5IXEA

1.75a resolution structure of 5-fluoroindole bound beta-glycosidase (w33g) from sulfolobus solfataricus
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
489
structure length
485
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDGYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-galactosidase
publication title Full and Partial Agonism of a Designed Enzyme Switch.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 200
structure length 485
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2016-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5ixeA00
1QVBA 1DP0A 1DHKA 1HVXA 1OT1A 2J7HA 1UD3A 1NWSA 2WVVB 1J0KA 1RH9A 2W61A 3ARUA 1UKPA 4J7RA 5AYBA 4WF7A 3CGTA 1NQ6A 3WQVA 5I3DA 3TOPA 3WF4A 3WMCA 2W91A 3DYMA 1E9LA 1JZ5A 4DWSC 4UCFA 3VIOA 3VD4A 1O6IA 1Y7VA 1Q6CA 2QV4A 4AZ5A 4Z2JA 1US3A 2W67A 2WHMA 5A6SA 3W6LA 4HZ8A 1GCYA 2RGLA 1RP8A 3AXHA 1MWOA 3HN3A 4CD8A 1UHVA 1VBUA 2PC8A 5DMYA 3I3DA 1ODUA 1XH0A 1W9PA 1CBGA 3M46A 4MNKA 1WDRA 3WD4A 3SCNA 3VDHA 2GDVA 1EHNA 3L4YA 4W7UA 5AYIA 3VIFA 2F8QA 4H2CA 3T0DA 2GJXA 1PIFA 2VCAA 4JKLA 4D6EA 2DT2A 2D1ZA 2WYSA 3WH7A 1CGTA 3MV01 1C8QA 1WPCA 4OBSA 1QNOA 4GKLA 5AY7A 3WDHA 1UR4A 2ZX8A 4YHGA 2EJ1A 1KBBA 3HJEA 3BC9A 2ZUUA 3JUGA 1W9BM 2WMKA 1KGXA 1VBRA 2CYGA 1OT2A 4Z2GA 4LPCA 1EO5A 1PPIA 4Z2IA 2PF0A 4CU6A 1KXQA 1AQHA 5A94A 1HT6A 1E71M 1V0MA 4NZCA 3ARZA 4HTYA 3VDCA 3AIRA 1NH6A 2J75A 3EMCA 4JFUA 1HN1A 1QHPA 4P8WA 4UQBA 4CN6A 1MW1A 3W25A 1W2VA 2B31A 3MV11 4D6HA 3ARYA 4WLCA 1SMAA 1GHSA 1GQKA 4H04A 4WKFA 1TVNA 3ZT5A 2GVYA 5I6SA 2GSJA 1GPFA 3IJ8A 2PWHA 3AMCA 2J25A 2WC7A 1HKJA 1CDGA 1U30A 4J3VA 1BQCA 3OGRA 4PMZA 1E70M 4V2XA 3SURA 2CESA 1BG9A 3HMCA 3RO8A 3KL5A 1C91A 5C8BB 1KXVA 2YOCA 3VIKA 1H49A 5BXRA 1E4NA 2XGIA 4FLOA 4W85A 2JFEX 1ITXA 2WMGA 4CU7A 3M6DA 4AMCA 3ZJ6A 3GXIA 1UQYA 3FW6A 2F2HA 3A4XA 4AD1A 6TAAA 3UR7A 1FP9A 2HVMA 3N12A 2E8ZA 1UR2A 3WDJA 4PN2A 2XVKA 3WEOA 1R87A 3IAQA 4PMUA 1HXJA 3SUUA 1VIWA 1E1FA 2YL9A 3MSGA 2DEPA 1LG1A 4OKDA 1UKTA 2VX7A 4TUFA 2XJ7A 3AIVA 4TX6A 2XWDA 1QBAA 4GQRA 1GW1A 3J7HA 1R85A 2W5FA 3GZAA 4D6GA 1H0IA 2XG9A 4B3KA 1VFMA 2VX4A 5LA2A 2OWXA 2V3DA 4Q7NA 2EEXA 1E6ZA 1G9HA 1WE5A 2BHUA 4C7FA 1J0YA 3CUHA 4H7VA 3FAWA 1FFQA 2CPUA 4WKHA 1E3ZA 3U5UA 4HZ7A 1VRXA 4AZCA 3POCA 4MNLA 5JIPA 2YA2A 5TD4A 3WENA 2JEQA 1G0CA 3WELA 3L4TA 4Y7EA 5E6ZA 1R8LA 3ARTA 3T2PA 5FKYA 1TFVA 5KEZA 2VT0A 5CLTA 1FA2A 2XTKA 2VCBA 4J3WA 1NOFA 4PCTA 2X09A 1TA3A 4MNJA 3WDRA 5ABGA 5D9PA 4HU0A 1CTNA 2ZIDA 1HKMA 1JG9A 2WAGA 1ZB5A 4ZEPA 3A4WA 1KXTA 4HU8A 4W7WA 5CGMA 2VZOA 2CHOA 3CMJA 3VIJA 4ZE5A 2VC9A 4LYRA 3WKZA 3I3BA 1Q4NX 4ZFMA 3W26A 4W8AA 2VVSA 1BAGA 3WF0A 2J7DA 3MMDA 4XV0A 3SCQA 4DUVA 1TG7A 1GNXA 4B16A 2NW0A 1EOKA 4UFMA 4MDOA 1VEMA 2O9OA 5LYRA 2WZIA 4FK9A 3VNYA 5E0CA 3UESA 1EO7A 1QI3A 5CPTA 1H1NA 4UFJA 1J10A 3WL0A 3WF3A 1UZ1A 1W1YA 5I24A 4TVDA 2JALA 2WMHA 5CG0A 3UG3A 2YBUA 2WVTA 4NRSA 1B1YA 4FLQA 3NDYA 1B3ZA 3SCVA 3TTSA 4UFIA 1WZAA 4AEFA 4AXNA 4K68A 1IZKA 2GDUA 2ZX6A 1GJWA 2EPLX 1KR0A 1GJUA 3B9EA 5BROA 3AS0A 2XHYA 2XYLA 3SCSA 2GUYA 5ABEA 1MFUA 4E4PA 4UOZA 5I0DA 2W4XA 1FH8A 2J77A 5E70A 3AOFA 1JXJA 2WSKA 2J47A 1J9YA 1ZL1A 4FLRA 4AWEA 4AIEA 5A8NA 4DWSA 1PEZA 3APGA 1ECEA 1XCWA 1V6VA 2YDQA 5BXSA 4XB3A 4P8XA 4QP0A 2QHAA 4U33A 3W38A 1LJYA 4NF7A 3A4AA 5HDRA 3BSGA 2PB1A 4MB4A 2WCSA 1V3JA 3II1A 1BLIA 4UQEA 2EPOA 1H4PA 3O6AA 1J0IA 4AZGA 3VM5A 1UR9A 3F5JA 3KZSA 2E3ZA 1XRVA 5E09A 2F61A 4PTXA 4KRUA 2VRJA 1EXPA 3THDA 1HKKA 4WSKA 2QPUA 3W37A 4M29A 1EH9A 4AZCB 3U7VA 4IM4A 2CHNA 5JBDA 2BVDA 2ZUSA 2G41A 4TX8A 3AJ7A 1PBGA 3AIWA 3CIVA 3W28A 3OLIA 3HU7A 3QOMA 3NSXA 4PMDA 4HZ6A 1HIZA 2DDXA 1XSIA 2VQUA 1DWJM 2UY4A 1GOMA 2PWGA 2BY0A 1MVYA 3CUGA 3VINA 1JI1A 2V3GA 1TA3B 4N0RA 1QNPA 4RE2A 3WMSA 1UH3A 1VENA 3CMGA 3B9DA 1TE1A 4YPJA 3MO4A 1E0XA 1CXLA 3VD3A 5A8MA 1V3KA 4F79A 4URIA 2Y5EA 1GOQA 3W29A 1LWHA 1NWTA 2CEQA 5I77A 3GNPA 3W53A 3CO4A 2J7GA 1EGZA 4MJ2A 1LL6A 2YBTA 1TVPA 1UD8A 1UR8A 2YA1A 2O92A 4PTWA 1CLVA 2G4FA 4PCSA 1UH2A 3ZM8A 1G01A 3L2MA 2XIBA 1VFUA 2WB5A 3VPLA 5HXMA 3VDAA 1JIBA 3DC0A 4H8VA 3VIGA 2E40A 4W89A 1KCLA 1ZS2A 2XWEA 2CBIA 5D9MA 4F9JA 5HOSA 4WJXA 1C7SA 4MB1A 1E5NA 1HKIA 1OM0A 1GORA 3RILA 3TONA 3FNDA 5CSYA 3TP4A 1PIGA 1HJWA 1V02E 3DYPA 3CLWA 3OLEA 6CGTA 3T2QA 1UZ4A 1KBKA 4HMDA 2VX6A 5CGTA 4AZ6A 3EBVA 2EBNA 1G5AA 3WIJA 1A3HA 1LQ0A 1QOXA 1SFSA 5EFDA 3ZJ8A 3DECA 2W62A 4JFVA 1MXGA 1CNVA 3AZTA 4W5UA 2X2YA 1BFNA 2A3CA 1FFRA 1V3LA 2CIPA 1ZJBA 1E0WA 2DH3A 1JNEA 4XUYA 3IAPA 1UWUA 2XM2A 4KWUA 3VOCA 1KFWA 3M7SA 3VNZA 5DO8A 3CHEA 3WD2A 1LL4A 4E8CA 3SUWA 2XUCA 3WBEA 3VTRA 1E6PA 3ECQA 1ZBCA 2XFRA 1PJ9A 3MANA 3EDEA 2WMIB 3CHDA 2E0PA 2A3EA 5IXEA 4GO9A 4IISA 4P7RA 3ARQA 1QW9A 4D6DA 4XZWA 3BCFA 1JDCA 3UEQA 2BNJA 4D6FA 2OLHA 3WUFA 1NP2A 3WH9A 3ZR5A 4AIUA 1YQ2A 4JL2A 3BAJA 1AQ0A 3SCRA 1V6YA 1SMDA 1C92A 1ISZA 4PMVA 1MQPA 1KR1A 4UQDA 1GQJA 4IPLA 4X0VA 4S3KA 4W87A 3VMNA 1ISVA 3AYSA 3WUGA 1MQRA 2BY2A 4GZJA 3PZOA 4HMEA 5CPQA 4UFKA 4MB3A 1O7AA 3RJYA 2WVSA 2C7FA 1XYZA 4B15A 4J3TA 4EE9A 1OD0A 3S2CA 3WUEA 1UG6A 5CPSA 1U33A 2J4GA 3ZJKA 2DSZA 2DGAA 2QPSA 4PBGA 1W9VA 3RDKA 1VFOA 1PX8A 1HNYA 2YDSA 4ZXOA 3O2LA 3ZSSA 4C7DA 2D23A 1CGUA 3GXDA 2EPMX 1C8YA 2NT0A 4JFTA 3SCPA 3WF2A 2X0HA 2WBGA 3SUVA 1X6LA 2ZICA 4GPNA 2OYMA 1H0GA 2CNCA 3A6OA 4PUEA 2G3JA 3OZPA 5A6KA 1PAMA 1V03A 1K6AA 2CBVA 1UD5A 3RCNA 4CCDA 3UCQA 1UQZA 2WKLA 3WQ8A 2A3BA 4AC1X 1DTUA 3OIHA 1UA3A 2JE8A 2BVTA 2WCGA 3EDFA 2EXOA 2J7BA 2FH8A 3BMVA 4QLLA 5ECUA 1PX4A 2FHBA 3ARWA 3AS3A 2WHLA 3PTKA 3WH6A 1BHGA 1UWIA 4EK7A 2BXZA 1I75A 1M03A 1CZ1A 2ZWZA 3UG4A 2D0FA 3ARPA 5BWFA 5AC4A 4ACZA 3AZSA 2FH6A 3AHYA 4PTVA 3WD3A 3W81A 5HPCA 4OOUA 4DM1A 3WDQA 2GJPA 1XH2A 4CU8A 3VIHA 3OZOA 3I3EA 3KEHA 1N82A 4F8XA 3QR3A 3ZJ7A 2QMKA 3TTOA 4JKMA 4JCMA 2ZX7A 3W24A 1EIBA 1CPUA 2UY3A 4TXEA 2V5CA 1NARA 4BQ2A 2VZSA 1EDTA 1KWGA 2BS9A 1SYTA 2CERA 4CD4A 2J62A 1R86A 2XVLA 1W2PA 3F5LA 2DIJA 4PEEA 1OWQA 4JFSA 3K46A 3AHXA 2FDMA 2W63A 3T0AA 2V3EA 2D24A 1ZJAA 2J7FA 2XVGA 2Y24A 1UKSA 4ZXLA 1WZLA 3BAXA 5FIPA 1J0HA 4M1RA 3AS1A 5JBEA 3K8KA 3N9KA 3FHAA 1KB3A 1QI5A 4P7NA 3VILA 4BS0A 2GK1A 1VEPA 3MUIA 1WAWA 1H11A 1LF1A 4TVUA 3U5YA 3SEPA 1UWRA 5ABFA 3L4WA 4J3XA 5GPRA 4U3AA 2YJQA 3T09A 1HP5A 1CXHA 1F4AA 1UH4A 1BSIA 2G3IA 4W93A 3IANA 4U2ZA 2VI0A 3OLDA 5F7UA 1HJSA 3B9AA 1W3LA 4WKAA 3W6MA 1Z32X 3KE0A 4M56A 1J0ZA 2WWDA 1MW0A 1WNOA 1JF6A 4U5KA 3DHUA 3VGBA 2CETA 1HJQA 1PX3A 4P8UA 1JZ8A 5A6MA 2PWDA 2NT1A 3OB8A 5CSUA 3FY1A 1CXKA 1R7AA 2GJXB 2WC4A 1E6SM 1VJZA 3UG5A 1I1WA 3EDKA 1JNDA 2DQXA 3OG2A 2VJXA 2J8FA 2Y4SA 2VX5A 4JAWA 3TA9A 3T0BA 1B30A 4HMCA 1WDPA 4PMYA 4TTUA 2A3AA 1E4LA 3VGDA 5FL0A 5C71A 3AROA 4L4PA 2ZX9A 3IJ9A 1MFVA 4GIAA 3GH4A 2YLAA 3CHFA 2VVNA 3D3AA 3N04A 3PZMA 3BH4A 4ACZB 2Q8XA 3CZJA 3A3HA 3AYRA 1LG2A 4A3HA 3NSMA 4QAWA 3VO0A 5M17A 3WY1A 3AMDA 3LMYA 2JF6A 3NJ3A 2OSYA 3AS2A 4KMQA 2Y2WA 1TCMA 2XVPA 4W86A 3WNPA 2VURA 1ISYA 1AVAA 1WO2A 4DWSD 1XSKA 3PZVA 3K8LA 4AD4A 3AXIA 4L4OA 2J8GA 4HOXA 1Q6GA 2O9RA 2D3NA 3ZIZA 2VMFA 2C0HA 2W92A 4OIFA 1K9DA 4XZBA 2QLYA 5EFFA 4BQ5A 2O9PA 3IJ7A 3MMUA 4MPKA 3AHTA 3VIPA 8A3HA 2WNWA 5GQBA 4HOWA 1H09A 3BLPX 3ZT6A 3RMEA 4JHZA 5D9OA 3LPFA 3S6TA 1CWYA 4B9YA 1NOUA 1QPKA 2YIHA 3N18A 3WSUA 7A3HA 3AIEA 3CZLA 1BYDA 3GNOA 3W82A 2CXGA 3FHQA 4WK9A 1E72M 1W91A 1L8NA 4JCLA 3MUAA 1P6WA 2X05A 4H8HA 5I5RA 2UY2A 1E4IA 1JZ4A 5ABFB 2XVNA 2Z1KA 1NP0A 6A3HA 1HF6A 2GFTA 2JIWA 2YL8A 3OLGA 4QLJA 4UQ9A 9CGTA 3UERA 3ARXA 1IT0A 1GQLA 4OBRA 3CUFA 1MYRA 3E1F1 1JAKA 4W7VA 1ISWA 3WH8A 1PZ3A 2WLYA 4OOZA 3VD5A 4CCEA 4R5EA 3POHA 2CKRA 2WVVA 2WW5A 3NCOA 4ACYA 4AISA 2VQTA 1W1PA 2ZUTA 1JYWA 4GZIA 3VD9A 2C8NA 4MNMA 5EMYA 2WK2A 2XSAA 2DSVA 4TTGA 3RJXA 2JEPA 1KXHA 2YKKA 2J7CA 4NRRA 4HPHA 1J12A 2ZWYA 1V6WA 2VR5A 4F9DA 5A2BA 4MJ4A 4W84A 4U2YA 1NWRA 1C93A 1QHOA 5LA0A 2BV9A 3CH9A 2VOTA 5A8OA 1UYQA 3QGVA 4D1JA 3VGEA 4JKKA 1J11A 1OCQA 1L0PA 4GO8A 2X1IA 4N42A 4UTFA 1H3GA 2JIEA 4AY1A 1J0JA 2D3LA 2WZEA 1GONA 3PBGA 4AD2A 5CJ5A 3WUBA 2VTFA 4M82A 4BA0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QVB A;  1DP0 A;  1DHK A;  1HVX A;  1OT1 A;  2J7H A;  1UD3 A;  1NWS A;  2WVV B;  1J0K A;  1RH9 A;  2W61 A;  3ARU A;  1UKP A;  4J7R A;  5AYB A;  4WF7 A;  3CGT A;  1NQ6 A;  3WQV A;  5I3D A;  3TOP A;  3WF4 A;  3WMC A;  2W91 A;  3DYM A;  1E9L A;  1JZ5 A;  4DWS C;  4UCF A;  3VIO A;  3VD4 A;  1O6I A;  1Y7V A;  1Q6C A;  2QV4 A;  4AZ5 A;  4Z2J A;  1US3 A;  2W67 A;  2WHM A;  5A6S A;  3W6L A;  4HZ8 A;  1GCY A;  2RGL A;  1RP8 A;  3AXH A;  1MWO A;  3HN3 A;  4CD8 A;  1UHV A;  1VBU A;  2PC8 A;  5DMY A;  3I3D A;  1ODU A;  1XH0 A;  1W9P A;  1CBG A;  3M46 A;  4MNK A;  1WDR A;  3WD4 A;  3SCN A;  3VDH A;  2GDV A;  1EHN A;  3L4Y A;  4W7U A;  5AYI A;  3VIF A;  2F8Q A;  4H2C A;  3T0D A;  2GJX A;  1PIF A;  2VCA A;  4JKL A;  4D6E A;  2DT2 A;  2D1Z A;  2WYS A;  3WH7 A;  1CGT A;  3MV0 1;  1C8Q A;  1WPC A;  4OBS A;  1QNO A;  4GKL A;  5AY7 A;  3WDH A;  1UR4 A;  2ZX8 A;  4YHG A;  2EJ1 A;  1KBB A;  3HJE A;  3BC9 A;  2ZUU A;  3JUG A;  1W9B M;  2WMK A;  1KGX A;  1VBR A;  2CYG A;  1OT2 A;  4Z2G A;  4LPC A;  1EO5 A;  1PPI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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