4ZZ9A

Crystal structure of t75s mutant of triosephosphate isomerase from plasmodium falciparum
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
246
structure length
243
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYSGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Probing the role of highly conserved residues in triosephosphate isomerase - analysis of site specific mutants at positions 64 and 75 in the Plasmodial enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 91
structure length 243
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4zz9A00
3ANYA 3M41A 3NL6A 4QISA 2NZLA 1KBJA 3HJZA 3C4UA 3G1SA 4P2VA 2PURA 4K36A 3SI9A 4HT3A 2YYUA 2P10A 1TJRA 5U7SA 4AAJA 1HTIA 1K7XA 1SW0A 1IGSA 2ZRYA 5F2LA 1LOQA 3QMSA 1EX5A 1OABA 5HULA 3S9YA 1DQXA 1ZJIA 3U6WA 3W86A 2VFGA 3S1XA 2P0OA 1UB3A 3QPZA 1H5YA 2QCDA 2WSQA 5TBOA 4ZL1A 1OF6A 3IIOA 3FA5A 2Y61A 3O07A 3GXPA 5CPMA 3P8JA 1AG1O 1JJKA 3L65A 4FX7A 3UD6A 3W7LA 2Q8ZA 4GUHA 3DBPA 1BEUA 3HOJA 4LY8A 3G1XA 1F7BA 3FYOA 3P67A 5HINA 2BSLA 8TIMA 3OVPA 3T78A 4JDYA 1TPVA 3GR8A 5FESA 1W56A 3O6CA 5F1VA 3N2MA 1KM1A 4LOCA 2P1FA 4AWTA 3QMRA 1JCMP 4H4IA 5D30A 4K6AA 5C5YA 2Q3OA 3W1UA 3P5YA 3QMTA 1YTDA 2CLKA 1JQXA 4C1LA 3NM3A 1OX6A 3L66A 4O4WA 3TQKA 5IBXA 3MHUA 3PBVA 4PCFA 4IMCA 1YTEA 3QW3A 4X22A 2YZRA 3KFTA 1WYIA 3C2RA 4IOTA 2RDWA 1GZGA 1XCFA 4XTDA 4IGHA 2Y70A 3NQCA 4LRSA 2Q3RA 5TQLA 1KFCA 2DZTA 2GVLA 4NJKA 4UNKA 5D02A 4Y96A 3SFKA 1TPC1 4KKXA 5CSRA 1PHWA 2WO5A 1LYXA 1W37A 1IF2A 2QAPA 1GQNA 1F5ZA 5C2XA 3TR2A 5F2MA 1R47A 3CHVA 3EXSA 3TFXA 4DPQA 5BMXA 4LS2A 3CM4A 2O7SA 3NO5A 4LRTA 4ZMGA 4BI7A 4O18A 1RD5A 3I6RA 3MMTA 5FEZA 1XUZA 1W5MA 4EF8A 2E6DA 3TC6A 3LXAA 1LM1A 2ABBA 5AC7A 3HG3A 2FB2A 2YXGA 6ALDA 2B7PA 5DXYA 4QITA 2VFEA 3WJZA 2Y7EA 3TDFA 4R33A 1DORA 3GZ3A 1OX4A 1OFAA 3LLDA 3PAJA 2ZZ2A 4WOZA 3TNOA 4LW7A 2ZZ1A 3A5VA 4FNTA 3LBMA 5F4XA 4UFIA 2EF9A 1QPNA 3P74A 4IXXA 4Q33A 4TMCA 3N19B 5DBUA 2EHHA 1A5AA 5DCBA 4Z1BA 2ZRXA 3CWOX 1K03A 3DFSA 3LHZA 2W0UA 4RXGA 1OFQA 5HNRA 1R46A 1JCYA 4M6PA 3E96A 4UFMA 5AN7A 1JCNA 1XI3A 1FWTA 3KVJA 3NQVA 3U2OA 1BWLA 1W5NA 3L67A 1ZAHA 1EB3A 4CQAA 3L5LA 3IIZA 4DPPA 4OT7A 3B8DA 5TIMA 2HTMA 1VYPX 1Z44A 4W9TA 4E2DA 3DFTA 5G4EA 1H1ZA 1Y0EA 3KXQA 3TXVA 4MY9A 3W1MA 1M7OA 6TIMA 3GXTA 3W6YA 4XKYA 3TSDA 4O57A 5BRBA 2B7NA 1LP6A 4R53A 3TV8A 3TU9A 2V8ZA 1JUBA 3QSTA 1OYCA 3W1RA 3WFAA 4ALDA 3BW2A 2NXHA 4UFHA 1EP1A 1AW2A 2KZHA 4CNOA 3QF0A 4MUZA 3UWZA 4O52A 5MHBA 1LROA 3LOTA 1LTDA 1M6JA 3F03K 1ZAIA 3DFQA 1VC4A 2NUWA 3PM6A 2E09A 3U8GA 4PL2A 4RZ4A 1ZHAA 3LHTA 5D05A 1O5KA 1Q45A 3E49A 4AVFA 4ADSA 1SSDA 2OX1A 3WJXA 1DV7A 1OFPA 2GJNA 1SW3A 4GNJA 1YDVA 2ZTKA 7TIMA 2ZA1A 2LLEA 5I3KA 2VEKA 2ATSA 2JK2A 1EUAA 2R8WA 5IM51 3G3DA 4NZFA 1J2WA 3MHGA 4JTIA 2H3DA 2O7QA 1Q6RA 3EXTA 1UBSA 5BNKA 2DORA 1OYBA 3W1TA 4M7SA 1G6CA 1WQ5A 2RKXA 3UQNA 1UCWA 1ZAJA 4YCOA 3M1ZA 3B04A 1ZFJA 3NQ7A 4UTJA 1ZNNA 4Z08A 3GK0A 1AL8A 3BLFA 5FF2A 1EP2A 4JTSA 5D32A 5EY5A 4S1FA 2CLOA 1T0OA 4GFSA 2DJLA 4O50A 4HPXA 3W23A 3H54A 1GVQA 1H1YA 2PC4A 3MP5A 4MFDA 2NUYA 4TX9A 1FWRA 4A21A 1S5WA 2X1TA 4WZHA 4NU7A 2E5BA 2I1OA 1LLZA 5I3IA 2PCQA 1FX6A 1H7XA 1K8YA 3EX4A 3W71A 1SZNA 4NNAA 3W7IA 1TPB1 4O53A 1PCWA 1UJPA 3O1NA 2A6NA 3LLFA 4NJHA 3N2XA 4UTWC 1TSIA 3KRZA 1FDZA 2ZYFA 4PTNA 3STGA 1X7FA 3DHDA 1XBVA 2WNNA 1O5XA 4Y9AA 4BI5A 3G0UA 4UNLA 3LCIA 4N4PA 5D04C 4N6FA 2ZA2A 2A1YA 3C61A 3PF3A 4NXSA 1FBAA 3FYPA 2HMCA 1LLWA 3UWVA 1HO4A 3NM1A 4GUGA 5LGZA 3FLUA 4RCXA 5AFDA 4HNNA 4RXFA 5AYXA 4O1BA 3W7EA 3FKRA 2OT1A 4ADTA 3M5YA 3B0VC 1GYLA 3R12A 4YMZA 1TB3A 2E6YA 2VFIA 3CTLA 3LXBA 1U5JA 3KVLA 1VCVA 2YR1A 1LRNA 1VH7A 3TE9A 1TV8A 3DHFA 2NXIA 3LTYA 2FPVA 3PBYA 1SSGA 4O0ZA 2H6RA 1V7YA 5EA9A 5D37A 1G4PA 3W7KA 3VE9A 3W70A 5FF3A 1W5PA 1M7PA 5AHFA 2NUXA 1JRBA 5BOOA 3VFLA 3I65A 4FXSA 5K4ZA 3IGSA 4RZ5A 3GIYA 2Z2UA 3EX1A 3UWYA 2VOMA 3OG3A 2YW4A 1X8FA 3BO9A 2J9ZA 3A22A 4UMAA 4FNPA 1LDCA 1K8XA 3V1PA 1AW5A 1XDLA 1FWWA 4L4LA 1B9BA 2GJLA 5D2VA 3Q37A 3IVTA 3FOKA 2A7RA 4G1KA 2X30A 1JCLA 1NAL1 3TW7A 1PVNA 2TYSA 4BF9A 3G1FA 3D0CA 3L9CA 3CT7A 1H50A 1MXSA 2PRMA 3W1PA 1D9EA 4FNQA 2CLEA 1ADOA 1L6SA 3BW3A 3NQ2A 3P7YA 3W2MA 5AB3A 1KM3A 4FNSA 1GTHA 3N9RA 4K8EA 3G8RA 4PODA 4HNVA 5K7JA 3RNDA 4UTMA 2CLIA 4LC8A 4FIQA 5LZLA 5CPLA 4K7YA 4IX0A 4P61A 1VR6A 3S5ZA 1FXQA 1ME9A 3O63A 1SO4A 3AJXA 1EUNA 5KSWA 3CQ0A 3L0NA 5K9CA 3DXIA 1YDNA 3MBFA 4D2JA 5I3HA 4CNNA 1YDOA 1UUMA 5H2ZA 5LHEA 2ATMA 4ZQCA 5F4SA 2J9XA 3C56A 2W6RA 3MI3A 1TJPA 1O4UA 2QJHA 4L4MA 1FQ0A 4OV9A 3TUUA 5LNRA 1VLIA 3I68A 4JX6A 3ZWTA 2E77A 3UXDA 3JR2A 2A6LA 5FF0A 5HWNA 3HPSA 4DO4A 5I3JA 1VJIA 3NG3A 1R2SA 4JTHA 2F7FA 3QJAA 2FJKA 1SZFA 3PUDA 1EIXA 3N14A 2R94A 3PS7A 4KFOA 3R8RA 1NF7A 3LB0A 4WXYA 1PS9A 2J6XA 2ZRWA 3GNNA 3L5MA 3R2GA 1A53A 2QCMA 2X1RA 5K3VA 2R14A 2Z6IA 1P0KA 3WJSA 3W7NA 2B7QA 3W88A 1GJPA 2V2CA 1QDSA 3LCHA 3T7VA 1NF0A 5AC8A 4HSOA 5D38A 4ZQOA 4LVFA 4GUFA 3MP4A 4B5NA 2QUVA 4PFMA 1JCXA 5DELA 2C0AA 3L21A 3EX6A 1ML1A 3M5VA 2R91A 3W7OA 1A5CA 4O54A 4LU0A 3DI1A 3THQA 4UC5A 1IIHA 4MJMA 4A2SA 2ZZ3A 1I2RA 4RZ6A 4AXKA 4LVAA 4RLIA 3DZ1A 3EWBX 3M5XA 2CLFA 5DCEA 3W1XA 1G4SA 2H8ZA 2QCHA 2Y6ZA 3M9YA 2OZ0A 2B0MA 3TAKA 4M6VA 3PBUA 2RFGA 2BXVA 4IWWA 1DQWA 1PCKA 3PULA 5KITA 4J9JA 1DHPA 2FLIA 1VHCA 4N4QA 1H7NA 2AQWA 3DENA 5CGQA 3Q2DA 1X1OA 4M7TA 3L0GA 4GWEA 3UWUA 4LS1A 1WOAA 1SW7A 1AL7A 1HL2A 3GNDA 1YXCA 2D73A 1YPIA 3S42A 2H3BA 1IXPA 1TREA 2DZPA 3UWQA 1ME7A 4ORMA 4DXVA 3HF3A 4K39A 5E1QA 2OCZA 3DFNA 3THAA 1GVSA 1VYRA 1O94A 1MO0A 3STEA 1HFBA 3IGUA 3PSVA 1JQVA 4O1AA 2JBMA 5ABTA 3ABQA 4WXZA 3BK0A 4OBTA 4JDBA 4TR9A 4NX5A 1CI1A 1EWEA 3OBKA 2VFHA 2YW3A 1OG0A 2XN1A 3LV6A 2Y63A 3TQVA 2HS6A 2V9DA 1P0NA 2NX3A 2WNZA 3BGGA 4UXDA 4U28A 1PE1A 4KWVA 3BGJA 2V5LA 3CU2A 1OYAA 4DQWA 1TRDA 4BI6A 2NX9A 1DL3A 2EKCA 4H3DA 4UTIA 3W1NA 5FEXA 4O10A 2E1DA 2FPYA 3EWYA 2H90A 3HIJA 2FPTA 3UPWA 5KTLA 4DF0A 3I7RA 1YADA 3SGZA 2WSRA 3IRDA 1FWNA 3QH2A 2JKPA 3SY5A 1WBHA 4I9AA 3W7GA 4X2RA 1QCWA 2VC6A 5LGXA 2ZFAA 2QCLA 3ZFHA 3TJLA 3RF9A 4S2CA 5T26A 3NQ6A 4XWUA 3GDRA 1IXOA 4ZVJA 2C3ZA 2A5HA 2ZCGA 4AHOA 3KVMA 3QQ1A 3WK0A 4WY0B 3WK2A 4YXGA 3C0JA 3W7DA 3OHIA 4GUJA 1P4CA 3CPRA 4LVGA 5DN1A 4KFPA 3CWNA 1Z48A 2IQTA 2VEMA 5I3GA 5F1UA 4Z0JA 2VELA 3P84A 4NUWA 5E93A 1QPQA 2X1SA 5K9XA 3S8HA 3EWZA 3MWAA 2CLLA 2QCEA 3TFCA 4N02A 3NZRA 4O28A 4AWSA 5BW6A 4MZ1A 4O14A 1GTEA 3W2JA 5KZEA 1OK6A 3L0KA 1MEHA 2ZZ6A 2UV8G 1W3IA 3PG9A 5HWMA 5K9DA 2V2DA 5C54A 3BG9A 1TTQA 3PSWA 4AF0B 3TMLA 1OFBA 4JIPA 1M5WA 2CZ5A 3EWUA 4JTLA 1KFJA 4YL2A 1LBMA 4WX2A 3DGRA 2WKJA 4MY8A 4CNPA 2C16A 4IMFA 5K2ZA 3LCFA 1QWGA 1Q6LA 2W79A 2GOUA 1F05A 2V30A 4O19A 3ZS4A 4UUIA 3GX9A 3VE7A 2A0NA 5HR6A 5DXXA 1C29A 1KM6A 1S3HA 3W83A 3B06A 4UTWA 4MFEA 3IVSA 2CZFA 1DJQA 3QC3A 4K7VA 3BW4A 4PH6A 1F73A 1LRTA 3RFAA 4UMBA 1RPXA 3ATZA 3BVJA 2BTMA 2C15A 5J5RA 2VFFA 1GEQA 3NQAA 4JS3A 5LHFA 3NQDA 4PC8A 1OFDA 3UYCA 3RU6A 4EWND 2FFCA 2CW6A 2DJXA 2NWSA 2XN0A 5CZTA 1TCDA 1O60A 3EXRA 3HG5A 2HS8A 4JTKA 1LBFA 2AAMA 2ZQ0A 2NXGA 1GPWA 4GJ1A 2YGYA 2ZTJA 4LWWA 4OWGA 1VYSX 4YLWA 1HO1A 1PL9A 4QNWA 3H53A 1U83A 3N73A 4LUIA 4IMEA 4UMCA 2RDUA 1E51A 3KX6A 4WY0F 3ELFA 2YX0A 2XN2A 5HQEA 4MLJA 3PY2A 1TTJA 3S0CA 3TQ0A 1KV8A 3QRHA 3P81A 4RK8A 3GDLA 4NJIA 5C55A 1KBIA 4UTUA 3STCA 1KTBA 5KINA 3C52A 1YYAA 1QNVA 1WX0A 3O16A 4AHQA 4QQ3A 3HG4A 1I8JA 1YXDA 2Y88A 2EPHA 1OJXA 4HPJA 4H6KA 3NL3A 2CLHA 3PC0A 1RR2A 5LKYA 2QCCA 1EWDA 5CPNA 1W54A 1G69A 3LRMA 3LHVA 3EKZA 3GKFA 2ZZ7A 4Z1AA 3USBA 2A7NA 3O6YX 3GAKA 4M19A 1LOLA 3IIPA 3S5OA 1FDYA 2QKFA 4Z0SA 3TH6A 4MIMA 1QMLA 4FO4A 4JX5A 3N3MA 3A9IA 4Z1DA 4FX6M 5AOUA 1FY6A 3TMQA 4CCDA 5AHNA 1O95A 4JEQA 1F74A 1K7FA 5HR7A 4UR7A 3M43A 4HKPA 4FEZA 2QCDB 1Z41A 3SJ3A 4MKNA 3W3OA 1X6UA 4QAIA 1GWJA 2EGZA 4JR5A 1PHQA 1EPXA 1R30A 2G5WA 3HGRA 1LBLA 2BWGA 3PBWA 1W5OA 1OFEA 4AWUA 3SSJA 4O1DA 2DZSA 3T40A 3I7QA 2C18A 2WSYA 1QO2A 3S6DA 1BTMA 2C1HA 3NEVA 3OA3A 4JD4A 1W0MA 4FNRA 3UZ5A 1B57A 1I2NA 3BARA 1W5QA 3GLCA 5AHEA 2PRHA 3OEXA 1OFOA 3G0SA 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 3W75 A;  2G96 A;  3BV4 A;  3SIZ A;  1FWS A;  2TPS A;  3B03 A;  5L9F A;  3E0I A;  1WA3 A;  1F6P A;  1WOB A;  2Y7D A;  4IMD A;  1T99 A;  4JNM A;  2TMD A;  3DAQ A;  3T4C A;  5A8G A;  1W3N A;  3UPB A;  4JY9 A;  4UFK A;  1I4N A;  4JTE A;  5GVJ A;  4KWW A;  3MI6 A;  1WDW A;  3RLU A;  3GR7 A;  4FX8 A;  3M44 A;  2Z0I A;  3I7S A;  2NLI A;  1G67 A;  1TV5 A;  3AO0 A;  4IJB A;  4JXC A;  1XBX A;  5EYW A;  5FF7 A;  3Q94 A;  1CW2 A;  1F6K A;  3G1V A;  3HB9 A;  1JRC A;  1LZO A;  4DO6 A;  3EX3 A;  2YCE A;  3O8A A;  1FCB A;  4QNE A;  3NPW A;  1LOS A;  4WD0 A;  4NZJ A;  1S5T A;  1P1X A;  3P5Z A;  5D2T A;  5KZM A;  1GG0 A;  2NV2 A;  3C8F A;  1QOQ A;  1YTK A;  3CLM A;  3G3M A;  3LTS A;  5CG7 A;  4R7J A;  3NOE A;  3FFS A;  1I2O A;  4FF7 A;  1YLV A;  1D3H A;  1VS1 A;  3W87 A;  3LI0 A;  4MZ8 A;  1I2Q A;  2WNQ A;  4M5P A;  4O0K A;  1KA9 F;  2I14 A;  2V0T A;  5DY3 A;  3BG3 A;  1IXQ A;  3NQE A;  1SO3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ONX A;  3GWQ A;  5CSU A;  1VEN A;  3ANY A;  1UWS A;  4QIS A;  2FTW A;  3HJZ A;  3EZ4 A;  1OQF A;  4GKL A;  4I90 A;  4IP7 A;  1XRS A;  1AMY A;  2YYU A;  3ZST A;  4PN2 A;  1FHD A;  4AAJ A;  4W88 A;  2ZRY A;  1IGS A;  4S3G A;  2DY3 A;  5F2L A;  4D6D A;  3QMS A;  3WLR A;  1F61 A;  2BXZ A;  1OIF A;  3NDY A;  3S1X A;  4GH1 A;  1UB3 A;  2VUY A;  3QPZ A;  2WSQ A;  4XVD A;  1DWG M;  5TBO A;  4ZL1 A;  2JEQ A;  1KKO A;  3FA5 A;  4X0N A;  2Y61 A;  1OT1 A;  1AG1 O;  3FA4 A;  3L65 A;  3T0B A;  4QFU A;  3VAV A;  4E3V A;  3AJ7 A;  1YMY A;  4LY8 A;  4GXP A;  1RA0 A;  3S9I A;  3AS3 A;  2FH6 A;  1NEL A;  1TPV A;  3AXX A;  4IIC A;  1JND A;  4J3V A;  3PHA A;  1CT5 A;  2E9M A;  3FA3 A;  3RO8 A;  2IPW A;  5C71 A;  3V1H A;  5E6Z A;  5D30 A;  1K9D A;  3EOS A;  5C5Y A;  4A05 A;  3M07 A;  2Y2W A;  2D1Z A;  3H2A A;  3L2L A;  7XIM A;  1QNO A;  1NOW A;  3L66 A;  4O4W A;  3CZ8 A;  3MUC A;  3PBV A;  3EWD A;  1YTE A;  1G5A A;  4IOT A;  4IGH A;  4LRS A;  1GJU A;  4HTY A;  1I75 A;  2DZT A;  3WEL A;  2GVL A;  3VCC A;  4NJK A; 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