149LA

Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNLFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed rcsb
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1994-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 149lA00
1D9WA 205LA 1QS9A 1L49A 3DKEX 1D3JA 185LA 4W57A 2RB0X 3HUQA 1JQUA 1SWYA 1L18A 144LA 1C67A 195LA 1L17A 212LA 1SX2A 196LA 1OWYA 1P37A 1QUDA 1OWZA 2HUMA 4EKRA 2CUUA 3C7WA 1LYFA 2RBRA 2OU9A 1CV5A 1L71A 4I7PA 1L45A 3SN6R 120LA 1OVHA 1L40A 238LA 1L47A 2NTGA 139LA 1PQKA 177LA 250LA 3FA0A 243LA 1LGWA 1C6CA 1C6AA 3DN2A 169LA 1C6HA 1P3NA 3NY8A 1L88A 4EJ4A 2B72A 4W53A 3PBLA 1CV3A 1L10A 1C65A 141LA 1L92A 1L37A 4ARJA 155LA 1L55A 2RH1A 1L60A 131LA 1L43A 1P6YA 1ZURA 4I7NA 1CU3A 1L38A 1T97A 2HUKA 122LA 3OE9A 1L22A 1L57A 1L29A 1L31A 3DN0A 3D4SA 3VW7A 1L96A 1C64A 4I7OA 1WTHA 152LA 1L44A 2RB2X 1L03A 1L27A 2OU0X 1CV6A 149LA 3NYAA 156LA 1QUGA 184LA 163LA 2OE7X 4PJZA 1CTWA 255LA 1KY0A 2NTHA 1XJTA 3SB8A 4DKLA 176LA 3C80A 1I6SA 1C6LA 1CVKA 162LA 1KNIA 1G0KA 1QTZA 222LA 3GUNA 1QSQA 3GUKA 157LA 1D3FA 3OE8A 4ARMB 104LA 1L64A 3C81A 1NHBA 4PK0A 1LGXA 1QT3A 2A4TA 1L50A 1L02A 127LA 1L20A 1L51A 3RZEA 1B6IA 1L89A 3DN6A 2OU8A 4YXAC 108LA 1DYBA 1C6QA 3SBBC 2QB0B 2B6WA 1QS5A 3OE6A 1KS3A 3L64A 1G1VA 4EKPA 1L58A 218LA 3HTBA 7LZMA 4I7QA 4K5YA 1L30A 3F9LA 2OEAX 3RUNA 257LA 1CU5A 1L80A 1L62A 1L19A 3HU8A 1L68A 192LA 3HT6A 3HTFA 209LA 254LA 1G0PA 102LA 4LDOA 1LYJA 206LA 4W52A 3SB9A 175LA 3HDFA 1LYGA 1SX7A 1PQOA 211LA 2OTZX 4GBRB 186LA 2B6TA 1KY1A 1L04A 2RAYX 4I7MA 3DN1A 189LA 261LA 2RBPA 1L85A 4I7KA 181LA 1KW5A 4ARPA 3HH4A 253LA 2B74A 1L33A 1G1WA 143LA 1L32A 3GUMA 210LA 1L34A 4E97A 3SB7A 1C6TA 213LA 229LA 2LC9A 3C82A 145LA 3G3VA 1PQJA 1QSBA 1DYEA 3SBAA 3C8QA 1L82A 1L28A 1JTMA 1QUOA 178LA 3HT7A 2B6YA 137LA 1C66A 109LA 1QUHA 1G0GA 1L36A 248LA 180LA 4DAJA 252LA 1L75A 1L16A 237LA 227LA 4ZPUA 197LA 3C7ZA 1P7SA 3LZMA 3V2YA 1L59A 1CV1A 2ANXA 2RBSA 146LA 1C6JA 1QTDA 1LYDA 1D2YA 256LA 115LA 220LA 2F32A 2Q9EA 3G3XA 1C62A 123LA 1L86A 3HH6A 2HULA 4LZMA 241LA 1CU0A 118LA 4OO9A 231LA 3OE0A 2B6ZA 1QT4A 1P5CA 2O79A 245LA 110LA 1C6GA 3HU9A 1L87A 1C69A 1C68A 1LGUA 1C6MA 1G0JA 3HT9A 1LI2A 1C6EA 1ZWNA 1G06A 1CV0A 4ARLA 1L24A 3CDTA 2ANVA 4EPFA 1D3MA 1DYDA 1K28A 1L91A 230LA 2F2QA 1D2WA 128LA 219LA 1L98A 1C6BA 4I7TA 1OVJA 1C60A 113LA 247LA 183LA 148LE 1L77A 1L72A 1L76A 1L01A 3C83A 3CDOA 4DJHA 1D3NA 258LA 1L41A 168LA 1LW9A 198LA 2OTYX 1SWZA 4W54A 1QTBA 1SSYA 1XJUA 2B7XA 1EPYA 1L84A 216LA 1KW7A 3PDSA 1L81A 158LA 3HH5A 6LZMA 246LA 111LA 244LA 4ARMA 3GUPA 187LA 1L74A 3DN4A 1L90A 2O4WA 1L65A 1LI3A 4ARQB 1L00A 3HTDA 166LA 103LA 236LA 242LA 201LA 1QT8A 114LA 1CX6A 1DYAA 1L14A 1L46A 1L15A 1LI6A 172LA 1L06A 3ODUA 4LDLA 3DNAA 4EKSA 4I7LA 4S0WA 1LPYA 1L73A 221LA 3V2WA 1L23A 159LA 214LA 2RBOA 1L99A 2O7AA 1P2RA 112LA 1T8AA 160LA 1L94A 4YX7C 164LA 1L13A 1LLHA 1L0KA 1QT5A 4AQNA 3DN8A 1G0MA 1L21A 1QT7A 2RBNA 1G07A 259LA 1QTVA 1SSWA 260LA 1P36A 1PQDA 4W51A 126LA 182LA 3GULA 3C8RA 2LCBA 2OE4X 224LA 1L0JA 4EKQA 119LA 2B75A 3HTGA 3GUOA 2IGCA 1LWGA 3SB6A 190LA 107LA 3G3WA 1L56A 2Q9DA 3DMZA 3QAKA 3DMVA 1T8FA 1C63A 2B6XA 3JR6A 3HT8A 1C61A 228LA 1JTNA 1OV5A 1DYCA 226LA 1G0LA 165LA 1L54A 1L70A 1DYFA 215LA 3GUJA 1L97A 125LA 233LA 232LA 3DN3A 4IAPA 1C6KA 2RAZX 1P46A 2L78A 1ZYTA 3L2XA 1L63A 4W56A 1CX7A 1XEPA 1L52A 1L83A 1L53A 2B70A 174LA 1L08A 1L12A 4I7RA 235LA 1C6NA 5I14A 1CU6A 1G0QA 4W59A 251LA 1L93A 1P64A 161LA 1L48A 1L66A 1P2LA 3FI5A 1P56A 3UONA 1L05A 188LA 1L11A 142LA 1L79A 173LA 2RBQA 3HWLA 2OE9X 3K2RA 3FADA 1QTHA 1C6IA 4YXCA 3HH3A 262LA 3HUAA 4GRVA 129LA 3DMXA 3CDQA 2QARC 4LDEA 3CDVA 1LYIA 147LA 1DYGA 3GUIA 1L95A 4I7SA 3CDRA 217LA 1L26A 1OVKA 4W55A 171LA 223LA 3NY9A 3F8VA 140LA 1L42A 2B73A 150LA 3C7YA 4W58A 167LA 2RB1X 4I7JA 1LYEA 1L35A 5LZMA 1L25A 225LA 1L07A 1L61A 200LA 1PQIA 1C6FA 2LZMA 3HDEA 239LA 1LWKA 1L69A 240LA 2Z6BA 3EMLA 1L09A 199LA 1OV7A 1QT6A 151LA 1L67A 3SB5A 1CV4A 3C8SA 191LA 1CUQA 1CUPA 2F47A 130LA 1LYHA 1C6PA 249LA 4EPIA 1PQMA 170LA 1L39A 1OYUA 234LA 1T6HA 138LA 1CU2A 1C6DA 1T8GA 4ARQA 4EXMA 1TLAA 3HUKA 1QTCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D9WA 1GFEA 3G3AB 5KXNA 2HU1A 5L9JA 1NQIA 3DKEX 1D3JA 1GE4A 4WO6A 1JQUA 4XN6A 1REZA 2H9JA 1IP6A 144LA 1C67A 4DDAA 196LA 1OWYA 4LYOA 1LHHA 1CV5A 4GN3A 2EPEA 1LSEA 4I7PA 2ZYCA 5L3HA 1L40A 5LAFA 1L47A 1EQEA 3TXBA 2ZILA 1PQKA 177LA 3BKHA 250LA 5A3EA 3DN2A 1IR7A 3NY8A 1LMQA 5KKJA 4O34A 1VEDA 1L92A 5JENB 1L55A 1GFRA 1YKXX 1L43A 1LZDA 1ZURA 2FBDA 4TWSA 2HTXA 3OE9A 1L57A 1LPIA 2MEHA 3D4SA 1AT5A 3VW7A 1C64A 4I7OA 4C5FA 3KAMA 2DKVA 2D91A 3B6LA 4LYCA 3GXKA 4ET9A 184LA 1AT6A 1GPQC 4NSJA 2NTHA 1XJTA 1I6SA 1KNIA 3GUNA 3GUKA 1XGUC 3C81A 5FEKA 1L50A 3A92A 2LYOA 1L02A 4H9EA 4YXAC 2HUBA 3WU8A 2FBBA 2XJWA 4DQ5A 1QS5A 1G1VA 2MEIA 4EKPA 1GBYA 1GF5A 1C7PA 153LA 1LSBA 4N1EI 257LA 1XGRC 1L62A 1L19A 1B7QA 2BAAA 3A6BY 3HT6A 3A8ZA 209LA 254LA 1YAMA 135LA 5APDA 4DQJA 102LA 1LYJA 4N0JA 3LYZA 1GAZA 1LZ4A 1RJCB 1OUEA 3HDFA 1SX7A 5HQ1A 186LA 1KY1A 4HTNA 1LZYA 4I7MA 2ZYPA 1L85A 5I4WA 181LA 1IR9A 2B74A 1G1WA 4WM3A 3TMVA 143LA 3GUMA 3GXRA 5KXXA 1IY3A 213LA 229LA 3C82A 145LA 3P68A 1QSBA 4YOPA 1DYEA 3SBAA 1YKYX 1JJ3A 2DQHY 5ILFA 4KT3A 1OUJA 248LA 180LA 1DI3A 1LCNA 227LA 2HU3A 2ZQ4A 1HNLA 3WH1A 2MEDA 1CV1A 1B5UA 2RBSA 1QTDA 1IP4A 1AM7A 4U3XB 5LVIA 2F32A 5KXLA 1GFJA 123LA 3HH6A 4NGLA 118LA 1TDYA 4OO9A 231LA 2B6ZA 1LKRA 245LA 3HU9A 1C6GA 1L87A 4P2EA 4H90A 1G7MC 1C68A 3J4GA 3HT9A 1C6EA 2BQEA 2Z2FA 1B2KA 1V7TA 4W94A 2I6ZA 1LHLA 5LYZA 4EPFA 6LYZA 1GE0A 1QIOA 1FN5A 1NWGA 1L98A 2BQHA 2G4PA 1XGTC 4I7TA 4OWAA 113LA 1UUZC 3C83A 4XADA 4DJHA 5KXKA 3AB6A 1UIAA 3AGIA 3A34A 198LA 4BAFA 1LMAA 1QTBA 5KXTA 2B7XA 2MECA 1EPYA 1L84A 4NGIA 1KW7A 3B72A 5LINA 2A7DA 3WPJA 111LA 1BWIA 1LJIA 3QY4A 1L74A 3DN4A 1L90A 2O4WA 4DDCA 2C8PA 1LZTA 2YVBA 1DYAA 1LZAA 172LA 4ETBA 4Z3MA 1FLQA 3A67Y 5LIOA 3AGGG 2Z2EA 3DNAA 5B07A 1B7RA 2Y8PA 1LPYA 5B1FA 1L23A 159LA 1L99A 194LA 2O7AA 4NGWA 3W3EA 2BQCA 1GF3A 112LA 4YX7C 1L94A 4I8SA 1F10A 4WM2A 3TXJA 4AQNA 4XJHA 3TMXA 1G0MA 1QT7A 1GF9A 2RBNA 1G07A 3P65A 3RU5A 1SSWA 260LA 3TXKA 2ZIJA 4HJVA 1IY4A 2OE4X 224LA 2B75A 1RFPA 2IGCA 3SB6A 4DD9A 107LA 4ML7A 3TXHA 1L56A 3DMZA 2H5ZA 3M3UA 1IWXA 3JR6A 3TXIA 1B7MA 1GB9A 1JTNA 1WQMA 165LA 2D4JA 1DYFA 2BQOA 1L97A 125LA 3DN3A 3WVYA 1GAYA 1L63A 1XEPA 1GFGA 2B70A 1L08A 3AZ7A 1C6NA 4HSFA 5EBHA 3ZVQA 1J1XY 1CKFA 4BADA 1L93A 1QQYA 1NBZC 1YILA 3EXDA 1JISA 1P56A 188LA 1IWTA 3LYOA 173LA 4D9ZA 3RNXA 4LZTA 1B5YA 1QTHA 1XGQC 1C6IA 1B7LA 2WARA 1GB8A 4J0LA 3G3BB 129LA 1BB6A 4LDEA 3CDVA 2C8OA 1JJ1A 1F6RA 1IOTA 1HFYA 193LA 3CDRA 4B1AA 3SP3A 4NG8A 171LA 3F8VA 1RE2A 1IEEA 3C7YA 167LA 2CDSA 4W96A 1LYEA 1L35A 1LZCA 225LA 1L07A 1L61A 1A4VA 4J1AA 1P2CC 4GN4A 3EMLA 4GCBA 199LA 151LA 1HSWA 1F0WA 3SB5A 1CV4A 1GBWA 1CUQA 1CUPA 4DD0A 1XEIA 1LYHA 1C6PA 1L39A 1OYUA 2NWDX 1DXJA 1T8GA 2BQGA 1NHEA 3WVXA 4ARQA 3P64A 4EXMA 1TLAA 2I26L 2BQIA 4QGZA 2Z38A 1HC0A 1INUA 1LZSA 1L49A 4EMNA 1JKCA 5LA8A 4WOAA 4W57A 1CKCA 2RB0X 1L18A 1LTMA 4H1PA 3TMUA 4MSTA 1GB3A 1L17A 4M6DA 1SX2A 1TCYA 1RCMA 1OWZA 4EKRA 2CUUA 4OWCA 2OU9A 5IELA 1LSGA 1MLCE 2MEGA 1XSFA 5KXRA 4NFVA 1OVHA 4IASA 1GF6A 1LGWA 1C6CA 1LJEA 4ET8A 1C6HA 1LJ3A 1LJJA 5APCA 2B72A 4ETEA 1UIEA 1L37A 155LA 1PS5A 1L60A 131LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1D9W A;  1GFE A;  3G3A B;  5KXN A;  2HU1 A;  5L9J A;  1NQI A;  3DKE X;  1D3J A;  1GE4 A;  4WO6 A;  1JQU A;  4XN6 A;  1REZ A;  2H9J A;  1IP6 A;  144L A;  1C67 A;  4DDA A;  196L A;  1OWY A;  4LYO A;  1LHH A;  1CV5 A;  4GN3 A;  2EPE A;  1LSE A;  4I7P A;  2ZYC A;  5L3H A;  1L40 A;  5LAF A;  1L47 A;  1EQE A;  3TXB A;  2ZIL A;  1PQK A;  177L A;  3BKH A;  250L A;  5A3E A;  3DN2 A;  1IR7 A;  3NY8 A;  1LMQ A;  5KKJ A;  4O34 A;  1VED A;  1L92 A;  5JEN B;  1L55 A;  1GFR A;  1YKX X;  1L43 A;  1LZD A;  1ZUR A;  2FBD A;  4TWS A;  2HTX A;  3OE9 A;  1L57 A;  1LPI A;  2MEH A;  3D4S A;  1AT5 A;  3VW7 A;  1C64 A;  4I7O A;  4C5F A;  3KAM A;  2DKV A;  2D91 A;  3B6L A;  4LYC A;  3GXK A;  4ET9 A;  184L A;  1AT6 A;  1GPQ C;  4NSJ A;  2NTH A;  1XJT A;  1I6S A;  1KNI A;  3GUN A;  3GUK A;  1XGU C;  3C81 A;  5FEK A;  1L50 A;  3A92 A;  2LYO A;  1L02 A;  4H9E A;  4YXA C;  2HUB A;  3WU8 A;  2FBB A;  2XJW A;  4DQ5 A;  1QS5 A;  1G1V A;  2MEI A;  4EKP A;  1GBY A;  1GF5 A;  1C7P A;  153L A;  1LSB A;  4N1E I;  257L A;  1XGR C; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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