7TIMA

Structure of the triosephosphate isomerase-phosphoglycolohydroxamate complex: an analogue of the intermediate on the reaction pathway
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
ARTFFVGGNFKLNGSKQSIKEIVERLNTASIPENVEVVICPPATYLDYSVSLVKKPQVTVGAQNAYLKASGAFTGENSVDQIKDVGAKWVILGHSERRSYFHEDDKFIADKTKFALGQGVGVILCIGETLEEKKAGKTLDVVERQLNAVLEEVKDWTNVVVAYEPVWAIGTGLAATPEDAQDIHASIRKFLASKLGDKAASELRILYGGSANGSNAVTFKDKADVDGFLVGGASLKPEFVDIINSRN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Intramolecular oxidoreductase
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
publication title Structure of the triosephosphate isomerase-phosphoglycolohydroxamate complex: an analogue of the intermediate on the reaction pathway.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 88
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 1991-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 7timA00
1MZHA 5FEZA 4WXZA 5D37A 1SSDA 4XKYB 4A21A 3I6RA 2ZZ3A 2WNNA 3NQFA 1H63A 5CPMA 4RR4A 1TPDA 5LNWA 1K7FA 1GTHA 3TUUA 3A9IA 3W7QA 5I3KA 6ALDA 1AW2A 5A8GA 4AHPA 1OK6A 1LROA 4O8RA 3W2NA 3NL6A 3HO8A 3INPA 1VC4A 3LXAA 3VE7A 3A23A 3BW2A 4X3ZA 6TIMA 4MLRA 4UTIA 1UUOA 3LCXA 3FOKA 2ZA2A 3W83A 2FPTA 5FF2A 3LHWA 3PAJA 4NJGA 2Y7FA 2CLKA 1SO6A 1ZJIA 1MO0A 1OX4A 2V2HA 4E38A 2ZZ7A 5EKYA 3OG3A 1KM1A 3TH6A 2VEKA 5H2ZA 2XFWA 2GOUA 2VEMA 5HNRA 1R46A 3W74A 4HPXA 3GKFA 4GUHA 3LHZA 4OT7A 1I4NA 4CNPA 3W7OA 3HPZA 5F1UA 1GG1A 1Z42A 2Y7DA 1ML1A 4MOZA 2DORA 4UXDA 5HJLA 2VFIA 1MEWA 3LM7A 3H54A 3QYQA 4OBTA 5EBUA 2E77A 2ABBA 5D2TA 1ICQA 3A24A 4KFPA 3C4UA 1TPB1 1DQWA 1J5TA 2V8ZA 3RK8A 3W22A 4LTSA 2B7PA 2A21A 3W72A 3N3MA 3O05A 5G2HA 4ALDA 1FY6A 1LDCA 2A5HA 2YFNA 1K3UA 5U4NA 1J4EA 4O1CA 3GDRA 1F6PA 2VEIA 4NX0A 5G4WA 1P0NA 1B9BA 2VOMA 3LOTA 2JKAA 1QO5A 3BLEA 5C54A 5AYZA 3PB0A 2NXIA 3NPWA 1EX5A 3TQ0A 3W88A 4KWWA 3WK0A 1VYPX 5AHIA 3LDVA 3OA3A 2TYSA 3EX6A 4EWND 1GYNA 1KLYA 3EEGA 5BMXA 1W5OA 2OZ0A 3UWWA 1YLVA 3DFNA 4FIQA 3GIYA 2CZDA 4IMDA 4JGDA 3R13A 2V82A 4FF7A 3LXBA 3BW4A 4JYDA 1L6SA 1KM3A 2Z6IA 1OG0A 3TC7A 2NXHA 1SU5A 3N2MA 4GE8A 3LI1A 5FEPA 3W1TA 2NUXA 1QPQA 3GR8A 1LLWA 4KKXA 4MY9A 3UY8A 3GDKA 3ATZA 4ZZ9A 1JUEA 3TSMA 5D09A 3M7WA 4N4QA 1CX9A 2G96A 4IX0A 1KFBA 1HL2A 4OQVA 4N9CA 1UJPA 2A2IA 3AO0A 1XBZA 4UTHA 3UYCA 2QDGA 5LNUA 3HQ1A 5LKYA 1TTPA 3TR2A 4W9TA 2FB2A 3NR0A 4JX4A 2B7OA 4DBEA 2VFFA 1OFQA 4AHOA 3B04A 5HINA 2QUVA 3F03K 4LVFA 1T8XA 1LRTA 1L6WA 2B0MA 4GUIA 3D0CA 3IV3A 1ONRA 3LERA 1ICPA 3K30A 1H5YA 3NQDA 3DI0A 5HULA 4UNKA 3RF9A 3GXNA 1GOXA 3PR2A 1YPIA 4P2VA 4FNQA 2ZRZA 4TIMA 4GUGA 3R12A 3NL2A 4BI6A 1TCDA 1W54A 2ZYFA 3DHFA 4MZYA 4YLWA 3B06A 3HPSA 1KTCA 2C6QA 5DBTA 4WY0B 5HR6A 2GPTA 3LV6A 4Y6GA 2V30A 1XL9A 1O5XA 3NL3A 3LTPA 5AHEA 3CEUA 5AHMA 4P61A 5HMSA 3RMJA 5EMUA 1VR6A 1TPFA 3L2IA 2DJXA 4LC8A 1NEYA 2DZWA 3PBYA 1A5CA 2DZXA 2VEPA 4LT9A 4UTTC 3G0SA 4NJJA 4O13A 4YCPA 4GFSA 1EWEA 1AW5A 4XTIA 4UTTA 5CZJA 3NYZA 3W6YA 1H51A 1LLZA 2B7QA 5F4WA 3SGZA 3BGJA 2WNQA 1Z44A 4N6FA 4ZQMA 1KM2A 2HSAA 2ZRVA 3W1RA 2ZTJA 1FXPA 4ZMGA 3O63A 3MI3A 1BEUA 3M1ZA 2TRSA 3NQ8A 3YPIA 4O16A 3ABQA 1TTQA 2E5DA 1TPH1 1U5JA 4IX2A 5BOOA 1YTDA 4XUGA 1WBHA 1O60A 4WZHA 3LXCA 2CFFA 1XDLA 1SZNA 3BV4A 4UTUA 1OHLA 1Z48A 1JUKA 4MJMA 3C0JA 3M5ZA 5CZTA 4FXSA 4N9BA 1X1ZA 1W3NA 4JEQA 4ADUA 4NJKA 1FWRA 4YL2A 3QF0A 2E6AA 3S9YA 3DH7A 3WJYA 5EPDA 3PG8A 3FLUA 3CB8A 4CNOA 1FQ0A 1NF0A 3TV8A 3MYPA 1QCWA 4OV9A 3LCIA 2GVJA 3EKLA 4FXRA 5C6MA 3KVMA 4LVBA 3EWZA 2GUUA 5DELA 3LTSA 1IGSA 1GVOA 4J9JA 1ME9A 5AOUA 3NDOA 1YYAA 1KTNA 1NF7A 2EPHA 3O16A 1TQJA 4XZ9A 3HBLA 1TV8A 2DZSA 4BFAA 3QPZA 4DF2A 3SGUA 1R2TA 3NQ7A 4IWWA 4JR5A 1K7XA 3DU0A 4UMAA 3NQAA 3F4WA 4HHPA 1KV5A 1DV7A 3NPVA 5FEXA 1WOBA 5D38A 3Q58A 1EIXA 1W5QA 3STEA 4LC6A 3GX9A 3B0UX 4JTUA 1F5ZA 5HWNA 3UWVA 2V81A 4LS2A 5FEWA 1W3IA 1YADA 3S5ZA 1OFBA 3N34A 5CSSA 1PVNA 1RV8A 3NAVA 1YDNA 3UWUA 2YYTA 3G1VA 5AHLA 1IF2A 2ISWA 3ABOA 5ABTA 2CLIA 5E93A 1VHNA 4ZL1A 4GUJA 4MIMA 3R89A 2NUYA 1IIGA 3UWQA 3E02A 1EB3A 1PIIA 4M19A 2BSLA 4OE7A 2BWGA 2QCHA 4IGHA 3L21A 4R53A 4UR7A 1LRNA 3W1UA 2YXGA 5C5YA 2E68A 4FHAA 2VELA 4JTSA 3LX9A 4A2RA 4R7JA 2QCLA 1B4KA 3LHUA 3W7RA 1SFJA 4JTLA 5D2WA 1E51A 1IXPA 2YX0A 2CW6A 4GUFA 2CLHA 5D02A 2P0OA 4H3DA 2OX1A 3W87A 2V2DA 1QPOA 2QCMA 4IMGA 3SY5A 4DO5A 2W6RA 3UXDA 5SWUA 3Q2DA 1D9EA 1H7XA 4UFLA 1G67A 1BWLA 1AG1O 3ABSA 1TYGA 2GQ8A 2QUTA 4MUZA 1XCFA 3W2MA 3M6YA 3A5VA 3PBVA 1G7UA 4PEKA 3UQNA 1TIMA 3MP5A 3NA8A 1GVFA 2E6FA 1OYCA 3N73A 3TMLA 3FKKA 1VCVA 2QCDB 4O1AA 5F2LA 1DL3A 3DAQA 2CU0A 3NL5A 1NFBA 2Y7EA 4O53A 4U4MA 3CWOX 1QMLA 4IJBA 3G1SA 4O4WA 3IIOA 1W37A 3PSWA 1C8VA 3NEVA 1VGAA 3NXFA 4DPQA 1OABA 1RQEA 1SW7A 1WXJA 2C16A 2FQIA 3NNTA 2FPYA 4RKAA 2H8XA 2R8WA 3W9ZA 4QAIA 3PB2A 4NNBA 2EKCA 3SR7A 3P84A 3GKAA 5CZ0A 2NZLA 2J6XA 1Q3NA 3G1XA 3OIXA 4OU1A 1SUXA 3JRKA 2D73A 4Y96A 5DCEA 4PODA 1R47A 1QR7A 5AN7A 2C14A 1HTIA 2X1TA 2NX1A 1G4EA 2RFGA 2Q3OA 3E0IA 4XWUA 3M16A 3HGSA 4S1FA 4PCFA 1QFEA 3T7VA 3QSTA 4O14A 4ZQCA 3T44A 5K9DA 4RXFA 2PCQA 2ZZ2A 3B03A 3GYEA 2PRLA 2PC4A 1UB3A 5CPOA 5DLCA 4IXXA 1H7OA 1XDMA 1K8ZA 2NV2A 4JX6A 3G3MA 4AF0A 1DVJA 5KTLA 1FWSA 1DOSA 1B57A 1SZEA 1Y0EA 3SIZA 3TX9A 3W07A 2YSWA 4K8HA 3W85A 3R2GA 4LOCA 2CWNA 1H7PA 5HUOA 3NQGA 4E2BA 3A5FA 1ZY9A 3E9AA 4WXYA 3C2EA 4XBKA 3L9CA 4Y9AA 3CM4A 2YFOA 3W7IA 3CC1A 1G4TA 5K7JA 1XXXA 4HNNA 3B8DA 4EVZA 1H1YA 1T99A 3S5YA 1KA9F 3NQ2A 4O1BA 4UFHA 4H6KA 4N02A 4BI7A 3BO9A 3TIMA 1KTBA 1AL7A 1N55A 2GJLA 3P74A 2LLEA 3T55A 4AWUA 4I9AA 3WJWA 1JCLA 1Q6LA 1V7YA 3KX6A 1FWTA 1YXDA 3O07A 4UR8A 3RLUA 3G22A 2JBMA 1OFRA 1WA3A 5J5RA 1TPVA 3NGJA 4Z1DA 5AFDA 4ZQRA 2Y7GA 2ZRYA 5K2ZA 2TPSA 4O52A 1JQXA 5G1YA 5DN1A 3G18A 3C61A 1JCNA 1Q45A 4RCXA 4A3UA 4AWSA 5KITA 3EB2A 4S2CA 1LBLA 5TBOA 1ME8A 3HG2A 3TA6A 5AC6A 3UPBA 2X30A 1KBJA 1WDWA 3I65A 2WSRA 4AEOA 4JN6A 4LY8A 3WJSA 1DQXA 2Z0IA 3MMTA 3MYOA 4M5PA 4UC5A 3STFA 3EXTA 4HKPA 2QF7A 5FF0A 2JK2A 4MFDA 4NQ1A 1RQBA 2BX7A 3S5NA 5KSWA 3N9SA 1LBMA 3L0KA 3C52A 2ZA1A 1G69A 5K9CA 1KM4A 4XTDA 4MY1A 3GLCA 3KRUA 4DBDA 3U8GA 3LHVA 4K7YA 2J9XA 3CT7A 2A7RA 3GB6A 4JNMA 4NJHA 5I3IA 5K9XA 2DJLA 1I2QA 3UNDA 1RQHA 3W1PA 1OFOA 1YDVA 1RPXA 3FYOA 2ATSA 3CHVA 3W2UA 3KXQA 3DXIA 3E96A 4E2DA 1O4UA 2A6NA 3LV5A 1P0KA 4RX0A 3KOFA 2YDAA 8TIMA 1KW1A 3P60A 4BWLC 1ZENA 3PBWA 4IMCA 2PRHA 4O10A 2WO5A 3W7DA 4EF8A 5KINA 4NXKA 1OF6A 2X1SA 1W5PA 3JS3A 1SZFA 1ICSA 4BWLA 3JR2A 1VLWA 4GRSA 4NU7A 4ADSA 3LI0A 4PL1A 1ZAHA 3S1UA 5G5IA 1M6JA 3QZEA 4JTEA 1VQTA 1WOAA 1EA0A 2QKFA 2EGZA 3W2KA 1K03A 2Y70A 4LVGA 4DEFA 2G97A 5L6UA 3WJZA 2NX9A 3TSDA 4PA8A 1X6UA 3F4NA 3FIGA 3HG5A 4KFOA 1OYAA 1OX6A 1ZFJA 3LHTA 3P7YA 4EOUA 3ZS4A 4O54A 3TXVA 4AWTA 1W5MA 2R14A 3A22A 5AHNA 1EEPA 4LWWA 3O6YX 5CZSA 5CKSA 3C3NA 1TQXA 3QPYA 2O7QA 4O57A 1GEQA 3TKFA 5D30A 1A5SA 1R2SA 1DBTA 4Z1CA 3LCHA 4MY8A 5DCBA 2AQWA 2WNZA 3ZFHA 4X9SA 1H1ZA 2FJKA 3CU2A 2FFCA 4DPPA 3OEXA 4TR9A 1H62A 3RFAA 2C1HA 1W8SA 3GNDA 4IMEA 3C8FA 4O0KA 3MP3A 1IIHA 5AHFA 2A6LA 1JVNA 1CW2A 5D2XA 3HGJA 3QFEA 5BW6A 4O17A 4K38A 3BLFA 3SJ3A 5J5DA 4ZQNA 4FNRA 3FKRA 2J27A 4MLJA 4IXHA 5EY5A 5CGQA 3I7RA 3W71A 3V75A 3DENA 4LRSA 3DFSA 1TJRA 4DO4A 2C18A 1FXQA 3TFXA 1PV8A 2ZDRA 4JYEA 5T26A 2JKPA 4O4VA 4E0CA 1OK4A 2HS6A 1WYIA 4YWIA 3Q37A 5HUPA 3QSRA 3QQ0A 4JTGA 1PHQA 3P62A 3NM3A 2YZRA 2QJHA 3DFOA 1GPWA 1TV7A 1OFDA 3BK0A 3LRLA 4FNSA 3KHJA 4Q4KA 4LV4A 4K7VA 3NM1A 2O7SA 3ZR4A 4BR1A 1BKSA 1H60A 4Z0JA 1ZHAA 4NVTA 4RXGA 4I7WA 1SW3A 4JTFA 1LORA 2DP3A 3TC6A 4KWVA 5KZMA 3PULA 4CQAA 3MUXA 1TJPA 5E1QA 2B7NA 5DXXA 1VRDA 2DZUA 1FWNA 1FDZA 1O95A 2NWRA 2W0UA 5F4SA 3GDMA 3MI6A 2Q8LA 2GQAA 5C55A 3W1LA 4TU1A 4WY0F 3GZ3A 2EF9A 1ALDA 3TW7A 3F1QA 1R2RA 4DXVA 2A1YA 2GVLA 2YW4A 4LS1A 3NVTA 1U83A 1ZNNA 5FF4A 2QAPA 4AHQA 4Z1BA 2Y88A 4GXMA 5D32A 1LOQA 3W73A 4ORMA 3W2LA 1EP1A 5F1VA 2QCEA 3EXSA 4PC8A 1DHPA 3TXZA 3HG3A 2R94A 2ATMA 5L9FA 4UTJA 1W31A 2RDTA 4IMFA 3DFTA 3I7QA 2Y89A 2CLFA 3VCRA 5A5WA 2WQPA 4WQ6A 1I2RA 3M5VA 1XKYA 2C0AA 1UCWA 3MHFA 5F4XA 1OF8A 3KAOA 1XUZA 4JY9A 1RR2A 3IIXA 5EL1A 1K8YA 3UWZA 1QNVA 4O11A 5LHEA 5BRBA 1A5AA 1JCYA 4FNTA 2Y63A 4XBSA 4WY0A 3LRKA 1LM1A 2X1UA 3UZ5A 1BWKA 2WPBA 3N19B 3I7SA 5IBXC 3G1HA 3IEBA 3S0CA 1KFKA 3G1AA 4FX7A 3DZ1A 4HSNA 4FB7A 1I45A 3L66A 5IBXA 1O5KA 2NUWA 3ELFA 3CQ0A 1TTIA 3MWAA 4MKNA 2PE4A 1NSJA 2RDWA 4AF0B 4RZ6A 1SR9A 3UD6A 3P8JA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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