5HBFA

Crystal structure of human full-length chitotriosidase (chit1)
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
452
structure length
424
Chain Sequence
AKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLQDTFCQGKADGLYPNPRERSSFYSCAAGRLFQQSCPTGLVFSNSCKCCTWNLVPRGSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitotriosidase-1
publication title X-Ray Crystal Structure of the Full Length Human Chitotriosidase (CHIT1) Reveals Features of Its Chitin Binding Domain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 137
structure length 424
sequence length 452
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-12-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
A PF01607 CBM_14 Chitin binding Peritrophin-A domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 5hbfA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5hbfA01
2WXDM 2D24A 1H3GA 4HPHA 3BAIA 4RE2A 1C91A 4J3VA 4CD4A 2WANA 1RP8A 4UQDA 5DT5A 1E70M 3RJXA 1TVPA 4UTFA 4Z2JA 4HZ8A 4U31A 3ZJ7A 5EFFA 2VX5A 5D4YA 1E43A 1WKYA 4PMUA 1HP5A 1H11A 1NWRA 2WK2A 2CIPA 5A6JA 3POHA 4IUGA 1C7SA 4XV0A 4PUDA 2XFRA 1E6QM 1KXHA 2TAAA 1E6ZA 5GPRA 3WD4A 3WH8A 1J12A 1GNXA 4OKDA 1GORA 2D0HA 1HNYA 1VFFA 4AEFA 1DWIM 1J0ZA 1YHTA 1VFUA 3VIKA 3KL3A 5A6MA 2YL8A 4IPLA 1M03A 4WJXA 5IDIA 2QPUA 2WBKA 3SCPA 4HOXA 1J10A 1XV8A 1XYZA 3CHEA 3CBWA 4AISA 1KWKA 3VD4A 4CCDA 1J18A 3FNDA 3VILA 3CMGA 5I5RA 1UA3A 5DFAA 4LGXA 1J01A 3OLGA 4E4PA 1C90A 2EPNA 3NYDA 4UFIA 4CN6A 3ZR6A 3AI0A 1TVNA 1G94A 3VPLA 5I23A 1D3CA 3SCNA 3VX0A 2XVGA 3WDHA 3RM8A 1WNOA 2IXVA 5D8WA 1TMQA 2E9LA 2UY4A 3EMCA 3AZTA 4J3XA 5D9OA 1E6PA 1UZ4A 3OGSA 4D6GA 4Z2KA 1JAKA 1QHPA 1MXDA 2VVNA 2WVVB 4AD2A 5A94A 4PMXA 3AISA 1CBGA 2WMIB 5BRQA 4AMCA 4J3UA 3VIIA 1XH1A 1W9VA 2WHLA 3M6DA 3TOPA 3CZJA 3PN8A 2W4XA 5AYBA 5GNZA 5C8BB 1BSIA 3F5KA 1JL8A 4FMVA 3SCRA 3WF3A 2XYLA 4PMDA 2CCRA 3RIKA 2DH2A 2VJXA 4CU7A 2QV4A 3VIFA 1CEOA 1F4HA 2WZHA 2CHOA 2WCSA 1GQJA 2PWDA 1DWJM 2GK1A 1V3MA 2DSUA 1UG6A 2VCAA 3MSDA 4OOUA 3WF1A 3DHUA 2O9OA 3ALFA 3POCA 1FFRA 3KWXA 5DO8A 3VIHA 4ATWA 1BHGA 3BGAA 4AXNA 3RO8A 2G3JA 4MB1A 3ZT7A 4AZBA 3VDHA 2YA0A 1H49A 5I2UA 2O9TA 3I3BA 1W3HA 3VD5A 5AC4A 1CGYA 4W7VA 1C92A 3EBVA 2WZEA 1EHNA 3T2QA 2X8RA 1QBAA 4W7UA 1XSKA 2VVSA 1UWIA 4ACZA 3NDZA 1K9TA 4W8BA 3LPOA 2PWGA 2A3AA 4PCTA 3GXFA 1QNRA 3BC9A 4WK9A 2VCCA 1VAHA 2OSYA 2WMGA 1EIBA 3HN3A 1I75A 1JAEA 4UFKA 1OD8A 2EPOA 2NSXA 1H0GA 4JZ5A 4X0NA 2WKGA 2Y2WA 3AYSA 3DECA 3D3AA 5BWFA 4MAZA 1H5VA 2CBIA 3CZ8A 2XGBA 3T09A 5A8OA 3WKZA 3W26A 2XUCA 4AIUA 4MNKA 2XTKA 2D0FA 4MB3A 4AEEA 1EHAA 4IPNB 4QLLA 1W1PA 2DEPA 1PBGA 4ZXOA 1UZ1A 5E0FA 1CIUA 2GJXA 1XH0A 4Z2GA 2V38A 3AFBA 5A6AA 1FHDA 2VCBA 3ZOAA 2YDSA 3WDPP 2DT2A 3WN6A 1B3WA 5I0DA 1TR1A 3BLKA 2E8YA 1V6XA 1J9YA 1UD5A 2D3LA 3BSGA 1OT1A 2DDXA 2GJRA 1LLOA 4GQQA 4TUFA 4FLRA 1JI1A 2FHFA 2CBVA 1GOMA 3TA9A 5A6BA 2ZXBA 2W62A 4PMYA 3WMBA 3CGTA 5JIPA 1R85A 1ZJBA 3AIRA 3UERA 2E0PA 1VJSA 2JF7A 1G01A 4P8VA 2J78A 1A3HA 3UG3A 4JKKA 5CJ5A 1KBKA 4M24A 4XZWA 4PCSA 4WKAA 3VDCA 3B8SA 1PEZA 1A47A 2YL5A 4PTVA 2Y24A 1B30A 1UQYA 2Y4SA 3GH4A 1KWGA 1CGWA 1JG9A 3VNZA 5JH8A 2OWWA 3TTYA 3AMDA 2J7FA 5BROA 1LF1A 1SR0A 2XVLA 4JHOA 2Z1KA 5A6SA 3FAXA 1JGIA 4IISA 3A4XA 1GQIA 5ECUA 4J27A 1VIWA 4IM4A 4LX4A 4Z2HA 4GZEA 4QCFA 3AIBA 5GQBA 1CGXA 3W37A 2G41A 4B15A 2ZWZA 9CGTA 2VZTA 3CUHA 1CXIA 5BXRA 3GH5A 2BY0A 2J77A 1QNQA 3OA5A 3VDBA 4AY1A 4TTUA 1ODZA 3B9AA 1E15A 3MUZ1 2EEXA 1MQQA 1JI2A 3GM8A 4W85A 3BH4A 1JDCA 3II1A 4J7RA 1MW1A 4AD0A 1JYVA 3WBAA 3K8MA 1NM9A 4TOQA 4EK7A 2NT1A 3EDFA 4W89A 3G6MA 4A3HA 4CVWA 2A3HA 3FW6A 3FN9A 1JZ3A 3GBEA 3FHAA 5KZ6A 2BHUA 3MMDA 2WZIA 3BMVA 4H41A 4HPGA 1QHOA 2ZX5A 4WIWA 3MS8A 4EANA 3GDBA 5JUVA 1DWAM 2VRQA 7TAAA 1OCQA 4NRRA 3AYRA 2V5CA 2FHBA 1BYAA 5DMYA 3CPUA 1JIBA 1LL7A 3WH9A 2PF0A 1GOKA 3MANA 2J47A 1H4PA 3PHAA 1NOFA 1W3KA 4UQCA 1NARA 4KMQA 1BQCA 4HU8A 2PBGA 5LA2A 1ISVA 3N17A 1FA2A 4DWSC 1K6AA 1P6WA 5A8QA 1B1YA 1Y7VA 1DWGM 4DWSA 3ZIZA 4D6EA 3WMSA 6A3HA 4J3TA 1JDDA 5CLTA 2ESCA 4E2OA 5ABFA 2VNCA 3VU2A 4JFTA 4UNIA 3NSXA 4AZ5A 5JBDA 3ARWA 5IXEA 3GNOA 1E4LA 1US3A 1FHLA 2VOTA 5FIPA 4BQ3A 5M3WA 3NJ3A 1XCWA 3IAQA 2BFGA 1E5JA 4HA1A 4UQ9A 1DP0A 3WNOA 1YQ2A 4NF7A 3UEQA 3VIPA 5LYRA 2NW0A 3BAJA 1JF5A 3WENA 1WPCA 3WFZA 3VINA 4Z2IA 4UOZA 4UQEA 1ZBKA 3MV01 3L4XA 4JKMA 3N12A 4HMEA 4P7LA 1RP9A 3WQ4A 1TCMA 2JIEA 1KR0A 3GYCA 1W3JA 4AZCA 1B3XA 5DT7A 3CZKA 1GVIA 4TTGA 3QOMA 1I1XA 1X6LA 5BXTA 4GINA 4D6CA 1OD0A 1L8NA 3WEOA 4B9ZA 5FD0A 4DUWA 4U5KA 4EE9A 5IHSA 1B31A 2J7EA 3SCOA 3WF4A 5ABEA 3PZVA 2OWCA 3ECQA 1E55A 2J25A 1V6WA 3W25A 4AW7A 3ZJ6A 2W67A 2CYGA 2BHZA 4FLOA 1FFQA 4PSRA 4D6FA 3EDDA 4CU6A 1M01A 1EDGA 1GCYA 4AD3A 3AIVA 1GJUA 2BY3A 3OZOA 3WBEA 3GTNA 4P7OA 4TX8A 2EBNA 4Z2LA 3VO0A 3LPGA 3WNKA 1OGGA 3WDIA 2VX7A 3MU7A 3U7VA 1CWYA 3WL1A 1FH8A 1FOBA 3WF0A 2DT0A 3VNYA 1HXJA 4P7RA 2XPKA 2ZUMA 4D72A 4WF7A 3LPFA 4FF5A 1AVAA 1B2YA 4BF7A 2XJ7A 3PZOA 2XIIA 3BAXA 2VI0A 2FGZA 3AHVA 5IFPA 2GUYA 3MMWA 4PEEA 1PX8A 1I1WA 2PWFA 3WQVA 1FH9A 4AZIA 1CDGA 4GIAA 3EMZA 4E8DA 3AROA 1OGBA 2OWXA 1CXFA 3WUBA 3AXIA 3N11A 1LG1A 1KQYA 1MFVA 3W29A 4UQAA 1NWTA 4D71A 1E6SM 3QHNA 1E6RA 3DHPA 4GZIA 1VF8A 1UR1A 2C8NA 2YBUA 5C70A 1Q6EA 2D2OA 1UWTA 4QAWA 1C8XA 3PZGA 4AZ6A 1V3HA 7CGTA 2BS9A 3AHTA 2WSKA 4CN1A 1CXKA 5D9MA 1UUQA 4UCFA 3SCWA 5EFDA 2EPLX 4JKLA 1WZMA 5EBAA 5ABGA 3W28A 2C0HA 4NZCA 1OIFA 5CSUA 1HKJA 1VEOA 4M8UA 4W87A 4XX6A 3QR3A 3WUGA 1XSIA 3SCSA 1NP2A 3CHFA 2F2HA 1UH2A 2GVYA 5I77A 2VQTA 2VZSA 2J7HA 4F9JA 2B31A 1H1NA 1XCXA 2QPSA 2ZUNA 2HISA 3PTQA 3U57A 3CTTA 1WCGA 3KL0A 4TXEA 3VKKA 5I24A 3RPMA 3ZJKA 1BGAA 3VDAA 4PMQA 1GHRA 1C8QA 5M17A 2VQUA 1RH9A 1KCLA 4JFSA 4B3KA 4E8CA 2QMKA 3UCQA 3AHXA 1W9UA 1JD7A 4Y7EA 5A8MA 5AYIA 3N04A 4Q22A 1E40A 2X05A 2WMIA 5A6KA 1QNOA 1QPKA 3UR8A 5KEZA 3HU7A 4P7NA 2BVTA 2PI6A 2PWEA 2OYKA 1JXKA 4P7QA 5E6ZA 1KXQA 3DYMA 4WSJA 1BAGA 4DM1A 3VD7A 3WQWA 5IHRA 1H0IA 3FY1A 2YKKA 1LQ0A 4C7FA 4GZJA 5A6LA 4MB5A 4DWSD 3A4WA 4HU0A 3UR7A 1KB3A 5EMYA 1GHSA 3KL5A 1VRXA 2YLLA 3IK2A 4MNJA 1QBBA 2WMJA 1HJWA 1MVYA 3FHQA 4QLJA 3TONA 2WHJA 2O9RA 3O6AA 4JCLA 2BNJA 2WHMA 2YJQA 1JZ5A 1CLXA 1WDQA 5F7UA 3OBAA 5GNXA 4M1RA 3AQUA 3HJEA 3F4VA 3VIJA 4D1IA 2UY2A 3VM7A 3K46A 1CPUA 1EDTA 3WQ8A 1E3ZA 4AZ7A 3ARQA 3AIEA 4UFMA 4W88A 1W1YA 4FLQA 4HMCA 3OGRA 1QW9A 3T08A 4ATLA 3ARPA 2GDVA 1EO7A 3EDKA 4JAWA 5A69A 2ZUTA 4UR9A 3MUAA 2VC9A 2E8ZA 1ITCA 2G3NA 2WVSA 1NP0A 1HN1A 4M80A 1RD6A 1CXEA 1BVZA 1DHKA 1MW2A 2XVKA 1LL6A 2GDUA 3THCA 3AZRA 4TX6A 1V02E 3SUTA 1NWSA 8CGTA 2BVDA 3WL0A 2V3FA 2XGIA 3O2LA 3ZMRA 1BLIA 1U33A 4BQ2A 1C8YA 1JDAA 3IAPA 3WDQA 1W2VA 3BAWA 1BYBA 1E72M 2IUZA 1M53A 1R7OA 1BFNA 1KGWA 4BZYA 2YIHA 2YL9A 1S46A 2W63A 4M29A 4C7DA 4FLSA 3CHDA 4UOJA 3N9KA 4JL1A 3A6OA 3PTKA 4HZ7A 1WE5A 1BGGA 3BAYA 4C7GA 1XD0A 1JYWA 2D1ZA 2J7GA 1UH4A 2VZUA 4YN5A 5JBFA 4TVCA 4AZHA 1GOOA 1PX4A 4F8XA 2X1IA 1ZL1A 2BXZA 1ZB5A 5A2BA 4MDPA 3W82A 1C7TA 1KFWA 1UR8A 3T0DA 2JE8A 2WWDA 4MTVA 1V02A 5E09A 2WC4A 4OUEA 3BSHA 3OIHA 4AIEA 2A3EA 2GJXB 1AQHA 2XFFA 4CD8A 4OIFA 3CZGA 3BMWA 3KEHA 1BG9A 3MSGA 1E0XA 2CKRA 1GJWA 1KR1A 1U30A 2EPMX 5D8ZA 1V03A 2YLAA 3BAKA 4RL3A 4OBRA 3WELA 4D6HA 5BYWA 4UOQA 1W1VA 2FH8A 1TE1A 4XUYA 3AZSA 4LYQA 4V28A 3K4AA 2DPEA 5LA1A 1UWUA 1OB0A 2PB1A 3NDYA 3WSUA 4EAMA 2VL4A 4ZENA 2W92A 2CXGA 2W61A 2UWFA 4JFVA 5M03A 5A8NA 3LMYA 2AAAA 3E1F1 4OJYA 2ZXQA 1XH2A 4ZEPA 3WNPA 2ZIDA 3KE0A 1BYDA 2VTFA 1HKMA 6CGTA 2ZUVA 3OG2A 4QP0A 2G8ZA 2VURA 1UYQA 3RCNA 5JIWA 3KZSA 4W93A 2V3GA 4ZE4A 1ZBWA 4L4OA 3NSMA 2DIJA 5FL0A 1EQPA 3UETA 2O92A 4BCEA 4PMVA 2DT3A 2PWHA 1K9EA 1XD1A 2VR4A 3M46A 4QDMA 5CZKA 5E0CA 1W9XA 5AC5A 4M56A 4GI8A 4YHEA 2YOCA 4MNLA 1XHGA 5HBFA 1QNPA 4PTXA 3GZAA 3VMNA 3ZT5A 2MANA 3T2OA 1UH3A 4ZE5A 3RM4A 2X2YA 3K8KA 2E40A 1VFOA 4UFLA 4W86A 2A3CA 1B90A 1BVNP 3GXMA 3VGDA 1V0LA 4CD6A 2FHCA 1Q6GA 1V3JA 1IZKA 1VJZA 2WW5A 4AC1X 5HPOA 1ISXA 2UY5A 2WCAA 1JZ4A 3CHCA 4H8UA 3CUFA 2JFEX 4HOWA 2ZWYA 1UHVA 3AS3A 3SCUA 1CZ1A 2WVTA 2Z1SA 3W6LA 3EYPA 2FH6A 4B9YA 1HL9A 1EQCA 4MADA 1PIGA 3CIVA 5CGTA 3S6TA 4RE3A 4ACYA 2WC3A 2F61A 1WAWA 1ZU8A 3WQ6A 1OM0A 2PC8A 4W5UA 1J11A 2ZICA 3VGGA 2VZOA 1C3FA 1EGZA 4MJ2A 4KWUA 4HA3A 5E6YA 3A4AA 3L4YA 1WO2A 2DGAA 1MW3A 3NCOA 2A3BA 1H41A 2D23A 4CGTA 1E4NA 1HJSA 1MW0A 4PUEA 4K68A 1MFUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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