1L67A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSEADKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords LYSOZYME
publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l67A00
4I7PA 110LA 1L30A 1C6BA 4EPIA 1L81A 1G1WA 1LW9A 4EKQA 2OU0X 2RBPA 3G3WA 5I14A 1OV5A 4DKLA 1T8GA 3OE0A 1CX7A 2F47A 4IAPA 2QARC 2ANXA 4I7MA 1QT8A 4W57A 1OVJA 234LA 4ARLA 4ARQA 4LZMA 141LA 260LA 177LA 2LC9A 1L39A 4YXCA 3HT6A 118LA 1C6DA 3CDOA 1C6NA 1G06A 7LZMA 4GRVA 3L64A 1L24A 1QT5A 169LA 3GUMA 156LA 3SBBC 1C6QA 3RUNA 1L87A 3CDRA 1L04A 4I7TA 1C60A 1DYAA 3GUPA 1QTVA 2OU9A 2A4TA 1L10A 1L59A 1L05A 218LA 226LA 1C6GA 1C6KA 3C81A 4S0WA 1G1VA 2OE7X 1OVHA 3GUKA 3SB7A 1L68A 1C63A 1C69A 1L0KA 1C6LA 4ZPUA 182LA 1G0JA 2CUUA 2F2QA 1L48A 255LA 183LA 2O79A 4K5YA 1XJTA 123LA 1ZWNA 4EKPA 1L17A 1L88A 4W53A 1L37A 1L38A 220LA 1CVKA 195LA 191LA 1C6MA 2RB1X 221LA 1L52A 128LA 201LA 1D3MA 1L32A 1L19A 4E97A 3DKEX 1C65A 1LGUA 1C67A 1L26A 1L54A 211LA 1CTWA 1QUOA 3GUOA 257LA 1L71A 254LA 161LA 1L01A 1LWKA 3HTFA 1L67A 1C6IA 1L33A 1C64A 1T6HA 3SB5A 119LA 3JR6A 3K2RA 239LA 3SB6A 4EXMA 245LA 1L77A 1L57A 1XJUA 122LA 1L51A 249LA 2Q9DA 1L60A 171LA 248LA 1SSYA 252LA 1L09A 1CV5A 222LA 2RBOA 2RBSA 185LA 1L43A 4I7KA 210LA 149LA 137LA 4I7JA 2RBRA 1L44A 1L70A 2RAZX 3L2XA 1D9WA 199LA 256LA 1L15A 4ARQB 3HT8A 1G0KA 3DMVA 1SWZA 2O4WA 1L25A 2RBQA 127LA 3HTGA 2Z6BA 3HH3A 1C6JA 1P5CA 3HWLA 1L76A 1L27A 1JTNA 3HUKA 188LA 152LA 1SX7A 115LA 1P7SA 1LYFA 3CDTA 3UONA 139LA 120LA 168LA 1CV6A 1QT7A 1LYIA 4YXAC 250LA 1L83A 165LA 2RBNA 233LA 4LDLA 157LA 1D3FA 3C8SA 166LA 3DMZA 216LA 1C66A 2F32A 1C68A 4EKRA 1L47A 1L08A 1KY0A 1G0PA 162LA 3NY9A 231LA 205LA 237LA 2ANVA 175LA 4I7RA 1EPYA 1P64A 1L94A 214LA 3OE6A 1L29A 2RH1A 2B6YA 3EMLA 3HDFA 258LA 2B74A 1L49A 1DYBA 3GUJA 145LA 1SSWA 1P46A 1L55A 1LWGA 2OEAX 3HUQA 1PQMA 196LA 1L02A 1KW7A 3V2YA 176LA 3HH4A 1LYGA 180LA 3DN3A 1C6FA 1PQDA 148LE 227LA 2NTGA 3DN0A 1L45A 1L74A 1LYHA 3NYAA 2Q9EA 1L53A 1SWYA 3ODUA 147LA 3VW7A 4DJHA 1L96A 3DN8A 1C62A 3C8RA 1DYEA 138LA 2B70A 1T8AA 151LA 197LA 159LA 4W51A 2OTZX 3RZEA 230LA 1LI2A 1OYUA 1CU5A 1DYDA 1QTZA 1KY1A 4PJZA 4EKSA 1OVKA 3GUIA 1QTCA 173LA 241LA 1CU3A 1CV1A 3HH6A 1DYCA 3D4SA 262LA 1CU0A 2L78A 1CV4A 228LA 1KS3A 1L36A 1LPYA 236LA 1L0JA 143LA 4W56A 1L69A 3CDQA 1L06A 1L12A 251LA 2B6WA 1D3JA 3HDEA 1K28A 2LZMA 2HUKA 2HULA 1WTHA 1C6PA 3LZMA 3F8VA 2B7XA 187LA 3HU9A 1L40A 1LI6A 1CV0A 1L14A 2B75A 3SBAA 158LA 4PK0A 3GUNA 1JQUA 1XEPA 2OE4X 209LA 4I7LA 215LA 3HT7A 1L80A 1QUHA 4YX7C 4AQNA 125LA 1C6AA 4I7NA 3DNAA 1P37A 163LA 2OU8A 4ARMA 3C7ZA 3OE8A 243LA 190LA 1L16A 2QB0B 167LA 3DN4A 3SB8A 253LA 3FADA 3F9LA 3GULA 1QT6A 3HT9A 206LA 1L56A 3C8QA 150LA 259LA 1LYEA 3DMXA 4LDOA 3C83A 244LA 1L18A 174LA 1L61A 1QT4A 219LA 160LA 1L95A 1L07A 1L22A 1L46A 1G0MA 1L34A 3QAKA 1LGWA 3FI5A 246LA 4I7SA 1B6IA 1OWZA 3HH5A 4GBRB 1L86A 164LA 200LA 1PQJA 198LA 1C6TA 1L41A 111LA 1C61A 1L35A 3FA0A 4EPFA 2B6TA 1L11A 1CU6A 1QS5A 1L84A 3DN6A 189LA 1L03A 1LGXA 3CDVA 1CX6A 1L93A 1L85A 146LA 224LA 1P6YA 2B6XA 1L21A 1L72A 6LZMA 178LA 1DYGA 1QUDA 1L28A 1G0GA 1QTBA 1L99A 1L82A 1KW5A 130LA 1L00A 1L91A 4OO9A 4ARJA 1QSQA 103LA 1TLAA 2HUMA 1P2LA 1P3NA 261LA 1L92A 1CUQA 213LA 1L63A 1L98A 4I7OA 2B6ZA 113LA 131LA 2O7AA 2OTYX 3HU8A 3C7YA 172LA 1L31A 4W55A 4EJ4A 3DN1A 1QT3A 1C6EA 1ZURA 3OE9A 1L23A 2NTHA 3DN2A 1G0QA 1L50A 192LA 1C6HA 104LA 1L73A 112LA 1G0LA 2LCBA 1L64A 181LA 1C6CA 1D2YA 4W52A 212LA 2B73A 3C82A 108LA 1T8FA 2RB2X 4W54A 155LA 3SN6R 1PQOA 3HTBA 4ARPA 3SB9A 1CV3A 102LA 1L97A 2OE9X 1L79A 1L62A 1NHBA 1LYJA 1L66A 3V2WA 109LA 4ARMB 1L75A 1L58A 1L90A 126LA 3HUAA 1OWYA 3PDSA 4LDEA 2IGCA 4I7QA 4W58A 1PQIA 1P56A 1QSBA 1D3NA 3PBLA 1G07A 1LYDA 1CUPA 142LA 1KNIA 1QTHA 114LA 1P2RA 2RAYX 2B72A 4W59A 225LA 1I6SA 186LA 1CU2A 1LLHA 1L13A 129LA 223LA 4DAJA 3C7WA 217LA 5LZMA 140LA 1QTDA 238LA 1ZYTA 1QUGA 3NY8A 1L42A 3C80A 3HTDA 184LA 1DYFA 235LA 170LA 242LA 1D2WA 1PQKA 1SX2A 229LA 107LA 1QS9A 3G3VA 247LA 1JTMA 1P36A 1L20A 144LA 1L65A 1T97A 1L89A 1OV7A 240LA 232LA 2RB0X 3G3XA 1LI3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LYOA 1G1WA 1XEKA 1LZCA 3WW6A 1T8GA 4XJGA 5B06A 2H9KA 1YL0X 2F47A 4IAPA 1FLQA 2ZWBA 4LYMA 1GF3A 4ARQA 1FLWA 3B0KA 1FBIX 1HELA 3A8ZA 260LA 177LA 2LC9A 1DI5A 1OUBA 2CWIA 1LZ8A 3CSZA 3CDOA 1C6NA 1G06A 4GRVA 1JSEA 1L24A 1NKHA 169LA 3SBBC 1I56A 1C6QA 3RUNA 5KKIA 1B7MA 4W94A 4I7TA 1C60A 1IOQA 1HENA 1IX0A 4R0FA 3A92A 3RW8A 1CKFA 1UIAA 218LA 4DD2A 4NSGA 1UCOA 1KXYA 132LA 2OE7X 1OVHA 3GUKA 1LHIA 4ZPUA 1VATA 3WU8A 1JKDA 1B5VA 4K5YA 5KXOA 3B6LA 1L88A 1UIDA 1CVKA 3N9CA 4FJRA 1L52A 4B49A 1WQNA 4XYYA 3TMUA 1NF5A 1L32A 3LZTA 1C65A 1HSXA 4ZIXA 1CKHA 4HTKA 1GB9A 257LA 1LWKA 3HTFA 4CGEA 1C10A 1LZBA 3SB5A 3JR6A 1D0LA 1CJ8A 2DQAA 2YBLA 249LA 1LTMA 4BAFA 2BQJA 4WM4A 3M18B 3TXEA 1CV5A 2MECA 1GFAA 4LYOA 4RW1A 2RBRA 4GCEA 4J1BA 4NSIA 1D9WA 1G0KA 4WG7A 1LZRA 2MEGA 1SWZA 1L25A 1B7QA 127LA 3HTGA 3HWLA 1L27A 1JTNA 1B7SA 2FBDA 188LA 1QDTA 4YENA 2LZTA 1HERA 1ZVHL 4QDNA 4WLDA 1QT7A 1JJ0A 1LYIA 1L83A 3J6KA 4OWAA 3TXHA 233LA 4H91A 3KAMA 1LZTA 5LVGA 4HJZA 1C66A 2F32A 3A3QA 1L47A 1L08A 1KY0A 2XTHA 162LA 3BKHA 5KXNA 2ANVA 175LA 1LMNA 1LCNA 214LA 5AMYA 1L29A 2RH1A 4DD1A 5IDDA 4GCFA 4MSTA 2B74A 1C46A 1GE0A 1YKXX 3A95A 1HNLA 1P46A 1L55A 4UWVA 2BQLA 1JHLA 2ZQ4A 5A3ZA 3WUNA 3HUQA 1KW7A 3HFMY 148LE 1PQDA 227LA 2NTGA 1L45A 1L74A 3NYAA 1UIFA 3AZ4A 5I4WA 1DYEA 1HC0A 2B70A 4YM8A 1T8AA 197LA 4W51A 5APCA 2CJLA 4I8SA 1LI2A 1LSZA 2GV0A 1CU5A 2D4JA 1KY1A 1GXV2 1QTCA 1HEPA 1DYCA 1XSFA 3W6AA 4TTDA 1YKYX 1CV4A 1KS3A 1LPYA 236LA 1LZ4A 1L69A 1W08A 3CSRA 2CGIA 1D3JA 207LA 3AB6A 1WTHA 4J7VA 4LYTA 1QUTA 3OK0A 2B7XA 4G49A 2AUBA 3HU9A 1LI6A 1CV0A 1L14A 3TXGA 158LA 4PK0A 4I7LA 1QUHA 1LSCA 4LYZA 125LA 1LPIA 1XEIA 4PGJB 1I20A 2QB0B 3FADA 3HT9A 1LYYA 3C8QA 1OUHA 1GBXA 1IWUA 3DMXA 174LA 1L61A 1BQLY 1L95A 1L07A 1A2YC 4AXTA 1G0MA 1VAUA 3QAKA 5B07A 1DKKA 4H9AA 1DQJC 4GBRB 1L86A 1OWZA 2YBNA 200LA 1PQJA 1GFHA 1GB7A 2BQNA 111LA 2LYMA 3FA0A 1OUGA 1EQEA 3G3BB 1L85A 1IP4A 1LJFA 4NGIA 5KXYA 146LA 4NHIA 4N0JA 1F6RA 1LSBA 4ET9A 1LJ4A 178LA 1IP2A 3SP3A 3ULRA 3RZ4A 3ZVQA 2BQHA 1KW5A 4WOAA 4ARJA 1B5XA 208LA 103LA 1UC0A 8LYZA 3TXIA 3A3RX 4XJHA 2EKSC 1GFEA 4RLMA 1CUQA 1L63A 4GLAA 1TEWA 4DDBA 131LA 4WL6A 1B7LA 3C7YA 4EJ4A 1GFUA 5L3IA 1IP6A 3B72A 1T6VL 1RE2A 4H9CA 1L23A 3DN2A 1G0QA 4LGKA 192LA 1ZV5L 1SLYA 3AGIA 1GHLA 212LA 3C82A 155LA 1JISA 1L97A 1QDRA 1XFPL 5DL9A 1L62A 4RDSA 4MR1A 1LYJA 2Z18A 1G7MC 3AZ7A 4N1CC 3HUAA 3PDSA 4I7QA 1QSBA 1G07A 4LT0A 5A3EA 114LA 2RAYX 2B72A 225LA 1LLHA 1ZMYL 4H94A 5F81A 3C7WA 4A7DA 217LA 5LZMA 1LSMA 140LA 4U3XB 1B5ZA 1VDSA 242LA 1GE2A 1IY3A 1PQKA 3HBDA 229LA 1JTMA 2HEFA 4H8YA 1GEVA 4XJDA 2F4AA 4BADA 4H9HA 2ZNXY 2D91A 1AZFA 1C6BA 4EPIA 3A34A 3WMKA 2OU0X 4W96A 4NGLA 1UIEA 2ANXA 2X0AA 4BAPA 1BWJA 234LA 2XJWA 4GCCA 4DD3A 4E3UA 4ML7A 4RLNA 1F6SA 141LA 4YXCA 3TXJA 3HT6A 118LA 5KJ9A 2BQCA 1L87A 4NWHA 3CDRA 3EO5A 1VEDA 4ETDA 1A4VA 1NDMC 1DYAA 1QTVA 2OU9A 1GXXA 1LSYA 154LA 1GF5A 226LA 1C6KA 4N1EI 3C81A 4S0WA 1LZYA 3SB7A 3WU7A 1L0KA 2CUUA 4ZEEA 3A91A 134LA 3TMXA 255LA 3A67Y 2D6BA 123LA 4RW2A 4J0LA 4XJFA 220LA 5KXXA 1HHLA 1YAOA 3B0IA 4NGYA 1KIPC 1LAAA 221LA 1UA6Y 1LMPA 1LGUA 1LKRA 2ZIJA 1XEJA 4WM3A 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4DQ7A 2YBHA 244LA 1YAQA 1L18A 3W3EA 1HSWA 1QT4A 1QQYA 3RU5A 1IVMA 1L22A 1C08C 1HMLA 4KPMA 1LYZA 1GFVA 5E9RA 1B6IA 1GF6A 1GB5A 4AGAA 4NGWA 4N5RA 3A90A 1GAZA 2DQGY 1CJ6A 1C61A 4EPFA 2B6TA 1G7LC 4NGKA 1CU6A 1QS5A 1L84A 3AGGG 4G4BA 1CX6A 1IP1A 3F6ZA 4NSHA 1LJNA 4LZTA 4WL7A 2B5ZA 1L21A 1L72A 1GB0A 1DYGA 1JUGA 1G0GA 1QTBA 4WM1A 1YROA 1JJ1A 1GBZA 5HMJA 4J1AA 2BLXA 1LYSA 5E4PA 1P3NA 1IR9A 2BQOA 1GB8A 213LA 2BAAA 1LSDA 1JEFA 1L98A 2DKVA 113LA 3CT5A 4XJIA 1FLYA 2O7AA 2OTYX 1LJKA 5C6LA 2MEHA 4HSFA 4W55A 1QT3A 2Z39A 1C6EA 2NTHA 1OUCA 104LA 1L73A 1L64A 4B4JA 4G9SA 1D2YA 2WARA 1UACY 4GCBA 2B73A 108LA 5LXWA 3FE0A 2Z38A 3SN6R 4ARPA 3M3UA 1LHJA 3OJPA 2HTXA 1DPXA 1NHBA 1L66A 1D6PA 1MLCE 2W1XA 5F14A 3QE8A 2HEDA 1GE3A 1HEWA 1YILA 4DWXA 1WQPA 1OWYA 4LDEA 4W58A 2LHMA 5K7OA 1AKIA 1D3NA 2DBTA 3PBLA 3P64A 1BWHA 4NHQA 5KXZA 7LYZA 4GN5C 5KXWA 1I6SA 1LZGA 1GB6A 1VDQA 129LA 2DQFC 1LZNA 1UIGA 4N9RA 1L42A 3HTDA 1DYFA 2Z37A 4N8ZA 1SX2A 1HFXA 1MELL 4Z98A 1HEQA 1P36A 2Q0MX 4BS7A 1H6MA 1T97A 240LA 2RB0X 1GDWA 2ZYPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LYO A;  1G1W A;  1XEK A;  1LZC A;  3WW6 A;  1T8G A;  4XJG A;  5B06 A;  2H9K A;  1YL0 X;  2F47 A;  4IAP A;  1FLQ A;  2ZWB A;  4LYM A;  1GF3 A;  4ARQ A;  1FLW A;  3B0K A;  1FBI X;  1HEL A;  3A8Z A;  260L A;  177L A;  2LC9 A;  1DI5 A;  1OUB A;  2CWI A;  1LZ8 A;  3CSZ A;  3CDO A;  1C6N A;  1G06 A;  4GRV A;  1JSE A;  1L24 A;  1NKH A;  169L A;  3SBB C;  1I56 A;  1C6Q A;  3RUN A;  5KKI A;  1B7M A;  4W94 A;  4I7T A;  1C60 A;  1IOQ A;  1HEN A;  1IX0 A;  4R0F A;  3A92 A;  3RW8 A;  1CKF A;  1UIA A;  218L A;  4DD2 A;  4NSG A;  1UCO A;  1KXY A;  132L A;  2OE7 X;  1OVH A;  3GUK A;  1LHI A;  4ZPU A;  1VAT A;  3WU8 A;  1JKD A;  1B5V A;  4K5Y A;  5KXO A;  3B6L A;  1L88 A;  1UID A;  1CVK A;  3N9C A;  4FJR A;  1L52 A;  4B49 A;  1WQN A;  4XYY A;  3TMU A;  1NF5 A;  1L32 A;  3LZT A;  1C65 A;  1HSX A;  4ZIX A;  1CKH A;  4HTK A;  1GB9 A;  257L A;  1LWK A;  3HTF A;  4CGE A;  1C10 A;  1LZB A;  3SB5 A;  3JR6 A;  1D0L A;  1CJ8 A;  2DQA A;  2YBL A;  249L A;  1LTM A;  4BAF A;  2BQJ A;  4WM4 A;  3M18 B;  3TXE A;  1CV5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1LYO A;  1G1W A;  1XEK A;  1LZC A;  3WW6 A;  1T8G A;  4XJG A;  5B06 A;  2H9K A;  1YL0 X;  2F47 A;  4IAP A;  1FLQ A;  2ZWB A;  4LYM A;  1GF3 A;  4ARQ A;  1FLW A;  3B0K A;  1FBI X;  1HEL A;  3A8Z A;  260L A;  177L A;  2LC9 A;  1DI5 A;  1OUB A;  2CWI A;  1LZ8 A;  3CSZ A;  3CDO A;  1C6N A;  1G06 A;  4GRV A;  1JSE A;  1L24 A;  1NKH A;  169L A;  3SBB C;  1I56 A;  1C6Q A;  3RUN A;  5KKI A;  1B7M A;  4W94 A;  4I7T A;  1C60 A;  1IOQ A;  1HEN A;  1IX0 A;  4R0F A;  3A92 A;  3RW8 A;  1CKF A;  1UIA A;  218L A;  4DD2 A;  4NSG A;  1UCO A;  1KXY A;  132L A;  2OE7 X;  1OVH A;  3GUK A;  1LHI A;  4ZPU A;  1VAT A;  3WU8 A;  1JKD A;  1B5V A;  4K5Y A;  5KXO A;  3B6L A;  1L88 A;  1UID A;  1CVK A;  3N9C A;  4FJR A;  1L52 A;  4B49 A;  1WQN A;  4XYY A;  3TMU A;  1NF5 A;  1L32 A;  3LZT A;  1C65 A;  1HSX A;  4ZIX A;  1CKH A;  4HTK A;  1GB9 A;  257L A;  1LWK A;  3HTF A;  4CGE A;  1C10 A;  1LZB A;  3SB5 A;  3JR6 A;  1D0L A;  1CJ8 A;  2DQA A;  2YBL A;  249L A;  1LTM A;  4BAF A;  2BQJ A;  4WM4 A;  3M18 B;  3TXE A;  1CV5 A; 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