5FOOA

6-phospho-beta-glucosidase
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
463
structure length
463
Chain Sequence
MLAFPKEFWWGGATSGPQSEGRFAKQHRNLFDYWYEEEPDLFYDYVGPDTASDAYHQIESDLTLLASLGHNSYRTSIQWTRLIDDFEQATINPDGLAYYNRVIDACLANGIRPVINLHHFDLPIALYQAYGGWESKHVVDLFVAFSKVCFEQFGDRVKDWFVHNEPMVVVEGSYLMQFHYPAIVDGKKAVQVAYNLALATAKVIQAYRRGPAELSDGRIGTILNLTPAYPASQSEADMAAAHFAELWNNDLFMEAAVHGKFPEELVAVLKKDGVLWQSTPEELALIAENRVDYLGLNFYHPKRVKAPDAIPVISPSWSPEWYYDPYLMPGHRMNVDKGWEIYPEAVYDIAIKMRDHYDNIPWFLSENGVGISGEDRYRDETGQIQDDYRIQFLKEHLTYLHKGIEAGSNCFGYHVWTPIDGWSWLNAYKNRYGLVENNIHTQVRRPKASAYWFKKVATHNRLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords 6-PHOSPHO-BETA-D GLYCOSIDASE
publication title Chemoenzymatic Synthesis of 6-Phospho-Cyclophellitol as a Novel Probe of 6-Phospho-Beta-Glucosidases.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pyogenes
total genus 194
structure length 463
sequence length 463
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2015-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fooA00
2GVYA 2VZUA 2VZTA 3VMOA 1JYVA 4CKQA 3FHQA 4F9JA 3UETA 1KQYA 3U7BA 2YDRA 1C7SA 1XH1A 1GOKA 4ML4A 1E6QM 3VM7A 1PAMA 3AZRA 4W87A 3TTQA 3VPLA 2QHAA 4JCMA 4D1JA 1UKPA 5BXPA 1WZAA 3NDYA 1ZB5A 2E0PA 2C0HA 3AIEA 5EMYA 4W5UA 4J28A 1JF5A 3PTQA 2J62A 2JIWA 2PI6A 4WSJA 1OCQA 4HU8A 4RL3A 3A4XA 1ISZA 4AZHA 1Z32X 1M53A 3KL5A 1QI5A 4W5ZA 4UOQA 4URIA 3EMCA 3WH9A 4TTGA 2HVMA 1HVXA 3AMDA 3K4AA 3RCNA 4WLCA 5ABFB 6A3HA 1EXPA 1B90A 2V3GA 2XYLA 2FGZA 1GJWA 2DGAA 2YKKA 4JL1A 4B3LA 3U7VA 3WQ5A 1UKQA 1I1WA 1WDRA 1FFQA 3VNZA 3ZQ9A 2WLZA 1EO5A 3CUGA 5JBFA 2X1IA 2XVKA 2PB1A 5I0DA 4Y7EA 2ZWZA 4GIAA 3E1F1 3WFZA 4CU6A 2V5CA 4Q7NA 3SUVA 1TR1A 3GNRA 2WVTA 4A3HA 1JI2A 2D22A 2WZIA 4DUVA 4JAWA 4EK7A 1Q6GA 1UWUA 3UCQA 2X09A 4N0RA 2A3HA 2Y8KA 1H5VA 4YHGA 2CBUA 2UY5A 3WF1A 4UOJA 1W9DM 3POCA 4HMEA 5A8QA 1UR8A 3L4XA 1US2A 2CHOA 1HT6A 1PJ9A 1Q6FA 3WQ8A 4EAMA 4PUEA 3AFBA 4UFHA 3RM4A 4MAZA 4P8VA 1JZ5A 3OGRA 4J3UA 1UYQA 1JDDA 4TVDA 4UZSA 4CCEA 1MFVA 4HTYA 1G0CA 3WFLA 5F7UA 4CD6A 7A3HA 5CQ1A 4W7WA 1DWFM 2CEQA 1H09A 4H04A 3AS1A 5HPOA 4QP0A 2D0HA 2TAAA 1H0GA 5KEZA 1UZ1A 3LMYA 2WVUA 1V0LA 3T08A 1UR1A 2E4TA 2D3NA 3OLEA 4GO8A 1E6SM 4YPJA 5M03A 1W9BM 3L4WA 2JFEX 1UKOA 2GDVA 4AEFA 1BVNP 4MAVA 1A3HA 4HPHA 3L4ZA 2E9LA 3PZQA 3D5HA 4AEEA 4QDMA 3WH7A 4B15A 2O9TA 3DHPA 3WQ4A 1C7TA 3OZPA 4GO9A 3DYMA 4BS0A 2W61A 3IAPA 4MPKA 1DTUA 1UKTA 4H8UA 5CJ5A 3WBEA 4ATWA 3DECA 2CIPA 5HPCA 3L4UA 3J7HA 2WBGA 1PZ2A 3EMQA 3VM5A 2WW5A 3SUWA 5CLWA 1ZBCA 3VX0A 3MANA 4P7QA 3BMWA 3MO4A 1W3LA 2G3NA 4HA1A 1H11A 1ZBKA 2O9PA 5ABHA 2W91A 4AZBA 3AIBA 1B2YA 1JIBA 3F5KA 2VX4A 2V3EA 1V6YA 1V6VA 3ZT5A 1WNOA 4PMVA 1PIGA 4CN1A 4PTXA 2XSBA 1U33A 4JIEA 3SUUA 9CGTA 1IV8A 3L4YA 3ZSTA 3AI0A 2WMIB 2VC9A 2WMJA 3POHA 1ECEA 3HMCA 2CBVA 4D6CA 5HBFA 1X6NA 3MU7A 1D2KA 3IJ9A 2ZUWA 3WUGA 1JAKA 1XD1A 3VDHA 1V02A 5I78A 5D4YA 5JIWA 2GUYA 4M8UA 2W67A 2XG9A 2YDSA 4PMXA 1C8YA 1HN1A 1B3ZA 2OSXA 3JUGA 1CNVA 3WNOA 5I6SA 1R7AA 2ZXAA 4NF7A 3VMPA 4E2OA 3U57A 3IANA 1V3JA 4U2ZA 3ZT7A 1JZ2A 4MB1A 3S6TA 3OGSA 4CGTA 4X9YA 1JYXA 3NCOA 3PZOA 5M5DA 3PZMA 3OLDA 4PTMA 3AMCA 4HU0A 4D6FA 2WMGA 1UD8A 1JI1A 3QOMA 1V6UA 1C3FA 1Q4NX 2PBGA 2QV4A 4D6HA 1WE5A 2PWDA 3UG5A 1QI3A 3VD5A 4CCDA 4XUYA 5HDRA 2E8YA 3N13A 4ACYA 3OLIA 1JL8A 1HJSA 2RGMA 1AMYA 1UA3A 5JBEA 3NSMA 1VF8A 4U2YA 3SEPA 3ZJKA 2D23A 1E6XM 1V6WA 1G9HA 1J11A 1J18A 3BLKA 1V0NA 1IZJA 3CMJA 3CIVA 1W3HA 4N42A 1GOIA 2MANA 2EPKX 3WIJA 3TTSA 5EB8A 5A1AA 4UFJA 5I79A 2E8ZA 4WKHA 3WDJA 1J12A 1BYDA 3WEOA 2CYGA 3K46A 2BHZA 1OB0A 5BCAA 4P7RA 3SCUA 4AD0A 4U5IA 4F8XA 5A8OA 4GI9A 2G8ZA 2G3MA 2WHMA 3ZOAA 1J0ZA 1KGUA 2YLAA 3CUJA 1J10A 3APGA 4PMQA 3IJ8A 4JFVA 4PEEA 1FFRA 3WQVA 4HA4A 4FMVA 1FH9A 4HZ6A 3EDKA 4E8CA 4M81A 3GNPA 3BC9A 1QNQA 1LJYA 1CGYA 4J3SA 1B3VA 3NUKA 1VFFA 4PCTA 4DWSA 4GQRA 3VGGA 2VL4A 3NYDA 1V02E 4Z2IA 2VR4A 3CZ8A 2PWEA 3PZVA 3WDIA 1E70M 2EXOA 4W88A 1QNRA 2V38A 4ATDA 2BY1A 1FP8A 1HVQA 3AIUA 2BNJA 1ISWA 1GOMA 4C7FA 3ARRA 3SCTA 3VDCA 1E15A 3OZOA 4TOQA 2VCCA 4AD1A 5DMYA 5E6ZA 4H8VA 2ZOXA 1CECA 3WKZA 4FLOA 3A3HA 1VEPA 2JEPA 2X2YA 1MXDA 2OWCA 2WZHA 2WKGA 3PTMA 4MDOA 1SMAA 2O9OA 1VFOA 1BHGA 2WSPA 8CGTA 3GBEA 3UEQA 1V3MA 1QI0A 2FH6A 1AQ0A 2FHBA 2XGIA 1VEMA 4CN4A 1ODUA 4C7DA 1L0PA 4MNJA 2ZUTA 4OOZA 4W8LA 1E55A 2UWFA 5A95A 3UG3A 3WNMA 5I3DA 3W38A 2J47A 1UD2A 3OG2A 1XYFA 1VIWA 4MDPA 4GXPA 1TE1A 2JEQA 1JNEA 3CUIA 4F9DA 1V03A 2CCRA 2WK2A 2NT0A 2WMIA 3FW6A 1VEOA 1VRXA 1CXKA 3AOFA 3VIHA 3GYCA 1U2YA 1EGZA 4FLQA 2VRJA 4D1IA 2D20A 1HKJA 2UY2A 2IUZA 3WNKA 4IUGA 1OWQA 4PMNA 2PWGA 2DT3A 4PN2A 1W1PA 3WY1A 1BAGA 4Z2GA 3BAXA 3ZIZA 4DUWA 3WMBA 3AISA 4QCEA 2WYSA 1JGIA 3RIKA 2WBKA 2J8GA 5E6YA 1RH9A 4U31A 1JF6A 4QAWA 2IXVA 2CBJA 3CLWA 1E4NA 2EBNA 1MW0A 3AS0A 2WVVB 4KMQA 4JL2A 3WH5A 3KL0A 2VMFA 1W9UA 4GINA 5HXMA 1FA2A 3EYPA 4LPCA 1FP9A 3CZGA 5DEZA 3WUBA 1E0XA 1KR1A 3T0DA 3MSGA 3VGDA 3HU7A 4CVUA 1JZ8A 4MNMA 2A3EA 2ZXBA 4TX8A 5DFAA 4NRRA 1E5JA 1KB3A 4UQDA 3FY1A 1H41A 1GOQA 2Z1SA 5FIPA 2XHYA 4AYSA 1KXTA 2CBIA 4FLRA 1HJVA 1V0MA 4WJXA 2DSVA 4OUEA 3ARQA 4XV0A 3N17A 3ZSSA 1LWHA 5FL1A 3TTOA 5LA1A 1ODZA 1HJUA 1JZ4A 5BXTA 2V3DA 2D0FA 2J78A 3MS8A 3A4AA 2WPGA 1FHLA 3L2LA 3N11A 2CNCA 2G4FA 5M17A 2VCBA 5DF0A 2FH8A 1TMQA 5A6JA 2J7FA 3RDKA 4HA3A 1BVZA 5BRPA 1VJSA 1LLOA 2EEXA 5IDIA 4WKFA 4WSKA 1W32A 1NOUA 2CPUA 3GXFA 5DT7A 1KCLA 3HN3A 3VIPA 5EFFA 5AC5A 1J0KA 4M1RA 1CBGA 1WCGA 4XZWA 1JZ6A 1CGVA 1MWOA 2WCAA 3BLPX 1QBBA 1W2PA 3L4TA 3W26A 3OGVA 3FAXA 4XZBA 1OBAA 2CETA 3NIYA 2D3LA 1K9FA 3TA9A 3BAYA 4J3XA 2GFTA 4JFUA 1CTNA 1DWJM 1E3XA 3KL3A 1HJWA 2BHYA 4BF7A 3M7SA 1UWRA 1W91A 1FH8A 1B9ZA 1F4HA 5AYIA 3W6MA 1E9LA 4CN6A 1UR9A 4CU7A 3RO8A 5A6MA 1C91A 1LG1A 2VTFA 4MTVA 3PHAA 1UWSA 1MW3A 1UUQA 1CXHA 2W4XA 1NWRA 1FOBA 1P6WA 3EMZA 1LL6A 2YIHA 5A2CA 1JYNA 4JKMA 2PWHA 5AC4A 2NT1A 2C8NA 2O92A 4AC1X 1C93A 3K1DA 3OLGA 4CVWA 3SURA 3K8KA 5GNYA 1KR0A 3WUFA 5E09A 1H2JA 1V3LA 4KWUA 4W8AA 4WIWA 1H1NA 4Q22A 1R8LA 2UY3A 1HNYA 4HMCA 1LL7A 2CKRA 3VIMA 1IT0A 1JZ3A 3WNNA 1GOWA 3SCOA 3AHXA 5I2UA 5A6BA 3PZ9A 1ZU8A 5CPSA 3WF0A 1ZS2A 4HOZA 5I23A 1HF6A 3B9AA 4H2CA 2WWCA 4AZ7A 4BA0A 4D71A 2GK1B 2BV9A 1KWKA 2ZUNA 4EE9A 2ZWYA 2YA0A 2WMHA 4UTFA 1AQHA 3VVGA 4CD7A 1DWGM 4M29A 4AWEA 4F66A 3TOPA 3VU2A 5CPTA 3AIQA 1UH4A 3AROA 2VOTA 1NM9A 2VZOA 4X0NA 1NWUA 5FL0A 1CXFA 1BGAA 2PF0A 1BYBA 1GHSA 1E4LA 3A47A 4NSBA 2WCSA 2BHUA 2BFGA 2ZUMA 3L4VA 4PSPA 1NQ6A 2OWWA 1NOWA 1YQ2A 4LYPA 2XGBA 2WVVA 4V28A 3WD1A 1HL8A 1JD9A 1UZ4A 2W63A 3LPFA 2VJXA 4A3YA 1US3A 4Z2LA 1ISXA 1GW1A 2EPLX 3QHMA 1WZKA 3FAWA 2WB5A 3AZSA 2ESCA 2EPNA 3VGHA 2CHNA 3OBAA 1UH3A 3AYRA 3T2QA 3W24A 3PZIA 4BZYA 1DWHM 1JD7A 4UQCA 2CERA 4AIEA 1DHKA 4AZ6A 3QOKA 3AHVA 1BGGA 2BS9A 2GJRA 3K4DA 4FK9A 5I77A 4UQEA 3N1AA 1H3GA 1WKYA 4NZCA 4ZEPA 4TTUA 2DQXA 3VDAA 1GONA 5IXEA 3VTRA 3W82A 5JIPA 1E5NA 1JXKA 8A3HA 1GZJA 3AS2A 4HOXA 3PZUA 5A69A 3WUEA 1SR0A 4E8DA 1G1YA 1TVPA 1Q6EA 2PC8A 5IHSA 2XIIA 3N9KA 3MMDA 2BXYA 1CIUA 2A3BA 3QGVA 3ALGA 5C8BB 4ATLA 1NOFA 1UWIA 2YL8A 3SCRA 1LF1A 1PX4A 3OB8A 4W93A 3T2OA 2X0YA 3VIJA 4LQ1A 5GNZA 5A3HA 3LPOA 1OM0A 1XSIA 3CMGA 1WZLA 1MVYA 4ZFMA 2XJ7A 1F4AA 2QPUA 1DP0A 2EPOA 2OYLA 1KBKA 1EHAA 3AIVA 3BCDA 3AIWA 3ZR6A 5A6KA 1CLXA 1S46A 4QLLA 6CGTA 4BQ3A 3ZJ8A 2DH2A 3ARSA 2VQUA 4FF5A 2DT0A 2GJXB 1TA3B 1E6RA 2A3CA 2ZICA 5D9PA 4GZIA 3AHTA 4P7NA 3WENA 1CWYA 2F2HA 3FHAA 5A94A 5BWFA 2G41A 2BY3A 3RPMA 4R5EA 4PMRA 3AMGA 1HP5A 3WN6A 2JE8A 1W1YA 1HKMA 4JCLA 4P8UA 1TVNA 4MNLA 2J4GA 4TX6A 1UH2A 4RE3A 5ABFA 1PZ3A 4JKKA 3MUZ1 2X0HA 4IISA 2D1ZA 4PSRA 3CUHA 3UESA 2XIBA 1LQ0A 1XHGA 2NW0A 1M01A 3AYSA 1EH9A 2DPEA 3SCNA 1A47A 1CXIA 2WMKA 4BQ4A 1GUVA 4W89A 5HNNA 2J74A 2YL9A 1GQIA 2G3IA 2WHKA 4PMDA 5D9MA 4JZ5A 4OKDA 3BSHA 3DHUA 3VKKA 2XVGA 4W84A 4JFTA 3TTYA 5GPRA 1RD6A 1NH6A 2XVNA 1Q6CA 3WNLA 2UY4A 5JBDA 1IZKA 1V3HA 4PCSA 5FCZA 3T0AA 1W9PA 4AMCA 1UQYA 1J0JA 5CGMA 1B3WA 2WHLA 4AD4A 1NP0A 2XTKA 1PBGA 1EDTA 1C8QA 4KH2A 2F8QA 4IPLA 3MKKA 1PX8A 3WD2A 1WDSA 1OIMA 1W2VA 4BQ2A 1E40A 3AQUA 1CGWA 1ISYA 3MUY1 2JIEA 4JKLA 2XFYA 3IAQA 4J7RA 4UOZA 1E72M 1W9XA 4Z2HA 2CESA 1BYCA 2VUYA 3SCPA 2J25A 1JFXA 1ZJAA 2EJ1A 4X0VA 1QI2A 3ZO9A 5IFTA 3TP4A 4AZCB 2W5FA 4M56A 3CH9A 2WSKA 1UA7A 1GQLA 4JHOA 3EBVA 1WPCA 5LA2A 4OBRA 3THDA 5GNXA 2WHJA 5ABGA 4B3KA 4OIFA 5HOSA 1WZMA 1X6LA 3LPGA 2XVPA 2BVTA 5E0FA 1E43A 1BG4A 1TUXA 2YBUA 2J7HA 2VRKA 3FN9A 2DDXA 3RM8A 2W62A 2ZE0A 3WL0A 4D72A 3VIKA 2ZIDA 3PTKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2GVY A;  2VZU A;  2VZT A;  3VMO A;  1JYV A;  4CKQ A;  3FHQ A;  4F9J A;  3UET A;  1KQY A;  3U7B A;  2YDR A;  1C7S A;  1XH1 A;  1GOK A;  4ML4 A;  1E6Q M;  3VM7 A;  1PAM A;  3AZR A;  4W87 A;  3TTQ A;  3VPL A;  2QHA A;  4JCM A;  4D1J A;  1UKP A;  5BXP A;  1WZA A;  3NDY A;  1ZB5 A;  2E0P A;  2C0H A;  3AIE A;  5EMY A;  4W5U A;  4J28 A;  1JF5 A;  3PTQ A;  2J62 A;  2JIW A;  2PI6 A;  4WSJ A;  1OCQ A;  4HU8 A;  4RL3 A;  3A4X A;  1ISZ A;  4AZH A;  1Z32 X;  1M53 A;  3KL5 A;  1QI5 A;  4W5Z A;  4UOQ A;  4URI A;  3EMC A;  3WH9 A;  4TTG A;  2HVM A;  1HVX A;  3AMD A;  3K4A A;  3RCN A;  4WLC A;  5ABF B;  6A3H A;  1EXP A;  1B90 A;  2V3G A;  2XYL A;  2FGZ A;  1GJW A;  2DGA A;  2YKK A;  4JL1 A;  4B3L A;  3U7V A;  3WQ5 A;  1UKQ A;  1I1W A;  1WDR A;  1FFQ A;  3VNZ A;  3ZQ9 A;  2WLZ A;  1EO5 A;  3CUG A;  5JBF A;  2X1I A;  2XVK A;  2PB1 A;  5I0D A;  4Y7E A;  2ZWZ A;  4GIA A;  3E1F 1;  3WFZ A;  4CU6 A;  2V5C A;  4Q7N A;  3SUV A;  1TR1 A;  3GNR A;  2WVT A;  4A3H A;  1JI2 A;  2D22 A;  2WZI A;  4DUV A;  4JAW A;  4EK7 A;  1Q6G A;  1UWU A;  3UCQ A;  2X09 A;  4N0R A;  2A3H A;  2Y8K A;  1H5V A;  4YHG A;  2CBU A;  2UY5 A;  3WF1 A;  4UOJ A;  1W9D M;  3POC A;  4HME A;  5A8Q A;  1UR8 A;  3L4X A;  1US2 A;  2CHO A;  1HT6 A;  1PJ9 A;  1Q6F A;  3WQ8 A;  4EAM A;  4PUE A;  3AFB A;  4UFH A;  3RM4 A;  4MAZ A;  4P8V A;  1JZ5 A;  3OGR A;  4J3U A;  1UYQ A;  1JDD A;  4TVD A;  4UZS A;  4CCE A;  1MFV A;  4HTY A;  1G0C A;  3WFL A;  5F7U A;  4CD6 A;  7A3H A;  5CQ1 A;  4W7W A;  1DWF M;  2CEQ A;  1H09 A;  4H04 A;  3AS1 A;  5HPO A;  4QP0 A;  2D0H A;  2TAA A;  1H0G A;  5KEZ A;  1UZ1 A;  3LMY A;  2WVU A;  1V0L A;  3T08 A;  1UR1 A;  2E4T A;  2D3N A;  3OLE A;  4GO8 A;  1E6S M;  4YPJ A;  5M03 A;  1W9B M;  3L4W A;  2JFE X;  1UKO A;  2GDV A;  4AEF A;  1BVN P;  4MAV A;  1A3H A;  4HPH A;  3L4Z A;  2E9L A;  3PZQ A;  3D5H A;  4AEE A;  4QDM A;  3WH7 A;  4B15 A;  2O9T A;  3DHP A;  3WQ4 A;  1C7T A;  3OZP A;  4GO9 A;  3DYM A;  4BS0 A;  2W61 A;  3IAP A;  4MPK A;  1DTU A;  1UKT A;  4H8U A;  5CJ5 A;  3WBE A;  4ATW A;  3DEC A;  2CIP A;  5HPC A;  3L4U A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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