5I3DA

Sulfolobus solfataricus beta-glycosidase - e387y mutant
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
487
structure length
487
Chain Sequence
SFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTYNGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-galactosidase
publication title A front-face 'SNi synthase' engineered from a retaining 'double-SN2' hydrolase.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus (strain atcc 35092 / dsm 1617 / jcm 11322 / p2)
total genus 192
structure length 487
sequence length 487
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2016-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5i3dA00
2O9PA 4ATDA 3WDIA 3IJ8A 4HA3A 3ALGA 2WWCA 1XH0A 4D6EA 3MANA 1QI5A 4AEFA 1V0KA 1E6NA 1ECEA 1K9FA 3WD2A 4TVUA 4J3UA 1K9DA 2GVYA 2XM2A 4MJ4A 1OGBA 1W32A 2ZX9A 5DT7A 1EOMA 2BS9A 5A2AA 2XYLA 4MNLA 3PZOA 2Y8KA 1XGZA 1UH2A 2D23A 4AD0A 1EHAA 1WDQA 2XVNA 1PIFA 1J18A 1C8XA 4P7NA 5A6LA 4N0RA 2YA0A 2RGLA 1XCWA 2XVLA 2WBKA 1OGGA 4UQBA 3VNYA 2BVYA 3M6DA 1JAKA 1VFMA 3W26A 7A3HA 3L4UA 1CGYA 3LMYA 4W87A 1V0LA 2EPMX 2PWDA 3BMVA 3E1F1 2VZSA 1DTUA 1GOOA 3L4TA 5BWFA 4NSBA 4UOJA 4XX6A 2ZUUA 2YBUA 2A3HA 5A2CA 1E55A 5LA0A 2J8FA 4WF7A 3AS2A 2X0YA 3BAXA 1J0KA 3CTTA 4J28A 3CHDA 5I5RA 3GXDA 3CBWA 2ZOXA 1QI4A 1QNQA 4J3TA 1HKMA 1E15A 1RD6A 1JF5A 4F9DA 3VINA 1PX3A 4U3CA 4AZIA 1HJUA 3WDRA 4GI9A 2AAAA 1JNEA 2WM0A 5DT5A 4CU6A 2D0FA 4HMEA 1H09A 1WCGA 1M53A 2WC7A 4JKMA 3CZLA 1JYNA 3UERA 4J3WA 5CSYA 2WKGA 1S46A 1HJXA 2W66A 2ZUNA 5JBDA 1MQRA 4PCSA 4DWSA 2RGMA 5AYBA 1W9PA 1M01A 1UH3A 4AZCA 4LQ1A 1GONA 2VOTA 3K4DA 2X05A 4LYPA 1UR0A 4NI3A 2DDXA 4LXFA 2CHOA 2ZE0A 2EPOA 3G6MA 4YPJA 3WNMA 2A3BA 2WZEA 2VRJA 1B3WA 1H4PA 3AXHA 1TVNA 5HPOA 1QNSA 4J7RA 4URIA 1J0IA 3WFLA 3OB8A 1DWAM 5IFPA 2PF0A 3SCNA 4H41A 4DWSD 1G0CA 2GSJA 1VBUA 2XGIA 4WKAA 2BV9A 3K46A 4MNJA 2EPLX 3WF1A 3WNNA 3SUUA 2WMIA 1NOWA 2J7CA 2XTKA 4AY1A 1PZ2A 1KQZA 1NWUA 4XV0A 2CKRA 5BRPA 2V38A 2FHCA 4HZ8A 5A1AA 3PZ9A 1R86A 2Y2WA 4BQ5A 2DSKA 4UFLA 2VR4A 1D2KA 1UG6A 2CESA 3K4AA 2WHKA 3DHUA 3CHCA 1RP9A 1SYTA 2BNJA 1HNYA 2ZWZA 4NF7A 4UZSA 3BMWA 2FHFA 2DT3A 2QV4A 2ZIDA 4W85A 5FCZA 3TOPA 2ZXDA 1W2PA 3IJ7A 3VDHA 2J4GA 3VGGA 5BROA 3BGAA 1F4AA 1UWRA 2GJRA 3PZVA 3AIEA 4B3KA 3SCUA 3J7HA 2GJPA 4PTWA 8CGTA 2VZTA 1RPKA 4P7RA 1RH9A 5M03A 1JD7A 1PEZA 2BFGA 3RJXA 4CCCA 3ZM8A 4M80A 5I77A 4AW7A 1EDTA 2D1ZA 3SIMA 5CSUA 3CHFA 1UKSA 3D5HA 1DWIM 3BAYA 4U33A 2WBGA 3WUBA 4CD6A 4XB3A 4NRRA 2D2OA 3VIFA 3F5JA 1GNXA 1QBBA 1G5AA 2WVSA 2D0HA 1J11A 2ZXAA 5HPCA 1US3A 3MKKA 2MANA 4FLOA 3W0KA 3HMCA 3PN8A 1GOMA 4H8VA 1PX8A 1E43A 3THCA 5E70A 5AYIA 2VQTA 3WH5A 1UUQA 2YLAA 1QPKA 3VM5A 3WH7A 3OGVA 3VM7A 5DFAA 1FHDA 5FKYA 3W25A 1CNVA 4H8UA 1OBAA 1WNOA 3RIKA 2UY4A 3CZJA 1PPIA 2J78A 3CIVA 1G9HA 2BVDA 4HPHA 3UG5A 1FP8A 3HJEA 1V6VA 4TVCA 2CXGA 2J62A 4WJXA 1NWTA 2JE8A 2WHLA 4UQAA 3TONA 2WW5A 3AMKA 2D3NA 1QI3A 5CXPA 5CZKA 3WENA 1WPCA 4RE3A 1Z32X 7CGTA 1PX4A 1V3LA 2ZUSA 2QLYA 3B9EA 3N04A 4F79A 2YLLA 1DEDA 2PWHA 1R85A 4DUWA 5GNYA 4D1IA 3KE0A 1HF6A 5I23A 3VDBA 4CCDA 4AISA 2Q8XA 4X0NA 1VEMA 2QPSA 4UFJA 5EFDA 2E9LA 3PZQA 5A94A 4GINA 3VGBA 4D6CA 4L4PA 2EBNA 4V2XA 1GVYA 1V03A 4JFUA 3AIUA 1PBGA 4U2YA 2G41A 1UOKA 2VRQA 4MAVA 4N42A 3N13A 3CUJA 4CU8A 3DYPA 1P6WA 1G94A 4LGXA 1CLVA 3DYMA 2UY2A 1XYZA 1KQYA 1H49A 2XIBA 1GHSA 4Z2LA 3VUPA 2Y4SA 3L2MA 3VGHA 4W7VA 1E0WA 4OJYA 4MB3A 5E0CA 1H1NA 3VMPA 4FK9A 5LA1A 1V6XA 2WVVB 4OOUA 5C70A 4QLLA 1XSIA 4AIOA 3WDJA 3VILA 4J27A 1BPLB 1EDGA 1XHGA 3ZT7A 2ESCA 3A47A 1VAHA 1HKJA 1AVAA 1SFSA 4WLCA 2CYGA 2QMKA 2E8ZA 4Z2HA 3QR3A 4BQ3A 4ZEPA 1ZBWA 3VD4A 3VPLA 1ZS2A 1W1TA 3A4WA 2JF7A 5CGTA 2V3DA 1E5NA 2ZWYA 3LPGA 4FLSA 3U7VA 1UYQA 3W28A 4PCTA 4XZWA 5D9OA 4V27A 1MFUA 4ZE5A 4GZEA 1Q6DA 2VX7A 1QHZA 3LPOA 1KB3A 2W61A 2J7GA 4DWSC 3THDA 2BHUA 4D1JA 4WKHA 1B3VA 1KWKA 2UWFA 3AI0A 4KGJA 4P7LA 1E4IA 1BGGA 2FHBA 4UOQA 3L4VA 2ZX7A 3U57A 1MFVA 5DMYA 3NIYA 3QGVA 1KBBA 3AISA 4FLQA 4IUGA 1XD1A 1Q4NX 5EBAA 4M81A 3F5KA 4F66A 4PMOA 5HOSA 3T2QA 1BVNP 1UD5A 1LL7A 1A3HA 1VF8A 1ISXA 3HN3A 3N18A 2ZXBA 3WD1A 5A6KA 3ARVA 3ECQA 3WL1A 3FAWA 3BLKA 3NCOA 3SURA 1EO5A 3OLIA 3GNOA 2J75A 2WMJA 1H0IA 2YDSA 2HVMA 1B3ZA 4HU8A 4DUXA 1LL4A 4AZHA 4HZ6A 7TAAA 4HU0A 1PAMA 3BH4A 4CUCA 1KR0A 1JZ7A 1GQLA 1WP6A 3VIPA 3WSUA 1W9DM 1V02E 5I2UA 2CBJA 4MAZA 1BGAA 2BY0A 1KCLA 1JFXA 2IXUA 1H5VA 4LPCA 2AMGA 3RPMA 1OB0A 1C92A 1U2YA 5CQ1A 1UH4A 2PWFA 1MQQA 1LF1A 4AD1A 3RMEA 3PBGA 1LG1A 3K8MA 1R7AA 2WSKA 3AIRA 1JDCA 2VX4A 3VD5A 4IISA 2YL9A 3AZTA 1NQ6A 3WD3A 1M04A 4UTFA 5D9MA 2NT1A 3WD4A 4U5IA 1E71M 3VMNA 4ACZA 2CPUA 3VTRA 3MUAA 3AHVA 4ZXOA 1HN1A 5IHRA 3SUSA 3W6LA 3SEPA 1O6IA 1UD2A 5FD0A 5BYWA 2Y8VA 4BS0A 4ACYA 4OKDA 4W7UA 2PBGA 4AZGA 1XSKA 3AHZA 1V08A 2BY3A 4OOZA 4EANA 1NM9A 1UWUA 1I75A 3FW6A 2YBTA 3PTKA 1LJYA 1QI2A 3EMQA 1GVIA 3SCQA 3DHPA 1TA3A 1UR4A 1CDGA 1LWHA 4B9ZA 1CLXA 3GZAA 1XH1A 4QCFA 1X6NA 4W8LA 4E8CA 2VCAA 3TA9A 5BXRA 1VFUA 1MVYA 2J8GA 4OUEA 4EAMA 3OZPA 1GUVA 5I6SA 3I3EA 3NJ3A 4W93A 2A3CA 3FN9A 1VIWA 1GHRA 1N82A 1MW1A 1BTCA 3SCRA 3CMJA 1MQPA 5AY7A 3BAKA 1KGUA 1ZBKA 2GDVA 4E4PA 1HVQA 1TVPA 3NDZA 3TTQA 1E70M 2WZIA 1QOXA 3EBVA 3POHA 1QBAA 1UZ4A 2ZICA 2W63A 2BY2A 1EH9A 2WHJA 3GH7A 4CD7A 1EQPA 4LX4A 4MNMA 4AD2A 1GPFA 1NOFA 2QPUA 3VIKA 1DWHM 4DM1A 3EYPA 3A4XA 6A3HA 4C7DA 2WZHA 3W38A 1TUXA 4TOQA 1C8YA 3CUGA 3IJ9A 5I3DA 3ZSTA 2WLYA 1W9VA 4P8VA 2WNWA 1VENA 4GQQA 4J3XA 1HVXA 2YA1A 2WYSA 5E9AA 3AFBA 3W82A 3JUGA 2F2HA 3WF0A 5CG0A 2CETA 4HPGA 1ISVA 3PTMA 1CGXA 3AIBA 2E3ZA 1ZJAA 5A95A 1B31A 4A4AA 1ISYA 1HJWA 3ZIZA 2YL5A 3IANA 3N12A 1CBGA 4PSRA 4TX6A 3W29A 4UQ9A 1QW9A 4W89A 2WC4A 3ARWA 4GI8A 3AHYA 1UD6A 2J7HA 1B90A 1HIZA 4PMRA 2J7BA 2O9RA 1FP9A 1XRVA 3GXMA 2XJ7A 4DWSB 1ZB5A 2IUZA 2PI6A 4AZCB 1NOUA 1VJZA 3A3HA 4Q22A 1I1XA 3VDAA 5ECUA 2W4XA 2OLHA 2DGAA 1ITXA 3DC0A 3KZSA 4J3VA 4CN1A 1VB9A 3B8SA 1CYGA 1XCXA 1VRXA 3IAPA 1MXDA 2WVUA 1QVBA 1JFHA 4PTMA 2WMKA 2CERA 1XD0A 3WQWA 3W37A 4OBSA 3WBAA 1JI2A 2FGLA 2NSXA 5M17A 1JYVA 3ARZA 3AHXA 3MMWA 3NSXA 4KWUA 2WXDM 3ZT5A 1CXFA 4YN5A 1ZJBA 1XV8A 2DT0A 1HJSA 1SMAA 1V0NA 4ATLA 4M56A 2WMIB 4PMXA 3VKKA 5A8NA 4M24A 4CCEA 1CGUA 3WNPA 3LPFA 3MSGA 5CPTA 4S3KA 3EDEA 3AMLA 4MDOA 4AIUA 1M03A 1UKQA 3BAJA 4TTUA 1WZAA 4CD8A 3BSHA 4JFTA 3PZIA 2YOCA 2QHAA 2XVPA 1OIMA 1V3JA 4JHZA 1V6UA 1WKYA 3VIHA 3AS0A 3N1AA 1JL8A 4GIAA 1FA2A 1HKKA 1E73M 3MMDA 1R8LA 5HXMA 4D6IA 4UQDA 4ZENA 4IM4A 1W3JA 4KRTA 3W4RA 2EXOA 1XH2A 1JYXA 4MB1A 4P7QA 5JIPA 3GNRA 4JHOA 2CIPA 2PBOA 1UR8A 4B15A 4GKLA 1WDRA 3ALFA 1EXPA 5GQBA 3M07A 3NSNA 1FH8A 3ZJ8A 1C93A 4OBRA 3ZT6A 3CZGA 1KXTA 1CGTA 2WCAA 2JIWA 1UR9A 4M8UA 2GFTA 2XHYA 4U31A 3KL5A 3WDPP 4D6FA 5I79A 2ZUTA 2EJ1A 1GOKA 1WZMA 3PZNA 4W86A 1W3HA 3NYDA 4PMVA 1V6YA 1JI1A 4UQEA 4C7GA 4AZ5A 3MS8A 1SMDA 3WEOA 1V6WA 1E4LA 5ABFA 3T2OA 3WDQA 4M82A 2C7FA 4UOZA 5A6SA 1EA9C 1WDPA 4DM2A 4TUFA 4EK7A 1EHNA 1C7SA 3N17A 1TZ7A 4AXNA 1JIBA 4ZFMA 1GW1A 3D3AA 3MSDA 4GI6A 2WLZA 4D6JA 3G6LA 4AWEA 3ZQ9A 4FLRA 4AZ6A 3TTOA 1HL9A 1QNOA 3AZRA 2YIHA 2VZUA 1BYAA 4QCEA 3RM4A 1Q6GA 2XFYA 1FOBA 1V02A 2XSBA 3VGEA 1V3IA 1V3HA 3EDDA 1KGXA 5M5DA 2X8RA 2O9TA 4GO8A 4QFUA 3WFZA 1BYDA 4M1RA 3NUKA 4Z2JA 3ZJKA 1Q6EA 3VIOA 5BXTA 1CTNA 5F7UA 3S6TA 2DPEA 1J9YA 5FIPA 5CPSA 2WSPA 3BAWA 4JAWA 1CXKA 4YHGA 1WZKA 3ARXA 3PZMA 1JD9A 4UFKA 2D24A 1FHLA 1DWGM 3AICA 1ITCA 1QHPA 1WB0A 3B9DA 2DT1A 4QP0A 1Q6CA 4KRUA 1WE5A 3UG3A 2VI0A 1QNPA 4C7FA 4JFVA 1TR1A 2G3MA 4JL1A 1GOQA 3FAXA 5CLTA 4BQ2A 3U7BA 2F61A 2DH3A 2ZXQA 1H11A 2BY1A 1UWIA 1BLIA 1Q6FA 5E0FA 4HP5A 1W9BM 2FH8A 4RE2A 1GOIA 1MW0A 1C3FA 4WSKA 3NDYA 3N9KA 3ZJ6A 1CXIA 3AJ7A 3K8KA 1CEOA 2X1IA 3MUY1 4JZ5A 4ZE4A 3FHAA 1KXHA 4PMDA 1GORA 4D6DA 1OINA 1UWSA 4ZXLA 3WNOA 3VGDA 4MJ2A 1F4HA 1BG9A 3MV11 3SUTA 4H2CA 4GQRA 1GJUA 1OWQA 1IT0A 3MUZ1 1XC6A 2EQDA 2JF6A 2W67A 5CJ5A 4L4OA 4UFMA 4IPNB 1IZJA 1LG2A 4V28A 2G3JA 3T0BA 5I78A 3BSGA 3FNDA 4DUVA 3VU2A 1E6PA 4BCEA 2YDQA 5LA2A 3I3DA 1W1PA 3WIJA 1GCYA 3WELA 2DH2A 1G01A 4AEEA 4JCLA 1BAGA 1NWRA 1GQJA 4GZIA 3VOCA 1SR0A 1RP8A 2EPKX 3OLDA 2Y24A 2NT0A 3NSMA 5D8ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2O9P A;  4ATD A;  3WDI A;  3IJ8 A;  4HA3 A;  3ALG A;  2WWC A;  1XH0 A;  4D6E A;  3MAN A;  1QI5 A;  4AEF A;  1V0K A;  1E6N A;  1ECE A;  1K9F A;  3WD2 A;  4TVU A;  4J3U A;  1K9D A;  2GVY A;  2XM2 A;  4MJ4 A;  1OGB A;  1W32 A;  2ZX9 A;  5DT7 A;  1EOM A;  2BS9 A;  5A2A A;  2XYL A;  4MNL A;  3PZO A;  2Y8K A;  1XGZ A;  1UH2 A;  2D23 A;  4AD0 A;  1EHA A;  1WDQ A;  2XVN A;  1PIF A;  1J18 A;  1C8X A;  4P7N A;  5A6L A;  4N0R A;  2YA0 A;  2RGL A;  1XCW A;  2XVL A;  2WBK A;  1OGG A;  4UQB A;  3VNY A;  2BVY A;  3M6D A;  1JAK A;  1VFM A;  3W26 A;  7A3H A;  3L4U A;  1CGY A;  3LMY A;  4W87 A;  1V0L A;  2EPM X;  2PWD A;  3BMV A;  3E1F 1;  2VZS A;  1DTU A;  1GOO A;  3L4T A;  5BWF A;  4NSB A;  4UOJ A;  4XX6 A;  2ZUU A;  2YBU A;  2A3H A;  5A2C A;  1E55 A;  5LA0 A;  2J8F A;  4WF7 A;  3AS2 A;  2X0Y A;  3BAX A;  1J0K A;  3CTT A;  4J28 A;  3CHD A;  5I5R A;  3GXD A;  3CBW A;  2ZOX A;  1QI4 A;  1QNQ A;  4J3T A;  1HKM A;  1E15 A;  1RD6 A;  1JF5 A;  4F9D A;  3VIN A;  1PX3 A;  4U3C A;  4AZI A;  1HJU A;  3WDR A;  4GI9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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