5GNZA

The m3 mutant structure of bgl6
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
RSYRFPEGFLWGAATAAYQIEGSSMADGAGESIWDRFSHTPGNMKDGDTGDVACDHYNRWREDIELMKRLNLQAYRFSVSWSRVIPQGRGAINPKGLAFYDRLVDGLLEAGIEPLATLYHWDLPAALDDRGGWLNPDIADWFADYGQVLFEKFKGRVKTWGTINEPWCIVDGGYLHGALAPGHRSAYEAVIAGHNVLRAHGAAVRRFREVGEGQIGIVLNIEPKYPASDKPEDEAARRRAEAQMNRWFLDPLMGRGYPEELTDVYGAAWREFPKEDFELIAEPTDWMGLNWYTRAVPENAPDAWPTRSRPVRQTQHAHTETGWEVYPPALTDTLVWLSEQTGGKLPLMVTENGSAWYDPPHAIDGRIHDPMRVHYLQTHIKALHDAIGKGVDLRGYMVWSLLDNLEWSLGYSKRFGIVHVNFATQERTIKDSGLFYAEVIKTHGDVLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Structures of a glucose-tolerant beta-glucosidase provide insights into its mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Metagenome
total genus 182
structure length 448
sequence length 448
chains with identical sequence B, C, D, H, I, J, K
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2016-07-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5gnzA00
1MW0A 1V6WA 3BAXA 1FP8A 2DDXA 2Y4SA 4OBSA 4MB3A 3ZT7A 4OJYA 3U5UA 3UR8A 2J77A 3FNDA 5D4YA 4MTVA 1GW1A 2WMIA 3VX0A 1JD9A 5D9NA 5AC5A 4AZ7A 2GSJA 1WCGA 1CGWA 2VRKA 2OLHA 5HNNA 3I3EA 3G6MA 2WMIB 4PMOA 1UKSA 4U31A 1E56A 1QI3A 1E40A 4B9ZA 1HJXA 3DHUA 1QW9A 3GXMA 1BTCA 2O9RA 4P8UA 2Y8VA 3CZLA 4FLOA 2WYSA 1GNXA 1VF8A 2VQUA 2J7HA 5E0FA 3WFZA 4F9JA 5JIWA 1Q6FA 2X0HA 2BVYA 3NSMA 2FH8A 3ZSSA 2E4TA 2XVPA 1GQKA 4P7LA 4PN2A 1E55A 1KWGA 1C7SA 3FHAA 5CSYA 4UQDA 4LPCA 2O9PA 2BFGA 5EMYA 4H8UA 4M8UA 3ZQ9A 5JIPA 4B3LA 2W67A 2VC9A 4BCEA 1J10A 4R5EA 3NDZA 4ACZA 2VT0A 3NYDA 1CEOA 3GH5A 3ZJKA 4TOQA 5BYWA 1X6NA 1I1XA 2X1IA 1NOFA 3OZPA 1U2YA 1UOKA 1GVYA 2D0GA 4U33A 2IUZA 3JUGA 4HMCA 1ZJAA 2YDQA 4ACZB 4ATWA 1EIBA 1WKYA 2VCBA 4U5IA 1EHNA 5HPCA 2JIEA 3NJ3A 1ODUA 2CBIA 2E8ZA 1TG7A 3WD3A 5FL0A 1DEDA 2CXGA 4CU6A 4CCCA 3G6LA 2PC8A 5JBEA 1V3MA 3AMKA 4J3TA 3K8KA 2DH2A 4FLQA 1NARA 3VIIA 3W4RA 1WDPA 5A69A 1HL8A 3ZOAA 5D8ZA 4DUWA 1KFWA 1H41A 3KE0A 2WNWA 1KXVA 4UOZA 1ZB5A 1BHGA 2VCCA 3OGVA 4A4AA 4E4PA 1ZBKA 1HKMA 3EMQA 2XG9A 3A3HA 3A6OA 2EPLX 3AIBA 4F8XA 4CN6A 1C91A 1LL4A 1HVXA 2ZX7A 2CKRA 3FXYA 2WANA 4FF5A 2PF0A 4CN4A 2WM0A 4HOXA 1C3FA 3WQ8A 4V28A 1HKKA 2DT3A 3WDPP 4FMVA 2PI6A 2EEXA 1AQ0A 4N0RA 1E15A 4OZOA 1GOOA 4FLSA 4JHOA 1DWGM 1FHDA 2WAGA 1YHTA 2PWHA 3MKKA 3N12A 4YN5A 4W7VA 3ZJ6A 3MV01 1TR1A 2DSUA 1NWTA 3ZJ8A 1M04A 3AHZA 2GFTA 2VCAA 1R86A 3A4XA 7A3HA 1LG2A 4NSBA 2PB1A 3OGSA 3GDBA 3MSDA 1V6XA 1D2KA 2GJPA 3CUJA 3IK2A 3AHYA 1E43A 1BVZA 2RGLA 5HPOA 4HMDA 5BROA 2XFFA 1NOWA 1HVQA 1PX8A 4ACYA 4AD4A 2XTKA 2W4XA 3CIVA 3CMGA 4P7RA 2VUYA 1UKOA 2E8YA 3A47A 1B31A 1PBGA 4HZ8A 2WCGA 2BNJA 4L4OA 2PBGA 1GJWA 2GVYA 2IXUA 2XIBA 1FFRA 4QLKA 3AIVA 1WAWA 3WUBA 1UH2A 1KGUA 3WH9A 2G4FA 1XH2A 4W93A 3VGGA 1E5NA 1JG9A 2BXZA 1CENA 1FH8A 2DT1A 1H3GA 4CD6A 3WDIA 4HA1A 3VMOA 4AZ5A 4M24A 2JEPA 3WEZA 3GTNA 3QHMA 3WN6A 1KXQA 2VURA 4P7NA 3VD4A 4QDMA 1W1PA 1E6RA 5GNYA 1UWUA 2GK1A 3FHQA 2ZUUA 3L4YA 3GNOA 3RDKA 3RIKA 1UWRA 4UOJA 2J79A 1KGWA 5AYBA 2ZUTA 3BSHA 5BRQA 1JZ2A 2WHJA 4WKFA 3I3DA 3VIOA 4L4PA 1B3YA 1V6YA 1WDSA 5JBDA 1FOBA 1GONA 1UZ1A 3QHNA 4CGTA 1W1VA 5DF0A 2GUYA 3WDHA 4GO9A 1QOXA 2VX7A 3RPMA 1SR0A 1VBRA 3ZT6A 1NP2A 1F4HA 3MSGA 2GJRA 3FY1A 4PMZA 1GORA 4CKQA 2F2HA 4AIEA 3VGDA 1XYZA 4CVUA 1R7OA 1MWOA 4UTFA 3VM7A 4B15A 1VRXA 1B3WA 3T2PA 1Q4NX 2OWWA 1OGBA 1CECA 1ESWA 1ZBCA 4X0NA 6CGTA 4JFSA 1JNDA 3F5LA 4YHGA 5I23A 2J4GA 4RL3A 1JYNA 1HNYA 2MANA 1E6SM 5I5RA 1E1FA 2ZOXA 4F79A 3QOMA 1WPCA 2BVTA 3VD9A 1C8QA 3M7SA 3KEHA 3F4VA 3WIJA 4BF7A 2TAAA 4DM2A 5HOSA 3SUWA 3PZOA 2W91A 1SFSA 2FHCA 1RPKA 1HKIA 1U30A 3VINA 2DSKA 4K68A 4XX6A 1CPUA 1L0PA 4X9YA 4U2ZA 3FW6A 3CZJA 2W62A 4V2XA 1BFNA 4W8AA 4DWSC 1EDGA 1GVIA 3AICA 1ZL1A 4MB1A 3SCNA 3W6MA 2VZSA 2CERA 4F9DA 2VRQA 2OYLA 2JF7A 1DP0A 3AS1A 2G3MA 3AXXA 3L4TA 4HU0A 3BCDA 1ZBWA 1EH9A 1JAKA 3OA5A 2J8GA 1BQCA 2ZXQA 1KCKA 3L2LA 2ZX6A 2OSYA 1JD7A 1UWSA 3D5HA 3SCOA 4PBGA 4DWSA 1J0YA 1BPLB 3GZAA 4HPHA 4UQBA 1HF6A 4H8VA 4JKMA 4Z2KA 3CHDA 1UQYA 1BAGA 3WNLA 2IXVA 1D3CA 3OB8A 4KRTA 4MNMA 1KB3A 3VO0A 3ZJ7A 4W7WA 3MMWA 1C93A 1LL7A 3MMUA 3A4AA 1TMQA 1ITCA 1XH0A 1PJ9A 3GNPA 1ZU8A 3N13A 1UHVA 3CUIA 1GZJA 1ZJBA 5I3DA 2V3GA 1PEZA 4QCEA 2E9LA 4GXPA 3THDA 3WENA 5CLWA 1ITXA 2OWCA 3TTYA 3PN8A 3W37A 1B3ZA 4WJXA 3M07A 1E9LA 3K4DA 3U5YA 1JL8A 2VVSA 1E0VA 2XSAA 1PIGA 4JIEA 4W5ZA 4HA4A 1GHSA 5A8PA 4ZE5A 3VDCA 1NOUA 1UYQA 3ZSTA 3VMNA 1WDQA 5F7UA 1NQ6A 3IAQA 4PMRA 3SIMA 1H4PA 4UQEA 1VJSA 4LQ1A 3T0BA 6TAAA 3SCWA 4D6JA 3K8LA 2A3HA 4E8CA 1XSJA 2ZWZA 4IUGA 5BXRA 4GPNA 3J7HA 1TA3A 1MYRA 2W92A 4H8HA 4TVCA 3ARSA 1B3VA 1MQQA 1ISYA 2DSZA 3HJEA 1GOMA 4NZCA 1UD3A 2WSPA 2W63A 4PMQA 5I79A 1BLIA 3N15A 3N04A 4AZCA 1QNOA 2VZTA 4JL1A 4D1JA 5CJ5A 2ZXDA 3IAPA 2Y24A 1VFFA 1WB0A 2NT0A 4JKLA 4AC1X 3ARUA 3VGEA 2A3BA 1R8LA 2E3ZA 4H04A 1CDGA 2OSXA 2DT2A 3LPPA 2CNCA 1UWTA 2V3FA 1HJQA 4D6IA 3W29A 4QFUA 5IFTA 4H41A 2XJ7A 4V27A 1G0CA 4OOUA 1QNPA 3BC9A 3VTRA 1CWYA 1LQ0A 2QF8A 3TTQA 1MXDA 1HKJA 4E8DA 4D6GA 4KGLA 2VZUA 2VI0A 4A3YA 1C7TA 5A8NA 1QBBA 1JNEA 1OB0A 1AQHA 4W8LA 1JDCA 3GYCA 1MW3A 3II1A 3RM4A 5FL1A 1K9DA 5FIPA 3AIUA 1OBAA 3IJ7A 1G01A 2VRJA 3VNZA 4TTGA 3WQ6A 2XGIA 4W89A 2D2OA 2BY0A 1E0WA 2VTFA 4CU8A 2DGAA 4WKHA 3CUGA 4QP0A 1VFMA 1E4LA 4CCDA 2D3NA 5DMYA 1OGSA 1OCQA 3PTQA 2YOCA 1J11A 2WBGA 4B3KA 1QI0A 1KBBA 1Z32X 3N1AA 4S3KA 1WZMA 1VAHA 3L4WA 3EMCA 4MB4A 1R7AA 3PZTA 4IM4A 1JZ6A 1H2JA 2HVMA 1MFVA 2BVDA 2YIHA 2HISA 3DECA 1TCMA 1HT6A 1HL9A 3ARTA 2GDUA 1HX0A 4AZGA 1BG9A 1EDQA 1M53A 4Z2LA 3SCRA 8CGTA 2FGZA 2VMFA 1JDAA 2YL6A 1O6IA 5E70A 1LG1A 1BYDA 3TTSA 1HN1A 1VFOA 1ECEA 3ARYA 4M29A 2WHMA 2CCRA 3KL0A 3FAXA 2CESA 2AMGA 4PMDA 5DO8A 5D9MA 4AISA 2QMKA 3L4XA 4D6DA 1GHRA 3U7BA 5FOOA 2EQDA 3GXIA 1MVYA 3VIHA 3O9NA 3VX1A 3EDJA 1NP0A 1MW2A 1OD8A 1QHPA 3T08A 4AEEA 1WNOA 1OIMA 3OBAA 3WQ4A 4JFUA 4IISA 2VR5A 1OWQA 5I6SA 3WEMA 1JAEA 3WD2A 1H0IA 4BZYA 1E72M 1FH7A 1FHLA 2VOTA 4AD2A 3PZQA 4UFKA 1FFQA 5BWFA 5CLTA 1CZ1A 4TVDA 4C7GA 2WBKA 1LF1A 3MUZ1 1TE1A 3IANA 1UWQA 4J27A 4AW7A 4HOWA 4XB3A 5CPTA 1B90A 2O9TA 3VIKA 2ZXBA 1XCXA 3DYMA 1HIZA 3VGHA 1E6QM 1B3XA 2WMKA 3SUVA 4DM1A 5CQ1A 1E4NA 1US3A 4NF7A 3KWXA 3KZSA 1UR2A 4A3HA 3EDKA 2ZUNA 2WVUA 3WDJA 3LMYA 2EXOA 1XRVA 4TXEA 4AZIA 2WVVB 3VIJA 2WC3A 1WP6A 1X6LA 2ZUMA 4MJ4A 2WMFA 1E0XA 3UEQA 2OYKA 4UFMA 1TVNA 1UR1A 1B2YA 2FGLA 2UY5A 3ARPA 3M46A 2Q8XA 4FLRA 4TX6A 4D71A 3WDQA 3WUGA 1MQRA 2OYMA 2XUCA 3CPUA 2CHOA 2YA2A 1C8YA 3WUEA 1Q6DA 3AMCA 3AIWA 4Z2GA 1VEOA 1JI1A 4LGXA 4ATDA 3NCOA 1UH3A 5DT7A 4HU8A 4EE9A 2WSKA 3N9KA 4W8BA 3SCQA 4JFWA 2X0YA 1PX3A 2D0FA 3D3AA 4AY1A 1UD8A 5LA2A 2UY4A 4U3AA 2WK2A 5AC4A 2ZE0A 4QLJA 1HP4A 4MAVA 2YL5A 4MB5A 3RCNA 1QI2A 4JZ5A 4W85A 3CUHA 1V02E 5BXTA 4MPKA 3CO4A 2WLYA 5LYRA 5CG0A 1J12A 2VX4A 1H0GA 2QPSA 3F5KA 4ZXLA 2EBNA 2DSVA 4GKLA 3WEOA 4WIWA 1JZ3A 4MDOA 4ATLA 4ZFMA 3T09A 3ZR5A 2YBUA 3VNYA 3WH6A 5A95A 4CD4A 3VD5A 6A3HA 2XSBA 2VX5A 4UFIA 2YJQA 3WF2A 1OGGA 1XH1A 3DYPA 4Y7EA 2WZIA 3SUTA 5EFDA 4AZBA 2J8FA 1M7XA 4GQRA 4BQ4A 2VJXA 5A6MA 1R85A 1UWIA 2EO7A 3ARQA 2QV4A 3RO8A 1W2PA 3VGFA 1H5VA 3WD1A 1KQZA 5DT5A 2EJ1A 3AJ7A 5BRPA 2WKGA 3BXWA 2WMHA 2Z1KA 4D6HA 5ABFB 4D6FA 4D1IA 3MV11 4RE2A 3POCA 2FHFA 1TUXA 2FDMA 3VIPA 3OIHA 1IZJA 3O6AA 1QVBA 3VUPA 4WLCA 1WE5A 2V38A 3SCUA 2F61A 5AYIA 3N17A 2XGBA 3W81A 1GQIA 2YDRA 3ARRA 2YA1A 1JF6A 2FHBA 2CKSA 4CCEA 2OWXA 1C8XA 5A94A 2CBJA 2EPOA 2Y2WA 1X1NA 4WF7A 1JIBA 1J01A 3VIGA 3ALFA 4GIAA 1KWKA 1KBKA 4D6EA 3VDAA 1TZ7A 3VVGA 4DUXA 4J3VA 4IPLA 3N18A 3BMWA 3CGTA 1J9YA 5C71A 2WWCA 3VU2A 1VEPA 3KL3A 3W6LA 1JZ5A 3HN3A 2QLYA 4UCFA 1KQYA 4UFLA 5HXMA 1AVAA 4EK7A 1B0IA 4WK9A 1AQMA 1NH6A 1CIUA 3RJXA 3GNRA 1EA9C 3OLDA 4TX8A 5A6LA 1UH4A 3AHXA 3WUFA 3LPGA 2V5DA 1B9ZA 4D6CA 4PMYA 3MUY1 3FN9A 3A4WA 4KWUA 3WD0A 3ZO9A 1B30A 3MUAA 4U5KA 1V3KA 1EO5A 4AD0A 2WMGA 2VQTA 3B8SA 3SUSA 1V3LA 5A6BD 1EO7A 2VO5A 2X05A 2G8ZA 3WDRA 1YQ2A 1W9VA 1UR0A 4EANA 4MNJA 4LX4A 2WB5A 2YKKA 1R87A 1RP9A 2E40A 9CGTA 2BV9A 3T0DA 2FH6A 4NRRA 4WSKA 1W3LA 2YL8A 3CZGA 2DSWA 1UKQA 1VB9A 3W53A 3AYRA 4J3WA 2XIIA 4PCSA 1CYGA 4GZIA 1GOIA 4HPGA 1K9EA 2ZUVA 5TD4A 4NRSA 4J3SA 3AYSA 1Y7VA 3W0KA 1QI5A 1E4IA 4AD3A 1EDTA 1QBAA 2O92A 5M5DA 2QMJA 3RJYA 5FD0A 1W2VA 1Q6EA 1ZS2A 3UG5A 1E71M 2XM2A 2J7EA 3VOCA 2NW0A 1NWUA 2J62A 1WO2A 4AYSA 1V0LA 1HJWA 2CETA 5BXSA 3BLPX 3NSXA 1DWHM 3WNOA 2VNCA 1UZ4A 3NIYA 1BYAA 5I2UA 3VGBA 1Q6GA 5A2AA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1MW0 A;  1V6W A;  3BAX A;  1FP8 A;  2DDX A;  2Y4S A;  4OBS A;  4MB3 A;  3ZT7 A;  4OJY A;  3U5U A;  3UR8 A;  2J77 A;  3FND A;  5D4Y A;  4MTV A;  1GW1 A;  2WMI A;  3VX0 A;  1JD9 A;  5D9N A;  5AC5 A;  4AZ7 A;  2GSJ A;  1WCG A;  1CGW A;  2VRK A;  2OLH A;  5HNN A;  3I3E A;  3G6M A;  2WMI B;  4PMO A;  1UKS A;  4U31 A;  1E56 A;  1QI3 A;  1E40 A;  4B9Z A;  1HJX A;  3DHU A;  1QW9 A;  3GXM A;  1BTC A;  2O9R A;  4P8U A;  2Y8V A;  3CZL A;  4FLO A;  2WYS A;  1GNX A;  1VF8 A;  2VQU A;  2J7H A;  5E0F A;  3WFZ A;  4F9J A;  5JIW A;  1Q6F A;  2X0H A;  2BVY A;  3NSM A;  2FH8 A;  3ZSS A;  2E4T A;  2XVP A;  1GQK A;  4P7L A;  4PN2 A;  1E55 A;  1KWG A;  1C7S A;  3FHA A;  5CSY A;  4UQD A;  4LPC A;  2O9P A;  2BFG A;  5EMY A;  4H8U A;  4M8U A;  3ZQ9 A;  5JIP A;  4B3L A;  2W67 A;  2VC9 A;  4BCE A;  1J10 A;  4R5E A;  3NDZ A;  4ACZ A;  2VT0 A;  3NYD A;  1CEO A;  3GH5 A;  3ZJK A;  4TOQ A;  5BYW A;  1X6N A;  1I1X A;  2X1I A;  1NOF A;  3OZP A;  1U2Y A;  1UOK A;  1GVY A;  2D0G A;  4U33 A;  2IUZ A;  3JUG A;  4HMC A;  1ZJA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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