4AZ5 | Genus

Total Genus 172

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	172
sequence length	434
structure length	434
Chain Sequence	NEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGWYNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDLNRYTAESVTAVKEAEKAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQETVNNLTLTP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title	Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh. pubmed doi rcsb
source organism	Streptococcus pneumoniae
total genus	172
structure length	434
sequence length	434
ec nomenclature	ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date	2012-06-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00728	Glyco_hydro_20	Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1270.90	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2	AF1782-like	4az5A02
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4az5A01

1J0JA 1C7SA 1E6NA 1ITXA 3W27A 1K9DA 4M29A 3QHMA 3VO0A 3NDZA 1CXKA 3L2LA 4U2YA 5A1AA 1G0CA 2XWDA 2IUZA 3APGA 2WSPA 4J3TA 1JF6A 2G3JA 3SURA 1MFVA 2E8YA 4MNKA 3TONA 1UKPA 1S46A 1BG9A 2WHLA 1UA7A 4KMQA 5ABFB 4HA3A 4HU8A 2X1IA 5BYWA 1KBKA 2YDQA 2J8GA 1UKOA 4EK7A 2VC9A 4BQ3A 1HXJA 1UWQA 2ZX8A 1JD9A 4D71A 3VDBA 1UHVA 3SUWA 3HMCA 2XWEA 1L8NA 1JZ7A 2XFRA 2FH8A 1JDCA 1CXFA 2EXOA 2PB1A 1JG9A 3GH5A 5I24A 1UWIA 5M17A 3GXFA 2PF0A 5CGTA 5CSYA 2Z1SA 4UCFA 3WELA 2G3NA 2ZXAA 2X0HA 1H09A 1MYRA 3A4XA 4TUFA 2XJ7A 1VEMA 2ZWZA 3WD3A 1DWAM 1OGBA 2FDMA 4B3LA 3GDBA 3EMQA 2DSVA 2YKKA 6A3HA 2EEXA 1MW0A 3L4VA 4W7VA 1HNYA 3UEQA 2CBJA 4IUGA 2MANA 1XV8A 4L4PA 1EDQA 2DIEA 3WNMA 4F8XA 1EIBA 3TA9A 5CXPA 3LMYA 3DYPA 3AHYA 2ZUVA 1WAWA 3OZPA 4AIEA 2G41A 1MFUA 2JF6A 5FIPA 3UCQA 2E9LA 2FHBA 4M24A 4U31A 5JUVA 3N18A 3WH7A 3L4UA 5JBFA 3W24A 2JNKA 1J0YA 3A3HA 1HJVA 3MUAA 3PZGA 1MXGA 2JE8A 2VRJA 4AYSA 2C0HA 3L4YA 2VJXA 3A4AA 1GNXA 4RE2A 4F9DA 2E9MA 2EJ1A 2VMFA 4URIA 1E0VA 1DWJM 1CGWA 2J4GA 3SCPA 4S3KA 5A6LA 2X2YA 1VF8A 6TAAA 1CGTA 3VIFA 1GJWA 1GHSA 4HZ6A 1X6LA 3BC9A 1ZJBA 1NWUA 2Y24A 2GSJA 4JL2A 5E70A 3GH7A 4V2XA 3PHAA 2DSKA 2GDVA 7TAAA 4CN6A 4PBGA 5HPOA 4PTVA 2OYKA 1JNDA 2XFFA 3ARZA 3VIIA 3ZT7A 1GQIA 5DMYA 2BHYA 2BS9A 5GQBA 4AEFA 3I3EA 3WENA 4J3WA 1XRVA 1C8YA 4GI9A 3WDPP 1VRXA 4A4AA 4X0VA 2CCRA 1ZBKA 3K46A 1ODZA 3MV11 2CHOA 2A3HA 4MTVA 1IV8A 3NCOA 2CBUA 3BLKA 5FL1A 4U5KA 1E6SM 3ZJ6A 2DGAA 4D6CA 3HJEA 4LYRA 5CGMA 3VD9A 2ZX9A 1KGWA 4PTXA 1GOWA 3AMKA 1KFWA 3PZQA 1XYZA 5I6SA 3ZSSA 5A69A 2XYLA 1HIZA 1PZ2A 1Y7VA 1E4LA 4GQRA 1J0IA 1E9LA 2GVYA 3RMEA 5LA0A 2AOSA 3CO4A 2CESA 2XVGA 1W91A 1E0WA 4UFKA 4JIEA 4W85A 5ABGA 1UWSA 1HL8A 4FLOA 3OBAA 3MO4A 1JDDA 2Z1KA 4BA0A 1W9PA 3EMZA 5EFFA 3TP4A 2XVPA 4ATDA 1K9EA 4LX4A 2PWGA 2VZVA 1TZ7A 5JIPA 3BAJA 4P7QA 3HU7A 3QOKA 4DM2A 1CNVA 4ZENA 5A8OA 2VNCA 3VUPA 1RH9A 2XTKA 1HP5A 3ARTA 3CUIA 2WM0A 5JIWA 1LG1A 3FXYA 1H0IA 1UD4A 5BROA 1D7FA 4EKJA 2ZUWA 3EBVA 1QI5A 1G5AA 3AMLA 4HPGA 4W87A 3WH6A 1EH9A 1J01A 1V0MA 2D2OA 5C70A 1TMQA 2BVYA 3D5HA 2O9PA 4HMDA 2CERA 3W6MA 1UOKA 4GQQA 3SEPA 3PZUA 2J7HA 3AS1A 3WDIA 3VIOA 2F61A 2ZUSA 5LYRA 3N13A 1PX8A 2ZE0A 3VDAA 2OZNB 2WWDA 5LA2A 3SCNA 1VAHA 3BMVA 3OLDA 1AVAA 2WHJA 2HISA 1GQKA 4HU0A 1WP6A 5I23A 5M03A 1C8XA 1LL4A 3AYRA 4V28A 2CITA 3ZSTA 1KGXA 2WVSA 1ZU8A 5CJ5A 3ZMRA 1OT2A 3AIEA 1KCKA 1UKQA 3MANA 1V6VA 1F4HA 4PMUA 4B9YA 1U33A 2YL8A 4HZ7A 1B9ZA 2ZX6A 4YHEA 2VVSA 1JZ4A 1LWJA 1W3LA 2WCSA 3FN9A 3VTRA 1OIMA 1UH2A 4UQBA 3FY1A 3II1A 1D2KA 8A3HA 3VGEA 2UY4A 3CUFA 4J3UA 1FH9A 4H8VA 1NP0A 4FF5A 4PMOA 4CU7A 3KZSA 5D8ZA 2BXZA 1JIBA 2XSAA 3ZR5A 3K8KA 1HKIA 3WF4A 4PMQA 2PWFA 3MUZ1 2BXYA 1MXDA 3BCFA 1UWRA 1Q4NX 1NWRA 1TE1A 2CKSA 3QR3A 1BF2A 3VDHA 2XIIA 4D6EA 4MPKA 2J7CA 3WUGA 4KGJA 5JBEA 1VIWA 4IISA 4OKDA 3WFLA 3RIKA 4AD1A 1W1PA 3VINA 1PEZA 5BXRA 1GOKA 4PSRA 2YIHA 1JGIA 4WK9A 3PZOA 1E3XA 1FP8A 1C7TA 4PCTA 2DH2A 1UR2A 3CZLA 1JYXA 4CU6A 1UWTA 4Z2LA 3VGHA 3VGDA 2DDXA 3AMCA 3N15A 1XHGA 3CPUA 4OUEA 1UR9A 3EDEA 3IK2A 4AISA 2V5DA 2CNCA 4DUWA 1W2VA 4ACYA 1RP8A 1WZKA 1K6AA 4JHOA 3VM7A 4C7FA 3AZRA 1OINA 4PMZA 3BH4A 1WKYA 3TTQA 4XZWA 3WNOA 5FL0A 3SUUA 3M7SA 4GO9A 4FZPA 3QGVA 1UD5A 2QLYA 2XHYA 1CWYA 4NRSA 4RL3A 1CIUA 2ZUNA 1PBGA 2AMGA 4AXNA 4PRWA 3NSXA 5IHRA 4WKAA 1HL9A 2JFEX 4H2CA 4P7OA 1MQPA 2ZICA 5AYBA 5A6SA 1OT1A 3PZMA 5JBDA 4BQ4A 3BAKA 3U57A 1QNPA 2VCBA 1U2YA 1D3CA 1US3A 1W1YA 1DWHM 4JFTA 2IXUA 4WSKA 1GCYA 4M80A 4XX6A 1GW1A 3IJ9A 3QHOA 3W26A 1ODUA 1DEDA 3VD7A 1HP4A 2J7BA 3ARXA 2EPOA 3U7VA 4LQ1A 3AI0A 2JEQA 2WCAA 5A8QA 1LL6A 2PMRA 4JKMA 2O9TA 4A3YA 4W8AA 4CCEA 4FK9A 4TOQA 4DWSC 3UG4A 4CD6A 1BYBA 4IPLA 2J7GA 1E6RA 2YBTA 4AD0A 2CETA 2XPKA 2DT0A 2G8ZA 4P8UA 3WQVA 4H7VA 4J3VA 1F4AA 1TVPA 4PYSA 3SCRA 3G6MA 4W8LA 1LWHA 2VRKA 2WVTA 3WNLA 1G9HA 4LXFA 3SCUA 2GDUA 3ZT5A 5HBFA 4UOQA 2XVKA 4KRUA 3RM9A 3G6LA 1E72M 3AXXA 4UFLA 1R87A 9CGTA 3AHXA 2C7FA 3DYMA 1BYDA 3K4DA 4Z2JA 2A3CA 3WNKA 1PZ3A 2A3EA 1AQMA 4CCDA 4GI8A 4W5UA 3W38A 1E70M 1FHDA 2WYSA 2ZUUA 3VIMA 1WPCA 3PZNA 1R7OA 2E9BA 1RD6A 1XYFA 1QNQA 1LQ0A 4F9JA 2Q8XA 3OZOA 2PI6A 3UETA 5DT7A 3WUEA 2ZIDA 1VFUA 1I1XA 1BVNP 4L4OA 3WL1A 1QI4A 2W67A 4BZYA 1W3JA 1UH3A 3F5KA 4CN1A 2VOTA 4PUDA 1EDGA 1UA3A 5GNXA 1TCMA 3PZIA 2YL5A 1J0HA 3QHNA 3CH9A 2DT2A 1CECA 3ZM8A 2V3DA 1HVQA 2DH3A 3OLIA 1E56A 3VOCA 2V3FA 2E40A 2WMGA 3VMNA 1V03A 1ZBWA 3UR8A 2O92A 3BSGA 1OD0A 4DUXA 1GVYA 2XGBA 2BHZA 4Q7NA 2V38A 3WBEA 2JF7A 3PTMA 4GZEA 3OGRA 5DF0A 2OO2A 3MUY1 1CGYA 2GJRA 3CHFA 1I1WA 3W4RA 5F7UA 1YQ2A 4AZHA 2J7FA 3BMWA 2DSZA 1BFNA 1WO2A 1B0IA 4QLJA 3I3BA 2WK2A 5C71A 1BGGA 2BHUA 2YJQA 3PZTA 3ARPA 5CG0A 1W32A 2E0PA 3DHPA 3WDRA 4UQEA 2WHMA 5HXMA 1BVZA 3OB8A 4U3AA 4AD2A 2VR4A 5E6YA 3KL3A 4OOUA 3ARWA 2FH6A 3WF1A 2BY0A 2EO7A 5A6MA 2WLZA 1JNEA 3HN3A 2EPLX 5A2CA 2VZTA 1WB0A 1B3WA 5E0FA 1EA9C 3IAPA 4UZSA 7A3HA 1SFSA 4PN2A 1RP9A 3VGBA 1C93A 2O9OA 2BVTA 3AHTA 1CXIA 4MB4A 3PTQA 4TXEA 1JFXA 1Q6EA 4CUCA 1CBGA 3PBGA 3ARSA 1KWGA 1VEPA 3K1DA 5HDRA 1V6WA 3T0AA 1BSIA 2EQDA 2XVNA 3W82A 2NT0A 1XSJA 2E4TA 1ISZA 4UQCA 2V3EA 3B9EA 2D23A 4N42A 1E1FA 2RGMA 1PIGA 1JI1A 4GPNA 4UZUA 3WF3A 4MJ4A 1E3ZA 1M01A 3KL5A 4WKFA 1BHGA 1LL7A 4W88A 3M46A 4W89A 1TFVA 3MMWA 4J7RA 1QW8A 4QCEA 2CIPA 3VD5A 3AYSA 3WMSA 1GQJA 4S3JA 5CLTA 1UQYA 1NOFA 4AZBA 3MS8A 4MDPA 4PCSA 4UFJA 3WUBA 3AIVA 4F79A 2OWWA 3WF2A 1W1TA 2XSBA 3VX1A 2WANA 1WZMA 5KEZA 3IAQA 3NJ3A 3WMCA 2A3BA 2XUCA 1E6PA 4UFIA 3VGFA 1QI2A 3U5YA 1P6WA 3CMJA 1UZ4A 2WC4A 4Z2HA 1VFOA 1IZKA 4ML4A 5A6BA 3CZKA 2QPSA 4V27A 4PSPA 5D9NA 5GNZA 1BYAA 4GZIA 3GYCA 1FH7A 1XGZA 1BG4A 2XM2A 1KWKA 1EQCA 1UR8A 2WMJA 1TVNA 4U3CA 3VPLA 1JXJA 3N04A 4AMCA 1X6NA 2OSXA 2WVUA 3ZR6A 5EFDA 4FZOA 5E9AA 2VZOA 2VQUA 4HTYA 1QI0A 1AQ0A 4C7GA 1IT0A 2EPNA 3MUIA 4CU8A 4D6JA 1B31A 3ARYA 2ZUTA 1LG2A 2VQTA 2O9RA 4HOZA 3SCTA 4AEEA 2FGLA 1MWOA 1WDPA 2DT3A 3WQ5A 3WN6A 1XH0A 2D1ZA 4F66A 1XSIA 4MADA 1NOUA 4LGXA 5D4YA 4W5ZA 2XIBA 3T08A 3LPGA 1M53A 1UKSA 3NIYA 4WIWA 3WH5A 1C92A 4KH2A 3VD4A 1GZJA 1V6YA 4XB3A 1C3FA 1VJSA 3WF0A 2BY2A 4TX6A 3EDKA 1UH4A 3VNZA 1FHLA 3D3AA 4RE3A 5E6ZA 3VGGA 4JKLA 4AD5A 1YHTA 2WAGA 5AY7A 2W4XA 5CZKA 3AFBA 5IFTA 3MMDA 3FW6A 1O6IA 3AIQA 1C91A 1V02E 5A6JA 5A2BA 3BGAA 1QHPA 3S2CA 3OLEA 3GXDA 5D9OA 1OBAA 1FA2A 1H2JA 5CPQA 5A94A 4TTGA 4DWSA 1EOMA 4AZGA 1FP9A 3JUGA 3NDYA 3VKKA 1M03A 4ATLA 2OYLA 1R85A 2X05A 1EQPA 1GONA 4P8VA 1GJUA 2WZIA 1WDSA 1QHZA 3RCNA 1SYTA 3MU7A 2WZHA 3OGSA 4U2ZA 1KR1A 3T09A 1V0LA 5ABEA 1GVIA 3UERA 1CGVA 2WMIA 3F5LA 4P7LA 3WQ8A 3CZGA 5BRPA 2BVDA 1QOXA 3F5JA 1E5JA 1BLIA 1NWSA 4GZJA 4HOXA 4M82A 3TTSA 2J8FA 4HMCA 3UR7A 3BCDA 3AISA 5I3DA 3VX0A 2WC7A 3W6LA 3OIHA 2G4FA 3ECQA 2G3IA 4YPJA 3B9AA 1RPKA 3WIJA 3AZTA 3N12A 1HJSA 3DHUA 1R8LA 4UQ9A 4Q22A 1JL8A 1OGGA 5A8PA 2W62A 3AMDA 3NYDA 2ESCA 3EMCA 1UG6A 1BYCA 3CUGA 3N9KA 2GJXA 4D1JA 3AHZA 5IHSA 3AICA 3CHDA 3K4AA 3ARRA 3GNRA 4UOZA 1QW9A 1VB9A 1H11A 1TR1A 4EAMA 2JIEA 4H04A 3WD0A 4B9ZA 4N0RA 2PBOA 1AQHA 3GXIA 3VIKA 3ARQA 2J77A 2NSXA 1MW3A 3OGVA 1B3ZA 1WZAA 4J27A 1OCQA 4KRTA 1MW2A 2VRQA 3AS2A 1HF6A 1OM0A 4FLSA 1J10A 4PMYA 2WBKA 4W7UA 2VO5A 2CXGA 3SCQA 4B3KA 3CZ8A 4HZ8A 3DYOA 4LYPA 5C8BB 5D9MA 1W9XA 3OA5A 4AIOA 4CD8A 3CGTA 2DSWA 2DSUA 5AC5A 1V0NA 1MQQA 3EYPA 3MV01 4BCEA 4W93A 1B30A 2W5FA 3VIPA 4ZE4A 1E4IA 1I75A 1G1YA 1QBBA 1A3HA 4JZ5A 3CBWA 3M07A 2J7DA 1GQLA 5ABHA 2DIJA 4M81A 3F4VA 1CGXA 4CKQA 4E2OA 2FGZA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1RQE A;  4FSA A;  1FVP A;  4D72 A;  3RM4 A;  2VUY A;  5K9D A;  1ZBC A;  3W02 A;  1WDW A;  3AZS A;  4NL1 A;  3PJU A;  4D8Z A;  2OR2 A;  5A8M A;  4J3X A;  4UQA A;  1DKZ A;  4AYG A;  3EAU A;  4HIB A;  1F3T A;  2BDQ A;  3IVT A;  4JFS A;  4HB7 A;  4DJD D;  3O9N A;  1LBM A;  2P5N A;  3TQK A;  3CB8 A;  3UZZ A;  3V16 A;  3D47 A;  3A5F A;  5FI8 A;  4WSJ A;  3LHW A;  2CLP A;  3N14 A;  2WJF A;  4JCL A;  3FLU A;  3ARU A;  2H8Z A;  3PR2 A;  3MWC A;  3GFY A;  5K4Z A;  1V6U A;  4LC6 A;  1I2R A;  2PLM A;  3COT A;  4HN8 A;  4IPN B;  1P0N A;  4HHL A;  1EGZ A;  4JBR A;  3H2M A;  4I8D A;  3P62 A;  4R5J A;  3GI7 A;  2JAL A;  1QUM A;  1B3X A;  3LPP A;  3DFY A;  3MBF A;  4F0R A;  3NPW A;  3QQ1 A;  2G3M A;  2AMX A;  4WR3 A;  1W5M A;  1VJI A;  2Q3O A;  1XF0 A;  1QAP A;  5F4W A;  4P8X A;  3DFO A;  2D20 A;  4Q4M A;  1HJX A;  4IF2 A;  2YIA A;  1Z32 X;  3W28 A;  1Q6R A;  3FFS A;  1JUK A;  1EDT A;  3EXR A;  5EMM A;  4S38 A;  4G8T A;  1EP1 A;  3MCM A;  3I6E A;  3WQE A;  4M0M A;  4DM1 A;  3K8L A;  4NF7 A;  2Q01 A;  3DG6 A;  3BLO A;  5AC4 A;  1ISY A;  4IM0 A;  1D8C A;  5JMU A;  4Z1B A;  3LS9 A;  3GFX A;  2A4A A;  4J40 A;  3D46 A;  2YYU A;  1K4H A;  3A6O A;  2WMH A;  4YHG A;  3G1A A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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4AZ5A

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