VA 3NDYA 1WCGA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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