5MHBA

Product-complex of e.coli 5-amino laevulinic acid dehydratase
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
TDLIQRPRRLRKSPALRAMFEETTLSLNDLVLPIFVEEEIDDYKAVEAMPGVMRIPEKHLAREIERIANAGIRSVMTFGISHHTDETGSDAWREDGLVARMSRICKQTVPEMIVMSDTCFCEYTSHGHCGVLCEHGVDNDATLENLGKQAVVAAAAGADFIAPSAAMDGQVQAIRQALDAAGFKDTAIMSYSTKFASSFYGPFREAAGSALKGDRKSYQMNPMNRREAIRESLLDEAQGADCLMVKPAGAYLDIVRELRERTELPIGAYQVSGEYAMIKFAALAGAIDEEKVVLESLGSIKRAGADLIFSYFALDLAEKKILR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Delta-aminolevulinic acid dehydratase
publication title Structural studies of substrate and product complexes of 5-aminolaevulinic acid dehydratase from humans, Escherichia coli and the hyperthermophile Pyrobaculum calidifontis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 120
structure length 323
sequence length 323
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 2016-11-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5mhbA00
4JIPA 1VCVA 4J9JA 3MO7A 1X8FA 3TW6A 5D38A 3AJXA 1XL9A 5DCBA 5G4EA 3KHJA 4ZQPA 2ZBTA 2G5WA 3NL2A 1BWKA 4DPPA 4M6QA 3W7MA 4AWUA 4GWEA 2GPTA 1EEPA 1O5XA 1S3HA 4NNAA 1GZGA 4LC6A 2VFGA 3LI0A 3C4UA 1OYAA 1O95A 1A5AA 3E12A 1F7BA 4K7VA 2RH9A 3HG4A 5K9XA 3TAKA 4HPXA 3B8DA 3DZ1A 3L68A 4AMAA 1FQ0A 1ICSA 3TU9A 4OQVA 4PH6A 4PTNA 1WYIA 3UXAA 3TXZA 2HTMA 3LHTA 4NJKA 2TPSA 1I2RA 2YXGA 4JD4A 4IOTA 2V2CA 2GVLA 3PB2A 3UWYA 4JYDA 4NXKA 1XDLA 1Z42A 2B7OA 4LVDA 4FHAA 3ABOA 3RK8A 4D2JA 2ABBA 2ZFAA 3EKZA 3W2LA 2G96A 1FDYA 2CLLA 3HPXA 4IJBA 4MFDA 4W9TA 2ZRWA 1TPEA 4JY9A 1F6KA 4PC8A 3BPWA 4UR7A 2QDGA 3JS3A 4O50A 2Q8ZA 1SSGA 5G5IA 3M1ZA 5CPMA 4N4PA 3BG9A 4XZ9A 3MP4A 4YL2A 4DF0A 3NXFA 3G1DA 3IGUA 3MHGA 2E5BA 4UNKA 4FX7A 4UTTA 5EPDA 5AC6A 4R33A 1BKSA 3S9YA 5FF2A 1EWDA 3U2OA 2XN1A 3W1AA 4I7VA 3G3MA 1XI3A 1IXPA 4UTWC 1TJPA 4FIQA 1KM1A 1WDWA 4BFAA 4WXZA 1W31A 4LU0A 4CNPA 4MLJA 3T40A 4DELA 3I7RA 2FPTA 2VEPA 1TJRA 3NQMA 3BVJA 1KV8A 3L9CA 3W75A 4GRSA 3GDRA 4UTIA 1OX4A 3KRSA 5U7SA 3B4UA 5BOOA 2ALDA 3HOJA 3CB8A 3IGXA 4EF8A 5CSSA 2G97A 2FB2A 3W7LA 3MBDA 1GWJA 4RZ4A 2V8ZA 1OJXA 2RHGA 3PG9A 1QDSA 3STFA 1ONRA 3N9RA 1KV5A 1W0MA 1ME8A 3FS2A 2I1OA 1W5MA 2RFGA 4K37A 2NX9A 4O54A 2Z2UA 2QCGA 4S1FA 2E6AA 2OT1A 1I2QA 2YW4A 3N19B 5D02A 3LTPA 2ZA3A 4Y90A 1QAPA 3LV6A 2A2IA 2OT0A 2ZZ6A 2DU2A 5LHEA 1KA9F 1QWGA 4HN4A 4YCOA 1ZAJA 2Q3OA 4ZQNA 5BMXA 5AHEA 1TTQA 3UNDA 4IGHA 1N7KA 3GXNA 2GVGA 2UV8G 1IF2A 1GVSA 3NQGA 1VR6A 4QM1A 3M5XA 1KBIA 2QCEA 1A5CA 5G1YA 5D05A 1F74A 3QMTA 4H3DA 3WFAA 1DV7A 1H7XA 1KFEA 1YXDA 2V9DA 2JGQA 1TMHA 5F1UA 1JQXA 3LXAA 3SI9A 1EWEA 2Y6ZA 5D2VA 5G1TA 5HR7A 3KRUA 2HMCA 1M6JA 3MI2A 1SO3A 1AL7A 1TPWA 2Y7GA 4JTKA 1KM0A 4OE7A 2CZ5A 3D0CA 1LOQA 4O1CA 2Z1BA 4HNVA 2VEKA 4ALDA 1G4EA 1PHQA 1IXNA 5D32A 5FF3A 5IBXC 4MZ1A 3P84A 4N9CA 2WKJA 1QNVA 1VYPX 3W7CA 3NQ6A 3OVQA 1FCBA 1SO6A 1GYLA 2WSRA 1OFBA 4UMCA 3IIZA 3YPIA 4NX5A 2W6RA 3W2NA 3HGJA 3OBKA 1JUBA 3W72A 5KZDA 3UWZA 5GVJA 4H6KA 1S5TA 1WAUA 1HFBA 3G1AA 3GIYA 5F4XA 4BF9A 2H8ZA 4N6FA 3W73A 4PL2A 4HNUA 5LNSA 3CT7A 4K39A 1UUMA 2WNNA 6TIMA 4Z0SA 3LBMA 5K7JA 4MY8A 4L4LA 2ZQ0A 3MP3A 3M44A 5TBOA 3E96A 3VFLA 4OV4A 1OFOA 3PWAA 1YTEA 4PODA 3UZ5A 3PC0A 3EX1A 4AHPA 3C3NA 1AW5A 4JR5A 4O53A 3KOFA 4Z0JA 1QFEA 2X1SA 3MHFA 1UUOA 3IVUA 3L5AA 1GVFA 2WO5A 3DFTA 1GVQA 1UB3A 4JX5A 2R94A 4YWIA 4GFSA 3TJXA 5G4WA 3OEXA 4K7YA 1W37A 3W85A 4N9BA 3M6YA 2E09A 1G6CA 2QF7A 3SR7A 3KAOA 1KM5A 4QITA 2ZZ4A 3N34A 5AHMA 4CNOA 4H4IA 1TTPA 4WQ6A 4X22A 3GK0A 1WQ5A 3L65A 2EHHA 5D33A 1NEYA 1SSDA 2QDHA 3A5FA 1B4KA 1T96A 1VGAA 1SW0A 3NOEA 3QRHA 5AYZA 1P0KA 2G95A 5CGQA 3O15A 4JTFA 2FPYA 1HTIA 3CWOX 1JCJA 3SGUA 3HGSA 5C5YA 4JTJA 5C55A 4NJHA 1I2NA 3P7YA 3Q2DA 3CIWA 2BTMA 1M7PA 4O0KA 3KVJA 2A7RA 3BGJA 2B7QA 3SSJA 2A6LA 2H6RA 1AK5A 4MOZA 4DO6A 1H7PA 3NZ1A 1CW2A 1D9EA 1I2OA 1ZALA 5BMWA 1FX6A 4UFHA 1SFLA 1DJQA 3NQ8A 2EGZA 3LXCA 4GE8A 4IPIA 1JCMP 3EX3A 3UY7A 4FIRA 4U4MA 3IIPA 3SECA 5D2TA 4OT7A 3OG3A 3W1RA 1IXOA 5K9DA 1G7VA 3FA5A 1B57A 1XC4A 1LBMA 1G69A 2YFNA 1GEQA 3W1NA 1H7RA 3NL5A 2X2GA 1OHLA 3PULA 2C6QA 3MJYA 1DORA 1KM3A 2QCFA 2E6YA 3TAOA 1KFKA 4UTUA 4WOZA 3M7WA 3LB0A 1SW3A 4LS2A 3EWUA 2X1RA 3HF3A 2AQWA 5HMSA 1SU5A 1I8JA 1PHWA 4QQ3A 3UZJA 2CLMA 2ZRVA 1OYCA 3UWVA 3BLFA 1YLVA 4WZHA 1RQBA 3QEZA 3CEPA 2DJXA 5J5RA 1V7YA 2J88A 2QCMA 3P8JA 3T78A 1L2UA 1PL9A 3C56A 1TTIA 3NQAA 2E5CA 3H54A 3AO0A 3BW2A 4NNCA 3W88A 5D2YA 3W6YA 2I9EA 1S5WA 5L6UA 3HG3A 2EAWA 3T55A 4JDYA 1MEIA 2BZNA 3HIJA 4CCDA 4FNSA 4LRSA 1JCLA 3RNDA 2GQAA 4RK8A 4GBUA 2VENA 3G0UA 4ZQRA 3LBCA 3P81A 2GQ9A 3TA6A 3O6CA 2ZYFA 3QM3A 4ADSA 3TC7A 1AG1O 3GB6A 3P74A 1K8ZA 1SQ7A 2X16A 4NQ1A 1EA0A 3SW6A 2JKAA 3BGGA 3QPYA 5CKSA 1W3TA 1UBSA 3TFXA 1JCXA 3K30A 4QISA 3STEA 4CNNA 2TSYA 2A21A 4HKPA 4PL1A 1RQHA 2HS6A 5K4XA 4AXKA 3B0PA 1EP2A 1SZFA 3G8RA 4XTIA 1OFRA 3TQVA 5HR6A 1B4EA 3A24A 5I3IA 2V5LA 2C19A 3UYCA 1NSJA 3EKLA 2WSQA 3EWZA 2NX1A 3LERA 4HSNA 4S2CA 3G1SA 4LVFA 3L66A 4POCA 4DF1A 2VEIA 2ABAA 3QFEA 2RDUA 1EP1A 3TMLA 4Z08A 3FIGA 4GC4A 1NAL1 2QAFA 4MJZA 3LGEA 5LKYA 3H55A 1KW1A 4Q4KA 3NG3A 3IIOA 2CZEA 3G8EA 4JS3A 1IIGA 5TIMA 2GJLA 3GZ3A 2A7PA 5CZJA 4ADTA 4LRTA 2LLEA 2EF9A 4JTIA 5K9CA 3MP5A 1VCFA 3RLVA 2FB3A 2NX3A 1JUKA 3W71A 4JN6A 1WBHA 3I7SA 3TSBA 4JTLA 1GJPA 3GR7A 4UCGA 1PE1A 5HJLA 4TIMA 3BO9A 3W7IA 3R89A 4NT0A 5F2LA 2A6NA 3QMSA 2QCNA 2Y61A 3STCA 2A85A 3WJSA 2EPHA 1NF7A 3NR0A 2FPVA 3GXTA 1P1XA 1JCNA 1SO5A 2AGKA 3L67A 3DFOA 4JX4A 4IMGA 5DCDA 3W1PA 3EWBX 4WXYA 1KLZA 3LRLA 1F05A 1WX0A 4IMDA 3LV5A 3QJAA 1I2PA 4R7JA 2EKCA 4UFIA 3QZEA 4IQLA 1TCDA 2NLIA 4NXSA 3TW7A 1F6PA 1TPUA 2PRMA 1QOQA 2FFCA 3IEBA 4JYFA 4QSHA 2RDWA 3PY2A 4DBDA 3L5MA 1SO4A 4ZQCA 4JEQA 3TKFA 4O28A 1GTHA 4FX6M 2OMAA 2CLKA 5DBUA 1FCQA 3RLUA 1J5TA 3QSTA 3UWUA 3VI2A 1XBXA 4FXRA 3W22A 3LHVA 4WUIA 2C0AA 4BI7A 2CLEA 3PUDA 2ZTJA 1PIIA 3HPZA 3USBA 1VHNA 1MEHA 3VCRA 4WY0B 3PM6A 4JTUA 2ZTKA 1ZNNA 3EX4A 3KVMA 4RXFA 2Z0IA 1BWLA 1OFDA 4CQ9A 3NM3A 3WJWA 2W79A 4AEOA 3W7NA 1EP3A 4ML9A 1FY6A 4LTSA 4ORMA 2DP3A 2BXVA 5AFDA 1D3GA 3O16A 4HHPA 4NZJA 4KWVA 2CWNA 4S2BA 4HNTA 3N9SA 3P82A 1JCYA 2E1DA 1IXQA 4WY0F 5C54A 5MHBA 5AOUA 3NAVA 1FUYA 4BR1A 1TYGA 1OFPA 2V0TA 3PG8A 4GJ1A 3HB9A 1QPNA 2PURA 2VELA 2YGYA 4C1LA 2QJIA 1LRTA 1VPXA 2PRHA 3BW4A 1YXYA 3ABSA 3A21A 3S8HA 2XN2A 1H62A 2ZRYA 1A50A 1ADOA 3GDKA 1OK6A 4DF2A 1T99A 1F2JA 3UY8A 1XBVA 2X1UA 4X3ZA 3NQCA 3ATZA 3STGA 1K7FA 2GJNA 4UFLA 1LM1A 2NV1A 1K7XA 1VLIA 5KTLA 3EWYA 4HT3A 3QYQA 4QAIA 2CLFA 3EWXA 4TO8A 3H53A 3QQ1A 1Q6OA 3NVTA 4BWLA 1BTMA 1OFEA 4WJEA 3QSRA 2QJGA 5DXXA 5EBUA 1X7FA 4RJEA 3P61A 5HWMA 2C16A 5KZEA 3ZR4A 3HG2A 3BK0A 1OVDA 1TO3A 3NPUA 3NYZA 2QCHA 2DZVA 4TR9A 4O14A 1MXSA 1WXJA 4LV4A 3GLCA 5EKYA 3W3OA 4FNUA 4OGZA 4ADUA 2JKPA 2ZA1A 4IX0A 1ME9A 1DKWA 3EXSA 4NJIA 3W2JA 2IQTA 1N8FA 3F03K 2CZDA 1FCUA 5H2ZA 3A22A 1OFAA 1QO5A 1G4SA 4XQ6A 3MMTA 4IMCA 1TV5A 5FEXA 3C8FA 3KX6A 4K38A 5LGXA 5D04C 1SUXA 3OVPA 4JTHA 2Q3RA 3SZ8A 4L4MA 1VC4A 4LS1A 1QOPA 3GDTA 1IGSA 3NPWA 1YDNA 2QCCA 2CZFA 1VS1A 2QCDA 4RV8A 4DXVA 5T26A 1GOXA 1WV2A 3BW3A 4M7TA 3I6RA 4O0ZA 1PVNA 4QJ1A 3W7QA 1J2WA 4O12A 3NQDA 2FIQA 3W1TA 2QKFA 4M6PA 1KBJA 4O10A 1A5BA 1W8SA 3Q58A 2NZLA 2A1YA 3CC1A 3U6WA 1FXPA 1PS9A 3PSVA 3BG3A 1M7OA 3QPZA 1TREA 3P5ZA 1VZWA 1W5NA 2VFFA 4IMFA 3G0SA 3LRKA 4N2YA 5A8GA 3OIXA 4Q33A 1OX4B 3TX9A 3ABQA 3M0ZA 5DXYA 3DXIA 1JRCA 1EUAA 3LXBA 2QCLA 3F4WA 1TRDA 3L0NA 4NZFA 1L6SA 1X1OA 1FWWA 3RF9A 2DZSA 3C0JA 3KVLA 1AL8A 1GYNA 3FFSA 3B0UX 2CW6A 5KMYA 3KVKA 4U28A 3GDMA 2WNZA 3FJ6A 1RV8A 3LCGA 4GUHA 4MFEA 5AC7A 1SZEA 5F1VA 1LBFA 4UMAA 3O8AA 4Z1BA 1M5WA 3I65A 2H3BA 1DBTA 2V81A 4C1KA 2QAPA 3M5VA 3IIXA 3C2FA 4M19A 4IMEA 3ABRA 4LOCA 1H50A 4JNMA 2J24A 3VNDA 3FJLA 4NU7A 2F7FA 4M7SA 4UFKA 3DHFA 3DKLA 4IX2A 4P2VA 4JTSA 4MYXA 2A4AA 3CTLA 3W86A 1B3OA 1UCWA 2TYSA 3GNNA 3FEMA 4MZYA 2WNQA 3FOKA 4RZ5A 3HGRA 3G1YA 4MZ8A 1VRDA 1KLYA 5FI8A 1SFJA 2QCDB 1XUUA 2PCQA 4NUWA 2YR1A 4MYAA 1JRBA 3T4CA 3W74A 5F2GA 2OZ0A 3P62A 4P61A 2B0MA 4TX9A 1TQXA 1K02A 1NF0A 4M5PA 4LWWA 4WOQA 3TROA 1QR7A 4UTLA 1XKYA 1U83A 1LZOA 1LDCA 5DELA 5HINA 3TDFA 3P67A 5AB3A 2J27A 1ZY9A 4O4WA 1C9DA 4UTKA 4KFPA 4O1AA 3NL3A 2YYTA 1VYRA 3L21A 3B03A 3QC3A 2VKZG 5LSMA 3G22A 5AYXA 3W7HA 3ZFHA 3LCXA 3SY5A 1K03A 4EOUA 1LP6A 3L2IA 2P0OA 3C2OA 5FEZA 5D30A 4AF0A 5F2MA 3EXRA 5CPLA 2Z6JA 4A22A 5AC8A 1LCOA 3PS7A 1TV8A 3DHDA 2A5HA 2YDAA 1FBAA 1GPWA 4E0CA 1NVMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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