5F4XA

Fructose-1,6-bisphosphate aldolase k229m mutant from rabbit muscle
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLMPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
publication title DECYCLIZATION DETERMINES DIASTEREOISOMERIC SUBSTRATE SPECIFICITY OF MAMMALIAN CLASS I FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE
rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 138
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2015-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5f4xA00
1YTDA 3F4NA 4FNSA 3NPXA 3E96A 4AF0A 3KRUA 3NL3A 3HGRA 2TRSA 5CPNA 4JY8A 2XN0A 3PSVA 3STFA 4CNPA 1L2UA 1GJPA 1NEYA 4O11A 1RD5A 1TO3A 3H55A 3O05A 4ZZ9A 1TPB1 4U4MA 3S5YA 1ZAIA 1XBYA 5E1QA 2ZZ2A 4JTKA 4O28A 1H1ZA 1U5JA 2ZFAA 1GZGA 2CLFA 2QR6A 4N9EA 4MZ1A 1KM5A 1QFEA 1GTHA 5C2XA 3TX9A 5D2TA 4RLIA 5HR6A 4AWTA 3HQ1A 2ZZ5A 1ME8A 1RQHA 3P8IA 2VXNA 3CQ0A 5EPDA 1KBIA 4O16A 3VE7A 3GYEA 4JTGA 3HB9A 2TPSA 4BFAA 3ABQA 1SZNA 1LTDA 2I9EA 4FNTA 3L5MA 4GRSA 2BWGA 4RX0A 4IMCA 1JCXA 1VLWA 3TQVA 1E51A 4FF7A 3LHWA 3LERA 1FBAA 3CM4A 3TIMA 3R5EA 3W7OA 3BG3A 3A24A 3G8EA 1TV8A 1TV5A 3SSJA 3QH2A 3W1TA 3E49A 3LBMA 5D02A 4O0ZA 3QW4B 2ABAA 1WA3A 2CZEA 5SWUA 3E02A 1QWGA 1TRDA 5FF4A 3TFXA 3P81A 1A5AA 4Y6GA 2X2GA 1LBFA 4FNPA 2YR1A 2ZTJA 1XBXA 5G2IA 4MYXA 2Z2UA 3NXFA 3THAA 4NJHA 4TX9A 2QCNA 1Z42A 3SFKA 3PB2A 4QISA 4LUIA 3IVUA 1UUOA 1ML1A 4XBKA 2GQ9A 2J27A 3QMRA 5KITA 1QPQA 5EL1A 3W84A 2YYUA 4FXSA 1QNVA 5K4XA 4XTIA 1TQXA 1OX4A 4AH7A 4Z08A 3FYPA 4EF9A 2FIQA 1RV8A 1H5YA 2Y88A 5C55A 3NOEA 2J9YA 4GNJA 4MVAA 3S5OA 3W71A 1LRTA 3DKLA 4H6KA 2NWSA 5F4WA 4I7VA 1UBSA 4PL2A 1RVGA 3MWAA 4DO4A 5J5DA 2Y6ZA 1NFBA 3FLUA 3PY2A 4CQAA 1P4CA 1GVRA 2A5HA 5K7JA 4N6FA 4XKYB 3CWOX 2NUWA 4DPPA 3ABSA 3HPZA 3G0XA 1C8VA 3N73A 1H50A 3GKAA 3C56A 3S6DA 2ISWA 3N9SA 3W76A 2OT1A 3M1ZA 3FFSA 1LDCA 1I2NA 1SSGA 5C54A 2EPHA 4UUIA 1IXOA 1XDLA 4LU0A 3MI3A 1YLVA 3NQCA 1VQTA 3P80A 3PR2A 3B8DA 2OCZA 4PA8A 3UWYA 1SO4A 2WSQA 4O13A 5FF2A 3LHTA 1RQBA 3LLFA 3PSWA 4K8EA 5EYWA 4AWSA 5MHBA 5F2LA 3SECA 4QQ3A 3C52A 2KZHA 4LVDA 1F05A 3L0NA 1ZAHA 1K7EA 3TDFA 1IXQA 2WNQA 3GDMA 2FDSA 3G18A 3GZ3A 1IGSA 1GVSA 3QMSA 3HF3A 1G7VA 3TC6A 3OEXA 4IMEA 4WQ6A 2R14A 3GDRA 3IRDA 2WJZA 2NXIA 1XKYA 3P67A 2YW3A 2RDTA 5LSMA 1W5PA 3W7PA 1HL2A 3INPA 4I7WA 4DEFA 4NNAA 3I6RA 4UFKA 3VFLA 3DFOA 1C29A 1SR9A 4POCA 4FX6M 3PM6A 3F4WA 3YPIA 1LCOA 1SZFA 5DELA 4EIVA 2HTMA 3TMLA 1SW7A 4M6PA 1THFD 3TE9A 3LGEA 3W1RA 1J4EA 3W23A 3W88A 3TXVA 1M6JA 3UYCA 2Y7EA 5F1VA 2NX3A 1GVQA 3DENA 4UTTA 2W79A 2DU2A 1SUXA 1SFJA 3CC1A 1X6UA 1YADA 3CIXA 4QSHA 1XC4A 4IQLA 3BGJA 1FXPA 1ICPA 1J5TA 2TMDA 1SO6A 1UUMA 3S1WA 1PHQA 3C3NA 2G97A 1FY6A 1R46A 1JCLA 4B5NA 3VCRA 1XFBA 2O7SA 2VC6A 1F5ZA 2RFGA 3P62A 4X9SA 3RFAA 3NO5A 1P5BA 2VFFA 3AJXA 4UNLA 3CB8A 1AL8A 3TQ0A 4O17A 4NT0A 3U8GA 4TMCA 3R12A 4ADUA 3HGSA 1DQXA 5I3IA 5D38A 3GK0A 3CT7A 3G24A 3BLIA 1EUAA 1Z48A 5FI8A 1F73A 4A21A 5I3GA 4A22A 4JYFA 1GYNA 4XKYA 5F2IA 8TIMA 1OFBA 4YCPA 1B4KA 1F2JA 3SIZA 3STEA 2DZSA 4R33A 3PULA 2QCFA 4NXKA 4O14A 3KVJA 3PB0A 4NX5A 3W1UA 2QEZA 5LHEA 4JS3A 1W37A 3M5ZA 1TTPA 3N3MA 1N8FA 2HS8A 2ZQ0A 4OE7A 2V0TA 5CZSA 2Q8LA 4MJMA 2RKXA 4JXCA 2Y63A 3NQGA 3UNDA 1DBTA 3Q94A 3D0CA 4LS0A 4DXVA 1NAL1 3T4CA 5K4ZA 4O54A 5LNVA 4BF9A 4UTKA 4O50A 3DFSA 3NQDA 1UCWA 4UTMA 5K9CA 3MHFA 3LCHA 1VYPX 3PBUA 1QPOA 4GUIA 1FXQA 4UFJA 1Y0EA 3PC0A 3E9AA 4U28A 1TPEA 4UFIA 3PBWA 4LVAA 3TSBA 1KLZA 5CG7A 4BWLA 2NXGA 5CSSA 3KVKA 1NF0A 3W7IA 3C6CA 3NPUA 1TJRA 4P61A 4OWGA 1KFCA 3W7JA 3UWZA 3GLCA 1S5TA 2E6DA 1PIIA 5HWNA 2A6NA 3GB6A 4JR5A 3UWUA 2JK2A 1WXJA 4K38A 1BWKA 2O7QA 2ZYFA 1OFQA 2A7NA 3E0IA 3VNDA 1Q6RA 3I7RA 4O1DA 3NPVA 5F4SA 3KX6A 2PCQA 1F76A 4IMDA 1LBLA 4N9BA 5C5YA 2TSYA 3LI1A 4CNOA 1RPXA 1ZENA 1DVJA 1LOQA 1SW0A 3RF9A 2ZRZA 1O95A 4A2SA 3QEZA 3T44A 2QCLA 4JGDA 3P82A 2JGYA 3NAVA 4PC8A 3B0PA 5AHEA 3CIWA 1KW1A 3NR0A 5HJLA 4M5PA 4O12A 3S9YA 2ZA1A 3CHVA 3M44A 5DXYA 1QCWA 1VYRA 5CSRA 1JCNA 1HUVA 1ICQA 2NV2A 4MFEA 3GAYA 3M5VA 3MYOA 4MZ8A 1WX0A 3NQAA 1WOBA 1VLIA 3RK8A 1FCUA 1AK5A 2YDAA 1S5VA 1AG1O 3WJZA 2E5BA 4WXZA 3BO9A 3LRLA 3C8FA 4BI6A 1BKSA 4ORMA 3M6YA 1OFAA 4EF8A 3R8RA 2CLLA 4KWVA 3QQ1A 2QCGA 3G1FA 4O1CA 3DFPA 2FPVA 3GXNA 3DGRA 1KFBA 3N14A 1P0NA 4WUIA 4CQ8A 3PUEA 5FEXA 3PUOA 1SO5A 3I7SA 5H2ZA 3G22A 1TPDA 2ZRWA 3IIVA 1QDSA 4RV8A 1A5CA 1DQWA 1T8XA 1PCWA 1LRQA 3LXBA 1ZY9A 1XM3A 5BRBA 3NZRA 3TSDA 3KRSA 3LLDA 1W1ZA 3W1PA 5F4XA 1LLZA 2V30A 4O53A 2AGKA 4GFSA 3M0ZA 3S42A 3SGUA 1KFJA 4MOZA 5G4WA 4WXYA 4Z1BA 1ME9A 3EXRA 3NA8A 2B7QA 1BTMA 5LGXA 2CLKA 1GPWA 1OX6A 3U2OA 1EA0A 3IV3A 2FB3A 3LCWA 2E6AA 3N2XA 3L21A 1MEHA 7TIMA 4M7SA 3GDLA 2Z0IA 3STGA 1C9DA 2E68A 3S1XA 5LNRA 1B57A 1FDJA 3P8JA 1KM0A 2QUTA 4IX0A 3TAOA 1M7OA 4OGZA 2DJXA 2VOMA 4MKNA 1Q6OA 4NUWA 4GUGA 3L0GA 2X1TA 3EEGA 1R30A 3SZ8A 3A5VA 3LHUA 1YPFA 3OG3A 2OT0A 3E12A 4CCEA 5CGQA 3DBPA 4AAJA 4M7TA 2VKZG 2GJNA 4YL2A 3PG8A 1YTKA 3L5LA 2H3BA 1KTBA 2YXGA 3DI1A 3NL2A 1T0OA 1KM4A 3BV4A 3GAKA 3ELFA 2PURA 4K8HA 4LNYA 5D04C 3BVJA 5K9DA 2G95A 3SGZA 2DZPA 1NVMA 1AW2A 1JCJA 4CCDA 2ZZ3A 5AHLA 4CNNA 1JVNA 2V2HA 2YSWA 1VYSX 2E09A 5AYZA 2VFIA 4O19A 1QO2A 1MSSA 1FX6A 3NPWA 3SJ3A 1G69A 2FQIA 4O1AA 1QAPA 1TCDA 3M43A 4DELA 1OX5A 4PODA 3I68A 3CEUA 4JD4A 3L9CA 3T55A 1D3GA 1IXPA 2BXVA 4W9TA 4HSOA 2VFHA 1K03A 1KBJA 3G3MA 2GVGA 3TAKA 2BSLA 3DKJA 5F1UA 3BW4A 2WOQA 4MYAA 4WJEA 4A29A 4S1FA 4ZQMA 3UY8A 4FX7A 1GYLA 4LOCA 2ISSA 3A9IA 3FKRA 1OK6A 4RZ4A 1TPUA 2DZVA 2WNZA 2QCDB 4OV4A 1B4EA 2E77A 4UTHA 3W7QA 4QITA 1XI3A 1VHCA 3QW3A 1ZCOA 1KA9F 3MUXA 1DJQA 4M6VA 3IGSA 3C2FA 1H51A 4ONVA 3LHYA 5IBXC 3WK2A 4A2RA 5EA9A 1JQVA 4UMCA 4PL1A 1YXDA 4PEKA 3W1AA 4BI5A 2IQTA 4LC8A 4Z1AA 1TSIA 1S5WA 3S8HA 4O8RA 4FX8A 3N19B 1GEQA 3FOKA 2WNNA 2R94A 3TC7A 1LLWA 4DF2A 4JDBA 5HWMA 3C2OA 2C1HA 3ZFHA 3O16A 3HG5A 3W2UA 1LBMA 1XUUA 3ZR4A 1ADOA 5KINA 2WSRA 1Q6QA 3O1NA 4OU1A 5FF7A 1LORA 2P10A 1FQ0A 1J2WA 3HBLA 5TBOA 2OMAA 3LRMA 2H8ZA 3W7EA 4XTDA 4N4QA 3NQ6A 2Q3RA 5E0KA 4KFNA 3H54A 3TKFA 4AWUA 3W07A 1AW5A 3W7HA 1OFDA 4L4MA 2Y89A 2C3ZA 4UMAA 3CEPA 3NQMA 2PC4A 1KM1A 3NEVA 1JUBA 2X1SA 2I1OA 2YCEA 2GQAA 1WQ5A 2V2DA 2WKJA 1PL9A 1JJKA 1O5XA 4JTJA 5K3VA 1CX9A 2DORA 3O8AA 4YWIA 3W87A 1V7YA 3EXSA 1JQXA 3BG5A 4RJEA 2FJKA 4NJKA 4QNWA 4CCCA 3LB0A 4MY8A 3W9ZA 3GR7A 4O4VA 1VGAA 4ZQOA 1FUYA 2NUXA 3C2EA 2A1YA 3EB2A 5FESA 3MP5A 4HPJA 4AHOA 3RLUA 1H62A 2CFFA 1AW1A 4FNQA 1F7BA 4FXRA 3W72A 2OZ0A 2HSAA 3BK0A 1XCFA 3Q2DA 1SPQA 4NJJA 2E1DA 3WK1A 2R91A 3LCFA 3TJXA 4KWWA 3C2RA 5CZ0A 1WYIA 4ZQCA 4IXHA 2F7FA 1LM1A 2JBMA 3G1VA 3IIOA 3DU0A 2Z6IA 1EP1A 3V75A 1ALDA 1XBZA 5D32A 4QIUA 2QCDA 3W86A 2CZDA 1SSDA 1G6CA 4FNUA 2H3DA 4GE8A 2V5BA 2P0OA 4TIMA 4DQWA 3G1AA 1PVNA 5J5RA 1TPH1 3LXAA 3IVSA 2XN1A 3W75A 1GQNA 1PE1A 1OF6A 3PWAA 3UQNA 3PAJA 3OVPA 3DHDA 4YLWA 4HIBA 4UTTC 3O6CA 1L6YA 3MI2A 4IXXA 4LVBA 3OVQA 5CPMA 2ZRUA 2A7RA 3OHIA 3NDOA 3EX3A 3EX2A 3L66A 2JGQA 4LUJA 2E5DA 4JX5A 3GNDA 3KRZA 3JR2A 3QYQA 5F2MA 3N9RA 4XZ9A 1W5NA 2B0MA 2VEMA 4CQ9A 3BW2A 4MY1A 5DBUA 2QUVA 4EWND 2B7OA 3FIGA 3VE9A 1W56A 4IJBA 3MBDA 5C6MA 1GG1A 2ZA3A 3O07A 1YTEA 2QJIA 1RR2A 3PG9A 1UASA 3O6YX 4EVZA 4Z1CA 5D03A 3TXZA 1W5QA 1H7OA 4MLRA 4ADTA 2A0NA 4ICNA 4ALDA 3GDKA 3LM7A 1I2OA 4D2JA 2DZWA 3KFTA 1Q3NA 4AHPA 2OJPA 4JTUA 1W8SA 3QFEA 3NQVA 3W22A 3H53A 3L68A 1OFOA 3FKKA 1U83A 2Q8ZA 4LWWA 5I3HA 4K6AA 1ZFJA 2QF7A 1TREA 4AMAA 2ZZ7A 5FEPA 5AYXA 3QRHA 2TYSA 4DO5A 4XQ6A 3QPYA 2I14A 2J88A 3G8RA 4RXGA 4K7YA 3I65A 3TSMA 2X1RA 1I45A 3UD6A 3ATYA 4FEZA 4R53A 1GVFA 3LCLA 3N34A 5AC8A 3BPWA 3BLEA 3GVGA 3WJWA 3ABOA 1I8JA 2R8WA 4NVTA 4R34A 4DF0A 5T26A 4P2VA 3TFCA 1K8ZA 4NNBA 4NXSA 3GX9A 4ADSA 5CPOA 3FJLA 4S2CA 1YDVA 5AC6A 1KLYA 3L2IA 4Q4KA 1DL3A 3EWYA 4MY9A 5H91A 2CLHA 2H90A 3B04A 3V1PA 1XL9A 4UTJA 3O06A 1FWWA 4BWLC 1G4TA 1BEUA 3HG2A 1GT8A 4O0KA 2ZRVA 1FCQA 2YX0A 1R47A 2RDUA 1L6SA 4GXMA 3EX1A 3DFQA 2F84A 4GUFA 5AHFA 3IGXA 1GTEA 3WJXA 1DORA 1OK4A 4X22A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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