5BMXA

Crystal structure of t75n mutant of triosephosphate isomerase from plasmodium falciparum
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
ARKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYNGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Probing the role of highly conserved residues in triosephosphate isomerase - analysis of site specific mutants at positions 64 and 75 in the Plasmodial enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 98
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5bmxA00
4JX4A 2A7NA 3S5ZA 2QCCA 3N2XA 4MZYA 3PG8A 2VEPA 1VZWA 3W7JA 4E2BA 3RK8A 4FNQA 1G4TA 2H90A 1KFBA 1GTHA 4PH6A 6TIMA 4XKYA 1FUYA 1N7KA 2C19A 2V2CA 2QJHA 3FOKA 2A5HA 3UNDA 1IXNA 2B7QA 1RR2A 4O12A 3W1QA 4UTTC 1SU5A 1JQVA 3LCLA 1RPXA 1NVMA 1L6SA 4MVAA 2C3ZA 2RH9A 2A7PA 1ZAHA 3QH2A 4JX5A 1ZJIA 1K8XA 2DZPA 3SSJA 3SY5A 3W7IA 1ZALA 2ZA3A 3MYPA 3S1XA 3H53A 4WUIA 1A5BA 3FIGA 1M7OA 5I3IA 1FDZA 1XBZA 5D09A 5DY2A 1H7RA 4N9DA 3MMTA 3CEUA 4UTLA 2ZFAA 2PC4A 1K03A 4KFPA 5E0KA 5DY3A 1SFJA 3P84A 1EPXA 3TW6A 3NQVA 1O4UA 2A85A 2Y61A 4BR1A 3YPIA 3PG9A 4UFHA 1JJKA 1IXQA 4DPQA 4KKXA 3QJAA 1OG0A 2ZTKA 3LRMA 4FHAA 1B9BA 1YDVA 4XZ9A 2Y7EA 3SJ3A 2TMDA 4CNOA 4FX8A 4FNUA 3OVQA 3G1HA 4MYXA 4YLWA 2I14A 5BW6A 4ZQRA 3EWWA 4N6FA 1I8JA 3WJXA 3HBLA 3C6CA 3RU6A 2YCEA 4FNRA 4MOZA 3G0SA 4FNTA 2JGYA 2ZRYA 1KBIA 4XWUA 1YYAA 4N6EA 4DQWA 2A21A 3EXTA 4CCCA 1XKYA 1VPXA 3W22A 3U6WA 3UXAA 4AWTA 1F6PA 3UY7A 4O50A 3EXSA 3UWQA 1IGSA 3BK0A 4IMGA 2GPTA 2PRLA 4O10A 5D32A 1WDWA 1XUUA 1ZHAA 5AYZA 3MI2A 4O0KA 4X3ZA 4NJHA 3TJLA 3OBKA 2E6FA 2DJLA 3W73A 2J24A 1UBSA 2YDAA 2Y6ZA 1C29A 1R46A 1TPVA 5GVJA 3G1AA 4LV4A 3C56A 4UCGA 4RLIA 1K8ZA 2NV2A 2OZ0A 3FEMA 3NYZA 3R5EA 3NQ6A 3LBMA 1GVFA 2H6RA 1LBLA 5F2MA 3LHVA 3IGSA 5F4SA 2E5BA 1UASA 3O16A 4O1BA 4LC8A 5BMWA 4MFDA 3C0JA 1YLVA 4JYFA 4LS0A 3GAKA 3G0XA 1EWEA 4MYAA 5HWMA 3NM1A 3NL3A 1NEYA 3ZS4A 2JBMA 3O63A 2QUUA 3TFXA 2A6NA 3TQ0A 1T99A 4M6VA 1F6KA 3PUEA 4K6AA 5D04C 1SW0A 1OABA 4S2CA 3LCIA 1FWNA 4O1AA 3MUXA 3NO5A 4L4MA 3PBYA 4AHPA 2Y89A 1SO5A 3QZEA 4AWUA 1GVOA 2GQ8A 1KM1A 2CLMA 3CU2A 3MWAA 1H5YA 4L4LA 4LUJA 2ZRZA 4LVFA 1XC4A 3T44A 1GVRA 3ABQA 5EL1A 1G7VA 3A24A 2Q3RA 4AHQA 2V8ZA 3TROA 3THAA 2FTPA 3W7GA 3HPZA 4JTSA 2FQIA 4NX5A 3ZWSA 5D03A 3GKAA 1MEWA 3KVKA 1O95A 1VRDA 1F2JA 1Z44A 2WNZA 5FEWA 2GVLA 4KWWA 1XBXA 1I2RA 1V5XA 2YX0A 1DORA 3UZJA 2A0NA 3CTLA 3K30A 3W84A 1XBVA 2PCQA 1OFDA 3SW6A 1XFBA 3RLUA 4JNMA 1VLWA 4JY9A 1HG3A 3PSVA 2E5CA 3S9YA 2VFIA 3TMLA 4LVGA 4RZ6A 1VYSX 3WJYA 1TTJA 4AHOA 2JKPA 3A9IA 3I65A 2FDSA 4UTIA 3LBCA 4MJMA 1OYCA 2XN1A 2CLKA 1KFCA 1LORA 4JD4A 1XBYA 4Y90A 1RV8A 1LLZA 1UUOA 3LGEA 3ZFHA 2QCEA 1S5VA 3W1PA 4NNCA 2YW3A 3KRSA 5AHNA 1SZEA 3W07A 3NEVA 4NZFA 1LROA 4WY0F 1OX6A 2BX7A 3W75A 4FF7A 4P2VA 1XDLA 1H7OA 1SQ7A 2RDTA 2GUUA 2XFWA 8TIMA 5FESA 1JCJA 4ORIA 3N9SA 1W8SA 4ZQMA 5HWNA 3W7KA 3CIWA 3LXBA 4LWWA 4R33A 2CW6A 2TRSA 4KWVA 1K7XA 3W70A 4TR9A 5F2IA 3E96A 3M5ZA 4AVFA 1AK5A 1PCWA 1GZGA 4MUZA 4AH7A 2V30A 3PBWA 2C14A 2TPSA 1RD5A 3KVLA 2PRMA 5CZ0A 3EX4A 2H3DA 3DKJA 5AC6A 1SSDA 4HNVA 1E51A 3W87A 2A1YA 4K7VA 2E1DA 4U28A 1L6YA 4ADTA 2QCFA 4R34A 1VJIA 4OGZA 2NXHA 1L2UA 1M6JA 4P61A 4YMZA 5EBUA 1J2WA 1FCUA 4AF0A 5KZDA 4R7JA 4OHQA 1LOLA 2GQAA 2XN0A 5D2WA 3I6RA 3I68A 1L9WA 1LOSA 4FB7A 5EA9A 5AHIA 3TQVA 3QSRA 1OFOA 2NX3A 3W7CA 2CLOA 5AFDA 2FPTA 3PUDA 3TSBA 3T55A 3QW4B 3DZ1A 1A50A 4UTJA 2V5BA 1QWGA 4HN4A 5KSWA 5F1UA 3IGUA 1G4EA 1B57A 5BNKA 1X1ZA 2ZZ4A 5F2LA 5CSSA 3FYPA 4A29A 1WOAA 1DJQA 4LT9A 2ZA2A 1RQHA 2WJZA 3ZR4A 3PBUA 2YW4A 3NQGA 1MXSA 3BGJA 1FWRA 1P1XA 1Z42A 1F73A 2C1HA 4UXDA 1PE1A 4IWWA 2BXVA 3WJWA 3VNDA 4GNJA 5HUOA 4IMFA 4UR8A 3L5MA 4UTHA 1PCKA 5L9FA 3PULA 4MY8A 1OFPA 4FX7A 4I7WA 1GVSA 2I9EA 2VFHA 3FJ6A 4GUIA 3EB2A 5K9XA 4PL1A 4MJZA 1IIHA 4LY8A 3GK0A 1H1YA 3IV3A 1QO5A 3I7QA 2QCDB 3NL6A 1GWJA 4A2RA 4CNPA 3STEA 1TREA 2ZRVA 4TO8A 3P7YA 4FO4A 2ZDRA 1QAPA 3C2RA 2E6AA 3BW4A 1W1ZA 3C8FA 3IIPA 1VHNA 1YTEA 2TSYA 5CGQA 2CZFA 4Y96A 1LBMA 1R2TA 1TPEA 5D2YA 2KZHA 3UPBA 2ZZ3A 2WV8A 1TJPA 4RKAA 3T4CA 4RX0A 1GG1A 4FXRA 1ZNNA 4OQVA 4QAIA 3W3OA 3N2MA 3LLDA 4DO4A 5LNRA 5D02A 2O7QA 1I2QA 3PSWA 1FXPA 5L6UA 1VCGA 3Q58A 4Z0JA 4IPIA 3L66A 1EEPA 1JUBA 4GWEA 1LYXA 3DFNA 4DEFA 1ALDA 3FKRA 3SFKA 1W5MA 1T96A 3OVPA 1WXJA 3T78A 3UD6A 4JICA 1PVNA 2HS6A 3GNNA 3JRKA 3NOEA 4HIBA 3UWUA 1YXCA 3LI0A 5K3VA 3CIXA 1KFLA 1H61A 1OYAA 1KM0A 1KTCA 2NWSA 4JTLA 5BMXA 3FJLA 3GB6A 4LVAA 3TMQA 1W5PA 4JTEA 4MPQA 2X16A 3U8GA 1UCWA 1K7FA 1P4CA 3Q37A 4JX6A 1FX6A 2NXGA 1TSIA 1QFEA 1W3TA 3L2IA 1EP3A 3LX9A 2Y7FA 3UZ5A 4PTNA 2Y7GA 3ELFA 2JKEA 1YADA 3UYCA 1OX4A 1NSJA 2EHHA 3HG4A 4EF9A 3M7WA 3HIJA 4JTFA 3LRLA 3OVRA 2LLEA 1ZFJA 1Y0EA 1R30A 4OU1A 4BFAA 5K2ZA 3GDTA 4LVBA 2OT1A 4NX0A 4PL2A 4QM1A 1LP6A 4IXHA 5FF3A 5I3KA 3W1NA 1PV8A 2B7OA 3L0NA 3LCXA 1TQXA 1H7XA 3BGGA 3QPYA 3F03K 5IBXA 4Z1CA 4HNTA 2BZNA 3B8DA 3HG3A 2YFOA 4BI5A 1PS9A 4LTSA 1BEUA 4ZL1A 3QMTA 3I7SA 7TIMA 1QPOA 1Q6OA 1G67A 2G97A 3LCWA 3TH6A 3QM3A 4M19A 4M5PA 3E02A 1TYGA 3S5YA 2NX9A 3QEZA 4IMEA 4O28A 2RFGA 1KFJA 4LW7A 4N4PA 5AHMA 6ALDA 4ADSA 3GDMA 1KA9F 3M44A 3NZ1A 3W2NA 2CZ5A 4MZ1A 1GYNA 1VC4A 1U83A 5CPLA 2CLEA 3W7EA 3KRUA 4IMDA 1A5SA 1JULA 2VEIA 4JTKA 4IUOA 5A8GA 3O06A 4GE8A 2DZSA 2VFGA 1C9DA 4O53A 4K38A 4ZQOA 5AOUA 3FS2A 1LLWA 3DGRA 4EWND 4DO5A 4YCPA 4CCDA 5K9DA 5KZMA 3P5YA 5HNRA 4GUFA 5H2ZA 3HGOA 3MI6A 2Y70A 4HNNA 5CZJA 3LV6A 2ZRWA 5AC7A 4NU7A 3NPUA 3EXRA 1YXDA 3I7RA 3KAOA 5F4XA 4NJJA 2YSWA 3DFOA 1THFD 4KFNA 1J4EA 4HKPA 3SGZA 4IOTA 3EX6A 4UTMA 3W86A 2WNQA 3QMRA 3W74A 5EPDA 2G5WA 4UMAA 1B4KA 5EKYA 4JY8A 1VYRA 1GT8A 1I2PA 3LOTA 5LHEA 2ISVA 3V75A 3W6YA 3G1YA 4NQ1A 1O5KA 2ATMA 2NWRA 3NA8A 3UPWA 3SI9A 4IQLA 2BLEA 3C3NA 1T0OA 4E2DA 2A2IA 1LM1A 1W5QA 3G22A 4GFSA 1ICQA 3CB8A 5TQLA 3A21A 3EWZA 4NT0A 4U4MA 5HQEA 1UB3A 3TC6A 1LRQA 3C2OA 4WX2A 4H4IA 1HTIA 4H6KA 1OX5A 4JN6A 1TPUA 3NNTA 3AJXA 2QR6A 4TX9A 1H60A 5U7SA 1TV5A 3USBA 1B3OA 5D2VA 1VCFA 3P74A 1TTIA 4FIRA 3RNDA 1OF8A 5LSMA 1W3IA 2VELA 4YL2A 1S5TA 2HSAA 1KM6A 5DELA 4ICNA 3E0IA 4RXFA 4H3DA 3LCGA 3W7DA 2OX1A 4UFMA 3W85A 5CPOA 1RQBA 3DKLA 1U5JA 2FJKA 2V82A 3TDFA 1EP1A 1SO3A 4O13A 3MBFA 3G18A 1TPDA 1ME8A 5LKYA 5DN1A 1JUEA 3WK2A 1ZCOA 4RV8A 2OT0A 2ZBTA 5H91A 1GJPA 3C52A 3E49A 2EAWA 3ANYA 4LU0A 2VEKA 3N14A 1M7PA 1CI1A 5I3JA 3TC7A 4MZ8A 3VE7A 3B05A 2XN2A 4R53A 1F74A 4GJ1A 1GG0A 2VFDA 3PR2A 4JR5A 1SUXA 3MYOA 5KZEA 3M5VA 4JYEA 2PE4A 2YPIA 4WY0A 2GOUA 3BG3A 4O4WA 4UFJA 3RMJA 2NUYA 1BTMA 3STFA 4S1FA 1FY6A 1Q45A 2ABBA 5I3FA 1SR9A 5IBXC 1KBJA 1W0MA 4QIUA 2BSLA 4HPXA 5LNSA 2Z1BA 3STCA 1TO3A 2V0TA 1WOBA 2DZWA 4O16A 2NUWA 5FF0A 3W2KA 4LOCA 3VCRA 5D2TA 5J5RA 1PHWA 3NPVA 3E9AA 4TIMA 2Z0IA 2W79A 5DLCA 1TPWA 2QDGA 5LGZA 5LNVA 1GPWA 5HINA 4AWSA 3G1VA 3T40A 3GXNA 2WO5A 4J9JA 1WX0A 2ZTJA 4WOQA 5HR6A 1KM3A 5AYYA 5KITA 1V7YA 1YTKA 3M16A 4K8EA 5C54A 4K8HA 1SFLA 5FF2A 4M6QA 3TW7A 1IF2A 5C2XA 3UWZA 3LM7A 3DAQA 1TTQA 4WQ6A 5A5WA 1LBFA 4LUIA 3TXVA 1PL9A 2D73A 1NAL1 5K4ZA 1TCDA 3L9CA 1LRNA 1TRDA 1KM5A 1O94A 3A5FA 4LVDA 2EGZA 3IIOA 3W88A 1CW2A 3NQAA 2ZRUA 2P1FA 5D2XA 2QCGA 3P67A 4LNYA 4M7TA 4Y8FA 3TJXA 3QC3A 1O60A 3TQKA 1EIXA 4FEZA 5IM51 3WK1A 3QSTA 3L5AA 3W1AA 1RQEA 4UC5A 3GDRA 3A23A 2YXGA 2Q8ZA 1OK6A 2R91A 3LXAA 3TAOA 2H3BA 4GC4A 1JCYA 1H50A 1TTPA 1VHCA 1TQJA 2IQTA 1JRBA 5LNUA 1X7FA 4XBKA 3LB0A 1QOQA 4IMCA 3G3DA 5BRBA 1CX9A 1KTBA 1H7NA 2B7PA 4I7UA 4CQ9A 4X9SA 5DXXA 4GUGA 1SO4A 1DQXA 2ZA1A 3R12A 4DBDA 1R47A 2GJLA 1YDOA 2ZYFA 3IVSA 5HR7A 2EF9A 1IIGA 1FWWA 3NL2A 2H8XA 1VCVA 3NPWA 1GYLA 5G2IA 5C5YA 4JEQA 4UR7A 1TMHA 1O5XA 1ML1A 2E5DA 4OV4A 4ORMA 4MFEA 4LS2A 1HFBA 3S1WA 4C1KA 1QDSA 1H51A 1DQWA 1I45A 3W1TA 3DFSA 1WYIA 3JS3A 1KFKA 4IPJA 4UTUA 3LCFA 1I2NA 2RDWA 3GVGA 4N9EA 1SZGA 1OK4A 4XTIA 4BI6A 3L67A 4WZHA 2ZQ0A 4JTHA 3B04A 3GNDA 1JQXA 2QJIA 3HG2A 3CQ0A 3EX3A 3P61A 1ZENA 2B0MA 4M7SA 4OV9A 3STGA 3R89A 2NZLA 4BI7A 2WKJA 4UTWA 1MEIA 5DCBA 4XBSA 1JCNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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