4AZ7A

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
433
structure length
433
Chain Sequence
NEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGWYNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDLNRYTAESVTAVKEAEKAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQETVNNLTLT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 171
structure length 433
sequence length 433
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4az7A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4az7A01
3IAPA 3PZOA 1OT2A 2G4FA 3IJ9A 3WNNA 2VO5A 1ZU8A 3GBDA 2BHUA 3CLWA 3UERA 2YBTA 1XH1A 3W53A 3L2LA 4JFTA 1PZ3A 1QHOA 5BRQA 4PMYA 3CZGA 2BV9A 5ABEA 3K8LA 1J0IA 3FY1A 2DEPA 1LL4A 1IZKA 1YQ2A 5AYBA 2CHOA 1OBAA 3K4DA 5M17A 3W4RA 4W7WA 4MB5A 1JG9A 3CIVA 2UY2A 3W81A 2D22A 3ZT6A 4Z2JA 3W24A 5A6BA 5CLTA 5CQ1A 3TTQA 2GVYA 4WKAA 4XB3A 2W67A 4FF5A 4GZIA 1DTUA 5BYWA 1CLXA 2WC4A 3JUGA 2Y8KA 1CXKA 1EIBA 1ZJAA 1J9YA 5I79A 4X0NA 3GXMA 2E8YA 4DWSD 3WF1A 1E3ZA 5JBDA 1C7TA 1TMQA 1HVXA 2RGLA 8CGTA 2JALA 2WVVB 2CHNA 1JZ4A 3T2QA 1CGVA 1DWHM 1VFFA 3MKKA 1BYCA 1ITCA 1IV8A 3I3DA 1MQPA 3THDA 2O9RA 4W84A 3GM8A 1WZKA 1JZ5A 1KR0A 3N15A 4J3UA 4B3LA 1E40A 1JDDA 3PTMA 3PZTA 2V3GA 4PTVA 3VGEA 1VF8A 1K9EA 1OIFA 4P8XA 1UD8A 1MWOA 1KBKA 4GZJA 3LPFA 1V3IA 4RE3A 4F79A 4NI3A 3CUGA 1M53A 1BG4A 4R5EA 1ISVA 2AOSA 3VIPA 2FH6A 3EDJA 2A3BA 1OD8A 3GXIA 1I1XA 5HPCA 1DEDA 1JZ2A 1GONA 1BAGA 3WEMA 4OIFA 1G9HA 3ZIZA 2HVMA 3N11A 1ISWA 2F61A 2EO7A 3VILA 3ARTA 2OSXA 4MNMA 1E56A 4FMVA 3MV11 2WANA 4F8XA 1OWQA 4H2CA 4PCSA 3WDQA 2CITA 1BQCA 5FOOA 3U5YA 1EDTA 1DHKA 2WHMA 1XSJA 2EPNA 4J3XA 2OZNB 2QHAA 5LYRA 1JYWA 3ZO9A 5D9OA 1HX0A 2WCSA 3MO4A 1FH9A 2VZSA 1PX8A 3RM9A 3WNMA 3DYOA 1Q4NX 1XH0A 2XJ7A 3N9KA 5FD0A 4KGJA 1A3HA 1CDGA 4MJ4A 2BHYA 2BVDA 4EAMA 1KGUA 5HNNA 5A6BD 5EMYA 3VGBA 4CD5A 3M7SA 1QPKA 3QOKA 4AEEA 4L4OA 1XSIA 2WWDA 5CZKA 1HT6A 3VD3A 4CUCA 2ZUWA 4J28A 4W5ZA 5DEZA 1JFXA 3ZMRA 1WE5A 4GXPA 2OYLA 1L0PA 3GZAA 4NRSA 1EHAA 3WBEA 1M03A 4AC1X 2BY0A 3RIKA 1XH2A 2JFEX 3PTQA 4EE9A 4AIUA 4LYRA 4PTWA 1V6YA 1W3JA 3ARPA 4TVUA 2XVLA 3AXIA 3W27A 2EQDA 4GINA 1RPKA 3BC9A 4BQ2A 5ABFB 2VZUA 3MMWA 4U2ZA 1GVYA 1UWQA 3WNPA 3N12A 4MTVA 5A8PA 2BFGA 4OOZA 4GQRA 1J11A 4DUXA 3M46A 3AIBA 4D6GA 5ABGA 3GDBA 2W63A 4ZEPA 3CZKA 1V3MA 7CGTA 4BS0A 4LGXA 1ITXA 3VD9A 2VT0A 4NRRA 2WLYA 3N1AA 4JKMA 3CTTA 1CGXA 4W88A 3N04A 1BYDA 3THCA 3TTOA 4BF7A 3W6MA 1W9UA 1E4IA 4U5KA 5A8NA 3A4XA 4UQ9A 3WSUA 3O2LA 3MUIA 2BNJA 4QLLA 1WDRA 3NSNA 1UR4A 1WDSA 4URIA 3A47A 4H04A 1E43A 1E6PA 1QNRA 6CGTA 4Z2KA 2BS9A 2J25A 2WBGA 3ZR5A 2VZVA 5JIWA 3WQ6A 3CZEA 2W91A 3GXFA 2XTKA 5DT7A 1NWUA 2NT0A 2Y5EA 3A3HA 2FHBA 4AD4A 1UD4A 2CKRA 2WZIA 4CD7A 2D1ZA 1EDGA 3WQVA 1GVIA 2C0HA 2XHYA 1DWAM 3FHAA 5E9AA 5GNYA 1G5AA 2J7FA 1WPCA 2VX5A 2J74A 1H5VA 2V38A 1W9VA 1GOMA 1WZMA 2ZIDA 3E1F1 3A6OA 1R7AA 3HJEA 5IHRA 4UQDA 3VPLA 1JZ3A 1UWSA 4AYSA 1LF1A 1DWFM 8A3HA 1UR0A 2WHJA 1W3LA 1NWSA 2A3EA 2X2YA 2NT1A 4IPLA 5ABFA 4TVCA 2WNWA 1H0GA 3BGAA 1OSEA 4QDMA 2ZXDA 4HA3A 4P8WA 3T2PA 2CBIA 2VURA 1I1WA 2WSKA 2PBGA 2JIWA 3FAXA 3NSXA 1GOQA 2VX7A 5HBFA 1UKQA 5C71A 4OZOA 1CGTA 1HKKA 4PSRA 3SCSA 3OLGA 1LJYA 4D6IA 1JD7A 4Z2HA 3RMEA 4PMUA 1ISXA 1V08A 1RP9A 4IPNB 3AOFA 4MB4A 2G3IA 5HXMA 3CHFA 3L4XA 3KL3A 3SIMA 3G6MA 4FZOA 1HIZA 2FH8A 1W1VA 1LG1A 1CENA 3CUFA 4XV0A 4DUWA 5A8QA 4JIEA 1XV8A 3POHA 4PRWA 2JEPA 3WMBA 2W5FA 1CZ1A 3AIWA 1JYXA 2CKSA 3UEQA 1IT0A 4HMEA 3LMYA 4GIAA 2XSBA 4EKJA 3HMCA 1PIGA 1VJZA 1GCYA 1QHPA 3ZT7A 1JZ7A 3SURA 3AZRA 3AS1A 5JBFA 4UFHA 3OBAA 5DMYA 1ODUA 3NDYA 2XUCA 2WM0A 2XFYA 4GQQA 1OIMA 4A4AA 1DWJM 1XHGA 2AAAA 3EDKA 2XFFA 4UR9A 1R86A 3VDAA 1V3HA 3TOPA 4MNKA 1TVPA 2VR4A 1K9TA 3EMQA 3RM8A 1QBBA 1J0KA 2V5CA 3WH5A 4AISA 3PZIA 1QI0A 4W8AA 1UOKA 1J01A 4U33A 2OYMA 1MFUA 2DSUA 1E3XA 1PX4A 4N42A 1VRXA 5CGTA 1MW1A 2UY5A 1PIFA 2X1IA 1B3YA 1HNYA 1E4NA 2GDUA 2YA0A 3F5LA 1UR8A 3HN3A 3WH7A 4UZSA 3WD4A 4CU8A 2YDQA 1E6RA 1NQ6A 4D72A 4GKLA 1UH3A 5A94A 5EFFA 3L4YA 4JHZA 2EEXA 3ARSA 2CYGA 3A4AA 3LPGA 3W0KA 2WC7A 3AHTA 2WMFA 2XVGA 4LYPA 2FDMA 1NOFA 2WCAA 4UOZA 4P7NA 3GH7A 1G01A 3CZLA 2WSPA 2A3AA 3CHEA 5D8ZA 2V3DA 2ZXAA 4M80A 4YHGA 2ZX5A 4D1JA 4CD8A 3L2MA 1J0JA 1C7SA 2D3NA 4BQ5A 2DGAA 1TUXA 2JF7A 1Q6GA 2VX6A 5GPRA 4MPKA 2VX4A 3U5UA 2PWEA 2WMIB 4M8UA 3AISA 1PAMA 4BQ3A 2VI0A 1F4AA 2Y8VA 4QLJA 1V3LA 3W28A 5I2UA 3TA9A 3WF2A 4UQAA 4CN6A 4RE2A 3WDJA 3WDHA 4GI6A 4PBGA 3WH9A 3MV01 4K68A 3BCFA 3T0AA 3AYSA 2C8NA 2XVPA 1W3KA 1BGGA 3VDHA 1BFNA 2J7CA 3BAIA 3CHCA 4U3AA 2DSVA 1XCXA 1PJ9A 2PWDA 1G94A 3NYDA 3ZJ6A 1CIUA 3AROA 1VFOA 1OB0A 5A8MA 4E4PA 1E5NA 1UYQA 4AZ7A 2DT1A 1KGXA 5FCZA 5HOSA 3TTSA 3W25A 4AD3A 3FHQA 1FH7A 1ODZA 2YOCA 4XZWA 2VVSA 4OUEA 2V3EA 3OGVA 4PTXA 4H8UA 4YHEA 1RH9A 1C91A 2GJXA 1PEZA 2BY3A 5CGMA 1WO2A 1BVZA 4V28A 2XG9A 1B3VA 2ZUUA 4UFMA 3GNRA 1HJVA 1V0MA 2VL4A 4HU8A 3SCTA 9CGTA 2ZXBA 3BMWA 3N18A 5BXPA 3VDBA 5LA2A 1H49A 3I3BA 2VCAA 4AD2A 2ZOXA 5E70A 2WYSA 1CLVA 3M07A 1B3WA 4ZENA 2YL9A 1MFVA 3EMZA 3AHYA 4TX8A 5A69A 4D6FA 2PI6A 5A1AA 3OZPA 1US2A 3WENA 2OYKA 5E6ZA 1GNXA 1VEPA 1E5JA 4HA4A 3NUKA 1W9XA 5I5RA 3T0BA 3UETA 2BVTA 2O9TA 1JL8A 3K8KA 2D0FA 4N0RA 3ARRA 2GJPA 1E70M 1SMAA 3WF3A 1SYTA 4AIOA 1KCLA 1ZJBA 1NP0A 4B9YA 3TONA 4MB3A 1PBGA 3KL0A 1WDPA 1EQCA 3GXDA 3SCQA 2DSKA 3VVGA 2UY4A 1C93A 3SCNA 5LA1A 1KWGA 5AC5A 2JNKA 3SUWA 1NOUA 2JF6A 3VGDA 2WC3A 4H8VA 4MB1A 3ZSSA 1H11A 3MS8A 4LPCA 4RL3A 2O92A 3L4UA 2OWWA 3SUUA 5DFAA 1UA3A 4H41A 3T08A 2XWEA 4ACYA 3VX0A 2CNCA 4BQ4A 1CXFA 5TD4A 4PN2A 5I78A 1GHRA 3VM5A 5CG0A 1PPIA 3SCWA 2VTFA 4DUVA 3VIJA 3DYPA 3WD3A 2XM2A 3K8MA 3RJYA 4UNIA 1D3CA 5D8WA 2J8FA 4P7RA 1U33A 3WQWA 4Y7EA 1Y7VA 1V3KA 4DM1A 1HVQA 1JAKA 4PMOA 2EBNA 3AXHA 4PCTA 4JKKA 4JAWA 1HJSA 4ATLA 1C8YA 3UR8A 1GOWA 2WHLA 4HZ7A 3RILA 4WKFA 4J3WA 4L4PA 1OM0A 1GPFA 2GK1B 3OZOA 2XVKA 1B3XA 2X05A 1HJQA 3WDRA 2Z1KA 4NZCA 1V0LA 2XIBA 1UKTA 4WKHA 4PUEA 3T0DA 4H7VA 4UCFA 1E1FA 2V3FA 2PBOA 1FHLA 1VJSA 4XZBA 4BA0A 1E6SM 3GTNA 3FN9A 1UKPA 1V0NA 3VTRA 4HMCA 1H4PA 2WVVA 3ARZA 1C8XA 4EANA 5BROA 4JCLA 1S46A 3WELA 4TVDA 3WH6A 2J78A 2DPEA 3UG3A 1H41A 1MW2A 5AY7A 3BXWA 2QF8A 1X6LA 1W9DM 1E6QM 1HKIA 3AI0A 2GSJA 5I6SA 3RDKA 1QBAA 1E0VA 4PMQA 1LL6A 4U31A 2WPGA 2ZUVA 4KGLA 5CJ5A 4YPJA 3MUZ1 3PHAA 1VFUA 5GNXA 3W38A 2G3NA 1J0YA 1BTCA 1JNDA 2BY2A 4W8BA 4MAZA 1C8QA 2VOTA 3MUAA 1XYZA 2PF0A 3D3AA 1E15A 2YL6A 2NW0A 3CMGA 4M82A 3VNYA 1MW0A 1GQLA 3CPUA 2YLLA 1VAHA 4TXEA 1D2KA 4LX4A 4AW7A 2J79A 1H2JA 2Y2WA 2ZXQA 5I23A 3POCA 4CN1A 1RD6A 5E0FA 1NM9A 4HMDA 3SCUA 5A6JA 3WUEA 1FH8A 2E9BA 3B9EA 2ZWZA 3WD0A 5I0DA 3PZMA 4QP0A 2ZUSA 4CKQA 3I3EA 4WF7A 1DP0A 4CCEA 3OLEA 4AD0A 2XGBA 2IUZA 1E4LA 1W32A 4EK7A 3EDDA 4WSJA 2A3HA 2FHCA 1VFMA 3WFLA 1GQKA 5IDIA 3WDIA 4PMVA 2TAAA 1DWIM 3ALGA 1GQJA 2WZEA 4AZ6A 1ESWA 1B2YA 4JZ5A 3WEZA 3GYCA 3VM7A 1JXJA 4Z2GA 2VCBA 5D9MA 2D23A 4CU7A 5CPTA 3CBWA 2DSWA 4P7OA 4AWEA 4X0VA 1BHGA 1AQMA 1B0IA 3T09A 3MSDA 4PMZA 2WXDM 4HZ6A 1NWTA 2BXZA 3B9DA 1NP2A 3ZJKA 4GO8A 4ZE5A 1PZ2A 1HKJA 1GOIA 2ZX7A 1TZ7A 3A4WA 1KQZA 1V6UA 1GHSA 3OLIA 4JCMA 1B9ZA 3ARXA 2JIEA 5F7UA 4MNJA 3ZJ8A 1ZS2A 3WUGA 1E73M 3CZJA 1JFHA 2WCGA 4W85A 2QMKA 4PEEA 4CD6A 1H1NA 4DWSC 4UFIA 1HJUA 3ZM8A 4XX6A 1GUVA 3ARUA 1JXKA 3BLKA 1ISZA 4X9YA 2WBKA 4AIEA 1EHNA 2DT2A 3WKZA 2WHKA 2HISA 3BCDA 1CPUA 1UD5A 1JAEA 3WNKA 3SUSA 5A95A 4CD4A 4PMNA 3AHZA 1ECEA 1UZ1A 1QW8A 4AZCB 3AIRA 4QLKA 2VRJA 2E40A 5GNZA 3OIHA 3BAYA 1K9DA 4JHOA 1EA9C 1HJWA 4P8UA 2YKKA 2W66A 1J12A 3GH5A 3OB8A 3AHXA 4AZIA 2X8RA 3QHMA 1C92A 4TTUA 1W9PA 1IZJA 4UQCA 4S3JA 3AMKA 1CXHA 5CLWA 3ARVA 2J75A 2DT3A 4ZFMA 1AQHA 1DWGM 1H3GA 1FFRA 1CGWA 4FLSA 1KQYA 5EB8A 1EXPA 5ABHA 3ARQA 2ZX8A 2GUYA 1EGZA 3WL1A 1W1YA 4Q22A 4PSPA 2A3CA 2W4XA 1KXVA 3ZR6A 1CWYA 3PZGA 2XGIA 1LWHA 2J4GA 4MAVA 1JYVA 4OOUA 1Q6DA 1XC6A 2ZUNA 1UHVA 2D0HA 4HP5A 1GOKA 3VKKA 3DECA 1CECA 1LQ0A 2Y4SA 1WZAA 3VGGA 2J7BA 3AFBA 1KB3A 1H0IA 3AHVA 3OGRA 3UG5A 3WH8A 1BVNP 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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