4AZHA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTNLEGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGLKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 163
structure length 421
sequence length 421
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azhA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azhA01
2A3HA 3F5JA 3VGGA 2VVNA 1EH9A 3WKZA 3GXIA 4JZ5A 1GNXA 3GH7A 4AZCA 3MSDA 2WMKA 4MB1A 3VDCA 4P8VA 1IT0A 2YOCA 4GI6A 3AMCA 1JG9A 1TA3B 4JFWA 1MW3A 1E4LA 1FH7A 2G41A 2FH6A 3DHPA 3CZLA 1C8QA 1J0YA 2XSBA 2D0FA 1EQCA 1JL8A 4YHEA 3VKKA 3WQ6A 3KZSA 4AZGA 4U31A 4WSJA 2J74A 3NUKA 3OA5A 3K46A 2HVMA 3RILA 3AS1A 1CBGA 3UG3A 2J7BA 4HPGA 4PUDA 1NWUA 5CPSA 2OYKA 2WCAA 1OD8A 1WZKA 1G01A 3MUIA 1PAMA 2TAAA 4AZBA 5IHSA 4AIEA 1E4NA 1W9DM 3SCTA 3CHEA 3KL5A 4HZ8A 2EJ1A 5EB8A 1AMYA 3NYDA 4L4PA 2PWHA 4W85A 1E4MM 2WMJA 7A3HA 3EMCA 2DIJA 3MSGA 1VIWA 2WZIA 4CD4A 3WELA 1MVYA 1JZ6A 1JI1A 4PMNA 1GOIA 4HMDA 2W92A 3AIEA 1CXHA 1XC6A 4EKJA 3NIYA 4PMYA 2XG9A 1E5NA 2Y8VA 3BCDA 5BRQA 1JZ7A 3WUFA 3RM9A 5BXSA 2CETA 1AVAA 3ECQA 2YDQA 2WNWA 1JDCA 1Q4NX 2F2HA 4JL2A 4AY1A 3WD1A 1Z32X 3AMLA 5CPQA 3OG2A 3WD4A 1GOOA 2NT0A 4IM4A 3AXIA 3UERA 2E8YA 2YL8A 1SMAA 4PSRA 3OGRA 1UWIA 2YKKA 4W8BA 2DT1A 1KQZA 3WF1A 3WF3A 4KRTA 1V03A 1H1NA 1PBGA 4TOQA 3S6TA 5JBFA 2ZUSA 4W88A 1UZ4A 1Q6CA 2XSAA 4AD2A 1GQKA 1UWUA 1ISZA 2E40A 4MDPA 4MNJA 3O9NA 5BROA 2JNKA 3WY1A 4AD0A 1V0KA 1E6PA 1GUVA 4DWSC 4HOXA 4TVDA 1R87A 9CGTA 4V28A 5A8QA 3UCQA 3VU2A 1W9BM 2W61A 1C8XA 1J0IA 1C92A 2DT0A 4PMQA 4XZWA 3WUEA 1BF2A 3L4TA 1TMQA 2VRJA 3U5YA 2VL4A 4ZE5A 3PZMA 2Y4SA 3SUVA 1BGGA 3TTSA 5BXRA 2CXGA 2XVKA 3AS3A 3U7BA 4AZIA 3VIPA 1TA3A 4CVWA 3ARTA 3LPOA 4AEEA 3ARUA 3PZOA 1CENA 4M29A 2WVTA 1A3HA 3BLPX 1Y7VA 3FNDA 1B1YA 1VB9A 3K4DA 3RIKA 4AC1X 1HKKA 1XHGA 1V3LA 2XUCA 4HA1A 2B31A 1KCKA 3WD3A 4D6CA 1UD6A 3SURA 5D4YA 3VM5A 1RPKA 1ZS2A 2YL9A 2BVDA 5HPCA 4MJ4A 2ZUUA 4JKMA 1NP0A 1TZ7A 3NSXA 2EXOA 3AFBA 1J0KA 1ZBKA 2GJXA 4J28A 3SUSA 1G0CA 1H2JA 2VMFA 2WBGA 4W7WA 2CESA 3L4WA 1I75A 1SR0A 3WBEA 3HJEA 3POCA 1HIZA 3CUGA 3HN3A 1SFSA 3VDHA 2Y2WA 1F4HA 4U33A 4BF7A 1BSIA 3W6MA 1ITCA 2WHKA 2ZX8A 3CGTA 1WNOA 3WH6A 1DWJM 2X0YA 4CKQA 2XVPA 1J0HA 4WLCA 4WJXA 2W63A 1W1PA 2W91A 1A47A 4UFIA 4KGJA 4HU8A 4IISA 1X6LA 1ISYA 5A6BA 2F8QA 2PBOA 3PZGA 3ARWA 4AZHA 2J75A 1US3A 2XWEA 3ARXA 2E9LA 4AYSA 1XSIA 3GNPA 2W5FA 4A3YA 1W9VA 3CUHA 3WQ5A 4AD3A 2G8ZA 2VNCA 1CXKA 2O9PA 1FA2A 4B3LA 5TD4A 1OBAA 2J7EA 1Q6EA 3N04A 1HP5A 4MNKA 3BAKA 1KWGA 1UR1A 3WQ8A 1JIBA 1U33A 2ZE0A 1BGAA 1HJUA 2WHLA 5I6SA 3WMBA 3D3AA 1C93A 3CUJA 1ZBWA 4U2YA 4E4PA 3WUBA 5GPRA 4FLRA 3VVGA 2A3CA 1I1WA 2CCRA 2DPEA 3N1AA 2DH3A 2OWWA 3VMOA 1W3JA 2GVYA 1BYCA 2CHNA 4UFHA 5LA0A 2ZX6A 4MB3A 1JZ3A 1E43A 3MV01 1FFQA 4ATLA 1XH1A 4B16A 4LYPA 2BNJA 1XD1A 2ZX7A 3T2QA 1JAEA 2WWCA 1QI5A 2EPNA 3PTQA 4XB3A 3EYPA 3AHVA 3EDDA 3GBDA 2QMKA 4HZ6A 1KXVA 3W38A 3AIBA 3VNZA 1MWOA 3ZT7A 4M8UA 2V3DA 1EIBA 4ATWA 4GKLA 1UH4A 3CHFA 2CEQA 3VIHA 3OZOA 1W9PA 3ALGA 2QHAA 4JL1A 4TX8A 2PWFA 1OCQA 5ABGA 2ZOXA 1V3JA 2XGIA 2VURA 3IAPA 2EPLX 2UY3A 1V08A 5I5RA 2XFYA 4MADA 1BG4A 1B3XA 4DWSB 3SUTA 3ZQ9A 1IZJA 5ABFB 5A6AA 1DHKA 2CBIA 2YL6A 2ESCA 2UWFA 2W4XA 1JNDA 4MB5A 5AY7A 4NF7A 4E8DA 2J8GA 5ABEA 1V0LA 4NI3A 3FXYA 3ZJ6A 5FL0A 4CCEA 1WE5A 2XM1A 4WF7A 2ZUWA 2XTKA 1EOMA 3FAWA 2VCAA 4FZOA 4MPKA 4MAZA 4D1IA 3GZAA 1CYGA 4PMOA 1W9UA 4UNIA 3WFZA 4D1JA 3W4RA 4QFUA 3AHTA 5A8OA 4MB4A 3WQ4A 1MFUA 1ZJBA 1UR0A 5CXPA 3RMEA 2ZUTA 5A8MA 1XH2A 3VD5A 5EFFA 1E3ZA 3OLIA 1B3WA 5EMYA 3HU7A 2CNCA 2EQDA 4UFJA 5CLWA 1MYRA 4HA4A 4AD1A 5A6KA 4J3UA 3GDBA 5CJ5A 3VD3A 1UWTA 1OB0A 5M5DA 3O2LA 3K8MA 2WK2A 1J10A 1GQIA 2EO7A 1CDGA 5A1AA 4NRSA 2EEXA 4W7VA 3SCUA 4J3TA 4GO8A 1OD0A 5HPOA 3VDAA 3RO8A 4H8UA 3B9DA 5A3HA 5I24A 1ISWA 2X8RA 2Q8XA 4Z2KA 1OM0A 5LYRA 4C7GA 3OLGA 3VINA 3SCSA 4UZSA 1MW2A 1ZL1A 4M82A 3ZO9A 1AQHA 1BLIA 3A4WA 1PX4A 1WZMA 1E0VA 5JBDA 3QOMA 1C7SA 1EA9C 2WMHA 1UA3A 1WDPA 2UY5A 5GNXA 4JFVA 4U3AA 1TVNA 3HMCA 3WUGA 2GJPA 1J0ZA 3PZ9A 3CZ8A 4DWSA 5M3WA 2D24A 3WDRA 5ABFA 4PMXA 2X09A 3MKKA 3CPUA 1UOKA 3SIMA 5D8WA 1CXEA 1G1YA 3MO4A 1PX3A 4P7NA 1E56A 2WMIA 2VUYA 4OJYA 4H41A 4CU6A 3TA9A 2FHCA 4GQRA 4QCFA 5AC4A 2GUYA 2BFGA 2D23A 2D22A 1G9HA 1L8NA 2ZXDA 5E0FA 3VOCA 2FDMA 1PZ2A 1E6SM 3U7VA 2VCBA 4PMRA 4DUWA 4JFUA 4U5IA 2DT2A 1CPUA 5IFTA 1D7FA 1US2A 3KEHA 4M56A 2VQTA 2DSUA 1CEOA 2J7GA 1J01A 2QF8A 5BYWA 3SCPA 2YA1A 4GPNA 4Y7EA 3K8LA 3M6DA 1ISXA 4UFKA 1GHSA 3CZEA 5JIPA 3B9AA 4ACYA 4J3XA 1CXLA 4EK7A 1IV8A 3WDJA 4W8AA 2WVVB 1DWIM 4QLJA 3SUUA 2WHJA 4WSKA 3SCNA 4CN4A 1OSEA 1M04A 2NT1A 4V2XA 2BY1A 1TCMA 1EDTA 3M7SA 2J7DA 3WQWA 2VZOA 1UHVA 4PSPA 8CGTA 1ZB5A 3UETA 1WP6A 3ARVA 4M80A 4S3JA 2D20A 5DF0A 2JF7A 3KE0A 4LPCA 4ZENA 2XIIA 3WNPA 1UD4A 1KGUA 2J4GA 1WDSA 5A2BA 5D9OA 1FP8A 4N42A 1B31A 3L2LA 2D1ZA 3TOPA 3W29A 2AOSA 2YA0A 2J7CA 1OT1A 1EHNA 2X0HA 1F4AA 2EBNA 3VD4A 2JIEA 1OIFA 1E0WA 2G3MA 3W25A 2UY4A 4D6GA 5A6JA 1JDAA 1WDRA 3WH9A 2ZWZA 1QHPA 3OLEA 2E3ZA 1MXDA 3ARYA 2AMGA 1BYDA 1JD7A 1QNQA 5EFDA 4CN1A 1CWYA 3G6MA 4P8XA 5ABHA 2HISA 2YIHA 1K9TA 5LA1A 3ARPA 4GI8A 1KGWA 3AZRA 1O6IA 5CLTA 2EPOA 3T0DA 1V3HA 5DT7A 4P7OA 2GJXB 4U3CA 5BXTA 4U5KA 1NM9A 5FD0A 2VR5A 3AMDA 1BPLB 3MMDA 1V0MA 5IHRA 1WCGA 3MU7A 5HBFA 5E70A 4PTMA 3CUIA 3PBGA 4R5EA 3D5HA 2OYLA 3J7HA 5DO8A 3F4VA 1WKYA 2EPKX 3M46A 4F9DA 3O6AA 2CBVA 4P7LA 3DYPA 4GINA 4C7DA 3TP4A 1H4PA 3IK2A 3AIWA 2CPUA 2FGLA 4F9JA 1LQ0A 5D9MA 5I2UA 4ZXLA 3DYMA 2VX4A 2X1IA 1V6VA 2VX7A 3ZT5A 2BS9A 4UQBA 1GVIA 4K68A 5A95A 3BAIA 1CXIA 3WN6A 3B8SA 1WZLA 4J3SA 1E1EA 4H8VA 2XFFA 2G3IA 1XSKA 1UZ1A 1LG2A 1HL9A 2WVVA 2GSJA 4PTVA 4BQ2A 1NOFA 3PN8A 1UR2A 2V5DA 3JUGA 3VIMA 5A8PA 1TVPA 1SYTA 4CCDA 4TUFA 2CIPA 3NJ3A 1E6ZA 2J7HA 1B9ZA 4OIFA 1CECA 3F5LA 4GZEA 2FHBA 4Z2HA 1HT6A 4PCTA 3PZIA 4P8UA 1XRVA 4LYRA 5C8BB 5IXEA 2CKRA 3IJ7A 5D8ZA 2CBJA 4URIA 3ZSTA 2DSZA 4X0VA 4WKHA 2OYMA 1V3MA 2XM2A 3EBVA 1W1VA 1GQLA 1UR4A 3DC0A 1NH6A 2CHOA 1E0XA 1JYVA 3DHUA 1DP0A 2BY2A 4LQ1A 4DUXA 1QI0A 1UQYA 1GJUA 4AZ6A 1V02E 2C8NA 4LGXA 1M53A 3E1F1 1BYBA 4MNMA 1E6RA 1GJWA 4B3KA 2G3NA 2WC3A 3VGFA 1E6NA 3CZGA 3VO0A 2O9TA 4UQCA 1JXJA 4FZPA 2WM0A 3WH5A 1HJSA 3WF0A 1V0NA 2CITA 4HZ7A 3L2MA 3ARRA 3UR7A 3EMQA 3OIHA 1K9DA 1JFHA 4C7FA 1BTCA 4AISA 1H09A 4D71A 1KBBA 1B2YA 1NOWA 2D0HA 3KL0A 2BY3A 1UKOA 4KRUA 1WO2A 3VGDA 5A2CA 4TX6A 5BRPA 3CIVA 1JD9A 3LMYA 3I3BA 4BQ4A 2YLAA 1VEOA 1ZU8A 3ZJKA 2VZUA 5DT5A 5DEZA 3VMNA 1TUXA 2ZX9A 2VJXA 2DH2A 4NSBA 1KXHA 4UOQA 1H0GA 2WLZA 5A6MA 3GM8A 3MANA 1KFWA 3AHYA 2DGAA 3VIJA 3WMSA 1M7XA 5AC5A 4KMQA 3MV11 2A3AA 3CZKA 2W67A 2PMRA 2WCSA 3AIQA 3CHDA 2WMGA 1NWRA 4DM2A 2J8FA 1XCXA 4UZUA 2E4TA 1GOKA 4JCLA 4AZ5A 5GNYA 3M07A 4Z2JA 4PYSA 3VMPA 4GIAA 4PN2A 1GCYA 1TE1A 1OWQA 4EAMA 4P7RA 1UWSA 3EDJA 1E73M 2XWDA 2XFRA 5D9NA 2WAGA 2V38A 1XCWA 1FOBA 3AXXA 5CPTA 4W7UA 1D3CA 1KB3A 2V3FA 3EDKA 1H11A 3VIGA 1TG7A 4D6FA 2QMJA 1PJ9A 3WH8A 3MMUA 4PEEA 1KCLA 3GXMA 4X0NA 1E6XM 3SCWA 3N13A 4AIOA 5JUVA 4PUEA 3AYRA 5LA2A 5A69A 2VO5A 2V3GA 3AIUA 3RJYA 4QCEA 5I3DA 1BVZA 1L0PA 4X9YA 1FP9A 1K9EA 3VIIA 1J0JA 1JZ2A 4UOJA 1VJZA 4IPNB 4JAWA 1FFRA 1QOXA 5FCZA 3WH7A 1PZ3A 1LL6A 2YDRA 2WZHA 3QHMA 4D6EA 3PTKA 4HTYA 3WD2A 2QPSA 1UG6A 4U2ZA 4XV0A 5KZ6A 3THDA 1K6AA 1JYNA 2VT0A 2RGLA 4B9YA 4BS0A 3WFLA 4CU7A 2BHYA 3BCFA 1DWFM 1H41A 3PZNA 3CLWA 1JFXA 1NQ6A 3CO4A 1WAWA 2Z1SA 1EXPA 3U57A 3FW6A 1JZ5A 1U30A 2DIEA 1HP4A 4AIUA 1LWJA 1ZBVA 2WYSA 2UY2A 4TVUA 2WMIB 2PWEA 4B15A 2XHYA 1QNSA 4OOUA 1HX0A 2CYGA 3TONA 3AS0A 1KQYA 1QHOA 1PX8A 4CVUA 3OGSA 4L4OA 2VOTA 5E6ZA 4JIEA 1J11A 3VIFA 2VZSA 2PBGA 2OWCA 3BGAA 1Q6GA 1V6UA 2ZXAA 2C0HA 3BMWA 4H8HA 4CD8A 1CGXA 4PMUA 4JFSA 4V27A 1OGBA 1XYZA 4HP5A 1VRXA 1NARA 4W93A 1UKSA 2J79A 3WNOA 3L4YA 3GNOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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