4AZBA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
425
structure length
408
Chain Sequence
NEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGGGNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 154
structure length 408
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azbA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azbA01
1B31A 3IJ8A 1DEDA 1XYZA 4PEEA 1DWFM 1UD8A 3G6MA 1JDAA 1QVBA 1H4PA 3VMNA 4OIFA 4AD2A 4ZXOA 1IZJA 4MAZA 4NZCA 2YDQA 2X0HA 3CUFA 4CCCA 2WXDM 2BVYA 2VCBA 1ZBKA 4RE4A 2YL5A 3ARYA 3K4AA 5IFPA 1BYAA 1DWAM 3QHNA 2DH3A 1F4HA 2UY3A 4FLOA 1XSIA 1K9TA 2VZSA 5KZ6A 5DFAA 1E6QM 3A6OA 4CCEA 3AHTA 2ZX5A 1UH3A 1DP0A 3VX1A 2WLZA 3W6MA 1TG7A 4GIAA 2WMGA 2VVSA 1HIZA 1Z32X 4XZBA 3WF4A 1Q6EA 3WD1A 2Y5EA 4Z2KA 2FHFA 1E4NA 4FF5A 5FCZA 2WCGA 1I1XA 2XFRA 4W85A 5I3DA 3AYSA 3T09A 1G01A 2X1IA 3AMCA 3AS0A 1H0GA 2D3LA 2VJXA 3B9DA 2YL8A 2PWFA 2GDUA 3ARQA 1HP5A 1G9HA 1JXKA 3W4RA 5I79A 1B1YA 1UA3A 4CVWA 3ALFA 1E0WA 2QLYA 3QHMA 4WKHA 1MFVA 4WIWA 4AZCA 5FIPA 2VR4A 1EIBA 4L4OA 5TD4A 3WH5A 5DMYA 4S3JA 3QOKA 3BAYA 4J28A 4CN1A 3MO4A 4CN4A 1WPCA 3AIUA 1K9FA 4D6CA 4PTMA 1QI3A 1UWTA 5GNZA 2Y8VA 2OZNB 2JEPA 2OYLA 1KQYA 4J3UA 3K8KA 3SCNA 2WHMA 2OYMA 4W89A 1EGZA 4D6IA 2VR5A 2XYLA 4U5IA 3U5YA 1CDGA 3LPFA 2EPOA 1FOBA 3CGTA 5I6SA 4MDPA 3CZJA 1Q4NX 2V3EA 4Z2JA 1EOKA 2WYSA 3M46A 5M5DA 5ABFA 3CUHA 4GO9A 2XVGA 1EDGA 4OKDA 1E4IA 1E3XA 1FHDA 5EB8A 3GXFA 3UG5A 3NDZA 3OGVA 3ZR6A 2PWGA 1HVXA 2E9LA 1WKYA 4DWSD 4J27A 3SUTA 4JFTA 2BY2A 1TUXA 3LPOA 4ZFMA 3S2CA 3ARZA 3A3HA 3WMBA 3N17A 4JFSA 1OIMA 4AISA 3BGAA 1QBAA 4AC1X 5E70A 2CPUA 1BGGA 4AIOA 4P7NA 3BXWA 3EBVA 3I3BA 1DWJM 2BXYA 5KEZA 5DF0A 4GPNA 5HPCA 1GCYA 1KXVA 2NT0A 3SURA 1E72M 4V28A 2WCSA 4AYSA 3FW6A 2PMRA 2FGZA 3BAJA 3GH7A 3ARSA 1UH2A 3W29A 4AZCB 2XTKA 3A4WA 4QLJA 2A3CA 2XJ7A 3CPUA 4PSRA 3PTKA 4LQ1A 2ZUTA 3NUKA 2ZXAA 1BQCA 1GW1A 1PIGA 1J0KA 1M53A 1MW2A 2ZUUA 1WB0A 1FFRA 4C7GA 5A6AA 4MJ2A 4BQ4A 2E9MA 2O9PA 1OINA 2WSPA 1J0HA 1CWYA 3K1DA 1VF8A 1OD8A 2VCAA 3EYPA 3VDCA 1E3ZA 4GZIA 2DIEA 5A2BA 1PJ9A 3LPGA 3RPMA 2VQUA 2WVSA 1GONA 2VVNA 5D9OA 1YHTA 2WVTA 5I0DA 1QPKA 2ZX7A 5ABFB 1AVAA 3T2QA 4CVUA 4UOZA 4MB4A 3UERA 2E3ZA 2JE8A 3FY1A 4FK9A 3TTSA 3AJ7A 2VL4A 3WNPA 3VKKA 1H0IA 4ZE4A 1TFVA 2DSWA 3GTNA 4AMCA 4XV0A 2YBUA 1Q6DA 4JL1A 2PWDA 3WDRA 3GH4A 4ATWA 3MU7A 2FH8A 1LQ0A 4MTVA 2VMFA 3BLPX 4MADA 3CLWA 3VTRA 2ZUWA 1UKOA 2VZUA 1JI1A 1X6NA 4P8XA 1U2YA 3MUIA 3UEQA 4PN2A 4J3TA 1QI0A 1HJQA 4FLSA 1MYRA 1VENA 3GH5A 5A6LA 2WWDA 3AIQA 1MW3A 2ZX8A 3NYDA 1UD2A 2VRQA 4X0NA 2C0HA 3T2PA 2W66A 4D6JA 1GORA 2YLLA 2V3FA 4PMDA 1UR1A 4HZ7A 4W7VA 1EQPA 1KQZA 4D72A 4GXPA 1AMYA 1V3KA 1J0JA 1CXLA 1UH4A 1E9LA 1JI2A 4HMEA 1US3A 2G3MA 4PMNA 4WJXA 4NF7A 4IPLA 1KWKA 3AIVA 4A3YA 1J01A 1W9DM 3M07A 5A69A 2WWCA 1BFNA 4MNMA 1EHAA 1L8NA 5A8OA 2CERA 3RIKA 1PAMA 4LYPA 1NOWA 1XH1A 3CUIA 5D8WA 2WHJA 3N04A 3VGEA 5D8ZA 2BVTA 3AXHA 3CHEA 4B16A 3WL1A 3FHQA 3NJ3A 3WNOA 3FXYA 5BXPA 2W4XA 3WUBA 4PYSA 4PMZA 3WF3A 3CZLA 4UFJA 3DC0A 1HJSA 1EO5A 3TTYA 2Y24A 4UQ9A 3EDFA 4MNJA 1HT6A 1BLIA 1QHZA 4XZWA 3M6DA 1QW9A 3WEOA 1VFMA 4KRUA 4PUDA 3GM8A 4CU6A 2O9TA 3N15A 3II1A 3ZJKA 1K6AA 2EPLX 2BY1A 4AEEA 1RP8A 3AYRA 1YQ2A 3VDBA 4E8DA 2W61A 4LGXA 4J3XA 1A47A 1MQPA 1CYGA 1ODUA 4U3CA 4AW7A 2RGMA 4HPHA 1K9DA 2ZUSA 1PX8A 1KGUA 1AQMA 3OGSA 1B3WA 3BC9A 2PBOA 3GYCA 1BTCA 1W3LA 1EXPA 3AMLA 3WY1A 4GKLA 4URIA 1AQ0A 9CGTA 5I5RA 2VT0A 4JFUA 4E4PA 1DWIM 1IV8A 1JZ5A 1X1NA 1VBRA 1JFHA 2ZXQA 1NWSA 1V08A 3CZGA 3WUEA 4W93A 1JZ3A 1KGXA 4W86A 4P7OA 3OLIA 3SUSA 1NH6A 1ZBVA 2D24A 1CEOA 3AS1A 5AC5A 4UOQA 1AQHA 3T08A 2GUYA 1NM9A 1NWUA 4KWUA 5AY7A 1J10A 2PB1A 3WKZA 2DGAA 2X8RA 1W32A 1TCMA 2PI6A 1LG2A 4U2YA 4QCEA 2F8QA 3ZT7A 2DT3A 3EDJA 3LPPA 4H2CA 3SCUA 1OB0A 4NI3A 1ESWA 2D20A 3CH9A 1OWQA 4V2XA 3NCOA 4JFVA 3IJ7A 2EBNA 3VILA 5AC4A 2VQTA 1WP6A 3AICA 3B9EA 4JCMA 4DUVA 1H2JA 5CLTA 3WNKA 1OT2A 4HTYA 1K9EA 1GJWA 1BYDA 3PZOA 1QI4A 2WC7A 3WENA 4BS0A 3QOMA 4H41A 4OBSA 5ABGA 5CSUA 2JALA 2VI0A 4IISA 1EHNA 1VB9A 1HKMA 3NSNA 1KB3A 2Y4SA 3W28A 3UESA 5HPOA 5EFDA 5JBEA 4D71A 2G8ZA 4D6GA 1OGGA 2VUYA 5CZKA 1F4AA 1CBGA 4EK7A 3L2LA 4UZUA 1WDQA 3FN9A 2QMJA 4UOJA 3VDHA 1FH8A 2CKRA 1BGAA 1SMDA 3OLDA 3BSGA 3ZSTA 2V5DA 5BRPA 5HBFA 5I78A 5IDIA 1W9XA 1C90A 2WPGA 4HMCA 1NP0A 3WDQA 1EOMA 3WNLA 4WKFA 3CUGA 1ZBCA 2XPKA 2OSYA 4CD4A 1GOWA 5A95A 1NP2A 1KGWA 4JKMA 2XWEA 1CGUA 2FGLA 3AMDA 2X0YA 1ZBWA 4HA3A 1CXHA 1EH9A 2CXGA 3PZNA 4AIUA 2XIIA 1CPUA 2GJXA 3THCA 2E8ZA 3CHCA 2YDSA 5E9AA 5D9NA 1SMAA 3ZQ9A 5EMYA 4ZEPA 2WLYA 1H09A 4K68A 2OO2A 1UQZA 4W87A 2OWXA 2CYGA 7TAAA 3IAPA 5CPSA 2QMKA 5A3HA 3T2OA 4PUEA 3PTMA 3TA9A 3CUJA 5I2UA 5A6BD 4H04A 4HOXA 1KR1A 4JHZA 4AD3A 2WVUA 1IT0A 2YA0A 4ATDA 4GQRA 3T0BA 5C8BB 2CEQA 3PZTA 1QHOA 3EMCA 1PIFA 2GJPA 1JIBA 1OM0A 4KMQA 2XVKA 2V5CA 4TX8A 5DO8A 4GZJA 1HKKA 5IFTA 3QGVA 3AIBA 3PZIA 5DEZA 4HZ8A 3FHAA 2D0GA 3WUFA 3ARVA 1U33A 2WZIA 1GOQA 3WD2A 2J75A 1JYVA 5CQ1A 1GZJA 2VZVA 4QLKA 4F66A 3RCNA 1XSJA 3GDBA 1E40A 2VX5A 1V6UA 5A8MA 4JZ5A 2XHYA 2GJXB 4PMOA 3AHXA 3AMGA 3SCQA 3G6LA 3VNZA 3ZJ6A 4HOZA 3PN8A 4S3KA 1H3GA 4MB3A 1GPFA 1L0PA 3IJ9A 4LYQA 4HA4A 2JFEX 4ZENA 2F2HA 1CENA 2DQXA 1VEOA 1UD4A 4TX6A 3VD9A 3K46A 5CPTA 2D2OA 1TR1A 3AOFA 2XG9A 2D0FA 4Z2LA 2WVVA 1GQJA 1PZ2A 2E40A 1MXGA 2PWHA 1ISWA 3KEHA 1JL8A 1GNXA 2WMKA 3M7SA 5IHSA 1WNOA 1Q6CA 1C7SA 1JZ2A 4Z2GA 5A94A 4UFIA 3AZTA 3WEMA 3DYOA 2GSJA 5D9MA 2ZX9A 3W24A 3BLKA 1TMQA 3W25A 5FOOA 4AD4A 1MW0A 4CU7A 3IK2A 3CZKA 4GI8A 5A6SA 2WBKA 1ISVA 3RO8A 1JYWA 1R85A 4P7LA 4AWEA 3DHPA 3WNNA 3VOCA 3AS2A 5A8QA 4ACZA 3GXDA 1XCXA 2IUZA 1H41A 4H7VA 1XH0A 4OUEA 3K4DA 4Q7NA 4PTWA 1HF6A 1ISXA 2YL9A 4UQBA 1PX4A 3MUZ1 4AZ6A 1ZS2A 4TTGA 4W7WA 4TOQA 2ESCA 1HN1A 3ARPA 1XCWA 1G5AA 3BMVA 3PZMA 3WFLA 1C8QA 4M1RA 3CBWA 5JUVA 2XWDA 4DM2A 1WZLA 3THDA 7A3HA 4R5EA 3LMYA 4FLQA 1GUVA 1VFOA 5I24A 3VU2A 1J0IA 5CG0A 2WVVB 1UD6A 1GOOA 1EDTA 3K8MA 4X9YA 1WZAA 3WSUA 4WF7A 5JBFA 3GXMA 1Q6FA 3CTTA 1XV8A 3WBEA 1MFUA 3D5HA 2GJRA 2E4TA 3W81A 2JNKA 1H1NA 2ZWYA 2ZWZA 4OZOA 3TONA 3OLGA 3VGHA 4F79A 3CZ8A 3WF0A 2J8FA 4JHOA 3L4ZA 3L4TA 3CHFA 2CHOA 1IZKA 4HP5A 1G1YA 3O6AA 3EDKA 1UR0A 3PZQA 5BYWA 3SUUA 2XFYA 2A3EA 4ACZB 1V02E 1SR0A 3BSHA 1I75A 3ZT6A 5DT7A 4AD5A 3VGFA 3TP4A 5LA1A 5CSYA 1LL4A 4DWSA 3AROA 3MMDA 5E0CA 2VZTA 2J7BA 1O6IA 1JFXA 4P8UA 2A3BA 2CIPA 1HL9A 1UKQA 1HP4A 3SCOA 4MNKA 3U7VA 4EE9A 3RM8A 2D1ZA 3W27A 3AHVA 3WQ6A 3W0KA 4LYRA 2AMGA 1CGVA 5GNYA 1QNQA 2DPEA 2WNWA 1FHLA 1KXQA 2XM2A 1JZ6A 1OSEA 1LWJA 4GINA 2J7HA 4XUYA 4WK9A 3VO0A 1MW1A 3O9NA 2J79A 7CGTA 4B9YA 4AY1A 4TTUA 4H8UA 1MWOA 3WDPP 3MUAA 1VEMA 4W5ZA 3N9KA 2PC8A 2BFGA 3MSDA 5A2AA 1XGZA 4E2OA 1BYCA 2UY2A 1H11A 2EQDA 4P7QA 1V02A 2DIJA 1HX0A 2DEPA 5M03A 1E70M 1CECA 4UFLA 1E5JA 1M04A 4N42A 3VIPA 3AHYA 1JNEA 3ARRA 3RJYA 3ZO9A 2Z1SA 2V3DA 1EA9C 3VMPA 2ZXDA 3CMGA 1W1TA 4C7DA 1R86A 1WE5A 2XUCA 1KCKA 5A6JA 2C8NA 2OWCA 2XVLA 3F5KA 2WSKA 4DWSB 1HXJA 3VDAA 3ARUA 3OA5A 1KXTA 3D3AA 1E4MM 2CCRA 1W3KA 1XD0A 3POCA 5LA2A 1BHGA 1RH9A 2WMIA 3VGGA 4WSJA 1W1VA 2XVNA 3OLEA 4JCLA 5BCAA 1GJUA 2FDMA 1V6YA 3PZ9A 3SUWA 2QHAA 1KFWA 5JBDA 1ISYA 1DWHM 4UQDA 1A3HA 4A3HA 3QHOA 1PPIA 2C7FA 1KWGA 3WH7A 3VGDA 1U30A 2J78A 1B30A 2VX7A 2W91A 6A3HA 1MVYA 3L4VA 4F8XA 3N18A 1I1WA 1ZB5A 4RL3A 1JD9A 1FA2A 4W7UA 3DECA 4YHGA 3ARTA 1W3JA 1UWUA 3F5LA 5BWFA 4XB3A 4A4AA 2ZICA 3TTQA 2XFFA 1JAKA 3AZSA 3VX0A 3UCQA 2GVYA 1UWQA 2VTFA 1UR4A 1B3ZA 5HXMA 1NARA 1VEPA 3WH9A 3VM7A 2G4FA 2W62A 3VD7A 3L4UA 1GVIA 2X2YA 4PMRA 5IHRA 1QOXA 3W26A 5A6MA 1DHKA 3UETA 1V6WA 5EFFA 1E55A 1Y7VA 1BG4A 1PEZA 1TA3A 1M01A 3NSXA 2WMIB 1UQYA 3HJEA 4M80A 3W37A 1X6LA 2OWWA 1B2YA 2OSXA 4UZSA 4FZPA 4WSKA 3L4WA 4M29A 1M03A 2VC9A 2G3NA 3PBGA 4W5UA 5GPRA 2YJQA 1CXFA 4M24A 4HA1A 1HJVA 4ZE5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HHL A;  1EGM A;  5FEW A;  3B97 A;  4HYR A;  4PEE A;  3H54 A;  1Z42 A;  1DWF M;  3WQE A;  4G1K A;  3MUX A;  1JDA A;  1H4P A;  4AHQ A;  4OIF A;  5FAC A;  4PUJ A;  4AG0 A;  4NZC A;  3M0J A;  1DIO A;  4C1N A;  2WXD M;  1REQ A;  1H7P A;  4UNL A;  1X8C A;  5EMK A;  1GQN A;  2BOE X;  5LKY A;  3GTI A;  3ARY A;  3K4A A;  3GC4 A;  3JW7 A;  1UPM B;  3W73 A;  3W00 A;  1KRB C;  4JTQ A;  1UJP A;  2UY3 A;  1Z8A A;  1Q63 A;  3TRO A;  4FLO A;  1XSI A;  3G0X A;  3KCO A;  5B80 A;  2BZN A;  1E6Q M;  3MMT A;  3DFN A;  3ZLH A;  2GVE A;  2ZX5 A;  4Q32 A;  2PD5 A;  4GBD A;  8XIM A;  4QS5 A;  2DZX A;  4GIA A;  1HIZ A;  4O50 A;  3CL7 A;  4HR1 B;  1PS9 A;  1IXN A;  1EEX A;  2E5C A;  2Y5E A;  4GVH A;  4Z2K A;  2FHF A;  5AB3 A;  1XLB A;  1FXP A;  2OR2 A;  1XG4 A;  3LN3 A;  5HNU A;  3W7O A;  2V82 A;  4CNU A;  3O16 A;  1H0G A;  2UZ9 A;  1E0T A;  1S5M A;  3P80 A;  2PTW A;  3E96 A;  1K7E A;  1UZD A;  5I79 A;  1B1Y A;  1UA3 A;  3LHU A;  4QSH A;  2QLY A;  4DO4 A;  4AZC A;  2VR4 A;  5AOU A;  4N2Y A;  4PL2 A;  4FAL A;  3U48 A; 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