4Z2LA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 33
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2lA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2lA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2lA01
1C8QA 3THCA 2BFGA 4GINA 4OZOA 5GPRA 1EDTA 2CYGA 3PZ9A 5A6KA 4PTVA 2XVPA 3A4AA 2BVYA 3PZVA 2J8GA 5CPTA 4AW7A 1HF6A 1J0ZA 1W2PA 2WVVB 4D6GA 4EK7A 1B3VA 4IISA 2WWCA 1UZ4A 4P8VA 1E43A 4TUFA 4HU8A 1KCKA 5CGTA 4JCMA 1GZJA 1I75A 3HMCA 4B9ZA 2G3MA 1KQYA 3MUY1 2JEPA 2WMGA 2ZIDA 1FA2A 4Z2GA 2XJ7A 1R86A 2IXVA 4J3VA 2XVGA 3VD3A 4PMDA 4NSBA 3FW6A 3LMYA 1G01A 1ECEA 3CMGA 4LYQA 3BAYA 1H09A 4JFVA 3VNZA 1ZB5A 2EEXA 3T2OA 2FHBA 4KGLA 3BSGA 1WZKA 1J0JA 4MNLA 4S3KA 4A3HA 4M56A 2XSBA 1GQKA 4BF7A 1EOKA 5A8OA 3OG2A 3ARYA 1NWRA 5CLWA 3LPFA 1C7SA 1U30A 5ABGA 3PZUA 5JH8A 3DHPA 1JFHA 1C92A 2AOSA 3TP4A 3UG5A 9CGTA 4UQAA 1V02A 1NWTA 3ZR5A 1J0YA 5D9PA 4RE3A 3WENA 1K9DA 2UY2A 4KRTA 3W26A 2VX4A 3GNPA 4PSRA 3HU7A 3EYPA 1GVYA 4TXEA 3OLGA 5DEZA 1VBRA 3MMWA 1E6QM 1W2VA 1M53A 5D9OA 3RDKA 1J0HA 1KBKA 2YKKA 3ZQ9A 1MW0A 1JIBA 5CSYA 1OGGA 1K6AA 2CHNA 3POCA 2BHYA 4QLKA 1ZS2A 2XGIA 2XWDA 3FAXA 3PTQA 4OBSA 1CNVA 1GOWA 1HVXA 1ISYA 1Q6FA 1J10A 3PZIA 1JYNA 1E72M 2GDUA 3VX0A 5A6BD 3WNLA 4PMZA 1D3CA 1V6VA 1J01A 3WQ5A 5C70A 4HPGA 5HBFA 1BVNP 3CUHA 1CXEA 4PMYA 4CD6A 1UYQA 4NF7A 3CHCA 1E5NA 1EIBA 2EJ1A 2OSXA 3WF2A 5FL0A 1V6UA 4HA4A 3D5HA 4J3SA 3UEQA 1QOXA 2WPGA 1FH7A 2JFEX 4E8DA 1H2JA 2XVNA 4TOQA 4U3AA 3PTKA 4D1IA 1GUVA 1FFQA 2WLYA 3T2PA 3CO4A 2XFFA 4P7NA 3VGHA 3MO4A 3M6DA 1E73M 3AROA 1WO2A 3VGBA 4LXFA 2BNJA 1EA9C 4NRSA 1FHDA 5IHSA 2J74A 3CGTA 4UFLA 6TAAA 4AZIA 3CUJA 2EXOA 4AZGA 3IK2A 1XD0A 5EFFA 4DUXA 1JNEA 1MQRA 1EHNA 4J3UA 1CPUA 1JZ5A 5A8QA 3OB8A 4X0NA 3ARUA 1LF1A 2YOCA 2ZXDA 5BXRA 4GO8A 4XB3A 4HU0A 1WZAA 1VBUA 1TE1A 4IM4A 4D6JA 1VF8A 5ABHA 1X6NA 1BYCA 1HKMA 3BMWA 4H8HA 2XM2A 3KL0A 1P6WA 3W28A 3W6MA 1VRXA 3WD4A 3AMKA 3QR3A 4ZEPA 3VIMA 1Q6EA 2WC4A 4DUWA 3N9KA 4M82A 2VQUA 1HJXA 1M03A 4GPNA 4N42A 1UG6A 4URIA 1TVPA 5EFDA 4ATLA 4CKQA 3BH4A 1UR8A 1UD3A 5FD0A 3W38A 3K1DA 4GI6A 5I0DA 1JD9A 1WZMA 1E70M 3WL1A 2RGMA 1E3ZA 2CBVA 5I6SA 1E71M 4M8UA 3RJYA 2MANA 2WHLA 2F61A 2DQXA 4AD2A 1GW1A 1UWQA 3UERA 1MQQA 2ZX6A 2A3BA 4GZIA 2D20A 1UKSA 2VJXA 4W8AA 2YBTA 1R8LA 2GFTA 5E0FA 1RD6A 2ZWYA 5HOSA 3FN9A 1B3XA 1ISWA 3QGVA 1J0KA 3ARZA 4GZEA 5A6BA 1UH3A 1DWGM 2D0GA 2CXGA 3WFLA 1CEOA 5M03A 1RP9A 1B3ZA 3TTOA 2JALA 1CXKA 1KQZA 3L4UA 1UR0A 2D3LA 4PTMA 2ZX7A 2EPKX 1LWHA 3WQ4A 1BF2A 1H0GA 1FHLA 2BXZA 1JF6A 2YDQA 4W93A 1W9XA 4H41A 4ML4A 3AS0A 3GNOA 3ZJ8A 3F4VA 4TVUA 5GQBA 2PWHA 4WKAA 4BQ4A 3N13A 1MW2A 2JIWA 4J3XA 4F9DA 3QOMA 5LA0A 5M5DA 1IZKA 3RM4A 4JL1A 1CWYA 2WVTA 1TVNA 3ARSA 2VCBA 3VGDA 1C8XA 4NZCA 1S46A 4PEEA 4QCEA 3WELA 2D23A 1RH9A 1E4NA 5DT5A 3F5KA 2XWEA 4E4PA 2C0HA 2VZSA 2VX7A 1JXJA 2QPUA 3L4YA 2FH8A 3VMOA 2WC7A 3SCRA 5IDIA 4CN6A 3MV01 2VI0A 3ZM8A 5JBDA 1QHZA 3TONA 2C7FA 3WQWA 1FFRA 4H8VA 5BXTA 3O2LA 1GPFA 3EDKA 8CGTA 3L2LA 3AISA 1JI2A 4AEEA 2X0HA 1YHTA 4M29A 1OWQA 4QLJA 1EDGA 4D6HA 5BXPA 4FMVA 4EE9A 4FF5A 3NCOA 3GNRA 2FGLA 4RE4A 3ZIZA 4FLOA 4GQRA 3ZMRA 1TCMA 2YL5A 2WCAA 3MMUA 4DM1A 2WW5A 2GUYA 3BMVA 3L4VA 3AMGA 3MU7A 1JD7A 1W32A 1XSJA 3I3EA 2W62A 3VO0A 3K4AA 2FGZA 1H4PA 1W3JA 1LLOA 4W87A 4LYRA 3VD7A 4AD5A 1QPKA 4PMVA 2DGAA 1OT1A 3VMPA 5JIPA 2J7BA 3BAWA 4K68A 2BY0A 3NSXA 2VMFA 4W8BA 2G4FA 5A3HA 1UA7A 3WD0A 5JBEA 2ZUWA 2XM1A 4JFTA 4Z2JA 3VGEA 2A3CA 2DT0A 2E8ZA 1OM0A 1J12A 5GNXA 3RM9A 1JYWA 2WZIA 2WHKA 3MUAA 4XZBA 4P7OA 2XUCA 2OSYA 3N1AA 4ATWA 3VMNA 4ZENA 5CLTA 1R7OA 4V2XA 4V28A 2X2YA 3K46A 4R5EA 1QI2A 3WD3A 1SMDA 1WKYA 3SURA 5I5RA 3SCNA 4J3TA 5ABFA 1WDRA 1UR4A 1GVIA 5A1AA 2GSJA 5E0CA 2DDXA 3AMCA 3WMBA 1CGVA 2VOTA 7CGTA 1W1VA 1EO7A 1V6YA 1W91A 1NWSA 4UOQA 5D4YA 5FKYA 1UOKA 1J0IA 3PN8A 1QVBA 1UUQA 3WQ8A 5D8WA 3WH5A 1ISZA 1DWIM 4PTXA 1D2KA 3U5YA 5E70A 1OGBA 1K9TA 4PBGA 3AHVA 5E9AA 4YHEA 1UD2A 3PZGA 1H5VA 4AMCA 3WNOA 4D6CA 3WNNA 2OWWA 2VZVA 5I77A 4ZXOA 2GJRA 2JF7A 4MPKA 2YDRA 5D9MA 2OWCA 3N17A 3OLDA 5AC5A 2GJPA 3GBEA 2WCSA 3VGGA 4QCFA 3VKKA 3W29A 4JFSA 1IV8A 1JAKA 4NI3A 1A3HA 2E3ZA 3VX1A 4CCCA 2E9MA 1WPCA 2J7DA 3AS2A 4UQEA 4IPNB 1JXKA 2VZUA 2G3JA 1QNPA 4D6IA 1VFOA 3BAIA 2W66A 3S2CA 3WL0A 2E9LA 3NDYA 2QF8A 3ZR6A 1V0NA 2V3FA 1KGXA 3AFBA 1Y7VA 5CGMA 2OWXA 3W53A 4BS0A 4XUYA 5BWFA 1NM9A 2WZEA 1NOFA 1W3HA 3CUGA 3AOFA 1VB9A 2E8YA 3M07A 4HZ6A 4GKLA 5BROA 1XSKA 2WANA 4Z2LA 3VGFA 2VX6A 1QI5A 3WF4A 2E4TA 1JZ3A 5FL1A 3OLIA 3CZLA 3VNYA 2CPUA 1QI4A 2WVSA 4B9YA 2AMGA 1H11A 1N82A 4UOZA 3B9DA 3BGAA 1XH2A 2G8ZA 5TD4A 1CXIA 3AQUA 2WM0A 4WKHA 1HJQA 1Q6CA 2CEQA 1QW8A 1CLVA 5I3DA 3OBAA 3IJ8A 4JIEA 4P8UA 2F2HA 3NIYA 3GH5A 1XHGA 2XFRA 1OGSA 1SR0A 1J9YA 3SCSA 3PZOA 2WWDA 2GJXA 4MNKA 2BY1A 2QV4A 2DSWA 5IXEA 3WUGA 1ZU8A 5EBAA 4QAWA 3VD4A 4C7DA 4V27A 4QDMA 3IJ7A 4Z2HA 1UQYA 3MANA 4PMOA 5HPCA 4XX6A 2JE8A 2RGLA 1PBGA 1B3YA 1HJSA 2DH3A 2E40A 2F8QA 2X09A 3CUFA 4J3WA 1VJSA 3KEHA 5FIPA 2DT1A 4DUVA 1IT0A 3GXFA 2ZXBA 8A3HA 1ZBKA 1WCGA 3N18A 3PHAA 1M7XA 4M24A 3SUTA 4AZ7A 5I2UA 5A2BA 1H1NA 3A4XA 2WK2A 2OYMA 3WNKA 4P7RA 2WSPA 5GNZA 2J7HA 2DPEA 2WSKA 5BXSA 4AIUA 3KE0A 3WUBA 4ZE4A 4TVCA 1VENA 2J77A 2WMIA 3O9NA 4AD0A 2YIHA 1NOUA 2FDMA 4UTFA 2V3EA 2CCRA 4PMQA 1GOKA 4D72A 3AMDA 2PBGA 1BG4A 3NSMA 4M80A 1ZBCA 4ACZA 1LG2A 2JEQA 3W82A 1UKOA 2PBOA 4W86A 3W4RA 1W1TA 3IANA 2O92A 1H3GA 3SUSA 3N15A 2PC8A 4HOWA 1TUXA 1EH9A 2VCAA 4EANA 1R7AA 1OD8A 3F5LA 1HN1A 3VOCA 1MXGA 2YL8A 3BC9A 5ABFB 1V3MA 3WMCA 5DO8A 1UWIA 1HKIA 5IFPA 1UD8A 4TX6A 1OIFA 3VPLA 4W7WA 3WDRA 4GIAA 3ARRA 4KMQA 1RP8A 1QNQA 4U2YA 3WY1A 5CG0A 5A6MA 1DWAM 4OJYA 5LA2A 5GNYA 3AJ7A 1KXQA 1QBAA 3TTSA 1VEOA 3WIJA 1HJUA 2Z1SA 1XD1A 2ZUMA 3WSUA 5DMYA 3W24A 2BVDA 3SEPA 1DEDA 4HA3A 4W5UA 2ZUVA 4B3LA 3WH7A 3ARPA 5A8NA 2BHZA 4B16A 4D71A 1Q6GA 3ARTA 1F4AA 2CHOA 4W5ZA 4YN5A 1HT6A 4A4AA 1K9EA 4YPJA 3WN6A 2VRQA 4PTWA 3AIBA 4F8XA 4CD5A 3WH6A 5CZKA 2EPMX 4D6DA 1JYXA 3VU2A 1KFWA 2AAAA 3TOPA 1UZ1A 1E6NA 3AICA 2Y4SA 3AHYA 3LPGA 4OUEA 1X1NA 1EQCA 1TZ7A 2XIIA 3A4WA 3UR7A 3WF3A 4HP5A 3MS8A 1C90A 4PUDA 2D24A 4AD4A 1BQCA 4CCDA 1EOMA 1B0IA 2VL4A 1V6XA 4J7RA 3NUKA 1WDPA 2VT0A 5A95A 2X8RA 1QHOA 2VCCA 1XRVA 4JKKA 1MFUA 4AIOA 2WHMA 3BAXA 5LA1A 3E1F1 4B3KA 3WEOA 5A94A 3DHUA 1BYBA 1BLIA 1XH1A 4UNIA 1TFVA 3PZQA 3VIIA 1E55A 2EPNA 3ZJ7A 1I1WA 3VD5A 2EQDA 1KWGA 1AIWA 1BAGA 3RO8A 3U7BA 4UFJA 1E6XM 3W25A 4AZHA 1HL9A 1OBAA 3K8LA 4PCTA 4BZYA 3VDCA 4W7UA 2VTFA 1BSIA 4AD1A 1W3KA 3THDA 7A3HA 4MB5A 2BVTA 3ARWA 2V3GA 3A6OA 3BAKA 4UCFA 2QLYA 1E0XA 4M1RA 1UR2A 3AHTA 1XC6A 1YQ2A 3CHFA 3MUZ1 1VJZA 1QNSA 3OIHA 3I3DA 4PUEA 1AQHA 2WHJA 1UWSA 4L4PA 5BRQA 1VIWA 4UQCA 2GVYA 3GBDA 4X9YA 3WF1A 4AISA 2W67A 4GQQA 3GXDA 3GM8A 4OKDA 1UH4A 1PX3A 3WBAA 2GJXB 1Q4NX 2O9RA 4JZ5A 3WQVA 2O9OA 2Y2WA 4FLRA 1V0KA 1B3WA 3QHOA 4D6EA 1H49A 2WLZA 5M3WA 4PCSA 4GO9A 1E6ZA 1HKJA 2NT1A 3VIFA 4CD8A 1V02E 3N11A 3DYMA 3RIKA 2ZUSA 3CIVA 4GI8A 3RPMA 4MB3A 3SUWA 4E8CA 4BQ2A 4PMXA 1B31A 1V0LA 2QHAA 4Q22A 1HJVA 1WNOA 1L8NA 5D8ZA 4UZSA 4P7QA 1LL6A 1B2YA 1CGTA 4CD4A 3AMLA 1DWHM 1WZLA 3B9AA 2FHCA 3GH7A 2YLLA 2EPLX 1W9PA 5C71A 2WMIB 1V3KA 2VVSA 1QNOA 1E0WA 2W92A 2VNCA 1AMYA 1K9FA 3M7SA 3AYRA 1ESWA 1ZBVA 4CU7A 5AC4A 1CGXA 1L0PA 1BG9A 1E1FA 4ACZB 1JL8A 3ZSSA 1VFUA 3OZOA 2VR4A 5I23A 5D9NA 2WMFA 2V5CA 4KH2A 3SCUA 1UWTA 2Y5EA 4DWSC 3NSNA 3CUIA 2D22A 2GK1A 3L4WA 2PWGA 3ZSTA 1NP0A 1IZJA 1CECA 2OSWA 1HJWA 2D0FA 1BTCA 1LQ0A 1X6LA 2X05A 4W8LA 2W4XA 2B31A 4RE2A 1GHSA 1KXHA 1PZ3A 1KR1A 4DWSD 5EB8A 1GHRA 1E3XA 1XV8A 3ARVA 5BRPA 3VM7A 4W84A 4ACYA 3KL5A 3A47A 2IUZA 1I1XA 1DWFM 1BGAA 2WB5A 5JBFA 5HDRA 1D7FA 3ZO9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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