8A3HA

Cellobiose-derived imidazole complex of the endoglucanase cel5a from bacillus agaradhaerens at 0.97 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (ENDOGLUCANASE)
publication title Lateral Protonation of a Glycosidase Inhibitor. Structure of the Bacillus agaradhaerens Cel5A in Complex with a Cellobiose-Derived Imidazole at 0.97 A Resolution
pubmed rcsb
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 120
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1999-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 8a3hA00
1QI0A 3VNYA 4HMCA 4CCEA 3EMQA 3WFZA 2CPUA 1XYZA 1HIZA 3SUUA 2XFRA 4QFUA 1XCWA 3VMPA 4GO9A 1E15A 3L4XA 1GVIA 1UKTA 1WZAA 4YPJA 1DWGM 3AIUA 5LA2A 3L4UA 4DUWA 2BFGA 1UKQA 3WBEA 1XSIA 1EQPA 3A6OA 3L4WA 4HA1A 1M7XA 1BHGA 1HJXA 3SCRA 5CLTA 2DSZA 3L4YA 3ZMRA 4PTMA 3U5UA 4D6IA 4KRTA 1HL9A 3IAQA 4UNIA 1M53A 1BAGA 2ZUWA 4GXPA 3GZAA 2VR5A 2ZXQA 1HJWA 3WNLA 4B3LA 4HU0A 4GPNA 3SEPA 3F5JA 1FH7A 3BAJA 3A4XA 4YHGA 4GI6A 3WD4A 3A4WA 2Y8KA 1EHNA 1VAHA 1HL8A 2W66A 1BSIA 1TVPA 3WUBA 2WKGA 1UD5A 2AOSA 5GNYA 1WDRA 3AMKA 5AY7A 2VVSA 1G1YA 4J28A 1D2KA 2YDQA 2YL8A 4UOJA 3SCSA 2UY5A 1NM9A 3NDZA 4AXNA 1QW8A 2BY3A 3K46A 2VUYA 1WZLA 2OSYA 4D6HA 3A3HA 1B9ZA 2UWFA 4M1RA 1BYCA 3KL0A 5E6ZA 4UFHA 1LF1A 3MMDA 4D6FA 1E9LA 3PTMA 1FFRA 1CYGA 3WL0A 1OM0A 2J77A 2E4TA 5EFFA 1OIFA 1UWQA 7CGTA 1FA2A 4AZCB 1XRVA 1GOOA 4PTXA 3M6DA 3OGSA 1UR4A 4P7QA 1VEPA 2F61A 3BXWA 3AIEA 5IXEA 3AQUA 3SUWA 4HTYA 2QHAA 1HP4A 2TAAA 2V38A 2ZUMA 2Y5EA 1W9DM 4F9JA 2ZE0A 1UWSA 1KR1A 2WVVB 2J7DA 3AOFA 4PMNA 5GQBA 4F66A 1CXKA 4YHEA 3MV11 1E0VA 2G3JA 1J0IA 2AMGA 3ARVA 5LA0A 4MNLA 3VGFA 1H11A 4ATLA 3WSUA 2XIBA 3UESA 5A8QA 4Q22A 4L4OA 3K1DA 3I3EA 2GUYA 2ZXDA 4AMCA 5A8OA 5IFPA 3OGRA 3TP4A 2BY0A 5FL1A 5CSUA 1PBGA 2G41A 3EYPA 1R7AA 3L2MA 2VT0A 3AS1A 1X6LA 4BQ3A 1BG4A 3RIKA 2VJXA 1B2YA 1G94A 3GDBA 3WD2A 4FLSA 1MXGA 2WHLA 2WMKA 1JAEA 1GOKA 1O6IA 4XUYA 1E6RA 2DQXA 4U3AA 5M17A 2QF8A 5A94A 1WDSA 2YL6A 1NP0A 4E2OA 4EKJA 3K4DA 2CHOA 4JL1A 3CHCA 1BQCA 3WF4A 4D6CA 1G01A 3ECQA 5BRQA 1TA3B 1J12A 1LL7A 1KXQA 3ZT5A 3ALFA 4PMZA 7A3HA 2BHZA 5CZKA 1A47A 2BXYA 1JGIA 1XD0A 3CO4A 1HKMA 1AMYA 1V0LA 1NP2A 1CLXA 1JXKA 2FH8A 4LYQA 5FD0A 1D7FA 2VZTA 1GJWA 1UG6A 1XV8A 2DSVA 3HN3A 4PSPA 3MUAA 4NSBA 2G3IA 2BXZA 3A47A 5DF0A 3AROA 1HJQA 1W9PA 1ZB5A 3MV01 4URIA 4D72A 5JIPA 4BQ5A 1V6YA 1B3WA 1WZKA 4HOZA 1QNOA 4QP0A 1PEZA 3AXHA 4NRRA 1V3JA 4Z2LA 1J0JA 4V2XA 4ML4A 3AFBA 4AZGA 2WK2A 4ZEPA 3MUIA 3SUSA 2GJXA 1A3HA 3VDBA 2A3CA 5BROA 3M46A 1MW1A 2OSXA 1G5AA 1QHOA 1C3FA 1V6VA 4EE9A 5JUVA 1KBBA 4UOZA 1DTUA 3N9KA 5JBDA 1CXLA 3AHTA 1E6NA 1J0KA 1OWQA 3WBAA 4M81A 4F79A 2DH3A 4W87A 3AXIA 1E3XA 1JFXA 1V03A 4DM1A 3W38A 3FW6A 2JFEX 1ZL1A 4HOWA 4WF7A 2YKKA 3FXYA 3SUTA 3QHOA 1SYTA 1B31A 1CEOA 3WEOA 3LPFA 3TOPA 2OYLA 2DIJA 3WKZA 4TTGA 1BYBA 1ZBVA 3VD5A 5AC5A 2X1IA 3VINA 3UG5A 1MQRA 4QLJA 2XGIA 1HJSA 1EO7A 3VIFA 1W9XA 3DHUA 3T08A 3VGGA 1CLVA 5HDRA 4GIAA 2J25A 3WIJA 5C70A 1UZ4A 1EXPA 1W2PA 3ARYA 4GI8A 3ZSTA 2O9RA 2Y2WA 3PN8A 3RM4A 4MNJA 1KGXA 3NDYA 4AD0A 5ECUA 1JG9A 1V3KA 1WE5A 2CHNA 3KWXA 4UR9A 3TTYA 5CGTA 3AS2A 4BF7A 3OLEA 2XVLA 1RP9A 4J3UA 5M5DA 4PMXA 4PCTA 2WBKA 5FOOA 4LYPA 3LPOA 4JZ5A 1LG2A 2PF0A 1WCGA 2ZX5A 3CHEA 2DT2A 3N13A 1DP0A 1E6XM 4MJ4A 3WDQA 1CTNA 1GOIA 4ZE4A 3LPGA 1K6AA 1W3KA 3NSNA 5I2UA 3PZQA 1E6QM 1JNEA 1W9UA 4WSJA 1LWHA 4ZFMA 4V27A 5D9MA 1E6PA 2G4FA 3I3BA 1UR2A 2GJRA 3NSXA 2YOCA 1R87A 1UZ1A 4PMVA 3ARWA 2V3EA 5A8PA 3ZJ6A 1CNVA 1GJUA 4UFKA 4AZBA 4S3KA 2NT1A 4P8XA 3RMEA 2VQUA 1HT6A 5BXSA 4UQAA 3CUJA 3VGEA 4U5KA 1ISZA 1HKJA 4LXFA 1PX3A 1NWSA 1W3HA 2WVTA 2GDVA 2XHYA 3ARXA 2CITA 4AIOA 5CG0A 4TTUA 3O9NA 3MMUA 3AMLA 4WKHA 1ZBKA 1G0CA 3UETA 1J0ZA 2VMFA 2NW0A 1B0IA 4X9YA 3UG4A 1GW1A 2YA2A 3BC9A 3VIPA 4EK7A 4KGLA 4HPGA 2ZICA 3WY1A 3G6MA 2OSWA 4D6JA 4HP5A 4ACZB 1V6WA 3VIOA 3WELA 5A2AA 1G9HA 3KE0A 1CXHA 1MFVA 1ISWA 1XD1A 3VDCA 2CNCA 4HZ8A 4PMUA 4W86A 3EDEA 5IDIA 1V6XA 2DDXA 4TVDA 4XX6A 2WAGA 4Y7EA 4XZBA 4GQRA 1QBBA 2OWCA 2X2YA 1V3MA 4D6DA 4GO8A 1R85A 1OGBA 3SCTA 2VX6A 3ZT6A 3VUPA 4NI3A 2D0FA 1V0KA 3WDJA 1HJUA 4BA0A 3D3AA 1QVBA 2XVGA 1YQ2A 1XH0A 2XVKA 3QGVA 4MTVA 5DO8A 1UKSA 3W6MA 1HF6A 3WMCA 4WSKA 3WENA 4PN2A 4UOQA 3WNKA 1V6UA 5CLWA 5A6KA 2F8QA 5A6LA 3WEZA 3W81A 3SCQA 1F4HA 3OA5A 1ISYA 3RDKA 1H09A 3VDAA 2WMFA 3POHA 1LQ0A 5I79A 3LMYA 3RILA 5ABFA 1UWRA 3GM8A 2D0HA 3WQ6A 1GQLA 3OLDA 1GQIA 2J79A 4GINA 2ZXAA 1DWAM 2CCRA 1K9EA 1VENA 4H41A 3WUFA 1FFQA 4PMOA 2WSKA 4H8HA 2XJ7A 4F8XA 4Z2GA 3FHQA 2CBVA 4HZ7A 2ZX7A 4B15A 2W67A 1XH2A 1ISXA 5I77A 1MW0A 2JE8A 3NCOA 3CZEA 2WVUA 4AEEA 4PMQA 1TE1A 1FOBA 1XYFA 1GOWA 3LPPA 3RJYA 4MJ2A 2J7GA 1GPFA 3WH6A 5JIWA 1E4IA 3K4AA 1ZBWA 3EDKA 3ARUA 3MUY1 2O92A 1PAMA 1IT0A 3IAPA 1E6ZA 5E9AA 5C8BB 2EXOA 3A4AA 1X1NA 3WNOA 3WQ4A 4H8VA 2ZUNA 4IPNB 3EMCA 1QNSA 3VGDA 3UR8A 2CYGA 4D6GA 2DIEA 1BLIA 1ITXA 4PTVA 4U31A 1OINA 2XUCA 3AZSA 1U2YA 4JKMA 1C91A 1XSJA 4E8DA 4JAWA 1H1NA 3CUFA 3CZJA 3ZJ8A 3AJ7A 1CECA 1E0WA 5LA1A 2WMGA 3QR3A 1OD8A 2XSAA 2VI0A 1K9FA 3BSGA 3WD1A 1QI5A 1LWJA 1Q6FA 6A3HA 1GOQA 3W27A 1KCLA 1JYXA 2CETA 4CVUA 3FN9A 4AZIA 3TTOA 3CMGA 1C8XA 4M24A 2O9PA 3IANA 2VCAA 2CBIA 4PCSA 2XSBA 3U7VA 3GBDA 3WMBA 3WDPP 1EA9C 1BYDA 1WPCA 3IK2A 1FHLA 2Z1SA 1RD6A 3OLGA 4CD6A 3N15A 2WCSA 4GI9A 2F2HA 2Q8XA 1Q4NX 1V08A 2E40A 2GK1B 3APGA 1PZ3A 3CUGA 1QPKA 1L0PA 2OWWA 3N11A 1ISVA 3AYSA 2WMIA 3WDRA 1E1EA 3WF3A 1KFWA 4J3VA 1JNDA 3WDIA 3BAKA 2X09A 2EPKX 3W6LA 3IJ8A 1JZ3A 1E72M 3CIVA 3DYMA 1TG7A 5HBFA 1C93A 2YJQA 5E6YA 3BGAA 1V0MA 4P7RA 4QCEA 1FHDA 1C90A 2EPMX 1WDPA 2VNCA 1Y7VA 4LGXA 2BY1A 4N0RA 3VO0A 2BS9A 3CHDA 3S2CA 4B9ZA 4AD1A 1E40A 3AHXA 3ARSA 2Z1KA 2WBGA 3SCUA 4HPHA 1J01A 1HXJA 1W1TA 1NWUA 1BGAA 5CPSA 2D0GA 5FKYA 1E55A 4H8UA 2WC7A 3W29A 2FGZA 1HP5A 3MO4A 3AMGA 2DT0A 2PWFA 2BVYA 1GUVA 1B30A 2G3NA 4W7VA 3ZIZA 2J4GA 5AYBA 4RE4A 1ZJAA 3OB8A 4QLLA 3CUIA 3DC0A 5CPQA 1H5VA 4CD7A 4DUVA 1HVQA 3PZNA 4S3JA 1CGUA 5DT5A 3WH5A 4P7LA 1E3ZA 3CGTA 3WF0A 3T2OA 1OBAA 2ZUTA 1XCXA 3AS0A 2BVDA 1R8LA 2VZOA 2WHMA 4AD4A 5DFAA 5A6BA 4M8UA 4CCDA 4MB1A 3OGVA 4JL2A 2WW5A 4MB5A 2J75A 3WN6A 1KQYA 3MKKA 2UY3A 1UA7A 3W25A 1VBUA 2CXGA 2WM0A 2FHFA 4ZE5A 5A6JA 3BLKA 3SURA 1QBAA 4FLRA 3OZOA 3WNNA 2A3HA 2W61A 1E4NA 3ZM8A 1BF2A 1E4MM 1J9YA 1ECEA 1VEMA 4FLQA 3W28A 2VURA 3SCVA 3WF1A 4XB3A 5BRPA 2CIPA 3WQVA 3NYDA 4KWUA 2ESCA 2JEQA 4MADA 4CU8A 3GXIA 3CZGA 1BPLB 5A2CA 4CVWA 2V3DA 4IPLA 3WL1A 1WB0A 1W9BM 2XPKA 5TD4A 4M80A 2YLLA 4PYSA 3N17A 2EBNA 2EEXA 2GJPA 2X05A 4CGTA 3AZRA 2E9BA 4DWSA 3CTTA 4HA3A 4BQ2A 3OZPA 4AIUA 2XIIA 2E9MA 1EDGA 1JZ7A 4KRUA 1DWFM 4R27A 2V3GA 4W7WA 3M07A 4RE3A 5LYRA 2XYLA 2EQDA 4P8UA 1H49A 3RO8A 5KZ6A 2VX5A 4OOZA 1TMQA 4P8VA 2WKLA 3II1A 4WLCA 4DM2A 5KEZA 3WQWA 6TAAA 3MSDA 4MDOA 3KL3A 1B3XA 1OGGA 3PBGA 1UKOA 3IJ9A 3W26A 1M01A 1WAWA 2YBTA 1EGZA 3BAXA 2CESA 4GZEA 4P7NA 5BYWA 4LX4A 3ARPA 2X8RA 2J7CA 3B9AA 2QMKA 2J78A 2PWHA 1LL4A 4YN5A 1K9DA 3MANA 5CXPA 1PIFA 2PC8A 1Q6CA 3UCQA 4CU6A 1Q6DA 3ARZA 2B31A 1QI3A 1QNRA 2WMHA 3VVGA 3CZKA 5HNNA 4ATDA 4WKFA 2E9LA 1JIBA 3AMCA 3GXMA 4W89A 3VIJA 2VOTA 3PHAA 2IUZA 1DWHM 4B16A 3GNRA 1I1WA 2WLZA 4BCEA 1FP9A 4JCMA 2XFYA 4U5IA 5E0CA 2YIHA 1EOKA 3BMVA 3VGBA 1NQ6A 3QOMA 2XVNA 3RM9A 3W4RA 2E8ZA 2EPNA 5GNXA 1WDQA 2Y4SA 4A3YA 2CKSA 2FH6A 1QI2A 2ZX9A 1C7SA 2XM2A 9CGTA 1M03A 4KH2A 3CBWA 4CN4A 5DT7A 5A1AA 3WD3A 4AISA 4JCLA 1UD2A 1Q6EA 2JIEA 4X0NA 3VIKA 1W9VA 1NARA 4ATWA 5M03A 1BYAA 1VB9A 3CMJA 1GORA 2VRQA 1OSEA 2WVSA 4AD2A 1GQJA 3WNMA 4XV0A 1KGUA 2JF7A 2IXVA 2GFTA 5HPCA 3VIGA 4V28A 2WC3A 2X0HA 1GHRA 1VJZA 3M7SA 2OYKA 4HOXA 3PZTA 3T09A 3SUVA 2WWCA 2VCCA 3VTRA 1HKIA 1MWOA 4FF5A 3QHMA 2W63A 1OB0A 3PZGA 1PX4A 7TAAA 3WFLA 1J0YA 1ZS2A 1CGWA 2J47A 1BVNP 2X0YA 1CWYA 2DEPA 2D20A 1E6SM 4H04A 4HMDA 1MQPA 2D3LA 1GHSA 2FHCA 3G6LA 1J11A 2QLYA 4WJXA 3AISA 2VQTA 1H4PA 1RP8A 2D1ZA 4NRSA 2JF6A 4FK9A 1UYQA 4HMEA 4CUCA 2CBJA 3AHVA 2E8YA 4QAWA 3BAYA 2VR4A 4UFMA 3UERA 1NOWA 2BHYA 4MDPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QI0 A;  3VNY A;  4HMC A;  4CCE A;  3EMQ A;  3WFZ A;  2CPU A;  1XYZ A;  1HIZ A;  3SUU A;  2XFR A;  4QFU A;  1XCW A;  3VMP A;  4GO9 A;  1E15 A;  3L4X A;  1GVI A;  1UKT A;  1WZA A;  4YPJ A;  1DWG M;  3AIU A;  5LA2 A;  3L4U A;  4DUW A;  2BFG A;  1UKQ A;  3WBE A;  1XSI A;  1EQP A;  3A6O A;  3L4W A;  4HA1 A;  1M7X A;  1BHG A;  1HJX A;  3SCR A;  5CLT A;  2DSZ A;  3L4Y A;  3ZMR A;  4PTM A;  3U5U A;  4D6I A;  4KRT A;  1HL9 A;  3IAQ A;  4UNI A;  1M53 A;  1BAG A;  2ZUW A;  4GXP A;  3GZA A;  2VR5 A;  2ZXQ A;  1HJW A;  3WNL A;  4B3L A;  4HU0 A;  4GPN A;  3SEP A;  3F5J A;  1FH7 A;  3BAJ A;  3A4X A;  4YHG A;  4GI6 A;  3WD4 A;  3A4W A;  2Y8K A;  1EHN A;  1VAH A;  1HL8 A;  2W66 A;  1BSI A;  1TVP A;  3WUB A;  2WKG A;  1UD5 A;  2AOS A;  5GNY A;  1WDR A;  3AMK A;  5AY7 A;  2VVS A;  1G1Y A;  4J28 A;  1D2K A;  2YDQ A;  2YL8 A;  4UOJ A;  3SCS A;  2UY5 A;  1NM9 A;  3NDZ A;  4AXN A;  1QW8 A;  2BY3 A;  3K46 A;  2VUY A;  1WZL A;  2OSY A;  4D6H A;  3A3H A;  1B9Z A;  2UWF A;  4M1R A;  1BYC A;  3KL0 A;  5E6Z A;  4UFH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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