4AZCA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
419
structure length
416
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 166
structure length 416
sequence length 419
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azcA01
1OBAA 2WBKA 3MO4A 1MYRA 3ALFA 1OD8A 2FH6A 2BHYA 3UG3A 4XZBA 1XYFA 1V3JA 2E40A 2CIPA 2W92A 1HVXA 5ABHA 3ZJKA 4RL3A 4JFWA 3KL3A 5I0DA 2X1IA 2VR4A 2D0GA 4Q22A 5HBFA 4JHZA 2VZUA 2Y8KA 4KWUA 5C8BB 3B8SA 1CGVA 3BAYA 2WVVA 4RE4A 3WNNA 3MUY1 3A4XA 1G01A 2VO5A 1E70M 1SMDA 1CPUA 3TONA 1DP0A 4TOQA 3HN3A 1FFQA 3PZGA 2XWEA 1SFSA 2JF7A 3AHTA 1UD8A 3VX0A 1RD6A 1E73M 3N1AA 3F5JA 4TUFA 4MDOA 5E09A 2Z1SA 2QMJA 1FP8A 5A8NA 2XWDA 2D24A 1E1FA 5A95A 3N13A 4D72A 4E4PA 3MANA 4XB3A 2G8ZA 2W5FA 3W27A 3PZNA 4QCFA 2J62A 1AVAA 3IAQA 1JI2A 4D1IA 1US3A 1QPKA 3WF0A 4JAWA 4MJ4A 3JUGA 1NWTA 4W8BA 1CBGA 4B9ZA 3GZAA 5DT7A 1V03A 3UETA 4ML4A 5E70A 3RO8A 3UR7A 1TZ7A 5A8QA 2V5CA 1UHVA 3CUIA 3WNPA 3ARYA 1AMYA 4NSBA 3AZSA 4BS0A 3FW6A 1NM9A 1MW1A 1XCWA 1GQKA 2CHNA 6A3HA 1M01A 3AZRA 2E4TA 2A3EA 1JXKA 3BC9A 1VAHA 1KWGA 4JFUA 1V0LA 3K46A 4D6DA 2ZWZA 5A6SA 1KXQA 1J9YA 4W89A 4S3KA 5CXPA 2YKKA 3A47A 4DWSB 1CGXA 1WPCA 1JZ7A 3WUEA 4P7LA 1B30A 4AY1A 1UR2A 1ECEA 2VI0A 4YHGA 3WBEA 2VMFA 2D22A 1BYAA 4QLJA 2A3CA 4TVCA 2XIIA 3AXXA 2VC9A 3II1A 4ZXLA 3OLIA 1UR4A 5GPRA 3W38A 2ESCA 2DSKA 5CSYA 5M17A 1JZ4A 2A3AA 2PB1A 3THCA 1WAWA 2XPKA 1QI5A 2O9OA 1C8YA 3NSNA 2WNWA 4UFHA 4E2OA 4GZEA 3VUPA 1VJZA 2ZXAA 5JBFA 3GYCA 2DT2A 4K68A 2V3EA 3GNRA 1B3XA 4YPJA 4H7VA 3OA5A 1Q6DA 4EAMA 2UWFA 3VO0A 5D9OA 4A4AA 5A3HA 4IPLA 1HVQA 3IANA 1WDRA 1J01A 2DEPA 5CQ1A 3TTYA 4H04A 3VD9A 2D2OA 3SCUA 3ZR5A 5ABFA 3N17A 3SUWA 1V3LA 2ZXBA 4AD5A 2G4FA 2ZX5A 2OSYA 1OCQA 1HKIA 1NH6A 3NJ3A 1XD1A 3VIIA 3CUHA 3K4AA 4BCEA 1CXIA 2EO7A 3QOKA 1E6ZA 1EOMA 4D6CA 2ZE0A 1QHOA 3T0BA 1E6SM 4CUCA 3VNZA 1HX0A 3PZUA 2J47A 4UR9A 2WLYA 3AYSA 4OOUA 2Y2WA 1ITXA 4AZCB 3WQ4A 1WDSA 4H8VA 4ATLA 2VCCA 5D8ZA 3CUFA 2QHAA 1EDTA 1UKPA 3MV01 4CD5A 3VMOA 1LG2A 3ARUA 3GNOA 3BXWA 1PAMA 1J12A 4BQ3A 2J77A 4ACZA 3N15A 2C8NA 4W8LA 3BCFA 3EDEA 1JXJA 1H5VA 3SUVA 5D9PA 5BWFA 3VGHA 3WEOA 5DEZA 1JNEA 1I1WA 3BAKA 3MUZ1 3VMPA 1OB0A 4AZHA 2BXZA 1H0GA 2BVDA 3ARXA 3GH4A 3BMVA 4P7NA 1E43A 4W7VA 4PMXA 1UR8A 2YL5A 4FZOA 1J0JA 3B9DA 4MAVA 2EPLX 4R27A 4KH2A 1M04A 4CCDA 3GDBA 4X0VA 4L4PA 2YL8A 1WCGA 3EDFA 2J8FA 1J0KA 4YN5A 2DSVA 3CPUA 1VFMA 2GJXA 4QLKA 2X2YA 3VIJA 1KFWA 1JFHA 3AIVA 5FL1A 1KBBA 2PWFA 1EO7A 3BAJA 2PI6A 1TE1A 5IHSA 3TOPA 3WF2A 4OZOA 5A6AA 1ZBKA 1VRXA 4TVUA 4XV0A 4WKAA 1ISVA 1K9FA 3ZJ8A 3U7VA 1KXHA 3WFZA 4HTYA 1ISXA 3SEPA 4PSPA 1G9HA 2WKLA 4IISA 3MMUA 4CGTA 4AC1X 1ODUA 2X09A 2XUCA 2XVGA 1FHLA 5ABFB 2JNKA 2W66A 3UEQA 1ESWA 4UQBA 1UZ1A 1UG6A 2XVNA 3T2OA 2XGIA 1QVBA 3A4AA 3VGBA 4UQ9A 5CLTA 3SUUA 1EDQA 2ZICA 2GJRA 2D0HA 3MUAA 2V3GA 1M03A 2XG9A 4NF7A 2BNJA 3OGVA 3AIUA 3CUJA 1WKYA 4Z2LA 2AMGA 4H41A 2VVNA 2WC4A 3VIKA 2V38A 2ZUTA 3AZTA 4MB1A 3PBGA 2WCAA 3N04A 4Z2GA 2EPNA 2V3DA 5CPSA 4J3SA 1HT6A 5DFAA 8A3HA 4R5EA 2XFFA 1EXPA 2J7FA 3ZT7A 3AMGA 2XVPA 4PMUA 4QLLA 1V6YA 2BFGA 7A3HA 1EH9A 4CKQA 2FGZA 2WLZA 3EMCA 1XH2A 1GVIA 2WWCA 1BSIA 4BQ5A 4EKJA 3W6LA 1JZ6A 1W91A 5ECUA 5A2AA 4JCLA 4J3XA 1BVZA 1J0ZA 4GI8A 2VX6A 2BY2A 3AFBA 2NT1A 1R85A 5IXEA 3ZM8A 2OZNB 1HJSA 3AICA 3W26A 1UOKA 1V0MA 4GINA 2G3JA 3OLDA 3ZO9A 4UFJA 1TUXA 3SUTA 1KR1A 4U5KA 1EOKA 2VQUA 3ARQA 3VU2A 1KCKA 4JFSA 3WDQA 1LLOA 2WK2A 1JAEA 1IZKA 2EQDA 1HKJA 3PZIA 3NSXA 2YLLA 1CENA 5BXTA 3WDJA 4HZ8A 2UY5A 5FOOA 1UKTA 5C70A 3VIMA 3AQUA 1JI1A 1X6NA 2YOCA 1GJUA 5LYRA 4TX6A 3WF4A 3FY1A 3UESA 2ZUWA 4HA4A 3BMWA 4JKLA 3OLEA 2EPKX 3F5LA 1DEDA 1NWUA 1WZKA 1ODZA 4MDPA 1GONA 1RPKA 1EDGA 1NOWA 3ARSA 4E8DA 1ZL1A 3RMEA 1Q6CA 3U5YA 1NWSA 1B31A 2G41A 4PMZA 4AWEA 3BAIA 1HJUA 1BG9A 3OZOA 2XIBA 3U57A 1G1YA 1CXFA 1OWQA 1BF2A 1W9BM 5BXRA 4TXEA 5A6KA 4N0RA 1UKQA 2CBVA 5EMYA 3W37A 4J27A 4AZGA 2PWHA 4IM4A 1EQPA 1L0PA 5IHRA 1NQ6A 1CXHA 2J7DA 3VM7A 1EHNA 1PZ2A 1FP9A 3OIHA 4QCEA 1MQQA 4W7UA 2J7EA 4J3WA 4ZXOA 1GOKA 5EBAA 4X0NA 4ATDA 3PN8A 2GVYA 4AXNA 4MADA 3POHA 1JF6A 1JYWA 1CWYA 3VMNA 1U33A 4A3HA 1C3FA 1R86A 1UR1A 4DWSA 1HJWA 1ISWA 3GNPA 4D6HA 3BH4A 3AXHA 1JGIA 3CGTA 1DWGM 5DF0A 2CITA 3O6AA 1XH0A 5FKYA 4PN2A 1I75A 1HP4A 1VIWA 3WNLA 2QMKA 4TTUA 1J0YA 1V3HA 3DHPA 1WB0A 5AC4A 3WL0A 1QW8A 2YBTA 1MQRA 1TR1A 1FHDA 3MS8A 3CHCA 3VD7A 1OGGA 3WN6A 4FLOA 3PZTA 1EIBA 2WWDA 2Y5EA 1JYNA 1OT1A 3ZJ6A 5JUVA 2YLAA 1Q4NX 1V3IA 1UZ4A 1PX3A 2WVUA 1UH2A 1XGZA 4AW7A 1OD0A 4BA0A 2FHFA 2VZVA 1GQJA 1UA3A 3M46A 3WEMA 3W6MA 3N18A 4LYQA 1B3WA 4F8XA 5TD4A 1TMQA 2DPEA 1LF1A 2VX4A 3VDBA 4OOZA 1XC6A 3VD3A 1C7SA 2VQTA 4FLRA 3QR3A 3RM4A 3AMLA 1ISZA 3PTKA 5A6BD 1YQ2A 2FDMA 5BXPA 4UQDA 1UWUA 4D6EA 3F4VA 1KGWA 1PX4A 5I78A 4OBSA 1WZMA 4JL2A 1KR0A 2ZUSA 1HJXA 5CJ5A 1M7XA 3CZGA 2XM1A 5CPTA 3W4RA 5E0CA 4OKDA 1CGTA 5HPCA 4U2ZA 2J78A 1UA7A 3BAWA 2EEXA 4AZCA 5HXMA 2VOTA 3G6LA 3VDHA 3VILA 4CD8A 4S3JA 1XYZA 2CKSA 4PTMA 1BG4A 1CXLA 2ZUMA 1A47A 4MTVA 2QLYA 4GPNA 2WHKA 3N11A 3ZSSA 4BZYA 4P8WA 3VM5A 3WQVA 4J3UA 4F9JA 4HPHA 5FD0A 4KGLA 1V02A 3AHZA 1B3YA 2YDQA 2HVMA 5FIPA 1E6PA 4CCCA 2VCAA 1U30A 1H3GA 3OLGA 1XD0A 2Y8VA 3ARTA 1E6NA 4B3LA 4HZ7A 1VEOA 1QNOA 4AEFA 3QHNA 2WSPA 1V6VA 2F8QA 2VVSA 1AQ0A 3K8KA 4HZ6A 3AROA 4FLSA 2YL9A 5GQBA 2CBJA 2VZSA 2DH2A 1BHGA 4DWSD 2ZXQA 2WMJA 4QAWA 3SURA 2GK1B 1NP0A 5CZKA 1B90A 4PEEA 3AJ7A 4CN4A 1B3ZA 2X0YA 1ZJAA 3ZMRA 1OIFA 2DGAA 3CZKA 4KRUA 4M56A 4GI6A 3ZT6A 3O9NA 4JCMA 4U2YA 2XVLA 3TA9A 1W1TA 3W24A 3CIVA 3W81A 3TTQA 3VGEA 1Y7VA 2WMFA 4J3TA 1C91A 4AD2A 1HXJA 1VJSA 1G5AA 3GTNA 2J25A 3SCPA 4W86A 1E9LA 4MPKA 1EA9C 3WNKA 2G3NA 5CSUA 3LPGA 2YBUA 3NSMA 1E4LA 4LYRA 1E72M 1KGXA 1CYGA 2ZUUA 4W84A 2CEQA 2VRJA 3WUGA 2YJQA 1OIMA 5JIWA 1W2PA 1OM0A 5IFPA 1JZ2A 2XSBA 3BGAA 2BV9A 2J7BA 3FHAA 3L4YA 3POCA 1EHAA 1BGAA 1UD5A 3F5KA 1P6WA 1D7FA 3N9KA 3OB8A 4PCSA 3SCTA 3GBDA 1JZ8A 2E8YA 2CBIA 4LPCA 3L4VA 5AYBA 4W5UA 3AS2A 3THDA 5CGMA 1CGWA 1H2JA 3CUGA 5D8WA 3L4XA 5LA0A 4GZJA 4GIAA 3WKZA 3SCRA 3PZVA 2J79A 1GZJA 3WH9A 3AI0A 1L8NA 3S6TA 1BGGA 4AIOA 2OYMA 3NYDA 1Q6EA 3AHYA 3T2PA 2MANA 1UWTA 4GI9A 2EPMX 4FMVA 5FL0A 3DECA 4HU0A 1QBAA 4CN6A 5CG0A 2BHUA 1E5JA 2DQXA 4P7RA 2XM2A 4L4OA 5A8OA 1BYBA 1QW9A 1MFVA 4IUGA 1CTNA 3KZSA 2WMKA 4LQ1A 4PMOA 1XRVA 2DIEA 1KQZA 2BS9A 3QOMA 4JHOA 4H8HA 5CLWA 4UQEA 3WQ5A 4D71A 3BAXA 3AMKA 3IK2A 1QI2A 2C0HA 2VCBA 1TCMA 4AD0A 1GVYA 4NRSA 5AYIA 4HPGA 1AQMA 3IAPA 1CLVA 1WDQA 1UR0A 3RM9A 3KWXA 1MQPA 1VFUA 2UY4A 5DO8A 1DHKA 2J7HA 1TG7A 3HU7A 3AS0A 5BROA 4H8UA 1G0CA 3UR8A 1VB9A 1ZB5A 4W88A 3CZEA 4Q7NA 2FH8A 2PWEA 2EXOA 5E9AA 1NOUA 1XH1A 4HP5A 1ZBCA 4AIUA 1GOMA 3U5UA 5M3WA 3SCVA 5BCAA 1HL9A 3OZPA 1W1VA 4Z2KA 3WDPP 3VIGA 5A69A 5I79A 3QGVA 2CESA 1C93A 1YHTA 5AY7A 5ABEA 1JZ5A 4PTWA 1UWSA 1ITCA 2XGBA 1BTCA 1KBKA 2DT0A 2ZXDA 1EQCA 1X6LA 3CHEA 2PBGA 3WH8A 1LL4A 1V08A 2XSAA 5DMYA 1N82A 1DWIM 3QHOA 5D9MA 3T2QA 5BRQA 5I23A 2PMRA 2E0PA 4PUDA 1CECA 1HNYA 1XCXA 3EMQA 1E5NA 1E15A 1UD3A 2O9RA 3VDAA 4CVWA 1RH9A 4TVDA 1EGZA 1H49A 1ZS2A 3AIBA 2Y4SA 3MKKA 3I3EA 3OBAA 3GH7A 3VGFA 3B9EA 3AIWA 1JDAA 4M82A 3VKKA 3GXMA 1MFUA 1JD7A 4AD3A 4WSJA 4MNLA 2PWGA 3ZJ7A 5A6JA 3KE0A 5I6SA 1W2VA 4FF5A 4MNJA 2ZWYA 3EMZA 4U3CA 4AD4A 1A3HA 4FK9A 2PF0A 4OIFA 3CH9A 1QNRA 3SCWA 1CZ1A 3IJ9A 1U2YA 1FH9A 2X0HA 1NARA 5CGTA 3VVGA 2J7GA 3T09A 3W53A 4C7FA 1XSKA 2UY2A 3RCNA 3AISA 4D1JA 1FOBA 2YDSA 2JIWA 4UQCA 4UCFA 4PUEA 3B9AA 3CLWA 4W7WA 3ARRA 3AYRA 2OWCA 3W0KA 3WDRA 4WLCA 3T0AA 4CU6A 3WMCA 2WKGA 6TAAA 3VD5A 1AQHA 1TA3A 2WANA 3NDZA 2WZIA 3CTTA 4B9YA 3KL5A 3N12A 4LYPA 1VEPA 3FAXA 2WHMA 3TTOA 1PIFA 1IZJA 1GW1A 3RILA 1JAKA 1R7OA 4H2CA 4XZWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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