1L67A

Tolerance of t4 lysozyme to multiple xaa (right arrow) ala substitutions: a polyalanine alpha-helix containing ten consecutive alanines
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSEADKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Folding and function of a T4 lysozyme containing 10 consecutive alanines illustrate the redundancy of information in an amino acid sequence.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1l67A00
1PQKA 4EXMA 1QTDA 3C8SA 1L01A 3CDVA 3OE8A 243LA 3CDRA 4YX7C 1QT8A 211LA 1L21A 4PK0A 3HUAA 110LA 1I6SA 164LA 1L92A 245LA 1L64A 112LA 188LA 1L81A 1L28A 3CDTA 103LA 2B72A 1LI6A 1QTCA 228LA 113LA 1L05A 4IAPA 1DYEA 3DMXA 1L48A 2RH1A 1L24A 219LA 1DYAA 155LA 220LA 3HH6A 1L83A 190LA 3GUOA 1C6KA 1C6GA 2OE7X 2RAZX 4W53A 2OEAX 2CUUA 1C60A 114LA 1CV6A 1QUDA 1C6LA 1L77A 178LA 3HDFA 3SBAA 111LA 3HU9A 3C7YA 3ODUA 108LA 4W52A 1KNIA 1L22A 3C7WA 162LA 3C83A 1OVHA 239LA 1CX6A 1C6QA 1L38A 1P56A 1K28A 1LYIA 2RB0X 3V2WA 123LA 3GULA 1OVJA 3OE0A 252LA 168LA 197LA 4I7JA 3SB9A 1CTWA 1L43A 2Z6BA 223LA 2NTHA 1CU3A 3LZMA 109LA 143LA 2OE9X 1L10A 3GUMA 3FA0A 3SN6R 1PQJA 2B74A 1JQUA 1T6HA 6LZMA 1LLHA 1LI3A 258LA 1L61A 1QTBA 1L75A 1L32A 1P37A 215LA 1DYDA 224LA 237LA 1CUPA 2RBSA 247LA 2RBPA 2ANVA 1L00A 1L53A 2LCBA 1L95A 256LA 2RBRA 3HT6A 255LA 1QT5A 260LA 3HH5A 4PJZA 1L16A 3NYAA 1L15A 2B6WA 1LYFA 2HULA 1PQIA 1SWYA 3C8QA 3GUIA 1L87A 2B6YA 176LA 129LA 1D3MA 1L0JA 2OU9A 1CU2A 1P46A 1KW7A 1L23A 1LYDA 226LA 1L18A 1L97A 1LGWA 1SSWA 2HUMA 5I14A 1L09A 2B75A 122LA 234LA 1L71A 4ARJA 1OWZA 1L13A 3HUQA 4LDOA 1XEPA 4I7TA 144LA 2NTGA 1L88A 2O7AA 4LDEA 1L42A 1L96A 4ARQA 1L45A 173LA 199LA 1QT4A 217LA 1L91A 1L65A 1C6CA 2RBNA 150LA 1L66A 4YXAC 2B6TA 1L69A 1C63A 1L34A 1G0LA 180LA 1CU5A 1C6PA 1CVKA 1C6IA 2IGCA 3K2RA 232LA 229LA 4W51A 195LA 2B6XA 4I7KA 5LZMA 1L86A 3DKEX 2RAYX 102LA 2LC9A 3HTBA 149LA 1ZURA 2O79A 3C81A 1CV3A 1P36A 174LA 242LA 165LA 3HTFA 2F47A 1EPYA 4YXCA 2RBQA 1L60A 1CX7A 1L85A 246LA 3C8RA 131LA 1L03A 4EPFA 3DN1A 4AQNA 1L54A 1XJTA 7LZMA 1P3NA 3DMZA 233LA 1L46A 1B6IA 3UONA 127LA 1WTHA 2OTZX 3GUNA 1L37A 128LA 1DYGA 3SBBC 227LA 1ZWNA 3FADA 231LA 4K5YA 185LA 1G07A 187LA 1QTZA 125LA 115LA 4I7NA 1L70A 3HH4A 1L90A 2F32A 183LA 4ARMA 214LA 1L02A 181LA 1L25A 205LA 4EKSA 1KS3A 1C6AA 1ZYTA 257LA 3HWLA 1L94A 3GUPA 1L74A 151LA 4EKPA 1P6YA 4GBRB 1C67A 4DKLA 4ARQB 1SSYA 1G0MA 139LA 1T8GA 142LA 1L56A 1L40A 1D3JA 3C7ZA 3OE9A 158LA 4LZMA 3NY9A 213LA 2F2QA 1C66A 4W57A 2ANXA 244LA 1QUGA 4LDLA 1L26A 1L0KA 1L31A 4W55A 4ARLA 1L47A 3PDSA 222LA 2OTYX 2Q9DA 1L59A 1L73A 170LA 1LWGA 4I7MA 2OE4X 1P5CA 2O4WA 1D3NA 4E97A 1L27A 3HH3A 3DNAA 1D9WA 1LWKA 3HU8A 3DN8A 3HUKA 119LA 2HUKA 138LA 1T8FA 221LA 1CV0A 1C6HA 1LW9A 236LA 118LA 3EMLA 2OU0X 1P7SA 1KY1A 3CDOA 3HTDA 2RB2X 1LGXA 3OE6A 1L76A 3PBLA 167LA 1L29A 1G0JA 1G1WA 1D2YA 1L93A 1CV5A 1G0GA 2OU8A 1C65A 191LA 145LA 4ARMB 2QB0B 1L82A 1L35A 1L50A 1L79A 4S0WA 1L44A 1LPYA 3HT9A 1C68A 1L39A 161LA 1C64A 1G0KA 1L33A 3G3XA 140LA 104LA 4I7QA 1L63A 2B73A 3GUKA 1LYGA 1CV1A 152LA 4W58A 4I7SA 1C6DA 3CDQA 241LA 3L64A 1LYHA 1QT7A 172LA 1L08A 3NY8A 120LA 212LA 253LA 1L20A 198LA 1C6EA 1C6FA 1SX2A 3SB8A 1QT3A 1PQMA 3DN6A 1L17A 1C6JA 1PQDA 3F9LA 3HT7A 3DN4A 1DYBA 3F8VA 1L41A 4W59A 3SB6A 1CUQA 3V2YA 1QTHA 1C61A 3HDEA 2A4TA 4EPIA 186LA 210LA 1L99A 157LA 1L49A 2L78A 4EJ4A 1NHBA 1OV7A 2QARC 251LA 1T97A 3G3WA 1L04A 1SX7A 2B7XA 218LA 1OV5A 1L06A 1L57A 4I7PA 216LA 3RZEA 248LA 235LA 230LA 159LA 1LYJA 1OWYA 240LA 250LA 130LA 163LA 1P64A 1CV4A 4I7LA 2Q9EA 261LA 1KW5A 4GRVA 262LA 1L07A 189LA 1L51A 137LA 4DJHA 1C6BA 1L30A 126LA 1C69A 2RBOA 3RUNA 1P2LA 4DAJA 1SWZA 1OYUA 1L58A 3SB5A 1QSQA 2RB1X 254LA 3D4SA 192LA 209LA 4ZPUA 3G3VA 3VW7A 1G0QA 1L98A 3DN2A 1G1VA 107LA 1LYEA 175LA 1L89A 3DMVA 4ARPA 3HT8A 1C6NA 225LA 3QAKA 3C80A 184LA 1C62A 1DYCA 1L72A 1QUOA 1G0PA 1L84A 166LA 3GUJA 1L68A 1JTMA 1L67A 206LA 3FI5A 2LZMA 1D3FA 3JR6A 4EKQA 196LA 1L52A 1L19A 3C82A 169LA 4EKRA 177LA 249LA 1QTVA 4W56A 1XJUA 1TLAA 1L62A 4W54A 200LA 1QS5A 160LA 147LA 1T8AA 1LGUA 1KY0A 156LA 3SB7A 3L2XA 2B70A 146LA 171LA 1PQOA 3HTGA 1JTNA 1QUHA 182LA 3DN3A 1D2WA 1L11A 1CU0A 1C6MA 1L55A 1L80A 1QS9A 238LA 259LA 4OO9A 4I7RA 1QT6A 1L14A 1L12A 141LA 1LI2A 1OVKA 201LA 1G06A 2B6ZA 148LE 1QSBA 1CU6A 1DYFA 1L36A 1P2RA 1C6TA 4I7OA 3DN0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EXMA 3C8SA 1L01A 3CDRA 5I53A 1QT8A 5LXWA 1IR9A 4LFPA 1OUGA 164LA 245LA 2D4JA 3EMSA 2B72A 3MGWA 1QIOA 1LMAA 5I4YA 1B5WA 4IAPA 2FBBA 3TMXA 1UIDA 1LMOA 1GFKA 1DI4A 4N1CC 2RAZX 4W53A 2CUUA 1C60A 5ILCA 4NGYA 1KIPC 3A3RX 1C6LA 1L77A 1HELA 3HU9A 1LZYA 2HEDA 1OVHA 1CX6A 4KL7A 2A7FA 3ZVQB 1L38A 1IP2A 1B7QA 4A7DA 2LZ2A 1XGPC 1G7JC 1LZAA 252LA 4I7JA 4NG1A 4LT3A 223LA 1GBWA 5B1GA 3GUMA 2F30A 2MEGA 1LYYA 3SN6R 1LMCA 1JWRA 4H9EA 3LYZA 1L61A 5JENB 1QTBA 1IC5Y 3TXKA 215LA 1LSFA 1VDTA 224LA 4ETBA 1OUBA 2RBPA 1B5YA 4EOFA 1L95A 4ETDA 3WH1A 256LA 2RBRA 4LYMA 3WW5A 255LA 1NF5A 5F9UA 1IP1A 1BWHA 5I4XA 2LZTA 1REMA 2Z12A 3A3QA 3C8QA 4DDAA 1GE0A 1LZGA 4IATA 1T3PA 1QDTA 3LHMA 1L23A 1HMKA 1D6PA 1LGWA 4Z3MA 3B0KA 4NY5A 4B1AA 1LJKA 3HUQA 4I7TA 144LA 4DD9A 4TSBA 1DXJA 3F6ZA 1BB6A 199LA 3G3AB 1L91A 1JKDA 4NGVA 3RT5X 4FJRA 4CFPA 4WO9A 1TBYA 4WG1A 2C8OA 4WMGA 1CVKA 2HEBA 1C6IA 1JHLA 5HNLA 195LA 3FE0A 1V7TA 5LZMA 3DKEX 4GLAA 2DQIY 1GF3A 1VAUA 1P36A 3HTFA 2F47A 2G4QA 1CNSA 1CX7A 3C8RA 4ETAA 233LA 1IR8A 127LA 3GUNA 3AZ5A 1L37A 1DYGA 1FLYA 4HV2A 3FADA 3AZ6A 3GXRA 4LYOA 4WLYA 1YILA 1LMPA 115LA 2F32A 183LA 2ZYPA 4BAPA 1NKHA 1D6QA 4B4JA 2D6BA 1L25A 1GB2A 2F2NA 5A3ZA 3B0IA 1ZYTA 3HWLA 1L94A 1IY3A 151LA 1OUFA 2XBRA 1SSYA 4G9SA 2MEFA 139LA 5LVIA 142LA 1IIZA 3WYHA 1B7MA 1JJ3A 4HV1A 4P2EA 2XTHA 2DBTA 4LZMA 2YBLA 135LA 4GCCA 213LA 4W57A 2N5ZA 244LA 5B06A 4LDLA 1L26A 4ARLA 4NSHA 2D4IA 1LWGA 4E97A 1L27A 4MR1A 3HUKA 1FLWA 3HU8A 3DN8A 1GB8A 2HUKA 118LA 3EMLA 5KXTA 1P7SA 1KY1A 5FELA 1REZA 1W08A 1FN5A 1G0JA 1D2YA 1CV5A 1YANA 4ZEEA 5KXRA 4WM6A 2Z38A 1CKGA 1GB7A 1L82A 1L50A 4S0WA 1L44A 1HMLA 1C68A 4LYTA 5LVHA 161LA 1HEPA 1DPWA 1L63A 2B73A 4L41A 1C6DA 3L64A 4H1PA 1LYHA 172LA 120LA 212LA 1L20A 1IORA 198LA 1C6EA 1SX2A 1CJ7A 2MEDA 5E9RA 3SB8A 1B5XA 1PQDA 3F9LA 4NSIA 4HJVA 1HEMA 1DKKA 186LA 1L99A 1NHBA 3K3TA 4GCDA 5LYTA 1SX7A 5LAFA 4NSGA 218LA 1OV5A 1WTNA 1L06A 1FKVA 3WULA 4WLXA 230LA 159LA 8LYZA 1OWYA 3WPJA 130LA 4I7LA 2Q9EA 261LA 4ETEA 4GRVA 1L51A 4DJHA 3P68A 2YBHA 4DAJA 4XJFA 1WQQA 1BB4A 4DQJA 2RB1X 3WU8A 1FBIX 4X3BA 1BB3A 1QDRA 4NGWA 4ZPUA 3P64A 3VW7A 1G0QA 1L98A 1G1VA 2YBNA 3LYOA 1L89A 4NWEA 1UIEA 1SLYA 3C80A 3AGHA 4PPOA 1DYCA 1G0PA 2MEEA 1L68A 1JTMA 3FI5A 4YF2A 196LA 1IP6A 1D0KA 3C82A 2LYMA 177LA 1XJUA 1UIHA 2BAAA 1TLAA 1G7HC 1L62A 1JKCA 2EKSC 3HBEX 1YQVY 2HTXA 3WUNA 4RLMA 1REYA 1GEVA 1LGUA 156LA 3EBAB 2HUBA 4XJDA 1YAOA 3AJNA 2XJWA 2B70A 4R6CA 1GFAA 4NGZA 1JTNA 3AB6A 3WU9A 5KXNA 4H91A 1LJEA 5FCPA 259LA 1CU0A 5HNCA 4LYCA 1L14A 1OVKA 4WL7A 5DN5A 3SP3A 2X0AA 1C6TA 3DN0A 1GFTA 4H9CA 4NGKA 2DQFC 4HPEA 1QSAA 211LA 1L21A 4PK0A 3HUAA 134LA 1L92A 188LA 1L28A 5APFA 2W1YA 5K7OA 1IX0A 1L05A 3DMXA 4RW2A 1OUDA 1LOZA 1L24A 1DYAA 4LYZA 220LA 1QUTA 1L83A 1OUAA 190LA 1LZTA 1LKRA 1C6KA 5C6JA 1KXYA 2MEAA 1HENA 3A94A 1Z55A 114LA 1CV6A 1GE4A 3OK0A 5KXPA 4Z98A 178LA 3QY4A 1IY4A 1L22A 5KKJA 4OWAA 5KXSA 1JTTL 1CKHA 3P66A 1LSBA 1GE2A 3V2WA 3OJPA 3N9CA 3N9EA 1LSAA 1TCYA 1EQ5A 1OVJA 1EQEA 1NMMA 1UBZA 2Z6BA 4NEBA 5LIOA 1WVVA 1C43A 1CU3A 2DQDY 5KJ9A 4G4HA 1LMQA 1L10A 4B49A 5LYZA 4ET8A 4DYGA 1PQJA 3TMWA 3VWOA 1LLHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4EXM A;  3C8S A;  1L01 A;  3CDR A;  5I53 A;  1QT8 A;  5LXW A;  1IR9 A;  4LFP A;  1OUG A;  164L A;  245L A;  2D4J A;  3EMS A;  2B72 A;  3MGW A;  1QIO A;  1LMA A;  5I4Y A;  1B5W A;  4IAP A;  2FBB A;  3TMX A;  1UID A;  1LMO A;  1GFK A;  1DI4 A;  4N1C C;  2RAZ X;  4W53 A;  2CUU A;  1C60 A;  5ILC A;  4NGY A;  1KIP C;  3A3R X;  1C6L A;  1L77 A;  1HEL A;  3HU9 A;  1LZY A;  2HED A;  1OVH A;  1CX6 A;  4KL7 A;  2A7F A;  3ZVQ B;  1L38 A;  1IP2 A;  1B7Q A;  4A7D A;  2LZ2 A;  1XGP C;  1G7J C;  1LZA A;  252L A;  4I7J A;  4NG1 A;  4LT3 A;  223L A;  1GBW A;  5B1G A;  3GUM A;  2F30 A;  2MEG A;  1LYY A;  3SN6 R;  1LMC A;  1JWR A;  4H9E A;  3LYZ A;  1L61 A;  5JEN B;  1QTB A;  1IC5 Y;  3TXK A;  215L A;  1LSF A;  1VDT A;  224L A;  4ETB A;  1OUB A;  2RBP A;  1B5Y A;  4EOF A;  1L95 A;  4ETD A;  3WH1 A;  256L A;  2RBR A;  4LYM A;  3WW5 A;  255L A;  1NF5 A;  5F9U A;  1IP1 A;  1BWH A;  5I4X A;  2LZT A;  1REM A;  2Z12 A;  3A3Q A;  3C8Q A;  4DDA A;  1GE0 A;  1LZG A;  4IAT A;  1T3P A;  1QDT A;  3LHM A;  1L23 A;  1HMK A; 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