5K7J | Genus

Total Genus 90

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	90
sequence length	247
structure length	240
Chain Sequence	PRYLKGWLKDVVQLSLRRPSFRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYSKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMADFIVKESQIDDAYNLGADTVLLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIGINDENDLDIALRIGARFIGIHSHNKENQRKLISMIPSNVVKVAAHGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKEFIL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Metal binding protein
molecule keywords	Indole-3-glycerol phosphate synthase
publication title	Probing the minimal determinants of zinc binding with computational protein design. pubmed doi rcsb
source organism	Sulfolobus solfataricus (strain atcc 35092 / dsm 1617 / jcm 11322 / p2)
total genus	90
structure length	240
sequence length	247
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2016-05-26

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5k7jA00

2A85A 3M41A 4CQ8A 1ML1A 4MFDA 4UFHA 3W76A 1K8XA 3BLFA 4NZFA 3O6DA 2NX3A 2VC6A 4UFKA 2QF7A 1CX9A 3W2NA 1PVNA 3G1SA 5HMSA 1M7PA 2CLLA 1DQWA 2FLIA 1OHLA 1Z48A 1YXYA 3THQA 4GBUA 5C54A 3S5NA 4LU0A 1TPC1 2CZEA 3BVJA 1TPFA 4WY0A 4EVZA 4H4IA 3RLUA 1D3GA 2C13A 4ZQNA 5HULA 3RK8A 1LP6A 3G3MA 2QCHA 4HPXA 3W07A 3ATZA 1LBMA 1H5YA 3M7WA 1O5KA 2A0NA 5DCBA 4JICA 1ME7A 4O13A 2ISWA 4ZVJA 3YPIA 4E2DA 3M0ZA 4XKYA 4R7JA 4O57A 1WBJA 4NUWA 1DQXA 4IQLA 5D2YA 3EWYA 4AMAA 3LHZA 4RCXA 4UTTA 2C18A 2A6LA 5AYXA 3IVSA 1DVJA 3PBWA 3EKLA 2YGYA 5I3KA 4NX5A 4O52A 3MI2A 1AW5A 1EP3A 2E6AA 4AB4A 2B4GA 3TFCA 4LV9A 4AHQA 1LTDA 2PURA 2GVLA 4S2CA 4UTIA 4N6EA 3SY5A 1SFLA 4O17A 3M1ZA 4H3DA 4PL1A 1WOAA 5I3FA 4JIQA 3W71A 2PE4A 2CZDA 1OYBA 5DXYA 4LTSA 3ATYA 1W56A 3MMTA 3GR7A 2A6NA 1VJIA 2H90A 2W0UA 5DLCA 1P0NA 3QFEA 1VC4A 4TU1A 4MLJA 1P1XA 4NU7A 3NOEA 3W75A 3WK3A 1OFDA 5FEWA 1AL7A 4FNSA 1QOQA 5D05A 3B0UX 2JBMA 2NWRA 1EP2A 3IIOA 1K3UA 3M5ZA 1H7RA 2AGKA 3CIXA 4N9DA 3FOKA 4JTEA 5C2XA 1TO3A 3U8GA 5IM51 2GUUA 3QMTA 5AN7A 5D04C 5AOUA 3TAOA 1ZHAA 3W22A 3R13A 3MP5A 1U83A 1VYPX 1UB3A 4N6FA 1S5VA 5D32A 3D0CA 3TXZA 4EWND 3RF9A 3BW4A 3WJYA 4RZ4A 2WSRA 4IMGA 3FS2A 4UTHA 2JKAA 2WNNA 3LXAA 1OYAA 4WOQA 2ISVA 2VELA 5I3HA 4UTTC 3NL2A 5FEXA 3IGUA 3LB0A 4JYEA 2CLFA 1D9EA 1TTIA 3T40A 1TSIA 1AW1A 1QO5A 3MP3A 3H53A 4CCDA 3PUEA 1N7KA 3B03A 4UFJA 2ZRXA 1XI3A 4BI5A 4UIOA 2V0TA 4FXRA 2RKXA 4LS2A 2FB3A 3IRDA 3QW4B 4IGHA 4RK8A 1OABA 1GVFA 4OV9A 5U4NA 1GG1A 3NQ7A 4MZ8A 3VKJA 2RDWA 4P61A 3DENA 5U7SA 1KM3A 3BARA 3CTLA 3C2VA 4K37A 3T7VA 4UR7A 1J4EA 5AHIA 2G96A 3W7RA 3P5ZA 2EF9A 1QFEA 5AC8A 4MZYA 1LLWA 2ZRWA 3R89A 2E68A 3F1QA 3ELFA 4JIPA 3GVGA 5DN1A 5LSMA 3GR8A 4JN6A 1ICPA 3UY8A 3UXDA 1P4CA 1JUKA 1IXQA 1EP1A 3W7DA 5G2WA 4DPQA 2NXIA 4ZQRA 3WK0A 2YPIA 2QAFA 3W85A 4HNNA 1GTHA 1XBZA 2P1FA 3TXVA 4EOUA 1T99A 3OVRA 3OG3A 1SW3A 5F4WA 2NV2A 2WNZA 2XN1A 4JD4A 1SZNA 3UD6A 4NJIA 4UNLA 2EKCA 1F76A 3GAYA 5I3IA 1WX0A 1M6JA 2BTMA 5D37A 4JDYA 3MHUA 1LBLA 3PBUA 4JTSA 1YXDA 4K39A 4UTUA 2ZA3A 1Z41A 3GKFA 3LCFA 3PVFA 1P5BA 1A5BA 4XBKA 5E0KA 4ORIA 2W6RA 4O50A 3TW6A 3SI9A 1NF0A 1HL2A 3KOFA 1H7OA 3CQ0A 3OHIA 4BK9A 1IIHA 2I1OA 1O95A 2O7QA 2BZNA 1VHNA 1I2OA 3W1LA 1TJPA 2F84A 3PWAA 4Y9AA 2ZZ4A 1ME8A 1QPNA 3UQNA 1MO0A 2XFWA 2NX9A 1RZMA 3MBDA 2HTMA 5CZ0A 1FCUA 1XBVA 1XUUA 2E5DA 3DU0A 4MOZA 3TIMA 3LLFA 2TPSA 1I4NA 1VLWA 2ZFAA 4HSNA 1EUNA 1YTEA 1H1YA 3LCWA 2JGYA 1SU5A 2VOMA 1LRTA 1FCVA 3IIZA 1ALDA 3B8DA 4OWGA 1EUAA 4UFIA 1KM4A 3BK0A 3GX9A 3QF0A 4TR9A 3QRHA 4WJEA 4WY0F 4IX2A 3GXTA 3JR2A 3GYEA 4FEZA 1XCFA 1W3IA 4QISA 2I9EA 3E0IA 5CSSA 2YW4A 5E1QA 1QNVA 5FEPA 3MP4A 1Q6RA 2RH9A 3O16A 2NUWA 1TJRA 4LVFA 1X1ZA 1TCDA 2GJLA 2CLMA 2QCCA 2RFGA 1KFJA 1THFD 1Y0EA 2GQAA 3P60A 2VKZG 3EXSA 2X16A 1SPQA 3LHWA 1DL3A 2A4AA 4FX7A 1Q6QA 1TPB1 4IXHA 3BG9A 1H7WA 4NXSA 5F4SA 3NQEA 3OBKA 3O05A 5CPLA 3RU6A 5BW6A 4O11A 4K8EA 3CEUA 3CU2A 1ZENA 3UPWA 5ABTA 3B0VC 3NAVA 3O8AA 3W7NA 3L5LA 2ZA2A 1BKSA 1QWGA 1G6CA 4JTJA 4MY1A 3NQDA 4FNTA 5CZJA 4AHPA 3QH2A 3KVMA 1EB3A 4ZQPA 3IGSA 4Z1AA 3SECA 1S5TA 1UJPA 3WJSA 1YDVA 3AO0A 5L6UA 3M43A 4I7UA 1WQ5A 3W6YA 3KX6A 3TV8A 5FF7A 5K9CA 4P2VA 2NX1A 5EYWA 5IBXC 3B4UA 5TQLA 2ZZ6A 4UTMA 4UMBA 2QCDA 1MEIA 1HO4A 1XUZA 3UWQA 4DF1A 4MJMA 3EX4A 3FJ6A 1RVGA 4M6PA 5L9FA 2A7NA 3MYOA 4JR5A 1HTIA 3EX3A 1DORA 3PC0A 3DHDA 3HG5A 1QPQA 2WKJA 1G67A 4XQ6A 1LORA 5J5DA 3STFA 3KRSA 5HNRA 2R91A 5F4XA 2G95A 3LDVA 1OX4A 4OBTA 3NR0A 3L0GA 3NO5A 2PC4A 3KXQA 2CFFA 5F2LA 1Z42A 1K7XA 1EEPA 1SZGA 3MUXA 2DJXA 3W7QA 4ADUA 5EKYA 3DFPA 1FDZA 4CQ9A 1R2SA 1LOQA 1NF7A 3W1UA 2ZRYA 1Q45A 1G7UA 4GUHA 3KRZA 2DORA 3DFQA 2C0AA 4GE8A 3VCRA 3L2IA 3CB8A 2DZVA 3FLUA 1AL8A 1ZJIA 4GJ1A 4JY8A 1SO6A 3W7IA 1O60A 3OVPA 4D2JA 2A21A 3M16A 1ZALA 3C61A 3MW7A 2ZTJA 2ZCGA 2WJZA 1JCXA 3DAQA 3GNNA 3QQ0A 3LGEA 1KW1A 3O1NA 3UWVA 4RX0A 2QJHA 4N9CA 1PIIA 1DJNA 3W1RA 1I2PA 2Y85A 3DI0A 3TR2A 1KM6A 3I68A 2NZLA 4DO6A 4JTGA 2ZRZA 3W2KA 3B0PA 4KWVA 3HOJA 2FIQA 4O1CA 4S1FA 1ADOA 3EXRA 3LV5A 2EPHA 3OVQA 2DP3A 1OFAA 1OFOA 5LZLA 3UZJA 1YTDA 2J88A 2DU2A 1F05A 1YDOA 3VE7A 1PV8A 1GYNA 4JS3A 3QMRA 4XTDA 3W7GA 3GXPA 4UR8A 3S0CA 1TTPA 1ME9A 4MKNA 2Y70A 4FHAA 3W1PA 3WJXA 2YXGA 3Q37A 4Q4KA 4GXMA 3U6WA 1GVQA 5D33A 2C16A 3A5VA 3QC3A 3GDKA 3OA3A 2C19A 2NV1A 1X6UA 1EPXA 3STGA 4GUFA 1L6YA 1VZWA 1QO2A 3I7RA 2PRLA 2ZZ7A 4N9EA 3NL6A 2A2IA 1TPVA 1JJKA 2CLHA 1XBXA 4L4LA 3HGSA 3W73A 1BWKA 3BW2A 1B9BA 3SIZA 3DZ1A 1R46A 2AQWA 3LLDA 1SUXA 5FESA 4ZL1A 1L6SA 1SSDA 5CPNA 4S2BA 2QCEA 3S1VA 3NQAA 4O54A 3TSDA 1QPRA 1R2TA 4WXZA 3EWUA 3P82A 2Y7FA 5LHFA 2ABAA 3W74A 4ONVA 5I3JA 1F2JA 1F5ZA 2OX1A 1RV8A 3W83A 3N3MA 2V81A 3G0UA 4MZ1A 3PAJA 4PH6A 3NQGA 4CNOA 2YCEA 3NQCA 4PCFA 3F4NA 3VE9A 1F73A 1LOLA 1W3NA 4NT0A 5GVJA 4JX6A 1LBFA 1JR1A 4M7TA 4AWTA 1YDNA 2FFCA 2P10A 1L9WA 2QR6A 5EA9A 4KKXA 1HFBA 4LVAA 1LDCA 1KV8A 1Q6OA 4BI6A 4HN4A 3W2MA 5CZTA 4TO8A 2R14A 5AHFA 4RV8A 3DKLA 2C1HA 3GIYA 1I2NA 1TQJA 1I8JA 3HJZA 3LBCA 4CCEA 4BWLC 2BXVA 1IXPA 4LRTA 4PC8A 2X2GA 2BWGA 4R53A 4NVTA 3W7CA 5G5IA 3IV3A 4HNTA 1JCMP 3TSBA 2ZZ2A 4QSHA 1TMHA 1WAUA 3DFOA 1IXOA 1AG1O 3L66A 3QEZA 4OGZA 3NYZA 5FF4A 1FBAA 3BG3A 3G1AA 5EBUA 5FF3A 3KHJA 3LXCA 2C15A 2A1YA 3C8FA 2VEIA 2WV8A 1W1ZA 1WYIA 5F1VA 3STCA 2ZZ3A 2CW6A 1SQ7A 5FF2A 4K7VA 3I6RA 1OFPA 4G1KA 2WOQA 1KFKA 4QIUA 3NVTA 4WUIA 1O94A 5CPMA 3L65A 2C6QA 3UY7A 3P67A 2DZUA 1S5WA 1JCNA 2J27A 1G4PA 1W5OA 3CPRA 6ALDA 3HG2A 2PCQA 3JRKA 5CPOA 3LTYA 3G1XA 1FCBA 2VFFA 4O19A 2V82A 3PUDA 2CLIA 3NM1A 4I7VA 3P84A 4YMZA 1LCOA 3NXFA 4QITA 2E6YA 4DPPA 2NWSA 3A9IA 1B57A 3Q58A 3ABRA 5CZSA 5F2GA 3WK1A 3S5OA 1FUYA 4HPJA 5KZDA 1L6WA 3G22A 3C0JA 1Q6LA 3BLIA 2Z1BA 3HIJA 1O4UA 5HUPA 4IOTA 4JX4A 4OQVA 4UC5A 4Z1DA 4FNPA 1Z44A 4OE7A 2GVGA 1G69A 2V5LA 3EX2A 1BTMA 4LOCA 1UCWA 1TPUA 3QZEA 2OT0A 1TV8A 2IQTA 1UUMA 3PBYA 1JQXA 1SR9A 4A22A 3C52A 4MYXA 3PSVA 3W84A 3W72A 4YCPA 4Z1BA 1TTQA 5T26A 1VR6A 1FWNA 2PRMA 2ZTKA 4K8HA 3ANYA 4Y90A 4Q33A 3NZRA 4YL2A 2Y62A 5LKYA 4HIBA 1KFBA 2NUYA 2FPVA 1H60A 1KM1A 4YLWA 4RKAA 3ZWSA 1WDWA 3SZ8A 5KTLA 3NL3A 1VLIA 3DHFA 4LS0A 1GPWA 2J9XA 4HHPA 3INPA 1PHQA 2WNQA 4N9BA 2ISSA 4GUIA 4U28A 3ZWTA 4GUGA 1G7VA 4Y6GA 2Q8LA 3TC7A 3LERA 1WBHA 4NJGA 3KAOA 3QYQA 1PS9A 2CLOA 4WQ6A 1LRQA 2QCMA 2V9DA 1H51A 3DI1A 1I2RA 1XBYA 5CKSA 3MI3A 1GJPA 1F7BA 4WY0B 2ZBTA 1YPIA 1C29A 1A50A 3W9ZA 5BNKA 3NEVA 3THAA 1VCFA 4UNKA 3DBPA 5AHNA 1FDJA 4AXKA 4KFPA 1PHWA 2FDSA 4HT3A 1TV5A 5AHMA 1CI1A 2BSLA 4NQ1A 4E0CA 3W7JA 1FY6A 2XN2A 3GK0A 2JKEA 4AWSA 4JYFA 2BLEA 3GDTA 4XKYB 3CC1A 4GNJA 3HGJA 3W7HA 5AHEA 1R2RA 3TQ0A 1BEUA 2YYUA 4NJHA 3R12A 2X1TA 2CZ5A 3O6CA 1JCYA 1RR2A 1DKWA 5G2HA 3RNDA 5D38A 2TRSA 3F03K 1VS1A 4NJKA 4AHOA 5DY3A 2D73A 1VRDA 4XTIA 2Y6ZA 1ICQA 1ZY9A 2DJLA 4KFOA 4EIVA 4AEOA 3W86A 3O07A 1UASA 3SFKA 4DQWA 2ZRVA 3EKZA 1DV7A 3WJWA 3W70A 2ZZ1A 3S1XA 3W3OA 3L5MA 1H1ZA 2E1DA 1L2UA 3N34A 4UTKA 2Q3OA 1TB3A 2VEKA 3HQ1A 4O1DA 4K36A 3MO7A 4IXXA 5DBTA 2FTPA 4MY8A 3UWUA 4C1LA 3IVUA 3IIVA 3N73A 2C14A 5K3VA 1H7PA 3K30A 4DO4A 1VCGA 1B3OA 2DZSA 1KM5A 3EWWA 1XM3A 5HR6A 3P8IA 4TMCA 1W0MA 2QCNA 1SZEA 6TIMA 2VEPA 3TU9A 3TE9A 4FNQA 1GOXA 1SO4A 1TRIA 4QJ1A 1SO3A 3V75A 2YDAA 2HSAA 3RMJA 3OIXA 4ZQOA 3PULA 2H3DA 2WSQA 1QPOA 4M6QA 3TQVA 4HKPA 3TUUA 3FA5A 1LOSA 4AWUA 1FWWA 1VHCA 3M5VA 3SGUA 1G4SA 1A5AA 4GWEA 2QJIA 3HO8A 4O12A 3QMSA 1KM0A 1IIGA 4U4MA 3TH6A 3A21A 3IIXA 3MBFA 4J9JA 1UUOA 5K2ZA 2HS8A 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2QDHA 3NDOA 1GVRA 2NXGA 4E2BA 2Y7EA 1T96A 3PBVA 4E38A 5EMUA 1G4TA 1M7OA 1NAL1 3S5ZA 4FB7A 1OFBA 4PEKA 3A22A 2R8WA 1MXSA 3GDMA 2YR1A 4M5PA 1B4KA 5BMXA 4WOZA 4ZQCA 4UCGA 1V5XA 4LWWA 4RJEA 3TX9A 3RLVA 4GFSA 5DXXA 4JY9A 4LNYA 4BF9A 3I7QA 1FXQA 1H61A 4QNWA 5DCEA 3ABSA 3MHFA 4Z1CA 1W5NA 3HPXA 1JCJA 1LROA 1YLVA 2WQPA 4OV4A 3B06A 4I7WA 2E6DA 3NPVA 4CNNA 4PL2A 4DBEA 3HBLA 1TQXA 5HINA 1M5WA 5CSRA 4B5NA 2QAPA 1OFEA 3QJAA 4WD0A 4LUIA 3TSMA 4O0ZA 4JDBA 2TSYA 4JTKA 1KLYA 3EXTA 2QCDB 3IIPA 1K7FA 3NZ1A 4MJZA 4O14A 1GVOA 3FYOA 2VFHA 2JK2A 1HG3A 1KV5A 1LRNA 4UFMA 5K4ZA 1LZOA 4FO4A 1DJQA 4LC6A 5KSWA 1RPXA 1JULA 4YWIA 4RZ5A 1JUEA 1KBJA 3I7SA 1OX4B 7TIMA 1RQBA 5TIMA 2LLEA 1H7NA 3TC6A 4OHQA 2J24A 3P8JA 3W1XA 2X30A 1NEYA 1W5QA 5D2VA 3C2OA 1WV2A 4X3ZA 3M6YA 3LHVA 1QMLA 4KFNA 1GWJA 1ZAHA 5F2IA 2VXNA 5AHLA 3DFSA 3T4CA 3SSJA 1LYXA 2YZRA 1SSGA 1K8YA 4UMCA 1PL9A 4OU1A 1RQHA 2RDTA 4UFLA 1ZFJA 1VGAA 3P74A 1F6PA 4ADTA 4FIRA 1KA9F 3P61A 1FWRA 5G4EA 1VPXA 3N14A 1W54A 3IVTA 4X9SA 1C8VA 3EWXA 3KFTA 3EX1A 2G97A 3WJZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5K7JA

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