4Z2JA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 31
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2jA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2jA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2jA01
1QBAA 3HJEA 3AMDA 2W92A 1E72M 3L4TA 1UKQA 4DWSA 2E40A 3EDDA 2UY2A 1DWFM 3OLDA 4TVCA 2XVGA 2BY3A 3MUIA 5A69A 1WCGA 1H2JA 1C3FA 4FMVA 1ZS2A 2JEQA 4V2XA 1PX8A 3ZT6A 2BV9A 4MB3A 1QNQA 1PPIA 1WDRA 4HZ6A 3QHMA 3VD4A 4P8UA 1CLVA 4ATDA 1QI5A 2DIEA 4Z2GA 4OBRA 3PZTA 4Z2IA 1FA2A 1GNXA 2XFRA 1JI2A 3PTQA 3M7SA 3WQ4A 4OUEA 1JZ2A 1L8NA 1E55A 3WFZA 4D6EA 1JL8A 1PZ2A 1XSJA 2EO7A 3F5LA 3T0DA 1MW3A 3A4WA 1UKSA 3ARQA 3WIJA 4XZBA 3TONA 3VD9A 1HVQA 3MV01 1N82A 2TAAA 2WHMA 1ESWA 3AISA 4AD2A 1JDDA 1E4MM 2D49A 2AAAA 2RTSA 3ZT5A 1E0VA 1AQ0A 3WL0A 4D72A 2WW5A 2ZXDA 3CZJA 3PZUA 4CD7A 5M03A 1S46A 3VGHA 4WKHA 4ZXOA 4ATLA 3L4ZA 1ISYA 2YKKA 5EFDA 4ACYA 1ZB5A 3W4RA 2WHLA 4CN1A 4AZ7A 4Z2LA 3SCTA 2WWCA 1H11A 3CGTA 2QPUA 2BVYA 1OB0A 1P6WA 4LYQA 5GPRA 2V3FA 4HZ8A 2GK1B 1EA9C 1MWOA 2DT3A 4V28A 5IFTA 4JFTA 2DSVA 3AS1A 1CXKA 4GPNA 1B3VA 2YJQA 3AIRA 4H8VA 1IT0A 1JYWA 1BQCA 4JKMA 4YHGA 4UQEA 1WO2A 1GCYA 2E8YA 1BYCA 2WVVA 4XUYA 1GORA 4PN2A 2QHAA 2E3ZA 5A8QA 3CUJA 5BRPA 4TOQA 1VFUA 4CU6A 4AZIA 5JBEA 2V38A 5E0CA 3WF2A 1KWKA 4RE3A 6CGTA 3WF1A 3UERA 1UHVA 1CENA 3VMPA 2CBVA 5CQ1A 5E9AA 1BFNA 4OOUA 4F66A 7A3HA 1V0MA 3BAKA 4JIEA 3OLGA 3OLIA 3W38A 5FOOA 4URIA 2J7BA 4M80A 5DFAA 3IJ8A 2VCBA 2YDRA 2XVKA 4JHZA 5CLWA 1XD1A 3CBWA 4AYSA 5A6BD 2E4TA 3BC9A 4TXEA 1MVYA 1HJUA 4UFHA 2OLHA 1W9VA 3AQUA 1J01A 4PTVA 1E6ZA 3VIPA 4K68A 3LPPA 2YA1A 2UY3A 3EMQA 2O9OA 3G6LA 3EBVA 1NWSA 2YDQA 3BAIA 3AYSA 1VFOA 3PZOA 1HF6A 4GZIA 3ZJ7A 1W1VA 5KZ6A 2VCAA 3AHTA 1OD0A 1UZ1A 2W66A 1QI0A 2OSXA 2A3HA 2IXUA 1D2KA 5AYBA 4P7LA 1MXDA 2J7GA 3KEHA 2VC9A 5HBFA 3TTQA 1UWUA 2ZWZA 5DMYA 2NW0A 3U5UA 1LL4A 4GKLA 1GONA 4CCCA 1UKPA 2YBUA 2QMJA 1C92A 5IFPA 5GNYA 1W91A 3W37A 4C7FA 1E71M 1HJQA 4Z2HA 3RJXA 4LXFA 3T2OA 2AMGA 1U2YA 3AHZA 1ISXA 3KL5A 3SCWA 4U2ZA 1H0IA 5EB8A 2EPOA 9CGTA 4MAZA 4CN4A 3D3AA 2ZUVA 4UCFA 4D6DA 4U31A 2WC4A 2VT0A 1VEPA 5IDIA 2EPNA 3TOPA 3W27A 2XVNA 4PRWA 2BY0A 1ITCA 1KXHA 1KGUA 3FY1A 3W0KA 1ITXA 3AIVA 3WQVA 3A47A 2BY1A 1XHGA 1IZJA 1HIZA 3JUGA 3LPGA 1GPFA 3AFBA 3BAJA 1C91A 5GNZA 1M01A 2YBTA 1X1NA 2J74A 1UQZA 3MMUA 1KGXA 2O9RA 2D0FA 3IJ7A 2WBGA 2FH8A 5ABFA 1EO7A 3AOFA 2WK2A 2A3BA 2D0GA 3ZSSA 2BNJA 3WMSA 2F2HA 3EDEA 2Y24A 2JFEX 3T0BA 1LF1A 2D0HA 4QLKA 4HPHA 5A6JA 2ZE0A 4QP0A 4CCDA 1VFMA 5C71A 4P8VA 4KRUA 1EXPA 4WJXA 2V3EA 4AMCA 3DYPA 1H0GA 1MW2A 4QLLA 3VILA 2WMIA 1OGGA 4KMQA 2CBJA 5D9PA 3WUFA 4W85A 4XZWA 2NSXA 3NSMA 1JD7A 1LJYA 4UFLA 4W7VA 4AXNA 1E9LA 3WF0A 2G41A 2J77A 3M6DA 5HOSA 2VX4A 5E0FA 3ZIZA 5DF0A 6A3HA 4QAWA 2A3AA 4PMOA 3VNYA 3VUPA 1OIMA 4UQBA 2E0PA 3ARPA 1JZ6A 2XSBA 1G94A 3VMOA 2Z1KA 2V3GA 5AYIA 4UOZA 2ZX7A 3GXMA 5E70A 1PX3A 4AZCA 1FP8A 1KR1A 4AD3A 2WCSA 2BY2A 1UD5A 4B9YA 1DEDA 4ZFMA 4OJYA 3WEZA 5BXTA 3EMCA 2EQDA 2ZX5A 2X8RA 4CGTA 4F79A 3F5KA 1NWUA 5CJ5A 4QCEA 5FD0A 2WVTA 1E70M 2YIHA 4JFUA 5ABEA 1HKIA 1ZBKA 4JKKA 1UD4A 3AHYA 4A4AA 1GJUA 1V08A 5JUVA 1QOXA 1UD8A 2J7EA 2JIEA 5A6AA 1GUVA 1OGBA 1DWIM 5ABGA 1V3MA 1W9XA 3LPFA 4C7GA 2J7FA 2OYKA 1V3JA 1CXHA 2EPLX 1ED7A 4NF7A 4AIOA 1KXVA 1J0KA 5HXMA 5A2AA 2VTFA 3BAYA 3U5YA 1QPKA 4OZOA 1E0WA 2ZWYA 3AMKA 3ALGA 3GYCA 1JFXA 2Y8KA 1VBUA 5A1AA 2C8NA 5I2UA 1HJXA 5F7UA 1YHTA 1QNPA 5M17A 1M04A 1KQYA 2CCRA 3GTNA 4PEEA 4X0NA 1JYVA 3L4WA 3MV11 1JZ7A 2XSAA 2XUCA 2YA2A 3VIJA 3AMCA 4BQ5A 1AVAA 4DM2A 4UFKA 4X0VA 3THCA 2ZXBA 4HOXA 3AS0A 3FW6A 2PWGA 4U33A 2WKGA 3WDPP 1UR1A 1Z32X 3AXHA 1HJSA 4CVWA 1CGWA 1RD6A 3KL0A 3POCA 2GDUA 4OKDA 3RM8A 5HDRA 3WNPA 1J0YA 4GQQA 2W61A 3A3HA 1R87A 1BVZA 4PUEA 1QHOA 4PSPA 4MDPA 2D22A 5M5DA 3SIMA 3B8SA 5LYRA 3VINA 2XM2A 1UWSA 3AYRA 5IHSA 4P7QA 2A3CA 2D23A 1VIWA 2IXVA 1CGVA 4PBGA 4Z2JA 4QDMA 3VMNA 2GVYA 4F9DA 3RCNA 2CNCA 4R5EA 3SCOA 5A8NA 4JZ5A 1JF5A 5AC4A 3ALFA 1GOWA 1NM9A 1VJZA 2FDMA 1JDCA 2UY5A 3CIVA 3SURA 3W25A 4CN6A 1US2A 4AISA 5BCAA 4WKFA 3CUIA 4AZ5A 1B1YA 1PJ9A 4HOZA 2XFYA 4W7UA 3IAPA 1UKTA 2VVSA 4J3UA 3WF3A 3N12A 1ZBVA 3WDHA 1CWYA 1QI4A 1UQYA 2X09A 4RE2A 3CH9A 4M56A 1W9DM 1FFQA 2DSKA 4M29A 1KWGA 4HMDA 3QOKA 1KGWA 2DQXA 3OGVA 1WP6A 1OINA 2GK1A 2QF8A 4KRTA 1EDGA 1R7AA 1E6XM 3BH4A 3VDBA 3E1F1 3FHQA 1BF2A 1Q6CA 4TVDA 5LA2A 2Y4SA 1YQ2A 3CMGA 4HTYA 7TAAA 4MNJA 3MSGA 1R86A 2Y5EA 2ZX9A 2DPEA 4IISA 1UR9A 2WMHA 2VQUA 4PMZA 1SMAA 4CKQA 5I0DA 2XPKA 3HN3A 4V27A 2ZIDA 6TAAA 4FF5A 3SCQA 3W82A 3OZOA 3FNDA 1OD8A 2VNCA 2XVLA 1D7FA 2E8ZA 2ZX6A 4WSJA 2D3LA 3CZGA 3RIKA 1JNEA 2NT0A 4MNLA 2VVNA 3W6LA 3WEOA 2ZX8A 3BCFA 3W28A 1WZAA 1FH8A 5D9OA 1WZKA 3I3EA 3U57A 4CUCA 2PC8A 1W1YA 4IM4A 1LQ0A 2MANA 2VZVA 2WVSA 1RH9A 4UTFA 1HX0A 5ECUA 3VDHA 3OG2A 1E4LA 1E40A 3QGVA 1E5NA 4Q22A 2WZEA 3L2MA 1TVNA 2VX6A 1KFWA 1EH9A 2WZIA 3SCSA 3RILA 3G6MA 4UOQA 1G0CA 1BG4A 2JF6A 1LG2A 1UA7A 5A8PA 2B31A 1FHDA 4P8XA 3DYOA 3PZVA 2GJXB 1RP9A 3GNPA 3A4XA 3ZO9A 2G4FA 2D3NA 1PZ3A 1J10A 2C7FA 4ZE4A 3PZQA 3OZPA 3ARYA 1GOMA 1QI2A 1V6VA 2ZUUA 1W1PA 3CO4A 1O7AA 4HA3A 5CSYA 3GBDA 1EOMA 4EK7A 1MW1A 1K9FA 1VEOA 1GVYA 2YLAA 1CGTA 3BLPX 3WELA 1BG9A 1E73M 3N13A 1KR0A 3CHFA 2VX5A 4TX8A 3GXFA 5FL0A 5E6YA 2CESA 3I3DA 3VVGA 4P7OA 4S3JA 2ZUTA 3ZJKA 3WFLA 4KGJA 3FXYA 4D1JA 1CIUA 2A3EA 1W3HA 2EPKX 4OOZA 4AD4A 4D6CA 5CLTA 4JFWA 4FLOA 3ZMRA 1XYZA 1W2VA 3APGA 2VZOA 3PZIA 2CBIA 4PMVA 5A94A 2YA0A 2V5CA 3U7BA 3ARUA 2PWEA 3O9NA 3F4VA 4HPGA 2EEXA 2PWDA 1JZ4A 2WC7A 3EDJA 1JD9A 1WZLA 3FAWA 1UWIA 1KB3A 2XVPA 3DHPA 1LL7A 4PSRA 1C8QA 1H3GA 3ZT7A 4J27A 1JYXA 4MJ4A 4U2YA 1KBBA 4MAVA 3VGGA 2AOSA 4AIUA 4EAMA 4LYRA 5M3WA 1XD0A 1US3A 3OGSA 1CYGA 3AZSA 4ACZA 2WLYA 3GZAA 3MO4A 3NSNA 4GXPA 1BGAA 3WUEA 5CGMA 4MADA 3SCNA 4J3TA 4FLQA 2ZUWA 3HMCA 3CZLA 4WSKA 2WCGA 1VRXA 1JZ3A 2JF7A 1J9YA 5A6MA 2OYLA 1QNRA 2W62A 2CERA 3GH4A 1X6NA 1K9DA 2WHJA 3WQ5A 3VM5A 2OWCA 3IANA 1IZKA 5FIPA 1VFFA 2BVDA 3WNLA 4C7DA 2F8QA 3T09A 5A2CA 1VAHA 3KL3A 1ISWA 4IPLA 1WPCA 2GUYA 4TX6A 3L4YA 1ISVA 2CKSA 1W3KA 4BCEA 2JALA 3CZEA 1M7XA 2WANA 3LPOA 4H04A 1L0PA 2D20A 1CXEA 1RPKA 1SMDA 2WPGA 3TTYA 2XTKA 3VDAA 2J7CA 1J18A 5E09A 1V0LA 2CITA 5HPOA 5FCZA 3WSUA 2X2YA 5KEZA 1EOKA 4HOWA 3AIQA 1JAKA 4MJ2A 3QHOA 4F8XA 2WXDM 4PCTA 4B3KA 1G1YA 4LQ1A 3PHAA 4Y7EA 4TTUA 3VD5A 1JNDA 2XGBA 4E2OA 2WVVB 5A6BA 1E6QM 5D9MA 5EFFA 4PYSA 4GI8A 1KBKA 5HPCA 1FH9A 3NIYA 5AC5A 4GINA 5HNNA 3SCRA 2FHBA 3IJ9A 3AMLA 5D9NA 2HISA 4D6IA 3ARZA 1ISZA 3N04A 4ZEPA 4LPCA 1BHGA 1GQIA 2O9TA 2V3DA 2GDVA 4FLRA 1CPUA 2OWXA 2FGZA 4LYPA 3BGAA 2FHFA 1WZMA 3SUWA 4J3SA 3WUBA 1EHAA 1UH4A 2DSZA 5C70A 5IHRA 5I3DA 2WBKA 1UR8A 4OIFA 1WKYA 1D3CA 3THDA 5FL1A 5CXPA 2GJRA 3S2CA 4WK9A 4PTWA 4W8BA 3OA5A 2J78A 5BXPA 1R85A 5DEZA 1E56A 5I78A 2ZICA 4J3XA 1DWJM 3VTRA 2J62A 4GZJA 4JFVA 1WE5A 1TFVA 3PN8A 4FK9A 4GIAA 2F61A 3WNOA 3AMGA 1UA3A 3MKKA 2G3NA 1E6RA 3ECQA 3CTTA 3EDFA 1H41A 4UFJA 1F4AA 4H7VA 1W9PA 4HZ7A 4EKJA 4AD5A 5BRQA 1AQMA 3PZGA 1C90A 2FGLA 2WCAA 1EDTA 2C0HA 1EGZA 4BQ4A 3AXIA 1NWTA 1GOOA 5TD4A 2WB5A 1XSKA 4H41A 3SUUA 1CGYA 3KWXA 2PWFA 3WNNA 1V02E 1M03A 2Z1SA 3ARTA 5CPSA 3SCUA 5JIPA 2CYGA 2XIBA 2WKLA 1OWQA 1U30A 1V02A 2QMKA 3T0AA 3K8LA 3VGFA 3HU7A 1CXIA 1Q6EA 4AW7A 1B30A 1ZL1A 3MANA 4PTXA 3WH5A 3WBAA 1MQRA 4GZEA 1HP5A 4IUGA 3I3BA 1E1FA 3WF4A 2RGLA 2CIPA 2WMFA 2BHUA 4YPJA 1XSIA 1ODUA 7CGTA 4W86A 2CPUA 4D6JA 1MXGA 2XGIA 2VX7A 2WZHA 1HNYA 3N1AA 4ML4A 1UZ4A 3VGBA 1GHSA 3PBGA 1JAEA 3WDIA 3AS2A 2X0HA 1JYNA 3DECA 1TA3B 2OWWA 1V0NA 5CG0A 2BHYA 5ABFB 3AIUA 1PIFA 1UH2A 5AY7A 3N11A 4AZGA 5I23A 1LL6A 3CMJA 5I77A 2FHCA 1OGSA 4ZE5A 1E43A 4GO8A 1JF6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1KQZ A;  3QHN A;  1Q6G A;  3ARV A;  2YL6 A;  2BHZ A;  4IPN B;  3NUK A;  1XV8 A;  5JBF A;  1B31 A;  2Y2W A;  1H09 A;  4JL2 A;  1E5J A;  2CBU A;  1KXQ A;  4MNM A;  4CVU A;  1CXL A;  3BLK A;  1OT1 A;  5JIW A;  1QW9 A;  5EMY A;  1PAM A;  4AWE A;  4NRR A;  5I6S A;  3DHU A;  3LMY A;  3K1D A;  4AEE A;  2J4G A;  2JIW A;  3BCD A;  4D1I A;  4S3K A;  3RJY A;  4AZB A;  2D24 A;  5CPQ A;  3WQ6 A;  3PTK A;  3AIC A;  3UR7 A;  1BLI A;  1QNS A;  1BYA A;  3KE0 A;  3WUG A;  4D6H A;  1K9T A;  3II1 A;  4NRS A;  2QPS A;  2YL8 A;  1ZJA A;  4GO9 A;  1GW1 A;  1XYF A;  1V3H A;  3ZJ8 A;  5C8B B;  4AZ6 A;  3U7V A;  2WM0 A;  5A3H A;  1E3X A;  3BAW A;  2VRK A;  3CUG A;  2VUR A;  5GNX A;  1CTN A;  1ZU8 A;  1E4I A;  3TA9 A;  2VMF A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3SO7 A;  2DGA A;  3I4K A;  3DGB A;  4IMG A;  3NYZ A;  4WJE A;  5REQ A;  4A3H A;  1UR0 A;  3HFY A;  2CLF A;  3DC0 A;  3VOC A;  2DT0 A;  2YL9 A;  3LYE A;  4DH0 A;  1LM1 A;  4HA1 A;  3KDN A;  4UFM A;  1A5L C;  1BSI A;  1KCK A;  1UPM B;  4QRN A;  3I7S A;  1OC5 A;  4M82 A;  3WDQ A;  3IVU A;  2Z25 A;  1RZM A;  1GVO A;  3ZLF A;  3KOZ A;  4MUP A;  4OJO A;  1KKO A;  2XII A;  2VEM A;  4LAN A;  3V1P A;  3CZK A;  2PUR A;  2Q01 A;  3O5D A;  3W1P A;  3CHV A;  2JE8 A;  4E2V A;  2GJP A;  3FGC A;  4MMW A;  3NUK A;  1XV8 A;  5JBF A;  5K9C A;  4ZO8 A;  3OOD A;  4M6P A;  4JL2 A;  4DWD A;  4XK2 A;  3VOF A;  1CXL A;  2XSX A;  1XRF A;  2Y88 A;  4GXW A;  2F9R A;  4H7C A;  3MCN A;  3K1D A;  3UZY A;  2XH7 A;  3OVG A;  3RYS A;  1BXN A;  3NFU A;  3STP A;  4LCR A;  1JPD X;  3THU A;  4S3E A;  3KP0 A;  3AIC A;  4X9S A;  1BYA A;  3U0H A;  4ZO7 A;  1K9T A;  5D2Y A;  4TX9 A;  1VC4 A;  4GO9 A;  1G6C A;  1GW1 A;  2Y63 A;  2HE5 A;  2R24 A;  1QK2 A;  4J4N A;  4NYY A;  5C8B B;  3JYM A;  4AZ6 A;  1SO5 A;  4DPQ A;  4GNJ A;  1N7K A;  1E3X A;  2VRK A;  1CW2 A;  3R1Z A;  3W7I A;  3EWX A;  2ZVR A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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