1QUHA

L99g/e108v mutant of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAGINMVFQMGVTGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Structural analysis of a non-contiguous second-site revertant in T4 lysozyme shows that increasing the rigidity of a protein can enhance its stability.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1quhA00
1L86A 2RBPA 1L61A 1L69A 216LA 114LA 2B7XA 4ARLA 225LA 1D3FA 4EKRA 4LZMA 1QTDA 2B6YA 170LA 4ARJA 164LA 1DYFA 3DNAA 3PBLA 1C62A 1LYEA 1PQDA 3CDQA 143LA 221LA 1LYIA 165LA 1L55A 3HDEA 3G3WA 1QTHA 1CU5A 112LA 1L68A 189LA 237LA 1LGUA 4I7NA 120LA 1JTNA 209LA 4ARMB 261LA 1L98A 152LA 1P5CA 1KS3A 1L21A 190LA 130LA 1L08A 1P2LA 1OV7A 1QUOA 3HT6A 1D3JA 2RBOA 1L50A 139LA 1L91A 173LA 2ANXA 1CVKA 1L60A 4ARQB 244LA 1D3MA 4I7QA 2RB1X 110LA 167LA 3QAKA 4LDOA 3F8VA 1PQIA 2CUUA 1QT4A 103LA 1L85A 1OYUA 2B73A 2F2QA 1L35A 1L19A 3HH5A 1C68A 1CV5A 4LDEA 1C6FA 1D3NA 1L00A 3V2WA 3HDFA 1L39A 1T8AA 1G0PA 1QS5A 1L80A 212LA 1L27A 1C64A 220LA 123LA 3PDSA 2OE9X 262LA 224LA 254LA 2F47A 2Q9EA 1CV6A 248LA 4W51A 1PQOA 1DYDA 149LA 1LI3A 4I7SA 4E97A 2RBSA 3DN8A 252LA 2OTZX 3DN4A 1L47A 148LE 2ANVA 1L56A 1L26A 2HUKA 109LA 1JQUA 3SBAA 1L07A 3GUOA 3FADA 3DMZA 4EXMA 3C81A 142LA 2RB2X 1L51A 1G0JA 1L44A 226LA 3DKEX 128LA 1CUQA 1QS9A 1WTHA 259LA 1I6SA 1L96A 1KW5A 1C67A 3HH6A 218LA 1L34A 3C8QA 1OWZA 1L87A 258LA 138LA 145LA 2OU9A 4ZPUA 1L74A 1ZURA 2B70A 182LA 1C6QA 1QTZA 3C7ZA 1L79A 2IGCA 1L16A 125LA 166LA 3DMVA 4AQNA 140LA 178LA 1P36A 245LA 201LA 2B6TA 2O4WA 1D9WA 1L25A 162LA 3C7YA 1L28A 1XJUA 3CDTA 2B6ZA 2B6WA 4IAPA 107LA 3CDRA 3C7WA 4PJZA 4YX7C 2O7AA 2RAYX 2RBNA 1L36A 1L48A 1L82A 1D2YA 4EKQA 1OVJA 151LA 104LA 169LA 1LLHA 1LYDA 211LA 1QT5A 3RUNA 1QT7A 1OVKA 1K28A 3HTFA 160LA 1LI6A 1OV5A 1CU0A 256LA 1T8GA 2B75A 1L31A 1CV4A 3SB5A 1L38A 1L76A 1LPYA 3HT7A 234LA 200LA 3SBBC 177LA 1OVHA 1G1VA 1L46A 1L54A 2B74A 3HUKA 1P6YA 235LA 227LA 1C63A 1L22A 2RAZX 1L53A 3HTBA 188LA 1EPYA 3GUIA 1L09A 163LA 1ZWNA 118LA 1KNIA 210LA 3D4SA 141LA 1SX2A 3C8RA 1L94A 3ODUA 1L01A 1LW9A 246LA 1SWZA 260LA 2OEAX 1L92A 1C61A 1L57A 1PQKA 3NY8A 146LA 1P2RA 1L0KA 1T97A 3DMXA 1G07A 2Z6BA 4I7PA 1KY1A 4YXAC 147LA 1L93A 2QB0B 1L83A 2O79A 3HT9A 1L41A 2OU8A 253LA 197LA 231LA 1CUPA 1JTMA 1ZYTA 243LA 1CV0A 205LA 1KY0A 3OE6A 7LZMA 4I7KA 1C6KA 1PQJA 3CDOA 1L04A 1LYGA 1CX7A 4I7MA 171LA 4LDLA 3GUPA 3HWLA 1C6AA 1L70A 113LA 1CV3A 1QTCA 184LA 1QT8A 3OE9A 1G0MA 1L52A 1L95A 158LA 1QTBA 3JR6A 4DAJA 1C6LA 1L06A 144LA 1LGWA 3SB7A 4DKLA 3GUNA 1L42A 2L78A 3G3XA 2OU0X 4I7LA 223LA 3UONA 3HH3A 1L67A 1SSWA 1L13A 1C6MA 1TLAA 3HU9A 159LA 1CV1A 1DYBA 1L10A 1L43A 1L33A 1C6HA 1C6EA 2RBRA 3FI5A 238LA 1C69A 4YXCA 1P46A 240LA 3HTDA 1DYEA 1LWKA 2HULA 3GUKA 4ARMA 2RB0X 4W53A 250LA 230LA 175LA 1C6JA 247LA 3DN2A 1QUGA 1QSQA 5LZMA 1G1WA 6LZMA 1G0KA 1T6HA 1L88A 1L66A 102LA 3GUJA 1P3NA 4ARQA 1C6BA 191LA 1L45A 2B72A 1C6CA 127LA 1L90A 1L73A 1L12A 1C60A 1CU6A 1L49A 3RZEA 206LA 174LA 111LA 185LA 196LA 1LWGA 1L62A 180LA 236LA 1C65A 3SB8A 3SN6R 1L99A 1L11A 115LA 126LA 1L02A 213LA 3F9LA 2LCBA 3C8SA 1L29A 228LA 1L18A 1L58A 3HTGA 233LA 156LA 3HU8A 1L81A 1L84A 1C66A 1CU2A 2NTHA 4EPFA 2HUMA 1L30A 1LYHA 1L32A 1CU3A 1CTWA 3DN3A 119LA 1G0LA 215LA 1CX6A 255LA 3DN6A 4I7TA 176LA 2RBQA 4W52A 4EPIA 1DYAA 2LC9A 137LA 183LA 1G0GA 199LA 1C6PA 186LA 4I7RA 4EKPA 3FA0A 3HUAA 1L71A 1SX7A 131LA 195LA 2QARC 4I7OA 239LA 3NY9A 2B6XA 1L63A 3OE8A 3VW7A 122LA 3HUQA 3NYAA 232LA 4W55A 1P56A 3LZMA 1L75A 4EKSA 1LYJA 4DJHA 3OE0A 4EJ4A 1L14A 1G0QA 251LA 3DN0A 1QT6A 1L0JA 2A4TA 1LI2A 2OE4X 1P37A 3HT8A 1QUDA 3GUMA 214LA 1PQMA 1LYFA 1L05A 1XEPA 3GULA 3CDVA 1L72A 1QT3A 4GRVA 3SB6A 1B6IA 1C6IA 4OO9A 1L40A 1P7SA 157LA 1DYCA 3V2YA 1L17A 1L89A 1L20A 4ARPA 3SB9A 181LA 161LA 2Q9DA 3DN1A 4W59A 1OWYA 3C82A 4GBRB 1QUHA 1T8FA 1QSBA 1L37A 222LA 5I14A 4W54A 129LA 2OE7X 1NHBA 1C6DA 1LGXA 4W56A 108LA 150LA 2NTGA 1KW7A 3L2XA 3L64A 168LA 242LA 1D2WA 172LA 217LA 3HH4A 155LA 187LA 1L65A 1L97A 2OTYX 4I7JA 198LA 192LA 1L15A 229LA 3G3VA 1SSYA 1L24A 3K2RA 249LA 1L03A 4K5YA 241LA 257LA 1C6NA 1G06A 1SWYA 1DYGA 1L59A 2RH1A 4W58A 1L64A 4W57A 1QTVA 1C6TA 1P64A 3C80A 4S0WA 3C83A 2F32A 3EMLA 1C6GA 1L77A 1XJTA 4PK0A 1L23A 2LZMA 219LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L86A 1L69A 3J6KA 1LZYA 114LA 1REMA 1GB3A 225LA 2H9JA 1IP6A 1GB7A 4RDSA 5KXNA 3DNAA 1JEFA 1LKRA 1FKVA 143LA 3AZ6A 221LA 4PHIA 1LYIA 3HDEA 1QTHA 1CU5A 5LVJA 3RU5A 152LA 1P5CA 4GN4A 4LYMA 4DDCA 1QDTA 5K7OA 1QTKA 1D3JA 4Z46A 4XJIA 4ARQB 244LA 4NWEA 4LFXA 5B06A 1RCMA 1HSXA 1QT4A 5KY1A 1GD6A 1L35A 1GXV2 3V2WA 3HDFA 4N9RA 1NBZC 212LA 1HC0A 1GFKA 1IX0A 1C64A 3PDSA 3BKVA 262LA 224LA 254LA 1CV6A 1IOSA 3G3AB 2W1YA 2C8PA 5F9UA 1IWYA 2RBSA 1GBZA 3B0KA 4IASA 1HEMA 2MEHA 4HV1A 1JQUA 1L07A 3GUOA 1AM7A 4QEQA 5I4YA 142LA 2RB2X 1G0JA 1O23A 1IWZA 226LA 1QUSA 1CUQA 1L96A 5LIOA 3C8QA 1L34A 1YKYX 9LYZA 4HTKA 145LA 4P2EA 3TXBA 2MEFA 1L79A 2EIZC 2IGCA 1B5ZA 1VATA 3VWOA 1OUBA 3TXKA 2W1XA 201LA 1B9OA 4NSIA 4NGWA 1D9WA 162LA 2B6ZA 5HNCA 107LA 1NQIA 4D9ZA 1VEDA 5FHWA 4YX7C 2O7AA 5APFA 1L36A 1J1PY 3CQLA 1L82A 2HEEA 5IDDA 4HJYA 4EKQA 4NG1A 1LMTA 169LA 1LYDA 135LA 1IR7A 1QT7A 3HTFA 3B0IA 1GE1A 1OV5A 4TTDA 1LHIA 1LSGA 1IVMA 1L31A 3W6AA 3M3UA 4NIJA 4OW1A 1B5VA 4N0JA 177LA 5FELA 1G1VA 1LZAA 1P6YA 235LA 4ZIXA 1QQYA 1VDQA 1LMNA 2RAZX 1LZ4A 3WU9A 4H92A 1JWRA 188LA 2DQIY 4WM5A 1IC7Y 118LA 3A96A 1E8LA 4B0DA 4G9SA 141LA 3ODUA 5KXMA 4LT2A 1HERA 246LA 2OEAX 3DMXA 1G07A 1RJCB 1L93A 2QB0B 4YEOA 5KJ9A 1L41A 5KXRA 1B7PA 3TXIA 253LA 1HELA 1JTMA 2FBDA 1KY0A 5J7CA 1HEWA 1B5UA 1KXWA 1GE4A 3A92A 1GF4A 1GF9A 4I7MA 208LA 171LA 1UICA 4WMGA 1YAPA 3EBAB 1L70A 113LA 4DDAA 1ALCA 1QTCA 5DLAA 1QT8A 1OUCA 1G0MA 1XSFA 1QTBA 158LA 4E3UA 1QDRA 3JR6A 4DAJA 4DKLA 1YROA 4WLDA 1OUDA 5L3HA 2Z2FA 1DYBA 1CV1A 1NDGC 1C6EA 4OWBA 238LA 4YXCA 1P46A 4ARMA 1FLYA 2RB0X 1GDWA 3WUAA 1QSQA 2HEBA 1XGPC 1L66A 1WQRA 1OP9B 3GUJA 1P3NA 4LYOA 5HMVA 1LMPA 4Z3MA 3W6EA 4YF2A 1YILA 4C5FA 1DPWA 206LA 111LA 1LWGA 5LXWA 236LA 3SB8A 1B7SA 3A6BY 1L99A 2Y8PA 213LA 2LCBA 3C8SA 1L18A 1UBZA 1L58A 1LTMA 1SLYA 1L84A 4GLVA 1HFYA 1UIEA 2HUMA 4B4JA 1LYHA 1GB9A 2X0AA 1L32A 1BWIA 4G4CA 3DN3A 4ETAA 1G0LA 3DN6A 4I7TA 176LA 4W52A 4EPIA 2MEAA 1JTOL 137LA 183LA 1GF6A 4YOPA 5II3A 1F0WA 4EKPA 5LA8A 2I6ZA 1L71A 3FI7A 1JJ3A 131LA 1JUGA 2QARC 4KT3A 1LSDA 239LA 3A94A 2B6XA 2HEFA 3OE8A 4XJDA 122LA 3NYAA 1B5YA 1IP5A 4ANRA 1CKGA 4RW1A 3OE0A 1LZEA 1XEKA 1T6VL 1JITA 1GFGA 3AGHA 2BLYA 4TSCA 1GF8A 3FE0A 1QUDA 1I20A 3MGWA 214LA 3T36A 1LJEA 1Z55A 1GBYA 1EQEA 4GRVA 4NGOA 3SB6A 3WL2A 1LSEA 2I26L 1I56A 1LJJA 2HTXA 1LJNA 4NFVA 2BPUA 3A3QA 1W08A 3DN1A 3AZ5A 1T8FA 1LYYA 1QSBA 5LVKA 1L37A 222LA 4NY5A 2W1MA 3TXEA 1OUIA 4W54A 129LA 4II8A 4WM2A 3EMSA 4C3WA 4RW2A 1D9UA 1BB3A 5LYZA 1D2WA 172LA 155LA 1JKDA 1L97A 3G3VA 4GLAA 257LA 4CJ2A 2RH1A 1LCNA 1L64A 2MEGA 1C6TA 2DQHY 3C80A 3P64A 4ETBA 4HJVA 1F6SA 2LZMA 4NGYA 2RBPA 1IWWA 1L61A 2FYDA 216LA 2B7XA 1REZA 1EL1A 1DI5A 1DYFA 1XEIA 3PBLA 1UACY 4I0CA 4R0FA 3CDQA 1C45A 1JISA 3TMVA 3G3WA 1TCYA 2CGIA 1LZCA 1LGUA 1D6PA 120LA 1JTNA 4ARMB 3ATNA 261LA 4OWAA 130LA 1DZBX 1KXYA 3A91A 3HT6A 1MELL 4H9HA 173LA 4R6CA 4CHXA 1L60A 3A93A 1D3MA 1IP7A 3F8VA 1PQIA 1LJ4A 5FSTA 4WG1A 3WXUA 1D3NA 1L00A 1HENA 4ETCA 1L39A 1QS5A 2LZ2A 1IP4A 3KAMA 2F47A 2LYOA 248LA 2Q9EA 2DQEY 1C10A 4W51A 1BHZA 1GBOA 4E97A 1B7MA 1OQMA 2OTZX 1QIOA 3DN4A 4I8SA 2AUBA 2XJWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L86 A;  1L69 A;  3J6K A;  1LZY A;  114L A;  1REM A;  1GB3 A;  225L A;  2H9J A;  1IP6 A;  1GB7 A;  4RDS A;  5KXN A;  3DNA A;  1JEF A;  1LKR A;  1FKV A;  143L A;  3AZ6 A;  221L A;  4PHI A;  1LYI A;  3HDE A;  1QTH A;  1CU5 A;  5LVJ A;  3RU5 A;  152L A;  1P5C A;  4GN4 A;  4LYM A;  4DDC A;  1QDT A;  5K7O A;  1QTK A;  1D3J A;  4Z46 A;  4XJI A;  4ARQ B;  244L A;  4NWE A;  4LFX A;  5B06 A;  1RCM A;  1HSX A;  1QT4 A;  5KY1 A;  1GD6 A;  1L35 A;  1GXV 2;  3V2W A;  3HDF A;  4N9R A;  1NBZ C;  212L A;  1HC0 A;  1GFK A;  1IX0 A;  1C64 A;  3PDS A;  3BKV A;  262L A;  224L A;  254L A;  1CV6 A;  1IOS A;  3G3A B;  2W1Y A;  2C8P A;  5F9U A;  1IWY A;  2RBS A;  1GBZ A;  3B0K A;  4IAS A;  1HEM A;  2MEH A;  4HV1 A;  1JQU A;  1L07 A;  3GUO A;  1AM7 A;  4QEQ A;  5I4Y A;  142L A;  2RB2 X;  1G0J A;  1O23 A;  1IWZ A;  226L A;  1QUS A;  1CUQ A;  1L96 A;  5LIO A;  3C8Q A;  1L34 A;  1YKY X;  9LYZ A;  4HTK A;  145L A;  4P2E A;  3TXB A;  2MEF A;  1L79 A;  2EIZ C;  2IGC A;  1B5Z A;  1VAT A;  3VWO A;  1OUB A;  3TXK A;  2W1X A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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