5U4N | Genus

Total Genus 129

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	129
sequence length	350
structure length	350
Chain Sequence	MALVSMRQLLDHAAENSYGLPAFNVNNLEQMRAIMEAADQVNAPVIVQASAGARKYAGAPFLRHLILAAVEEFPHIPVVMHQDHGASPDVCQRSIQLGFSSVMMDGSLLEDGKTPSSYEYNVNATRTVVNFSHACGVSVEGEIGVLGNLETGEAGEEDGVGAAGKLSHDQMLTSVEDAVRFVKDTGVDALAIAVGTSHGAYKFTRPPTGDVLRIDRIKEIHQALPNTHIVMHGSSSVPQEWLKVINEYGGNIGETYGVPVEEIVEGIKHGVRKVNIDTDLRLASTGAVRRYLAENPSDFDPRKYLGKTIEAMKQICLDRYLAFGCEGQAGKIKPVSLEKMASRYAKGELN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Fructose-1
publication title	Crystal structure of a fructose-bisphosphate aldolase from Neisseria gonorrhoeae rcsb
source organism	Neisseria gonorrhoeae
total genus	129
structure length	350
sequence length	350
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2016-12-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5u4nA00

2QCMA 2ZYFA 1W0MA 1F2JA 1TTPA 1VHNA 1O94A 4WZHA 5K9CA 4P2VA 1SW7A 3EX3A 5C2XA 4MOZA 2V9DA 3SI9A 4HKPA 1ADOA 2QCDA 3QW4B 1KM5A 3BGGA 5IBXC 3V75A 1I8JA 1OABA 4MPQA 4TIMA 3DKJA 1VC4A 4IPIA 5F2MA 1KFEA 4X3ZA 4OE7A 4JTIA 1ZJIA 4RK8A 2PCQA 1NF7A 3DXIA 3ZWSA 3RF9A 2GQ9A 1C8VA 4JTLA 4AWUA 4RZ6A 5A5WA 3G8RA 3C3NA 4AHQA 1J5TA 1RR2A 2QCDB 3O15A 4X9SA 2ISWA 2Y7FA 3C2EA 3UWQA 1YYAA 1ME7A 2JGQA 1XFBA 3TFCA 1LROA 5DLCA 3EX2A 2FB3A 2ZQ0A 1HL2A 5F4WA 3IIZA 3EX4A 4JY9A 3E49A 3LGEA 1LTDA 2E09A 3W22A 3W84A 4YXGA 4WXZA 4O1CA 1KBIA 4FX8A 3KOFA 2DJLA 1Z42A 1QWGA 3L68A 3M7WA 1KFKA 3W7NA 2AGKA 3KRZA 2V82A 5LNUA 4NNCA 3G1YA 3TC7A 2V2HA 3MW7A 4ALDA 5CPNA 3LBCA 1F74A 1A50A 2Z6IA 4HIBA 1L2UA 2ALDA 4OQVA 3TW7A 3LXCA 4JTJA 5FI8A 4BI5A 4GJ1A 3HG5A 3P60A 3WJZA 1R30A 3OG3A 3W7LA 3L5MA 3MI3A 1XUUA 4O15A 1CW2A 3QQ1A 4NZJA 4QAIA 3NL6A 3S5OA 4FNQA 4O0KA 2J9YA 1TMHA 1YTKA 5AYXA 3CHVA 5D2WA 3OVRA 3UWYA 1VPXA 4C1KA 4XBSA 3CEUA 4JTUA 2BLEA 3HMJG 3W85A 1TPH1 1KFJA 3N19B 4H4IA 5C5YA 3TX9A 2PE4A 3G1DA 3NM1A 1KM0A 4AF0B 5HWMA 3W1QA 1Q45A 2VEMA 4L4MA 1ZAIA 2FPVA 3NQ2A 3HGJA 4K37A 3LHYA 4LV4A 4MLJA 5FESA 1DBTA 3KVKA 4NJGA 3SFKA 1XCFA 1XBXA 3NM3A 3OA3A 3TSDA 2YX0A 3NYZA 1SPQA 4GC4A 3TSBA 6TIMA 4GUJA 3UY8A 3INPA 4AWSA 4UFKA 1H7WA 1RD5A 4MZ8A 1KA9F 3LLFA 3BW2A 1FWNA 4NJHA 3UPBA 4FNUA 4JTHA 3L66A 4UTHA 3L65A 2NWRA 3A5FA 4FB7A 1ZAJA 3C2RA 3QMRA 4BK9A 1OF8A 2E6YA 1EB3A 4Z1CA 2NUXA 2GVGA 2H90A 3GR8A 5AHEA 5DBTA 4PTNA 3BW3A 5G2HA 3S5NA 3OIXA 5AFDA 5A8GA 2HMCA 3E12A 1GVFA 1VJIA 5LNSA 2WQPA 3MBDA 3E9AA 3LX9A 1VGAA 3EXSA 2ZZ1A 1W37A 1H51A 1H63A 1YLVA 1H7XA 3T78A 1KM3A 2Q3RA 2XN1A 1D3HA 3TAOA 1LRQA 1LRNA 1JCNA 5CPMA 3NQAA 2CLOA 3DFTA 2OJPA 4UR8A 1JRCA 4GWEA 1DL3A 4LRSA 3W7CA 1WA3A 4IOTA 1B4EA 4JYEA 2WSRA 3N3MA 3WK0A 1A5SA 4CNOA 1FWTA 1EUNA 1TQJA 2V2DA 3SY5A 2JBMA 3TJLA 4O17A 4O1BA 1MEHA 2JKPA 4PEKA 1FCBA 4O14A 4NT0A 2HS6A 1H60A 1UUMA 2VEPA 3TW6A 1YTDA 1YXCA 4IX2A 3ABSA 1WV2A 1A53A 4UCGA 5CZ0A 1SO3A 4O18A 2TPSA 4DO5A 1RQHA 1O4UA 1QPRA 2J24A 4Z1DA 3M5YA 3MUXA 1HO1A 4RV8A 2YZRA 5DCDA 5EMUA 7TIMA 2W0UA 3ZS4A 4JDBA 2A85A 5G5IA 1PCWA 1GVSA 4UNKA 4HPXA 1OHLA 4FO4A 1DOSA 3ATYA 3L67A 2A7NA 2QCNA 3O07A 2E77A 1HUVA 1VYPX 4JTGA 3L5AA 3EX6A 3CLMA 1ICQA 1OYCA 1DORA 3S5ZA 1A5CA 2VFFA 4M7SA 2YYTA 2A2IA 2ZCGA 3O63A 3B0PA 2GPTA 4AH7A 3P5ZA 3PUOA 3HF3A 3LV6A 1W1ZA 4WOQA 1FBAA 5G1YA 2QDGA 4DELA 3TU9A 2ABAA 5K3VA 2R8WA 4WJEA 2NX1A 3HPXA 4N02A 3TIMA 3NQCA 1Q3NA 4O53A 1EX5A 1YDOA 3HO8A 1WDWA 1DJQA 1LOSA 3Q2DA 3GDRA 1RVGA 3FFSA 4FIQA 5LNWA 2OT0A 4ML9A 5CPOA 3ELFA 4NX5A 4MFEA 3WJSA 4HNUA 3D0CA 3W1NA 2G97A 2QUTA 4N9BA 1ZFJA 5AHIA 4LRTA 2VFGA 3FA5A 2GOUA 1V7YA 2VEIA 5EYWA 1GT8A 5FEZA 3GKFA 3LM7A 3OVPA 1W3IA 4RX0A 2B7OA 1VS1A 1SFJA 2A7PA 3GB6A 3SJ3A 1OFOA 3TCEA 3EXRA 1KFLA 1OF6A 2WNZA 3KAOA 4MY8A 3QH2A 4S2CA 3LCGA 1CI1A 2OMAA 4MJZA 4MKNA 1K8ZA 4O13A 1ZY9A 4N6EA 3W87A 1W5OA 3TV8A 4FF7A 3A24A 3N9RA 4G1KA 2DU2A 4M7TA 4WY0F 1M5WA 2C19A 4JR5A 4RLIA 3ABRA 5FF3A 2QUVA 4AVFA 4QJ1A 4Y8FA 4EVZA 5AHMA 1W5QA 2FDSA 3G1XA 3RK8A 4GUHA 4PCFA 1H1YA 3C2OA 3ABOA 1TV5A 1PHWA 3LDVA 3Q58A 2CLFA 4OWGA 1SQ7A 1H7PA 1VH7A 5FF2A 4OBTA 2GVJA 2QF7A 3MBFA 2ZZ7A 4ICNA 1ONRA 3HBLA 3QYQA 2QJGA 3STEA 1SW0A 3E0IA 1B9BA 4YWIA 4YCPA 3NR0A 3CWNA 2QCHA 4R33A 2ZBTA 3LHZA 2ABBA 3P84A 3OHIA 3MO7A 5G4EA 1FWWA 1F5ZA 3SZ8A 2Y7GA 3WK1A 3EXTA 5E0KA 3EKZA 2ZTJA 3BLEA 3KX6A 3P7YA 2C15A 4JTFA 5G2IA 5AYZA 4L4LA 1X8FA 5DXXA 1TYGA 3NQVA 2F84A 3TQ0A 1XI3A 4NVTA 4TX9A 1TPC1 3LTSA 4ZMGA 3Q94A 4JY8A 4NNAA 5I3KA 4I7WA 2YCEA 3LERA 3LLDA 4HT3A 1F73A 4BWLC 2A4AA 4ZQOA 1WQ5A 3G1HA 4PA8A 4LS0A 4LT9A 3W1PA 4QSHA 5I3GA 1I2OA 2FJKA 1W54A 3V1PA 1TO3A 3W6YA 4MLRA 1PS9A 3GDKA 3UY7A 1FUYA 1QPNA 1VR6A 1LOQA 3C2FA 1PIIA 5LKYA 4Y6GA 1F76A 2BTMA 4UTKA 5D2VA 3BO9A 5K4ZA 3LI1A 1FXQA 2FQIA 4GRSA 3OBKA 5G2WA 1VHCA 4O10A 1GVQA 4ONVA 1FX6A 2P10A 4LY8A 1W5NA 4N9CA 3U6WA 1OFQA 2NV1A 1ZALA 1PVNA 2HS8A 4ADSA 2EGZA 4LC8A 4FIRA 1OFEA 1I45A 2ZA1A 4O19A 3S0CA 1DHPA 1DQWA 1ME8A 4B5NA 1K7FA 1JUBA 2HSAA 3IVUA 2QAPA 4E2BA 1EP3A 4JXCA 4EOUA 4R7JA 2FLIA 3LB0A 4PODA 4FNSA 2Z6JA 4MFDA 1QAPA 2R91A 5K4XA 8TIMA 4YLWA 3TC6A 3W83A 4N2YA 1TQXA 2FPYA 3LTPA 3KHJA 5CSRA 4JTSA 3TQVA 1QO2A 5KITA 3G1VA 1KM4A 4UC5A 3PSVA 3T55A 1I4NA 1KLZA 4UMBA 1SO5A 4H3DA 3W86A 3HG2A 5I3HA 1LDCA 5HULA 3CT7A 2CLMA 1WOAA 2VENA 1JCXA 2UV8G 3NQMA 1PE1A 3W70A 3L2IA 4NJIA 3NA8A 1TB3A 3DI1A 5FEXA 5LNRA 4R53A 4QQ3A 4IMEA 4Q4KA 3GXPA 1K7EA 1R2RA 2Y7EA 1FQ0A 4ZQRA 2VKZG 1Y0EA 2H8XA 2ZZ3A 4IMDA 3W76A 5LSMA 4KWVA 2DJXA 4CLMA 4UXDA 1G6CA 5DCBA 1GWJA 4KKXA 1TPDA 4JTKA 1H50A 2TSYA 1R2TA 5AHFA 3O1NA 1QPQA 3HGOA 1YXDA 4LTSA 1TREA 2VFHA 4O0ZA 2VFEA 3W7JA 5TBOA 2ZRYA 1QNVA 1RPXA 2IQTA 4FX6M 3CIWA 1ICSA 3NQFA 3B06A 3ATZA 4MVAA 4E2DA 3DZ1A 4CQ9A 4ADTA 5LNVA 3N14A 4QNWA 4N4QA 1YDVA 1W5MA 2CLLA 3BGJA 3R8RA 2DZXA 3FJLA 5K2ZA 5CG7A 5D30A 2FB2A 1BWKA 3RLVA 5F2LA 1VYRA 5EBUA 3W71A 3T4CA 4KFOA 3DI0A 1TRIA 4PH6A 3B0VC 1J4EA 4CQAA 2H3DA 2ZZ2A 1TTJA 4JS3A 2B7QA 3EWZA 3MP5A 3AO0A 1B4KA 1Q6RA 4M6QA 5LGZA 2PRMA 3GX9A 4O52A 5HR7A 4M6PA 1S5VA 5LHFA 2AQWA 5DCEA 3TH6A 2H8ZA 3GDMA 3LCXA 5I3IA 3H54A 3JR2A 4UTLA 1G67A 3FKKA 3DGRA 3QPYA 1ZNNA 3B04A 3DFQA 2JGYA 2VELA 2R94A 2ZRXA 4DF1A 3LHVA 3W7EA 3UD6A 5C54A 4JD4A 4BI6A 4AEOA 2DZVA 3M5VA 2EAWA 1QCWA 4AF0A 1DV7A 1GG1A 3P61A 3CM4A 4XTIA 5CKSA 4NZFA 3GXNA 5J5DA 5KTLA 4LC6A 3TNOA 2DZPA 1GVRA 1I2RA 1SR9A 3VKJA 2BSLA 4Y96A 3L0KA 3S42A 3W7KA 4WUIA 1EIXA 2C16A 5EY5A 5E93A 2ATSA 4MYXA 3P74A 4BF9A 2DZTA 5GVJA 3F03K 2CZDA 3EX1A 2DZUA 1LLWA 3O05A 2FPTA 4N9EA 3NZRA 4EF8A 1QFEA 1KLYA 1LZOA 5FF7A 2BWGA 2ZRUA 3W1MA 3TXVA 3DH7A 1QOPA 1NVMA 5EKYA 5D32A 3R5EA 2AAMA 4ADUA 1PV8A 1G4SA 1SZGA 1KW1A 2CLHA 4AWTA 3DHFA 1V5XA 4O4VA 4CCCA 4QIUA 3NQ6A 3IV3A 3E02A 3A21A 3HIJA 4UNLA 5DY3A 3WJYA 3FS2A 2BZNA 4UMCA 2J9XA 3ZFHA 1NSJA 4XBKA 3PY2A 3SGZA 5HWJA 2PC4A 2C0AA 2QCCA 1P4CA 3TAKA 1T8XA 2CZFA 2QCEA 3ANYA 1W5PA 4HPJA 4JGDA 3NVTA 3DFPA 4U28A 1TPUA 2V81A 3P62A 4ZQNA 3TFXA 3IIPA 5HQEA 1G4TA 3DHDA 4KWWA 5HUOA 3UWZA 2Q3OA 3N34A 1GVOA 4QM1A 2CW6A 3P67A 1IXNA 3FOKA 2V8ZA 2GQAA 4LV9A 3I6RA 5D33A 3O16A 4NNBA 4CCEA 4FXRA 4K8EA 3IRDA 5EL1A 2C3ZA 2G96A 3HGSA 5AN7A 4BR1A 1D3GA 1LORA 4BI7A 2A6NA 1RV8A 4UIOA 4LW7A 2NX9A 1F6KA 2ZA2A 1TJPA 1JR1A 2HTMA 4IMCA 2G95A 2A7RA 1AMKA 3NQ8A 1K7XA 3NXFA 1LBMA 3H53A 5KZEA 4LOCA 2CWNA 4XUGA 4LS2A 1OK4A 3G1SA 3IGXA 4WY0A 3QM3A 1OX6A 3U2OA 1H7OA 4RXFA 4TR9A 5K9XA 5KMYA 4HNNA 1SSDA 4UTTA 1XXXA 3ZR4A 3HPSA 1EWDA 3NAVA 4S2BA 4IXXA 4AMAA 3I65A 4DO4A 3G3DA 1QOQA 3M6YA 4IJBA 3RU6A 1A5AA 3NQGA 4WY0B 1F6PA 4BWLA 3W07A 1IXQA 3VFLA 1F7BA 2A21A 4NJJA 3UQNA 1T96A 3TJXA 4TO8A 2XN2A 1PL9A 1S5TA 5MHBA 1EUAA 1SZEA 1TPWA 2Q8ZA 2OX1A 1JCLA 3LRMA 1O5XA 3TXZA 4MIMA 2QCGA 3PUEA 1JQXA 3FEMA 3CEPA 3W7PA 2A0NA 3B05A 1ZENA 3I7SA 3PVFA 3GZ3A 3PWAA 3IGSA 3W74A 3RNDA 3WK2A 3C56A 1K03A 1ZAHA 3IVTA 3CTLA 1GTHA 3SGUA 3GAKA 5F4SA 2Z0IA 3MHUA 4IX0A 1SZFA 3QPZA 1XM3A 4O11A 3W7QA 3GIYA 2ZRWA 3HOJA 4QITA 5BW6A 1EWEA 1GTEA 1P5BA 4CCDA 3GR7A 3MI2A 4OV9A 3SW6A 3DBPA 3M5ZA 2O7QA 2CLIA 1KV5A 3WK3A 3PB2A 3VCRA 3CIXA 3EWWA 3M41A 4TU1A 5ABTA 2W79A 1E51A 1FDZA 3M1ZA 3RMJA 4O1DA 2Y62A 2CU0A 2WOQA 3A23A 3PAJA 4M19A 1DQXA 2WPBA 2JK2A 3LOTA 2C13A 4NQ1A 4A21A 3TDFA 1GPWA 2ISSA 3VNDA 3N2MA 3HQ1A 1UUOA 3IIXA 3KVMA 1MEWA 3IEBA 3TMLA 3UPWA 2Y7DA 1LM1A 3W7OA 4DPPA 2WO5A 3BARA 4UUIA 2YFOA 3GYEA 3NNTA 3GVGA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5U4NA

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