6TIMA

The adaptability of the active site of trypanosomal triosephosphate isomerase as observed in the crystal structures of three different complexes
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCNGSQQSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTFVHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAIAKSGAFTGEVSLPILKDFGVNWIVLGHSERRAYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLVGGASLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
publication title The adaptability of the active site of trypanosomal triosephosphate isomerase as observed in the crystal structures of three different complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei brucei
total genus 92
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 1991-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 6timA00
1ICQA 1ZAJA 4DXVA 4AMAA 1SO3A 4O53A 3EX6A 1ZENA 2RHGA 5I3GA 2F84A 3DFSA 1E51A 3R8RA 5AYXA 3EWZA 4ML9A 4ALDA 2E68A 3BLEA 3PM6A 4R53A 3UWZA 3B06A 1TPFA 1VR6A 1TRIA 3EX4A 1QO5A 4M7SA 4AWUA 1XDMA 5F4WA 4AB4A 2CZEA 1WQ5A 4BWLC 1ME7A 4BFAA 3H54A 2ATMA 4LS2A 1K7FA 3TSBA 2QCNA 1FDZA 1LTDA 1W54A 1VLWA 1KV8A 3HGSA 1JCNA 1W37A 2CLHA 3AO0A 1SO5A 2FPYA 2NWRA 3M47A 3N34A 3IVUA 4OBTA 2NLIA 1Q6QA 1QFEA 1R47A 3BO9A 4HKPA 3CEUA 4UTIA 3T55A 2WSYA 2NXGA 4PCFA 4MOZA 1RR2A 2WO5A 3LOTA 3ABSA 3M9YA 3OIXA 2EGZA 3P60A 1TPWA 2BLEA 4ZQRA 2GQAA 3TAKA 5HNRA 3PY2A 4OU1A 1XM3A 4KWWA 3B03A 1H1YA 2B7PA 3L65A 5TBOA 1ICSA 2ZRZA 2V2DA 2NV2A 1S3HA 4IGHA 4RCXA 2ISSA 1JUEA 1KFJA 5KMYA 3DXIA 2X1SA 1QWGA 3W7MA 4QJ1A 3S8HA 4KFNA 1Q3NA 3EWWA 3OVQA 5DLCA 1OX5A 4AF0A 1TQJA 5AN7A 3UWYA 4EOUA 1TPH1 4DPPA 1G4EA 3LTYA 2FB2A 5F2LA 4JR5A 4UR7A 1RQHA 3LHTA 3TFCA 3DENA 4LUJA 4NX5A 1A5BA 3LHWA 3W83A 4O52A 1KM2A 4IX0A 3MI6A 1SW7A 2FJKA 3R13A 1B4EA 5IBXC 3W2KA 3OBKA 1YXDA 1T0OA 2V30A 3LXBA 4OHQA 2C16A 4FB7A 1JCLA 1LBMA 3MJYA 3VFLA 2J9XA 1BKSA 4UFKA 4O14A 2E6YA 3TW7A 4LT9A 1KM6A 4LVBA 3EKLA 3P5ZA 4K38A 3KX6A 2YFNA 1I2QA 1LM1A 3GDTA 4CCEA 5F2IA 3B0VC 5ABTA 2Z2UA 5CGQA 3FJLA 3W1TA 3W7DA 2NX1A 1SZNA 1EEPA 5CPNA 3NXFA 1TYGA 1KFLA 1VC4A 5DXYA 2V82A 5LGXA 4OV9A 2DZPA 2BSLA 2A2IA 3I7RA 4NZJA 3LLFA 3O6CA 5I3IA 3B4UA 3NQFA 4HNUA 4M6VA 3UWUA 3Q37A 4I9AA 2UV8G 5AHLA 3C2VA 3TNOA 4N4PA 5GVJA 1ALDA 4MY9A 3L5AA 1AW1A 3HB9A 4I7WA 2E6AA 3TDFA 4JTLA 2DZXA 3QC3A 1PV8A 4UFLA 5G2IA 1D3HA 3DI0A 1EUAA 4NT0A 4WUIA 3HPXA 1H7WA 4JN6A 5L9FA 4O1AA 5F1UA 4LVDA 3VKJA 3JRKA 4HIBA 4QISA 2GVLA 5CPMA 3JR2A 3G0UA 3N9SA 3R5EA 2J27A 2HTMA 3L66A 5G4WA 4HT3A 4RZ6A 5FEPA 1TB3A 3HF3A 3TX9A 4O28A 3LCFA 4ICNA 4ZMGA 3WFAA 1ZAIA 2RKXA 1H7OA 2YW4A 1ZALA 3C2RA 3VCRA 3NL6A 4MZYA 3N2MA 2X2GA 5K4ZA 4RR4A 2GOUA 3STEA 4TU1A 1TTQA 3KRUA 4Z08A 3DKLA 2NXIA 3W2LA 3SFKA 4FEZA 5CSSA 1G67A 1KFCA 1TO3A 1ZY9A 3LDVA 1I8JA 3GK0A 1H7XA 3NQEA 4FHAA 3TQVA 1OFOA 3BW3A 4UR8A 3UY7A 3M6YA 1WBJA 2VFEA 2CZFA 1MSSA 1LDCA 4WD0A 3C3NA 4LWWA 2V9DA 1L9WA 2FB3A 3M5VA 5CKSA 3B05A 3P82A 3G1AA 4GNJA 4H6KA 5U4NA 1W1ZA 3IIZA 5MHBA 1TTIA 1FCQA 2QCDA 2H6RA 3OVRA 3PBUA 4JIPA 3GDLA 3HPZA 3LCHA 4BF9A 3IVSA 5CPLA 3EEGA 3TE9A 4UTKA 3W7OA 1OHLA 5CG7A 3C6CA 4JTTA 1YXYA 1DJNA 3MW7A 5LNSA 4Z1AA 5C6MA 4GUJA 4JY9A 2ZRWA 1SSGA 4X3ZA 1KV5A 1WDWA 3I7QA 3QW3A 3NOEA 2Q3RA 2X1RA 4WJEA 3NL3A 4LRSA 5A5WA 5AC6A 4JX6A 1O4UA 4RK8A 1BWKA 4NJGA 2ZA2A 3THQA 2R8WA 4AWSA 3LB0A 3S9YA 3UZ5A 1QDSA 1EUNA 1JUBA 2G95A 2GQ9A 5DXXA 3TKFA 5D02A 1TQXA 2YW3A 2VEMA 1M6JA 4N9BA 1R2SA 3M1ZA 3RK8A 2ZZ3A 1VRDA 1SZGA 5EKYA 3TV8A 3K30A 1KTCA 1LZOA 2EPHA 4G1KA 1SSDA 4UNLA 1JCMP 3C2EA 3MHFA 4NJKA 4U4MA 1U5JA 5LKYA 2C1HA 5FF2A 2FPVA 4MIMA 3S6DA 3TR2A 2XN1A 5LHFA 4JTFA 3PS7A 1D9EA 2WJZA 1XCFA 3PG9A 3EWUA 3W7LA 1EWEA 3O63A 1JCYA 4UMCA 1H1ZA 3NQDA 1KM3A 4JNMA 1CI1A 1IIGA 4R34A 3N14A 1HL2A 2QEZA 2DP3A 3G1XA 3TSDA 2E5CA 4IWWA 4E2BA 1XI3A 5D33A 1ZCOA 3Q94A 4NQ1A 3QPZA 4XKYB 2XFWA 3FOKA 3W1NA 4TIMA 1H60A 4NXKA 3O06A 4DO4A 3KRZA 4LC8A 3SW6A 1GYLA 2E5DA 1GTEA 5FI8A 1QO2A 1HO4A 3GKFA 3LBMA 1MEIA 4UTUA 1X7FA 5D32A 1FY6A 1W3IA 2LLEA 3T7VA 3PR2A 1I2RA 1UASA 2DORA 3BG3A 3W1UA 1TPC1 3HG2A 4LU0A 2EKCA 2Y62A 5AHMA 3CTLA 4M5PA 1BWLA 1W8SA 3W7GA 2NUWA 4AF0B 2ZZ6A 4MPQA 4IPIA 3LBCA 3CIXA 5FESA 1SZEA 4CQAA 4UFIA 4PTNA 2QCMA 3UPWA 4ZQOA 1NEYA 2ZTJA 1T8XA 3E9AA 1F74A 4GJ1A 3RLUA 3I65A 3W1MA 4Z1CA 4MJZA 3S5YA 1ML1A 4AXKA 2QUTA 2AQWA 3TXVA 1KM0A 1PS9A 3OG3A 1M7PA 3UY8A 2C13A 3NQ6A 1XKYA 3G1FA 2Y7DA 4X9SA 2R94A 3FS2A 4AH7A 3MP5A 4OGZA 5D2TA 4LV9A 3G8EA 1TSIA 1W3TA 3HMJG 5U7SA 3EXRA 3GXPA 2ZDRA 3LHZA 2TSYA 2JGQA 2NUYA 3BG9A 2WKJA 2Y85A 3BLIA 1LBLA 2YYUA 4FIQA 5D2VA 3NG3A 4OE7A 1QPOA 3S1VA 4P2VA 3TSMA 3PF3A 1OYAA 1K03A 3TIMA 4UTJA 2YX0A 3ZFHA 3QYQA 1HUVA 3TW6A 2E6FA 3GNDA 4GE8A 5LSMA 2Y7EA 3W1AA 1QCWA 4IMDA 1VPXA 3IGUA 4K8EA 4WZHA 1TREA 1B4KA 3LRLA 1XXXA 4NVTA 2YPIA 1NFBA 3GXTA 5HUPA 3OA3A 4POCA 3G1SA 5EBUA 4UXDA 1AG1O 3LRMA 2H8XA 1SR9A 2C18A 2QCLA 5I3HA 3MP4A 1MEHA 2A5HA 3W86A 1QOPA 4GFSA 3QEZA 2TRSA 4KKXA 3S5ZA 4JGDA 1AL8A 3DFTA 1PE1A 5AYZA 2C6QA 1ZHAA 5F2GA 1MO0A 4K6AA 5K9DA 5AOUA 1SZFA 5I3FA 1TIMA 1K8YA 4LC6A 5D2YA 3VE9A 2DZWA 4HHPA 3DU0A 2AGKA 4OV4A 5I3JA 5AB3A 3NPVA 4LUIA 2E5BA 4CNNA 4YL2A 3DHFA 4EVZA 1LOSA 2JKEA 4N9DA 1BTMA 3DH7A 3NQVA 3UD6A 1TJPA 1PCWA 1KA9F 4YWIA 2OJPA 3DI1A 2A0NA 3BK0A 2JK2A 1TV8A 3LCLA 4UC5A 3ZWSA 4RXGA 1O94A 3MMTA 4IQLA 2YYTA 2FQIA 3DKJA 5DN1A 2H3BA 3LXAA 2V5LA 4O0ZA 3GZ3A 1RQEA 3NPXA 1G7UA 4UTTC 3QSTA 3NA8A 1L6SA 1RV8A 2CLLA 3H53A 4R7JA 2A7RA 5BW6A 2FTPA 3KVJA 4UFHA 1OG0A 5J5RA 3CEPA 1DORA 1WXJA 1TPUA 2QCDB 3RU6A 5L6UA 3NNTA 1JJKA 2WPBA 3NQGA 3KAOA 4NJHA 2QF7A 2R91A 4FXSA 4GBUA 3STGA 4HN4A 1YLVA 4FNTA 5DCBA 3W1RA 3BG5A 3LM7A 2YFOA 4E38A 1JCXA 4N6FA 1ZJIA 1C9DA 3F1QA 4UIOA 1LRQA 3BGJA 3W88A 2QR6A 3ELFA 4MYAA 1J5TA 2ZA3A 3A21A 3PG8A 1PHQA 3IIOA 1GPWA 4NNAA 5D37A 4BR1A 4QM1A 4FX6M 2PCQA 4ADUA 5BRBA 2CLIA 3CWNA 3NYZA 3TXZA 3AJXA 1CW2A 3B0UX 4IXHA 3TCEA 3NM3A 3EWXA 4EIVA 4PFMA 1H5YA 4K39A 4Z0JA 1W56A 3C8FA 4QIUA 4DQWA 1EP1A 1B3OA 5C5YA 4JTEA 3EWYA 1GJPA 3W3OA 4TX9A 3L21A 2B7QA 2V8ZA 2ZCGA 4WY0B 1FXPA 1NF0A 3ZWTA 4GC4A 4FF7A 3OEXA 3BPWA 5AHEA 5KITA 1SU5A 5K4XA 1EP2A 3IIXA 5FF7A 1KM5A 2EF9A 3V75A 3C2OA 3NR0A 1C8VA 3HIJA 3NL2A 3E49A 3E12A 3TA6A 3B8DA 1W5OA 1GVOA 4UMAA 4X2RA 3THAA 4TR9A 1H62A 1GT8A 4ZZ9A 1FCVA 3MBFA 1L6WA 3G22A 1EP3A 2Q8ZA 1LYXA 3TROA 1LLWA 4XBSA 2PRHA 3S0CA 3LI1A 2RH9A 3WK0A 1A5AA 1OX4B 1L6YA 5D2XA 2E09A 1LOQA 3NPUA 2VENA 3P67A 3W7EA 1PIIA 1JQXA 1OK4A 3TH6A 1SFLA 4JICA 3PSWA 1F5ZA 3W7RA 4JD4A 3UYCA 4Z1BA 4IJBA 3W7NA 3W7PA 4O4WA 1TTPA 2YSWA 3P74A 5HWNA 2C14A 4HPXA 4AHQA 2A85A 2A6NA 3L5LA 1OX6A 2PC4A 1UUMA 4JIQA 2NWSA 5HUOA 2TPSA 4RV8A 5CPOA 2CLEA 2NXHA 2A7NA 3C2FA 1H7NA 2VFDA 3GLCA 3HOJA 3M5XA 3F4NA 5EY5A 1OYBA 3MI3A 1XUUA 3O6YX 2Q3OA 5E93A 1G4PA 4AEOA 5DELA 1TV7A 3PB2A 3TK7A 4JDYA 2VXNA 3FEMA 1IXQA 4JS3A 1QNVA 1I4NA 3W1LA 1J4EA 1K3UA 1K8XA 3MO7A 4NZFA 4Q4KA 5KZMA 3NAVA 2YXGA 4GUGA 1VCFA 3LERA 4XZ9A 3W73A 4UTMA 2TYSA 1GVFA 4AAJA 2RDUA 1KLYA 4QNEA 3C4UA 1G4SA 4ONVA 3T40A 3W2NA 3WJZA 1FXQA 2Y63A 3P5YA 5EMUA 3H55A 2Z6JA 1K02A 2CLOA 5K3VA 3G1DA 4DBDA 2PRLA 1FUYA 1O95A 5G1YA 3WJWA 3FYPA 1NAL1 1OFPA 4JX5A 3G1YA 3WJSA 1YDOA 5AC7A 4IMCA 3FIGA 4IX2A 1WV2A 4M6PA 1AW2A 2BX7A 4HNVA 4TMCA 3GVGA 2ZRVA 2OT1A 3TAOA 2QJGA 3W85A 5J5DA 4Z1DA 3W7JA 2FDSA 2P0OA 3NQAA 3F4WA 4JTUA 3L5MA 1H61A 3B04A 5FF4A 1X1OA 5LGZA 2V2CA 3GXNA 1QAPA 5LNRA 2Z1BA 5TQLA 3RNDA 3U2OA 2H90A 4KWVA 4O10A 1F6KA 4Z0SA 4EF8A 3NO5A 3WJYA 2B4GA 2NX3A 5KSWA 1GZGA 1DQWA 3EX2A 4RJEA 3QSRA 5EA9A 3P8IA 4FNSA 3PWAA 1R30A 3SGUA 5KZEA 3M0ZA 1JRCA 1XC4A 2PE4A 1TMHA 3W1QA 1GG0A 2X1UA 4L4MA 3PULA 4BK9A 2GJLA 1H63A 1DHPA 1JR1A 5BNKA 1FWSA 1XBXA 4A2RA 4UCGA 2J24A 3PUDA 3A22A 1IXNA 1VLIA 2JKPA 2P10A 1OFBA 5CSRA 4J9JA 4NX0A 2GJNA 4KFOA 3C61A 5HJLA 1MZHA 1UBSA 2WNZA 2OCZA 5C54A 1KFKA 1ADOA 2CZ5A 2C0AA 1ME9A 4IMGA 3TMQA 3W2UA 3RFAA 2TMDA 4O13A 3QMTA 1FDYA 4O16A 1GYNA 3C52A 5LNWA 5HWMA 1OABA 1VCGA 1THFD 4LV4A 3QFEA 2DJXA 3GR8A 2G5WA 1YPIA 1ONRA 3A9IA 3N19B 4JTIA 4JX4A 4O1CA 4X22A 3QQ0A 2WSRA 2DU2A 3ABRA 3HGJA 3PSVA 3W7HA 2ZQ0A 3BGGA 1KTBA 3R12A 3NQ2A 4MFEA 2VELA 3B0PA 1FCBA 2D73A 2ZRUA 5G5IA 5D04C 2OX1A 2GVJA 4K7VA 4M7TA 4MY1A 3PBWA 1EWDA 3CU2A 3LCGA 3P8JA 2FIQA 4ZVJA 3TJLA 3G0XA 2OZ0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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