4NHQA

X-ray structure of the complex between hen egg white lysozyme and pentachlorocarbonyliridate(iii) (5 days)
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Interaction between proteins and Ir based CO releasing molecules: mechanism of adduct formation and CO release.
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4nhqA00
4WMGA 4DC4A 4Z41A 1IWVA 3E3DA 4U3XB 2HU1A 4DD1A 1C43A 4HTNA 4QGZA 4QEQA 3CT1A 1GWDA 2NWDX 3LZTA 4GN5C 1AT5A 1JWRA 3WL2A 1BVXA 3CB7A 3B0KA 4J1AA 3AZ6A 1J1XY 1BGIA 1GFAA 133LA 3WVYA 1AT6A 1HENA 1JTOL 2BQBA 4FJRA 4GCFA 5KXYA 3VWOA 1LJJA 1LZYA 1IY4A 3A96A 1HEWA 1BHZA 2ZYCA 1EQ4A 1LZ5A 3AZ4A 3W6DA 4TX7A 2D4KA 3ZEKA 5I54A 4IATA 1OUDA 4PPOA 3WXUA 5LYTA 1IR9A 1BB3A 1HFYA 1OUEA 2Z37A 4AGAA 5M1YA 3W6AA 1GFGA 5E4PA 2BQDA 2MEEA 1LZAA 1BB6A 1YKZX 2AUBA 2DQDY 1IO5A 3OK0A 1JJ3A 207LA 4UWVA 4II8A 5LIOA 5II3A 1GBOA 5L3HA 1I56A 5APCA 4N5RA 1JKAA 4DD0A 1LJEA 1CJ8A 5I4WA 1GF0A 3A93A 5FSTA 7LYZA 3LZ2A 2DQCY 5APDA 5KXMA 1XFPL 1JTTL 4NGJA 4WLXA 5DL9A 1SLYA 1YANA 4NSGA 1HC0A 1FN5A 3HBEX 5LYZA 153LA 1GB2A 1WQMA 208LA 3HFMY 3GXRA 1IWTA 3T36A 1GF6A 3TXIA 3SP3A 1BWHA 4NGYA 4P2EA 1LOZA 2FYDA 4KPMA 4OWHA 2MEFA 1REXA 1JSEA 4NGIA 1CKFA 1J1PY 1LSNA 5FCPA 4YM8A 3TXJA 1HFZA 2VB1A 2Q0MX 5B05A 1V7SA 5KXSA 1A4VA 1NDGC 4GCCA 1YQVY 4XJDA 4LT3A 1QSWA 3P68A 4DD3A 4WM3A 3A92A 1LZ4A 1GFVA 5DN4A 1CKGA 1LZDA 1LMAA 4XJGA 4DT3A 3A8ZA 4PJ2C 154LA 4NIJA 5KJ9A 1CJ9A 4NGKA 1B7MA 1B7LA 1LSGA 1I20A 1FDLY 1YL0X 2BQHA 4NSJA 1BWIA 1G7HC 3LYOA 4LT0A 3W6FA 1J1OY 1B7OA 4H90A 3A6BY 1QSAA 5KXLA 1CNSA 1LZBA 3J4GA 2XBRA 1GDXA 1HERA 3IWRA 2LYMA 2HECA 5F9UA 3F6ZA 3AW7A 1JKCA 5KKIA 3RU5A 1IWXA 1JPOA 1LYSA 1UIGA 1N4FA 4WL7A 5AMYA 4NHPA 1XEKA 2ZWBA 4GLVA 1LHMA 1XGQC 2FBDA 1UC0A 2ZIJA 5KXRA 4GN4A 3WUNA 4DDBA 4TSCA 1LMNA 2ZQ4A 2I6ZA 3AW6A 4OWAA 1VEDA 4HTQA 1RFPA 2MEGA 4WG1A 4AXTA 1DPWA 1IORA 2F30A 1GPQC 1C45A 3A34A 3ULRA 3QE8A 3IJVA 2BQOA 5ILFA 2H9JA 4H9CA 1XGUC 2MEDA 5APFA 1HELA 3OJPA 5KXXA 3EMSA 1IWWA 1GFRA 1IP5A 1QDRA 4G49A 4NSIA 4H91A 4GCBA 1BB7A 1YILA 3FE0A 1HEQA 3B0OA 4H8YA 4RW2A 4NGVA 3TXBA 1LMQA 1IOTA 1PS5A 1A2YC 4LT2A 4G9SA 1F6RA 4XJBA 1LSBA 2ZQ3A 1LZGA 4G4BA 4H9HA 4NG1A 1UA6Y 4NGOA 3M18B 4XJHA 4WM1A 1UACY 5IDDA 2EPEA 3G3AB 1XGRC 1YL1X 2I25L 3WU7A 4H1PA 1BWJA 4NHIA 4M6DA 4ZIXA 3EXDA 1B5XA 3CSRA 4HJZA 4PHIA 1IP1A 2F2NA 3B6LA 3GXKA 4XADA 1IP4A 1DZBX 4EMNA 3A94A 2BQKA 135LA 3KAMA 5I4YA 4LYMA 5LAFA 2G4NA 1AKIA 2W1LA 4B4EA 1LZ8A 1GF4A 4DDAA 1F0WA 4RLNA 1HHLA 2CGIA 2DQHY 1QUSA 1LHHA 3TMXA 4OOOA 4FDYA 2W1MA 5LINA 5FHWA 1B7RA 5B07A 4HV2A 1G7MC 3LYTA 4LZTA 4N9RA 4XJFA 1VDSA 4DD9A 1GD6A 1UIEA 1FKVA 3N9AA 1C7PA 4KT3A 4PGJB 5LVKA 1IY3A 4KL7A 1OUAA 2BLXA 2G4PA 1KXXA 1LZ6A 2XTHA 5L9JA 2HTXA 3HBHA 1OUIA 4YOPA 1YAMA 4N8ZA 1LJGA 4N0JA 5APEA 5J7CA 1GB6A 1JKDA 2XJWA 3TMUA 1GE0A 1JITA 1D0MA 3EO5A 4H94A 3ZVQB 2DQJY 3TXDA 1FBIX 1B5VA 4B4IA 4ETAA 1XGTC 5LVGA 5A3EA 4RLMA 2H9KA 4LYBA 4RW1A 5C6JA 4BAFA 1NDMC 4HP0A 1LSZA 1GBYA 1D0KA 3WPJA 1QDTA 2D4JA 1B5YA 2Z18A 1GF5A 1AM7A 1EQ5A 1HEPA 2YBIA 3RNXA 3WVXA 1GAZA 1LJFA 4R0FA 4OWCA 1IP6A 2YBHA 1Z55A 5EBHA 3QY4A 3A91A 1GB7A 1D6QA 1B0DA 2A7DA 5LVIA 1IC5Y 2BQEA 1G7IC 1ZMYL 2YSSC 1ALCA 1BQLY 3WPKA 1LJNA 3TXHA 1GBSA 2DQEY 3D3DA 4GLAA 5LVJA 1WQQA 1TEWA 4J7VA 1QQYA 1GFEA 4HTKA 1KIQC 4MSTA 4WM2A 1LSYA 3CQLA 4DYGA 4B4JA 1YIKA 2D91A 1IIZA 1FLUA 5DN5A 1LCNA 1DQJC 2Z39A 3A3RX 2HEFA 4H93A 1LSEA 1WQNA 2GV0A 1UIBA 4IJ4A 1D0LA 1LMPA 5KXKA 134LA 1IP7A 1AZFA 1KIRC 4N1CC 3D9AC 1YAOA 193LA 1C08C 5D5FA 1IC4Y 4PRUA 1FKQA 4XN6A 1LMCA 1DPXA 2Z38A 4D9ZA 1GFJA 1GF9A 1CJ6A 3A3QA 1LJKA 1HEOA 1GF3A 1HMLA 1LJ3A 2ZNWY 4LYZA 2MEIA 1B7NA 3AGIA 1B9OA 4MR1A 1BB5A 4ML7A 4TTDA 1OP9B 1JHLA 1IC7Y 3A95A 3TXEA 2BQFA 1GFKA 4LFPA 1MLCE 4DD2A 5A3ZA 1WQOA 3WUMA 1LYZA 1REMA 1HNLA 2XBSA 4OWBA 1CJ7A 1IEEA 5ILCA 1GE1A 1WQPA 1NMMA 4J0LA 2LYOA 1JTPL 1LMOA 5F81A 1NWGA 4B1AA 8LYZA 1UIDA 2LHMA 1G7JC 4NHTA 6LYTA 1IWZA 5HMVA 3CSQA 2YBMA 1FLWA 3P65A 4A7DA 1LSAA 3A90A 4X3BA 2ZIKA 3W6CA 1WTMA 1IP2A 4HV1A 4QY9A 1GB5A 2Z12A 2YBLA 1IVMA 3B72A 3W6EA 1GXV2 1RCMA 4TUNA 2DKVA 5K7OA 1EL1A 1UUZC 2BQLA 1LSFA 3AZ5A 3P4ZA 2DBTA 1IR7A 1MELL 1B7PA 4NEBA 4NSHA 3HBDA 1HFXA 2BAAA 4CFOA 1UIHA 3LYMA 2ZNXY 1UICA 1YKYX 1XEJA 4TSBA 5FELA 1F10A 1W6ZA 3N9CA 1FLQA 4I0CA 4NHQA 5B1GA 1IOSA 1LSMA 2F4GA 5T3FA 1ZVHL 4Z98A 1T3PA 3WW5A 4OW1A 1VDQA 3LYZA 2CDSA 1GBXA 1JJ0A 1GDWA 1LSDA 4G4CA 3A6CY 4NY5A 5IHGA 2PC2A 2ZILA 132LA 5F16A 3WMKA 1I1ZA 2D6BA 2D4IA 2BQMA 1NQIA 3WYHA 2FBBA 3P66A 1G7LC 1VAUA 1XGPC 1YAQA 4C3WA 5KXTA 4EOFA 1GBWA 1WVUA 3TXKA 5HMJA 4HSFA 4WLYA 1LZTA 3IJUA 5KXWA 4G4HA 1GB8A 1OUFA 1LSPA 4NG8A 2DQIY 4CHXA 4O34A 1NF5A 1UCOA 1H87A 2Y8PA 3WU9A 4H9IA 1REYA 3B0IA 1DXJA 1JISA 4XJIA 1T6VL 1LPIA 4TWSA 1DI4A 2BLYA 5DM9A 3WU8A 2Z2FA 2CWIA 2YDGA 1CKHA 4YF2A 5C6LA 4IASA 4M4OA 1HF4A 3N9EA 1IWUA 1W08A 2DQGY 4UWNA 1VFBC 4LGKA 4UWUA 1HSWA 1TBYA 1GFUA 1LZ9A 3AYQA 4WL6A 4LT1A 2BQJA 2FYCA 1LZRA 3ZVQA 2YBNA 2G4QA 4QDNA 2BPUA 1GEVA 2Z19A 4J1BA 3ATNA 1JKBA 5FDJA 1GEZA 4RDSA 4ET9A 1LHJA 4PRQA 5F14A 1GE4A 1JIYA 1D6PA 2MEAA 4ET8A 1LYYA 2W1YA 5HLLA 1FLYA 5D5CA 3WPLA 1KXWA 1NBYC 1OUCA 1EQEA 1JSFA 1P2CC 2BQCA 2MEBA 2MECA 4GN3A 4H8XA 4LFXA 4CGEA 1C46A 4LYTA 2CJLA 2N5ZA 1VDTA 4L41A 3EBAB 4ZFPA 1LKSA 1RJCB 1DI3A 5LA8A 3BKVA 1IP3A 1HSXA 3LN2A 4ZEEA 4WO9A 4H92A 1V7TA 1VDPA 3AB6A 2BQGA 1E8LA 5KXNA 3LHMA 5DLAA 4NWEA 1JJ1A 1XEIA 2H5ZA 4ETDA 1CKDA 4B49A 3RW8A 1GBZA 2HEDA 1IR8A 3AZ7A 4GCDA 4H9BA 4WO6A 4CJ2A 3RZ4A 1LKRA 2ZYPA 4NFVA 1NHEA 5KKJA 4MCKA 1GB3A 1KXYA 1LZ1A 3K3TA 1B2KA 3MGWA 1OUJA 3P64A 1QTEA 4H8ZA 1LHIA 4BAPA 1VATA 1TCYA 4KXIA 1QIOA 4DWXA 2MEHA 4R6CA 1B5ZA 2A7FA 4YEMA 5IELA 4WM6A 2F4AA 1GB9A 2BQAA 2HEEA 3W3EA 1GHLA 1QUTA 1DI5A 4C5FA 9LYZA 4I8SA 1GXXA 2B5ZA 1OQMA 4H9AA 4WOAA 1GB0A 1GF8A 5B59A 1WQRA 3TXGA 2EKSC 2DQFC 4NGZA 4Z3MA 3TXFA 1LHLA 3ATOA 3CT0A 5LVHA 1UIFA 4BADA 4GCEA 4YENA 4XYYA 1C10A 3M3UA 1BB4A 1DKKA 5HQ1A 5I5QA 1IOCA 4HJVA 4DDCA 1TAYA 1LZCA 1LTMA 2C8OA 3CT5A 2LYZA 2HEBA 1OUGA 2HEAA 3AGHA 5L3IA 3W6BA 1LHKA 3RT5X 1DKJA 1HEMA 4HJYA 1GAYA 1LYOA 1GFHA 1LMTA 1CKCA 1LZSA 2EQLA 2IFFY 5B1FA 5KY1A 2W1XA 2BQIA 1LJHA 4OWEA 194LA 2Z2EA 1H6MA 4ETEA 3G3BB 1JEFA 1GF7A 1LAAA 2EIZC 1SQ2L 1XSFA 4WM5A 3WUAA 2LZ2A 4B0DA 1YAPA 4LYCA 4HPIA 1YKXX 4ETBA 4W96A 4YEOA 5KXZA 5B06A 1BVKC 5I53A 3WH1A 4BS7A 1GE3A 2HUBA 1JUGA 2DQAA 1HMKA 4NGLA 4WLTA 6LYZA 3QNGA 4WM4A 1REZA 5F9XA 3WULA 5LA5A 5E9RA 1B5UA 1LZEA 5LXWA 1IWYA 1D9UA 2HU3A 4CFPA 4N1EI 5HNLA 5HNCA 1ZVYB 3TMWA 4DD7A 1OUHA 3AGGG 3J6KA 1IOQA 1KIPC 1QTKA 4W94A 4NGWA 2WARA 1B7QA 4WG7A 2LZTA 4H9FA 5KXPA 3WW6A 2YBJA 5LAGA 1UBZA 1PZYA 1WVVA 3TMVA 1LZNA 1GFTA 3CSZA 1GE2A 2I26L 5I4XA 1IX0A 1O23A 1OUBA 3AJNA 1B7SA 3T6UA 1LJIA 5LYMA 1B5WA 2BQNA 1RI8B 1LJ4A 4ANRA 4LYOA 1YROA 1INUA 4HPEA 2RSCA 5FEKA 3WXTA 3BKHA 1NKHA 1WTNA 1UIAA 5JENB 5C6IA 1ZV5L 3A67Y 1TDYA 4E3UA 1LSCA 2IHLA 4Z46A 5KXOA 2YVBA 4OOTA 4NHSA 2X0AA 1NBZC 1F6SA 1RE2A 3FI7A 4H9EA 2C8PA 4WLDA 4XENA 4NWHA 4ETCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WMGA 1L43A 3CT1A 2NWDX 2RBQA 3GUJA 1C6TA 3WL2A 1XJTA 4J1AA 2BQBA 1IY4A 3HU8A 1L00A 1L03A 1HEWA 2B6WA 1EQ4A 3ZEKA 2D4KA 1L66A 4PPOA 4AGAA 1CV5A 3DMVA 5E4PA 2MEEA 1BB6A 1IO5A 191LA 5LIOA 156LA 5L3HA 5I4WA 5FSTA 184LA 5DL9A 1HC0A 153LA 3GXRA 3T36A 1GF6A 1C6IA 1QTBA 3CDQA 4NGYA 4KPMA 1JSEA 1CKFA 1LSNA 4YM8A 1SSWA 5KXSA 1L95A 1QSWA 1C6AA 4DD3A 232LA 1LZDA 3CDVA 4NGKA 1B7MA 187LA 1C6QA 3SN6R 1FDLY 1YL0X 2BQHA 1BWIA 1G7HC 4LT0A 3W6FA 1LI2A 4H90A 3A6BY 1LZBA 3J4GA 1DYDA 1HERA 2HECA 5F9UA 3F6ZA 3AW7A 1JKCA 1LW9A 120LA 1UIGA 5AMYA 241LA 2FBDA 5KXRA 1L91A 4TSCA 2I6ZA 190LA 1IORA 1C45A 1C66A 1KW5A 3A34A 3RUNA 3ULRA 3QE8A 2H9JA 5KXXA 1GFRA 3GUNA 4YXCA 242LA 3NYAA 1PQJA 1HEQA 3TXBA 1C62A 4NGVA 1A2YC 2ZQ3A 4G4BA 1CUPA 1UA6Y 4NGOA 1UACY 2EPEA 3G3AB 4PK0A 1XGRC 2I25L 4ZIXA 1L40A 3B6LA 4W59A 3DKEX 3HH3A 3KAMA 1LZ8A 1HHLA 2DQHY 1LHHA 1L52A 2Z6BA 4LZTA 1L65A 4DD9A 1C7PA 4PGJB 5LVKA 1KXXA 5L9JA 1CX6A 3HBHA 1L23A 1KNIA 111LA 1GB6A 1L35A 2DQJY 1FBIX 2B73A 5LVGA 1L21A 3VW7A 2H9KA 5C6JA 3DN8A 1NDMC 1EQ5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WMG A;  4DC4 A;  4Z41 A;  1IWV A;  3E3D A;  4U3X B;  2HU1 A;  4DD1 A;  1C43 A;  4HTN A;  4QGZ A;  4QEQ A;  3CT1 A;  1GWD A;  2NWD X;  3LZT A;  4GN5 C;  1AT5 A;  1JWR A;  3WL2 A;  1BVX A;  3CB7 A;  3B0K A;  4J1A A;  3AZ6 A;  1J1X Y;  1BGI A;  1GFA A;  133L A;  3WVY A;  1AT6 A;  1HEN A;  1JTO L;  2BQB A;  4FJR A;  4GCF A;  5KXY A;  3VWO A;  1LJJ A;  1LZY A;  1IY4 A;  3A96 A;  1HEW A;  1BHZ A;  2ZYC A;  1EQ4 A;  1LZ5 A;  3AZ4 A;  3W6D A;  4TX7 A;  2D4K A;  3ZEK A;  5I54 A;  4IAT A;  1OUD A;  4PPO A;  3WXU A;  5LYT A;  1IR9 A;  1BB3 A;  1HFY A;  1OUE A;  2Z37 A;  4AGA A;  5M1Y A;  3W6A A;  1GFG A;  5E4P A;  2BQD A;  2MEE A;  1LZA A;  1BB6 A;  1YKZ X;  2AUB A;  2DQD Y;  1IO5 A;  3OK0 A;  1JJ3 A;  207L A;  4UWV A;  4II8 A;  5LIO A;  5II3 A;  1GBO A;  5L3H A;  1I56 A;  5APC A;  4N5R A;  1JKA A;  4DD0 A;  1LJE A;  1CJ8 A;  5I4W A;  1GF0 A;  3A93 A;  5FST A;  7LYZ A;  3LZ2 A;  2DQC Y;  5APD A;  5KXM A;  1XFP L;  1JTT L;  4NGJ A;  4WLX A;  5DL9 A;  1SLY A;  1YAN A;  4NSG A;  1HC0 A;  1FN5 A;  3HBE X; 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 1DKJ A;  1HEM A;  4HJY A;  1GAY A;  1LYO A;  1GFH A;  1LMT A;  1CKC A;  1LZS A;  2EQL A;  2IFF Y;  5B1F A;  5KY1 A;  2W1X A;  2BQI A;  1LJH A;  4OWE A;  194L A;  2Z2E A;  1H6M A;  4ETE A;  3G3B B;  1JEF A;  1GF7 A;  1LAA A;  2EIZ C;  1SQ2 L;  1XSF A;  4WM5 A;  3WUA A;  2LZ2 A;  4B0D A;  1YAP A;  4LYC A;  4HPI A;  1YKX X;  4ETB A;  4W96 A;  4YEO A;  5KXZ A;  5B06 A;  1BVK C;  5I53 A;  3WH1 A;  4BS7 A;  1GE3 A;  2HUB A;  1JUG A;  2DQA A;  1HMK A;  4NGL A;  4WLT A;  6LYZ A;  3QNG A;  4WM4 A;  1REZ A;  5F9X A;  3WUL A;  5LA5 A;  5E9R A;  1B5U A;  1LZE A;  5LXW A;  1IWY A;  1D9U A;  2HU3 A;  4CFP A;  4N1E I;  5HNL A;  5HNC A;  1ZVY B;  3TMW A;  4DD7 A;  1OUH A;  3AGG G;  3J6K A;  1IOQ A;  1KIP C;  1QTK A;  4W94 A;  4NGW A;  2WAR A;  1B7Q A;  4WG7 A;  2LZT A;  4H9F A;  5KXP A;  3WW6 A;  2YBJ A;  5LAG A;  1UBZ A;  1PZY A;  1WVV A;  3TMV A;  1LZN A;  1GFT A;  3CSZ A;  1GE2 A;  2I26 L;  5I4X A;  1IX0 A;  1O23 A;  1OUB A;  3AJN A;  1B7S A;  3T6U A;  1LJI A;  5LYM A;  1B5W A;  2BQN A;  1RI8 B;  1LJ4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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