5BNKA

Crystal structure of t75c mutant of triosephosphate isomerase from plasmodium falciparum
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
246
structure length
244
Chain Sequence
RKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGCGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Probing the role of highly conserved residues in triosephosphate isomerase - analysis of site specific mutants at positions 64 and 75 in the Plasmodial enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 96
structure length 244
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5bnkA00
3LHWA 1FDJA 5GVJA 3W87A 1GOXA 5D2WA 4GUGA 5HQEA 3MHGA 4HHPA 4M19A 1GEQA 4BFAA 4M6QA 4UTJA 1VLWA 2ZYFA 1OFRA 4QNWA 4ZQOA 3OVQA 3CEUA 1LRTA 5G5IA 4XTDA 2V0TA 1NAL1 1DJNA 1OFOA 3S5ZA 2HSAA 2TYSA 1F6PA 2RKXA 1M5WA 2QUVA 4DBDA 4P61A 4UTMA 5DBUA 4N6FA 4ZVJA 5F1UA 1PCKA 3E02A 1HUVA 3NNTA 3B4UA 4Q4KA 1FCBA 5C5YA 4X9SA 3QYQA 2CZEA 4IXHA 3P61A 2E5BA 4ZQNA 3V75A 2E6AA 1GVFA 2TMDA 3TQ0A 4O11A 3QW4B 4ORIA 4DF2A 2AAMA 1OJXA 4LW7A 5D38A 3RF9A 4OWGA 3W1NA 3TNOA 4MLRA 1O95A 5D30A 1JCMP 2ZRYA 3HBLA 3C2FA 2PCQA 2YW4A 3NDOA 4RZ6A 4X22A 5K9XA 4DO4A 1OYAA 5HR7A 2NUWA 2BZNA 5D33A 4NNCA 1SW0A 3C8FA 1IF2A 3H53A 1G6CA 4CQ8A 4ML9A 1Q6OA 2RFGA 4K8HA 3CIWA 3KXQA 2YPIA 3C3NA 2KZHA 2Y7EA 4IPJA 2DZTA 5DXXA 1D3HA 1RD5A 1GZGA 2Z1BA 1EIXA 3Q2DA 5LNUA 3WFAA 5FF7A 5CSSA 3G3DA 1KFBA 3NG3A 4CNOA 4WOZA 3QZEA 4QSHA 2QAFA 3TSDA 3T78A 1QWGA 4K37A 5K2ZA 3PG9A 3KRSA 4MY1A 5KZDA 4JGDA 5AYYA 1KTBA 2E6FA 3DXIA 5AC8A 4IMEA 4AWSA 1QAPA 4AF0A 1NFBA 2J9ZA 2ZTKA 2ZDRA 4PFMA 1NSJA 1SO3A 1M7OA 5U7SA 1H61A 2VFFA 4DF1A 1TTIA 3N73A 3G18A 4XTIA 2WOQA 3W2LA 3MYOA 2YZRA 3GKFA 1DHPA 1W5PA 3NQAA 1E51A 1AW1A 4O4VA 1ZHAA 1L9WA 3LXCA 4LOCA 3BVJA 4IMGA 3W1XA 4CQ9A 8TIMA 3CC1A 5EKYA 1NEYA 1AK5A 2NLIA 2HMCA 3U6WA 3IVSA 3NQCA 5D2TA 1KFLA 3CM4A 4RR4A 3BLEA 3W6YA 4HNUA 5LNWA 5KZMA 3GDTA 3HOJA 3M47A 2WV8A 3ATZA 3H54A 4LVAA 4JN6A 4NX5A 5DN1A 4XUGA 1R46A 3TR2A 2A2IA 5AHNA 3W7PA 5K4ZA 2V30A 3EWZA 3W83A 2V82A 1A53A 3W84A 4EVZA 1TTPA 2OT1A 1SQ7A 3PBYA 5A8GA 1H7WA 1OFQA 5G1YA 1BWLA 2Q8LA 5F2LA 5E93A 3UWQA 1KFCA 1B4KA 3W2UA 3G1VA 4O0KA 2CZDA 1R47A 3QEZA 1YTKA 1Z41A 2Y85A 3OEXA 1SZFA 3W22A 1AG1O 1ZFJA 3L5MA 2FQIA 3NR0A 4O8RA 2C14A 1HTIA 1ICPA 1PIIA 3CU2A 4RLIA 3PBUA 1O5KA 3P74A 5CPMA 2DP3A 1Q6LA 1W54A 5IBXC 3M5YA 3A23A 3G8EA 2CZ5A 4BI5A 2WNNA 4O16A 1W5QA 2FJKA 2HS8A 1UUOA 4OU1A 2CLLA 5EBUA 3ZFHA 1VCGA 2NWRA 4FNPA 2G97A 2GVJA 3CLMA 1TRDA 1TRIA 1LRQA 3BV4A 1BEUA 5DCBA 2QCDA 2C0AA 4CCCA 4WJEA 3B04A 5AB3A 4ZQCA 2E6DA 3ABRA 4K36A 4QITA 4NZJA 3NQEA 1W31A 4AEOA 1K8YA 3TFXA 2ZA2A 2V9DA 1EA0A 1KBIA 2G5WA 3RLUA 2YFNA 4N2YA 1PHQA 2FDSA 2WPBA 4O4WA 3CWNA 5I3JA 2NXGA 4Y90A 3PB2A 3LCWA 2JKPA 2TSYA 3HF3A 4PL1A 3UNDA 5DCDA 1TPDA 1F5ZA 3SIZA 3NEVA 3G0UA 4WXZA 2QJHA 3KVMA 5LGXA 1TV5A 3L9CA 3DKJA 4GC4A 1IXPA 3BG3A 3NAVA 5D04C 3NPWA 4AWTA 2H6RA 3I7RA 3Q94A 3W76A 1Z42A 1A50A 3FYPA 1KM2A 3QJAA 1LDCA 2VXNA 2X1UA 5T26A 5CZSA 1P0NA 1ZY9A 1WOBA 4QJ1A 4IMCA 1W3NA 2TPSA 1SZNA 1YPIA 3O6CA 4UTWC 2ZRXA 2DU2A 3HPZA 1B57A 1OYBA 4N9DA 2FB3A 4IXXA 4WZHA 4K7VA 4YLWA 1FWTA 3L2IA 4FNRA 4LV4A 4HNTA 1JQVA 3NQGA 4NXSA 3PUDA 3NM3A 4FXSA 4Z0JA 3DHDA 3W7GA 4NNBA 1TSIA 3NOEA 4GBUA 1I2RA 1QFEA 3BGJA 4MZ8A 1YYAA 5A5WA 5G2IA 5LKYA 1K7EA 4MZ1A 4XKYB 1UUMA 3S5OA 2DZVA 1H7NA 3SGUA 1H1YA 2VOMA 1HO1A 2B7NA 1GG0A 4RKAA 1I8JA 3EXRA 4OT7A 3DENA 1J2WA 2EGZA 4Y96A 3LI0A 1JUKA 4WX2A 2J88A 3CEPA 2Z6JA 1I45A 1K03A 1MSSA 4TMBA 4JTFA 3G22A 5D37A 3B05A 3P62A 3ZR4A 2GUUA 3KVJA 1O4UA 3GXPA 2Y61A 5G2WA 1RQBA 1KTNA 2GQ8A 3U2OA 3HO8A 1HFBA 4A3UA 3BK0A 4NNAA 3W2NA 1Z48A 3TQKA 4MY9A 4PTNA 3W7NA 3KAOA 3MI3A 1SU5A 4M6PA 2V5BA 5EYWA 1H7OA 3QFEA 2WSQA 1XBXA 1OX4B 1OX6A 1VHCA 1DORA 1MEHA 3LCGA 2EKCA 3L0GA 3WJYA 4IMDA 4FB7A 1QPNA 5CKSA 1ZAHA 4DO5A 1DVJA 3HPSA 3NO5A 4NVTA 3P60A 1RQHA 5C6MA 1TTQA 3QC3A 1L6YA 3EWXA 4GFSA 5AHLA 4N6EA 3WJZA 1W56A 2DZSA 1LOSA 4RK8A 1QO2A 4OHQA 4HSNA 4MPQA 4X3ZA 2UV8G 4DBEA 3TV8A 4UTIA 3C52A 3VI2A 1OFAA 3FKRA 1TYGA 1FDZA 4JYFA 3W2MA 4K7YA 3B8DA 4GXMA 1VQTA 3NQFA 1GWJA 3M9YA 4O53A 2PRLA 3QF0A 1MXSA 2BTMA 3B06A 1QNVA 1K8XA 4LRSA 3DKLA 3W7QA 1SFJA 5F4SA 3FA5A 4GNJA 4O28A 1JRCA 3DI0A 1X8FA 1JULA 3UY8A 3MW7A 1W3TA 3NGJA 4JD4A 3RNDA 3MJYA 4AMAA 2QCLA 4XWUA 2PURA 2D73A 5FF4A 1TPVA 2A5HA 2ZQ0A 3LLFA 5FESA 1I2OA 2DJXA 4FX8A 1KM0A 5D02A 4TR9A 5FEXA 1UJPA 1OHLA 1AL7A 3TMLA 1TPEA 3TDFA 1O94A 3GKAA 1T99A 2CFFA 5G4WA 1I4NA 4TU1A 2I9EA 4O0ZA 4LS1A 2VEPA 1XI3A 2DZXA 2R14A 4TIMA 1SZGA 5L9FA 5FF2A 2VFHA 3G1HA 1W3IA 4O57A 1THFD 1DV7A 2CLMA 4UTLA 3WK0A 4N02A 1QPQA 2C6QA 1LBLA 2QJGA 2NX3A 1C8VA 1W5NA 3TC7A 1UB3A 2RDWA 3H55A 3THAA 3BARA 2LLEA 1H5YA 1I2PA 1EUNA 3RMJA 3SR7A 1RR2A 4UR7A 1KM5A 3M1ZA 4M5PA 3GAYA 2CLKA 4L4MA 3GXTA 2C15A 4MFDA 4DXVA 2GQ9A 3F4WA 3O07A 4FX6M 4BWLC 3LBMA 3T4CA 4JYDA 4MKNA 3S9YA 4A22A 1KFKA 2E68A 4A29A 1XUZA 4JTGA 1P0KA 1LLWA 3DI1A 2E77A 5CZ0A 1OF8A 3I7SA 3L67A 2X16A 3GX9A 3M41A 1C9DA 1L2UA 4LC8A 2V81A 1RPXA 4FO4A 3O1NA 1LLZA 3P8JA 3HGOA 2DORA 4JTSA 1ME8A 5K9CA 2ZA1A 4YWIA 3MP5A 4I9AA 1MZHA 1XM3A 3NQ6A 1VYRA 2CLFA 3A24A 3IRDA 3UWZA 3W07A 2QCGA 1W5MA 4GJ1A 4Z1AA 3SZ8A 2C18A 3L66A 1YTDA 3W73A 2C19A 4JDBA 3USBA 3N9SA 3P80A 4FIRA 3S1UA 5CPNA 2QKFA 3LXAA 3W85A 4E0CA 3A21A 2VFGA 2BXVA 1M6JA 3UPWA 3L65A 4NXKA 5FEWA 3IGUA 1G4TA 1TB3A 1SO5A 2I1OA 3QPYA 4UMBA 4POCA 3O16A 5HMSA 3G0XA 1ZNNA 1ME7A 4S2CA 5DBTA 1NF0A 1JR1A 4ONVA 3UXAA 3E49A 4UMCA 4UFKA 1UCWA 3BO9A 1S5TA 4FNQA 1BTMA 1S5WA 1RQEA 1ZALA 3C2RA 3FJLA 2VKZG 5I3IA 2J24A 4NQ1A 4OV9A 3S6DA 1F05A 3IV3A 1XBVA 2F7FA 2GJLA 4NU7A 4ZMGA 3G1DA 3LX9A 4IOTA 1F74A 1SO6A 4LV9A 3MBFA 1ZJIA 2VELA 4JIPA 3EX6A 4O12A 3UZJA 5KSWA 1TJPA 1QDSA 3BG5A 4O15A 3STEA 5KMYA 1ZAIA 3I68A 1TQXA 5TBOA 4XQ6A 3HQ1A 4UR8A 1RV8A 4LVBA 4FEZA 3TXZA 3KOFA 5I3FA 3S5YA 5EPDA 3THQA 2QJIA 1DQWA 1DKWA 3TSMA 5LZLA 1IIHA 3W86A 1B3OA 1YDNA 1JQXA 4Z1BA 4C1KA 1K02A 3W3OA 3PY2A 1EP3A 3C2EA 1GYLA 1EWDA 5AHIA 3R2GA 5BOOA 3W1UA 4AHOA 4A21A 1KW1A 2ISSA 3IIOA 2A6LA 2V5LA 4U28A 3CQ0A 1GTHA 5TQLA 5EL1A 3W1TA 4ZL1A 5K9DA 3LBCA 3LHVA 3S1VA 4R34A 4HNVA 1KLYA 3NQVA 4LUJA 4FNSA 3GR8A 3R8RA 3UXDA 5FEPA 3ELFA 4HN4A 4HPXA 3L21A 4FF7A 3W7DA 1FWSA 1JJKA 3MWAA 3R5EA 5FI8A 5J5RA 3TJXA 2RDUA 3W1QA 1M7PA 3UWWA 2DZWA 5CPLA 2VFIA 5C55A 2OMAA 2VFEA 4JTTA 3ANYA 4KFPA 3W72A 1WA3A 3HMJG 1JUEA 4MOZA 2DZUA 1PL9A 1FDYA 4O13A 1DQXA 2P1FA 1EX5A 3LRLA 3EEGA 4UXDA 4LVDA 1WBHA 3R12A 1KA9F 4I7VA 3W7JA 3P5ZA 1ICSA 1KM1A 2GVLA 2FTPA 3GDKA 4LT9A 4BK9A 4HKPA 3N14A 3HG3A 3NL3A 1TREA 1TPH1 4JX6A 3CPRA 4UTHA 4UFHA 2Q3RA 1IIGA 1YADA 4BR1A 2Q8ZA 1KFJA 2RH9A 2CWNA 2ZZ4A 3ABQA 3O6DA 4QAIA 3NXFA 3P67A 2I14A 4CCEA 4EWND 3GNDA 4AAJA 1KLZA 3RU6A 3N2XA 2QUUA 3AJXA 2FPTA 4UCGA 1TIMA 2QDGA 1TTJA 4MZYA 3IVTA 2A85A 2Y6ZA 1A5CA 3Q58A 1GVOA 1SSGA 3NQ2A 4FIQA 3LCHA 1PS9A 2J9XA 4ADTA 1LYXA 1W0MA 1NF7A 3EWBX 4UFLA 2A21A 5HULA 1F6KA 3IGSA 1EP2A 5K7JA 3L5LA 1LORA 3W2KA 2NV1A 4QNEA 3UWUA 3T7VA 3VKJA 2ISVA 4LC6A 5HWNA 3Q37A 4LVFA 1XFBA 3A5FA 3S1WA 1I2NA 2YYUA 3W75A 4E2DA 1F7BA 4AH7A 4O14A 4YCOA 5H91A 2ZRUA 4M7TA 1LP6A 1QR7A 1Z44A 2J6XA 3W7CA 3E96A 5BW6A 2ZZ7A 2ZZ5A 3EXTA 3EXSA 3A9IA 3HB9A 3W1PA 2GVGA 2QEZA 4UTTC 3C4UA 2Y63A 3NPUA 3DFNA 4AHQA 1H7RA 3JR2A 4PA8A 3TW7A 1FX6A 1EWEA 1YTEA 1OABA 1LOQA 3WJWA 4OE7A 4KFNA 2H3BA 4DF0A 1TV7A 3LTSA 5C54A 1JVNA 4RX0A 3IEBA 1KM4A 1TV8A 5HR6A 3DBPA 3LRKA 4ZQMA 1SSDA 2PRHA 1OFPA 2E09A 3W71A 2HTMA 4O10A 1U5JA 1K8ZA 4TO8A 1QO5A 4PEKA 3TKFA 3DFSA 3GXNA 1X6UA 1YPFA 1EPXA 3I6RA 1T8XA 2YX0A 2A4AA 3CHVA 3OVPA 4YXGA 3P82A 2W79A 2JGQA 4LWWA 2A1YA 4ICNA 1Q45A 1GVRA 4LTSA 1V7YA 4KFOA 4XKYA 4GUJA 3TXVA 3I7QA 5AC6A 1BWKA 4N4QA 5AN7A 2JKEA 1H51A 1JCJA 3EX4A 3W23A 3EX1A 1AW5A 3KX6A 1KM6A 1OFEA 2C3ZA 2QR6A 2OZ0A 4MIMA 4JXCA 2QCMA 3MP3A 3I65A 2BX7A 3LTPA 1V5XA 4ZQPA 2H8XA 4H3DA 1H60A 5LGZA 4WY0A 2Y7GA 1FY6A 2YCEA 4OQVA 4DQWA 3PSVA 4O52A 2ZCGA 4X2RA 1WAUA 1KFEA 2VFDA 3BLIA 4JNMA 3RFAA 1H1ZA 1OVDA 3FJ6A 1U83A 2XN1A 1AW2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FDJ A;  3W87 A;  2BS9 A;  1A5U A;  3D46 A;  1GOX A;  1XQK A;  3MHG A;  4M19 A;  1GOO A;  2GFT A;  3V16 A;  1UQY A;  4M6Q A;  4BFA A;  1G1Y A;  2ZYF A;  1OFR A;  3AIQ A;  5CSY A;  3OVQ A;  4RZB A;  3DYO A;  1NAL 1;  1DJN A;  3ARU A;  4AY7 A;  4LBR A;  4DBD A;  2D3N A;  4P61 A;  2ON3 A;  4HMC A;  4N6F A;  5F1U A;  3TYZ A;  2PTX A;  3NNT A;  4AU0 A;  1QK2 A;  1F3E A;  4JHM A;  3B4U A;  4Q4K A;  4YWS A;  4LF1 A;  3QYQ A;  1MYR A;  3GH4 A;  4AY8 A;  5ECU A;  3P61 A;  3QHN A;  2WJF A;  3MKC A;  4DF2 A;  3EB3 A;  2DUZ A;  1AOD A;  3CAW A;  3TNO A;  4EE9 A;  4GZJ A;  2OYM A;  3OOD A;  2IKG A;  1KGW A;  2ACU A;  1N82 A;  4FZI A;  3NDO A;  1V3M A;  3VGG A;  3ZR5 A;  2BZN A;  4YYF A;  2FMN A;  4KT2 A;  5DX7 A;  3TTE A;  2VT0 A;  3TWB A;  1OIN A;  4DBW A;  1G6C A;  1HP4 A;  5FKY A;  3OIH A;  4K8H A;  4XD4 A;  2Y7E A;  4IPJ A;  4EKJ A;  4DI9 A;  1XYF A;  3R6I A;  4ZA0 A;  1UIO A;  4ES4 A;  2PS2 A;  5CSS A;  3OLI A;  3AYV A;  3NG3 A;  2DSZ A;  2SFP A;  1DWF M;  2QAF A;  2WYS A;  3TSD A;  4NRS A;  4PUE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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