4AZGA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
418
structure length
411
Chain Sequence
RGSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKISKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 161
structure length 411
sequence length 418
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azgA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azgA01
3L4VA 4H41A 1ZJBA 2O9TA 4P8UA 5A8OA 1BYAA 4AWEA 4LPCA 1B3VA 4HPGA 2NT0A 4TXEA 1W1TA 4MB4A 2WMGA 1PJ9A 1V0KA 1MQPA 2MANA 3UG3A 4BQ5A 1AQMA 1DWAM 4Z2JA 1HP5A 3MUIA 3AYSA 6CGTA 4TUFA 4RE3A 3CZ8A 1VFUA 4W7WA 5CSUA 3BMWA 1W1YA 4X0VA 2CIPA 4JAWA 2UY5A 4OBRA 2WVUA 5EB8A 1WKYA 4MNJA 3W24A 4JKKA 4LQ1A 3IANA 1OGGA 1UR9A 1W9UA 3NCOA 4M81A 3AIVA 4FLRA 4LXFA 1QNRA 4FK9A 3UERA 5AY7A 2A3HA 4B15A 3MUAA 1BTCA 2PI6A 2YLAA 1DWIM 3VIKA 4D6EA 1G1YA 1TA3A 2QV4A 1VFFA 1OSEA 3W53A 3SUTA 1KBKA 1C8QA 2DH3A 3WF0A 2ZX5A 3PZGA 1MYRA 3OLDA 2CITA 1EQPA 1OINA 3BSHA 3GTNA 3S2CA 3RPMA 2CBIA 4ZXOA 1IT0A 3OIHA 2C8NA 1CGTA 5DO8A 3QGVA 2OZNB 1JZ2A 1HKMA 1TMQA 4J27A 4GO8A 4W5UA 4WIWA 3FAXA 2DSKA 4U2YA 2J47A 4KWUA 3CH9A 3AMCA 2BY1A 3ALGA 4W86A 3PTKA 5A8QA 3VNYA 3B8SA 3AHVA 2OSWA 3ZSTA 5A94A 1QNOA 3OLGA 3TOPA 1UQYA 3K4AA 4OBSA 1GJWA 1FOBA 2WCAA 4TOQA 4JFVA 1OIMA 3ECQA 3RCNA 1AQHA 2VOTA 4URIA 2W62A 3PZOA 1QBAA 2Y5EA 4BCEA 1W3JA 2PWDA 5D8ZA 2XYLA 2CHNA 1MQRA 4IISA 4TVDA 3WMSA 3I3BA 1LWHA 3BSGA 4MDOA 3TTOA 3W37A 1JF6A 1HKJA 3VIJA 4KMQA 3OLIA 2YLLA 4HU8A 3CIVA 1WNOA 2RGLA 1OD8A 1KWGA 4CN6A 1XRVA 3CHEA 1UD2A 5ABFB 1E70M 2GVYA 4JFWA 5CZKA 2J7BA 2VZTA 3BC9A 1B3ZA 1WCGA 1C91A 3THCA 5DMYA 1KXTA 3MSGA 3AI0A 3POHA 1ISVA 1E5JA 5M3WA 4D6CA 2PWEA 1VB9A 1FFRA 3HJEA 1CXFA 2PF0A 4K68A 1UKOA 2GFTA 1C93A 1KXHA 4A3YA 1UHVA 3EDJA 1E55A 2BHYA 2JE8A 1B9ZA 2CHOA 3UR8A 2W91A 4LX4A 1W2VA 4PTWA 3GBDA 1HNYA 1R87A 1IZKA 4QLKA 3EDEA 1ODUA 2W66A 1PZ2A 1R85A 5HBFA 3W4RA 4F66A 2AOSA 4MDPA 2CESA 1BGAA 1UUQA 3KL5A 2D23A 3WQ4A 1TE1A 2CPUA 1GQKA 3BGAA 1ISWA 2J8FA 2AMGA 2VVSA 1W3HA 3UCQA 2FHCA 1H2JA 4DWSC 5BXSA 5CXPA 3SCNA 1JD7A 1J0YA 1UWIA 1L8NA 5KEZA 1J0JA 3SUSA 4BA0A 3GNPA 4MNMA 3N17A 3FN9A 2WHKA 4Z2GA 3SCTA 2XVKA 4XX6A 4HA4A 2XGIA 5I6SA 1MVYA 2D22A 1J0HA 2FHFA 2CXGA 1CGUA 3ALFA 4JFTA 4IM4A 3VD5A 1WDQA 3M6DA 2ZUVA 1ISYA 3PZUA 3T0AA 5A6BA 1J01A 1H0GA 5C8BB 1EOKA 4W5ZA 3QHMA 5I77A 4M29A 1HVXA 1GVIA 2YL6A 3AICA 3CUHA 1PPIA 4D6FA 5FIPA 4AZBA 1EH9A 4FZOA 4AD1A 2ZX8A 4HMEA 3W82A 4Z2LA 4UOJA 1J9YA 1A47A 5A69A 2X0YA 3GDBA 1M03A 3ARPA 3L4YA 1HN1A 3PZVA 4UR9A 4NRRA 3BAXA 3WDPP 4AD0A 1MXGA 4HZ6A 1OB0A 1QVBA 3I3EA 2WPGA 1KGWA 2Y8KA 4PCSA 4MNKA 3GXFA 4AZ6A 1MWOA 4Z2HA 3VIIA 3W28A 4HU0A 5A2CA 5JBDA 2J8GA 1LQ0A 2JF6A 1OBAA 1SYTA 6A3HA 3CHCA 1KGXA 2J78A 4CCEA 2CBUA 2VTFA 3RIKA 1E3XA 3ARQA 2EPOA 3TP4A 2BVYA 1HVQA 3FAWA 3PHAA 3N04A 5IDIA 3A4XA 5JIPA 3CUGA 2GDUA 3SCSA 1J0IA 2UY2A 2YA1A 4HOWA 1KQZA 2FDMA 4MB3A 1E4MM 1BPLB 1EHAA 3CBWA 5A6JA 1XC6A 4DWSA 4D1JA 4D6HA 1AQ0A 5DEZA 1B31A 3ZMRA 1XV8A 1UD8A 1JDDA 2VVNA 1UH2A 1QHOA 3IAPA 5TD4A 1IZJA 1KFWA 2VZVA 1UR1A 5CPQA 4HTYA 3BAJA 1XCWA 4DWSD 1H1NA 1VBUA 1TR1A 4EAMA 1CIUA 4TVUA 1GHSA 3AMKA 4U33A 4MB5A 4W93A 2YL5A 1K6AA 4AY1A 4AD4A 1MW1A 2DSVA 3THDA 1UWTA 3WUEA 1OIFA 1UD5A 1K9EA 3UR7A 3VGDA 1CWYA 2WMHA 2WSKA 1QI5A 2WW5A 4CCCA 1VEMA 2VRQA 4TVCA 3DECA 2ZXQA 5BWFA 2E40A 2Y2WA 1CXEA 3HU7A 1HKKA 1HF6A 1NWUA 2VRKA 2ZUUA 4D6JA 2ESCA 3SCQA 4S3KA 1EHNA 1UD6A 3D3AA 5IHSA 1FP8A 2JFEX 3T2OA 1LL6A 2EPMX 4CD8A 2ZWYA 1E0VA 1FH9A 2XVLA 4ACZB 4B16A 5ABGA 4YHGA 1VBRA 2IUZA 3AZSA 5A1AA 2Y4SA 3AHYA 2WLYA 3ARVA 4W8BA 2ZUNA 4B3KA 2YBTA 3SEPA 4R27A 2UWFA 1RPKA 2XUCA 3QHOA 1RD6A 2JF7A 1W9DM 3AZRA 4W85A 4CVWA 1WP6A 1G94A 3FHAA 2WC4A 1CLXA 5A2BA 5ABHA 2OYLA 3EMQA 1KR0A 3WQ8A 2V3FA 2XIIA 3WNMA 1V02A 2EO7A 3BXWA 2FHBA 3SUVA 1NM9A 1F4AA 3WFLA 2OWCA 3EDFA 4MJ4A 2XVGA 1TZ7A 4F9DA 1ZL1A 1EDQA 1E4NA 2W61A 1TG7A 3WDHA 4PEEA 1K9TA 1EO5A 3ARZA 2BFGA 4EE9A 4Q22A 4JL1A 1L0PA 3KL3A 1CGVA 4WSJA 3BAYA 1CXLA 1IV8A 1UKPA 1KWKA 3ZR5A 3J7HA 1UKTA 3T0DA 3VD9A 4FLOA 1TVPA 4YPJA 3WEMA 2DT1A 1VEPA 4W8AA 4GI9A 3D5HA 1W9XA 3RILA 4W84A 2Z1KA 1HIZA 5BROA 1NOUA 2E0PA 1W91A 2IXUA 4AXNA 4M1RA 3W0KA 3SCOA 3WN6A 4UQEA 3SCRA 2ZOXA 1CDGA 1D3CA 1NWSA 1JF5A 2XSAA 2YOCA 1BVZA 3CHFA 1CYGA 2BHZA 1PIFA 3F5KA 1BF2A 1V3IA 1B3YA 3OB8A 3WBEA 3CGTA 2ZUMA 2CCRA 3UETA 1R8LA 2NSXA 7A3HA 2WSPA 3RM8A 2VJXA 3FHQA 5GPRA 5GNZA 2G3JA 2X09A 2BVTA 4KH2A 3G6LA 3U7VA 1YHTA 2PB1A 1W9BM 7TAAA 3VMPA 2WANA 4J3XA 3CLWA 1CBGA 3A3HA 1J12A 5JUVA 2EXOA 1NOFA 4FLQA 1E6SM 2VX6A 3CUJA 3CZEA 2ZIDA 4LYPA 1KR1A 4EK7A 1UQZA 1WB0A 1I1XA 2RGMA 1UA7A 5A95A 1NWTA 1EQCA 4FMVA 1GORA 1GOQA 1GONA 2AAAA 1R7AA 4GZJA 1XD1A 4DM1A 3WEOA 5E6YA 4J7RA 1P6WA 3VIFA 1WPCA 2O9RA 3VM5A 3OGVA 2WMIB 4F8XA 4CGTA 5CG0A 2VQTA 2ZWZA 3ZJKA 2YA2A 2F2HA 1XHGA 2D3LA 1GQJA 2Y24A 1BYBA 4GO9A 3O9NA 3ARTA 1HT6A 1D2KA 3GNRA 2WMFA 1VAHA 3KWXA 4IPNB 4A4AA 3WDIA 2WHLA 3OZPA 1JNDA 4P7NA 4D6DA 2WVVB 4GI6A 4HMDA 1TCMA 1PZ3A 4P8WA 9CGTA 4UFHA 5IXEA 3BAIA 1CGWA 4X9YA 4UOZA 2GJPA 4P7OA 4UQCA 3N15A 4AZ7A 5LA1A 2WHMA 2YDQA 3O2LA 3TA9A 3AXHA 1C7TA 2X1IA 1GVYA 4JFSA 5CLTA 1XSIA 3QOKA 1X1NA 2ZUWA 3MKKA 1CZ1A 1UKSA 3AHZA 4P8VA 4HA3A 2CNCA 3NSNA 4M80A 2XPKA 4ATLA 3L2LA 1BG4A 2BY3A 1Q6EA 2BXZA 1GPFA 3L4TA 5GNXA 5DT5A 2GK1A 4ACZA 4E2OA 1HJXA 1J10A 2BNJA 4QDMA 3W27A 1FFQA 1NQ6A 1UA3A 1ZBKA 5C71A 3L4ZA 2J7DA 1V6XA 3A6OA 1M53A 1H0IA 4ZE5A 5E09A 1W9VA 2O9OA 4ZEPA 1HJQA 3VU2A 4PMNA 2XFRA 1JYXA 4P8XA 2WK2A 3O6AA 3WNOA 1E71M 3WDRA 3RJYA 1V0NA 3AMDA 2DSWA 2J4GA 1OCQA 1OGBA 1GUVA 3WF2A 4Z2IA 4L4OA 1UWSA 3DYMA 1XH1A 1BQCA 5FOOA 1ZU8A 3ARUA 3VIOA 1UR4A 2V3GA 3VD3A 3UESA 3MU7A 5FL1A 3WNLA 3MV11 2XTKA 2QMKA 4KGJA 4OZOA 4PMVA 3BCFA 4GINA 4AIEA 5IFPA 1XCXA 5M03A 4W87A 3FY1A 3WD3A 1KB3A 1BYDA 4Q7NA 4D1IA 3LPOA 4P7QA 1TUXA 5CGTA 1RH9A 2ZXBA 2B31A 3OBAA 4OJYA 3CUIA 1UH4A 4QP0A 1KQYA 1VENA 1JZ3A 2OYKA 4UQ9A 1J0KA 2EQDA 3BLKA 3SCUA 1V03A 2V38A 5HNNA 4TTUA 5CQ1A 3SCWA 3K8KA 2BS9A 4NZCA 1E56A 1GQIA 2OO2A 1G5AA 4MAZA 3HMCA 3T0BA 1GHRA 4AZCB 1OWQA 3GXDA 3WEZA 4J28A 2QPUA 1XH2A 1UH3A 1JYNA 1B2YA 1Z32X 2ZX9A 4V2XA 3ZSSA 1W3KA 3IJ9A 1Q6GA 4CU7A 2XSBA 4CKQA 2DIJA 3LMYA 3WDQA 1E0WA 2OSYA 4UOQA 5FCZA 3WDJA 1JI2A 3T08A 1QNQA 3HN3A 2X8RA 1JZ4A 3W26A 4F79A 4WKHA 1MFVA 3WD2A 1EIBA 4JHOA 2VX7A 3OA5A 4GPNA 1M01A 2ZUTA 1JYWA 2J7GA 1DWFM 5IFTA 4C7GA 4OKDA 3PZTA 2YA0A 2VX4A 2GJXB 1WE5A 1LF1A 4AD5A 1UR2A 3CMGA 3CHDA 1BFNA 1HL8A 3MMUA 3MS8A 4JIEA 3ZT6A 3ZO9A 3NIYA 1OT2A 4RL3A 1CPUA 5EFFA 4JZ5A 3CZLA 2E3ZA 3SCVA 3FNDA 4UFJA 5CJ5A 3TONA 3ZR6A 1US2A 3WH7A 5M5DA 1Q6FA 2PWGA 3VINA 5M17A 5A6BD 3A4WA 3PN8A 7CGTA 4PSRA 5CPTA 3CO4A 5D9PA 1G01A 1G9HA 1PEZA 4NI3A 2J74A 3WMCA 4N42A 4GXPA 1HKIA 4UZSA 3WSUA 5D4YA 3CZJA 4PMQA 2WVTA 5I0DA 3FW6A 1VF8A 1W1PA 1QI4A 1ZS2A 3LPFA 1UD3A 4M82A 4MTVA 4H04A 2XIBA 1O6IA 2WNWA 5FD0A 1V3KA 2XM1A 3ARYA 3AZTA 1GJUA 3MANA 4B3LA 3RM9A 3F4VA 3MUZ1 4LGXA 1MQQA 3NYDA 6TAAA 5AC5A 2XVNA 2HVMA 4PTXA 2D0HA 3NDYA 3CUFA 2ZXAA 3VDAA 4OOZA 1RP9A 1JZ5A 2TAAA 1DWHM 4AZHA 5A8NA 2O92A 2VT0A 2DSZA 1UWQA 3M46A 5A6MA 3ZT7A 1UR8A 1QHPA 1PX3A 4J3UA 1US3A 3T09A 2DT0A 2VUYA 3QHNA 3GYCA 1EDGA 3MMDA 3OGRA 2J75A 2XWDA 3VPLA 4D6GA 3VM7A 3VIMA 4FZPA 2QHAA 3B9AA 3ARSA 3L2MA 3PZNA 1B30A 1JNEA 1VFMA 3BAKA 5I78A 4MPKA 4H8VA 1ESWA 3T2QA 2J7CA 1VRXA 1X6LA 3ZJ8A 2VCCA 1MFUA 4GQQA 3E1F1 3AS3A 5I5RA 4HZ7A 1CECA 1J11A 2WCSA 2E4TA 1EGZA 1B3XA 1BSIA 4WJXA 2VMFA 3WD1A 4UQDA 2WWCA 4ZE4A 5A6AA 1N82A 2WCGA 1QI2A 2V3DA 3WF4A 3KE0A 3POCA 5BXTA 3L4XA 2EJ1A 2NT1A 1V0MA 2VQUA 1E9LA 1V3MA 3PZ9A 2UY4A 4OOUA 3ZJ6A 4R5EA 2W63A 1Q6CA 1SR0A 1UKQA 2D0FA 3T2PA 5ABFA 4KGLA 2XJ7A 3WD0A 2WZHA 1QW8A 1BLIA 5LYRA 4U31A 5CPSA 1CNVA 4OIFA 3S6TA 1WZMA 4QLJA 2CBJA 4E4PA 2DT2A 2G3MA 4H8UA 2E9MA 4DUXA 1OM0A 3K8LA 4DUVA 1B0IA 4NRSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3L4V A;  4H41 A;  2VP8 A;  3W3O A;  4P8U A;  3N19 B;  4LPC A;  1ZGD A;  3GAY A;  5I3H A;  4B5U A;  4HPG A;  3DG6 A;  1F3T A;  1W1T A;  4MB4 A;  1SJA A;  2C14 A;  4MFE A;  4BF5 A;  2PDP A;  3HQO A;  2DIK A;  3UG3 A;  4HCD A;  3TYD A;  1AQM A;  2OEJ A;  1DWA M;  3QST A;  3F7W A;  4Z2J A;  4JLC A;  3LA4 A;  5IDZ A;  1QR7 A;  3MUI A;  1SR9 A;  5DAN A;  4TUF A;  5C2X A;  4RE3 A;  3CZ8 A;  3RXZ A;  1VFU A;  3ISI X;  3QV8 A;  3QV6 A;  3W9Z A;  1F2J A;  2PC4 A;  4LAZ A;  4RXG A;  3W71 A;  3TRO A;  3IEB A;  4JAW A;  2BAS A;  2PP1 A;  2UY5 A;  4GUG A;  1XL9 A;  4OBR A;  2HMC A;  5EB8 A;  1JGM A;  3A23 A;  5F2I A;  1Z44 A;  1XQK A;  2YBV A;  1FBA A;  4M81 A;  5AHF A;  4FLR A;  5HK4 A;  3R43 A;  4HQV A;  5HAN A;  3B0P A;  2ABB A;  2YLA A;  1S2A A;  2QV4 A;  1VFF A;  1W5M A;  3W53 A;  2DH3 A;  3WF0 A;  2QJM A;  1MYR A;  5D2V A;  1EEP A;  1DYS A;  3ZLH A;  1IXO A;  3GTN A;  4QRO A;  1AJ0 A;  5F4S A;  3HA1 A;  2ZA3 A;  4QJ3 B;  3SI9 A;  4NAS A;  5DO8 A;  1LZO A;  4R53 A;  2PDY A;  2OZN B;  1JZ2 A;  1TMQ A; 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