5LHFA

Phosphoribosyl anthranilate isomerase from thermococcus kodakaraensis
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
MVEFVKICGVKTMDELRLVERYADATGVVVNSRSKRKVPLKTAAELIEMAEIPIYLVSTMKTFPEWANAVEKTGAEYIQVHSDMHPKAVNRLKDEYGVSVMKAFMVPRESDDPAEDAERLLELIGQYEVDKILLDTGVGSGRRHDYRVSAIIAKEYPIVLAGGLTPENVGEAIRWVKPAGVDVSSGVERNGVKDRVLIEAFMAVVRNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase
publication title Crystal structure of a phosphoribosyl anthranilate isomerase from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis.
pubmed doi rcsb
source organism Thermococcus kodakarensis (strain atcc baa-918 / jcm 12380 / kod1)
total genus 78
structure length 208
sequence length 208
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.24: Phosphoribosylanthranilate isomerase.
pdb deposition date 2016-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00697 PRAI N-(5'phosphoribosyl)anthranilate (PRA) isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5lhfA00
3HGSA 3W7DA 3O8AA 3W84A 1QNVA 2Z6JA 3QJAA 1VC4A 1RQBA 2C0AA 1I45A 4YCPA 2P0OA 4N9BA 1Z44A 4O16A 4UTTA 3KRZA 4YLWA 1JQXA 1DBTA 3MI2A 3W1QA 3DI1A 4LC8A 3UQNA 3G1AA 2NX1A 4RJEA 3E02A 1KTCA 1QWGA 4UNKA 1JJKA 3KHJA 5U7SA 2D73A 2Y63A 3OHIA 2A1YA 4RX0A 1OJXA 5C54A 5AHLA 3KRSA 2JKPA 4LV4A 1KFLA 1W5PA 2V9DA 3O1NA 1P5BA 4HIBA 1SZFA 1OK6A 3CU2A 3LXAA 1TQXA 3QH2A 2J9XA 2O7SA 2Q3RA 4BI6A 1V5XA 3TJLA 2YYUA 4K7YA 3TC7A 1D9EA 3BK0A 2ZRZA 1ADOA 1PE1A 3P61A 2B0MA 2FB2A 1JCMP 3G24A 3KXQA 1WBJA 3FFSA 4L4LA 4DF0A 3NNTA 4JX6A 4A22A 2A85A 3W6YA 3ATYA 1G4PA 3PC0A 3Q37A 4AH7A 5AHMA 1JUEA 3GK0A 2JGYA 1VZWA 4N4QA 3A22A 4QNWA 3PR2A 4Z08A 5DELA 4DF1A 3G0XA 2A5HA 1NSJA 5TBOA 2RKXA 4TMCA 4ONVA 2RDWA 3OEXA 1Z42A 4DO4A 2Z2UA 3IIPA 1OFEA 3TR2A 3JR2A 4I7WA 3L0NA 4O50A 3W7HA 4FNRA 3W9ZA 2QUVA 4C1LA 3MW7A 4NT0A 1PL9A 3W1PA 4Y6GA 1KV5A 1H7NA 4TR9A 3NL5A 1UUMA 3L9CA 4PFMA 3HGJA 1G69A 4M7TA 5DXYA 4JNMA 1WX0A 5G1YA 1KM2A 2QDGA 1W5OA 3PBVA 4ORIA 3S9YA 4RR4A 4O1AA 1M5WA 1JCLA 4N6EA 4LUIA 4O52A 1ICQA 3BG5A 3IVUA 1TSIA 1GQNA 1O5XA 1GWJA 4NX5A 1O95A 4HHPA 4ADSA 1TPDA 1NFBA 1FWNA 3PUEA 1TTPA 3DHFA 3HQ1A 4ZQRA 4YXGA 1MO0A 2OCZA 2WPBA 2X1RA 3FJ6A 4NNBA 3C6CA 3DFPA 1DJNA 5EPDA 4RCXA 4QM1A 4LVDA 4O4WA 5IM51 2DZSA 4IMFA 1BTMA 1H7PA 2AGKA 1E51A 2Y6ZA 1EP2A 2ISSA 2E1DA 3STFA 4KKXA 5HMSA 3G1VA 2ALDA 4WXYA 4HNTA 2Q3OA 4WUIA 1WOBA 1OF6A 4KFOA 3STGA 2NUXA 3M5VA 3LRMA 1VLIA 5LSMA 2HS6A 4AHOA 4FF7A 1PCWA 4Y9AA 4ML9A 4HPJA 1TPB1 3KAOA 4HPXA 3QSTA 3M9YA 5F4SA 3C61A 4BI7A 2Y89A 3GYEA 3MP3A 5KZDA 1W0MA 4WY0B 3OBKA 3R89A 3KX6A 1H7RA 4L4MA 1QO5A 3BW2A 3N2MA 3LCXA 4I7VA 2NXGA 1NF0A 3DFQA 4IPIA 4JS3A 3TV8A 1YXYA 1M6JA 3VE9A 5D30A 2BXVA 1LROA 1QPNA 1UB3A 1W3NA 1OK4A 3EX4A 3LBCA 2YR1A 3B06A 3IVTA 3U8GA 1RD5A 1P1XA 3TFXA 2E6DA 3CM4A 3MI6A 3LCWA 3M1ZA 2Y88A 1ZCOA 3M0ZA 3TNOA 1OVDA 5D32A 2VC6A 2AAMA 5K9CA 5U4NA 1DV7A 1R2SA 4PC8A 1Q6RA 5G2HA 3CB8A 3TMLA 3P82A 2V30A 2DZUA 4N2YA 3MO7A 1QOQA 1Z41A 1HG3A 3DFSA 4WD0A 1TPVA 4UTUA 4ZL1A 4N9DA 1P4CA 1H51A 2CLFA 1QPRA 5AYZA 3GDKA 5L9FA 3G1HA 3QMSA 2F84A 4KFNA 5HINA 2QUUA 4JGDA 2HMCA 2CLHA 3LI0A 5I3IA 1X1OA 5AHEA 1FY6A 1K3UA 3MUXA 1W5MA 2A7NA 5CKSA 4E38A 3UY7A 3CT7A 2F7FA 5KTLA 3BGGA 4K6AA 4XBKA 1FWWA 3L68A 2ISWA 1H50A 1S5VA 1FWSA 4R53A 3HO8A 3W7GA 2TSYA 3LRKA 1UJPA 3WK3A 5CPLA 2HS8A 1AMKA 3NGJA 2NXHA 5FF3A 3TSDA 2A4AA 2A0NA 4RLIA 1FUYA 4ZQCA 4CQAA 3GKFA 2GQ8A 4PEKA 4JTLA 4FX6M 1F76A 1HFBA 5FEPA 4LVBA 1ME7A 4POCA 2E68A 1CX9A 3PSWA 1RQEA 1G4EA 3W87A 4JN6A 3TAOA 1OFOA 1D3HA 2H90A 1G67A 1EX5A 4GUFA 2VEMA 5CSRA 3G8RA 1B9BA 1PHWA 1SR9A 4QITA 2NV2A 3MHUA 2FPYA 1SQ7A 4J9JA 1KFCA 1SO4A 2G95A 3LLDA 2WNQA 4ZQOA 3OA3A 2WSYA 5D2TA 3N9RA 1EP3A 3C2EA 1U83A 4S2BA 4NZJA 2Q8ZA 3G3MA 1RQHA 1XUZA 5AB3A 2OT0A 1W1ZA 1I4NA 1HO4A 3OIXA 4E2BA 4JTKA 3ABSA 1OYAA 4AWUA 2NXIA 3UXAA 3ELFA 4LS0A 1L6WA 1H63A 3U2OA 3ZS4A 3LCFA 3HPSA 3STEA 5CPOA 3LLFA 3TKFA 2X30A 2E5DA 3MBDA 4M7SA 1I2PA 1DKWA 1F2JA 4O1DA 2A6LA 3QM3A 4CCDA 4UC5A 3FS2A 1XDLA 5HWNA 3G1XA 3W7QA 4IMDA 1TV7A 4MLRA 2ZZ1A 2C16A 4AF0A 2CLEA 4UTMA 2HTMA 3GAYA 3IGUA 3IRDA 3EWXA 4GUHA 2ZRWA 4GUJA 4OT7A 4P61A 2NZLA 5BMWA 2V2HA 1GEQA 2QF7A 3EEGA 2ZBTA 3RLUA 1QDSA 1ZJIA 3PY2A 3UWYA 3C4UA 4GRSA 2X16A 4XTIA 1HO1A 1YDVA 4N9EA 4QNEA 4NQ1A 5G5IA 3NQFA 3TIMA 1OX4A 4CNNA 2ZRXA 3G1FA 1SW7A 5DBUA 3E96A 1XL9A 3NZ1A 4JR5A 1TCDA 4JX4A 3ATZA 1GT8A 3HPXA 5HNRA 2CU0A 3C2FA 2Y70A 3EXRA 1VCFA 4ICNA 3LERA 1OYCA 3P5ZA 3W1RA 4W9TA 1IIHA 1G6CA 3FOKA 1ZENA 4UFIA 2GPTA 5AHNA 3LCLA 3T44A 1GJPA 3CEPA 5FF2A 5F4WA 2VFEA 5KZEA 5F1UA 1UUOA 3EX3A 1KM0A 1LCOA 4HSNA 3W1UA 3GDLA 2I9EA 3QW4B 4UMBA 2FTPA 3DFOA 4BFAA 3E49A 5DN1A 4O1CA 4O4VA 4DF2A 3GX9A 3NQMA 1LM1A 2Z1BA 3UD6A 3DGRA 1GTEA 3W7OA 2PC4A 3LHUA 1EUAA 3SIZA 4NU7A 4BWLC 2QCDB 2DORA 1YADA 4UTWC 5J5RA 4O19A 2CLIA 3GDMA 3S1XA 3TK7A 1X6UA 3WJZA 2FB3A 4Y90A 2QCMA 5E0KA 3LTSA 1ZAJA 1WA3A 3MMTA 4IGHA 3NYZA 5K2ZA 3WK0A 1TPWA 3BGJA 4ADTA 1TB3A 1FCQA 1KM6A 4O57A 5CZ0A 1KTBA 3EWUA 4O13A 1YPFA 2ZTKA 2DZTA 4XKYA 1B4EA 3CC1A 2ZA3A 3NQAA 1F73A 3L21A 4IPJA 3P62A 2Y7GA 2YZRA 4AWSA 1K02A 3NPVA 3PBYA 3TQVA 1R2TA 1DHPA 1G7UA 1XDMA 2G96A 4LY8A 3W7KA 3UWZA 4A3UA 4ZMGA 3S5NA 4A2RA 5AC7A 2FQIA 3SY5A 4Q4KA 4M5PA 5HULA 5E1QA 3M6YA 3WJSA 2VFIA 5BMXA 2GVLA 3GKAA 1JRCA 1TPFA 1YPIA 3NQGA 4JTGA 3CIXA 4Q33A 2QCLA 4FX7A 4FNUA 3I68A 5K4XA 5D03A 2V0TA 1DOSA 1WAUA 4OE7A 4UFJA 3W86A 3NPXA 4U4MA 3R8RA 4ZZ9A 5KMYA 1ME9A 3PSVA 3KVJA 1OFAA 4JTTA 3VCRA 4MY1A 4HSOA 5DY3A 3TAKA 3UWVA 2JK2A 1KW1A 4MZ1A 4MZYA 4MFEA 3TUUA 2BLEA 2TPSA 4AEOA 1H7XA 5F1VA 1KV8A 4MJMA 3LM7A 2VELA 1LTDA 1FCBA 4O0KA 3W1AA 2ZA2A 3RU6A 3BARA 3HG2A 5BRBA 5CSSA 4O10A 3IEBA 4FO4A 3STCA 3GXNA 1TV5A 4BK9A 1KLZA 2J9ZA 2QJHA 1BWLA 4LS1A 1XKYA 3HG4A 5HWMA 4A29A 6TIMA 5A5WA 3TW6A 4UR7A 3UZ5A 3LI1A 3IIZA 1QAPA 3SGZA 2YYTA 4TMBA 2QKFA 3B8DA 3NAVA 4LWWA 1GPWA 4R34A 5KITA 3KVLA 3NQDA 3EX1A 2CLOA 2CWNA 1VGAA 3A5FA 2ZRUA 3S0CA 3GNNA 1XBZA 4JTIA 5CPMA 3IV3A 4CLMA 4K8HA 1DQWA 3W7IA 2VFFA 2WQPA 3ZFHA 3QW3A 2C6QA 3BG3A 4DO6A 1F05A 1H7WA 5L6UA 3O15A 1IXPA 1OG0A 4MLJA 1ICSA 3C0JA 4JIPA 2ZZ3A 4CQ9A 4XUGA 3W73A 1QCWA 3EKLA 3HIJA 1GYLA 1H1YA 1OX6A 4K39A 3O16A 4JTFA 2E5CA 5F2GA 4I7UA 3EXSA 1OFDA 1JR1A 5AN7A 3W7CA 4AVFA 1IXQA 5I3HA 1Q6OA 3LCGA 3NL3A 3TX9A 3W3OA 1FXPA 3GDTA 3DI0A 2W6RA 4MPQA 2ZZ7A 4GC4A 2YPIA 4JTSA 2QUTA 3NPUA 3RF9A 3LHVA 3TDFA 3M47A 5LGXA 3LV6A 3HPZA 1I2OA 4CNPA 4IOTA 3M41A 1EWEA 3HBLA 1ALDA 3GIYA 2ISVA 5CZSA 1OABA 4M6VA 4LOCA 4NJHA 1FWRA 3NOEA 3YPIA 2I1OA 1F74A 4UFHA 3NM3A 3C52A 1T99A 5LNUA 4UMCA 2BWGA 1FDYA 4LV9A 2DJLA 1RR2A 2EGZA 2EKCA 2DZPA 4JYEA 1FWTA 2FJKA 2PRMA 2GQAA 3I7RA 3CIWA 3W2LA 3THAA 2EPHA 1A50A 5CPNA 4WQ6A 2A7PA 3O6DA 3M44A 3MHFA 3TU9A 2NV1A 3BO9A 4ZVJA 3SR7A 3NL2A 4MYXA 1I2NA 1ICPA 1K7FA 2VKZG 4YL2A 1YDOA 4PL1A 3W7RA 4IXXA 2X1TA 3FLUA 3EX2A 5LZLA 1H61A 3ANYA 4I9AA 1MEIA 4X22A 1S3HA 3L65A 3B0PA 3LRLA 1EPXA 1ZY9A 1NF7A 3DZ1A 3MYPA 5EY5A 3PAJA 4UFMA 3W23A 3JS3A 1V7YA 2ZFAA 1O94A 3I65A 3KOFA 3TXZA 1JCNA 1U5JA 3ZWTA 3TQ0A 1QPQA 3UXDA 4EF8A 3IIXA 4FXRA 4O17A 4DEFA 2E5BA 4MFDA 4DO5A 1LOSA 1W3TA 3NZRA 3UYCA 3LDVA 4GJ1A 1FCVA 1SPQA 5E93A 3B4UA 3GB6A 3QSRA 3LTPA 3M5ZA 3QZEA 2CZEA 2E6AA 5DXXA 4Z0JA 3SW6A 1YYAA 3OG3A 2E09A 1XXXA 4NNCA 4UNLA 4JXCA 3QC3A 4RKAA 2Y7DA 4YMZA 4D2JA 2CLKA 3PBUA 5DY2A 3UWUA 3RK8A 3TJXA 3W72A 4AMAA 4N9CA 2FIQA 3GAKA 3NEVA 1K7EA 4CCCA 4O53A 1OX5A 4Z1DA 2QAFA 4LRTA 2A2IA 2ABBA 3W1MA 3W07A 1QOPA 2W79A 3MJYA 2X2GA 1QR7A 4IMCA 1C9DA 4GUGA 3I6RA 1VHNA 3HJZA 4RZ5A 1WQ5A 2O7QA 1KLYA 3F03K 5SWUA 2QAPA 4K38A 1ZHAA 3L0KA 1VJIA 4GBUA 1ME8A 4YCOA 4UTIA 3DU0A 5EL1A 4JTHA 1I2QA 1DORA 2QCHA 3HGOA 4MJZA 5FEXA 2E6FA 3PB2A 4AHPA 5C5YA 1TPEA 3Q94A 3CQ0A 4QISA 5C55A 4N02A 1SW0A 5CGQA 3H55A 3W22A 1CI1A 4HNNA 4UTHA 5CZJA 3UWQA 2ATMA 5G4WA 4LTSA 1KFJA 5D2YA 2E6YA 3EWBX 5FF7A 1TMHA 2XN0A 4UTKA 1GOXA 1MSSA 1OF8A 3LCIA 3W7JA 1YXDA 3CLMA 4GE8A 2A21A 3QEZA 1LRNA 1LZOA 4PH6A 4MZ8A 3UPBA 1LRTA 3EWYA 2C19A 4NUWA 4CCEA 4IX2A 1W8SA 4QQ3A 1XFBA 5HJLA 3W2NA 5FF0A 3ZR4A 3N2XA 2GQ9A 5ABTA 1G4SA 2B7PA 3P80A 2WKJA 1WDWA 2QJIA 3I7QA 3DXIA 4IMEA 1C29A 3IVSA 3W7PA 3WK2A 3R13A 2ZRYA 4O1BA 5FEWA 1JUBA 5K7JA 4WXZA 5IBXC 2WNNA 3N34A 1WV2A 1LOLA 4AF0B 4EF9A 3S1WA 1KM5A 5HR7A 1TYGA 3QRHA 3WJWA 4K36A 1UBSA 1H60A 3NQVA 5EBUA 4IX0A 3EWWA 1TTJA 3FYOA 1W54A 1PS9A 1X7FA 1GZGA 3TC6A 3B0VC 1AL7A 4IUOA 3HG3A 1AW2A 3OVRA 4JY8A 3CWOX 4XZ9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EDF A;  3P0W A;  3HGS A;  3W7D A;  1GW9 A;  3W84 A;  2DH2 A;  2PDK A;  1F07 A;  4RL3 A;  1C8Q A;  1UG6 A;  1V8E A;  4N9B A;  3KRZ A;  4YLW A;  1WKF A;  1PBG A;  1DBT A;  3CAS A;  4J3U A;  4XIM A;  2Z1W A;  1AH4 A;  4RJE A;  3THU A;  4H7Z A;  1QWG A;  4UNK A;  1JJK A;  4R88 A;  4W85 A;  2DY3 A;  5U7S A;  2D73 A;  3UW6 A;  2Y63 A;  1XLB A;  2A1Y A;  4KT2 A;  4RX0 A;  3KRS A;  1JYW A;  2CKR A;  1KFL A;  3M7S A;  4LV4 A;  4AZC B;  5I23 A;  3RX4 A;  3PAN A;  1SZF A;  3QH2 A;  1IZJ A;  1OGB A;  2PZ0 A;  2O7S A;  4TOQ A;  1XYB A;  2Q3R A;  2YIH A;  3UXK A;  2YYU A;  5EMM A;  3BE7 A;  2ZX9 A;  1D9E A;  3M46 A;  2HEJ A;  1ADO A;  1PE1 A;  2XFR A;  1XKJ A;  2B0M A;  1H1N A;  5FJP A;  1HP4 A;  3V5C A;  4ZO8 A;  4JX6 A;  1K6A A;  2WAN A;  3LYE A;  3ATY A;  1G4P A;  3PC0 A;  4A05 A;  2JGY A;  4N4Q A;  3A22 A;  5FJI A;  5DEL A;  4HGX A;  4IF2 A;  4LBS A;  4HHM A;  1NSJ A;  1K8C A;  2RKX A;  1JAE A;  2RDW A;  5CQ1 A;  1XRV A;  2Z2U A;  4W7V A;  5IDZ A;  3E5B A;  1VBR A;  3TR2 A;  3L0N A;  3QOK A;  5A6J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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